Curriculum vitae

Curriculum vitae
Catarina Lopes Pinho
Junho de 2010
CV Junho 2010
Informação pessoal
Nome
Catarina Lopes Pinho
Bilhete de identidade
11201930
Local e data de nascimento Coimbra, 5 de Abril de 1978
Nacionalidade
Portuguesa
Estado civil
Solteira
Morada
Rua das Magnólias, 188
4250 – 272 Porto
Portugal
Moradas instituicionais
CIBIO - Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos
Genéticos
Campus Agrário de Vairão
4485-661 Vairão
Portugal
Department of Genetics
Rutgers, the State University of New Jersey
Piscataway, NJ 08854
USA
Telefone
252660411 (Portugal) / +1 732 445 2681 (EUA)
Telemóvel
965563396
Fax
252661780
E-mail
[email protected]
Formação académica
2008 -
Frequência da Licenciatura em Matemática da Faculdade de
Ciências da Universidade do Porto, Portugal. (Actualmente a
terminar o segundo ano; média provisória: 17 valores)
2007
Doutoramento em Biologia. Universidade do Porto, Portugal.
Classificação: aprovada por unanimidade.
2000
Licenciatura em Biologia. Universidade do Porto, Portugal.
Classificação: 18 valores.
1
C. Pinho
Formação complementar
Fevereiro – Abril 2008
Curso PADI de Mergulho em Águas Livres (Universidade de
Rutgers, EUA / Escola Mar do Cachalote, Portugal).
Janeiro – Abril 2008
Curso: Quantitative Genetics and Bioinformatics, pelo Dr.
Jody Hey (Universidade de Rutgers, EUA)
Novembro 2004
Curso avançado: Genética populacional, pelo Dr. Stuart Baird,
da Universidade de Montpellier, França.
Novembro 2004
Curso avançado: Ecologia molecular, evolução e conservação,
pelo Prof. Craig Moritz, do Museum of Vertebrate Zoology,
Universidade da Califórnia em Berkeley.
Julho 2004
Estágio de um mês no Museum of Vertebrate Zoology,
Universidade da Califórnia em Berkeley, sob a supervisão do
Prof. Craig Moritz.
Maio 2004
Curso avançado: Detecção de hibridação em populações
naturais, pelo Prof. Ettore Randi, do Istituto Nazionale per la
Fauna Selvatica, Bologna, Itália.
Entre 1997 - 2000
Cursos da responsabilidade do Núcleo do Porto da Quercus:
Identificação de Aves, Identificação de Plantas, Fotografia da
Natureza.
Experiência profissional
2007 – presente
Bolseira de Pós-Doutoramento
CIBIO, Universidade do Porto, Portugal
Rutgers, the State University of New Jersey, EUA
Supervisores: Jody Hey e Nuno Ferrand de Almeida
Tema do projecto de investigação: “Divergence and gene flow
in Lake Malawi cichlids”.
2005 - 2007
Bolseira de Investigação
CIBIO, Universidade do Porto, Portugal
Supervisora: Raquel Godinho
Tema do projecto de investigação: “Genealogias nucleares,
genética da paisagem e SIGs: desenvolvimento de uma
abordagem
integrada
para
testar
hipóteses
sobre
a
biogeografia da herpetofauna ibérica”: projecto POCI/BIA-
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CV Junho 2010
BDE/60911/2004 da Fundação para a Ciência e a Tecnologia
(FCT).
2001 – 2005
Bolseira de Doutoramento
CIBIO, Universidade do Porto, Portugal
Orientadores: Nuno Ferrand de Almeida, D. James Harris
Tema do projecto de investigação: “Evolution of wall lizards
(Podarcis spp.) in the Iberian Peninsula and North Africa”.
2000 – 2001
Estágio profissionalizante em Biologia Animal Aplicada
CIBIO, Universidade do Porto, Portugal
Orientador: D. James Harris
Tema do projecto de investigação: “Differentiation between
and within forms of Podarcis lizards in the Iberian Peninsula
and North Africa: evidence from protein electrophoresis”.
Domínios
de
especialização
e
actuais
interesses
de
investigação
Especialização
Biologia
molecular,
genética,
evolução,
biodiversidade,
bioestatística, bioinformática (programação em Python).
Interesses
Especiação, filogeografia, genética populacional, filogenia,
caracterização de zonas híbridas, detecção de selecção
natural.
Bolsas
2007 – presente
Bolsa de Pós-Doutoramento concedida pela FCT; referência
SFRH/BPD/28869/2006.
2005 – 2007
Bolsa de Investigação no projecto POCI/BIA-BDE/60911/2004
(FCT).
2001 – 2005
Bolsa de Doutoramento concedida pela FCT; referência
SFRH/BD/4620/2001.
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C. Pinho
Participação em projectos de investigação
Como investigadora principal
PTDC/BIA-BEC/102179/2008 (FCT). O caminho para a especiação: uma análise integrada da
evolução do isolamento reprodutivo num complexo de espécies crípticas
(início em Abril de 2010).
Projecto no âmbito do Programa de Apoio à Investigação na Fronteira das Ciências da Vida
(Fundação Calouste Gulbenkian). On the nature of species: insights into
the Lake Malawi cichlids explosive radiation based on a genomic analysis.
(início em Abril de 2009).
PTDC/BIA-BDE/66210/2006 (FCT). Divergência e especiação em ciclídeos do Lago Malawi
(início em Janeiro de 2008).
Como membro da equipa de investigação
PTDC/BIA-BEC/105083/2008 (FCT). Teste da hipótese do padrão filogeográfico efémero e do
movimento de zonas híbridas em anfíbios Ibéricos utilizando uma
combinação de análises multilocus, métodos de simulação e modelação
de nicho ecológico. PI: Fernando Sequeira.
PTDC/BIA-BDE/74349/2006 (FCT). Gene flow across the pillars of Hercules: the role of North
Africa in the postglacial recolonization of Europe. PI: D. James Harris
POCI/BIA-BDE/60911/2004 (FCT). Genealogias nucleares, genética da paisagem e SIGs:
desenvolvimento de uma abordagem integrada para testar hipóteses
sobre a biogeografia da herpetofauna ibérica. PI: Raquel Godinho.
POCTI/BSE/40987/2001 (FCT). Análise filogeográfica da herpetofauna ibérica: padrões e
processos de subdivisão genética, expansão geográfica, hibridação e
especiação. PI: Nuno Ferrand de Almeida.
POCTI/BSE/41912/2001 (FCT). Filogeografia da herpetofauna através do Estreito de
Gibraltar. PI: D. James Harris.
POCTI/BSE/34547/2000 (FCT). Aplicação de marcadores moleculares na identificação de
novas espécies ibéricas de lagartixas (Podarcis). PI: D. James Harris.
Prémios e distinções
2009
Distinção no âmbito do Programa de Apoio à Investigação na
Fronteira das Ciências da Vida, atribuída anualmente pela
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CV Junho 2010
fundação
Calouste
Gulbenkian
a
dois
investigadores
portugueses.
2000
Prémio Eng. António de Almeida para o aluno a concluir o
curso
de
Biologia
da
Universidade
do
Porto
com
a
classificação mais elevada.
1998
Prémio Rui de Serpa Pinto para o aluno a concluir a disciplina
de Biologia Humana com a classificação mais elevada
(referente ao ano anterior).
1997/1998
Bolsa de mérito da Faculdade de Ciências da Universidade do
Porto
1996/1997
Bolsa de mérito da Faculdade de Ciências da Universidade do
Porto
Actividades docentes
Abril – Maio 2010
Leccionação de quatro aulas teóricas da disciplina de Evolução
da Licenciatura em Biologia (FCUP, Universidade do Porto;
regente da cadeira: Jorge Rocha).
Abril 2009
Leccionação de duas aulas teóricas da disciplina de Evolução
da Licenciatura em Biologia (FCUP, Universidade do Porto;
regente da cadeira: Nuno Ferrand).
Novembro 2008
Leccionação das aulas práticas do módulo de “Genética
Populacional e Filogeografia” do Mestrado em Biodiversidade
e Recursos Genéticos (CIBIO, Universidade do Porto).
Maio 2007
Leccionação das aulas práticas do módulo de “Genética
Populacional e Filogeografia” do Mestrado em Biodiversidade
e Recursos Genéticos (CIBIO, Universidade do Porto).
Abril 2006
Workshop: A genética como ferramenta para o estudo e
conservação da biodiversidade. X Encontro Nacional de
Estudantes de Biologia.
Março 2005
Palestrante convidada no Curso Avançado de Biologia e
Conservação de Anfíbios e Répteis, Universidade de Santiago
de
Compostela,
ferramentas
Espanha.
genéticas
no
Palestra:
estudo
A
e
aplicação
de
conservação
da
herpetofauna Ibérica.
Março 2005
Colaboração na leccionação das aulas práticas do módulo de
“Análise Filogenética” do Mestrado em Biodiversidade e
Recursos Genéticos (CIBIO, Universidade do Porto).
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C. Pinho
Março 2004
Colaboração na leccionação das aulas laboratoriais do módulo
de “Métodos Moleculares na Análise da Diversidade Biológica”
do Mestrado em Biodiversidade e Recursos Genéticos (CIBIO,
Universidade do Porto).
Experiência em trabalho de campo
Maio-Junho 2008
Organização, coordenação e participação em campanha de
recolha de amostras no lago Malawi – CIBIO, Universidade de
Rutgers.
1998 – 2007
Participação em campanhas de recolha de amostras e
elaboração de atlas de distribuição de répteis e anfíbios, em
Portugal, Espanha, Marrocos e Tunísia – CIBIO.
1999 – 2001
Colaboração no projecto Atlas das Aves Nidificantes em
Portugal Continental – SPEA/ICN.
Julho 2000
Colaboração num estudo de telemetria na toupeira-de-água,
Galemys pyrenaicus – CIBIO.
Agosto 2000
Colaboração num projecto de anilhagem científica de aves
(Laguna de La Nava, Palencia, Espanha) – Fundación Global
Nature.
Outras actividades
Março de 2009 – presente
Membro da Direcção Nacional da Associação de Bolseiros de
Investigação Científica (ABIC)
Julho de 2007 – presente
Líder da unidade de investigação em “Genética populacional,
especiação e hibridação” do CIBIO.
Julho de 2007
Colaboração na organização das conferências TiBE (Trends in
Biodiversity and Evolution), realizadas em Vairão nos dias 2 e
3 de Julho de 2007.
2004 – presente
Revisora
científica
internacional:
para
diversas
Amphibia-Reptilia,
revistas
de
circulação
Conservation
Genetics,
European Journal of Wildlife Research, Molecular Biology and
Evolution, Molecular Biology Reports, Molecular Ecology,
Zoologica Scripta, Zoological Journal of the Linnean Society.
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CV Junho 2010
2002
Membro
da
comissão
organizadora
do
International
Symposium: Phylogeography in Southern European Refugia,
realizado em Vairão, Portugal, de 11 a 15 de Março de 2002.
Comunicações em congressos, conferências e seminários
Comunicações orais por convite
1. Harris D.J., Pinho C. & Ferrand N. Iberian Podarcis: delimiting species boundaries. V
International Symposium on the Lacertids of the Mediterranean Basin, Lipari, Italy, 7
– 11 Maio de 2004.
Outras comunicações orais
1. Díaz-Rodriguez, J., Pinho, C. Ferrand, N., Gonçalves, H., & Tejedo, M.
Filogeografía molecular de los sapillos moteados, Pelodytes sp., en la
Península Ibérica: datos preliminares. X Congresso Luso-Espanhol de
Herpetologia, Coimbra, Portugal, 15 a 18 de Outubro de 2008.
2. Kaliontzopoulou, A., Pinho, C., Brito, J. C., Carretero, M. A., Harris, D.J. & Llorente,
G. A. Geographic patterns of morphological and genetic variability of Podarcis
vaucheri in Morocco. 14th European Congress of Herpetology. Porto, Portugal, 19 a
23 de Setembro de 2007.
3. Pinho, C., Kaliontzopoulou, A., Carretero, M.A., Harris, D.J. & Ferrand, N. Genetic
admixture between the Iberian endemic lizards Podarcis bocagei and P. carbonelli:
evidence for limited natural hybridization and a bimodal hybrid zone. Conferências
TiBE – Trends in Biodiversity and Evolution. Vairão, Portugal, 2 e 3 de Julho de 2007.
4. Pinho, C., Harris, D.J., Ferrand, N. Evolution of wall lizards (Podarcis) in the Iberian
Peninsula and North Africa. The 2004 Annual Meeting of the Society for the Study of
Evolution. Fort Collins, CO, EUA. 26-30 de Julho de 2004.
5. Pinho, C., Harris, D.J., Ferrand, N. Iberian Podarcis: intraspecific variation. 12th
Ordinary General Meeting of the Societas Europaea Herpetologica, S. Petersburgo,
Rússia, 12-16 de Agosto de 2003.
6. Harris, D.J., Pinho, C., Carretero M.A., Ferrand N. Iberian and North African
Podarcis: how many species? 12th Ordinary General Meeting of the Societas
Europaea Herpetologica, St. Petersburg, Russia, August 12-16, 2003.
7
C. Pinho
7. Pinho, C., Harris, D.J., Carretero, M.A., Sá-Sousa, P., Ferrand, N. Avaliação do
número de espécies do género Podarcis existentes na Península Ibérica através do
estudo de polimorfismos proteicos e de DNA-mitocondrial. VII Congresso LusoEspanhol de Herpetologia, Évora, Portugal, 2 – 5 de Outubro 2002.
8. Harris D.J., Pinho C., Carretero M.A., Ferrand N. Análise da variação genética em
lagartixas do género Podarcis: evidência para múltiplos eventos de colonização do
Norte de África. VII Congresso Luso-Espanhol de Herpetologia, Évora, Portugal, 2-5
de Outubro de 2002.
9. Harris, D. J., Pinho, C., Carretero, M., Sá-Sousa, P., Ferrand, N. Iberian Podarcis:
How many species? How many refugia? International Symposium: Phylogeography in
Southern European Refugia, Vairão, Portugal, 11 – 15 de Março de 2002.
10. Pinho, C., Ferrand, N. Differentiation within and between forms of Podarcis in the
Iberian Peninsula: evidence from protein electrophoretic data. IV International
Symposium on the Lacertids of the Mediterranean Basin, Maó, Espanha, 7 – 11 de
Maio de 2001.
Seminários
1. Speciation in wall lizards (Podarcis) in the Iberian Peninsula and North Africa.
Universidade de Zomba, Malawi, 14 de Junho de 2008.
2. Evolution of wall lizards (Podarcis) in the Iberian Peninsula and North Africa.
Seminários do Grupo de Investigação de Michael Nachman, Universidade do Arizona,
Tucson, EUA, 26 de Novembro de 2007.
3. Genética das lagartixas do género Podarcis na Península Ibérica: um complexo de
espécies? Universidade de Aveiro, 3 de Dezembro de 2003
Apresentações em poster
1. Pinho, C., Harris, D. J., & Ferrand, N. Incipient speciation in Iberian and north
African wall lizards (Podarcis): a multilocus approach. 14th European Congress of
Herpetology. Porto, Portugal, 19 a 23 de Setembro de 2007.
2. Pinho, C., Harris, D. J., & Ferrand, N. Testing phylogeographic hypotheses in Iberian
and north African Podarcis: the influence of latitude in shaping historical demography
and substructure. 14th European Congress of Herpetology. Porto, Portugal, 19 a 23
de Setembro de 2007.
3. Pinho, C., Harris, D.J. & Ferrand, N. Evolution of wall lizards (Podarcis spp.) in the
Iberian Peninsula and North Africa. 10th Congress of the European Society for
Evolutionary Biology. Cracóvia, Polónia, 15-20 de Agosto de 2005.
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CV Junho 2010
4. Pinho, C., Corti, C., Carretero, M.A. & Harris, D.J. Genetic variability within Podarcis
tiliguerta: preliminary evidence from 12S rRNA gene sequences. V International
Symposium on the Lacertids of the Mediterranean Basin, Lipari, Itália, 7-11 de Maio
de 2004.
5. Carretero, M.A., Perera, A., Harris, D.J., Batista, V. & Pinho, C. Oukaïmeden – spring
aspect of the diet in an alpine lizard community. V International Symposium on the
Lacertids of the Mediterranean Basin, Lipari, Itália, 7-11 de Maio de 2004.
6. Pinho, C., Harris D.J. & Ferrand N. Postglacial expansion of Podarcis bocagei:
evidence from protein electrophoretic data. VII Congresso Luso-Espanhol de
Herpetologia, Évora, Portugal, 2-5 de Outubro de 2002.
7. Pinho, C., Harris D.J., Carretero M.A., Barbosa D. & Ferrand N. Genetic variation
within Podarcis carbonelli using protein markers. VII Congresso Luso-Espanhol de
Herpetologia, Évora, 2-5 de Outubro de 2002.
8. Pinho, C., Harris, D.J. & Ferrand, N. Postglacial expansion of Podarcis bocagei
(Squamata: Lacertidae). Evidence from protein electrophoretic data. International
Symposium: Phylogeography in Southern European Refugia, Vairão, Portugal, 11-15
de Março de 2002.
Publicações
Teses
1. Pinho, C. (2007) Evolution of wall lizards (Podarcis spp.) in the Iberian Peninsula
and North Africa. Dissertação de Doutoramento. Faculdade de Ciências, Universidade
do Porto.
2. Pinho, C. (2002). Differentiation between and within forms of Podarcis lizards in the
Iberian Peninsula and North Africa: evidence from protein electrophoresis. Relatório
de Estágio. Faculdade de Ciências, Universidade do Porto.
Capítulos em livros
1. Pinho, C. (2008). Podarcis bocagei Seoane 1884. In Atlas dos Anfíbios e Répteis de
Portugal (eds Loureiro A, Carretero, Ferrand N, Paulo O), Instituto da
Conservação da Natureza e da Biodiversidade, Lisboa (in press).
2. Pinho, C. & Ferrand, N. (2008). Biogeografia e evolução recente dos anfíbios e
répteis de Portugal. In Atlas dos Anfíbios e Répteis de Portugal (eds Loureiro A,
9
C. Pinho
Carretero, Ferrand N, Paulo O), Instituto da Conservação da Natureza e da
Biodiversidade, Lisboa (in press).
3. Vasconcelos, R., Harris D.J., Corti C., Carretero, M.A., Capula M., Pinho C.,
Delauguerre M. & Spano G. (2006): Podarcis tiliguerta, a species complex. in Corti,
C., Lo Cascio, P. & Biaggini M. (eds.) Mainland and insular lizards. A Mediterranean
perspective, Firenze University Press. Florence, 191-199.
4. Pinho, C., Ferrand N. & Harris D.J. (2004) Genetic variation within the Podarcis
hispanica species complex: new evidence from protein electrophoretic data. in PérezMellado V., Riera N. & Perera A. (eds.) The Biology of Lacertid Lizards: Evolutionary
and Ecological Perspectives. Institut Menorquí d’Estudis. Recerca 8:269-277.
Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica
1. Pinho, C., Hey, J. (in press) Divergence with gene flow: models and data. Annual
Review of Ecology, Evolution and Systematics (in press).
2. Pinho, C., Kaliontzopoulou, A., Harris, D.J., Ferrand, N. (in press) Recent
evolutionary history of the Iberian endemic lizards Podarcis bocagei (Seoane 1884)
and P. carbonelli Pérez-Mellado 1981 (Squamata: Lacertidae) revealed by allozyme
and microsatellite markers. Zoological Journal of the Linnean Society (in press)
3. Pinho, C., Rocha, S., Carvalho, B.M., Lopes, S., Mourão, S., Vallinoto, M., Brunes,
T.O., Haddad, C.F.B., Gonçalves, H., Sequeira, F., Ferrand, N. (in press) New primers
for the amplification and sequencing of nuclear loci in a taxonomically wide set of
reptiles and amphibians. Conservation Genetics Resources (in press).
4. Sá-Pinto, A., Baird, S.J.E., Pinho, C., Alexandrino, P., Branco, M. (in press). A threeway contact zone between forms of Patella rustica (Mollusca: Patellida) in central
Mediterranean Sea. Biological Journal of the Linnean Society, 100, 154-169.
5. Pinho, C., Kaliontzopoulou, A., Carretero, M. A., Harris, D. J., Ferrand, N. (2009)
Genetic admixture between the Iberian endemic lizards Podarcis bocagei and P.
carbonelli: evidence for limited natural hybridization and a bimodal hybrid zone.
Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research. 47:368-377.
6. Lima, A., Pinho, C., Larbes, S., Carretero, M.A., Brito, J.C., Harris, D.J.
(2009) Relationships of Podarcis wall lizards from Algeria based on mtDNA
data. Amphibia-Reptilia 30, 483-492
7. Pinho, C., Harris, D.J., Ferrand, N. (2008) Non-equilibrium estimates of gene flow
inferred from nuclear genealogies suggest that Iberian and North African wall lizards
(Podarcis spp.) are an assemblage of incipient species. BMC Evolutionary Biology,
8:63.
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CV Junho 2010
8. Harris, D.J., Carretero, M.A., Brito, J.C., Kaliontzopoulou, A., Pinho, C., Perera, A.,
Vasconcelos, R., Barata, M., Barbosa, D., Carvalho, S. Fonseca, M.M., Pérez-Lanuza,
G., Rato, C. (2008). Data on the distribution of the terrestrial herpetofauna of
Morocco: records from 2001–2006. Herpetological Bulletin 103:19–28.
9. Pinho, C., Harris, D.J., Ferrand, N. (2007) Comparing patterns of nuclear and
mitochondrial divergence in a cryptic species complex: the case of Iberian and North
African wall lizards (Podarcis, Lacertidae). Biological Journal of the Linnean Society,
91, 121–133.
10. Pinho, C., Harris, D.J., Ferrand, N. (2007) Contrasting patterns of population
structure and historical demography in three western Mediterranean lizard species
inferred from mtDNA variation. Molecular Ecology, 16, 1191–1205.
11. Pinho, C., Ferrand, N., Harris, D.J. (2006) Reexamination of the Iberian and North
African Podarcis (Squamata: Lacertidae) phylogeny based on increased mitochondrial
DNA sequencing. Molecular Phylogenetics and Evolution, 38, 266-273.
12. Carretero, M.A., Perera, A., Harris, D.J., Batista, V., Pinho, C. (2006). Spring diet
and trophic partitioning in an alpine lizard community from Morocco. African Zoology,
41, 113–122.
13. Harris, D.J., Pinho, C., Carretero, M.A., Corti, C., Böhme, W. (2005). Determination
of genetic diversity within the insular lizar Podarcis tiliguerta using mtDNA sequence
data, with a reassessment of the phylogeny of Podarcis. Amphibia-Reptilia, 26, 401407.
14. Pinho C., Sequeira F., Godinho R., Harris D.J. & Ferrand N. (2004) Isolation and
characterization of 9 microsatellite loci in Podarcis bocagei (Squamata: Lacertidae).
Molecular Ecology Notes, 4, 286-288.
15. Carretero M. A., Harris D.J., Pinho C., Batista V. & Perera A. (2004) Pleurodeles
waltl (Gallipato): nueva población meridional en Marruecos. Boletin de la Asociacion
Herpetologica Española, 15, 13.
16. Pinho, C., Harris, D.J., Ferrand, N. (2003) Genetic polymorphism of 11 allozyme loci
in populations of wall lizards (Podarcis sp.) from the Iberian Peninsula and North
Africa. Biochemical Genetics, 41, 343–359.
17. Harris, D.J., Carranza, S., Arnold, E.N., Pinho, C., Ferrand, N. (2002). Complex
biogeographical distribution of genetic variation within Podarcis wall lizards across
the Strait of Gibraltar. Journal of Biogeography, 29, 1257–1262.
18. Carretero M.A., Sá-Sousa P., Barbosa D., Harris D.J., Pinho C. (2002) Sintopía
estricta entre Podarcis bocagei y P. carbonelli. Boletin de la Asociacion Herpetologica
Española, 13, 20-24.
11
C. Pinho
19. Harris D.J., Batista V., Carretero M.A., Pinho C. & Sá-Sousa P. (2002) Mitochondrial
DNA sequence data confirms the presence of Podarcis carbonelli, PÉREZ-MELLADO,
1981 in southern Spain. Herpetozoa, 15, 188-190.
Conhecimento de línguas
Inglês
muito bom, quer ao nível da leitura como da escrita e
conversação.
Francês
nível médio na compreensão e leitura; elementar ao nível da
conversação.
Espanhol
bom ao nível da conversação e leitura; elementar ao nível da
escrita.
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