Curriculum Vitae

Daniele Santoni ­ Curriculum Vitae
Dados Pessoais:
Local e data de nascimento: Roma, Italia, 31 Julho 1971 Nacionalidade:
Italiana
E­mail: [email protected]
Web site
http://www.iac.rm.cnr.it/~santoni/ Sexo:
Masculino
Telefone
Trabalho: +39 06 88470274 ­ Celular: +39 3460180027
Idiomas: Italiano, Inglês, português, francês.
Educaç ã
o:
Novembro 2006 ­ Atual: Dotourando na Universidade “La Sapienza” em Roma, Departamento de Genetica e Biologia Molecular ­ Charles Darwin.
September 1­12 2008: Summer School of advanced Computing – CASPUR – Villa Florio Grottaferrata, Rome, Italy.
August 11­15 2008: Scholarship to attend “3rd Annual Summer School in Computational Immunology” ­ Symposium “Systems Biology of Innate Immunity” ­ School of medicine ­ Yale University – New Haven, USA. May 21­23 2008: Curso em Microarray data analysis ­ “Bioinformatics training course Microarray Data Analysis using GEPAS and Babelomics – MDAGBA08” ­ Instituto Gulbenkian de Ciência, Lisboa, Portugal.
2003: Master de segundo nivel em Bioinformatica, Universidade “La Sapienza” de Roma (cum laude).
1999: Licenciatura em Matematica (110/110), Universidade “La Sapienza” di Roma com o Prof. Aldo de Luca. Argumento da tesi: DNA Computing, Information theory. Titulo: Modellos de computação, Problemas NP e DNA. 1990: Diploma Cientifico (Liceo Scientifico Statale Cavour, Roma) votacão 60/60.
Actividade Profissional:
Abril 2007 ­ Atual: Contrato de Pesquisa no Instituto para a Aplicação da Computação (IAC) do (Conselho Nacional de Pesquisa) CNR. ComplexDis – Análise, estudo e desenho de modelos de computação “agent­
based” para a simulação da resposta immunitária em patientes atópicos.
Outubro 2008: Vencedor de uma bolsa de estudo "Short­term mobility program of researchers", CNR ­ Departamento de Intercambios Internacionais; visiting­scholar program ­ “Knowledge Discovery and Bioinformatics group ­ Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores: Investigação e Desenvolvimento INESC­ID” ­ Lisboa, Portugal.
Outubro 2006 – 2007: Docente do curso IN2 Modellos de Computação (esercitaçoes) na Universidade “Roma III” ­ Roma ­ Italia.
Setembro 2003 – Abril 2007: Contrato de Pesquisa no Instituto Universitario de Ciencias Motorias (IUSM) ­ Departamento da Sciencia da Saude – Laboratorio de Bioinformatica ­ Roma – Italia.
Fevereiro 2007: Pesquisador visitante no Centro Nucleo de Genomica e Bioinformatica (NUGEN) da Universidade Estadual do Cearà – Fortaleza – Brasil. Setembro­Outubro 2006: Vencedor de uma bolsa de estudo "Short­term mobility program of researchers", CNR ­ Departamento de Intercambios Internacionais; visiting­scholar program ­ “The Technical University of Denmark ­ Center for Biological Sequence Analysis ­Comparative microbial genomics group”.
Março­Junho 2004: Docente no curso post­licentiatura: Bioinformatica e Biotecnologias em Saùde Pu­
blica , IUSM, Roma ­ Italia.
Março 2002 Setembro 2003: Bolsa de estudo ­ CASPUR (Consorzio per l'Appplicazione del Superercalcolo Per Università e Ricerca) Roma – Italia. Aplicações para simulações de ondas sismicas (WISA).
Dicembro 2000 Marzo 2002: Isinet srl, Roma ­ Italia: Análise e desenvolvimento de projetos de aplicações web. Web programming no ambiente UNIX (perl javascript CGI­PHP) e Windows (VBScript javascript ASP).
Computer Science Skills: Sistemos operativos: UNIX, Linux, Windows. Linguagens de programmação : Perl, Fortran, C, Pascal, Javascript, Vbscript, Matlab, SQL ,HTML.DBMS: MySql.
Publicaç õ es:  Pedone F, Santoni D. (2008) DNA length and nucleosome positioning. BMC Genomics (Submitted).
 Santoni D, Romano­Spica V. (2008) Comparative genomic analysis by microbial COGs self­attraction rate. J Theor Biol. (Submitted).
Cacchiarelli D, Santoni D and Bozzoni I. (2008) MicroRNAs as prime players in a combinatorial view of evolution. RNA biol. 5(3).
Santoni D, Pedicini M and Castiglione F. (2008) Implementation of a regulatory gene network to simulate the TH1/2 differentiation in an agent­based model of hyper­sensitivity reactions. Bioinformatics. 24(11):1374­1380.
Paparini A, Ripani M, Giordano GD, Santoni D, Pigozzi F and Romano­Spica V. (2007). ACTN3 Genotyping by Real­Time PCR in the Italian Population and Athletes. Med Sci Sports Exerc. 39(5):810­815.
Brandi G, Sisti M, Paparini A, Gianfranceschi G, Schiavano GF, De Santi M, Santoni D, Magini V, Romano­
Spica V. (2007). Swimming pools and fungi: an environmental epidemiology survey in Italian indoor swimming facilities. Int J Environ Health Res.17(3):197­206.
Paparini A, Santoni D, Romano­Spica V. (2006). Bioinformatics and microbial biodiversity: analysis of vibrios by the GenEnv system. J Prev Med Hyg. 47(3):100­104.
Santoni D, Romano­Spica V. (2006). A gzip­based algorithm to identify bacterial families by 16S rRNA. Lett Appl Microbiol. 42:312­314.
Pedone F, Mazzei F, Santoni D. (2004). Sequence­dependent DNA torsional rigidity: A tetranucleotides code. Biophysical Chemistry. 112: 77­88.
Robaud V, Magini V, Sabatini A, Montuori E, Santoni D, Pascale S, Paparini A, Romano­Spica V. (2004). Obesità infantile e dati antropometrici in una scuola elementare: aspetti legati alla suscettibilità genetica ed al ruolo delle attività motorie adattate. J Prev Med Hyg, 45(4):394 in italian.
Romano­Spica V, Santoni D, Paparini A, Orsini M, Castrignanò T. (2004). Il database GenEnv: un nuovo strumento di bioinformatica per la sanità pubblica. J Prev Med Hyg, 45(4):160­161 in italian.
Magini V, Robaud V, Montuori E, Sabatini A, Santoni D, Pascale S, Paparini A, Romano­Spica V. (2004). Attività motorie e prevenzione dell'obesità infantile: aspetti genetici e antropometrici. L’Igiene Moderna. 123: 49­
69 in italian.
Romano­Spica V, Santoni D, Paparini A, Orsini M, Canali A, Giammanco G, Castrignanò T. (2004) Bioinformatics and GenEnv database in biological risk management. Sanità Pubblica 6:401­420 in italian.