Sabatina Ecologia Microbiana

[2.000] Qual a lógica dos métodos para determinação de biomassa e respiração microbianas?
A biomassa microbiana (BM) se refere a parte da matéria orgânica do solo (MOS) constituída por organismos
vivos com volume menor que 5 x 10³µm³, sendo expressa como micrograma (µg) de carbono por grama de solo
seco. Os métodos mais citados na literatura para quantificação da BM são os métodos da microscopia direta, do
trifosfato de adenosina, da respiração induzida pelo substrato, da fumigação-incubação e da fumigação-extração,
sendo os dois últimos os mais utilizados.
A respiração microbiana (RM), muito utilizada para quantificar a atividade microbiana, representa a oxidação da
matéria orgânica do solo (MOS) por organismos aeróbios, podendo ser avaliada pelo consumo de O2 e/ou pela
produção de CO2. Entre os vários métodos, a determinação de O2 pode ser feita por cromatografia gasosa ou
eletrorespirômetro e a de CO2 por titulação ou condutividade elétrica. Tanto os métodos para determinação da BM
quanto o da RM se baseiam em um fator de avaliação passível de mensuração (como por exemplo o CO2 capturado
em solução de NaOH ou KOH) que possa se relacionar com outro fator que não seja difícil de ser quantificado (por
exemplo a biomassa e respiração microbiana). É importante dizer que estes métodos devem ser calibrados para
cada situação a qual sejam utilizados e que a partir dos dados de respiração e biomassa microbiana pode se calcular
o quociente metabólico (qCO2), o qual quantifica o C-CO2 evoluído por unidade de C microbiano.
embora essencialmente ok, na realidade a lógica para a maioria dos métodos é observar a diferença entre
duas amostras, sendo uma sob condições naturais e a outra com a eliminação da microflora. Depois desta
eliminação é que entra a parte que você discute mais.
[2.000] Os meios de cultura mais comumente utilizados são complexos ou simples?
São os complexos, ou seja, com pelo menos um componente múltiplo.
ok, mas você não paga por letra, paga? Ser sucinto é positivo, mas isto já chega ao rídiculo
[1.000] Como a variabilidade do solo, em suas diversas escalas, afeta a composição da biota do solo?
O solo como habitat é um sistema heterogêneo, descontínuo e estruturado onde se encontram os
microrganismos. Qualquer alteração ou modificação no solo irá refletir sobre a sua biota, pois são altamente
interdependentes. Isso significa dizer que a variabilidade do solo (tipo, formas e dimensões) pode afetar na
composição da biota do solo e nas interações entre os microrganismos e o solo, uma vez que há uma grande
diversidade de microrganismos com características específicas. Por isso são muito importantes a natureza dos
materiais que fornecem carbono, nutrientes e energia e a dinâmica dos fatores físico-químicos afetando o
metabolismo celular e a disponibilidade de substrato.
como é que afeta? Onde entra a escala do solo nesta sua resposta? sua resposta tem muito pouca relação
com a pergunta na realidade, ficando apenas em termos muito, muito genéricos sobre variabilidade do solo
[2.000] O que aparece primeiro: o solo ou a biota do solo? Justifique detalhadamente sua resposta.
A biota do solo. Pois os microrganismos são um dos principais agentes que, juntamente com os fatores clima,
relevo e tempo, atuam nos processos de formação dos solos. A ação desse conjunto de fatores sobre o material
rochoso é que dá origem ao solo. Portanto, para que o solo se forme é necessário, primeiramente, que se tenha
microrganismos.
embora essencialmente correta, novamente muito superficial
[2.000] Como o meio de cultura utilizado para incubação do solo afeta a avaliação da diversidade
microbiana?
Embora o meio de cultura seja uma ferramenta usualmente adotada na avaliação da ocorrência, densidade e
diversidade de microrganismos, esse método apresenta algumas limitações, pois estima-se que apenas
aproximadamente 1% ou menos da microfauna do solo apresentem crescimento em meio de cultura. Isso significa
dizer que sempre haverá subestimativas nos resultados da densidade de organismos do solo e, consequentemente,
da sua diversidade. Além disso, características morfológicas, fisioçógicas e bioquímicas em meio de cultura não
refletem, necessariamente, o mesmo status encontrado no solo.
embora a resposta cobra (sumariamente) uma parte da pergunta, não leva em consideração o efeito das
diferenças entre os meios de cultura na capacidade de crescimento microbiano, o que por sua vez afeta a avaliação
da diversidade
[1.750] Qual a ligação entre PCR e extremófilos?
Primeiramente, vamos conceituar:
- PCR = reação em cadeia da polimerase
- Extremófilos = microorganismos que não apenas toleram, mas crescem otimamente em ambientes normalmente
considerados inóspitos para a vida, como fontes termais, águas extremamente salgadas, temperaturas baixas e
condições extremas de pH.
A PCR revolucionou a prática da biologia molecular, com replicações in vitro de sequencias específicas de DNA
possibilitou isolamento de genes, sequenciamento e mutações específicas. Este método foi extremamente
simplificado com a descoberta e utilização de enzimas hipertermofílicas (organismos extremófilos). Foi realizado o
isolaram de enzimas extremófilas e as utilizaram para investigação biomédica com o método PCR com o uso de altas
temperaturas obtendo elevado número de cópias de DNA.
cobriu a questão, mas dificilmente conseguiria ser mais sucinta ou superficial. Um ponto muito importante é
que o PCR é realmente a base de todo o desenvolvimento da biologia molecular, em particular de tudo e qualquer
uso de genômica, o que inclui particularmente tudo que se refere à avaliação da biodiversidade.
[2.000] Como a variabilidade do pH do solo pode afetar atividade de determinados grupos de
microorganismos? Como isto poderia ser avaliado experimentalmente?
O solo é constituído por uma enorme diversidade de microrganismos, sua plasticidade genética e fisiológica
capacita-os a adaptarem-se aos mais diferentes ambientes podendo suportar alterações na temperatura, pH,
pressão, concentração de nutrientes e recursos.
Os microorganismos podem ser classificados em relação ao pH como:
a) insensitivos ou indiferentes – toleram ampla faixa de pH
b) neutrófilos – não toleram acidez ou alcalinidade
c) acidófilos – crescem melhor em condições ácidas
d) basófilos – crescem melhor em condições alcalinas
De maneira geral, fungos são mais adaptados a valores de pH menores que 5,0 e bactérias, incluindo actinomicetos
(streptomicetos, actinobacterias) e cionobactérias a valores de pH entre 6 e 8 (havendo exceções.
O pH pode afetar a quantidade e diversidade de microrganismos num hábitat, pois a disposição e toxicidade de
nutrientes minerais estão relacionadas a esse fator químico. Em ambientes com pH maior que 7, o Fe, Mn e Zn são
menos disponíveis para a absorção pelas plantas e pelos microrganismos. O Fe e Al tornam-se tóxicos em pH menor
que 5, sendo menos disponíveis em pH baixo ou alto. Processos como germinação e crescimento de esporos e
fungos micorrízicos são afetados de forma negativa devido à maior concentração de alumínio (Moreira & Siqueira,
2006).
A avaliação pode ser feita através da forma INDIRETA por meio de cultivo com diferentes graus de seletividade para
grupos fisiológicos que podem incluir fatores de estresse para seleção de tolerantes/resistentes ou através de
microscopia de alta resolução.
ok, mas novamente muito superficial. um ponto muito importante que você não parece ter considerado na
resposta é que existe ampla variabilidade no pH do solo em um determinado momento e ao longo do tempo, e as
duas coisas vão afetar a atividade microbiana, e podem levar a modificações na distribuição dos microorganismos no
solo.
[1.250] Discuta métodos de avaliação de diversidade e sua aplicação.
Há vários métodos para avaliação da diversidade, dentre eles temos técnicas bioquímicas e técnicas
moleculares.
* Técnicas bioquímicas:
- Microscopia simples (ex. colonização micorrízica)
- Extração simples (ex. macrofauna).
- Estruturas morfológicas (ex. nódulos, fungos ectomicorrízicos, galhas nematoides)
- Nível fisiológico da comunidade
- Atividade enzimática do solo (ex. liberação de Co2 para atmosfera)
- Caracterização dos organismos isolados morfológica, fisiológica, bioquímica e geneticamente.
* Técnicas moleculares:
- Análise de moléculas “assinaturas” (ex. biomarcadores, incluído DNA diretamente extraído do solo)
- Conteúdo de guanina + citosina
- Microarranjos de DNA
Grande número de métodos disponíveis e cada um deles têm suas limitações fornecendo apenas um retrato parcial.
a pergunta foi discutir, não foi? Você apenas citou e de forma extremamente sumária. Em particular, você
não discutiu absolutamente nada em termos de comparação das informações que são obtidas pelos diferentes
métodos
[2.000] Discuta os principais papeis da fauna do solo, e como estes interagem com as demais
características do solo.
A fauna do solo está dividida em três tipos, micro, meso e macrofauna, de acordo com o tamanho dos seus
integrantes.
* Microfauna - composta por protozoários, nematóides, rotíferos, pequenos indivíduos do grupo Collembola, Acari e
outros, cujo diâmetro varia de 4 a 200 μm. Atuam, de maneira indireta, na ciclagem de nutrientes, regulando as
populações de bactérias e fungos e podem afetar a estrutura do solo através de interações com a microflora.
* Mesofauna - possui diâmetro corporal entre 200 μm e 2 mm, é constituída pelos grupos Araneida, Acari,
Collembola, Hymenoptera, Diptera, Protura, Diplura, Symphyla, Enchytraeidae, Isoptera, Chilopoda, Diplopoda e
Mollusca; podendo incluir pequenos indivíduos do grupo Coleoptera. Tem como função a regulação da população
microbiana, fragmentação do resíduo vegetal, alteram a ciclagem de nutrientes e promovem a humificação.
* Macrofauna - possui diâmetro corporal acima de 10 mm (ex. minhocas, besourosformigas, cupins, grilos, caracóis,
aranhas entre outros), são animais de grande mobilidade que exercem importante papel no transporte de materiais,
tanto para confecção de ninhos, quanto para construção de galerias que alcançam profundidades variáveis no solo.
Suas principais funções são: fragmentação do resíduo vegetal e sua redistribuição, misturam partículas orgânicas e
minerais, a predação de outros invertebrados e a contribuição direta na estruturação do solo – “engenheiros do solo”.
embora essencialmente ok, está excessivamente sucinta
[2.200] Os meios de cultura mais comumente utilizados são complexos ou simples?
São os complexos.
* Meios de cultura simples = são quimicamente definidos (normalmente são utilizados para crescimento de seres
autotróficos).
* Meios de cultura complexos = apresentam algum componente que tenha uma composição variável (extratos de
leveduras, de carne, de plantas ou produtos da digestão proteica; quando o meio complexo está na forma líquida, é
chamado de caldo de nutriente e quando está apresentado na forma solidificada é denominado de Agar nutriente =
mais utilizado).
resposta correta, mas realmente parece que você paga por cada palavra...