Relatório de Atividades do Centro de Biotecnologia (2010

Transcrição

Centro de
Biotecnologia
da UFRGS
Relatório de Atividades 2010 a 2013
Centro de Biotecnologia - CBIOT
Centro de Estudos Interdisciplinares
Universidade Federal do Rio Grande do Sul
1.
Introdução
O Centro de Biotecnologia (CBIOT) foi criado em dezembro de 1981, através de
convênio entre o Governo do Estado do Rio Grande do Sul, o Banco de Desenvolvimento
do Estado (BADESUL), a FAPERGS e a UFRGS.
Suas atividades iniciaram em julho de 1982 em área de 220 m2 cedida pelo
Instituto de Pesquisas Agropecuárias (IPAGRO) da Secretaria da Agricultura, com o apoio
financeiro da FAPERGS, BADESUL e Financiadora de Estudos e Projetos (FINEP),
instalando-se no Campus do Vale em 1988. Atualmente o Centro de Biotecnologia ocupa
uma área física de 3.700 m2.
Em 1997, baseado no disposto no Estatuto e Regimento da UFRGS, o CBiot foi
institucionalizado como Centro de Estudos Interdisciplinares, ligado diretamente à Reitoria
(Figura 1).
Assim, conforme normas do Estatuto e do Regimento da UFRGS, a continuação
das atividades do Centro de Biotecnologia, assim como de outros Centros de Estudos
Interdisciplinares, necessita da aprovação do Conselho Universitário, a cada três anos.
Figura 1. Estrutura organizacional da UFRGS – Inserção do Centro de Biotecnologia como Centro
de Estudos Interdisciplinares.
2
Figura 2. Organograma funcional do Centro de Biotecnologia como Centro de Estudos
Interdisciplinares.
3
2.
Objetivos do CBiot
2.1. O CBiot tem como objetivos:
2.1.1. Desenvolver projetos de pesquisa, processos e produtos em biotecnologia e áreas
afins;
2.1.2. Formar recursos humanos em diversos níveis, incluindo pós-graduação, nas áreas
de sua competência técnico-científica;
2.1.3. Promover o intercâmbio e a integração entre as entidades públicas e privadas que
possam contribuir para a pesquisa, o desenvolvimento tecnológico e as atividades
de extensão em biotecnologia;
2.1.4. Proporcionar condições para o estabelecimento de empreendimento em
biotecnologia, principalmente através da sua Incubadora Empresarial (IE-CBiot).
3.
Resultados
Os resultados alcançados pelo CBiot desde a sua criação, em especial nos últimos
anos, como mostrado nos relatórios de atividade, confirmam que este Centro de Estudos
Interdisciplinares contribuiu efetivamente para o desenvolvimento de ações em
Biotecnologia no Rio Grande do Sul e que tem capacidade para desenvolver e aplicar
novas idéias nessa área de atividade.
Pelo presente Relatório, buscamos demonstrar o amplo leque de áreas da
Biotecnologia para cujo desenvolvimento o Centro de Biotecnologia (CBiot) Universidade
Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS) colabora. A qualidade desta contribuição pode ser
verificada pelos projetos que foram financiados por diversas agências de fomento, dentro
de uma competição cada vez maior devido ao aumento do número e da qualidade dos
projetos de investigação submetidos para análise destas agências. O exame da lista dos
artigos científicos publicados por pesquisadores deste Centro e o destino dos seus alunos
egressos também indicam a qualidade do trabalho realizado.
A convocação de membros do CBiot para participarem de cargos de direção e em
comitês de agências reguladoras e de fomento indica o reconhecimento da qualificação
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profissional do pessoal atuante no CBiot. Atualmente, o Presidente da Coordenação de
Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES – Ministério da Educação), Prof.
Jorge Almeida Guimarães, e o ex-presidente da Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado
do Rio Grande do Sul (FAPERGS), Prof. João Antonio Pêgas Henriques, são
pesquisadores do CBiot. O Prof. Augusto Schrank é coordenador da área de Ciências
Biológicas I na CAPES. Vários outros pesquisadores do CBiot participam como membros
de comitês e grupos de trabalho nacionais e internacionais. Também é grande a
participação de docentes do CBiot como membros de comitê editorial e revisores de
artigos de revistas científicas publicadas no Brasil e no exterior.
No final de 2004, a Financiadora de Estudos e Projetos (FINEP), autorizou a
concessão de recursos para revitalização do CBiot, de modo que este Centro finalmente
vencesse os problemas causados pelo incêndio criminoso ocorrido no final de 2003 e
atualizasse seus equipamentos. Estes recursos permitiram recuperar totalmente as
instalações e equipamentos destruídos pelo incêndio e, também, incorporar novos
equipamentos. Dentre os novos equipamentos adquiridos que ampliaram a capacidade
analítica do CBiot destacam-se dois espectrômetros de massa para a análise de proteínas,
equipamentos modernos para cromatografia líquida de alto desempenho, digitalização de
imagens de alta definição e PCR em tempo real. Além disso, a CAPES apoiou a aquisição
de equipamento para a determinação da seqüência de proteínas pela química de Edman.
Assim, o CBiot dispõe hoje de boas condições para trabalhar na área de proteômica e
realizar outras análises de proteínas, fundamentais para o desenvolvimento das pesquisas
na área.
4.
Laboratórios de Pesquisa / Líderes de Grupo
4.1 Laboratório de Imunologia Aplicada à Sanidade Animal
Líder: Itabajara da Silva Vaz Jr.
Descrição: O carrapato Rhipicephalus microplus causa grandes prejuízos econômicos na pecuária,
causando queda na produção de leite e carne, danos ao couro. Atualmente, o controle do carrapato R.
microplus é feito principalmente com o uso de acaricidas. Entretanto, devido à crescente preocupação
com os problemas criados pela poluição química do ambiente, ao alto custo e toxidez das drogas, e ao
aparecimento de carrapatos resistentes a diversas gerações de acaricidas, alternativas para o controle
do R. microplus têm sido procuradas, tais como o desenvolvimento e emprego de vacinas. A linha de
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pesquisa visa identificar alvos com potencial para desenvolvimento de novos métodos de controle do
R. microplus.
Linhas de pesquisa: 1- Imunoparasitologia do carrapato Rhipicephalus microplus | 2Desenvolvimento de teste diagnóstico.
4.2 Laboratório de Biologia Molecular de Cestódeos
Líder: Arnaldo Zaha
Descrição: Os Laboratórios de Biologia Molecular de Cestódeos e de Genômica Estrutural e
Funcional do CBiot estudam vários aspectos da biologia de helmintos parasitas utilizando
metodologias de Biologia Molecular. São estudados genes e proteínas expressos no estágio larval
patogênico (cisto hidático) do cestódeo Echinococcus granulosus, tanto do ponto de vista estrutural
como funcional. Além disso, outro cestódeo, Mesocestoides corti, vem sendo estudado como modelo
para a identificação de genes expressos diferencialmente durante o processo de diferenciação de larvas
em vermes adultos (estrobilização).
Linhas de pesquisa: 1- Biologia Molecular de Echinococcus granulosus; 2- Análise de Genomas; 3Genomas e transcritomas de micoplasmas.
4.3 Laboratório de Biologia Molecular de Fungos Filamentosos
Líder: Augusto Schrank
Descrição: Investigação de aspectos da biologia celular e molecular do processo de infecção de
fungos, em especial, do fungo entomopatogênico Metarhizium anisopliae. O objetivo é descrever, em
nível molecular, o processo de penetração utilizando abordagens dirigidas, como a caracterização de
enzimas hidrolíticas, e globais, como a caracterização de genes que apresentam expressão alterada
durante a infecção e a análise da função de genes com a construção de mutantes insercionais.
Linhas de pesquisa: 1- Biologia celular e molecular de fungos utilizados em controle biológico | 2Estudo de modelos de aplicação do controle biológico empregando fungos
4.4 Laboratório de Peptidases e Enzimas Proteolíticas
Líder: Carlos Termignoni – Associado: Alexandre José Macedo
Descrição: Caracterização bioquímica e fisiológica de proteínas animais e de microorganismos, tendo
como principais áreas de atuação: identificação e caracterização de proteínas de Rhipicephalus
(Boophilus) microplus, visando propor antígenos para o desenvolvimento de uma vacina contra o
carrapato bovino; estudo de proteínas e peptídeos com ação sobre a hemostasia e o sistema
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calicreínas-cininas; caracterização do efeito biológico de enzimas e peptídeos de artrópodes e de
microorganismos; uso de enzimas em tecnologia industrial; caracterização de proteínas com
importância para controle de biofilmes e biodegradação de matéria orgânica.
Linha de pesquisa: Peptidases de importância veterinária
4.5 Laboratório de Proteínas Tóxicas
Líder: Célia Carlini – Associado: Fernanda Stanisçuaski
Descrição: Conhecer o mecanismo de ação de proteínas tóxicas requer a caracterização, em nível
molecular, da toxina e das alterações fisiológicas acarretadas nos organismos afetados. Esse
conhecimento é fundamental para o diagnóstico, tratamento, e prevenção das condições patológicas
causadas por essas toxinas e também serve de base para o desenvolvimento de aplicações
biotecnológicas para essas moléculas. Ureases apresentam propriedades tóxicas independentes de sua
ação enzimática sobre uréia. Ureases são tóxicas contra alguns tipos de insetos e fungos, e são
consideradas fatores patogênicos de microrganismos causadores de doenças no homem e em animais.
Esta linha de pesquisa busca isolar ureases de bactérias, fungos e plantas, caracterizar em nível físicoquímico essas moléculas, clonar e obter expressão heteróloga de genes de ureases e suas proteínas
acessórias, estudar os efeitos tóxicos e mecanismos de ação de ureases em diferentes organismos,
desenvolver aplicações para ureases e peptídeos derivados como biopesticidas.
Linha de pesquisa: Ureases: aspectos moleculares, mecanismos de ação e potencial biotecnológico.
4.6 Laboratório de Biologia Molecular Vegetal
Líder: Giancarlo Pasquali
Descrição: Três conjuntos de atividades são desenvolvidos pelo grupo do Laboratório de Biologia
Molecular Vegetal (LBMV) do Centro de Biotecnologia (CBiot). Na atividade intitulada "Genômica
Vegetal", o objetivo geral do grupo é realizar, em grande escala, o sequenciamento e a análise de
genes expressos e de genomas vegetais. Nesta atividade, destaca-se a participação do LBMV/CBiot
em projetos de genômica estrutural e transcritômica de Eucalyptus grandis e E. globulus. Também
nesta atividade estão concentrados os trabalhos com os transcritomas e genomas de videira (Vitis
vinifera), macieira (Malus x domestica) e mamona (Ricinus communis). Com a atividade de pesquisa
"Isolamento e Caracterização de Genes de Interesse Agroflorestal", o grupo tem por objetivo geral a
disponibilização de genes de interesse e sequências reguladoras de DNA para a introdução e expressão
em plantas. Entre os genes de maior interesse estão àqueles envolvidos na síntese de ligninas, óleos
essenciais, cofatores de ferro-enxofre e de expressão diferencial em diferentes tecidos e órgãos de
Eucalyptus; ureases e outras proteínas tóxicas de soja (Glycine max); genes de videiras responsáveis
pela formação de frutos e sementes; genes de macieira responsáveis pela dormência e pela quebra da
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dormência de brotos; genes de expressão constitutivo em plantas que sirvam de referência em análises
da expressão gênica; genes potencialmente capazes de conferir a resistência vegetal a insetos e a
outras pragas; resistência vegetal a doenças fúngicas; e sequências de DNA com atividade promotora
em plantas. Finalmente, na atividade intitulada "Transformação Genética Vegetal", os objetivos
concentram-se na definição e otimização de protocolos para a transformação genética de células
vegetais, seleção de tecidos transformados, regeneração de plantas transgênicas e avaliação do estado
transgênico nos níveis molecular, bioquímico, genético e biológico. Esta atividade inclui
experimentos desenvolvidos com Eucalyptus, soja, arroz (Oryza sativa), mamona e videira.
Biossegurança de OGMs está, também, inserido neste último conjunto de atividades.
Linhas de pesquisa: 1- Genômica Vegetal; 2- Isolamento e Caracterização de Genes de Interesse
Agroflorestal; 3- Transformação Genética Vegetal.
4.7 Laboratório de Sinalização e Plasticidade Celular
Líder: Guido Lenz
Descrição: Os glioblastomas multiformes, principal tipo de tumor cerebral, possuem um dos piores
prognósticos, com sobrevida média de apenas 12 meses após o primeiro tratamento. O objetivo geral
da linha de pesquisa é uma melhor compreensão da biologia tumoral de gliomas para poder encontar
fármacos e alvos com potencial terapêutico. O foco desenvolve-se em três frentes, que são: 1. a
modulação da autofagia para uma melhor resposta a quimioterápicos e 2. a compreensão do papel das
células tronco tumorais e da reprogramação celular na dinâmica populacional de gliomas em resposta
à terapia. Os estudos são realizados em linhagens e culturas primárias de gliomas de rato,
camundongo e humano, manipulação farmacológica e gênica através da utilização de vetores
lentivirais e avaliações diversas in vitro e in vivo.
Linhas de pesquisa: 1- Papel da Autofagia na resposta de gliomas à quimoterapia | 2- Células tronco
tumorais e reprogramação celular na resposta à quimioterapia.
4.8 Laboratório de Fisiologia Vegetal
Líder: Arthur Germano Fett Neto – Pesquisador Associado: Janette Palma Fett
Descrição: Análise fisiológica (sistemas de cultivo, propagação), bioquímica (enzimas de biossíntese,
fornecimento de precursores químicos), e molecular (expressão e caracterização de genes
codificadores de enzimas ou proteínas regulatórias) da produção de metabólitos secundários de
interesse farmacêutico, agrícola, florestal ou industrial, principalmente alcaloides e terpenos em
espécies arbóreas. Caracterização das fases de indução e formação de raízes em estacas de Eucalyptus
sp. de diferentes graus de recalcitrância ao enraizamento e de ecotipos e mutantes de Arabidopsis
thaliana com diferentes capacidades de rizogênese, visando à identificação de fatores limitantes,
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assim como possíveis mecanismos de superação dos mesmos. Compreensão dos mecanismos
envolvidos na homeostase do ferro em plantas de arroz (incluindo sua absorção, transporte entre
órgãos, células e compartimentos subcelulares, armazenamento, redistribuição, estresses causados por
sua deficiência ou excesso, alocação de ferro para o grão). As análises realizadas envolvem diversas
abordagens: quantificação de nutrientes minerais, medida de atividades enzimáticas, identificação e
avaliação da expressão de genes potencialmente importantes para a homeostase do ferro,
caracterização e construção de linhagens de arroz com mutações em alguns destes genes, expressão de
transportadores de ferro de arroz em linhagens mutantes de levedura, entre outros.
Linhas de pesquisa: 1- Regulação da Produção de Metabólitos Secundários Vegetais de Interesse
Econômico; | 2 - Controle e Mecanismos da Rizogênese Adventícia; | 3 - Nutrição Mineral e Estresses
Abióticos em Plantas
4.9 Laboratório de Genômica Estrutural e Funcional
Líder: Henrique B. Ferreira
Descrição: atualmente desenvolvidas várias linhas de pesquisa na área de biologia molecular de
patógenos de interesse médico e/ou veterinário. Platelmintos parasitas de relevância médica e
veterinária do gênero Echinococcus (Cestoda, Cyclophyllidea, Taeniidaee), causadores de diferentes
formas de hidatidose (ou equinococose), e Mesocestoides corti (Cestoda, Cyclophyllidea,
Mesocestoididae), uma espécie de cestódeo-modelo, estão sendo estudados para (i) a identificação e
caracterização funcional de genes/proteínas relevantes para a relação parasito-hospedeiro no contexto
de infecções crônicas; (ii) a identificação e a caracterização funcional de genes/proteínas expressos
diferencialmente durante o desenvolvimento larval; e (iii) o desenvolvimento de metodologias de
RNAi para a caracterização funcional de genes de cestódeos. Bactérias do gênero Mycoplasma, em
especial Mycoplasma hyopneumoniae e Mycoplasma flocculare, estão sendo estudadas buscando (i) a
identificação de determinantes de virulência ou avirulência; e (ii) a caracterização imunológica de
proteínas antigênicas de M. hyopneumoniae visando ao desenvolvimento de formulações vacinais
recombinantes contra a pneumonia enzoótica suína. Finalmente, em colaboração com outros grupos
de pesquisa, estão sendo desenvolvidos estudos de caracterização de repertórios de proteínas
expressos por estágios de vida patogênicos de protozoários dos gêneros Trypanosoma e
Acanthamoeba.
Linhas de pesquisa: 1- Caracterização dos repertórios de proteínas expressas nos estágios larvais
patogênicos de parasitos do gênero Echinococcus (Platyhelminthes, Cestoda); | 2- Caracterização
estrutural, funcional e imunológica de proteínas de Echinococcus spp. relevantes para interações
parasito-hospedeiro; 3- Cultivo in vitro e caracterização de genes e proteínas expressos
diferencialmente durante o processo de desenvolvimento larval de parasitos cestódeos dos gêneros
Echinococcus (família Taeniidaee) e Mesocestoides (família Mesocestoididae); 4- Estudos genômicos
comparativos e funcionais de micoplasmas para a identificação e caracterização de determinantes de
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patogenicidade e virulência; 5- Estudos proteômicos comparativos e funcionais de protozoários dos
gêneros Trypanosoma e Acanthamoeba para identificação e caracterização de determinantes de
patogenicidade e virulência.
4.10 Laboratório de Microrganismos Diazotróficos
Líder: Irene S. Schrank
Descrição: A bactéria diazotrófica do gênero Azospirillum, que realiza associação com plantas de
importância econômica, está sendo utilizada como modelo no entendimento da organização e
regulação dos genes envolvidos no processo de fixação do nitrogênio. Os genes envolvidos na fixação
biológica do nitrogênio (FBN) são chamados de genes nif e genes fix. Muitos deles estão localizados
em regiões próximas do genoma, organizados em operons. A FBN requer grandes quantidades de
ATP, que é conseguido através da respiração aeróbica. Ao mesmo tempo, a nitrogenase é altamente
sensível ao oxigênio. Estes estudos fornecem informações básicas que possibilitam o entendimento
das inter-relações entre as associações bacterianas e células eucarióticas. Projetos em andamento:
genomica comparativa; expressão gênica diferencial (RDA) entre espécies de Azospirillum.
Linha de pesquisa: Genomica comparativa em especies de Azospirillum.
4.11 Radiologia Molecular
Líder: João Antônio Pegas Henriques – Pesquisador Associado: Diego Bonatto
Descrição: Uso de ferramentas de biologia e de farmacologia de sistemas para avaliação de
mecanismos biológicos complexos, como envelhecimento e senescência, assim como para a
prospecção de novos compostos quimioterápicos para indução do estado de pluripotência celular e
para o tratamento de tumores. Estabelecimento de modelos celulares de adenocarcinomas humanos
para prospecção de novos compostos quimioterápicos. Uso de leveduras para avaliação dos
mecanismos de envelhecimento cronológico. Estabelecimento de modelos de células-tronco
mesenquimais para estudos de mecanismos de diferenciação celular.
Linhas de pesquisa: 1- Aplicação de ferramentas de biologia de sistemas para a avaliação de
processos biológicos complexos; | 2- Avaliação dos
células-tronco
mecanismos de diferenciação celular
mesenquimais; | 3- Reparação do DNA
e
Mutagênese
em
em
Saccharomyces
cerevisiae; | 3- Estudo dos mecanismos de envelhecimento em Saccharomyces cerevisiae; | 4Mecanimos de Reparação de DNA associados com lesões citotóxicas e genotóxicas induzidas por
agentes antineoplásicos; | 5- Estabelecimento de modelos de adenocarcinoma humano para
prospecção de novos compostos quimioterápicos; | 6- Análise das atividades citotóxica, genotóxica e
mutagênica de produtos de origem natural e sintético.
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4.12 Laboratório de Bioquímica Farmacológica
Líder: Jorge Guimarães – Pesquisador Associado: Hugo Verli
Descrição: Identificação, isolamento e caracterização de princípios ativos de origem natural que
atuam e/ou interferem com os processos que compõem o sistema da hemostasia. O alvo principal tem
sido os peptídeos, as enzimas e outras proteínas produzidas por insetos, animais hematófagos e
peçonhentos, que apresentam ação específica sobre as cascatas da coagulação sangüínea e da
fibrinólise, e sobre a agregação plaquetária e eventos vasculares. Em especial, são estudados os
mecanismos fisiopatológicos envolvidos no envenenamento pela taturana Lonomia obliqua, e por
serpentes do gênero Bothrops e pela abelha Apis mellifera. Contribuição relevante também tem sido
dada na pesquisa dos mecanismos envolvidos na infestação pelo carrapato Rhipicephalus microplus e
na identificação da atividade antitrombótica de saponinas obtidas de extratos vegetais.
Linha de pesquisa: Bioinformática Estrutural Aplicada à Macromoléculas Biológicas.
4.13 Laboratório de Fungos de Importância Médica Biotecnológica
Líder: Marilene H. Vainstein – Pesquisador Associado: Charley Christian Staats
Descrição: Cryptococcus neoformans e Cryptococcus gattii são leveduras encapsuladas, agentes
etiológicos da meningite criptocócica, infecção fúngica que acomete o sistema nervoso central e
terceira complicação neurológica mais frequente em pacientes com AIDS. C. neoformans acomete
principalmente pacientes imunocomprometidos, sendo um patógeno oportunista. Já C. gattii é um
patógeno primário que causa infecção em indivíduos imunocompetentes. Estes microrganismos
tornaram-se modelos para estudos moleculares de mecanismos envolvidos no processo de
patogenicidade em fungos. A linha de pesquisa visa elucidar a função de novos fatores de virulência
destas leveduras, relacionados ao processo de interação patógeno-hospedeiro. A identificação e
análise funcional destes genes são realizadas pela aplicação de abordagens como analises
transcricionais e proteômicas globais, nocaute gênico e ensaios de interação com o hospedeiro murino.
Linhas de pesquisa: 1- Bioquímica e biologia molecular de fungos de importância médica e
biotecnológica; 2- Biologia Molecular e Celular do processo de infeccão de Metarhizium anisopliae;
3- Análise funcional de genes de virulência de Cryptococcus neoformans e Cryptococcus gattii; 4Producão de proteínas de interesse biotecnológico.
4.14 Laboratório de Genoma e População de Plantas
Líder: Rogério Margis
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Descrição: Os microRNAs foram identificados como sendo mais um dentre os vários agentes que
regulam a expressão gênica em eucariotos. Sua atuação pode ocorrer por repressão da tradução ou por
modulação da concentração dos mRNA dos genes alvos por processos de clivagem sítio específica.
Após a identificação dos miRNA, que vem crescendo em escala exponencial nos diversos organismos,
há a necessidade de conhecer-se em que células, tecidos, órgãos e etapas do desenvolvimento eles
estão presentes e quais os genes que estão sendo regulados. A modulação da expressão de miRNAs
pode ocorrer em diferentes condições de estresses bióticos e abióticos. A compreensão e domínio dos
mecanismos envolvidos nesta modulação possuem imenso potencial biotecnológico e diagnóstico e
constituem um dos principais focos do grupo de pesquisa.
Linha de pesquisa: MicroRNAs: Identificação, Análise do Padrão de Expressão e Genes Alvo.
4.15 Unidade de Química de Proteínas e Espectrometria de massas – multiusuário
Responsável Charley Christian Staats
A Unidade de Química de Proteínas e Espectrometria de Massas (Uniprote-MS) do Centro de
Biotecnologia da UFRGS entrou em operação em outubro de 2007. Possui sistema LC-ESI-MS/MS,
composto de espectrômetro de massas Micro-Q-ToF com sistema de nanoAcquity dedicado, um
espectrômetro de massas MALDI-ToF, um microsequenciador de proteínas por química de Edman, e um
sistema HPLC bidimensional preparativo, vários cromatógrafos do tipo HPLC, quatro sistemas de
eletroforese bi-dimensional, três sistemas digitais de análise de imagens e outros equipamentos acessórios. O
conjunto desses equipamentos representou investimentos de mais de R$ 2 milhões, recursos concedidos pela
CAPES e pela FINEP.
A Uniprote-MS tem por objetivo atender pesquisadores e alunos vinculados ao Centro de Biotecnologia
da UFRGS, em análises proteômicas (peptide fingerprint), sequenciamento (N-terminal e por MS/MS) de
proteínas e peptídeos, caracterização de modificações pós-traducionais em proteínas e peptídeos.
Com sua infraestrutura atual, o UNIPROTE-MS analisa dezenas de amostras protéicas diariamente,
com identificação de dezenas a centenas de proteínas e/ou peptídeos por amostra. São atendidas demandas de
fracionamento e identificação de proteínas e peptídeos de grupos de pesquisa vinculados a diferentes
unidades da UFRGS e de outras universidades brasileiras (UFSC, UFPR, UFC e UFRN, entre outras) e
estrangeiras (UDELAR-Uruguai e a U. de Chile, entre outras). Na UFRGS, as unidades atendidas incluem,
além do próprio CBiot, o IB, o ICBS e o Instituto de Química, abrangendo vários Programas de PósGraduação (PPGs). Desde a consolidação de estratégias de trabalho na Uniprote-MS, mais de 7.500 análises
já foram realizadas nos equipamentos da unidade. Resultados obtidos desde 2007 na Uniprote-MS já foram
utilizados em mais de 20 teses e dissertações e resultaram na publicação de dezenas de artigos de alto
impacto.
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5 Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular
No período de 2010-2013, foram aprovadas 89 dissertações de mestrado e 64 teses de
doutorado no Programa de Pós-graduação em Biologia Celular e Molecular (PPGBCM), Programa
sob a responsabilidade do CBiot. É importante ressaltar que este Programa possui conceito 6 (de
um máximo de 7), caracterizado como de excelência internacional, junto à CAPES.
6 Incubadora Empresarial CBiot
As incubadoras de empresas são ambientes dotados de capacidade técnica, gerencial,
administrativa e infraestrutura para amparar o pequeno empreendedor. Elas disponibilizam espaço
apropriado e condições efetivas para abrigar idéias inovadoras e transformá-las em
empreendimentos de sucesso.
A IE-CBiot apóia empresas nas áreas de saúde humana e animal, agroindústria e meio
ambiente. Além disso, promove atividades de ensino e treinamento de recursos humanos altamente
qualificados na sua área de atuação.
As empresas Bioplus, Ludwig e NoddTech foram graduadas neste período.
Figura 3. Organograma funcional da Incubadora de Empresas (IE-CBiot) do Centro de
Biotecnologia.
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Recursos Recebidos e Utilizados no período (2010-2013)
DESCRIÇÃO
VALOR TOTAL
(R$)
PROJETOS DE PESQUISAS DOS DOCENTES
4.598.961,97
LÍDERES DE GRUPOS
DOTAÇÃO ORÇAMENTÁRIA UFRGS
141.949,44
PROJETO CBIOT - FAURGS
334.174,45
PPGBCM
3.958.619,96
TOTAL GERAL
9.033.705,82
Detalhamento de Projetos de Pesquisa Concedidos no período, Órgãos Financiadores,
Respectivos Coordenadores e Colaboradores
●
Sistema de expressão e sequências promotoras artificiais para a regulação gênica
em plantas.
Valor: R$ 300.000,00 (CAPES)
Vigência: 2009-2014
Coordenador: Giancarlo Pasquali
Professores colaboradores: --
●
Identificação de biomarcadores para a detecção e diferenciação precoce de
hepatites.
Valor: R$ 60.000,00 (CNPq)
Coordenador: Marilene Henning Vainstein
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●
Proteínas bioluminescentes de bactérias marinhas: biomarcadores para o
monitoramento in vivo da infecção pelas leveduras patogênicas Cryptococcus
neoformans e Cryptococcus gattii.
Valor: R$ 546.301,00 (CNPq)
●
Desenvolvimento de soluções biotecnológicas eficientes e ambientalmente corretas
visando redução de custo da produção de biodiesel e melhorias da qualidade de
armazenamento.
Valor: R$ 811.989,28 (CNPq)
●
Identificação e caracterização de novos determinantes de virulência de patógeno
humano.
Valor: R$ 76.875,00 (CNPq)
●
Prospecção e caracterização de toxinas e princípios ativos de natureza protéica da
biodiversidade vegetal, animal e microbiana brasileira com potencial aplicação
biotecnológica nas áreas médica, agropecuária e sanitária.
Valor: R$ 803.000,00 (CAPES)
●
Implantação do laboratório de serviços biotecnológicos da IE-Cbiot.
Valor: R$ 255.608,00 (CNPq)
●
Inovação em estratégias imunoterapêuticas para o tratamento de infecções fúngicas
emergentes.
Valor: R$ 102.960,00 (CNPq)
●
Utilização de flagelina como imunomodulador de antígenos recombinantes para a
profilaxia e terapêutica de criptococose e candidíase.
Valor: R$ 1.010.074,50 (FINEP)
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Professores colaboradores: -●
Estudo de proteínas potencialmente envolvidas na interação parasito-hospedeiro
durante a infecção pelo metacestódeo de Echinococcus granulosus
(Platyhelminthes, Cestoda).
Valor: R$ 79.622,00 (CNPq)
Professores colaboradores: Henrique Bunselmeyer Ferreira
●
Regulação transcricional em micoplasma.
Valor: R$ 30.000,00 (FAPERGS)
Coordenador: Irene Silveira Schrank
●
Avaliação de antígenos recombinantes de Mycoplasma hyopneumoniae:
desenvolvimento de vacinas e testes diagnósticos.
Valor: R$ 499. 943,00 (MAPA/FINEP)
Coordenador: Odir Delagostin
Professores colaboradores: Irene Silveira Schrank, Arnaldo Zaha, Henrique
Ferreira, Augusto Schrank, Marilene Vainstein
●
Inibidores de proteases em carrapatos bovinos e seu potencial para uso em vacinas.
Valor: R$ 150.000,00 (Mais Bolsas - CNPq)
Coordenador: Itabajara da Silva Vaz Junior
Professores colaboradores: Carlos Termignoni
●
Programas de Pós-graduação da UFRGS, UENF, FIOCRUZ e UFRJ: Estímulo à
formação de recursos humanos em parasitas e vetores.
Valor: R$ 147.800,00 (Subprojeto - Mais Bolsas - CAPES)
●
Núcleo de excelência em desenvolvimento de vacinas veterinárias.
Valor: R$ 117.400,00 (Subprojeto - FAPERGS)
Coordenador: Odir Dellagostin
Professores colaboradores: Itabajara da Silva Vaz Junior e Carlos Termignoni
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●
Caracterização bioquímica e imunológica de cistatinas de Rhipicephalus
(Boophilus) microplus.
Valor: R$ 69.500,00 (FAPERGS)
●
Interação científico-acadêmica entre a UFRGS, UENF e UDELAR: Consolidação
de linhas de pesquisa e formação de recursos humanos.
Valor: R$ 30.000,00 (Mais bolsaas - CNPq)
Coordenador: Aoi Masuda
●
Instituto Nacional de Entomologia Molecular.
Valor: R$ 200.000,00 (Subprojeto - CNPq)
Coordenador externo: Pedro L. Oliveira
●
Caracterização da cisteíno endopeptidase VTDCE como indutora de uma resposta
imune protetora contra Rhipicephalus (Boophilus) microplus.
Valor: R$ 20.000,00 (CNPq)
Coordenador externo: Adriana Seixas
●
Identificação e caracterização de marcadores biológicos e diagnósticos em
tripanosomatídeos patogênicos através de genômica e proteômica.
Valor: R$ 50.000,00 (Genoprot/FINEP)
Coordenador externo: Edmundo C. Grisard (UFSC)
Professores colaboradores: Henrique Bunselmeyer Ferreira (Participante)
●
Estudo de proteínas potencialmente envolvidas na interação parasito-hospedeiro
durante a infecção pelo metacestódeo de Echinococcus granulosus
(Platyhelminthes, Cestoda).
Valor: R$ 79.622,00 (CNPq Edital Universal 2009)
Coordenador: Arnaldo Zaha
●
Estudo da estrutura oligomérica do antígeno B do parasito Echinococcus
granulosus (Platyhelminthes, Cestoda).
Valor: R$ 15.933,96 (CNPq Edital Universal 2008)
Coordenador: Arnaldo Zaha
17
●
Estudo de proteínas relacionadas ao estabelecimento e desenvolvimento da forma
larval patogênica de Echinococcus granulosus.
Valor: R$ 30.000,00 (CNPq/CONICYT – Edital CNPq nº 60/2008 Convênios
Bilaterais- Américas)
Coordenador Brasil: Henrique Bunselmeyer Ferreira
Coordenador Chile: Norbel Galanti
●
Genômica funcional de microrganismos patogênicos.
Valor: R$ 46.544,88 (Edital MCT/CNPq/CT-Bio/CBAB n° 31/2008 – Cursos de
Formação de Recursos Humanos em Biotecnologia CBAB)
Coordenador: Henrique Bunselmeyer Ferreira
●
Caracterização funcional de proteínas expressas na fase larval de Echinococcus
granulosus e de interações proteicas relevantes na interface parasito-hospedeiro
durante a infecção crônica.
Valor: R$ 40.000,00 (Edital Universal 14/2011 do CNPq - Faixa B)
●
Estudo de aspectos moleculares da biologia de platelmintos parasitas da classe
Cestoda.
Valor: R$ 447.200,00 (Edital CAPES PROGRAMA NACIONAL DE INCENTIVO À
PESQUISA EM PARASITOLOGIA BÁSICA - EDITAL nº 032/2010)
Professores colaboradores: -●
Prospecção e estudos funcionais de proteínas relevantes para a relação parasitohospedeiro na hidatidose cística e na hidatidose alveolar.
Valor: R$ 48.000,00 (FAPERGS 02/11 - Programa Pesquisador Gaúcho – PqG)
●
Investigação de funções moonlighting das enzimas glicolíticas enolase e frutosebifosfato-aldolase de Echinococcus granulosus no contexto de interações parasitohospedeiro.
Valor: R$ 17.500,00 (CNPQ Universal 2012)
18
●
Identificação e caracterização de repertórios de proteínas e microRNAs de
Echinococcus granulosus expressos na fase larval patogênica de diferentes
genótipos do parasito que ocorrem no Brasil e na Argentina.
Valor: R$ 13.000,00 (CAPES/MINCYT 2013)
Coordenador Brasil: Henrique Bunselmeyer Ferreira
Coordenadora na Argentina: Dra. Mara Rosenzvit
●
Obtenção e integração de dados genômicos de helmintos em um novo banco de
dados relacional, FlatDB, para identificação de candidatos a alvos terapêuticos.
Valor: R$ 99.500,00 (MCTI/CNPq/CBAB N º 21/2012)
Coordenador externo: Guilherme Correa de Oliveira (CPqRR-FIOCRUZ, MG)
Coordenador UFRGS: Henrique Bunselmeyer Ferreira
●
Os venenos animais: do diagnóstico ao tratamento do envenenamento / da estrutura
ao mecanismo de ação das toxinas.
Valor: R$ 387.000,00 (CAPES)
Coordenador externo: Russolina Zingali
Coordenador interno: Carlos Termignoni
●
Explorando o carrapato bovino Rhipicephalus (Boophilus) microplus: identificação
de antígenos para vacina.
Valor: R$ 36.900,00 (CNPq)
Coordenador: Carlos Termignoni
●
Apoio a Eventos Científicos / apoio à participação em eventos científicos no
exterior.
Valor: R$ 5.000,00 (CNPq)
Vigência: 2011
●
Identificação de proteínas ligadoras de heparina para a seleção de alvos para
vacinas parasitárias.
Valor: R$ 8.570,85 (CNPq)
Professores colaboradores: Prof. Itabajara da Silva Vaz Júnior, Profa. Patrícia
Berasain (Universidad de la Republica, Montevideo, Uruguai)
19
●
Identificação e clonagem dos genes de cininases salivares do carrapato bovino
Rhipicephalus (Boophilus) microplus.
Valor: R$ 35.750,00 (CNPq)
●
Determinação da sequência de aminoácidos e produção de dois anticoagulantes da
saliva do carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus.
Valor: R$ 28.800,00 (CNPq)
●
Análise funcional de fatores de transcrição reguladores do metabolismo de zinco
em Cryptococcus gattii.
Valor: R$ 18.950,00 (CNPq)
Coordenador: Charley Staats
Professores colaboradores: Augusto Schrank, Marilene Henning Vainstein
●
Homeostase de metais no processo de interação patógeno e hospedeiro.
Valor: R$ 22.000,00 (CNPq)
Coordenador: Charley Staats
Professores colaboradores: Augusto Schrank, Marilene Henning Vainstein
●
Caracterização funcional de potenciais transportadores vacuolares de ferro e zinco
em plantas de arroz.
Valor: R$ 69.600,00 (CNPq - Universal)
Coordenador: Janette Palma Fett
Professores colaboradores: David Salt (Purdue University - USA), Michael
Grusak (United States Department of Agriculture (USDA), Houston - USA),
Marcelo Menossi Teixeira (Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP) e
Carla Andréa Delatorre (Faculdade de Agronomia – UFRGS).
Brazilian Rice Ionomics Collaborative - Projeto de colaboração internacional,
complementar a projeto maior, coordenado pelo Dr. David Salt e financiado pela
NSF, intitulado “Ionome to the Genome: Mapping the Gene Networks Controlling
Nutrient Content in Rice Grain”.
Valor: R$ US $ 99.126,00 (NSF - National Science Foundation - USA)
Coordenador: Dr. David Salt (Purdue University, USA)
Professores colaboradores: Equipe no Brasil: Janette Palma Fett (UFRGS),
Marcelo Loureiro (UFV), Antonio Oliveira (UFPel), Equipe nos Estados nidos:
Mary Lou Guerinot (Dartmouth College - USA), Shannon Pushon (USDA - USA),
além do Dr. David Salt (coordenador).
20
The iHUB: A Collaborative International Network for Ionomics.
Valor: US $ 534,173 (NSF -National Science Foundation - USA)
Coordenador: Dr. David Salt (Purdue University, USA, e University of Aberdeen,
UK)
Professores colaboradores: Janette Fett (Universidade Federal do Rio Grande do
Sul, Brazil) e outros pesquisadores externos ao Brasil.
●
Identificação de novos genes responsivos ao frio em cultivares de arroz (Oryza
sativa L.) da subespécie indica durante as fases iniciais do desenvolvimento.
Valor: R$ 40.000,00 (FAPERGS – Pesquisador Gaúcho 2012)
Professores colaboradores: Luis Mauro Gonçalves Rosa (Faculdade de
Agronomia, UFRGS) e Raul Antonio Sperotto (UNIVATES, Lageado, RS)
●
Caracterização avançada de transportadores de metais em plantas de arroz.
Valor: R$ 23.000,00 (CNPq – Universal)
Professores colaboradores: Mary Lou Guerinot (Dartmouth College, USA),
Lorraine E. Williams (University of Southampton, UK) e David Salt (University of
Aberdeen, Scotland)
●
Estresses em Plantas Cultivadas: Elucidação de Mecanismos e Desenvolvimento de
Tecnologias de Mitigação.
Valor: R$ 545.000,00 (EDITAL FAPERGS/ CNPq n. 008/2009 - PROGRAMA
DE APOIO A NÚCLEOS DE EXCELÊNCIA PRONEX)
Coordenador: Paulo Regis Ferreira da Silva (Faculdade de Agronomia, UFRGS)
Professores colaboradores: Janette Palma Fett e vários outros docentes da UFRGS
e de outras Universidades.
●
Bases moleculares da oleorresinose em Pinus elliotti.
Valor: R$ 53.790,00 (CNPq- Universal)
Coordenador: Arthur G. Fett-Neto
Professores colaboradores: Prof. Gary Peter – University of Florida- Gainesville –
USA
Aumentos de temperatura e CO2: impactos no metabolismo primário e secundário
de Eucalyptus grandis
Valor: R$ 45.000,00 (CNPq- Universal)
Professores colaboradores: Prof. Paulo Mazzafera – Unicamp
Expressão de genes relacionados à ação de auxina durante o enraizamento
adventício de Eucalyptus globulus Labill
21
Valor: R$ 20.000,00 (FAPERGS – PESQUISADOR GAÚCHO)
Professores colaboradores: -Sequestro de carbono em florestas plantadas de Pinus elliottii no litoral sul do RS
Valor: R$ 23.760,00 (FAPERGS – Edital Mudanças Climáticas 2010)
Professores colaboradores: -Teste de pastas indutoras de oleorresina de Pinus combinando vias de sinalização
Valor: R$ 72.000,00 (IRANI CELULOSE - FAURGS)
8 Formação de Recursos Humanos (2010-2013)
Dissertações de Mestrado Concluídas no Período
(Total de 56 Dissertações concluídas durante o período)
Adriana Dalpicolli Rodrigues (2012). Atividade antioxidante, anticonvulsivante e
comportamental de suco de uva bordô orgânico e convencional, em ratos wistar. Orientador: Joao
Antonio Pegas Henriques.
Aline Teichmann (2010). Clonagem e expressão da proteína 14-3-3epsilon1 de Echinococcus
granulosus em Escherichia coli. Orientador: Henrique Bunselmeyer Ferreira.
Ana Carolina Perpétua Joazeiro (2012). Detecção e diferenciação de Anaplasma marginale e
Anaplasma centrale por reação em cadeia de polimerase (PCR). Orientador: Itabajara da Silva Vaz
Junior.
Ana Paula Christoff (2012). Caracterização funcional de fitocistatinas de arroz (Oryza sativa).
Orientador: Rogerio Margis.
Andrew Oliveira Silva (2012). Silenciamento de xiap potencializa os efeitos da superexpressão de
P53 na redução da proliferação e aumento da morte celular em gliomas. Orientador: Guido Lenz.
Angela Junges (2010). Expressão do peptídeo tóxico jaburetox da leguminosa Canavalia
ensiformis no fungo entomopatogênico Metarhizium anisopliae. Orientador: Augusto Schrank.
Anna Carolina Alves Yendo (2012). Tratamentos pós-colheita de folhas e acúmulo de saponinas
bioativas de Quillaja brasiliensis. Orientador: Arthur Germano Fett Neto.
22
Augusto Frantz Uberti (2010). Urease do Helicobacter pylori: ativação de plaquetas e neutrófilos.
Orientador: Celia Regina Ribeiro da Silva Carlini.
Bárbara Kunzler Souza (2011). Abordagens para a caracterização do processo de penetração do
entomopatógeno Metarhizium anisopliae. Orientador: Augusto Schrank.
Bruna Ferreira Leal (2012). Caracterização funcional e avaliação imune de um antígeno salivar
do carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Co-Orientador: Itabajara da Silva Vaz Junior.
Carlo Frederico Moro (2010). Comportamento do peptídeo entomotóxico Jaburetox-2Ec em
solução e a sua interação com lipossomas miméticos de plaquetas humanas. Orientador: Celia
Regina Ribeiro da Silva Carlini.
Carolina Acevedo (2012). Caracterización de una cistatina tipo ii de poblaciones de Rhipicephalus
microplus de Uruguay. Orientador: Itabajara da Silva Vaz Junior.
Caroline Oliveira da Silva Frozza (2012). Caracterização química e avaliação da atividade
biológica da própolis vermelha em célulastumorais e não tumorais. Co-Orientador: Joao Antonio
Pegas Henriques.
Clara Forrer Charlier (2012). Influência da variabilidade genética sobre biomarcadores de dano
oxidativo e não oxidativo em pacientes com doença pulmonar obstrutiva crônica (DPOC).
Orientador: Joao Antonio Pegas Henriques.
Cláudia Egres Coutinho (2010). Isolamento e identificação de leveduras do complexo
Cryptococcus neoformans que comprometem a segurança no serviço de saúde do rio grande do sul:
avaliação ambiental interna do hospital de pronto socorro (HPS) e recomendações para prevenção
das patogenias relacionadas. Orientador: Marilene Henning Vainstein.
Cristiano Trindade (2012). Avaliação do Potencial Antigenotóxico e Antimutagênico do
Ditelureto de Difenila em Fibroblastos de Pulmão de Hamster Chinês V79. Orientador: Joao
Daiane Patrícia Oldiges (2012). Caracterização da rVTDCE de Rhipicephalus (Boophilus)
microplus: uma peptidase antimicrobiana. Orientador: Carlos Termignoni.
Daniele Chaves Kühleis (2013). Epidemiologia da tuberulose em uma penitenciária do Rio
Grande do Sul. Orientador: Arnaldo Zaha.
Eduardo Cremonese Filippi Chiela (2011). A autofagia e o ciclo celular desempenham papel
central no mecanismo de ação do resveratrol e do co-tratamento com temozolomida em células de
linhagens de glioblastoma humano. Orientador: Guido Lenz.
Elisa Simon (2012). Análise de alterações morfológicas associadas a mutação de tropomiosina em
Cryptococcus gattii. Orientador: Marilene Henning Vainstein.
Emilly Schlee Villodre (2012). Estratégias farmacológicas para a redução da população de células
tronco tumorais em glioblastoma. Orientador: Guido Lenz.
Fernanda Cruz (2012). Sistemática e filogenética molecular do gênero Hexachlamys (Myrtaceae)
através do uso de marcadores plastidiais e nucleares. Orientador: Rogerio Margis.
Franciele Cristina Kipper (2013). Investigação do envolvimento da NTPD ase2 nos processos de
adesão célula-célula, célula-matriz, migração e proliferação. Orientador: Guido Lenz.
23
Franciele Maboni (2010). Organização das unidades de transcrição em Mycoplasma
hyopneumoniae. Orientador: Irene Silveira Schrank.
Genaro Azambuja Athaydes (2010). Clonagem caracterização e expressão de genes envolvidos
na síntese de compostos isoprenóides em Eucalyptus grandis. Orientador: Giancarlo Pasquali
Giovana Vera Bortolini (2012). Atividade antioxidante, antigenotóxica de extratos de folhas de
Vitis labrusca (variedade isabel) orgânica e convencional em células de mamífero V79. Orientador:
Joao Antonio Pegas Henriques.
Grethel León Méjia (2011). Avaliação dos efeitos genotóxicos e citogenéticos na população de
trabalhadores de mineração de carvão do Cerrejón (Guajira-Colômbia) utilizando diferentes
biomarcadores. Orientador: Joao Antonio Pegas Henriques.
Guilherme Brzoskowski dos Santos (2012). Estudo populacional dos parasitos neotropicais
Echinococcus vogeli e Echinococcus oligarthrus. Orientador: Arnaldo Zaha
Guilherme Cordenonsi (2011). Identificação do vírus do mosaico do pepino no genoma da soja e
seu reconhecimento pelo sistema de produção de pequenos RNAs. Orientador: Rogerio Margis.
Guilherme Loss de Morais (2010). Caracterização filogenética das Proteínas Inativadoras de
Ribossomos (RIPs) de mamona (Ricinus communis L.) e análise da expressão gênica das RIPs
durante estádios do desenvolvimento da semente. Orientador: Rogerio Margis.
Hélio Nitta Matsuura (2012). Papel do alcalóide glicopiranosilvincosamida (GPV) na resposta a
dano mecânico, herbivoria e UV em Psychotria leiocarpa. Orientador: Arthur Germano Fett Neto.
João Antonio Debarba (2013). Marcação e detecção de proteínas sintetizadas durante o
desenvolvimento estrobilar de Echinococcus granulosus in vitroces e células de Echinococcus
granulosus in vitro. Orientador: Arnaldo Zaha
Joemerson Osório Rosado (2010). Análise de redes de interações entre drogas quimioterápicas
usadas no tratamento de câncer gástrico: explorando proteínas e processos biológicos por meio de
ferramentas de farmacologia de sistemas. Orientador: Joao Antonio Pegas Henriques.
Juliana Beringer (2011). Estratégias genômicas e proteômicas no estudo da expressão de fatores
de virulência em Metarhizium anisopliae. Orientador: Augusto Schrank.
Juliana Ferraz de Correa (2012). Identificação de proteínas envolvidas na resposta de
Cryptococcus gattii à temperatura de infecção. Orientador: Marilene Henning Vainstein.
Karina Rodrigues Lorenzatto (2011). Estudo de enzimas da via glicolítica de Echinococcus
granulosus com possíveis funções moonlighting na interação da forma larval com o hospedeiro
intermediário. Orientador: Henrique Bunselmeyer Ferreira.
Lorrayne Gomes Molina (2012). Identificação e análise de expressão de microRNAs em tecidos
florais de soja (Glycine max (L.) Merrill). Orientador: Rogerio Margis.
Lucas Moitinho e Silva (2010). Caracterização da sinal-peptidase I de Mycoplasma
hyopneumoniae. Orientador: Henrique Bunselmeyer Ferreira.
Lucas Tirloni (2012). dentificação e caracterização de inibidores de serino-endopeptidases de
Riphicephalus (Boophilus) microplus. Orientador: Carlos Termignoni.
24
Luis Felipe Ingrassia Campesato (2010). Silenciamento da ecto-5 nucleotidase/CD73 altera a
progressão de gliomas. Co-Orientador: Guido Lenz
Luís Fernando Parizi (2010). Proteção cruzada contra a infestação de Rhipicephalus (Boophilus)
microplus em bovinos vacinados com a Glutationa S-transferase recombinante de Haemaphysalis
longicornis. Orientador: Itabajara da Silva Vaz Junior.
Luiz Carlos Saramago Gonçalves (2012). Inibição da triose fosfato isomerase (tim) do carrapato
bovino Rhipicephalus (Boophilus) microplus com metilmetano tiosulfonato (mmts), ácido 5,5´ditio-bis 2-nitrobenzóico (dntb), anticorpos monoclonais e construção de uma mutação no
aminoácido 86. Coorientador: Itabajara da Silva Vaz Junior.
Luiz Felipe Valter de Oliveira (2011). Aspectos funcionais e evolutivos da família WAK em
Oryza sativa. Orientador: Rogerio Margis.
Lyda Espidia Perez (2011). Influência de polimorfismos em genes de metabolismo de
Xenobióticos e Reparo do DNA no Risco Ocupacional de Mineiros de carvão a céu aberto.
Márcia Almeida Rodrigues (2011). Determinação de genes-referência e análise da expressão de
transportadores de auxina em Eucalyptus globulus e Eucalyptus grandis. Orientador: Arthur
Germano Fett Neto.
Márcia Rodrigues Sandri (2010). Desenvolvimento de um biorremediador biológico para
tratamento de resíduo da indústria de Petróleo. Orientador: Marilene Henning Vainstein.
María Fernanda Alzugaray Gastellú (2012). Búsqueda del antígeno oculto Bm05 en garrapatas
del ganado vacuno Rhipicephalus (Boophilus) microplus, producción de la proteína recombinante y
evaluación de su uso en vacunas. Orientador: Itabajara da Silva Vaz Junior.
Marina Schumacher Defferrari (2010). Ação tóxica da urease de Canavalia ensiformis e do
peptídeo recombinante jaburetox-2Ec sobre Oncopeltus fasciatus (Hemiptera: Lygaidae).
Orientador: Celia Regina Ribeiro da Silva Carlini.
Pâmela Perini (2011). Seleção de genes-referência para estudos de expressão gênica em macieiras.
Orientador: Giancarlo Pasquali.
Patrícia Mendes Jorge (2012). Estudo do mecanismo de ação do Ditelureto de difenila e sua
possível interação com ezimas topoisomerase. Orientador: Joao Antonio Pegas Henriques.
Poliana Leopoldino Ansolin (2013). Co-expressão das subunidades EgB8 /2 e EgB8/3 do
antígeno B de Echinococcus granulosus em E coli. Orientador: Arnaldo Zaha
Rangel Celso Souza (2011). Sistema de comparação d egenomas de procariotos - SCGP. CoOrientador: Arnaldo Zaha.
Raquel Calloni (2013). Caracterização Molecular de células tronco isoladas de fetos de Gallus
gallus.Orientador: Joao Antonio Pegas Henriques.
Rodrigo Ligabue Braun (2010). Conformação estrutural de ureases de Canavalia ensiformis. CoOrientador: Celia Regina Ribeiro da Silva Carlini.
25
Taís Cestari de Brito (2010). Polimorfismos em CYP2E1, GSTM1 e GSTT1 e hepatotoxicidade
no tratamento da tuberculose. Orientador: Arnaldo Zaha.
Yasmine Serafini Micheletto (2010). Estudo físico-químico da interação da urease de jack bean
com lipossomas miméticos de plaquetas humanas. Co-Orientador: Celia Regina Ribeiro da Silva
Carlini.
Teses de Doutorado Concluídas no Período
(Total de 47 Teses concluídas durante o período)
Alessandra Luiza Pelegrini (2012). O silenciamento da quinase humana Nek1 altera a resposta a
danos ao DNA induzidos por agente indutor de crosslinks. Orientador: Guido Lenz.
Alessandra Sayuri Kikuchi Tamajusuku (2010). Expressão e funcionalidade do receptor p2x7
em linhagem de Glioma de camundongo GL261. Orientador: Guido Lenz.
Ana Cristina Arend (2010). Genotipagem de Echinococcus granulosus de cistos bovinos e análise
da expressão dos genes que codificam as subunidades do antígeno B. Orientador: Arnaldo Zaha.
Ana Lúcia Arigony (2013). Avaliação do efeito do micronutriente Ferro (Fe) na viabilidade
celular e estabilidade genômica de culturas celulares de fibroblasto pulmonar (MRC5) e
hepatorcarcinoma (Hep G2) humanos. Orientador: Joao Antonio Pegas Henriques.
Ana Paula Franco Lambert (2010). Estudo da integridade genômica durante o processo de
diferenciação de células-tronco adultas em células com características neurais. Orientador: Joao
Andrea Lúcia Gonçalves da Silva (2013). Dano oxidativo, reparação do dna e a influência de
polimorfismos genéticos na fisiopatogenia da doença pulmonar obstrutiva crônica. Orientador:
Anne Helene de Souza Martinelli (2012). Jaburetox, peptídeo tóxico derivado da urease: estudos
de estrutura e função. Orientador: Celia Regina Ribeiro da Silva Carlini.
Beatriz Wiebke-Strohm (2010). Obtenção de plantas estavelmente transformadas pelo sistema
integrado bombardeamento/Agrobacterium e análise funcional dos genes que codificam as ureases
estruturais da soja. Co-Orientador: Giancarlo Pasquali.
Carolina Michels Ruedell (2012). Enraizamento adventício de Eucalyptus glubulus em sistema in
vitro e ex vitro. Orientador: Arthur Germano Fett Neto.
Danielle Costenaro da Silva (2010). Identificação e Caracterização do perfil transcricional de
genes durante o desenvolvimento inicial do fruto videira sem sementes (Vitis vinifera L.v."
Sultanina. Orientador: Giancarlo Pasquali.
Diana Bordin (2013). Ativação de autofagia ao tratamento com oxaliplatina em células de câncer
colorretal. Orientador: Joao Antonio Pegas Henriques.
Dinara Jaqueline Moura (2010). Estudo das funções da proteína Kin3 de Saccharomyces
cerevisiae na resposta e danos no DNA. Co-Orientador: Guido Lenz.
26
Fernanda Mosena Munari (2013). Estudos das interações do gene PSO2 de Saccharomyces
cerevisiae com genes da resposta a danos no DNA após tratamento com agentes indutores de
pontes intercadeias. Orientador: Joao Antonio Pegas Henriques.
Fernanda Sá Spies (2011). Determinação do custo biológico em isolados de Mycobacterium
tuberculosis com mutações nos genes rpsL, rrs, gidB, rpoB e katG. Orientador: Arnaldo Zaha.
Fernando Hayashi Sant´Anna (2011). Estudo da bactéria promotora de crescimento vegetal
Azospirillum amazonense: aspectos genomicos e ferramentas genéticas específicas. Orientador:
Irene Silveira Schrank.
Franceli Rodrigues Kulcheski (2013). Identificação e análise da expressão de microRNAs em
soja sob estresse biótico e abiótico. Orientador: Rogerio Margis.
Gabrielle Dias Salton (2011). Importância de motivos conservados do fator de inicio de tradução
2b (eIF 2b ) na síntese de proteínas e na distribuição subcelular desse fator em células humanas.
Co-Orientador: Guido Lenz.
Guilherme Loss de Morais (2013). Micro RNAs de sementes de soja madura e em germinação e
transferRNA-derived fragments (tRFs) associados a proteínas argonauta de Arabidopsis.
Orientador: Rogerio Margis. .
Iuri Marques de Oliveira (2013). Nitrorredutades: um estudo das possíveis funções na resposta ao
estresse oxidativo.Orientador: Joao Antonio Pegas Henriques.
Jose Eduardo Vargas (2013). Estudos in vitro e in silico dos mecanismos moleculares da
senescência celular em glioblastomas. Orientador: Guido Lenz.
José Reck Junior (2011). Caracterização do parasitismo por Ornithodoros brasilienses
(Chelicerata:Argasidae) e da toxicose induzida em humanos e animais. Co-Orientador: Jorge
Almeida Guimaraes.
Juliana Crestani (2011). Análise proteômica do fungo Cryptococcus gattii sob limitação de ferro.
Orientador: Marilene Henning Vainstein.
Juliana de Marco Salvadori (2011). Caracterização da patogenicidade de nematoides
entomopatogênicos e de bactérias associadas para o controle biológico de Spodoptera frugiperda
(Lepidoptera: Noctuidae). Orientador: Celia Regina Ribeiro da Silva Carlini.
Julio Cesar de Lima (2011). MicroRNAs como reguladores do desenvolvimento em plantas e o
papel regulatório em raízes de arroz (Oryza sativa L.) na resposta ao alumínio. Orientador:
Rogerio Margis.
Karina Mariante Monteiro (2010). Identificação e caracterização de proteínas expressas pelo
metacestódeo de Echinococcus granulosus durante a infecção do seu hospedeiro intermediário.
Orientador: Henrique Bunselmeyer Ferreira.
Karine Rigon Zimmer (2012). Atividade antibiofilme e antibiótica da cera dos ovos e de bactérias
associadas ao carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Orientador: Carlos Termignoni.
Lauren Lucia Zamin (2010). Resveratrol e quercetina: avaliação da atividade antitumoral e dos
mecanismos de ação em linhagens de gliomas in vitro e num modelo de implante de gliomas in
vivo. Orientador: Guido lenz.
27
Lavínia Almeida Cruz (2012). Avaliação dos mecanismos de ação da associação de 5-fluorouracil
e cisplatina quanto às vias de reparo de dano aoDNA. Orientador: Joao Antonio Pegas Henriques.
Leonardo Broetto (2010). Caracterização funcional da proteína gliceraldeído-3-fosfasto
desidrogenase na superfície celular do entomopatógeno Metarhizium anisopliae. Orientador:
Augusto Schrank
Luciana Sonne (2010). Intoxicações experimentais e naturais por Vicia villosa em coelhos e
bovinos. Orientador: Itabajara da Silva Vaz Junior.
Luisa Abruzzi de Oliveira (2012). Análise transcricional dos genes do sistema Isc em Eucalyptus
grandis e Azotobacter vinelandii. Orientador: Giancarlo Pasquali.
Martin Pablo Cancela Sehabiague (2010). Análise do transcritoma do estágio invasivo de
Fasciola hepatica e sua contribuição na compreensão dos mecanismos moleculares envolvidos no
processo de infecção. Orientador: Arnaldo Zaha.
Melissa Postal (2012). Propriedades antifúngicas da urease de Canavalia ensiformis. Orientador:
Celia Regina Ribeiro da Silva Carlini.
Michèle Claire Breton (2011). Estudo do transcriptoma em flores de Eucalyptus grandis.
Orientador: Giancarlo Pasquali.
Miriana da Silva Machado (2011). Avaliação dos mecanismos de ação dos novos agentes
Zalypsis, Tryptamicidin e 3'3-ditrifluormetildifenil disseleneto.Orientador: Joao Antonio Pegas
Henriques.
Mônica de Medeiros Silva (2012). Papel de ureases na nodulação de Glycine max por de
Bradyrhizobium japonicum. Orientador: Celia Regina Ribeiro da Silva Carlini.
Naíla Cannes do Nascimento (2011). Indução do alcalóide braquicerina por UV-B em folhas de
Psychotria brachyceras e potencial fotoprotetor em pele humana. Orientador: Arthur Germano Fett
Neto.
Patrícia Luciana da Costa Lopez (2012). Influência das proteínas XIAP e Survivina na
resistência de gliomas. Orientador: Guido Lenz.
Paula Cristiane Pohl (2012). Participação dos transportadores ABC na destoxificação de
acaricidas no carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Co-Orientador: Itabajara da Silva
Vaz Junior.
Rafael Augusto Arenhart (2012). Caracterização funcional dos genes ASR na resposta ao
alumínio em arroz (Oryza sativa L.). Co-Orientador: Rogerio Margis
Rafael Real Guerra (2011). Ureases vegetais e suas chaperonas de ativação: um avanço na
compreensão de suas propriedades estruturais e funcionais. Orientador: Celia Regina Ribeiro da
Silva Carlini
Renata Maria Soares Terra (2010). Venômica: Identificação de proteínas envolvidas na
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9 Publicações dos Líderes de Grupo e Associados no Período
30
25
20
15
10
5
0
Figura 4. Índice H dos pesquisadores do CBiot.
Índice H: é o maior número de artigos que recebe pelo menos um igual número de citações.
Por exemplo, um índice H=15 significa que o pesquisador publicou 15 artigos com pelo menos
15 citações em cada artigo. No periodo foram publicados 335 artigos científicos pelos
pesquisadores do CBiot.
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BONATTO, D. Patente: Modelo de Utilidade. Número do registro: 0000221112703564, data de depósito:
14/12/2011, título: "Método, Sistema e Aparato de Análise de Dados de Expressão Gênica
(Transcriptograma)". Instituição de registro: INPI.
2) Bodanese-Zanettini, MH ; Wiebke-Strohm, B ; PASQUALI, G ; Pinheiro-Margis, M M. A.
N.;
CARLINI, C R ; Becker-Ritt, A B ; Bencke, M ; Bücker-Neto, L Patente: Privilégio de Inovação. Número do
registro: PI1002675-4,
data de depósito: 06/08/2010, título: "Célula Transformada, Material Vegetal
Transgênico, Método de Proteção Celular, Uso e Composição Compreendendo Ureases”, Instituição de
registro: INPI.
3) BONATTO, D. Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: BR 10 2012-01114, data de
depósito: 11/05/2012, título: "Processo de Obtenção de Leveduras para Fabricação de Bebidas Fermentadas".
Instituição de registro: INPI.
4) FETT-NETO AG ; Rodrigues, KCS ; Azevedo PC . Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro:
PI120046199, data de depósito: 01/03/2012, título: "Composição e Pasta Indutora de Exsudação Aumentada
de Oleoresina e Processo para Produção Aumentada de Oleoresina em Coníferas Vivas (Depósito INPI BR
10 2012 004619 9)" , Instituição de registro:INPI.
5) LENZ, G; Filippi-Chiela, E ; Jurkovski, B ; Oliveira Neto, M.M ; Jacques, S M C ; Silva, V D. Patente:
Privilégio de Inovação. Número do registro: BR1020120152886, data de depósito: 21/06/2012, título:
"Método de Análise e Mensuração Morfométrica Nuclear e Uso do Método de Análise e Mensuração
Morfométrica Nuclear" Instituição de registro: INPI.
6) Oldiges, D. P. ; MASUDA, A. ; VAZ JR, IS. Seixas A; TERMIGNONI, C. Patente: Privilégio de
Inovação. Número do registro: BR00221104949908, data de depósito: 19/05/2011, título: "Cisteíno
Endopeptidase Recombinante ou Peptídeos Derivados Utilizados para o Controle de Carrapatos" , Instituição
de registro: INPI.
65
7) TERMIGNONI, C; MACEDO, AJ; Zimmer, Karine Rigon ; Giordani, R. B. Patente:
Privilégio de Inovação. Número do registro: PI0310112, data de depósito: 05/12/2012, título: "Processo de
Inibição e/ou Controle de Biofilme Utilizando N-(2-sulfooxi-25-colest-5-en-26-oil)-L-isoleucina, Natural ou
Sintética, ou seus Derivados (Naturais ou Sintéticos)". Instituição de registro: INPI.
8) VAZ JR., I. S.; Gomes, H F; Logullo, Carlos ; Dias, A. J. B. ; Carvalho, C. S. P. Patente: Privilégio de
Inovação. Número do registro: 0000220907204144, data de depósito: 14/05/2010, título: "Meio Modificado
com Presença de Inibidores de Enzima para Produção in vitro de Embriões de Mamíferos". Instituição de
registro: INPI.
9) VAZ JR., I. S.; TERMIGNONI, C; Ali, A. ; Guizzo, MG ; Tirloni, L ; Parizi, LF; Seixas, A. Patente:
Privilégio de Inovação. Número do registro: BR1020130191353, data de depósito: 26/07/2013, título:
"Antígenos de Metaloprotease ou Peptídeos Derivados para Controle do Carrapato" , Instituição de registro:
INPI.
66

Relatório de Atividades do Centro de Biotecnologia (2010

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