PPC_BBT - Campus São José dos Campos
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Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia PROJETO PEDAGÓGICO DO CURSO DE BACHARELADO EM BIOTECNOLOGIA Reitora: Profa. Dra. Soraya Soubhi Smaili Diretor Acadêmico: Prof. Dr. Luiz Leduíno de Salles Neto Coordenador do Curso: Prof. Dr. Martin Wurtele Junho de 2014 1 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia MEMBROS DA COMISSÃO DE CURSO Coordenador Prof. Dr. Martin Wurtele Vice-Coordenadora Profa. Dra. Elisa Esposito Membros Docentes Profa. Dra. Claudia Campos Profa. Dra. Elisabeth Augusto 2 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia MEMBROS DO NÚCLEO DOCENTE ESTRUTURANTE Presidente Prof. Dr. Martin Wurtele Vice-Presidente Profa. Dra. Elisa Esposito Membros Docentes Profa. Dra. Claudia Campos Profa. Dra. Elisabeth Augusto 3 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Sumário APRESENTAÇÃO............................................................................................................................. 6 1. 2. 3. DADOS GERAIS DO CURSO .................................................................................................... 7 1.1 Nome do curso .............................................................................................................. 7 1.2 Grau ............................................................................................................................... 7 1.3 Forma de ingresso ......................................................................................................... 7 1.4 Número de vagas no ato da implantação ..................................................................... 7 1.5 Número de vagas atual ................................................................................................. 7 1.6 Situação legal do curso .................................................................................................. 7 1.7 Regime do curso ............................................................................................................ 7 1.8 Carga horária total ........................................................................................................ 8 1.9 Tempo de integralização ............................................................................................... 8 1.10 Turno de funcionamento .............................................................................................. 8 1.11 Organização curricular .................................................................................................. 8 HISTÓRICO DA INSTITUIÇÃO E DO CURSO .......................................................................... 10 2.1 Breve Histórico da UNIFESP ........................................................................................ 10 2.3 Histórico do Curso de Biotecnologia ........................................................................... 10 2.4 Apresentação, Justificativa e Perfil do Curso .............................................................. 11 CONCEPÇÃO DO CURSO DE BIOTECNOLOGIA..................................................................... 13 3.1 Objetivos do curso....................................................................................................... 13 3.2 Perfil do egresso .......................................................................................................... 14 3.3 Competências e habilidades ....................................................................................... 14 3.4 Bases teóricas .............................................................................................................. 15 3.5 Bases didático-pedagógicas ........................................................................................ 17 3.6 Bases metodológicas ................................................................................................... 17 3.7 Sistema de avaliação do processo de ensino e aprendizagem ................................... 18 3.8 Sistema de Avaliação do Projeto do Curso.................................................................. 19 3.9 Matriz curricular do Bacharelado em Biotecnologia................................................... 19 4 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 3.10 Trabalho de Conclusão de Curso (TCC) ....................................................................... 31 3.11 Atividades Complementares ....................................................................................... 31 3.12 Estágio curricular ......................................................................................................... 31 3.13 Relação do curso com Ensino, Pesquisa e Extensão ................................................... 32 4 EMENTAS DAS UNIDADES CURRICULARES .......................................................................... 33 5 CORPO SOCIAL..................................................................................................................... 68 6 INSTALAÇÕES FÍSICAS .......................................................................................................... 73 ANEXO A ...................................................................................................................................... 76 ANEXO B .................................................................................................................................... 170 ANEXO C .................................................................................................................................... 175 ANEXO D .................................................................................................................................... 179 ANEXO E .................................................................................................................................... 184 ANEXO F .................................................................................................................................... 188 5 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia APRESENTAÇÃO Este documento tem como objetivo orientar a implementação e gestão do Bacharelado em Biotecnologia da Universidade Federal de São Paulo - UNIFESP, definindo objetivos, conteúdo e estrutura curricular do curso. 6 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 1. DADOS GERAIS DO CURSO 1.1 Nome do curso Curso de Graduação em Biotecnologia. 1.2 Grau Bacharelado. 1.3 Forma de ingresso A admissão ao Bacharelado em Biotecnologia segue as especificações vigentes do Instituto de Ciência e Tecnologia da UNIFESP, do SiSU e dos editais de seleção interna (após completar o Bacharelado em Ciência e Tecnologia) e externa para o curso. 1.4 Número de vagas no ato da implantação Total de 25 vagas por ano no período integral. 1.5 Número de vagas atual Total de 25 vagas por ano no período integral. 1.6 Situação legal do curso Aprovação: Ata do Conselho Universitário (CONSU) de 14 de março de 2012. Autorização: Processo MEC n° 201404510. Portaria SERES/MEC nº 646 do 30/10/2014, Publicada no DOU 3/11/2014. Abertura do Campus: portaria n° 355 de 14 de março de 2008. 1.7 Regime do curso Semestral. 7 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 1.8 Carga horária total 3.420 horas. 1.9 Tempo de integralização Tempo regular: 8 semestres (incluindo o Bacharelado em Ciência e Tecnologia). Tempo máximo: Definido de acordo com o regimento interno da prograd e os editais de seleção para progressão ao curso Bacharelado em Biotecnologia. 1.10 Turno de funcionamento Período integral, com atividades de segunda-feira a sábado. 1.11 Organização curricular O conteúdo curricular do curso caracteriza-se por ser dividido em 4 núcleos ou ciclos, o núcleo de conhecimentos básicos generalistas, o núcleo de conhecimentos básicos especializados, o núcleo de conhecimentos profissionalizantes e o núcleo de conhecimentos específicos.A estrutura curricular do curso está sumarizada na seguinte tabela: Tabela 1. Distribuição de créditos e carga horária do curso por áreas No. Carga Créditos Horária I Núcleo de conhecimentos básicos 42 756 generalistas II Núcleo de conhecimentos básicos 62 1116 especializados III Núcleo de conhecimentos 58 1044 profissionalizantes IV Núcleo de conhecimentos específicos 28 504 Total 190 Créditos em atividades práticas dos Núcleos de 52 I a IV (não incluíndo UCs eletivas) % de Créditos 22 33 30 15 3420 100 930 27 8 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Este projeto pedagógico se orienta em diversos pareceres CNE/CES publicados no site do MEC (http://portal.mec.gov.br/) sob o título “Diretrizes Curriculares - Cursos de Graduação – Orientações Gerais”, na Resolução Nº 1 sobre Educação em Direitos Humanos, de 30 de maio de 2012, na Resolução CP/CNE nº 1, de 17 de junho de 2004 sobre Educação das Relações Étnico-Raciais e para o Ensino da História e Cultura AfroBrasileira e Africana na Resolução Nº 2, de 15 de junho de 2012 sobre Educação Ambiental e no Parecer CNE/CES nº 266/2011 - Referenciais Orientadores para os Bacharelados Interdisciplinares e Similares. Especificacões destas diretrizes são levadas em consideração nas Unidades Curriculares deste projeto pedagógico, especificamente nos conteúdos das disciplinas “Bioética e Biossegurança”, “Introdução à Ecologia” e “Biotecnologia Ambiental”. Também levamos em consideração as diretrizes especificadas no Decreto Nº 5626 de 22 de dezembro de 2005 sobre LIBRAS (Unidade Curricular optativa). Não existem diretrizes curriculares para Bacharelados em Biotecnologia. 9 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 2. HISTÓRICO DA INSTITUIÇÃO E DO CURSO 2.1 Breve Histórico da UNIFESP A Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) foi fundada em 1933 como Escola Paulista de Medicina (EPM). Em 1956, a Instituição tornou-se pública. Em 1994, transformou-se na Universidade Federal de São Paulo. A partir de 2004, a UNIFESP iniciou um processo de expansão que levou a implementação de 5 novos Campi: Baixada Santista (início das atividades 2006), Diadema, Guarulhos, São José dos Campos (todos com inicio de atividades 2007) e Osasco (incio das atividades 2011). 2.2 Breve Histórico do Campus O Campus de São José dos Campos da UNIFESP começou suas atividades em 2007 seguindo o plano de Reestruturação e Expansão das Universidades Federais (REUNI). Atualmente, o ICT possui sete cursos de graduação e três programas stricto sensu de pós-graduação. Os cursos de graduação são: Bacharelado em Biotecnologia, Bacharelado em Ciência da Computação, Bacharelado em Ciência e Tecnologia, Bacharelado em Engenharia Biomédica, Bacharelado em Engenharia de Materiais e Bacharelado em Matemática Computacional. Por sua vez, os programas de pósgraduação stricto sensu são: Mestrado/Doutorado em Biotecnologia, Mestrado em Ciência da Computação e Mestrado/Doutorado em Engenharia e Ciências de Materiais. 2.3 Histórico do Curso de Biotecnologia O curso de Biotecnologia está diretamente relacionado ao histórico do próprio Campus de São José dos Campos da UNIFESP, sendo aprovada sua criação em fevereiro de 2012 no conselho de graduação (CG) da UNIFESP e em março de 2012 no seu conselho universitário (CONSU). Na sequência, a congregação do campus decidiu pela abertura e implantação do curso de formação específica em Biotecnologia para início em 2013 com entrada anual de 25 alunos por meio do curso de Bacharelado em Ciência e Tecnologia (BCT) do ICT. 10 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 2.4 Apresentação, Justificativa e Perfil do Curso A biotecnologia é uma área interdisciplinar fortemente ligada à pesquisa científica e tecnológica que tem como principal objetivo desenvolver processos e produtos utilizando agentes biológicos. De acordo com a ONU, “Biotecnologia significa, qualquer aplicação tecnológica que utilize sistemas biológicos, organismos vivos, ou seus derivados, para fabricar ou modificar produtos ou processos para utilização específica.” (ONU, Convenção de Biodiversidade 1992, Art. 2). A Biotecnologia moderna engloba áreas de aplicações biológicas em saúde e biomedicina, na agricultura e na produção de insumos industriais, com uma forte orientação multidisciplinar e experimental. Dentre as disciplinas que constituem as bases da Biotecnologia destacam-se aquelas das áreas biológicas (principalmente microbiologia e biologia molecular), das áreas químicas (química orgânica, química analítica e bioquímica) e das áreas de engenharia (principalmente engenharia química e engenharia de bioprocessos). A interdisciplinaridade da Biotecnologia pode ser exemplificada por algumas de suas aplicações industriais. Na indústria farmacêutica: desenvolvimento de novas drogas, farmacoterapias, produção e melhoramento de antibióticos, produção de proteínas recombinantes para fins terapêuticos, vacinas, estabelecimento de terapias gênicas e outras estratégias para o tratamento de doenças animais e vegetais. Nos laboratórios de análises: desenvolvimento de testes diagnósticos clínicos, alimentícios, agrícolas e ambientais. Na agricultura: desenvolvimento de novas variedades de cultivos/organismos transgênicos. Na indústria alimentícia: diversas aplicações na produção e no controle de qualidade de produtos alimentícios e bebidas. No meio ambiente: tratamento de esgoto e efluentes industriais, bioremediação, biocombustíveis. Na Indústria química: produção de insumos químicos, enzimas e outras proteínas recombinantes. Na área de insumos: desenvolvimento de bioreatores, de softwares, de instrumentação e de consumíveis específicos da área biotecnológica. Na medicina: desenvolvimento de biomateriais reparativos e bioindutores, produção de órgãos e tecidos biológicos ex-vivo. 11 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Estimativas mais conservadoras apontam a Biotecnologia como responsável por aproximadamente 1% do PIB dos países da OECD (Organisation for Economic Cooperation and Development), com um potencial atual de contribuir para 5,6% do PIB destes países. Estima-se que, em 2030, a área de Biotecnologia contribuirá para a geração de 80% dos novos medicamentos, 35% da produção química, 50% da produção do setor primário, num total de 2,7% do PIB dos países ligados à OECD, ou seja, com um mercado em torno de 1 trilhão de USD. No Brasil, a Biotecnologia é uma das principais linhas de ação de Pesquisa, Desenvolvimento e Inovação em áreas consideradas estratégicas pelo Ministério de Ciência, Tecnologia e Inovação. Atividades na área são reguladas por diversas leis, como Lei N˚ 11.105 de março 2005, que define as diretrizes de Biossegurança, e pelo Decreto N˚ 6041 de 8 de fevereiro de 2007 da Presidência da República, que estabelece diretrizes e metas para o Desenvolvimento da Biotecnologia no Brasil; este último faz menção explícita à necessidade de se incentivar a formação e capacitação de recursos humanos para o desenvolvimento de C&T e inovação em biotecnologia. O profissional Bacharel em Biotecnologia não tem a sua profissão regulamentada. No registro eMEC do Ministério de Educação, atualmente 22 Universidades no Brasil oferecem cursos cadastrados como Bacharelados em Biotecnologia e áreas relacionadas. O Bacharelado em Biotecnologia da UNIFESP São José dos Campos destina-se principalmente a estudantes com interesse em: Uma formação sólida em áreas da biologia moderna como biologia molecular, bioquímica, fisiologia molecular, biologia de sistemas, etc. Aplicações de biologia, por exemplo biotecnologia para a saúde humana, para a produção de insumos industriais e biotecnologia agricola, etc. Pesquisa científica e tecnológica em áreas relacionadas à biologia moderna e biotecnologia. Interdisciplinaridade, pois é um curso que integra conhecimentos de áreas da biologia, da química e da engenharia. 12 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 3. CONCEPÇÃO DO CURSO DE BIOTECNOLOGIA 3.1 Objetivos do curso O principal objetivo geral deste programa é formar especialistas da área de biotecnologia, que consigam lidar com especialistas das áreas da biologia, química e engenharia, para promover inovação tecnológica. Os principais objetivos específicos do curso são: Formar profissionais capazes de resolver problemas biotecnológicos relacionados ao desenvolvimento de produtos, à produção e purificação de biomoléculas, e ao desenvolvimento e síntese de fármacos e de métodos para melhorar sua eficiência terapêutica. Espera-se desse profissional o entendimento avançado dos fenômenos moleculares e atômicos necessários ao desenvolvimento de produtos biotecnológicos, métodos de diagnóstico e tratamento de doenças. Formar profissionais capazes de resolver problemas relacionados a sistemas complexos, como aqueles relacionados à manipulação de respostas fisiológicas, engenharia tecidual, produção e utilização de seres vivos transgênicos ou nocautes para o melhor conhecimento de sistemas de forma a permitir desenvolvimento de proposta de terapias para doenças ou vantagens adaptativas ao meio ambiente. Espera-se desse profissional o entendimento de fenômenos fisiológicos fundamentais para a biologia molecular e celular de organismos pluricelulares e de estruturas complexas dos seres vivos. Formar profissionais capazes de resolver problemas relacionados à engenharia de bioprocessos e engenharia bioquímica em processos e ambientes industriais e de grande escala que permita o desenvolvimento de instrumentação para a produção, purificação e análise de produtos biotecnológicos. Formar profissionais capazes de lidar com questões inerentes ao avanço biotecnológico e sua interface com a sociedade, relacionados à (bio)economia, meio ambiente, ética, sustentabilidade e direito. 13 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 3.2 Perfil do egresso O curso Bacharelado em Biotecnologia tem como objetivo geral formar recursos humanos de alto nível, com uma sólida formação interdisciplinar, qualificados para o desenvolvimento de atividades de Pesquisa e/ou Desenvolvimento Tecnológico nas áreas de Biologia e Biotecnologia. Portanto, nossos egressos serão capazes de atuar em empresas e instituições públicas e privadas, gerando ou aplicando conhecimento, com uma visão interdisciplinar para a solução de problemas complexos em ciência básica, desenvolvimento e inovação tecnológica de processos e produtos biotecnológicos. Entre os principais objetivos do curso destacam-se: 3.3 Formar profissionais com conhecimento sólido em ciência básica e aplicada, com capacidade de realizar pesquisa e interagir com áreas relacionadas à química, biologia e engenharia, bem como às ligadas à ética, administração e economia, com atitude crítica e aberta a desenvolvimentos futuros; Preparar e estimular os alunos a conduzirem de forma autônoma trabalhos em pesquisa e desenvolvimento; Estimular estes a acompanhar a literatura científica para se manter atualizado; Capacitar estes para trabalhos em equipes multidisciplinares e em cooperação nacional/internacional; Formar profissionais empreendedores, capazes de identificar e viabilizar mecanismos que estabeleçam interações entre empresas e a universidade, de modo a transformar conhecimento em benefícios para a sociedade; Capacitar e estimular os egressos a empreenderem seus próprios negócios em C&T. Competências e habilidades 3.3.1 Competências e habilidades gerais O Bacharelado em Biotecnologia tem como objetivos gerais preparar seu egresso para desenvolver futuras atividades e tarefas em Universidades, Institutos de Pesquisa, na Indústria, em Empresas Privadas ou Estatais, assim como na Administração Pública nas áreas relacionadas à Biotecnologia. 14 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Durante o curso o estudante deve adquirir conhecimentos científicos, técnicos e formas de comportamento adequadas ao trabalho científico e ao desenvolvimento tecnológico. O estudante deve ser também qualificado para orientar terceiros em trabalhos científicos e para realizar desenvolvimento tecnológico. 3.3.2 Competências e habilidades específicas da formação do Bacharelado em Biotecnologia. 3.4 Além da especialização, o curso deve levar a aquisição da capacidade de entendimento de problemas específicos de áreas científicas dentro do escopo da Biotecnologia como das áreas a ela adjacentes e tornar estes conhecimentos úteis ao próprio trabalho. Para isto, é necessário obter uma ampla visão das diferentes áreas básicas e aplicadas da Biologia, de áreas relacionadas da Química e da Engenharia, assim como novas áreas em desenvolvimento. Para estes fins é necessário aprofundar 1) conhecimentos sobre as ciências naturais que são importantes para a Biotecnologia, incluindo também seus conjuntos de métodos relevantes; 2) conhecimentos exemplares nas disciplinas biológicas e as de aplicação de conhecimentos e técnicas para a solução de questões científicas e de desenvolvimento tecnológico; 3) conhecimento de formas de trabalho teóricos e experimentais na Biologia, Biotecnologia, e das áreas relacionadas da Química e Engenharia e 4) o entendimento das relações entre a sociedade, a economia e a Biotecnologia, assim como as condições sócias para pesquisa biotecnológica em áreas básicas e aplicadas. O estudante deve ser estimulado a adquirir conhecimentos da língua inglesa para capacitá-lo a ler e entender literatura científica e, assim, possibilitá-lo a se comunicar na comunidade científica internacional nas áreas de Biologia e Biotecnologia. Bases teóricas A Biotecnologia é uma área interdisciplinar fortemente ligada à pesquisa científica e tecnológica. Com a introdução da tecnologia do DNA recombinante e outros avanços contemporâneos, pode-se diferenciar a Biotecnologia “clássica” da Biotecnologia “moderna”. Também pode se diferenciar a Biotecnologia voltada à área de saúde e 15 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia biomedicina (a assim denominada Biotecnologia “vermelha”), à agricultura (a Biotecnologia “verde”) e à produção de insumos industriais (a Biotecnologia “branca”). Do ponto de vista das disciplinas que constituem as bases da Biotecnologia, destacamse aquelas das áreas biológicas (principalmente microbiologia e biologia molecular), das áreas químicas (química orgânica, química analítica e bioquímica) e das áreas de engenharia (principalmente engenharia de bioprocessos). Por estas razões a Biotecnologia pode ser considerada uma área fortemente diversa e interdisciplinar. O Projeto Pedagógico aqui apresentado tem como base teórica a necessidade de formar discentes neste contexto interdisciplinar da biotecnologia. Interdisciplinaridade é primariamente entendido como um diálogo entre disciplinas. Por estas razões a interdisciplinaridade surge das disciplinas (Abbott A., Chaos of Disciplines, Univ. Chicago Press, 2001; Turner S., What are disciplines? And how is interdisciplinarity different? IN: Weingart P, Stehr N, Eds., Practising Interdisciplinarity, Univ. Toronto Press, 2000.; Whitley R., The Intellectual and Social Organization of the Sciences, Clarendon, 1984). A aproximação do Projeto Pedagógico à interdisciplinaridade na Biotecnologia se baseia nesta interação entre disciplinas, tendo como meio, tratar as matérias básicas oferecidas no início da formação de uma forma mais generalista. Este Projeto Pedagógico recomenda uma aproximação em etapas à profundidade da Biotecnologia, iniciando com uma visão mais generalista para apresentar ao ingressante a diversidade da área, com conceitos básicos e importantes das ciências naturais, seguindo com o oferecimento ao discente de uma especialização em áreas específicas da Biotecnologia. O objetivo final é atingir uma visão crítica guiada pela capacidade de entender e realizar pesquisa seguindo uma atitude científica. Este projeto pedagógico reconhece a importância do princípio da indissociabilidade entre ensino, pesquisa e extensão e da liberdade de cátedra como elementos essenciais na educação superior. A indissociabilidade entre atividades de divulgação (ensino, extensão) e produção de conhecimento (pesquisa), como reconhecido em todas as Universidades de excelência, é um elemento fundamental para gerar qualidade em ensino acadêmico, permitindo a formação de discentes críticos e versados nos princípios de pesquisa cientifica. Este princípio é fundamental para manter uma coerência entre discurso e prática e formar indivíduos críticos, com pensamento autônomo, mente inovadora e a capacidade de se adaptar aos desafios e problemas da atualidade utilizando ferramentas de pesquisa científica. 16 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia A liberdade de cátedra assegura a liberdade de aprender, ensinar, pesquisar e divulgar o pensamento acadêmico, garantido o pluralismo de ideias e concepções no ensino. Este princípio também garante autonomia didático-científica, permitindo aos docentes que expressem, quando haja vários critérios metodológicos ou didáticos com relação à matéria ensinada, suas próprias convicções e pontos de vista, sem que haja a imposição de uma única visão sobre este assunto. É fundamental acrescentar também a necessidade de toda atividade relacionada ao ensino superior ter objetivos éticos no âmbito do respeito à segurança de trabalho, principalmente em laboratórios, à biossegurança, aos princípios da eficiência administrativa, e às considerações de contorno econômicas, políticas, jurídicas, culturais, sociais e ambientais. 3.5 Bases didático-pedagógicas Este projeto pedagógico está baseado nos seguintes princípios didático-pedagógicos: 3.6 Permitir, através de um currículo flexível, o amadurecimento diferenciado e gradual do discente em um ambiente mais interdisciplinar e generalista nos primeiros semestres antes de possibilitar uma especialização mais profunda. Oferecer aos alunos um currículo de base forte em ciência e tecnologia e, ao mesmo tempo, opções de especialização nas mais diversas áreas da biotecnologia. Manter um sistema de ensino voltado à interconexão entre atividades de divulgação de conhecimento (ensino), com atividades de produção e inovação de conhecimento (pesquisa cientifica e tecnológica), preparando os alunos através de uma atitude aberta à pesquisa e desenvolvimento de soluções de problemas atuais e futuros enfrentados em um mundo no qual o conhecimento envelhece cada vez mais rápido. Maximizar, dentro do possível, a interação entre teoria e prática, oferecendo cursos em laboratórios modernos e com conteúdo inovador. Bases metodológicas As Unidades Curriculares do Bacharelado em Biotecnologia devem seguir as diretrizes curriculares deste Projeto Pedagógico. Como descrito no capítulo sobre Competências e Habilidades, a graduação em Biotecnologia deve capacitar os discentes a aprender a 17 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia lidar, reconhecer e utilizar soluções científicas das diversas áreas que compõem a Biotecnologia, assim como as possíveis aplicações tecnológicas destas áreas. Para estes fins, a graduação em Biotecnologia geralmente consiste em cursos básicos e especializados que tem como objetivo ideal formar profissionais altamente capacitados, críticos e independentes. É, portanto, importante induzir os discentes a trabalharem e se desenvolverem de forma independente, a se organizarem em equipes, a valorizarem os detalhes do trabalho científico sem esquecerem a visão pelo todo. É recomendável utilizar, sempre que possível, exemplos e aplicações, observando ao mesmo tempo as limitações impostas pelas condições experimentais e teóricas atuais por trás destes exemplos, instigando a busca por soluções; buscar formar uma unidade entre o ensino e a pesquisa, assim como entre a teoria e a prática, conhecimentos fundamentais e aplicações científicas; e, finalmente, saber valorizar formas modernas de estudo como estudo de casos, seminários de literatura e projetos de pesquisa práticos a serem realizados por grupos de alunos. Idealmente, os cursos de biotecnologia devem ter objetivos de reconhecimento de conhecimentos, aplicação de conhecimento e, como princípio, a criação de novos conhecimentos. Os cursos devem ser adaptados aos conhecimentos prévios dos alunos, sem deixar de permitir aprofundar conceitos. Estimula-se em casos específicos, justificados e aprovados pela Comissão de Curso oferecer adicionalmente a opção de UCs ministradas na língua inglesa. Por fim, é também recomendável que as Unidades Curriculares sejam concluídas com avaliação dos conhecimentos adquiridos que também deve servir ao docente como controle de seu êxito educacional. 3.7 Sistema de avaliação do processo de ensino e aprendizagem O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas, devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. Como formas de avaliação do aluno podem constar provas, trabalhos, avaliações e seminários. O desempenho acadêmico deve ser atestado demonstrando a frequência de assistência e as médias das notas dos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pelas Pró-Reitoria de Graduação da UNIFESP, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. 18 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 3.8 Sistema de Avaliação do Projeto do Curso O acompanhamento do projeto pedagógico do curso será realizado por meio da atuação da coordenação de curso, da comissão de curso, do núcleo docente estruturante e do corpo docente envolvido nas unidades curriculares. A avaliação das unidades curriculares e da qualidade do curso obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação da UNIFESP, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Como exemplos de métodos de avaliação de unidades curriculares e da qualidade do curso estão: Aplicação da prova ENADE como enfoque em áreas da biotecnologia, levantamento de dados sobre número de alunos participantes nas unidades curriculares, número de reprovações nas unidades curriculares, média de notas, testes de progresso dos alunos, avaliação das Unidades Curriculares, e avaliação do Curso com questionários aplicados ao ingressante, ao formando e ao egresso. 3.9 Matriz curricular do Bacharelado em Biotecnologia 3.9.1 Núcleo de conhecimentos básicos generalistas Unidades Curriculares (UCs) deste núcleo têm como objetivo proporcionar aos estudantes do programa uma formação sólida em conceitos fundamentais da matemática, ciências naturais, ciências da computação e ciências humanas aplicadas. Estes conhecimentos básicos são fundamentais para o entendimento da área, para formar alunos interessados em se desenvolver em um ambiente interdisciplinar e para proporcionar aos alunos do curso a flexibilidade necessária para atuar numa área em pleno desenvolvimento, como é o caso da Biotecnologia moderna. Este núcleo de conhecimentos básicos generalistas consiste em seis eixos temáticos. As UCs (e o respectivo número de créditos) destes eixos temáticos estão indicadas a seguir: 1) Matemática Cálculo em uma Variável Matemática Geral 2) 6 4 Ciências da Computação 19 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Lógica de Programação 3) Física Fenômenos Mecânicos Física Geral 4) 4 4 4 Biologia Fundamentos de Biologia Moderna 6) 4 4 Química Química Geral Química Orgânica Termodinâmica Química 5) 4 4 Ciências Humanas Aplicadas Ciência Tecnologia e Sociedade Ciência Tecnologia, Sociedade e Ambiente 2 2 Soma de créditos obrigatórios do núcleo de conhecimentos básicos generalistas: 42. Carga horária: 756 h (22% carga horária total). 3.9.2 Núcleo de conhecimentos básicos especializados Unidades Curriculares (UCs) deste núcleo tem como objetivo proporcionar aos estudantes do programa uma formação sólida nos conceitos básicos importantes das áreas da Biologia, da Química e da Engenharia Bioquímica relacionadas à Biotecnologia. Este núcleo consiste em seis eixos temáticos. As UCs (e o respectivo número de créditos) destes eixos temáticos estão indicadas a seguir: 1) Bioquímica Bioquímica I 4 20 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bioquímica II Laboratório de Bioquímica Bioquímica Analítica Laboratório de Bioquímica Analítica 2) Biologia Molecular Biologia Molecular do Gene Biologia Molecular da Célula Laboratório de Biologia Molecular Biologia do Desenvolvimento 3) 4 4 Engenharia Bioquímica Fundamentos Eng. Bioquímica 6) 4 4 2 Fisiologia Fisiologia Humana Laboratório de Fisiologia 5) 4 4 2 2 Microbiologia Microbiologia Geral Microbiologia Aplicada e Industrial Laboratório de Microbiologia 4) 4 4 4 2 4 Áreas Correlatas Introdução à Biotecnologia Biologia Geral Introdução à Ecologia 2 4 4 Soma de créditos obrigatórios totais do núcleo de conhecimentos básicos especializados : 62. Carga horária: 1116 h (33% da carga horária total). 21 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 3.9.3 Núcleo de conhecimentos profissionalizantes Unidades Curriculares (UCs) deste núcleo tem como objetivo proporcionar aos estudantes do programa uma formação sólida nos conceitos avançados importantes das principais áreas da Biotecnologia. Devido à diversidade da Biotecnologia, aproximadamente 60% das UCs deste núcleo são eletivas. Os alunos tem que optar por UCs eletivas (marcadas com asterisco) deste Núcleo que perfaçam um total de 36 créditos, além dos 22 créditos obrigatórios. É interesse da comissão deste curso aumentar o oferecimento de UCs eletivas para propiciar uma formação mais abrangente em Biotecnologia. As UCs (e o respectivo número de créditos) dentro dos diversos eixos temáticos da Biotecnologia estão indicadas a seguir: 1) Biotecnologia Molecular Introdução à Bioinformática Bioinformática avançada Biologia de Sistemas Proteômica* Biologia Estrutural* Modelagem Molecular* Química Medicinal I* Química Medicinal II* 2) Biotecnologia em Sistemas Fisiológicos Engenharia Tecidual e Medicina Regenerativa* Imunologia Geral* Imunologia Aplicada* Biotecnologia Animal* Modelos Animais* 3) 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 Biotecnologia Industrial Engenharia Bioquímica I Engenharia Bioquímica II Laboratório de Engenharia Bioquímica Biotecnologia de Energias Renováveis I* 4 4 2 4 22 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Biotecnologia de Energias Renováveis II* Biotecnologia Ambiental I* Biotecnologia Ambiental II* 4) Biotecnologia Verde Botânica e Fisiolologia Vegetal * Biotecnologia Vegetal * 5) 4 4 4 4 4 Áreas Correlatas Ecologia Avançada* Bioética e Biossegurança Empreendedorismo em Biotecnologia Libras (optativa) 4 2 2 2 UCs indicadas com asteriscos (*) são eletivas. Soma de créditos obrigatórios totais do núcleo de conhecimentos profissionalizantes: 22. Carga horária: 396 h. Soma de créditos eletivos totais exigidos: 36. Carga horária 648 h. Soma total de créditos do núcleo de conhecimentos profissionalizantes: 58. Carga horária: 1044 h (30% da carga horária total). 3.9.4 Núcleo de conhecimentos específicos Unidades Curriculares deste núcleo tem como objetivo proporcionar aos estudantes do programa extensões e aprofundamentos dentro dos conteúdos do núcleo de conhecimentos profissionalizantes. Entre estas UCs figuram atividades complementares de livre escolha (6 créditos, carga horária de 108 hrs) e o Trabalho de Conclusão de Curso, TCC (22 créditos, carga horária de 396 hrs). A realização do TCC está prevista para o 8º semestre. Carga horária total do núcleo de conhecimentos específicos: 504 h (15% da carga horária total). 23 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 3.9.5 Atividades Práticas As atividades práticas obrigatórias do curso incluem UCs teórico-práticas, laboratórios, e o Trabalho de Conclusão de Curso (veja Tabela 3, Matriz Curricular do Curso). A carga horária destas atividades práticas do curso soma 52 créditos ou 930 h (27% da carga horária total). 24 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Tabela 2: Estrutura curricular do Bacharelado em Biotecnologia Primeiro Semestre Pré-Requisitos Fundamentos de Biologia Moderna Segundo Semestre Pré-Requisitos -/- 4 Matemática Geral Cálculo em uma Variável 4 Cálculo em uma Variável -/- 6 Fenômenos Mecânicos -/- 4 Ciência Tecnologia e Meio Ambiente -/- 2 Lógica de Programação -/- 4 Química Geral -/- 4 Bioquímica I Fund. de Biologia Moderna 4 Ciência Tecnologia e Sociedade -/- 2 Biologia Molecular do Gene Fund. de Biologia Moderna 4 Microbiologia Geral -/- 4 Introdução à Biotecnologia -/- 2 Termodinâmica Química Química Geral e Cálculo em uma Variável 4 Terceiro Semestre Física Geral Quarto Semestre Fenômenos Mecânicos 4 Química Orgânica Química Geral 4 Bioquímica II Bioquímica I 4 Laboratório de Bioquímica Bioquímica I e Biologia Molecular do Gene 4 Laboratório de Biologia Molecular Celular Biologia Molecular da Célula 2 Biologia Molecular da Célula Fund. de Biologia Moderna 4 Fisiologia Experimental Fisiologia Humana 4 Matemática Geral, Física Geral 4 Microbiologia Aplicada e Industrial Microbiologia Geral 4 Fundamentos de Engenharia Bioquímica Fisiologia Humana -/- 4 Biologia Geral -/- 4 Biologia do Desenvolvimento Biologia Molecular do Gene 2 Laboratório Microbiologia Microbiologia Geral 2 Bioquímica I 4 Laboratório de Bioquímica Analitica Bioquímica Analítica 2 -/- 4 Quinto Semestre Bioquímica Analítica Introdução à Ecologia Introdução Bioinformática Engenharia Bioquímica I Sexto Semestre Lógica de Programação e Biologia Molecular da Célula Fund. de Eng. Bioquímica e Microbiologia Geral Introdução à Biologia Sistemas Biologia Molecular da Célula 4 4 Lab. de Eng. Bioquímica Engenharia Bioquímica I 2 4 Engenharia Bioquímica II Engenharia Bioquímica I 4 Empreendedorismo em Biotecnologia -/- 2 Eletiva 4 Bioética e Biossegurança -/- 2 Eletiva 4 Eletiva 4 Sétimo Semestre Oitavo Semestre Eletiva 4 Eletiva 4 Eletiva 4 Eletiva 4 Eletiva 4 Eletiva 4 LIBRAS (optativa) 2 TCC Atividade Complementar 22 -/- 6 Núcleo de Conhecimentos Básicos Generalistas Núcleo de Conhecimentos Básicos Especializados Núcleo de Conhecimentos Profissionalizantes Conhecimentos Profissionalizantes: Eletivas Núcleo de Conhecimentos Específicos 25 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Tabela 3: Matriz curricular do curso 1º Termo Nome da UC Categoria CH Teórica CH Prática CH Total Pré-Requisitos Fundamentos de Biologia Moderna Fixa 72 0 72 -/- Química Geral Fixa 72 0 72 -/- Cálculo em uma Variável Fixa 72 36 108 -/- Lógica de Programação Fixa 42 30 72 -/- Ciência, Tecnologia e Sociedade Fixa 36 0 36 -/- 2º Termo Nome da UC Categoria CH Teórica CH Prática CH Total Pré-Requisitos Bioquímica I Fixa 72 0 72 Fundamentos de Biologia Moderna Biologia Molecular do Gene Fixa 72 0 72 Fundamentos de Biologia Moderna Microbiologia Geral Fixa 72 0 72 -/- Introdução à Biotecnologia Fixa 36 0 36 -/- Matemática Geral Fixa 72 0 72 Cálculo em uma Variável Fenômenos Mecânicos Fixa 72 0 72 -/- Ciência, Tecnologia, Sociedade Fixa e Ambiente 36 0 36 -/- 26 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 3º Termo Nome da UC Categoria CH Teórica CH Prática CH Total Pré-Requisitos Biologia Molecular da Célula Fixa 72 0 72 Fundamentos de Biologia Moderna Laboratório de Bioquímica Fixa 72 72 Bioquímica I, Biologia Molecular do Gene Microbiologia Industrial Aplicada e Fixa 72 0 72 Microbiologia Geral Fisiologia Humana Fixa 72 0 72 -/- Biologia do Desenvolvimento Fixa 36 0 36 Biologia Molecular do Gene Química Orgânica Fixa 72 0 72 Química Geral Física Geral Fixa 72 0 72 Fenômenos Mecânicos Nome da UC Categoria CH Teórica CH Prática CH Total Pré-Requisitos Bioquímica II Fixa 72 0 72 Bioquímica I 0 36 36 Biologia Molecular da Célula 0 36 36 Microbiologia Geral 72 0 72 Matemática Geral, Física Geral 4º Termo Laboratório de Molecular e Celular Biologia Fixa Laboratório de Microbiologia Fixa Fundamentos de Engenharia Fixa Bioquímica 27 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Fisiologia Experimental Fixa 0 72 72 Fisiologia Humana Biologia Geral Fixa 72 0 72 -/- Termodinâmica Química Fixa 72 0 72 Química Geral e Cálculo em uma Variável Nome da UC Categoria CH Teórica CH Prática CH Total Pré-Requisitos Bioquímica Analítica Fixa 72 0 72 Bioquímica I Introdução à Bioinformática Fixa 36 36 72 Lógica de Programação e Biologia Molecular da Célula Engenharia Bioquímica I Fixa 72 0 72 Fundamentos Engenharia Bioquímica Microbiologia Geral 5º Termo Introdução à Ecologia Fixa 72 0 72 -/- em Fixa 36 0 36 -/- Bioética e Biossegurança Fixa 36 0 36 -/- Atividade Complementar Fixa 0 108 108 -/- Empreendedorismo Biotecnologia de e 28 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 6º Termo CH Teórica CH Prática CH Total Pré-Requisitos 36 36 72 Biologia Molecular da Célula 0 36 36 Bioquímica Analítica 72 0 72 Engenharia Bioquímica I 0 36 36 Engenharia Bioquímica I Energias Eletiva* 72 0 72 -/- Biologia Estrutural Eletiva* 36 36 72 Bioquímica I Química Medicinal I Eletiva* 72 0 72 Bioquímica I Imunologia Geral Eletiva* 72 0 72 Biologia Molecular da Célula Bioinformática Avançada Eletiva* 36 36 72 Introdução Bioinformática Biotecnologia Ambiental I Eletiva* 72 0 72 -/- Biotecnologia Animal Eletiva* 72 0 72 -/- Botânica e Fisiologia Vegetal Eletiva* 72 0 72 -/- Nome da UC Introdução Sistemas Laboratório Analítica Categoria à Biologia de Bioquímica Fixa Engenharia Bioquímica II Laboratório Bioquímica Biotecnologia Renováveis I de de Fixa Fixa Engenharia Fixa de à *Discente deve cursar 3 destas UC Eletivas 7º Termo Nome da UC Categoria CH Teórica CH Prática CH Total Pré-Requisitos Proteômica Eletiva* 36 36 72 Bioquímica Analítica e 29 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Introdução à Bioinformática Modelagem Molecular Eletiva* 36 36 72 Biologia Estrutural Química Medicinal II Eletiva* 72 0 72 Química Medicinal I Energias Eletiva* 72 0 72 Biotecnologia de Energias Renováveis I Imunologia Aplicada Eletiva* 72 0 72 Imunologia Geral Biotecnologia Ambiental II Eletiva* 72 0 72 Biotecnologia Ambiental I Modelos Animais Eletiva* 72 0 72 Biotecnologia Animal Biotecnologia Vegetal Eletiva* 72 0 72 Botânica e Fisiologia Vegetal e Eletiva* 72 0 72 Biologia Molecular célula Fisiologia Humana. Biotecnologia Renováveis II de Engenharia Tecidual Medicina Regenerativa Ecologia Avançada Eletiva* 72 0 72 Introdução Ecologia LIBRAS Optativa 36 0 0 -/- da e à *Discente deve cursar 6 destas UC Eletivas 8º Termo Nome da UC Categori CH CH Teóric Prática a a CH Total Pré-Requisitos Trabalho de Conclusão de Curso Fixa 396 -/- 0 396 30 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 3.10 Trabalho de Conclusão de Curso (TCC) O TCC é obrigatório para a integralização do curso. Os TCCs poderão ser realizados em empresas, laboratórios privados, institutos ou laboratórios de pesquisa da UNIFESP ou de outras instituições. Ao ser realizado em laboratórios de pesquisa de professores do Bacharelado em Biotecnologia, recomenda-se que o discente que realize o TCC frequente semanalmente seminários de acompanhamento (2 créditos) em grupo e seminários de literatura (2 créditos). Após finalização dos trabalhos práticos, o aluno deve confeccionar uma monografia do TCC que será avaliada por uma comissão de docentes do Programa, que pode ter membros externos. O Regulamento do Trabalho de Conclusão de Curso do Bacharelado em Biotecnologia encontra-se especificado no Anexo D. 3.11 Atividades Complementares Com objetivo de complementar a sua formação tecnológica, científica e humanística, todo discente do Bacharelado em Biotecnologia deve cursar 108 horas de atividades complementares. Estas atividades podem consistir em atividades de extensão (primeiro eixo), atividades de orientação acadêmica do aluno (segundo eixo), ou atividades acadêmicas, profissionais ou artísticas (terceiro eixo). Os alunos do Bacharelado em Biotecnologia devem participar em pelo menos uma atividade de cada um destes eixos. O Regulamento de Atividades Complementares do Curso Bacharelado em Biotecnologia encontra-se especificado no Anexo F. 3.12 Estágio curricular Um estágio curricular não é previsto neste Projeto Pedagógico. Ele é entretanto recomendado aos alunos do curso. O Regulamento do Estágio Curricular do Curso Bacharelado em Biotecnologia encontra-se especificado no Anexo E. 31 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 3.13 Relação do curso com Ensino, Pesquisa e Extensão De Acordo com Art. 2º do Estatuto Geral da UNIFESP, esta Universidade tem por finalidade principal desempenhar com excelência atividades indissociáveis de ensino, pesquisa e extensão. Neste sentido, entendemos, portanto, que este Projeto Pedagógico tem como objetivo formar alunos da melhor forma possível por professores genuinamente motivados por fazerem a melhor pesquisa possível, como esperado numa Universidade de Pesquisa. O principio de indissociabilidade entre ensino e pesquisa é fundamental para formar discentes críticos, abertos a inovação e adaptados a lidar e resolver problemas em um mundo em constante transformação. Entendemos do mesmo modo que formação de recursos humanos em uma Universidade inovadora de pesquisa, que interage de forma aberta e pluralista com a sociedade, necessariamente fomenta de forma fundamental o papel da extensão social, econômica e cultural das Universidades. A liberdade de pesquisa é garantida a todo Docente da UNIFESP. Para organizar e fomentar pesquisa na área da Biotecnologia, a UNIFESP recentemente aprovou na CAPES o Programa de Pós-graduação Interunidades em Biotecnologia (PPG-BT) em nível de Mestrado Acadêmico e Doutorado. O PPG-BT está aberto, seguindo os seus critérios de credenciamento, assim como os critérios de credenciamento da PróReitora de Pós Graduação e Pesquisa da UNIFESP, a todos os docentes que participam deste Projeto Pedagógico. Refletindo a interdisciplinaridade e diversidade da Biotecnologia, o PPG-BT estabeleceu três áreas de concentração: Biotecnologia Molecular, relacionada com fenômenos moleculares e bioquímicos estabelecidas; Biotecnologia em Sistemas Fisiológicos, que consiste no estudo sobre os fenômenos moleculares, teciduais e sistêmicos de organismos vivos; Engenharia Biológica, que consiste em uma área voltada para engenharia e aplicações relacionadas a produtos biotecnológicos. Estas áreas refletem também os diversos eixos de atuação descritos neste Projeto Pedagógico e geram uma opção de aperfeiçoamento muito interessante para os egressos do Bacharelado em Biotecnologia. 32 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 4 EMENTAS DAS UNIDADES CURRICULARES 4.1 Núcleo de conhecimentos básicos generalistas Fundamentos de Biologia Moderna – 4 Créditos – Primeiro semestre Ementa: Introdução à Ciência da Biologia. Tópicos Introdutórios em Evolução, Diversidade e Bioética. Bases químicas. Estrutura e função das principais biomoléculas. Fundamentos do metabolismo energético. Replicação. Tradução e transcrição. Bibliografia Básica: ALBERTS, Bruce et al. Fundamentos da biologia celular. 2.ed. Porto Alegre: ARTMED, 2006. Stryer, L., Tymoczko, J. L., Berg, J. M. Bioquímica. 5a ed., Ed. Guanabara-Koogan 2004. Silverthorn, Deen Unglaub. - Fisiologia Humana – Uma Abordagem Integrada. 5a ed., Ed. Artmed 2010. Bibliografia Complementar: NELSON, David L; COX, Michael M. Lehninger princípios de bioquímica. 5.ed. Porto Alegre: Artmed, 2011. Guyton, A C.; Hall, E. J. – Tratado de Fisiologia Médica. 11a ed., Ed. Elsevier 2011. HARVEY LODISH ET AL. Biologia Celular e Molecular. Ed. Artmed, 2007. Berne & Levi - Fisiologia. 6a ed., Ed. Elsevier 1997. Berne & Levi - Fisiologia. 6a ed., Ed. Elsevier 1997. Alberts, Bruce et.al. The Cell: problem book. 5th edition, Garland Science. Cálculo em uma Variável – 4 Créditos – Primeiro semestre Ementa: Funções reais de uma variável. Limite e continuidade. Derivação. Integração. Aplicações. Bibliografia Básica: GUIDORIZZI, H. L. Um curso de cálculo. v. 1. 5ª Ed. Rio De Janeiro: LTC, 2007. LEITHOLD, L. O cálculo com geometria analítica. v. 1. 3ª ed. São Paulo: Harbra, 1990. STEWART, J. Cálculo. v.1. 6ª ed. São Paulo: Cengage Learning, 2009. Bibliografia Complementar: BOULOS, P. Cálculo diferencial e integral. v.1. São Paulo: Pearson, 1999. FLEMMING, D. M.; Gonçalves, M. B. Cálculo A: funções, limite, derivação e integração. 6ª ed. São Paulo: Pearson, 2006. GUIDORIZZI, H. L. Um curso de cálculo. v. 2. 5ª Ed. Rio De Janeiro: LTC, 2007. 33 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia LARSON, R.; EDWARDS, B.; HOSTETLER, R. P. Cálculo. v. 1. 8ª ed. São Paulo: Mc Graw-Hill, 2006. SIMMONS, G. F. Cálculo com geometria analítica. v. 1. 1ª ed. São Paulo: Pearson, 2008. THOMAS, G. B. Cálculo. v. 1. 12ª ed. São Paulo: Pearson, 2013. Matemática Geral– 4 Créditos – Primeiro semestre. Ementa: Vetores, matrizes, determinantes e sistemas lineares. Derivada de funções de várias variáveis. Números complexos, séries e equações diferenciais. Bibliografia Básica: WELTNER, K. et al. Mathematics for physicists and engineers: fundamentals and interactive study guide. Berlin: Springer, 2009. LEITHOLD, L. O cálculo com geometria analítica. v. 1. 3ª ed. SãoPaulo:Harbra, 1990. SIMMONS, G. F. Cálculo com geometria analítica. v. 1. 1ª ed. SãoPaulo:Pearson, 2008. Bibliografia Complementar: Boulos, P. ; Abud, Z. I. Cálculo Diferencial e Integral. São Paulo :Pearson, 2006. vol. 2 . Flemming, D. M. ; Gonçalves, M. B. Cálculo B: Funções de Várias Variáveis, Integrais Múltiplas, Integrais Curvilíneas e de Superfície. 2ª Ed. São Paulo, Pearson, 2007. Simmons, G. F. Cálculo com Geometria Analítica. 1ªed. São Paulo:Makron Books, vol. 2. Lima, E., L., Geometria Analítica e Álgebra Linear, Coleção Matemática Universitária, IMPA, 2a. Edição, 201. ZILL, D. G.; CULLEN M. R. Equações diferenciais. 3ªed. São Paulo: Makron, 2001. v. 1. Lógica de Programação – 4 Créditos – Primeiro semestre. Ementa: Introdução à computação; Noções de lógica; Conceitos e representação de algoritmos; Constantes e variáveis; Estruturas de controle; Vetores; Matrizes; Registros e uniões; Procedimentos, Funções com passagem de parâmetros por valor e referência; Recursividade; Introdução à linguagem de programação. 34 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bibliografia Básica: Forbellone, André L.V; Eberspache, Henri F. Lógica de programação: a construção de algoritmos e estruturas de dados. 3.ed. São Paulo: Pearson, 2005. 218 p. ISBN 978-85-7605-024-7.; Feofiloff, Paulo. Algoritmos em linguagem C. Rio de Janeiro: Elsevier, 2009. 208 p. ISBN 978-85-352-3249-3.; Mokarzel, Fábio; Soma, Nei. Introdução à ciência da computação. Rio de Janeiro: Elsevier, 2008. 429 p. ISBN 978-85-352-1879-4.; Bibliografia Complementar: Mizrahi, Victorine Viviane. Treinamento em linguagem C: módulo profissional. Säo Paulo: Makron, c1993. 225 p. ISBN 978-85-346-0109-2.; Deitel, Paul; Deitel, Harvey. C: como programar. [C: how to program]. Tradução: Daniel Vieira. 6 ed. São Paulo: Pearson Prentice Hall, 2011. 818 p. ISBN 978-857605-934-0.; KERNIGHAN, Brian W; VIEIRA, Daniel; RITCHIE, Dennis M. C: a linguagem de programação padrão ANSI. Rio de Janeiro: Campus, 1989. ISBN 978-85-7001586-0.; FARRER, Harry et al. Algoritmos estruturados. 3.ed. Rio de Janeiro: LTC, 1999. 284 p. ISBN 978-85-216-1180-6. ; Horowitz, Ellis; Sahni, Sartaj; Rajasekaran, Sanguthevar. Computer algorithmics/C++. New York: Computer Science, 1997. 769 p. ISBN 978-0-71678315-2. Fenômenos Mecânicos – 4 Créditos – Segundo semestre. Ementa: Medidas e Unidades. Leis de Movimento. Aplicações das leis de Newton. Trabalho e energia. Momento. Sistemas de partículas. Bibliografia Básica: Paul A. Tipler, Física para cientistas e engenheiros, v.1, 6ª ed., Livros Técnicos e Científicos Editora. David Halliday, Robert Resnick e Jearl Walker, Fundamentos de Física, v.1, 8ª ed., Livros Técnicos e Científicos Editora. Raymond A. Serway e John W. Jewett, Jr., Principios de Física, v.1, Editora Thonsom. Bibliografia Complementar: Nussenveig, Moysés, Curso de Física Básica:v.2, 4a. Ed., Edgard Blücher. Alonso, M., Finn, E., Física Um curso Universitário, v.1, Edgard Blücher. R. Feynman, Lectures on Physics, v.1, Addison Wesley. 35 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia C. Kittel, W. D. Knight e M. A. Ruderman, Mecânica, Curso de Física de Berkeley vol. 1, Edgard Blucher (1970). M. Fishbane, S. Gasiorowicz e S. T. Thorton, Physics for Scientists and Engineers, 2a ed., Prentice Hall (1996). Física Geral – 4 Créditos – Terceiro semestre. Ementa: Oscilações e ondas. Fluidos. Termodinâmica. Ótica. Eletricidade e Magnetismo. Física Moderna. Bibliografia Básica: TIPLER, P.A. Física para cientistas e engenheiros, v.1, 6ª ed., Livros Técnicos e Científicos Editora. HALLIDAY, D.; RESNICK, R.; WALKER, J. Fundamentos de Física, v.1, 8ª ed., Livros Técnicos e Científicos Editora. SERWAY, R.A.; JEWETT, Jr., J.W. Princípios de Física, v.1, Editora Thomsom. Bibliografia Complementar: R. Feynman, Lectures on Physics, v.1, Addison Wesley. C. Kittel, W. D. Knight e M. A. Ruderman, Mecânica, Curso de Física de Berkeley vol. 1, Edgard Blucher (1970).Moisés Nussenzweig, Curso de Física Básica: v.1, 4ª ed., Editora Edgard Blücher. Marcelo Alonso e Edward Finn, Física Um Curso Universitário, v.1, Editora Edgard Blücher. C. Kittel, W. D. Knight e M. A. Ruderman, Mecânica, Curso de Física de Berkeley vol. 1, Edgard Blucher (1970). Química Geral– 4 Créditos – Primeiro semestre. Ementa: Noções preliminares. Estrutura do átomo e periodicidade química. Ligações químicas. Estudo dos gases. Estequiometria. Soluções. Termoquímica. Eletroquímica. Cinética química. Equilíbrios químicos. Biomoléculas. Bibliografia Básica: P. Atkins & L. Jones, Princípios De Química: Questionando A Vida Moderna E O Meio-Ambiente 2001. J. C. Kotz & P. Treichel Jr., Chemistry & Chemical Reactivity, Saunders College Publishing 4aed 1999. T. Brown, H. E. Lemay, E., B. Busten, Química: A ciência central. 9 ed. PrenticeHall, 2005. Bibliografia Complementar: Atkins, P. W., Paula, J., Físico-Química, Vol.3, 7ª ed., LTC. 36 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Lee, J. D., Concise Inorganic Chemistry, 5 ed., Blackwell Science. J. McMurry. Química Orgânica. vol. 1 e 2. 6 ed. Cengage Learning, 2005. Russel, J. B. Química Geral 2a Edição. Vol. I E II, Editora Afiliada. J. McMurry. Química Orgânica. vol. 1 e 2. 6 ed. Cengage Learning, 2005. Química Orgânica- 4 Créditos – Terceiro semestre. Ementa: Estrutura e propriedades físico-químicas de compostos orgânicos, síntese e reações de alcanos, alcenos, alcino, haletos de alquila, álcoois, fenóis, éteres, epóxidos, ácidos orgânicos, esteres, amidas, cetonas e aldeídos. Bibliografia Básica: Solomons T. W. G., Fryhle C. B. Química Orgânica, v. 1 e 2, LTC, 9ª ed., 2009. Carey, F. A. Química Orgânica, v 1 e 2, 7ª ed., Bookman, 2011. Bruice, P. Y. Química Organica, v1 e 2, 4ª ed., Pearson Prentice Hall, 2006. Bibliografia Complementar: Atkins, Peter; Jones, Loretta. Princípios de química: questionando a vida moderna e o meio ambiente, 3ª ed., Bookman, 2006. Brown, Theodores L et al. Química: a ciência central. 9ª ed., Pearson Prentice Hall, 2005. Kotz, J. C.; Treichel, P. M; Weaver, G. C. Química geral e reações químicas, Cengage Learning, 2010. Costa, Paulo R. R. Ácidos e bases em química orgânica. Bookman, 2005. Vollhardt, K. Peter; Schore, Neil E. Química orgânica: estrutura e função. Tradução de: Ricardo Bicca de Alencastro et al. 4ª ed., Bookman, 2004. Termodinâmica Química- 4 Créditos – Quarto semestre. Ementa: Introdução a leis da termodinâmica e suas aplicações químicas. Potencial Químico e Equilíbrio de soluções. Bibliografia Básica: Atkins P., Paula J. Físico-Química, Trad. de Horácio Macedo, 8a ed., LTC- Livros Técnicos e Científicos, 2008. Castellan G.W. Fundamentos de Físico-Química. Trad. de Cristina M.P. dos Santos, LTC, 1986. McQuarrie D. A., Simon J. D. Physical Chemistry: A Molecular Approach University Science Books, 1997. Bibliografia Complementar: McQuarrie, Donald A. Quantum Chemistry. 2ed, California: University Science 37 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Books, 2007 Terron L. R.Termodinâmica - Química Aplicada, Manole, 2009. Van Wylen, Gordon et al. Fundamentos da termodinâmica clássica. São Paulo, Edgard Blücher LTDA, 1995. Oliveira, Mário José Termodnâmica. São Paulo: Livraria da Física, 2005. Pilla L., Termodinâmica Química e Equilíbrio Químico, Editora da Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 2ª ed., 2006. Halliday, D.; Walker, J.; Resnik, R. Fundamentos de física, 8ed., LTC, 2009, vol. 2 Ciência, Tecnologia e Sociedade – 2 Créditos – Primeiro semestre. Ementa: Técnicas e tecnologias como dimensões da humanidade. Ciência, tecnologia e inovação como construção social. Advento do campo da CTS (Ciência, Tecnologia e Sociedade). Política científica e tecnológica. Valores e ética na prática científica. Controvérsias científicas. Bibliografia Básica: Walter A. Bazzo (ed.), Introdução aos Estudos CTS (Ciência, Tecnologia e Sociedade), Organização dos Estados Ibero-americanos para a Educação, a Ciência e a Cultura (OEI), 2003. DAGNINO, Renato. Neutralidade da Ciência e Determinismo Tecnológico - Um Debate sobre a Tecnociência. Campinas: Editora da Unicamp, 2008. Latour, Bruno. Ciência Em Ação: Como Seguir Cientistas E Engenheiros Mundo Afora. São Paulo: Ed. Unesp, 2001. Bibliografia Complementar: BOURDIEU, Pierre. Os Usos da Ciência. São Paulo: Ed. Unesp/Inra, 2002. SHIVA, Vandana. Monoculturas da Mente-Perspectivas da Biodiversidade e da Biotecnologia, São Paulo: Global Editora, 2003. DAGNINO, Renato & HERNAN, Thomas (org). Ciência, Tecnologia e Sociedade Uma Reflexão Latino-Americana. Editora Cabral, São Paulo, 2003. FIGUEIREDO, VILMA. Produção Social da Tecnologia - Sociologia e Ciência Política - Temas Básicos. São Paulo: EPU, 1989. BOURDIEU, Pierre. Para uma Sociologia da Ciência. São Paulo: Edições 70 Brasil, 2008. Ciência, Tecnologia, Sociedade e Ambiente– 2 Créditos – Segundo semestre. Ementa: Advento do campo da CTSA (Ciência, Tecnologia, Sociedade e Ambiente). Tecnologias Alternativas. Movimentos socioambientais e Ciência e Tecnologia. Sócio diversidade, biodiversidade e Ciência e Tecnologia. Temas Geradores, Educação em CTSA e Educação Ambiental. 38 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bibliografia Básica: Walter A. Bazzo (ed.), Introdução aos Estudos CTS (Ciência, Tecnologia e Sociedade), Organização dos Estados Ibero-americanos para a Educação, a Ciência e a Cultura (OEI), 2003. Gadotti, Moacir. Fórum Mundial de Educação. Pro-posições para um outro mundo possível. Série Cidadania Planetária 1. Editora e Livraria Instituto Paulo Freire, 2009. CANAVARRO, J. M. Ciência e sociedade. Coimbra, Portugal, Quarteto Editora, 2000. Bibliografia Complementar: DAGNINO, Renato & HERNAN, Thomas (org). Ciência, Tecnologia e Sociedade Uma Reflexão Latino-Americana. Editora Cabral, São Paulo, 2003. Rezende, Sergio Machado. Momentos da Ciência e Tecnologia no Brasil. Uma caminhada de 40 anos pela C&T. Editora Vieira & Lente, 2010. CUNHA, Marcia Borin da. O movimento ciência/tecnologia/sociedade (CTS) e o ensino de ciências: Condicionantes estruturais. São Paulo: Revista Scientia, v.06, n. 12, 2006. p. 121-134. Loureiro, C. F. B., Layrargues, P.P., Castro, R. S.de. (Orgs.) Sociedade e Meio Ambiente: A educação Ambiental em Debate. São Paulo: Cortez, 2000. VOGT, C.; POLINO, C. (orgs.). Percepção Pública da Ciência: resultados da pesquisa na Argentina, Brasil, Espanha e Uruguai. Campinas: Editora da UNICAMP, 2003. 4.2 Núcleo de conhecimentos básicos especializados Bioquímica I – 4 Créditos – Segundo semestre. Ementa: Estrutura e Função de Proteínas, Glicídios, Ácidos Nucleicos e Lipídeos. Métodos Bioquímicos. Enzimas e enzimologia. Glicólise. Ciclo de Krebs. Fosforilação Oxidativa. Metabolismo do Glicogênio. Fotossíntese e Ciclo de Calvin. Bibliografia Básica: SHULER, M.L.; KARGI, F. Bioprocess engineering: basic concepts. BioprocessEngineering: Basic Concepts, 2ndEdition, Prentice Hall,2001, 576p. SCHMIDELL, W.; LIMA, U.A.; AQUARONE, E.; BORZANI, W. Biotecnologia industrial. vol 2: Engenharia Bioquímica, Edgard Blucher, 2000. RATLEDGE, C.; KRISTIANSEN, B. Basic Biotechnology. Cambridge University Press; 3rd edition, 2006 39 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bibliografia Complementar: Fonseca, M.M.; Teixeira, J.A. Reatores biológicos: fundamentos e aplicações. Lisboa: Lidel Edições Técnicas, 2007, 483p. (Colecão Biotec) ISBN 9727573665 Levenspiel, O. Engenharia das reações químicas. São Paulo: Editora Blücher, 2011. 563 p. ISBN 9788521202752. Fogler, H.S. Elementos de engenharia das reações químicas. 4.ed. Rio de Janeiro: LTC, 2009. 853 p. ISBN 9788521617167 Blanch, H.W.; Clark, D.S. Biochemical engineering. Boca Raton: CRC/Taylor & Francis, 1997. 702 p. ISBN 9780824700997 Doran, P.M. Bioprocess engineering principles. USA: Academic Press, 2012. Bioquímica II – 4 Créditos – quarto semestre. Ementa: Metabolismo dos Lipídeos. Metabolismo dos Aminoácidos. Metabolismo dos Ácidos Nucleicos. Mecanismos de Regulação do Metabolismo. Integração do Metabolismo. Introdução ao Metabolismo Secundário. Tipos de metabolismos energéticos microbiano. Metabolismo de E. coli. Diversidade metabólica de organismos heterótrofos aeróbicos. Catabolismo de heterótrofos aeróbicos. Organismos quimiolitotróficos e fototróficos. Fixação de N2. Bibliografia Básica: PESSOA Jr, A, KILIKIAN B. Purificação de processos biotecnológicos. Manole, 2005, 444p. SHULER, M.L.; KARGI, F. Bioprocess engineering: basic concepts. BioprocessEngineering: Basic Concepts, 2ndEdition, Prentice Hall,2001, 576p. SCHMIDELL, W.; LIMA, U.A.; AQUARONE, E.; BORZANI, W. Biotecnologia industrial. vol 2: Engenharia Bioquímica, Edgard Blucher, 2000. Bibliografia Complementar: Blanch H.W.; Clark D.S. Biochemical engineering. Boca Raton: CRC/Taylor & Francis, 1997. 702 p. ISBN 9780824700997 Nielsen J.; Villadsen J.; Lidén, G. Bioreaction Engineering Principles. Springer 2011 (3a Ed). 591p. ISBN 978-1441996879. RATLEDGE, C.; KRISTIANSEN, B. Basic Biotechnology. Cambridge University Press; 3rd edition, 2006 Fonseca M.M.; Teixeira J.A. Reatores biológicos: fundamentos e aplicações. Lisboa: Lidel Edições Técnicas, 2007, 483p. (Colecão Biotec) ISBN 9727573665 DORAN, P.M. Bioprocess engineering principles. USA: Academic Press, 2012. 40 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Laboratório de Bioquímica – 4 Créditos – terceiro semestre. Ementa: Segurança Biológica e Química. Métodos para o trabalho com microorganismos. Métodos e técnicas da tecnologia de DNA recombinante. Métodos de produção de proteínas recombinantes. Métodos analíticos da bioquímica de proteínas. Bibliografia Básica: LEHNINGER. Princípios de Bioquímica Ed. Sarvier, 2007. LUBERT STRYER. Bioquímica Ed. Guanabara Koogan, 2007. Alberts, A.; Bray, D., Johnson, A, Lewis, J., Raff, M., Roberts, K & Walter, P. Fundamentos da Biologia Celular. Editora Artmed 1999. Bibliografia Complementar: HARVEY LODISH ET AL. Biologia Celular e Molecular. Ed. Artmed, 2007. DONALD VOET & JUDITH G. VOET. Bioquímica Ed. Artmed, 2007. SIMÕES, Jose A.Martinho et al. Guia do laboratório de química e bioquímica. Bioquímica Analítica – 4 Créditos – quinto semestre. Ementa: Introdução e métodos estatísticos. Cromatografia. Eletroforese. Espectroscopia. Espectrometria de massas. Métodos eletro analíticos. Radioisótopos. Automação. Métodos Imunológicos. Enzimas. Testes Genéticos. Métodos de Sequenciamento. PCR e métodos derivados. Sondas. Microarranjos. Análise bioquímica de amino ácidos, proteínas, carboidratos e lipídeos. Biossegurança e aspectos éticos. Bibliografia Básica: HOLME, D.; Peck, H. Analytical Biochemistry. Addison Wesley 1998. BURTIS, C.; ASHWOOD, E.; BURNS, D. Tietz Textbook of Clinical Chemistry and Molecular Diagnostics. 4th Ed. Elsevier Saunders, 2006. PATRINOS, G.; ANSORGE, W. Ed. Molecular Diagnostics. 2nd Ed. Elsevier 2010. Bibliografia Complementar: NELSON, D.L., COX, M.M. Princípios de Bioquímica de Lehninger 5ªEd. Artmed. 2011. VOET, D., VOET, J.G. Bioquímica 4ª Ed. Artmed. 2013. ROBYT. J.F. and WHITE, B.J., Biochemical Techniques: Theory and Practice, Waveland Press.1990. 4BOYER, R.F. Modern Experimental Biochemistry. 3rd Edition. Prentice Hall, 2000. COMPRY-NARDY, M. Práticas de laboratório em Bioquímica e Biofísica. Uma visão integrada. 1ª. Ed. Lab (Grupo Gen).2009. 41 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Laboratório de Bioquímica Analítica– 2 Créditos - sexto semestre. Ementa: Espectroscopia UV/VIS. Métodos Cromatográficos. HPLC. Interpretação de resultados de espectroscopia IR e CD, RMN. Espectrometria de Massas. Métodos de extração. Bibliografia Básica: HOLME, D.; PECK, H. Analytical Biochemistry. Addison Wesley 1998. BURTIS, C.; ASHWOOD, E.; BURNS, D. Tietz Textbook of Clinical Chemistry and Molecular Diagnostics. 4th Ed. Elsevier Saunders, 2006. PATRINOS, G.; ANSORGE, W. Ed. Molecular Diagnostics. 2nd Ed. Elsevier 2010. Bibliografia Complementar: STRYER, L. Bioquímica. Ed. Guanabara-Koogan, 2007. NELSON, D.L.; COX, M.M. Lehninger princípios de bioquímica. 5 a ed. Porto Alegre: Artmed, 2011. VOET, VOET, Bioquímica, 4a ed. SARAIVA, 2013. CAMPBELL, M. K. Bioquímica, 3ª edição, Artmed, 2000. MARZZOCO, Anita; TORRES, Bayardo Baptista. Bioquímica básica. 3 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2007. Biologia Molecular do Gene – 4 Créditos – segundo semestre. Ementa: Introdução à Genética Clássica e Molecular. Estrutura e Compactação do DNA. Genomas. Replicação. Transcrição. Tradução. Regulação da Expressão Gênica. Tecnologia do DNA Recombinante. Epigenética e RNAi. Bibliografia Básica: Alberts, A.; Bray, D., Johnson, A, Lewis, J., Raff, M., Roberts, K & Walter, P. Fundamentos da Biologia Celular. Editora Artmed 1999. Lodish, H. e cols. Biologia Celular e Molecular. 5a ed., Ed. Artmed 2005. Cooper. A Célula – Uma Abordagem Molecular. 3a ed. Ed. Artmed 2007. Bibliografia Complementar: ALBERTS, Bruce et al. Biologia molecular da célula. 5.ed. Artmed 2010. WATSON, James D; BERRY, Andrew; MALFERRARI, Carlos Afonso. DNA: o segredo da vida. São Paulo: Companhia das Letras, 2005. WALTER, Peter et al. Molecular biology of the cell. 5 ed. 2010. KARP, Gerald. Cell and molecular biology: concepts and experiments. 5 ed. 2008. Schrödinger, Erwin; Assis, Jesus P. (Trad.); Assis, Vera Y. K. P. (Trad.). O que é vida? UNESP, 1977. 42 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Biologia Molecular da Célula – 4 Créditos – terceiro semestre. Ementa: Controle da expressão gênica. Estrutura e transporte membranal. Compartimentos intercelulares e direcionamento de proteínas. Mecanismos de comunicação celular. Câncer. Ciclo celular e apoptose. Citoesqueleto e matriz celular. Desenvolvimento. Imunologia. Bibliografia Básica: Alberts, A.; Bray, D., Johnson, A, Lewis, J., Raff, M., Roberts, K & Walter, P. Fundamentos da Biologia Celular. Editora Artmed 1999. Lodish, H. e cols. Biologia Celular e Molecular. 5a ed., Ed. Artmed 2005. Cooper. A Célula – Uma Abordagem Molecular. 3a ed. Ed. Artmed 2007. Bibliografia Complementar: ALBERTS, Bruce et al. Biologia molecular da célula. 5.ed. Artmed 2010 WATSON, James D; BERRY, Andrew; MALFERRARI, Carlos Afonso. DNA: o segredo da vida. São Paulo: Companhia das Letras, 2005. WALTER, Peter et al. Molecular biology of the cell. 5 ed. 2010. KARP, Gerald. Cell and molecular biology: concepts and experiments. 5 ed. 2008. Schrödinger, Erwin; Assis, Jesus P. (Trad.); Assis, Vera Y. K. P. (Trad.). O que é vida? UNESP, 1977. Laboratório de Biologia Molecular e Celular– 2 Créditos – quarto semestre. Ementa: Introdução à Cultura de Células. Transfecção. Western-Blot. Imunoprecipitação. Imunofluorescência. ELISA. Bibliografia Básica: MANIATIS, T.; FRITSCH, E.F.; SAMBROOK, J. Molecular cloning: a laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory, 1982. ALBERTS, A.; BRAY, D.; JOHNSON, A.; LEWIS, J.; RAFF, M.; ROBERTS, K.; WALTER, P. Fundamentos da Biologia Celular. Editora Artmed 1999. ABBAS, ABUL K.; LICHTMAN, ANDREW H., Imunologia Molecular e Celular. Editora Elsevier 2012. Bibliografia Complementar: DOUDNA, JENNIFER A.; DOUDNA, JENNIFER A.; M. COX, MICHAEL, Biologia Molecular – Princípios e Técnicas. Artmed, 2012. ABBAS, ABUL K.; LICHTMAN, ANDREW H., Imunologia Básica. Editora Elsevier 2013. BRAY, DENNIS; HOPKIN, KAREN; ALBERT, BRUCE, Fundamentos da Biologia 43 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Celular. Artmed, 2012. Lodish, H. e cols. Biologia Celular e Molecular. 5a ed., Ed. Artmed 2005. KARP, Gerald. Cell and molecular biology: concepts and experiments. 5 ed. 2008. Biologia do Desenvolvimento– 2 Créditos– Terceiro semestre. Ementa: Este curso visa apresentar ao aluno a história e as bases científicas da biologia do desenvolvimento, além de seus principais conceitos e relevância para a ciência moderna e inovativa. A disciplina foi estruturada para ser um guia do discente com informações objetivas, atualizadas e concisas, contribuindo para a integração dos domínios cognitivos, afetivos e psicomotor do aluno. Bibliografia Básica: Gilbert, S. Developmental Biology. Ed. Sounders, 8a. edição. 2006 Moore & Persaud. Embriologia Básica. Ed. Elsevier, 8ª. ed. 2013 Anatomia Humana. Kent M. Van De Graaff. Editora Manole, 6ª edição. 2003. Bibliografia Complementar: Fisiologia Humana, Uma abordagem integrada. Dee Unglaub Silverthorn. Editora Artmed, 5ª Edição. 2010. Gray’s Anatomia para estudantes. Richard L. Drake, et al. Editora Elsevier, 2ª Edição. 2010. Histologia Texto e Atlas. Michael H. Ross & Wojciech Pawlina. Editora Guanabara-Koogan, 5ª Edição. 2008. Alberts, A.; Bray, D., Johnson, A, Lewis, J., Raff, M., Roberts, K & Walter, P. Fundamentos da Biologia Celular. Editora Artmed 1999. Lodish, H. e cols. Biologia Celular e Molecular. 5a ed., Ed. Artmed 2005. Microbiologia Geral – 4 Créditos – terceiro semestre. Ementa: Morfologia e estruturas bacterianas. Nutrição e crescimento bacteriano. Metabolismo bacteriano. Genética bacteriana. Morfologia e estruturas de Archaeas. Nutrição e crescimento de Archaeas. Técnicas moleculares para Identificação de Microrganismos. Biologia dos fungos levuriformes e filamentosos. Nutrição e crescimento fúngico. Morfologia e estruturas de protozoários. Nutrição e crescimento dos protozoários. Métodos de controle microbiano. Propriedades gerais dos vírus e sua replicação. Patogênese bacteriana, fúngica e viral. Origem e Evolução dos vírus. Terapia Gênica. Príons. Bibliografia Básica: 44 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Madigan, M.T. et al. Microbiologia de Brock. São Paulo: Prentice Tortora, G.J. et al. Microbiologia. Porto Alegre: ArtMed, 10ª ed., 2010. SCHAECHTER, M.; INGRAHAM, J.L.; NEIDHARDT, F.C. Micróbio: uma visão geral. Artmed, 2010. Bibliografia Complementar: TRABULSI, L. R.; ALTERTHUM, F. Microbiologia. 5 ED. São Paulo: Atheneu. 2008. ZAITZ, C. Compêndio de Micologia Médica. Rio de Janeiro: Medsi. 1998. VERMELHO, A.B.; BASTOS, M.C.F.; SÁ, M.H.B. Bacteriologia geral. Guanabara Koogan, 2008. WINN JR., W.; et.al. Koneman diagnostic microbiológico. 6 ed. Guanabara Koogan, 2008. BLACK, J.G. Microbiologia. Fundamentos e perspectivas. 4 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2002. Microbiologia Aplicada e Industrial – 4 Créditos – terceiro semestre. Ementa: Histórico e novas tendências em bioprocessos/ microbiologia industrial; Morfologia e Bioquímica de procariotos e eucariotos; Fases de um processo microbiológico genérico; Microrganismos de interesse industrial e ambiental; Principais substratos industriais Rotas metabólicas de interesse industrial e ambiental; Fermentações; Aminoácidos; Antibióticos; Biotransformações; Biotecnologia Alimentícia. Bibliografia Básica: MADIGAN, M.T.; MARTINKO, D.; CLARK. Microbiologia de Brock. 12 ed. Porto Alegre: Artmed, 2010 TORTORA, G. J.; VAINSTEIN, M. H.; SCHRANK, A. (Cons., super. , rev.técn.). Microbiologia. Porto Alegre: Artmed, 2008. TRABULSI, L. R.; ALTERTHUM, F. Microbiologia. 5 ED. São Paulo: Atheneu. 2008. Bibliografia Complementar: BORZANI, W.; SCHMIDELL, W., LIMA, U.A.; AQUARONE, E. Biotecnologia Industrial. Volume 1. São Paulo: Edgard Blucher, 2001 VERMELHO, A.B.; BASTOS, M.C.F.; SÁ, M.H.B. Bacteriologia geral. Guanabara Koogan, 2008. WINN JR., W.; et.al. Koneman diagnostic microbiológico. 6 ed. Guanabara Koogan, 2008. ZAITZ, C. Compêndio de Micologia Médica. Rio de Janeiro: Medsi. 1998. 45 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia WESSNER, DUPONT. Microbiology. Willey 2013. Laboratório de Microbiologia– 2 Créditos – quarto semestre. Ementa: Métodos de isolamento e identificação microbiana. Manipulação correta de materiais potencialmente contaminados e normas de biossegurança. Estudo de métodos de assepsia, desinfecção e esterilização de materiais utilizados em laboratório microbiológico. Bibliografia Básica: TORTORA, G. J.; VAINSTEIN, M. H.; SCHRANK, A. (Cons., super. , rev.técn.). Microbiologia. Porto Alegre: Artmed, 2008. MADIGAN, M.T.; MARTINKO, D.; CLARK. Microbiologia de Brock. 12 ed. Porto Alegre: Artmed, 2010 BLACK, J.G. Microbiologia. Fundamentos e perspectivas. 4 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2002. Bibliografia Complementar: TRABULSI, L. R.; ALTERTHUM, F. Microbiologia. 5 ED. São Paulo: Atheneu. 2008. VERMELHO, A.B.; BASTOS, M.C.F.; SÁ, M.H.B. Bacteriologia geral. Guanabara Koogan, 2008. WINN JR., W.; et.al. Koneman diagnostic microbiológico. 6 ed. Guanabara Koogan, 2008. ZAITZ, C. Compêndio de Micologia Médica. Rio de Janeiro: Medsi. 1998. SCHAECHTER, M.; INGRAHAM, J.L.; NEIDHARDT, F.C. Micróbio: uma visão geral. Artmed, 2010. Fisiologia Humana– 4 Créditos – terceiro semestre Ementa Introdução à Respiração e Metabolismo celular. Sistema Muscular Esquelético, Sistema Nervoso Central. Sistema Nervoso Autônomo, Células sanguíneas. Física do Sangue. Sistema Cardiovascular. Sistema Respiratório. Sistema Digestório. Sistema Renal. Regulação da Temperatura Corporal. Endocrinologia. Processos Fisiopatológicos. Bibliografia Básica: Silverthorn, Deen Unglaub. - Fisiologia Humana – Uma Abordagem Integrada. 5a ed., 2010 - Ed. Artmed. Guyton, A C.; Hall, E. J. - Fisiologia Humana e Mecanismos das Doenças. 6a ed., 1997 - Ed. Guanabara Koogan. Constanzo L. Fisiologia. 3a ed., 2007- Ed. Elsevier. Berne & Levi - Fisiologia. 6a ed., 1997 - Ed. Elsevier. 46 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bibliografia Complementar: McArdle, W.D.; Katch, F.I.; Katch, V.L. Fisiologia do Exercício: Energia, Nutrição e Desempenho Humano. 6a. ed. 2008. Guanabara Koogan. Abbas, A.K.; Kumar, V; Fausto, N.; Aster, J.C. Robbins & Cotran – Patologia: Bases Patológicas das Doenças. 8a. ed. 2010. Elsevier. Nelson, D.L.; CoX, M.M. Princípios de Bioquímica de Lehninger. 5a. ed. 2011. Artmed. Carroll, Robert G - Fisiologia. 6a ed. 2007 - Ed. Elsevier 2007. Douglas, Carlos R -Tratado de Fisiologia Humana Aplicada às Ciências Médicas. 6a ed., 2006 – Ed. Guanabara-Koogan. Fisiologia Experimental– 4 Créditos – quarto semestre. Ementa: Este curso visa proporcionar conhecimento prático sobre o funcionamento dos sistemas orgânicos, bem como sobre as interrelações funcionais existentes entre eles. A disciplina foi estruturada para ser um guia do discente com informações objetivas, atualizadas e concisas, contribuindo para a integração dos domínios cognitivos, afetivos e psicomotor do aluno. Bibliografia Básica: Barker K. Na bancada - Manual de iniciação científica em laboratório de pesquisas biomédicas. 1. ed. Porto Alegre: Artmed, 2002. Feijó AGS, Braga LMGM, Pitrez PMC. Animais na pesquisa e no ensino: aspectos éticos e técnicos. 1. ed. Porto Alegre: EdiPUCRS, 2010. Andrade A, Pinto S, Oliveira R. Animais de laboratório: Criação e experimentação. 2. ed. Rio de Janeiro: Ed. Fiocruz, 2006. Bibliografia Complementar: Peterson S, Loring J. Human stem cell manual: A laboratory guide. 2. ed. São Paulo: Elsevier, 2012. Hedrich H. The laboratory mouse. 2. ed. São Paulo: Elsevier, 2012. Vianna LMA. Manual de fisiologia experimental. 1. ed. São Paulo: Yendis, 2009. Valle S, Telles JL. Bioética e biorrisco: Abordagem transdisciplinar. 1. ed. Rio de Janeiro: Interciência, 2003. Tharp GD, Woodman DA. Experiments in Physiology. 10. ed. Pearson, 2010. Fundamentos de Engenharia Bioquímica – 4 Créditos – quarto semestre. Ementa: Os conceitos apresentados nesta disciplina são essenciais para as etapas de transformação de descobertas biológicas em produtos de interesse industrial. A partir dos fundamentos da engenharia (balanços de massa e energia, fenômenos de 47 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia transporte e cinéticas de reações químicas) estabelecem-se as base para compreender e controlar às reações bioquímicas envolvidas nesse tipo de processo. Esses conhecimentos são fundamentais na definição e otimização das várias operações unitárias, tanto da fase de síntese (upstream), como de recuperação e purificação de produtos (downstream), que serão abordadas em disciplinas subsequentes. Bibliografia Básica: PM Doran, Bioprocess engineering principles. USA: Academic Press, 2012. 928p. ISBN 978-0122208515. RM Felder; RW Rousseau. PRINCIPIOS ELEMENTARES DOS PROCESSOS QUIMICO. Rio de Janeiro: LTC. 2005 (3a Ed). 604p. ISBN 978-8521614296. O Levenspiel. Engenharia das reações químicas. São Paulo: Editora Blücher, 2011. 563 p. ISBN 9788521202752. Bibliografia Complementar: HW Blanch; DS Clark. Biochemical engineering. Boca Raton: CRC/Taylor & Francis, 1997. 702 p. ISBN 9780824700997. J Villadsen , J Nielsen, G Lidén. Bioreaction Engineering Principles. Springer 2011 (3a Ed). 591p. ISBN 978-1441996879. DM Himmelblau; JB Riggs. ENGENHARIA QUIMICA - PRINCIPIOS E CALCULOS. Rio de Janeiro:LTC. 2006 (7a Ed). 2006. 868p., ISBN 978-8521615026. HS Fogler. Elementos de engenharia das reações químicas. 4.ed. Rio de Janeiro: LTC, 2009. 853 p. ISBN 9788521617167. ML Shuler; F Kargi. Bioprocess engineering: basic concepts. 2nd ed. Upper Saddle River: Prentice Hall, 2002. 553 p. ISBN 0130819085. Katho e Yoshida, Biochemical Engineering, Wiley 2009. ISBN 3527325360. Introdução à Biotecnologia – 2 Créditos – segundo semestre Ementa: O curso propõe uma introdução à Biotecnologia Clássica e Moderna mediante a breve explanação das principais técnicas (biologia molecular, microbiologia industrial e engenharia bioquímica) envolvidas na manufatura de produtos biológicos e a apresentação de um conjunto representativos de bioprodutos e bioprocessos das áreas das Biotecnologias “Branca” (produtos de aplicação industrial ou ambiental), “Vermelha” (produtos com aplicação na saúde) e “Verde” (produtos com aplicação agrícola). Bibliografia Básica: R Rennerberg. Biotechnology for beginners. China: Academic Press, 2008, 349p. ISBN 978-0-12-373581-2. N Lima; M Mota (Coord.). Biotecnologia: fundamentos e aplicações. Lisboa: 48 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Lidel, 2003. 505 p. ISBN 9789727571970. WJ Thieman; MA Palladino. Introduction to Biotechnology. Pearson Education, 2013 , 3rd Edition, 408p. ISBN 978-0321766113. Bibliografia Complementar: Schmidell, Willibaldo (Coord.) et al. Biotecnologia industrial: engenharia química. São Paulo: Edgard Blucher, 2001. v.2. 541 p. ISBN 9788521202790 . Lima, Urgel de Almeida (Coord.) et al. Biotecnologia industrial: processos fermentativos e enzimáticos. São Paulo: Edgard Blücher, 2001. v.3. 593 p. ISBN 9788521202806. 2ª Reimpressão - 2007; 4ª reimpressão - 2011. Bon, Elba P. S.; Ferrara, Maria Antonieta; Corvo, Maria Luísa (Ed.). Enzimas em biotecnologia: produção, aplicações e mercado. Rio de Janeiro: Interciência, 2008. 506 p. ISBN 9788571931893. JE Smith. Biotechnology. 5ed. Cambridge 2009. DP Clark, NJ Pazdernik. Biotechnology. Academic Cell Update. Elsevier 2012. Biologia Geral – 4 Créditos – quarto semestre Ementa: Evolução. Taxonomia e sistemática dos seres vivos. Fisiologia e morfologia animal. Fisiologia e morfologia vegetal. Bibliografia Básica: CAMPBELL, N.A.; REECE, J.B. Biology. 9 ed. Pearson 2011. PURVES, W.K.; SADAVA, D.; ORIANS, G.H.; HELLER, H.C. Vida: A ciência da Biologia. Vol II: Evolução, diversidade e ecologia. Porto Alegre: Artmed, 2005. MAYR, E. This Is Biology: The Science of the Living World. BELKNAP 1998. Bibliografia Complementar: RAVEN PH, EVERT RF, EICHHORN S. Biology of Plants. 8th Ed. Freeman 2012. KERBAUY, G.B. Fisiologia vegetal. 2 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2008. ORR, R.T., Biologia dos Vertebrados, 5ª Ed. Roca, 1986. Vários Autores. Princípios Integrados de Zoologia. 15ª Ed. Guanabara, 2013. MILLER, HARLEY. Zoology. 9ed. McGraw-Hill, 2012. Introdução à Ecologia – 4 Créditos – quinto semestre Ementa: Recursos naturais e ecossistemas. Interações entre as espécies. Fluxo de energia em ecossistemas. Biodiversidade e ecossistemas. Hiperciclos ecológicos. Fotossíntese e sequestro de carbono. Ecologia e Ciência do Sistema Terrestre. Ecologia e Agricultura sustentável. Evolução e ecologia. Bibliografia Básica: MILLER, T., Essentials of Ecology. Cengage 2005. 49 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia TOWNSEND, C.R.; BEGON, M.; HARPER, J. L. Fundamentos em Ecologia. 2ª Ed. PortoAlegre:Artmed, 2006. PURVES, W.K.; SADAVA, D.; ORIANS, G.H.; HELLER, H.C. Vida: A ciência da Biologia. Vol II: Evolução, diversidade e ecologia. Porto Alegre: Artmed, 2005. Bibliografia Complementar: RICKLEFS,R.E., A ECONOMIA DA NATUREZA, Guanabara 2010 BARRET,G.E., ODUM, E.P., Fundamentos de Ecologia, 5ª Ed. Thomson Pioneira, 2007. VALLERO, D.A. Environmental Biotechnology: A Biosystems Approach. Elsevier, Academic Press, 2010. FRANKHAM, Richard; BALLOU, Jonathan D.; BRISCOE, David A. Fundamentos da genética da conservação. SBG, 2008. PRIMACK, Richard B., 1950-; RODRGUES, Efraim. Biologia da conservação. Londrina: Planta, 2006. 4.3 Núcleo de conhecimentos profissionalizantes Introdução à Bioinformática – 4 Créditos – sétimo semestre Ementa: Este curso introdutório será fundamentalmente baseado na utilização de ferramentas bioinformáticas para o entendimento de diversos processos em biologia molecular e bioquímica. Com o advento das estratégias analíticas empregadas em biologia moderna, a bioinformática tem se tornado uma ciência de fundamental importância, sobretudo para auxiliar a interpretação e atribuir significância ao grande volume de informação adquirido. Bibliografia Básica: ARDREY, R.E. Liquid chromatogrtaphy – Mass spectrometry: An introduction. John Wiley & Sons, 2003. KANNICHT, C. Post translational modifications of proteins – tools for functional proteomics. Humana Press, 2002. KINTER, M.; SHERMAN, N.E. Protein sequencing and identification using tandem mass spectrometry. John Wiley & Sons, 2000. Bibliografia Complementar: TWYMAN, R.M. Principles of Proteomics. Taylor & Francis Group, 2007. 50 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia WESTERMEIER, R.; NAVEN, T. Proteomics in Practice: a laboratory manual of proteome analysis. Darmstadt-German, Wiley-VCH Verlag-GmbH Press, 2002. Bischoff, R., Schlüter, H. Amino acids: chemistry, functionality and selected nonenzymatic post translational modifications. J. Proteomics 75:2275-96, 2012. Cottrell, J.S. Protein identification using MS/MS data. J. Proteomics 74:1842-51, 2011. Artigos a serem entregues durante as aulas. Bioinformática Avançada –Eletiva - 4 créditos – sexto semestre Ementa: Introdução à linguagem Python e ao uso de bibliotecas de BioPython. Métodos de Alinhamento de Sequências simples (Needleman-Wunsch, SmithWaterman, BLAST). Métodos de alinhamentos múltiplos. Modelos de Markov escondidos. Análise de Clusters. Análise de Componentes Principais. Métodos de sequenciamento, montagem e análise de genomas. Bibliografia Básica: KINSER, J.M. Python for Bioinformatics. Jones & Barltett, 2008. MOUNT, D.W. Bioinformatics. 2nd Ed. CSHL Press, 2004. LESK, A.M. Introdução à Bioinformática. 2ª Ed. Artmed, 2005. Bibliografia Complementar: GRAUR, D.; LI, W.H. Fundamentals of Molecular Evolution. 2nd Ed. Sinauer, 2000. N. C. Jones and P. A. Pevzner. An Introduction to Bioinformatics Algorithms, The MIT Press; 1 edition, 2004. D. Gusfield. Algorithms on Strings, Trees and Sequences: Computer Science and Computational Biology. Cambridge, UK: Cambridge University Press, 1997 M. Waterman. Introduction to Computational Biology: Maps, Sequences, and Genomes, Boca Raton, FL: CRC Press, 1995. R. Durbin, S. R. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison: Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids, Cambridge University Press, 1998. Introdução à Biologia de Sistemas – 4 créditos – sexto semestre Ementa: A biologia sistêmica compreende o estudo interdisciplinar de sistemas biológicos, sobretudo com auxílio de modelos matemáticos e/ou computacionais. De forma mais específica, em biologia sistêmica busca-se entender as propriedades que emergem da interação entre as partes, em detrimento ao entendimento 51 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia (exclusivamente) do funcionamento destas de forma isolada. Ao longo deste curso introdutório serão apresentados temas-chave em biologia sistêmica, bem como artigos científicos que ilustram as propriedades de sistemas biológicos, tais como (a) modularidade, (b) robustez e (c) utilização recorrente de elementos de circuito (network motifs). Uma introdução à modelagem matemática de redes biológicas e identificação de padrões de interação será também apresentada. Tentativamente, os alunos serão familiarizados com o programa Cytoscape, para análise e integração de dados oriundos de redes de interação biológica. Bibliografia Básica: Voit, E.O. A first course in systems biology. Garland Science, 2013. Alon, U. An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits (Chapman and Hall/CRC Press), 2006. Klip, E., Liebermeister, W.,Wierling, C., Kowald, A., Lehrach, H., Herwig, R. Systems biology - A textbook. Wiley-VCH, 2009. Bibliografia Complementar: Watts, D.J. Six degrees: the science of a connected age. W.W. Norton & Company, 2004. Milo, R., Shen-Orr, S., Itzkovitz, S., Kashtan, N., Chklovskii,D., Alon, U. Network motifs: simple building blocks of complex networks. Science, 298:824-827, 2002. Alon, U. Biological networks:The tinkerer as an engineer.Science 301:1866-67, 2003. Kitano, H. Biological robusteness. Nat.Gen.5: 826-837, 2004. Bray, D. Molecular networks:the top-down view. Science 301, 1864-65, 2003. Proteômica - Eletiva – 4 créditos – sétimo semestre. Ementa: O estudo do complemento protéico do genoma (proteoma) tem se consolidado como ciência e revelado importantes desafios na biologia contemporânea. O entendimento da proteômica como ciência passa obrigatoriamente pela compreensão de características físico-químicas de proteínas e peptídeos, bem como pelos conceitos já bem estabelecidos de análise de dados em larga-escala, tais como na genômica e na transcriptômica. As plataformas bioinformáticas em proteômica tem evoluído concomitantemente com as novas tecnologias de aquisição de dados, desta forma, torna-se de fundamental importância entender os algoritmos bioinformáticos que norteiam a análise, identificação e sequenciamento de peptídeos por espectrometria de massas. 52 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bibliografia Básica: ARDREY, R.E. Liquid chromatogrtaphy – Mass spectrometry: An introduction. John Wiley & Sons, 2003. KANNICHT, C. Post translational modifications of proteins – tools for functional proteomics. Humana Press, 2002. KINTER, M.; SHERMAN, N.E. Protein sequencing and identification using tandem mass spectrometry. John Wiley & Sons, 2000. Bibliografia Complementar: TWYMAN, R.M. Principles of Proteomics. Taylor & Francis Group, 2007. WESTERMEIER, R.; NAVEN, T. Proteomics in Practice: a laboratory manual of proteome analysis. Darmstadt-German, Wiley-VCH Verlag-GmbH Press, 2002. Bischoff, R., Schlüter, H. Amino acids: chemistry, functionality and selected nonenzymatic post translational modifications. J. Proteomics 75:2275-96, 2012. Cottrell, J.S. Protein identification using MS/MS data. J. Proteomics 74:1842-51, 2011. Artigos a serem entregues durante as aulas. Biologia Estrutural - Eletiva – 4 Créditos – sexto semestre Ementa: Introdução à biologia molecular. Estrutura dos ácidos nucleicos e das proteínas. Exemplos de estruturas de proteínas das vias de sinalização, de enzimas e de complexos proteicos. Classificação estrutural das proteínas. Biofísica Molecular. Cristalografia de Raios X. RMN. Bibliografia Básica: BRANDEN, C.; TOOZE, J. Introduction to Protein Structure, 2nd Ed., Garland,1999. DRENTH, J. Principles of Protein X-Ray Crystallography, 3rd Ed. Springer, 2006. LESK, A. Introduction to Protein Science, Architecture, Function and Genomics, Oxford, 2010. Bibliografia Complementar: DONALD VOET & JUDITH G. VOET. Bioquímica Ed. Artmed, 2007. MCREE, D. Practical Protein Crystallography, 2ª Ed., Academic Press 1999. BANASZAK, L.J. Foundations of Structural Biology. Elsevier, 2000. BRUCE ALBERTS et al. Biologia Molecular da célula. 4ª Edição, Artmed, 2004. LILJAS, A. et al. Textbook of Structural Biology. World Scientific Publishing, 2009. 53 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Modelagem Molecular– Eletiva - 4 Créditos – sétimo semestre. Ementa: Métodos de bioinformática estrutural. Modelagem molecular. Mecânica Molecular. Dinâmica molecular. Cálculos energéticos. Desenho racional de fármacos. Bibliografia Básica: LEACH, A.R. Molecular Modelling, Principles and Applications. 2nd Ed. Prentice Hall 2001. SCHLICK, T. Molecular Modeling and Simulation. Springer 2002. CRAMER, C.J. Computational Chemistry. Wiley 2002. Bibliografia Complementar: FIELD, M.J. A Practical Introduciton to the Simulation of Molecular Systems. JENSEN, J.H. Molecular Modeling. CRC Press 2012. HINCHLIFFE. Molecular Modelling for Beginners. 2a Ed. Wiley 2011. BRANDEN, C.; TOOZE, J. Introduction to Protein Structure, 2nd Ed., Garland,1999. MILLER, TANNER. Essentials of Chemical Biology. Structure and Dynamics of Biological Macromolecules. Wiley 2013. Química Medicinal I –Eletiva - 4 Créditos – sexto semestre Ementa: Introdução. Estrutura e características de fármacos. Relações estruturafunção de receptores e alvos moleculares. Princípios de desenho de fármacos. Produtos naturais. Biofármacos. Estratégias gerais em síntese e purificação de fármacos. Farmacocinética. Fases de desenvolvimento de fármacos. Aprovação e produção. Aspectos Legais. Bibliografia Básica: BARREIRO, E.J.; FRAGA, C.A.M. Química medicinal: as bases moleculares da ação dos fármacos. 2. ed. Porto Alegre: Artmed, 2008. THOMAS, G. Química medicinal: uma introdução. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2003. WERMUTH, C.G. The pratice of medicinal chemistry. 3rd. ed. Amsterdam: Elsevier, 2008. Bibliografia Complementar: Nogrady T, Weaver D. Medicinal Chemistry. 2nd ed. Oxford 2005. Patrick, G.L. An Introduction to Medicinal Chemistry. 5a Ed. Oxford 2013. DONALD VOET & JUDITH G. VOET. Bioquímica Ed. Artmed, 2007. STRYER, L.; TYMOCZKO, J.L.; BERG, J.M. Bioquímica. 5a ed., Ed. GuanabaraKoogan, 2004. 54 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia NELSON, D.L.; COX, M.M. LEHNINGER princípios de bioquímica. 5a ed. Porto Alegre: Artmed, 2011. Química Medicinal II –Eletiva - 4 Créditos – sétimo semestre Ementa: Principais classes de fármacos e seus alvos moleculares. Neurotransmissores e seus receptores. Hormônios e seus receptores. Imunomoduladores e seus receptores. Alvos membranares. Alvos citoplasmáticos. Organismos patogênicos como alvos. Bibliografia Básica: BARREIRO, E.J.; FRAGA, C.A.M. Química medicinal: as bases moleculares da ação dos fármacos. 2. ed. Porto Alegre: Artmed, 2008. THOMAS, G. Química medicinal: uma introdução. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2003. WERMUTH, C.G. The practice of medicinal chemistry. 3rd. ed. Amsterdam: Elsevier, 2008. NOGRADY T, WEAVER D. Medicinal Chemistry. 2nd ed. Oxford 2005. Bibliografia Complementar: Nogrady T, Weaver D. Medicinal Chemistry. 2nd ed. Oxford 2005. Patrick, G.L. An Introduction to Medicinal Chemistry. 5a Ed. Oxford 2013. DONALD VOET & JUDITH G. VOET. Bioquímica Ed. Artmed, 2007. STRYER, L.; TYMOCZKO, J.L.; BERG, J.M. Bioquímica. 5a ed., Ed. GuanabaraKoogan, 2004. NELSON, D.L.; COX, M.M. LEHNINGER princípios de bioquímica. 5a ed. Porto Alegre: Artmed, 2011. Engenharia Tecidual e Medicina Regenerativa – Eletiva- 4 Créditos – sétimo semestre Ementa: Disciplina teórica. Visa promover o entendimento dos princípios e conceitos da engenharia molecular, celular e tecidual; ensinar as técnicas básicas de engenharia tecidual; e estimular a aplicação dos conceitos básicos da engenharia tecidual à problemas práticos da área da saúde. Bibliografia Básica: MCCONNELL, J. et al. Anatomy, Physiology and Pathology of the Skeletal System. Versão online gratuita, 2008. DAVIES, J.E. Bone Engineering. Editora Em2. 2000. MUKHERJEE, A. Biomimetics: Learning from Nature. InTech , 2010 55 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bibliografia Complementar: LANZA, R., LANGER, R, VACANTI, J.P. Principles of Tissue Engineering. 3 ed. San Diego: Academic Press, 2007 PALSSON, B., HUBBELL, J.A., PLONSEY, R., BRONZINO, J.D. Tissue Engineering (Principles and Applications in Engineering). 1 ed., New York: CRC, 2003. ALBERTS, Bruce et al. Biologia molecular da célula. 5.ed. Artmed 2010. Lodish, H. e cols. Biologia Celular e Molecular. 5a ed., Ed. Artmed 2005. Cooper. A Célula – Uma Abordagem Molecular. 3a ed. Ed. Artmed 2007. Imunologia Geral –Eletiva - 4 Créditos – sexto semestre Ementa: Visão histórica. Sistema imune inato e adaptativo. Anticorpos: isotipos, recombinação somática. Antígeno. Sistema complemento. Órgãos e células do sistema imune. Resposta imune humoral e celular. Rede idiotípica. Reações de Hipersensibilidade. Receptores celulares. Linfocinas e citocinas. Controle da resposta imune. Imunidade e infecção. Bibliografia Básica: CALICH, V.L.G.; VAZ, C.A.C. Imunologia. Rio de Janeiro: Revinter, 2001. 260 p. ABBAS, A.K.; LICHTMAN, A.H. Imunologia básica: funções e distúrbios do sistema imunológico. Patricia Dias Fernandes (Trad.). 3ª ed. Rio de Janeiro: Elsevier, 2009. ABBAS, A.K.; LICHTMAN, A.H.; PILLAI, S. Imunologia celular e molecular. Claudia Reali (Trad.), et al. 6ª ed. Rio de Janeiro: Elsevier, 2008. Bibliografia Complementar: BENJAMINI, E.; COICO, R.; SUNSHINE, G. Imunologia. Rafael Silva Duarte (Trad.). 4 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, c2002. JANEWAY JR, C.A. et al. Imunobiologia: o sistema imune na saúde e na doença. Cristina Bonorino (Trad.). 5 ed. Porto Alegre: Artmed, 2002. GODING, JAMES W. Monoclonal antibodies: principles and practice. 3 ed. London: Academic Press, 1993. 492 p. ZHIQIANG AN. Therapeutic Monoclonal Antibodies: From Bench to Clinic. 1 ed. Wiley& Sons, 2009. ROITT, I.M.; BROSTOFF, J.; MALE, D. Imunologia. Ida Cristina Gubert (Trad.). 6ª ed. Barueri - SP: Manole, 2003. 56 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Imunologia Aplicada –Eletiva - 4 créditos – sétimo semestre Ementa: Linfocinas, citocinas e sinalização celular. Imunoprofilaxia. Imunidade e tumores. Imunidade e transplantes. Doenças auto-imunes. Soros e vacinas. Anticorpos como ferramentas biotecnológicas. Bibliografia Básica: CALICH, V.L.G.; VAZ, C.A.C. Imunologia. Rio de Janeiro: Revinter, 2001. 260 p. ABBAS, A.K.; LICHTMAN, A.H. Imunologia básica: funções e distúrbios do sistema imunológico. Patricia Dias Fernandes (Trad.). 3ª ed. Rio de Janeiro: Elsevier, 2009. ABBAS, A.K.; LICHTMAN, A.H.; PILLAI, S. Imunologia celular e molecular. Claudia Reali (Trad.), et al. 6ª ed. Rio de Janeiro: Elsevier, 2008. Bibliografia Complementar: BENJAMINI, E.; COICO, R.; SUNSHINE, G. Imunologia. Rafael Silva Duarte (Trad.). 4 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, c2002. JANEWAY JR, C.A. et al. Imunobiologia: o sistema imune na saúde e na doença. Cristina Bonorino (Trad.). 5 ed. Porto Alegre: Artmed, 2002. GODING, JAMES W. Monoclonal antibodies: principles and practice. 3 ed. London: Academic Press, 1993. 492 p. ZHIQIANG AN. Therapeutic Monoclonal Antibodies: From Bench to Clinic. 1 ed. Wiley& Sons, 2009. ROITT, I.M.; BROSTOFF, J.; MALE, D. Imunologia. Ida Cristina Gubert (Trad.). 6ª ed. Barueri - SP: Manole, 2003. Biotecnologia Animal –Eletiva- 4 créditos – sexto semestre Ementa: Conceitos gerais. Bases da zoologia. Bases da fisiologia animal. Introdução à Biotecnologia animal. Aplicações. Doenças veterinárias de interesse econômico. Biotecnologia aplicada à produção e reprodução animal. Métodos de cultivo de células animais in vitro. Métodos de transferência de genes para células de mamíferos e células de insetos. Animais transgênicos: aplicações. Clonagem de animais. Bibliografia Básica: COLLARES, T. Animais transgênicos - princípios & métodos. Sociedade brasileira de genética, 2005. GONÇALVES, P.B.D.; FIGUEIREDO, J.R.; FREITAS, V.J.F. Biotécnicas Aplicadas à Reprodução Animal. Roca, 2008. CASTILHO, L.R.; AUGUSTO, E.F.P.; MORAES, A. Tecnologia de Cultivo de Células Animais - de Biofármacos à Terapia Gênica. Roca, 2008. 57 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bibliografia Complementar: ALBERTS, A.; BRAY, D., JOHNSON, A, LEWIS, J., RAFF, M., ROBERTS, K.; WALTER, P. Fundamentos da Biologia Celular. 1999. Editora Artmed – Porto Alegre – RS; LODISH, H. et al. Biologia Celular e Molecular. 2005. 5a ed., Ed. Artmed; LEHNINGER, A.L.; NELSON, D.I.; COX, M.M. Princípios de Bioquímica. 2007. 4a ed. Ed. Sarvier. R Rennerberg. Biotechnology for beginners. China: Academic Press, 2008. JE Smith. Biotechnology. 5ed. Cambridge 2009. Modelos Animais– Eletiva- 4 Créditos – sétimo semestre Ementa: Introdução de modelos experimentais em medicina e biologia. Roedores. C. elegans. D. melanogaster. Zebra fish. Transgenia. Nocauteamento gênico. RNA de interferência. Morfolinos. Bibliografia Básica: COLLARES, T. Animais transgênicos - princípios & métodos. Sociedade brasileira de genética, 2005. GONÇALVES, P.B.D.; FIGUEIREDO, J.R.; FREITAS, V.J.F. Biotécnicas Aplicadas à Reprodução Animal. Roca, 2008. CASTILHO, L.R.; AUGUSTO, E.F.P.; MORAES, A. Tecnologia de Cultivo de Células Animais - de Biofármacos à Terapia Gênica. Roca, 2008. Bibliografia Complementar: ALBERTS, A.; BRAY, D., JOHNSON, A, LEWIS, J., RAFF, M., ROBERTS, K.; WALTER, P. Fundamentos da Biologia Celular. 1999. Editora Artmed – Porto Alegre – RS; LODISH, H. et al. Biologia Celular e Molecular. 2005. 5a ed., Ed. Artmed; LEHNINGER, A.L.; NELSON, D.I.; COX, M.M. Princípios de Bioquímica. 2007. 4a ed. Ed. Sarvier. R Rennerberg. Biotechnology for beginners. China: Academic Press, 2008. JE Smith. Biotechnology. 5ed. Cambridge 2009. Engenharia Bioquímica I – 4 Créditos – quinto semestre Ementa: Apresentação dos conceitos teóricos envolvidos na pesquisa e no desenvolvimento de processos biotecnológicos de interesse industrial. As ferramentas apresentadas nesta disciplina - estequiometria e cinética de bioprocesso, análise de bioprocesso e projeto de biorreatores - devem possibilitar a compreensão dos 58 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia fenômenos biológicos e controlar às reações bioquímicas envolvidas nesse tipo de processo. Esses conhecimentos são fundamentais na definição e otimização das várias operações unitárias, notadamente na fase de síntese do bioproduto ("upstream"). Bibliografia Básica: SHULER, M.L.; KARGI, F. Bioprocess engineering: basic concepts. BioprocessEngineering: Basic Concepts, 2ndEdition, Prentice Hall,2001, 576p. SCHMIDELL, W.; LIMA, U.A.; AQUARONE, E.; BORZANI, W. Biotecnologia industrial. vol 2: Engenharia Bioquímica, Edgard Blucher, 2000. RATLEDGE, C.; KRISTIANSEN, B. Basic Biotechnology. Cambridge University Press; 3rd edition, 2006 Bibliografia Complementar: Fonseca, M.M.; Teixeira, J.A. Reatores biológicos: fundamentos e aplicações. Lisboa: Lidel Edições Técnicas, 2007, 483p. (Colecão Biotec) ISBN 9727573665 Levenspiel, O. Engenharia das reações químicas. São Paulo: Editora Blücher, 2011. 563 p. ISBN 9788521202752. Fogler, H.S. Elementos de engenharia das reações químicas. 4.ed. Rio de Janeiro: LTC, 2009. 853 p. ISBN 9788521617167 Blanch, H.W.; Clark, D.S. Biochemical engineering. Boca Raton: CRC/Taylor & Francis, 1997. 702 p. ISBN 9780824700997 Doran, P.M. Bioprocess engineering principles. USA: Academic Press, 2012. Engenharia Bioquímica II – 4 Créditos – sexto semestre Ementa: Apresentação dos conceitos teóricos envolvidos na pesquisa e no desenvolvimento de processos biotecnológicos de interesse industrial. As ferramentas apresentadas nesta disciplina - ampliação de escala de bioprocessos, monitoramento e controle de bioprocessos, separação e purificação de bioproduto, avaliação econômica - em conjunto com aqueles vistos anteriormente na disciplina Engenharia Bioquímica I (pré-requisito), devem possibilitar uma compreensão total dos fenômenos biológicos e técnicas de controle das reações bioquímicas envolvidas nesse tipo de bioprocesso. Esses conhecimentos são fundamentais na definição e na otimização das várias operações unitárias, tanto da fase de síntese do bioproduto ("upstream"), como de sua separação e purificação (“downstream”). Bibliografia Básica: PESSOA Jr, A, KILIKIAN B. Purificação de processos biotecnológicos. Manole, 2005, 444p. SHULER, M.L.; KARGI, F. Bioprocess engineering: basic concepts. 59 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia BioprocessEngineering: Basic Concepts, 2ndEdition, Prentice Hall,2001, 576p. SCHMIDELL, W.; LIMA, U.A.; AQUARONE, E.; BORZANI, W. Biotecnologia industrial. vol 2: Engenharia Bioquímica, Edgard Blucher, 2000. Bibliografia Complementar: Blanch H.W.; Clark D.S. Biochemical engineering. Boca Raton: CRC/Taylor & Francis, 1997. 702 p. ISBN 9780824700997 Nielsen J.; Villadsen J.; Lidén, G. Bioreaction Engineering Principles. Springer 2011 (3a Ed). 591p. ISBN 978-1441996879. RATLEDGE, C.; KRISTIANSEN, B. Basic Biotechnology. Cambridge University Press; 3rd edition, 2006 Fonseca M.M.; Teixeira J.A. Reatores biológicos: fundamentos e aplicações. Lisboa: Lidel Edições Técnicas, 2007, 483p. (Colecão Biotec) ISBN 9727573665 DORAN, P.M. Bioprocess engineering principles. USA: Academic Press, 2012. Laboratório de Engenharia Bioquímica – 2 créditos – sexto semestre Ementa: A disciplina pretende consolidar importantes conceitos teóricos aprendidos em disciplinas de engenharia bioquímica, microbiologia e bioquímica, mediante uma série de experimentos realizados em escala de bancada (frascos e biorreator). Esses conceitos são essenciais no desenvolvimento e na otimização de bioprocessos de interesse industrial. Os experimentos concentram-se nas operações unitárias da fase de síntese do produto (upstream), i.e., cinéticas enzimática e microbiana, modo de operação e caracterização de biorreatores, bem como naquelas operações características da etapa de separação e purificação de bioprodutos (downstream). Bibliografia Básica: PELCZAR M.; CHAN E.C.S.; KRIEG N.R. Microbiologia, 2a ed., vol.1, Makron Books, São Paulo, 1997. PESSOA A; KILIKIAN B. Purificação de processos biotecnológicos. Manole, 2005, 444p. SHULER M.L.; KARGI F. Bioprocess engineering: basic concepts. BioprocessEngineering: Basic Concepts, 2ndEdition, Prentice Hall,2001, 576p. Bibliografia Complementar: SCHMIDEL W.; LIMA U.A.; AQUARONE E.; BORZANI W. Biotecnologia industrial. vol 2: Engenharia Bioquímica, Edgard Blucher, 2000. Blanch HW; Clark DS. Biochemical engineering. Boca Raton: CRC/Taylor & Francis, 1997. 702 p. ISBN 9780824700997 Nielsen J, Villadsen J, Lidén, G. Bioreaction Engineering Principles. Springer 2011 60 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia (3a Ed). 591p. ISBN 978-1441996879. RATLEDGE C.; KRISTIANSEN B. Basic Biotechnology. Cambridge University Press; 3rd edition, 2006 Fonseca MM; Teixeira JA. Reatores biológicos: fundamentos e aplicações. Lisboa: Lidel Edições Técnicas, 2007, 483p. (Colecão Biotec) ISBN 9727573665 Biotecnologia de Energias Renováveis I –Eletiva - 4 Créditos – sexto semestre Ementa: Introdução: histórico no Brasil e no mundo. Biomassa. Bioetanol. Engenharia bioquímica do bioetanol. Substratos lignocelulósicos. Aspectos econômicos da produção de bioetanol. Combustível fóssil x biocombustível. Desafios para a agricultura e desenvolvimento sustentável. Bibliografia Básica: Hinrichs, R.A., Kleinbach, M., Reis, L.B. Energia e Meio Ambiente. Cengage Learning, 2011. MOUSDALE D. BIOFUELS - Biotechnology, Chemistry, and Sustainable Development. CRC Press, 2008. BNDES; CGEE. Bioetanol de cana-de-açúcar - energia para o desenvolvimento sustentável. Rio de Janeiro: BNDES, 2008. Bibliografia Complementar: GOLDENBERG,J., LUCON, O., Energia, meio ambiente e desenvolvimento, 3a edição, Editora da Universidade de São Paulo, 2008. BORBA, M., GASPAR, N. (Trad.). Um futuro com energia sustentável: iluminando o caminho. São Paulo: FAPESP; Amsterdam: InterAcademy Council; Rio de Janeiro: Academia Brasileira de Ciências, 2010. Disponível online em http://www.fapesp.br/publicacoes/energia.pdf CGEE. Bioetanol combustível: uma oportunidade para o Brasil. Brasília: CGEE, 2009. Klass, D. Biomass for Renewable Energy, Fuels, and Chemicals, Academic Press Publications, 1998. Gupta, R.B., Demirbas, A. Gasoline, Diesel and Ethanol Biofuels from Grasses and Plants. Cambridge University Press, 2010. Biotecnologia de Energias Renováveis II –Eletiva - 4 Créditos – sétimo semestre Ementa: Biogás. Butanol. Hidrogênio. Biocombustíveis avançados. Fermentação de pentoses. Rotas termoquímicas para obtenção de biocombustíveis de segunda 61 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia geração. Biocombustíveis de algas. Biocombustíveis de aviação. Sustentabilidade da produção de biocombustíveis. Biorrefinarias. Bibliografia Básica: Hinrichs, R.A., Kleinbach, M., Reis, L.B. Energia e Meio Ambiente. Cengage Learning, 2011. MOUSDALE D. BIOFUELS - Biotechnology, Chemistry, and Sustainable Development. CRC Press, 2008. Brown, R.C., Brown, T.R. Biorenewable Resources: Engineering New Products from Agriculture. 2nd ed., John Wiley & Sons, 2013. Bibliografia Complementar: GOLDENBERG,J., LUCON, O., Energia, meio ambiente e desenvolvimento, 3a edição, Editora da Universidade de São Paulo, 2008. BORBA, M., GASPAR, N. (Trad.). Um futuro com energia sustentável: iluminando o caminho. São Paulo: FAPESP; Amsterdam: InterAcademy Council; Rio de Janeiro: Academia Brasileira de Ciências, 2010. Disponível online em http://www.fapesp.br/publicacoes/energia.pdf Drapcho, C.M., Nhuan, N.P., Walker , T.H., Biofuels Engineering. McGraw-Hill 2008. Klass, D. Biomass for Renewable Energy, Fuels, and Chemicals, Academic Press Publications, 1998. Gupta, R.B., Demirbas, A. Gasoline, Diesel and Ethanol Biofuels from Grasses and Plants. Cambridge University Press, 2010. Biotecnologia Ambiental I– Eletiva- 4 Créditos – sexto semestre Ementa: Avaliação da biodiversidade para manutenção e conservação dos ecossistemas para seu uso aplicado. Processos biológicos de transformação de resíduos. Tratamentos aeróbios e anaeróbios. Remediação biológica utilizando microrganismos e plantas. Processos ambientalmente corretos envolvidos nas tecnologias verdes ou limpas (“greentech” ou “cleantech”). Prevenção, detecção e monitoramento. Efeitos bioquímicos e fisiológicos dos poluentes nos organismos. Desenvolvimento sustentável. Bibliografia Básica: VALLERO, D.A. Environmental Biotechnology: A Biosystems Approach. Elsevier, Academic Press, 2010. FRANKHAM, Richard; BALLOU, Jonathan D.; BRISCOE, David A. Fundamentos da genética da conservação. SBG, 2008. 62 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia G. M. Evans, J. C. Furlong, Environmental Biotechnology. Theoryand Application. John Wiley & Sons, England, 2003. Bibliografia Complementar: FRANKHAM, Richard; BALLOU, Jonathan D.; BRISCOE, David A. Introduction to Conservation Genetics. Cambridge University Press, 2ª edição, 2010. PRIMACK, Richard B., 1950-; RODRGUES, Efraim. Biologia da conservação. Londrina: Planta, 2006. BARRET,G.E., ODUM, E.P., Fundamentos de Ecologia, 5ª Ed. Thomson Pioneira, 2007. VALLERO, D.A. Environmental Biotechnology: A Biosystems Approach. Elsevier, Academic Press, 2010. RICKLEFS,R.E., A ECONOMIA DA NATUREZA, Guanabara 2010. Biotecnologia Ambiental II– Eletiva- 4 Créditos – sétimo semestre Ementa: Parâmetros químicos e biológicos. Métodos de tratamento e purificação de água. Filtração. Métodos químicos. Dessalinização. Métodos aeróbicos. Métodos anaeróbicos. Tecnologia de tratamento de efluentes. Bibliografia Básica: VALLERO, D.A. Environmental Biotechnology: A Biosystems Approach. Elsevier, Academic Press, 2010. METCALF & EDDY INC. Wastewater Engineering.4ª Ed. McGrawHill, 2003. G. M. Evans, J. C. Furlong, Environmental Biotechnology. Theoryand Application. John Wiley & Sons, England, 2003. Bibliografia Complementar: FRANKHAM, Richard; BALLOU, Jonathan D.; BRISCOE, David A. Introduction to Conservation Genetics. Cambridge University Press, 2ª edição, 2010. PRIMACK, Richard B., 1950-; RODRGUES, Efraim. Biologia da conservação. Londrina: Planta, 2006. BARRET,G.E., ODUM, E.P., Fundamentos de Ecologia, 5ª Ed. Thomson Pioneira, 2007. VALLERO, D.A. Environmental Biotechnology: A Biosystems Approach. Elsevier, Academic Press, 2010. RICKLEFS,R.E., A ECONOMIA DA NATUREZA, Guanabara 2010. 63 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Botânica e Fisiologia Vegetal- Eletiva- 4 Créditos – sexto semestre Ementas: Classificação das Plantas. Algas. Musgos. Líquens. Pteridófitas. Gimnospermas. Angiospermas. Estrutura e Desenvolvimento de Angiospermas. Fisiologia Vegetal. Regulação hormonal do crescimento e desenvolvimento. Fatores de crescimento. Solo e nutrição. Transporte de substâncias e solutos. Bibliografia Básica: RAVEN PH, EVERT RF, EICHHORN S. Biology of Plants. 8th Ed. Freeman 2012. PRADO, C.B.A.; CASALI, C.A. Fisiologia vegetal: práticas em relações hídricas, fotossíntese e nutrição mineral. Barueri: Manole, c2006. KERBAUY, G.B. Fisiologia vegetal. 2 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2008. Bibliografia Complementar: JOLY, A.B. 1979. Botânica: introdução à taxonomia vegetal. 5ª ed. São Paulo, Editora Nacional. 777 p. FERRI, M.G.; MENEZES, N.L.; MONTEIRO, W.R. 1981. Glossário Ilustrado de Botânica. São Paulo, Ed. Nobel. 197 p. PRADO, C.B.A.; CASALI, C.A. Fisiologia vegetal: práticas em relações hídricas, fotossíntese e nutrição mineral. Barueri: Manole, c2006. KERBAUY, G.B. Fisiologia vegetal. 2 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2008. JE Smith. Biotechnology. 5ed. Cambridge 2009. Biotecnologia Vegetal– Eletiva- 4 Créditos – sétimo semestre Ementa: Conceitos básicos. Histórico da biotecnologia vegetal: melhoramento clássico versus manipulação genética. Micropropagação: cultura de células, tecidos e órgãos de plantas. Germinação e conservação de sementes. Bancos de germoplasma. Plantas transgênicas. Métodos de transformação de plantas. Bases moleculares da resistência de plantas a doenças. Interação planta-patógeno. Interação planta-insetos. Bibliografia Básica: PRADO, C.B.A.; CASALI, C.A. Fisiologia vegetal: práticas em relações hídricas, fotossíntese e nutrição mineral. Barueri: Manole, c2006. KERBAUY, G.B. Fisiologia vegetal. 2 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2008. Biology ofplants. 7 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, c2001. Bibliografia Complementar: Pierik, R.L.M. In vitro Culture of Higher Plants. Martinus Nijhoff Publishers, Dordrecht. 1987. Reinert, J. e Yeoman, M.M. Plant Cell and Tissue Culture. A laboratory Manual. Sringer Verlag, Berlin. 1982. 64 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Torres, A.C., Caldas, L.S. e Buso, J.A. Cultura de Tecidos e Transformação Genética de Plantas. Embrapa – CNPH – CBAB, vol.1, 1998. R Rennerberg. Biotechnology for beginners. China: Academic Press, 2008. JE Smith. Biotechnology. 5ed. Cambridge 2009. Bioética e Biossegurança – 2 Créditos – quinto semestre Ementa: Origens dos critérios éticos e da moral. Ética médica. Direitos humanos. Eugenica. Diversidade e Racismo. Conceitos de etnia. A origem e herança africana do ser humano. Biossegurança no contexto da atividade e tecnologias humanas e dos eventos naturais. Análise de risco. Legislação correspondente. Repercussão na sociedade das questões relativas a ética e segurança. Bibliografia Básica: How risky is it, really? - David Ropeik, 2010, McGrawHill. Risco, John Adams, 1995, Editora Senac. Manual de Biossegurança, Mario H. Hirata, Rosario D.C. Hirata, Jorge Mancini Fo, 2012, Manole. Bibliografia Complementar: The better angels of our nature - why violence has declined, Steven Pinker, 2011, Viking. Whole earth discipline – Stewart Brand, 2009. Voodoo science, the road from foolishness to fraud, Robert L. Park, Oxford University Press, 2000. Armas, germes e aço - Jared Diamond, 2007. JE Smith. Biotechnology. 5ed. Cambridge 2009. Ecologia Avançada – Eletiva – 4 Créditos – sétimo semestre Ementa: Ciclos biogeoquímicos. Evolução e a biosfera. Modelagem ambiental. A hidrosfera. A atmosfera. Solo e sedimentos. Erosão. Fatores antropomórficos. Bibliografia Básica: MILLER, T., Essentials of Ecology. Cengage 2005. TOWNSEND, C.R.; BEGON, M.; HARPER, J. L. Fundamentos em Ecologia. 2ª Ed. PortoAlegre:Artmed, 2006. PURVES, W.K.; SADAVA, D.; ORIANS, G.H.; HELLER, H.C. Vida: A ciência da Biologia. Vol II: Evolução, diversidade e ecologia. Porto Alegre: Artmed, 2005. 65 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bibliografia Complementar: RICKLEFS,R.E., A ECONOMIA DA NATUREZA, Guanabara 2010 BARRET,G.E., ODUM, E.P., Fundamentos de Ecologia, 5ª Ed. Thomson Pioneira, 2007. VALLERO, D.A. Environmental Biotechnology: A Biosystems Approach. Elsevier, Academic Press, 2010. FRANKHAM, Richard; BALLOU, Jonathan D.; BRISCOE, David A. Fundamentos da genética da conservação. SBG, 2008. PRIMACK, Richard B., 1950-; RODRGUES, Efraim. Biologia da conservação. Londrina: Planta, 2006. Empreendedorismo em Biotecnologia – 2 Créditos – quinto semestre Ementa: Disciplina que investiga a relação entre os processos de pesquisa científica na biotecnologia e o mercado de produtos e processos. São também estudados como o mercado influência e afeta o desenvolvimento da pesquisa biotecnológica através dos fatores econômicos, e as estruturas para o desenvolvimento e proteção intelectual através de regulações, patentes, competição e cooperação entre empresas. Bibliografia Básica: SIMON, F.; KOTLER, P. Building global biobrands: taking biotechnology to market, Free Pr, 2003. SIMON, F. "Market access for biopharmaceuticals: new challenges." Health Affairs 25(5): 1363-1370, 2006. AUSTIN, M. Business Development for the Biotechnology and Pharmaceutical Industry, Gower Publishing Company, 2008. Bibliografia Complementar: KRAGL, U. Technology transfer in biotechnology: from lab to industry to production, Springer Verlag, 2005. GANGULI, P.; PRICKRIL, B. et al. Technology transfer in biotechnology: a global perspective, Vch Pub, 2009. OECD (2011) Future Prospects for Industrial Biotechnology. Organisation For Economic Co-operation And Development. BURGELMAN, R.A.; C.M. CHRISTENSEN, et al. Strategic management of technology and innovation, McGraw-Hill/Irwin, 2008. SCHILLING, M.A. (2005). Strategic management of technological innovation, McGraw-Hill Education. 66 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia LIBRAS – Optativa – 2 Créditos – sétimo semestre Ementa: Introdução à Língua de Sinais Brasileira – Libras. Características básicas da fonologia. Noções básicas de léxico, de morfologia e de sintax. Noções de variação. Prática de Libras. Bibliografia Básica: Forbellone, André L.V; Eberspache, Henri F. Lógica de programação: a construção de algoritmos e estruturas de dados. 3.ed. São Paulo: Pearson, 2005. 218 p. ISBN 978-85-7605-024-7.; Feofiloff, Paulo. Algoritmos em linguagem C. Rio de Janeiro: Elsevier, 2009. 208 p. ISBN 978-85-352-3249-3.; Mokarzel, Fábio; Soma, Nei. Introdução à ciência da computação. Rio de Janeiro: Elsevier, 2008. 429 p. ISBN 978-85-352-1879-4.; Bibliografia Complementar: Mizrahi, Victorine Viviane. Treinamento em linguagem C: módulo profissional. Säo Paulo: Makron, c1993. 225 p. ISBN 978-85-346-0109-2.; Deitel, Paul; Deitel, Harvey. C: como programar. *C: how to program+. Tradução: Daniel Vieira. 6 ed. São Paulo: Pearson Prentice Hall, 2011. 818 p. ISBN 978-857605-934-0.; KERNIGHAN, Brian W; VIEIRA, Daniel; RITCHIE, Dennis M. C: a linguagem de programação padrão ANSI. Rio de Janeiro: Campus, 1989. ISBN 978-85-7001586-0.; FARRER, Harry et al. Algoritmos estruturados. 3.ed. Rio de Janeiro: LTC, 1999. 284 p. ISBN 978-85-216-1180-6. ; Horowitz, Ellis; Sahni, Sartaj; Rajasekaran, Sanguthevar. Computer algorithmics/C++. New York: Computer Science, 1997. 769 p. ISBN 978-0-71678315-2. 67 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 5 CORPO SOCIAL 5.1. Corpo Docente do Curso de Biotecnologia Tabela 4 : Corpo Docente do ICT-UNIFESP dedicado ao Bacharelado em Biotecnologia DOUTORAMENTO DOCENTE ÁREA de Instituição Ano REGIME DOUTORAMENTO DE TRABALHO André Zelanis Bioquímica Cláudia Campos Neurobiologia Elisabeth de Fátima Pires Engenharia Química Augusto Elisa Esposito Engenharia Química Kátia Conceição Biotecnologia Luciane Capelo Biologia Celular e Desenvolvimento Martin Wurtele Química/Bioquímica USP UFRJ USP 2011 DE 1999 DE 1998 DE UNICAMP USP do USP 1995 DE 2007 DE 2009 DE MPIDortmund 2003 DE DE: Dedicação Exclusiva DOCENTE Martin Rodrigo Alejandro Wurtele Alfonso Claudia Barbosa Ladeira de Campos Elisa Esposito ÁREA ENSINO Orientações Graduação IC TG M S D R 11 1 3 0 - 6 0 3 0 - 29 11 30 9 - PósGrad . Bioquímica Fundamentos de Biologia Moderna, x e Biologia Biologia molecular da célula, Estrutural Bioquímica I e II, Laboratório de Bioquímica, Biologia Estrutural, Modelagem Molecular Bioquímica Fundamentos de Biologia Moderna, x e Biologia Biologia molecular da célula, Biologia Molecular molecular do gene, Bioquímica I, Laboratório de Bioquímica, Laboratório de Biologia Molecular da Célula, Imunologia Biotecnolo Microbiologia Geral, Microbiologia x gia Industrial e Aplicada, Laboratório de Ambiental Microbiologia, Introdução à Ecologia, e Fundamentos de Biologia Moderna Engenharia Bioquímica 68 Extens ão Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia André Zelanis Proteômic a e Biologia de Sistemas Introdução à Bioinformática, x Proteômica, Fundamentos de Biologia Moderna, Biologia de Sistemas 0 0 3 2 - Katia da Biotecnolo Conceição gia 1 0 0 0 - Elisabeth Augusto Engenharia Bioquímica Bioquímica Analítica e Diagnósticos x Moleculares, Laboratório de Bioquímica Analítica, Fundamentos de Biologia Moderna, Bioquímica II, Química Medicinal I Fundamentos de Engenharia x Bioquímica, Engenharia Bioquímica I e II, Laboratório de Engenharia Bioquímica 2 0 3 4 - Luciane Capelo Biologia do Fundamentos de Biologia Moderna, x Desenvolvi Biologia do Desenvolvimento, mento Engenharia Tecidual e Engenharia Regenerativa, Bioética e Biossegurança 0 0 0 0 - 5.2 Corpo Docente do Instituto de Ciência e Tecnologia (ICT) da UNIFESP, Campus São José dos Campos Tabela 5: Composição atual do corpo docente do ICT-UNIFESP. DOUTORAMENTO DOCENTE ÁREA de Instituição DOUTORAMENTO Álvaro Luiz Fazenda Ana Carolina Lorena Computação Aplicada INPE Ciências da Computação e USP Matemática Computacional Martins Biotecnologia UFSCar Ana Luísa Dine Lemos Ana Paula Lemes Química Anderson Garbuglio de Quimica Oliveira Angelo Calil Bianchi Matemática Antônio Augusto Chaves Computação Aplicada Ano REGIME DE TRABALHO 2002 DE 2006 DE 2011 DE UNICAMP USP 2010 DE 2010 DE UNICAMP INPE 2012 DE 2009 DE 69 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Arlindo Flávio da Conceição Carlos M. Gurjão de Godoy Claudio Saburo Shida Daniela Leal Musa Danieli A. P. Reis Ciência da Computação Engenharia Elétrica Física Ciência da Computação Engenharia e Tecnologia Espaciais Dayane Batista Tada Química Dilermando Nagle Travessa Ciência e Engenharia de Materiais Eduardo Antonelli Física Eduardo Quinteiro Ciência e Engenharia de Materiais Eliandra de Sousa Trichês Ciência e Engenharia de Materiais Elizangela Camilo Engenharia Mecânica Erwin Doescher Computação Aplicada Eudes Eterno Fileti Física Ezequiel Roberto Zorzal Engenharia Elétrica Fabiano C. Paixão Biologia Geral Aplicada Fábio Augusto Menocci Ciência da Computação Cappabianco Fábio Fagundes Silveira Engenharia Eletrônica e Computação Fábio Passador Ciência e Engenharia de Materiais Fernando Henrique Química Cristovan Flávio A. Soares de Carvalho Engenharia Biomédica Gabriel Haeser Matemática Aplicada Gisele Ferreira de Lima Ciência e Engenharia de Materiais Horácio Hideki Yanasse Pesquisa Operacional Henrique Alves de Amorim Jaime Shinsuke Ide Jean Faber Ferreira de Abreu Juliana Garcia Cespedes Karina Rabello Casali Katia Regina Cardoso Kelly Cristina Poldi USP UNICAMP USP UFRGS INPE 2006 1994 1998 2006 2005 USP UFSCar 2007 DE 1998 DE USP UFSCar 2006 DE 2001 DE UFSC 2007 DE USP INPE USP UFU UNESP UNICAMP 2007 2002 2004 2009 2009 2010 ITA 2007 DE UFSCar 2012 DE UFSCar 2009 DE UNIVAP UNICAMP UFSCar 2006 DE 2009 DE 2010 DE Massachusets Institute of Technology Neurologia Experimental UNIFESP Engenharia Mecatrônica USP Modelagem Computacional LNCC Estatística e USP Experimentação Agronômica Ciências Biológicas UFRGS Ciência e Engenharia de UFSCar Materiais Ciências da Computação e USP DE DE DE DE DE DE DE DE DE DE DE 1981 DE 2012 2005 2005 2008 DE DE DE DE 2009 DE 1998 DE 2007 DE 70 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Matemática Computacional Lilia Muller Guerrine Ciência e Engenharia de UFSCar Materiais Luciana Ferreira da Silva Educação USP Luis Felipe Cesar da Rocha Matemática Aplicada UNICAMP Bueno Luiz Eduardo Galvão Martins Engenharia Elétrica UNICAMP Luiz Leduíno de Salles Neto Matemática Aplicada UNICAMP Manuel Henrique Lente Física UFSCar Marcelo Cristino Gama Matemática Aplicada UNICAMP Márcio Porto Basgalupp Ciências da Computação e USP Matemática Computacional Marcos Gonçalves Quiles Ciências da Computação e USP Matemática Computacional Mariá Cristina Vasconcelos Ciências da Computação e USP Nascimento Matemática Computacional Mariana Motisuke Engenharia Mecânica UNICAMP Marina Oliveira de Souza Engenharia Química UNICAMP Dias Mauricio Pinheiro de Engenharia de Materiais USP Oliveira Otavio Augusto Lazzarini Ciências da Computação e USP Lemos Matemática Computacional Regina Célia Coelho Física Computacional USP Reginaldo Massanobu Biologia Computacional University of Kuroshu Tokyo Renato Cesar Sato Tecnologia Nuclear USP Rossano Lang Carvalho Ciência dos Materiais UFRGS Silvio Eduardo Duailibi Odontologia Unifesp Tatiana Sousa Cunha Fisiologia UNICAMP Thaciana Valentina Ciências USP Malaspina Fileti Tiago de Oliveira Engenharia Elétrica UNESP Valério Rosset Engenharia Eletrotécnica e Universidade de Computadores do Porto Vanessa Gonçalves Paschoa Matemática Aplicada UNICAMP Ferraz Vinícius Veloso de Melo Ciências da Computação e USP Matemática Computacional 2007 DE 2009 DE 2011 DE 2001 2005 2001 2008 2010 DE DE DE DE DE 2009 DE 2010 DE 2010 DE 2011 DE 2010 DE 2009 DE 1998 DE 2011 DE 2010 2010 2002 2009 2006 DE DE DE DE DE 2008 DE 2009 DE 2012 DE 2009 DE 71 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Tabela 6: Diretoria Acadêmica. Servidor Função/Cargo Prof. Dr. Luiz Leduíno de Salles Neto Profa. Dra. Cláudia Barbosa Ladeira de Campos Diretor Acadêmico Vice-Diretora Acadêmica Tabela 7: Corpo Técnico Administrativo. NOME CLAYTON RODRIGUES GUSTAVO HENRIQUE VANESSA RIBEIRO EDNA LÚCIA ALESSANDRA DE CÁSSIA ALICE OLIVEIRA FRANK ALVES KATHIA HARUMI MARCO ANTÔNIO HENRIQUE ROGÉRIO G DOS SANTOS DEBORAH GODOY THIENY DE CÁSSIO IVAN LÚCIO ALESSANDRA A. CABRAL DANIELA ROCHA WESLEY ALDO GEORGIA MANSOUR DEBORA NUNES LISBOA JÚLIO CESAR BESSA LUCAS ADRIANO LAURO PAULO NÁDIA DE SOUZA JOÃO MANUEL LIMA SANDOVAL SIMÕES CARLOS A. O. COUTO SARA DE CARVALHO FABIANA G. FERREIRA THAIS HELENA CARGO ASSISTENTE EM ADM BIBLIOTECARIO BIBLIOTECARIO BIBLIOTECARIO ASSISTENTE EM ADM UNIDADE PARQUE TEC. PARQUE TEC. PARQUE TEC. PARQUE TEC. TALIM DIVISÃO BIBLIOTECA BIBLIOTECA BIBLIOTECA BIBLIOTECA CONTRATOS TEC. EM CONTABILIDADE TEC. EM CONTABILIDADE ASSISTENTE EM ADM CONTADOR TALIM CONTRATOS TALIM CONTRATOS TALIM TALIM CONTROLADORIA CONTROLADORIA TÉC EM LIBRAS PARQUE TEC. DIV. ASSUNTOS EDUC TEC. ASS. EDUCACIONAIS TEC. ASS. EDUCACIONAIS TEC. ASS. EDUCACIONAIS ASSISTENTE EM ADM PARQUE TEC. DIV. ASSUNTOS EDUC PARQUE TEC. DIV. ASSUNTOS EDUC PARQUE TEC. DIV. ASSUNTOS EDUC PARQUE TEC. DIRETORIA ACADÊMICA SECRETARIA EXECUTIVA ASSISTENTE EM ADM ASSISTENTE EM ADM ADMINISTRADOR PARQUE TEC. DIRETORIA ACADÊMICA TALIM TALIM TALIM SERVIÇOS DIRETORIA ADM GESTÃO DE MATERIAIS ASSISTENTE EM ADM ASSISTENTE EM ADM ENGENHEIRO ELETRICO TÉC LABORATORIO TÉC LABORATORIO TÉC LABORATORIO TECNOLOGO FARMACEUTICA TÉC LABORATORIO TÉC LABORATORIO TALIM PARQUE TEC. TALIM TALIM PARQUE TEC. PARQUE TEC. PARQUE TEC. PARQUE TEC. PARQUE TEC. PARQUE TEC. GESTÃO DE MATERIAIS INFRAESTRUTURA INFRAESTRUTURA LAB BIOLOGIA LAB DE MATERIAIS LAB DE MATERIAIS LAB DE MATERIAIS LAB DE QUÍMICA LAB DE QUÍMICA LAB DE QUÍMICA 72 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia MATHEUS SACILOTTO WAGNER SOUZA WLADIMIR A. GUERRA ANA CAROLINA GONÇALVES PRISCILA MARÇAL CINTIA BOARETTO JANDERCY MORENO RAFAEL MOURA CARVALHO CAETANO MONTOURO FILHO NATÁLIA RANGEL NILCE MARA HERICKSON AKIHITO ELIANE DE SOUZA KATIUCIA D. R. ZIGIOTTO LEILA DENISE FERREIRA MARIA DO CARMO LUIS EDUARDO LIMA WALFRAN CARVALHO ANA LUCIA S BERALDO DANIELLE DOS SANTOS THIAGO BARBOSA 6 FISICO TÉC LABORATORIO TECNOLOGO ASSISTENTE SOCIAL PARQUE TEC. PARQUE TEC. PARQUE TEC. PARQUE TEC. LAB FÍSICA LAB FÍSICA LAB FÍSICA NUCLEO APOIO ESTUD PSICÓLOGA ADMINISTRADOR ASSISTENTE EM ADM ASSISTENTE EM ADM PARQUE TEC. TALIM TALIM TALIM NUCLEO APOIO ESTUD RH RH RH ASSISTENTE EM ADM PARQUE TEC. SEC. ACADÊMICA ASSISTENTE EM ADM ASSISTENTE EM ADM ASSISTENTE EM ADM ASSISTENTE EM ADM SECRETARIA EXECUTIVA SECRETARIA EXECUTIVA ADMINISTRADOR ANALISTA TI ANALISTA TI ANALISTA TI TÉC EM TI TÉC EM TI PARQUE TEC. PARQUE TEC. TALIM PARQUE TEC. TALIM SEC. ACADÊMICA SEC. ACADÊMICA SEC. PÓS GRADUAÇÃO SEC. PÓS GRADUAÇÃO SEC. PÓS GRADUAÇÃO TALIM SEC. PÓS GRADUAÇÃO PARQUE TEC. PARQUE TEC. PARQUE TEC. TALIM PARQUE TEC. PARQUE TEC. SERVIÇOS TECNOL INFORM TECNOL INFORM TECNOL INFORM TECNOL INFORM TECNOL INFORM INSTALAÇÕES FÍSICAS Tabela 8: Espaço físico disponível na Unidade I - Parque Tecnológico. Quantidade Discriminação Área aprox. (m2) 14 20 7 1 1 31 1 1 1 1 Laboratórios de graduação Sala de aula Laboratório de informática para a graduação Biblioteca Restaurante Universitário Salas para docentes Secretaria acadêmica Auditório Sala de Apoio ao Estudante Secretaria Academica 1600 (total) 2000 (total) 850 (total) 1800 320 22 (cada) 200 360 80 220 73 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Tabela 9: Espaço físico disponível na Unidade I – Av. Talim. Quantidade Discriminação Área (m2) 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 270,0 46,8 100,0 70,6 46,7 (cada) 54,0 (cada) 20,3 24,0 20,0 17,0 70,0 Restaurante universitário Laboratório de informática para a pós-graduação Laboratório de informática para a graduação Laboratório de biologia Laboratório de física/química/biologia Laboratório de física/química/biologia Enfermaria Depósito de produtos químicos Secretaria do Departamento de Ciência e Tecnologia Secretaria de pós-graduação Administração Tabela 10: Espaço físico disponível na Unidade II Av. Talim. Quantidade Discriminação Área (m2) 1 1 8 2 1 2 2 4 12 32 1 1 1 128,0 60,4 62,4 (cada) 150,9 (cada) 128,0 89,6 (cada) 62,4 (cada) 13,8 (cada) 9,0 (cada) 8,7 (cada) 34,9 150,4 295,3 Laboratório de pesquisa Sala de aula Sala de aula Sala de aula Laboratório de informática para a graduação Laboratório de informática para a graduação Laboratório de informática para a graduação Sala para docente Sala para docente Sala para docente Secretaria acadêmica Anfiteatro Biblioteca Tabela 11: Espaço físico disponível na Unidade III Av. Talim (Prédio FINEP). Quantidade Discriminação Área (m2) 1 1 1 1 1 1 Laboratório de bioquímica e biologia molecular Laboratório de bioquímica e biologia estrutural Laboratório de fisiologia Laboratório de análise de materiais Laboratório de materiais Laboratório de tratamentos térmicos 30 30 30 30 30 30 74 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 6.1 Laboratórios utilizados no desenvolvimento do curso1 1. Laboratório de Bioquímica. Fluxos laminares, incubadoras, espectrofotômetros, sistema de eletroforese, sistema de fotodocumentação de géis. 2. Laboratório de Biologia Molecular da Célula. Sala de cultura com fluxo para trabalho com células e incubadora de CO2. Sistema de eletroforese e de transferência de géis para desenvolver western-blot. Microscópios e Estereomicroscópios. 3. Laboratório de Microbiologia. Fluxos microbiológicos, incubadoras microbiológicas, espectrofotômetros. Espaço separado para autoclavagem, lavagem e preparação das aulas. 4. Laboratório de Fisiologia Humana. Microscópios e estereomicroscópios. Equipamento para experimentação com modelos animais. Espaço separado para autoclavagem, lavagem e preparação das aulas. 5. Laboratório de Engenharia Bioquímica. Bioreatores e autoclave para realizacão de fermentações. Aparelhos de cromatografia para purificação de bioprodutos. 6. Laboratório de Bioquímica Analítica. Aparelhos para extração, capela, cromatografia líquida, purificação de proteínas, fotômetros, fluorimetros e leitores de placas. Espaço separado para autoclavagem, lavagem e preparação das aulas. 7. Laboratórios de Bioinformática. Computadores pessoais com sistema operacional Windows e Linux. 1 Vários destes ambientes de laboratório podem ser compartilhados. 75