Pedido de Acreditação

Transcrição

NCE/11/01741 — Apresentação do pedido Novo ciclo
de estudos
Apresentação do pedido
Perguntas A1 a A4
A1. Instituição de ensino superior / Entidade instituidora:
ISPA, Crl
A1.a. Descrição da Instituição de ensino superior / Entidade instituidora
ISPA Instituto Universitário de Psicologia Aplicada, Crl
A2. Unidade orgânica (faculdade, escola, instituto, etc.):
ISPA Instituto Universitário de Ciências Psicológicas, Sociais e da Vida
A2.a. Descrição da Unidade orgânica (faculdade, escola, instituto, etc.):
ISPA Instituto Universitário de Psicologia Aplicada
A3. Ciclo de estudos:
Biologia Marinha e Conservação
A3. Study cycle:
Marine Biology and Conservation
A4. Grau:
Mestre
Perguntas A5 a A10
A5. Área científica predominante do ciclo de estudos:
Biologia
A5. Main scientific area of the study cycle:
Biology
A6.1. Classificação da área principal do ciclo de estudos de acordo com a Portaria n.º 256/2005, de 16 de Março
(CNAEF). 421
A6.2. Classificação da área secundária do ciclo de estudos de acordo com a Portaria n.º 256/2005 de 16 de Março
(CNAEF), se aplicável. <sem resposta>
A6.3. Classificação de outra área secundária do ciclo de estudos de acordo com a Portaria n.º 256/2005 de 16 de
Março (CNAEF), se aplicável. <sem resposta>
A7. Número de créditos ECTS necessário à obtenção do grau:
120
A8. Duração do ciclo de estudos (art.º 3 DL74/2006):
2 anos
A8. Duration of the study cycle (art.º 3 DL74/2006):
2 years
A9. Número de vagas proposto:
30
A10. Condições de acesso e ingresso:
Podem candidatarse ao acesso ao ciclo de estudos conducente ao grau de Mestre em Biologia Marinha e
Conservação os titulares do grau de licenciado ou equivalente legal em Biologia ou áreas similares,
nomeadamente Ciências do Ambiente, Taxonomia, Botânica, Genética, Engenharia Zootécnica. No entanto,
apenas ficarão habilitados como Biólogos os perfis de formação devidamente reconhecidos pelas entidades
competentes para o efeito, nomeadamente a respectiva ordem profissional.
A10. Entry Requirements:
Students may apply to this Masters study cycle if they have a bachelor’s degree or a legally equivalent title in
Biology or similar areas such as Environmental Sciences, Taxonomy, Botany, Genetics, Zootechnical
Engineering. However, the title in Biology is only ascertained to the training profiles recognized by the
respective competente entities, namely the respective professional order.
Pergunta A11
Pergunta A11
A11. Ramos, opções, perfis, maior/menor ou outras formas de organização de percursos alternativos em que o
ciclo de estudos se estrutura (se aplicável):
Não
A11.1. Ramos, opções, perfis, maior/menor, ... (se aplicável)
A11.1. Ramos, opções, perfis, maior/menor, ou outras formas de organização de percursos alternativos em que
o ciclo de estudos se estrutura (se aplicável) / Branches options, profiles, major/minor, or other forms of
organization of alternative paths compatible with the structure of the study cycle (if applicable)
Ramos/Opções/... (se aplicável):
Branches/Options/... (if applicable):
<sem resposta>
A12. Estrutura curricular
Anexo I
A12.1. Ciclo de Estudos:
A12.1. Study Cycle:
A12.2. Grau:
Mestre
A12.3. Ramos, opções, perfis, maior/menor, ou outras (se aplicável)
<sem resposta>
A12.3. Branches, options, profiles, major/minor, or other forms (if applicable)
<no answer>
A12.4. Áreas científicas e créditos que devem ser reunidos para a obtenção do grau / Scientific areas and credits
that must be obtained for the awarding of the degree
Área Científica / Scientific Area
Ecologia e Conservação Marinha / Marine Ecology and
Conservation
Biologia do Comportamento e Ética / Biology of Behaviour
and Ethics
Métodos e Técnicas de Investigação / Research Methods
and Techniques
(3 Items)
Sigla /
Acronym
ECTS Obrigatórios /
Mandatory ECTS
ECTS Optativos* /
Optional ECTS*
ECM
96
15
BCE
6
6
MTI
6
3
108
24
Perguntas A13 e A14
A13. Regime de funcionamento:
Diurno
A13.1. Se outro, especifique:
<sem resposta>
A13.1. If other, specify:
<no answer>
A14. Observações:
Esclarecimento sobre o nome institucional:
No sistema da A3ES o nome da unidade orgânica aparece referido como “ISPA Instituto Universitário de
Psicologia Aplicada”. Essa designação resultou da passagem do “ISPA – Instituto Superior de Psicologia
Aplicada” a Instituto Universitário, com o reconhecimento pelo Ministro da Ciência, Tecnologia e Ensino
Superior (D.L. 221/2009 de 8 de Setembro), tendo esse nome sido publicado pelo Ministério sem o conhecimento
da entidade instituidora. Posteriormente, e na sequência de um pedido de alteração de designação institucional,
foi exarado despacho por Sua Ex.ª O Ministro da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior (Processo: 50.28/97.324;
Entrada: 5835) tendo sido dado conhecimento dessa aprovação ao Exmo. Senhor DirectorGeral do Ensino
Superior, passando a designação oficial a: “ISPA Instituto Universitário de Ciências Psicológicas, Sociais e da
Vida”.
O regime de funcionamento será diurno, mas existe a possibilidade de abrir uma turma em regime nocturno
caso haja candidatos suficientes para preencher a mesma.
A14. Observations:
Clarification on the institutional name:
In the A3ES system the name of the institute appears as “ISPA Instituto Universitário de Psicologia Aplicada”.
This designation resulted from the attribution to ISPA of the statue of “University Institute”, with the recognition
by the Minister of Science, Technology and High Education (D.L. 221/2009 from 8 Setember), but was published
without the institution’s prior informed consent. After that, and following a request to change the institutional
name, his Excellency the Minister of Science, Technology and Higher Education pronounced favorably to this
request (Proc.: 50.28/97.324; Entry: 5835) and the DirectorGeneral of Higher Education was duly informed,
being the new designation: “ISPA Instituto Universitário de Ciências Psicológicas, Sociais e da Vida”.
The working regime is during the daytime, but there is a possibility to open na afterhours class, pending on the
number of students.
Instrução do pedido
1. Formalização do pedido
1.1. Deliberações
Anexo II Conselho Pedagógico / Pedagogical Council
1.1.1. Órgão ouvido:
Conselho Pedagógico / Pedagogical Council
1.1.2. Cópia de acta (ou extrato de acta) ou deliberação deste orgão assinada e datada (PDF, máx. 100kB):
1.1.2._Acta Conselho Pedagógico Mestrado Biologia Marinha e Conservação.pdf
Anexo II Conselho Científico Scientific Council
Conselho Científico Scientific Council
1.1.2._Acta Conselho Científico Mestrado Biologia Marinha e Conservação.pdf
Anexo II Reitor / Dean
Reitor / Dean
1.1.2._Homologação Reitor Mestrado Biologia Marinha e Conservação.pdf
1.2. Docente responsável
1.2. Docente responsável pela coordenação da implementação do ciclo de estudos A respectiva ficha curricular deve ser apresentada no Anexo V.
Emanuel João Flores Gonçalves
2. Plano de estudos
Anexo III 1 º Ano / 1º Semestre
2.1. Ciclo de Estudos:
2.1. Study Cycle:
2.2. Grau:
Mestre
2.3. Ramos, opções, perfis, maior/menor, ou outras (se aplicável)
<sem resposta>
2.3. Branches, options, profiles, major/minor, or other forms (if applicable)
<no answer>
2.4. Ano/semestre/trimestre curricular:
1 º Ano / 1º Semestre
2.4. Curricular year/semester/trimester:
1st Year / 1st Semester
2.5. Plano de Estudos / Study plan
Unidades Curriculares / Curricular Units
Área
Horas
Horas
Observações
Duração /
Científica /
Trabalho /
Contacto /
/
Duration
ECTS
Scientific Area
Working Hours Contact Hours
Observations
Ecologia Marinha / Marine Ecology
Biodiversidade, Biologia Populacional e
Biogeografia Marinha / Biodiversity, Population
Biology and Marine Biogeography
Desenho Experimental e Análise Avançada de
Dados Ecológicos / Experimental Design and
Ecological Data Analysis
Biologia e Ecologia de Peixes / Fish Biology and
Ecology
(1)
(2)
(3)
(4)
ECM
S
225
45 (T); 15 (TC);
9
15 (OT); 4 (AV)
ECM
S
225
45 (T); 15 (TP);
9
15 (OT); 4(AV)
MTI
S
150
30 (T); 15 (TP);
6
10 (OT); 4 (AV)
ECM
S
75
S
75
S
75
S
75
Genética Aplicada de Populações Marinhas /
ECM
Applied Genetics in Marine Populations
Biologia e Conservação de Mamíferos Marinhos /
ECM
Biology and Conservation of Marine Mammals
Biologia e Conservação de Aves e Répteis
Marinhos / Biology and Conservation of Marine
ECM
Birds and Reptiles
BemEstar Animal / Animal Welfare
BCE
S
75
Ética Ambiental / Environmental Ethics
BCE
S
75
ECM
S
75
MTI
S
75
Biologia Larvar e Recrutamento / Larval Biology
and Recruitment
Modelação Ecologica e Estatística Espacial /
Ecological Modelling and Spatial Statistics
(11 Items)
(5)
30 (TP); 15
(PL); 5 (OT); 4 3
(AV)
30 (TP); 5 (OT);
3
4 (AV)
30 (TP); 5 (OT);
3
4 (AV)
30 (TP); 5 (OT);
3
4 (AV)
30 (TP); 5 (OT);
4 (AV)
30 (TP); 5 (OT);
4 (AV)
30 (TP); 5 (OT);
4 (AV)
30 (TP); 5 (OT);
4 (AV)
O
O
O
O
3
O
3
O
3
O
3
O
Anexo III 1º Ano / 2º Semestre
2.1. Study Cycle:
2.2. Grau:
Mestre
<sem resposta>
<no answer>
1º Ano / 2º Semestre
1st Year / 2nd Semester
Unidades Curriculares / Curricular Units
Biologia da Conservação Marinha / Marine
Conservation Biology
Governação do Oceano e Áreas Marinhas
Observações
Área Científica Duração / Horas Trabalho Horas Contacto
/
/ Scientific
Duration / Working
/ Contact Hours ECTS
Observations
Area (1)
(2)
Hours (3)
(4)
(5)
45 (T); 15 (TC);
ECM
S
225
9
15 (OT); 4 (AV)
30 (T); 15 (TP);
Protegidas / Ocean Governance and Marine
ECM
Protected Areas
Ecologia Comportamental e Sociobiologia /
BCE
Behavioural Ecology and Sociobiology
Biologia e Ecologia de Peixes / Fish Biology and
ECM
Ecology
Genética Aplicada de Populações Marinhas /
ECM
Applied Genetics in Marine Populations
Biologia e Conservação de Mamíferos
Marinhos / Biology and Conservation of Marine ECM
Mammals
Biologia e Conservação de Aves e Répteis
Marinhos / Biology and Conservation of Marine ECM
Birds and Reptiles
BemEstar Animal / Animal Welfare
BCE
Biologia Larvar e Recrutamento / Larval Biology
ECM
and Recruitment
Modelação Ecológica e Estatística Espacial /
MTI
Ecological Modelling and Spatial Statistics
S
225
S
150
S
75
S
75
30 (TP); 5 (OT);
3
4 (AV)
O
S
75
30 (TP); 5 (OT);
3
4 (AV)
O
S
75
30 (TP); 5 (OT);
3
4 (AV)
O
S
75
S
75
S
75
Ética Ambiental / Environmental Ethics
BCE
S
75
(11 Items)
15 (OT); 4 (AV)
9
45 (TP); 10
6
(OT); 4 (AV)
30 (TP);15 (PL);
3
5 (OT); 4 (AV)
30 (TP); 5 (OT);
4 (AV)
30 (TP); 5 (OT);
4 (AV)
30 (TP); 5 (OT);
4 (AV)
30 (TP); 5 (OT);
4 (AV)
O
3
O
3
O
3
O
3
O
Anexo III Perfil 1 2º Ano
2.1. Study Cycle:
2.2. Grau:
Mestre
Perfil 1
Profile 1
2º Ano
2nd Year
Unidades Curriculares /
Curricular Units
Área Científica /
Scientific Area (1)
Duração /
Horas Trabalho /
Duration (2) Working Hours (3)
Horas Contacto /
Contact Hours (4)
Observações /
ECTS Observations
(5)
Estágio / Internship
ECM
A
1050
64 (S); 12 (OT); 2
(AV)
42
A
450
64 (S); 6 (OT); 2 (AV) 18
Seminario de Dissertação /
ECM
Dissertation Seminar
(2 Items)
Anexo III Perfil 2 2º Ano
2.1. Study Cycle:
2.2. Grau:
Mestre
Perfil 2
Profile 2
2º Ano
2nd Year
Unidades Curriculares /
Curricular Units
Área Científica /
Scientific Area (1)
Estágio / Internship
ECM
Seminário de Dissertação /
ECM
Dissertation Seminar
(2 Items)
Duração /
Horas Trabalho /
Duration (2) Working Hours (3)
A
450
A
1050
Observações /
ECTS Observations
(5)
64 (S); 6 (OT); 2 (AV) 18
64 (S); 12 (OT); 2
42
(AV)
Horas Contacto /
Contact Hours (4)
3. Descrição e fundamentação dos objectivos
3.1. Dos objectivos do ciclo de estudos
3.1.1. Objectivos gerais do ciclo de estudos.
A UIEE do ISPA, classificada com Excelente pela FCT, suporta o presente ciclo de estudos integrando alguns
dos seus elementos doutorados nas diferentes unidades curriculares. Pretendese fornecer uma formação
especializada em Biologia Marinha e Conservação dos Ecossistemas Marinhos integrando as principais teorias
e métodos de estudo e análise com uma abordagem prática às problemáticas da gestão dando em opção dois
perfis no 2º ano com maior peso para: i) uma componente aplicada integrandose os alunos em empresas,
institutos ou instituições com quem o ISPA tem protocolos e realizando o seu estágio nas mesmas; ii) uma
componente mais científica e de desenvolvimento de trabalho de investigação. Este ciclo de estudos promove o
desenvolvimento de competências de aprofundamento teórico e análise crítica, a aprendizagem de técnicas
avançadas de estudo em laboratório e no campo e a realização de trabalhos científicos originais e estudos
aplicados à biologia marinha e conservação.
3.1.1. Study cycle's generic objectives.
ISPA’s UIEE R&D Unit, classified as Excellent by FCT supports this study cycle integrating some of its PhD
members in the different curricular units. It will provide a specialized training in Marine Biology and
Conservation of Marine Systems, integrating the main theories and methods of study and analysis with a
practical approach to the problems of management given the students the possibility of choosing two profiles in
the 2nd year: i) an applied profile integrating their work in an internship in institutes, institutions and corporations
with which ISPA establishes agreements; ii) a scientific and research profile. This study cycle promotes the
development of competencies for deepening theoretical knowledge and critical analysis, the learning of
advanced laboratory and field study techniques and the accomplishment of original scientific work and applied
studies in marine biology and conservation.
3.1.2. Objectivos de aprendizagem.
1. Compreender e integrar de modo aprofundado as principais teorias da Biologia Marinha e da Conservação de
Ecossistema e utilizar de forma profissional e competente os principais métodos e técnicas
2. Compreender os fenómenos biológicos de base que influenciam os processos ecológicos marinhos e as
suas implicações para as estratégias de conservação
3. Dominar a análise estatística avançada de dados ecológicos e a interpretação dos resultados obtidos
4. Conceber, projectar, adaptar e realizar investigação científica em Biologia Marinha e Conservação,
respeitando os princípios éticos subjacentes ao processo de investigação e ao uso de animais em
experimentação
5. Comunicar as conclusões dos trabalhos efectuados assim como os pressupostos teóricos e metodológicos
subjacentes de forma clara e profissional a públicos diversos: cientistas, decisores, gestores e ao público em
geral
6. Transmitir e promover o conhecimento científico e a sua integração no contexto social e cultural
3.1.2. Intended learning outcomes.
1. Understand and integrate in a proficient manner the main theories of Marine Biology and Conservation of
Ecossystems and use in a professional and competent way the main methods and techniques
2. Understand the basic biological phenomena which influence marine ecological processes and their
implications to conservation strategies
3. Master the advanced statistical analysis of ecological data and the interpretation of the results obtained
4. Design, project, adapt and execute scientific research in Marine Biology and Conservation, respecting the
ethical principles underlining the research process and the use of animals in research
5. Communicate in a clear and professional way the conclusion of the research as well as its theoretical and
methodological assumptions to diverse audiences: scientists, decision makers, managers and the general
public, 6. Transmit and promote scientific knowledge and its integration in the social and cultural context
3.1.3. Coerência dos objectivos definidos com a missão e a estratégia da instituição de ensino.
O ISPA iniciou a sua actividade em 1962 como Instituto de Ciências Psicológicas, passando a Instituto Superior
de Psicologia Aplicada (ISPA) em 1964. Desde então constituiuse como uma referência incontornável no
ensino superior em Portugal. Pioneiro no ensino e investigação das ciências psicológicas e do comportamento, o ISPA é reconhecido
nacional e internacionalmente pela excelência do seu projecto científico, pedagógico e cultural, pela qualidade
do seu corpo docente e da sua actividade de investigação e desenvolvimento e pela relevância da sua extensão
universitária.
Desde o início, o projecto ISPA estruturouse segundo uma matriz de desenvolvimento institucional que concilia
seis linhas de força essenciais.
1. Constituição de um corpo docente próprio e altamente qualificado e prestigiado; 2. Formação científica e pedagógica plural com um enfoque muito particular na multidisciplinaridade científica e
na vertente cultural; 3. Produção científica relevante, internacionalmente reconhecida e referenciada; 4. Uma aposta clara na internacionalização através de parcerias fortes com instituições de referência no
espaço Europeu, da América do Norte e Brasil; 5. Uma actividade editorial diversificada com títulos que são, actualmente, referências na área das ciências
sociais, psicológicas e do comportamento; 6. Intervenção social e comunitária relevante, permanente e diversificada; Desde 1994, foi igualmente reconhecida pela FCT, a Unidade de Investigação em EcoEtologia que obteve as
mais elevadas classificações desde a sua constituição, tendo actualmente o nível de Excelente, sendo uma
referência nas ciências do mar, nomeadamente na biologia marinha, ecologia, conservação, comportamento,
fisiologia, evolução, biogeografia, entre outras.
O ano de 2009 representou mais um marco histórico do desenvolvimento institucional com a reconversão em
Instituto Universitário, no quadro do novo modelo organizativo do ensino superior. O ISPA foi a segunda
instituição em Portugal e a primeira no subsistema do ensino particular e cooperativo a satisfazer os requisitos
formais e o nível de qualificação exigidos para esta adequação organizacional. Com esta nova matriz
institucional o ISPA – Instituto Universitário de Ciências Psicológicas, Sociais e da Vida passou a ministrar, de
forma autónoma, todos os graus académicos previstos no quadro da organização dos estudos introduzido pelo
Processo de Bolonha alargando também a sua oferta formativa a outras áreas com particular destaque para a
Biologia.
Neste contexto, é criado, em 2009, o Centro de Biociências e iniciouse em 2010 o funcionamento da
Licenciatura em Biologia. Esta nova realidade traduz a excelência do projecto pedagógico e científico do ISPA,
alicerçado nas mais elevadas classificações atribuídas por entidades independentes. Neste sentido, a presente
proposta vem dar corpo às capacidades instaladas e constituirá uma peça fundamental do projecto de
desenvolvimento em curso.
3.1.3. Coherence of the defined objectives with the institution's mission and strategy.
ISPA started its activity in 1962 as Instituto de Ciências Psicológicas and in 1964 adopted the name Instituto
Superior de Psicologia Aplicada (ISPA). Since then it constituted an inescapable reference in the Portuguese
higher education system.
Pioneer in research and education in the psychological and behavioural sciences, ISPA is internationally and
nationally recognized by the excellence of its scientific, pedagogical and cultural project, the quality of its
academic staff and of its research and development activities and the relevance of the extension and outreach
programs.
From the beginning, ISPA project was built over an institutional development matrix which integrates six main
lines:
1. A highly qualified and prestigious academic staff fully committed to the institution;
2. Plural scientific and pedagogical learning particularly focused in a scientific and cultural multidisciplinary
approach;
3. Relevant scientific production, internationally recognised and referenced 4. A clear investment on the internationalization through strong partnerships with universities and research and
intervention centres of excellence in Europe, North America and Brasil; 5. A diversified editorial activity with titles that currently constitute reference citations in the social,
psychological and behavioural sciences;
6. Relevant, permanent and diversified social and community intervention and outreach.
Since 1994 the R&D EcoEtology Research Unit was recognized by FTC and has obtained the highest
classifications from the beginning, currently being marked as Excellent, and a reference in the marine sciences,
namely in marine biology, ecology, conservation, behavior, physiology, evolution, biogeography, among others.
The year 2009 represented another historical mark in the institutional development with the conversion in
University Institute (Instituto Universitário), in the framework of the new organizational model of higher
education. ISPA was the second institution in Portugal and the first one in the private and cooperative
subsystem to comply with the formal requisites and mandatory quality level. With this new institutional matrix, ISPA – University Institute of Psychological, Social and Life Sciences is now
able to offer, in an autonomous way, all academic levels part of the study cycles organization established by the
Bolonha Process also widening the portfolio to other areas with special reference to Biology.
In this context, it is launched in 2009 the Biosciences Centre and initiated in 2010 the Biology 1st cycle degree.
This new reality translated the excellence of the ISPA scientific and pedagogical project, sustained in the highest
classifications attributed by independent external evaluation bodies to scientific research and high level
activities in the Biology domain. In this context, the current proposal will constitute a central piece of the on
going development project.
3.2. Adequação ao Projecto Educativo, Científico e Cultural da Instituição
3.2.1. Projecto educativo, científico e cultural da instituição.
Ao longo de décadas o ISPA desenvolve um projecto universitário que se consolidou em torno de três
preocupações estruturantes: i) constante produção e difusão do conhecimento, ii) intervenção social e, iii)
desenvolvimento de uma cultura científica de base humanista e ambientalmente sustentável.
i) A produção e difusão de conhecimento assentam numa estratégia de formação universitária caracterizada
pela crítica sistemática do conhecimento estabelecido, dando expressão a uma intensa actividade de
investigação que se desenvolve desde os primeiros anos de formação inicial até às estruturas associadas ao
Centro de Investigação e Intervenção que integra as Unidades de Investigação com reconhecimento
internacional. Esta actividade é apoiada por recursos laboratoriais e de campo cujo acesso é aberto não só a
investigadores como aos estudantes. A dinâmica pedagógica e científica apoiase ainda, para lá da estimulação
do pensamento crítico, no desenvolvimento de competências geradoras de autonomia e de competências
sociais, favoráveis à difusão do conhecimento produzido, recorrendo às mais diversas formas (conferências,
seminários, congressos e outras reuniões científicas, bem como edição de publicações periódicas de
expressão nacional e internacional). Neste sentido, os estudantes são sistematicamente estimulados à difusão
crítica do conhecimento através do treino em comunicações escritas e orais, em contexto de sala de aula,
desde o primeiro ano de formação.
ii) No âmbito da intervenção social, a actividade formativa é articulada com actividades de extensão
universitária assegurada por estruturas como o Centro de Biociências, o Centro de Estudos Interculturais Aziz
Ab’Saber, o Centro de Estudos da Criança e da Família e a Clínica Universitária. Para além da actividade de
intervenção, estes centros garantem a incorporação constante de problemáticas de incidência ambiental e
social na actividade de investigação aplicada desenvolvida pelo ISPA, favorecendo igualmente o
desenvolvimento da consciência cívica dos nossos estudantes e alargando o espectro de intervenção
profissional.
iii) Finalmente, o desenvolvimento constante de actividades de expressão científica, cultural e artística,
paralelamente à organização de ciclos de conferências orientados para o cruzamento de conhecimento
científico de diferentes áreas disciplinares com preocupações emergentes nas sociedades actuais, são a base
de uma cultura científica de base humanista e ambientalmente sustentável.
Para alcançar estes objectivos, o ISPA criou uma vasta rede de cooperação nacional e internacional, com
muitos projectos em parceria com outras instituições, a mobilidade de estudantes através de redes europeias,
a validação científica e pedagógica do trabalho desenvolvido e a incorporação constante de factores de
inovação nestes domínios. A qualificação do quadro de pessoal técnico e de um quadro de pessoal docente
próprio está na base de toda actividade desenvolvida no âmbito deste projecto.
3.2.1. Institution’s educational, scientific and cultural project.
For decades, ISPA has developed a University Project strengthen over three main goals: i) constant knowledge
creation and outreach, ii) social intervention, iii) development of a scientific culture with a humanistic base and
environmentally sustainable.
i) Knowledge creation and outreach stand on a strategy of university culture characterized by the systematic
critique of the established knowledge, giving expression to an intense research activity developed from the first
years of initial to the research structures associated to the Centre for Research and Intervention which
integrates the internationally recognized Research Units. This activity is supported by laboratorial and field
resources which are available not only to researchers but also to students. The pedagogical and scientific
dynamics is also supported, not only by the stimulation of critical thought, but also on the development of
capabilities which generate autonomy and social competencies and are favourable to the dissemination of the
created knowledge, taking advantage of different type of means (conferences, seminars, conferences and other
scientific meetings, as well as the edition of national and international periodic journals). Therefore, students are
systematically stimulated to the critical transmission of knowledge through training in written and oral
communication skills, in the classroom context, from the first year of the course.
ii) In the social intervention, the educational activity is harmonized with outreach and intervention activities
based on structures such as the Biosciences Centre, the Intercultural Studies Centre Aziz Ab’Saber, the Child
and Family Studies Centre and the University Clinic. Besides the intervention activities, these centres
guarantee the regular incorporation of environmental and social problems in the applied research activity
developed by ISPA, further favouring the development of the civic conscience of our students and widening the
range of professional involvement.
iii) Finally, the constant development of activities in all forms of scientific, cultural and artistic expression,
together with the organization of conference cycles aimed at crossing scientific knowledge from different
disciplinary areas with emerging issues in the current societies, are the basis of a humanistic and
environmentally sustainable based scientific culture.
To achieve these goals, ISPA has created a vast network of national and international cooperation, with many
projects in partnership with other institutions, the students’ mobility through European networks, the scientific
and educational validation of the results achieved and the constant incorporation of innovation aspects in these
domains. The qualification of the technical staff and its own academic and scientific staff is at the core of all
activity developed in this project.
3.2.2. Demonstração de que os objectivos definidos para o ciclo de estudos são compatíveis com o projecto
educativo, científico e cultural da instituição.
A Unidade de Investigação em EcoEtologia do ISPA reconhecida pela Fundação para a Ciência e a Tecnologia
desde 1994 (FCT 331/94) e classificada como Excelente na última avaliação independente de painéis
internacionais da FCT, apresenta uma vasta e reconhecida actividade científica, de extensão e de
enquadramento pedagógico dos ciclos de estudos e unidades curriculares da área das ciências da vida (1º ciclo
em Biologia; Mestrado em Psicobiologia; diversas unidades curriculares ministradas noutros ciclos de
estudos).
O corpo docente próprio qualificado em regime de exclusividade enquadra um conjunto significativo estudantes
de mestrado e doutoramento, bem como de investigadores doutorados que desenvolvem um leque alargado de
projectos de investigação nacionais e europeus com uma produção científica de excelência. Desenvolvem
ainda actividade relevante de extensão universitária, prestação de serviços e participação na implementação
de políticas públicas que conferem ao ISPA um reconhecimento inquestionável na área das ciências da vida e,
em particular, da Biologia. Uma das áreas mais fortes na área da investigação em Biologia realizada no ISPA é
a Biologia Marinha nas vertentes da ecologia marinha, comportamento de animais aquáticos, conservação de
ecossistemas marinhos, fisiologia, evolução, biogeografia e filogeografia.
A recente passagem do ISPA a Instituto Universitário abriu a porta a que, de uma forma natural, o potencial
científico, pedagógico e cultural na área das ciências da vida fosse aproveitado como o devido reconhecimento
e avaliação pelo Ministério da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior com a entrada em funcionamento do 1º
ciclo em Biologia.
Assim, consolidase na área das ciências da vida, a construção de um projecto sólido, sustentável e de
excelência, do qual a presente proposta é parte integrante.
Este ciclo de estudos pretende fornecer uma sólida formação de base teórica em Biologia Marinha e em
Conservação dos Ecossistemas Marinhos, áreas centrais de investigação dos membros da equipa docente do
curso. Desta forma, o conhecimento gerado no âmbito da investigação de excelência no ISPA nestas áreas do
conhecimento, será traduzido num plano de cursos centrado para o fornecimento de competências que
permitam uma completa e integrada compreensão do funcionamento dos ecossistemas marinhos.
Adicionalmente, o ISPA trabalha há muitos anos em estreita articulação com as instituições públicas com
acção na área da conservação marinha, tendo os estudos de base que justificaram a criação do Parque
Marinho da Arrábida, onde continuamos a trabalhar, sido realizados pelo ISPA sob coordenação do coordenador
da UI&D em EcoEtologia e do coordenador do presente ciclo de estudos. Esta componente aplicada da gestão
dos ecossistemas marinhos será uma maisvalia deste curso quando comparado com outros similares
existentes em Portugal e permitirá aos estudantes aplicar os seus conhecimentos na prática durante os dois
anos de formação do mestrado.
3.2.2. Demonstration that the study cycle's objectives are compatible with the institution's educational, scientific
and cultural project.
The EcoEthology Research Unit of ISPA, recognised by the Portuguese Science and Technology Foundation
since 1994 (FCT 331/94) and ranked as Excellent by the last FCT evaluation from independent reviewers,
presents a vast and internationally recognised scientific activity, extension and outreach programs and
educational support of the study cycles and curricular units in the life sciences (1st cycle in Biology; Masters
degree in Psychobiology; several curricular units in other study cycles). The qualified staff with exclusive activity at the institute organise a significant set of masters and PhD students,
as well as PhD researchers which together are involved in a wide range of national and European research
projects with a highly relevant scientific output. They further develop relevant activity of university extension
and outreach, acquisition of services and participation in the definition and implementation of public policies
which award ISPA an unquestionable recognition in the life sciences and, in particular, in Biology. One of the
strongest areas of research in Biology performed at ISPA is Marine Biology in the areas of marine ecology,
behaviour of marine animals, conservation of marine ecosystems, physiology, evolution, biogeography and
phylogeography.
The recent conversion of ISPA in a University Institute opened the door to, in a natural way, take the best
advantage of this scientific, educational and cultural potential in the life sciences, with the due recognition by the
Ministry of Science, Technology and Higher Education with the launch of the 1st cycle in Biology. Therefore, a
solid and sustainable project of excellence in the life sciences is consolidated, from which the current proposal
is an integral part.
This study cycle aims at providing a solid theoretical background in Marine Biology and the Conservation of
Marine Ecosystems, central areas of research of the academic staff of this study cycle. In this way, knowledge
generated by the research of excellence at ISPA in these areas, will be translated in a course plan centred to
provide competences that allow a complete and integrated understanding of how marine ecosystems function.
Additionally, ISPA works at many years in close collaboration with the public institutions responsible for
implementing marine conservation policies in Portugal, and the baseline studies which justified the creation of
the Arrábida Marine Park, where we continue to work, were performed by ISPA under the supervision of the
current R&D Unit coordinator and the coordinator of the present study cycle. This applied component of
management of marine ecosystems will be an important comparative advantage for our students when
compared with similar courses existing in Portugal, allowing the students to apply their knowledge to concrete
problems during the twoyear duration of the course.
3.3. Unidades Curriculares
Anexo IV Biodiversidade, Biologia Populacional e Biogeografia Marinha
3.3.1. Unidade curricular:
Biodiversidade, Biologia Populacional e Biogeografia Marinha
3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):
Vítor Manuel Carvalho Almada
3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:
André Levy Martins Coelho
Joana Isabel Espírito Santo Robalo
3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:
A presente unidade curricular tem como objectivo introduzir os estudantes ao estado da arte e aos principais
problemas actualmente em debate nos domínios da biologia populacional e biogeografia marinhas e ao estudo
da biodiversidade existente no mar. No final o aluno deverá ser capaz de dispor de conceitos que lhe permitam
abordar adequadamente problemas centrais neste domínio como: o papel de factores estocásticos e
determinísticos na determinação da biodiversidade e do tamanho das populações; a interacção entre
processos históricos e determinantes ecológicos na formação dos actuais padrões biogeográficos no meio
marinho; identificar os traços mais peculiares às populações marinhas e que as distinguem habitualmente das
populações terrestres. A importância do estudo da biodiversidade atravessa todo o conteúdo da unidade
curricular e a importância do seu conhecimento para a conservação do meio marinho constitui um tópico final
que envolve a síntese dos conhecimentos obtidos
3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:
This course aims to introduce students to the state of the art and to the main issues currently under discussion
in the fields of population biology and biogeography and the study of marine biodiversity that exists in the sea.
In the end the student should be able to have concepts that allow it to adequately address the core problems in
this area as the role of stochastic and deterministic factors in determining the biodiversity and population size,
the interaction between ecological and historical processes determining the formation of current biogeographic
patterns in the marine environment, to identify the traits peculiar to marine populations and that usually
distinguish them from terrestrial populations. The importance of the study of biodiversity across the entire
content of the course and the importance of their knowledge for the conservation of the marine environment is
one final topic that involves the synthesis of knowledge gained in previous topics
3.3.5. Conteúdos programáticos:
1. Conceitos básicos de biologia populacional: principais traços das populações marinhas, variações espacio
temporais e os efeitos na variação de recrutamento
2. Modelos de regulação das populações marinhas: processos estocásticos e determinísticos
3. Conceitos e medidas de biodiversidade 4. Padrões de variação geográfica e ecológica da biodiversidade marinha
5. Conceitos básicos de biogeografia marinha
6. Principais regiões biogeográficas e ecológicas no meio marinho 7. Os mares tropicais, costeiros, os mares temperados e glaciais, o oceano profundo e os ambientes pelágicos
8. Factores históricos que afectam os padrões de biodiversidade e distribuição das espécies: o passado dos
oceanos
9. Factores ecológicos que afectam a biodiversidade marinha: porquê os picos de diversidade nos trópicos
10. O problema da especiação no mar
11. O estudo da biodiversidade e as suas aplicações na protecção e conservação marinhas
3.3.5. Syllabus:
1. Basic concepts of population biology: the key traits of marine populations, spatiotemporal variations and
effects on recruitment variation
2. Models for the regulation of marine populations: stochastic and deterministic
3. Concepts and measures of biodiversity
4. Patterns of geographic variation of marine biodiversity and ecological
5. Basic concepts of marine biogeography
6. Major biogeographical and ecological marine environment
7. The tropical seas, coastal, glacial and temperate seas, the deep ocean and pelagic environments
8. Historical factors that affect patterns of biodiversity and species distribution: the past of the oceans
9. Ecological factors affecting the marine biodiversity: why the peaks of diversity in the tropics
10. The problem of speciation in the sea
11. The study of biodiversity and its applications in protecting and conserving marine
3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidade
curricular.
A presente unidade curricular tem como objectivos introduzir os estudantes ao estado da arte e aos principais
problemas actualmente em debate nos domínios da biologia populacional e biogeografia marinhas e ao estudo
da biodiversidade existente no mar. Em primeiro lugar serão expostos os conceitos básicos de biologia populacional e os principais modelos de
regulação das populações marinhas. De seguida serão abordados os conceitos e medidas de biodiversidade
assim como os padrões de variação geográfica e ecológica da biodiversidade marinha. No que respeita à componente biogeográfica da unidade curricular serão primeiro abordados os conceitos
básicos de biogeografia marinha assim como as principais regiões biogeográficas e ecológicas no meio
marinho. Os mares tropicais, costeiros, temperados e glaciais assim como o oceano profundo e os ambientes
pelágicos serão discutidos de seguida. Os factores históricos que afectam os padrões de biodiversidade e
distribuição das espécies assim como os factores ecológicos que afectam a biodiversidade marinha serão
outros dos temas abordados nesta unidade curricular, assim como o problema da especiação no mar e o
estudo da biodiversidade e as suas aplicações na protecção e conservação marinhas.
O programa desta unidade curricular é como se poderá constatar confrontandoo com os objectivos uma
concretização directa dos mesmos. Cada objectivo corresponde a um grupo de aulas teóricas. As aulas
práticas têm uma sequência própria mas acompanham os conceitos e metodologias apresentados nas aulas
teóricas.
3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.
This course aims to introduce students to the state of the art and the main issues currently under discussion in
the fields of population biology and biogeography and the study of marine biodiversity that exists in the sea.
First we will show the basic concepts of population biology and the main regulatory models of marine
populations. Then we will focus on concepts and measures of biodiversity and patterns of geographic variation
and ecological marine biodiversity.
Regarding the biogeographic component of the course will be first discussed the basics of marine biogeography
as well as key biogeographical and ecological marine environment. The tropical seas, coastal, temperate and
glaciers as well as the deep ocean and pelagic environments will be discussed below. The historical factors that
affect patterns of biodiversity and species distribution and ecological factors affecting the marine biodiversity of
other issues will be addressed in this course, as the problem of speciation in the sea and the study of
biodiversity and its applications in the protection and marine conservation.
The program of this course is how we will see by comparing it with the direct targets of such an achievement.
Each objective corresponds to a group of lectures. Practical classes have a proper sequence but follow the
concepts and methodologies presented in the lectures.
3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):
Com base na lista bibliográfica geral e em artigos de revisão específicos, será feito para cada tópico: i) uma
apresentação oral pelo docente dos conceitos básicos e problemas actuais; ii) um ‘journal club’ no qual os
alunos apresentam e discutem artigos ou capítulos de revisão relativos aos temas em discussão.
Serão também realizadas aulas práticas:
1 Num pequeno trabalho de campo os alunos realizarão no litoral rochoso inventários de biodiversidade à
escala de uma poça e de dois tipos de quadrados com dimensões diferentes. Os dados serão utilizados para
ilustrar a complexidade das relações entre biodiversidade e área e para discutir com os estudantes as
metodologias para realizar amostragens representativas.
2 No laboratório os estudantes serão introduzidos ao software relevante para a modelação da dinâmica
populacional e para a identificação de padrões biogeográficos.
A avaliação será contínua, valorizando desempenho em trabalhos práticos e nas discussões temáticas.
3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):
Based on the general list of references and review articles specific to each topic will be: i) an oral presentation
by the teacher of basic concepts and current issues, ii) a 'journal club' in which students present and discuss
articles or chapters review relating to issues under discussion.
We will also conduct practical classes:
1 In a small field work students will visit the rocky shore and make inventories of biodiversity at the scale of a
pool tide using two types of squares with different dimensions. The data will be used to illustrate the complexity
of relations between biodiversity and area and to discuss with students the methodologies to achieve
representative samples.
2 In the lab students will be introduced to the relevant software for the modeling of population dynamics and to
identify biogeographical patterns.
The evaluation will be continuous, valuing performance in practical work and discussions topics.
3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidade
curricular.
Os métodos de ensino descritos acima pretendem promover um estilo de aprendizagem activo nos alunos,
através da introdução de momentos de discussão da matéria nas aulas, e responsabilizando os alunos pela
pesquisa de determinados temas sobre os quais devem informar a turma.
É também valorizada a leitura de fontes primárias como meio dos estudantes entenderem a dinâmica da
propagação de informação científica e de promover uma atitude proactiva na busca de informação e formação
de uma opinião esclarecida sobre um tema. Todos estes aspectos são coerentes com os objectivos genéricos
expressos acima.
3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learning
outcomes.
The teaching methods described above is intend to promote an active learning mode among the students,
through the introduction of discussion moments within each class, and by assigning student chores for
researching specific issues and then informing the class mates on these. It is also valued the reading of primary
sources as a mean for students to understand the dynamics of the scientific information spread and in order to
promote a higher proactive attitude regarding literature research and the building up of an informed opinion on
specific topics. All these aspects are consistent with the generic objectives expressed above.
3.3.9. Bibliografia principal:
Briggs, J.C. (1995). Global biogeography—developments in palaeontology and stratigraphy. Elsevier,
Arnoldsville.
Cox, C.B. & Moore, P.D. (2010).Biogeography: An Ecological and Evolutionary Approach. Wiley; 8th edition.
Gebruck, A., Southward, E. & Taylor, P. (1997). Advances in Marine Biology, Volume 32: The Biogeography of the
Oceans. Academic Press.
Stenseth, N., Ottersen, G., Hurrell, JW & Belgrano, A. (2005) Marine Ecosystems and Climate Variation: The
North Atlantic: A Comparative Perspective. Oxford University Press.
Neal, D. (2004). Introduction to population biology. Cambridge University Press.
Anexo IV Biologia da Conservação Marinha
Biologia da Conservação Marinha
Manuel Eduardo de Noronha Gamito Afonso dos Santos
Paulo Xavier Catry
1. Partindo dos conceitos essenciais da biologia da conservação, promover nos alunos a compreensão dos
aspectos especiais da situação ecológica do meio marinho e a necessidade do equilíbrio entre a utilização dos
recursos e a protecção da biodiversidade marinha.
2. Reforçar os conhecimentos sobre a distribuição da biodiversidade marinha e as regiões oceânicas.
3. Preparar os alunos para a intervenção técnica em situações de regulação de actividades extractivas no meio
marinho, gestão de Áreas Marinhas Protegidas e noutros contextos relacionados com a conservação da
biodiversidade marinha.
1. Starting from the essential concepts of conservation biology, to promote in students an understanding of the
special aspects of the ecological situation in the marine environments, and the need to obtain a balance between
the use of resources and the protection of marine biodiversity.
2. To increase knowledge on the distribution of marine biodiversity and oceanic zones.
3. To prepare the students for technical interventions in situations of regulation of extractive activities in the
marine environment, in the management of Marine Protected Areas and in other contexts related to marine
biodiversity conservation.
1. Introdução à biologia da conservação; a necessidade de proteger a biodiversidade marinha.
2. Padrões de distribuição de espécies, populações e metapopulações nos ambientes marinhos e suas
consequências.
3. Grandes ecossistemas marinhos, ecoregiões e subregiões; A importância da noção de escala nas
estruturas e nos processos ecológicos; valor e limitações da zonação.
4. Extinções (naturais e antropogénicas) e espécies chave nos ecossistemas marinhos.
5. Ameaças à biodiversidade marinha: sobreexploração, poluição, degradação dos habitats, espécies
invasoras e alterações climáticas globais.
6. Estratégias para a conservação marinha e principais aspectos biológicos relevantes; a necessidade das
Áreas Marinhas Protegidas, suas vantagens e limitações.
7. Regulação das pescarias e outras actividades extractivas; intervenções ao nível dos produtores como
stakeholders, dos mercados, dos consumidores e dos decisores políticos.
3.3.5. Syllabus:
1. Introduction to conservation biology; the need to protect marine biodiversity.
2. Patterns in the distribution of species, populations and metapopulations in the marine environments and their
consequences.
3. Large marine ecosystems, ecoregions and subregions; the importance of the notion of scale in ecological
structures and processes; value and limitations of zonation.
4. Extinctions (natural and anthropogenic) and key species in marine ecosystems.
5. Threats to marine biodiversity: overexploitation, pollution, habitat loss and degradation, invasive species and
global climate change.
6. Strategies for marine conservation and their main biological aspects; the need for Marine Protected Areas
and their limitations.
7. Regulation of fisheries and other extractive activities; dealing with producers as stakeholders, with market
and consumers, and with policy makers.
curricular.
O programa desta Unidade Curricular está organizado em torno de 7 tópicos que cobrem as principais questões
relativas à conservação da biodiversidade marinha, desde os conceitos básicos da biologia da conservação até
às estratégias de gestão de Áreas Marinhas Protegidas, passando pela forte contextualização ecológica da
distribuição dos organismos e dos processos biológicos no meio marinho. A questão das possibilidades de
intervenção técnica nas situações reais em que a proteção dos recursos é crítica toma uma importância
especial nesta Unidade Curricular.
The syllabus of this curricular unit is organized around 7 topics that cover the main issues related to the
conservation of marine biodiversity, from the basic concepts of conservation biology to the management
strategies of Marine Protected Areas, with strong ecological framing of the distribution of marine organisms and
of the biological processes in the marine environment.
The possibilities of technical intervention in real situations where resource protection is critical becomes
especially important in this curricular unit.
Os conceitos teóricos e as suas ilustrações práticas serão discutidos em ambiente de sala de aula no contexto
das aulas teóricas
Haverá visitas de estudo a 3 Áreas Marinhas Protegidas ou regiões costeiras de especial interesse em termos
de conservação (ex. Arrábida, Berlengas e Sudoeste Alentejano).
A avaliação será baseada em trabalhos de pequenos grupos sobre duas temáticas diferentes por grupo, a
serem apresentados e discutidos nas aulas teóricopráticas.
Theoretical concepts and their practical illustrations will be discussed in the classroom during the theoretical
classes.
Field visits will be made to 3 Marine Protected Areas or coastal regions of special interest in terms of
conservation (eg. Arrábida, Berlengas and Sudoeste Alentejano).
Evaluation will be based on smallgroup projects on two different themes per group, to be presented and
discussed in the practicaltheoretical classes.
curricular.
Uma abordagem fortemente baseada na apresentação de exemplos concretos, e aberta à participação
interactiva dos alunos com o docente, será a mais indicada para a aquisição das competências e
conhecimentos expressos nos objectivos da Unidade Curricular. O trabalho de campo e a visita a locais de especial interesse são essenciais para o alcance dos objectivos mais
aplicados da Unidade Curricular.
A formação de pequenos grupos (23 alunos) para a pesquisa dos recursos bibliográficos e electrónicos
disponíveis permitirá a exploração dos temas de uma forma mais criativa, enriquecedora da sua formação e
até de maior interesse para os docentes. No entanto, cada elemento dos grupos estará sujeito a um escrutínio
oral durante as apresentações dos trabalhos, que permitirá uma apreciação da profundidade dos
conhecimentos adquiridos acerca da biologia da conservação marinha e também a sua partilha por todo o
grupo.
outcomes.
An educational approach strongly based on the presentation of real situations, and open to the interactive
participation of all students with the lecturer, will be the most suited to the acquisition by the students of the
knowledge and competencies expressed in the curricular unit’s objectives.
Field work and visits to special interest sites are essential to the achievement of the more applied objectives of
this curricular unit.
Small groups (of 23 students) will research the literature and the electronic resources available in a more
creative way, with more potential interest for the students and even for the lecturer. However, each student will
have to display, during the oral presentations in class, the depth of the knowledge acquired concerning marine
conservation biology, and that knowledge will thus be shared with the whole group.
Gubbay, S. (Ed.) (1995). Marine Protected Areas. Principles and Techniques for Management. London: Chapman
& Hall.
Kritzer, J. P. & Sale, P. F. (Eds) (2006). Marine Metapopulations. Amsterdam: Elsevier.
Nybakken, J. W. (2001). Marine Biology. An Ecological Approach, 5th Ed. San Francisco: Benjamin Cummings.
Pullin, A. S. (2002). Conservation Biology. Cambridge University Press.
Roff, J. & Zacharias, M. (2011). Marine Conservation Ecology. London: Earthscan.
Anexo IV Desenho Experimental e Análise Avançada de Dados Ecológicos
Desenho Experimental e Análise Avançada de Dados Ecológicos
João Paulo Maroco Domingos
Regina Maria Baltazar Bispo Carita
Descrever os delineamentos experimentais mais comuns em Investigação em Ecologia
Descrever técnicas avançadas de análise estatística multivariada com aplicação a dados ecológicos
Os alunos irão desenvolver competências no planeamento e análise de projetos experimentais aplicados à
Investigação em Ecologia
Os alunos irão desenvolver competências na utilização de técnicas de análise estatística multivariada aplicada
à Ecologia
To describe the major experimental designs in Ecological Research
To describe advanced multivariate statistical analysis techniques with application to Ecological Data
Students will develop competences in the planning and analysis of experimental designs applied to Ecological
Research
Students will develop competences in the use of multivariate statistical analysis techniques as applied to
Ecological Research
1. Introdução
1.1. Estratégia de Experimentação
1.2. Conceitos básicos
1.3. Directrizes para o planeamento de experiências
1.4. Algumas aplicações de desenho experimental
2. Principais tipos de delineamento experimental
2.1. Processos comparativos simples
2.2. Processos com factor único
2.3. Experiências em blocos aleatórios, quadrados latinos e quadrados grecolatinos 2.4. Desenhos factoriais
2.5. Desenhos aninhados e Splitplot 3. Técnicas estatísticas exploratórias multivariadas
3.1. Análise de Componentes Principais
3.2. Análise de Clusters
3.3. Escalonamento multidimensional
3.4. Análise Discriminante
3.3.5. Syllabus:
1. Introduction
1.1. Strategy of Experimentation
1.2. Basic Concepts
1.3. Guidelines for the design of experiments
1.4. Some applications of experimental design
2. Major experimental designs 2.1. Simple comparative experiments
2.2. Single factor experiments
2.3. Randomized Block designs , Latin Squares and GrecoLatin Squares
2.4. Factorial Designs
2.5. Nested and Splitplot designs
3. Multivariate Exploratory Statistical techniques
3.1. Principal Component Analysis
3.2. Cluster Analysis
3.3. Multidimensional Scaling
3.4. Discriminant Analysis
curricular.
O programa é composto por temas de delineamento experimental e análise avançada de dados multivariados.
O objectivo é dar aos alunos a capacidade de planear experiências em investigação ecológica e fazer a análise
dos dados respectivos.
Começa por se introduzir os estudantes às diferentes estratégias de planeamento e desenho de experiências
em ecologia, dando exemplo de diferentes estudos onde são aplicados diferentes tipos de desenhos
experimentais e discutidas as regras básicas de delineamento de experiências em ecologia. De seguida, são
sistematizados de forma mais específica alguns dos principais tipos de desenhos experimentais em ecologia,
nomeadamente, processos comparativos simples, de factor único ou em blocos. Detalhase o desenho em
blocos aleatórios, quadrados latinos e grecolatinos. Serão depois apresentados e discutidos diferentes tipos
de desenhos experimentais factoriais, aninhados (nested) e split plot. Após consolidação dos conceitos e
aplicações dos diferentes tipos de desenhos experimentais, serão apresentados aos alunos os principais tipos
de estratégias de tratamento de dados multivariados, nomeadamente as análises de componentes principais,
de clusters, o escalonamento multidimensional e a análise discriminante. Com estes conteúdos será fornecida aos alunos uma sólida base teórica sobre estratégias de planeamento de
experiências em ecologia e de tratamento de dados ecológicos, com uma abundante apresentação de
exemplos e casos de estudo que serão apresentados pelos alunos em grupo em contexto de sala de aula.
Desta forma, cumpremse os principais objectivos propostos para esta unidade curricular.
The syllabus is composed of themes in experimental design and advanced multivariate data analysis that will
give students the ability to plan experiments in Ecological research and perform data analysis.
It will start by introducing the students to the different strategies of planning and experimental design in ecology,
using as examples different studies where different experimental design types are applied and the basic rules of
planning experiments in ecology are discussed. Next, some of the types of experimental designs in ecology are
systematized in a more specific way, namely, Simple comparative experiments, of single factors and in blocks.
Randomized block designs, latin squares and grecoLatin squares are detailed. Then, different types of factorial,
nested and splitplot designs are presented and discussed. After the consolidation of concepts and application
of the different types of experimental designs students will learn the main types of multivariate data treatment
processes, namely principal component analysis, cluster analysis, multidimensional scaling and discriminant
analysis.
These contents will provide to the students a solid theoretical basis on strategies for experimental planning of
experiments in ecology and data treatment of ecological data, with a profusion of examples and casestudies
that will be presented by the students in groups in classroom context. This way, the main objectives proposed
for this curricular unit are fulfilled.
As aulas serão teóricas e teóricopráticas (com recurso a laboratórios de informática e software de análise
estatística). Os alunos serão chamados a resolver problemas práticos relacionados com o planeamento e
análise de experiências, bem como a efectuar análise de dados reais (usando sempre que possível dados
originais de investigação realizada na Unidade de Investigação em EcoEtologia do ISPA) usando os software
estatísticos (SPSS Statistics, PrimerE e R). Avaliação dos alunos será feita testando os conceitos teóricos
num exame, bem como em avaliações praticas (trabalhos de grupo e relatórios) usando software de análise
estatística nas aulas teóricopráticas.
Lectures will be both theoretical and practicaltheoretical (computer labs). Students will be proposed to solve
specific problems related to the planning and analysis of experiments as well as do realdata analysis (using as
much as possible data originated from the research performed at the EcoEthology Research Unit of ISPA)
using statistical software (SPSS Statistics, PrimerE and R). Evaluation of students will be done by testing
theoretical concepts in an exam as well as handson data analysis using statistical software in the practical
theoretical classes.
curricular.
Teaching methodologies will include both theoretical classes to provide students the theoretical background of
experimental design and data analysis of ecological experiments as well as handson computer lab practices
and group work. These two approaches will increase student theoretical competences as well as their
competences to plan experiments, gather data and do their own data analysis.
outcomes.
As metodologias de ensino incluirão quer aulas de exposição teórica (com o objetivo de transmitir aos alunos
os fundamentos teóricos do desenho experimental e da análise de dados ecológicos) quer aulas práticas onde
serão resolvidos exercícios práticos no laboratório de informática e trabalhos de grupo. Estas duas abordagens
trarão aos estudantes competências teóricas de planeamento de experiências, bem como competências ao
nível do planeamento de experiências e da recolha e análise de dados.
Maroco, J. (2011). Análise Estatística com o SPSS Statistics. 5a. Ed. ReportNumber, Pero Pinheiro, 990p.
Montgmorey, D. (2009). Design and Analysis of Experiments. 7th. Ed. John wiley & Sons. London
Scheiner, S. M. & Jessica, G.(Eds) (2001). Design and Analysis of Ecological Experiments. 2nd Ed. Oxford
University Press. NewYork.
Anexo IV Ecologia Comportamental e Sociobiologia
Ecologia Comportamental e Sociobiologia
Rui Filipe Nunes Pais de Oliveira
Maria Leonor Santos Galhardo
Esta Unidade Curricular tem como objectivo apresentar a Ecologia Comportamental e a Sociobiologia como a
ciência que estuda os aspectos biológicos do comportamento animal e das interacções sociais entre os
indivíduos numa perspectiva evolutiva e ecológica. Pretendese ainda demonstrar a relevância do estudo do
comportamento animal para a biologia da conservação, em particular do meio marinho. No final deste curso os
alunos deverão estar aptos a:
debater temas actuais de investigação em Ecologia Comportamental e Sociobiologia;
avaliar de forma crítica a literatura primária relevante desta área;
comunicar ideias e resultados de investigação oralmente, por escrito, e através da utilização de meios audio
visuais;
compreender os mecanismos biológicos subjacentes ao comportamento e como estes estão sujeitos a
processos evolutivos e ecológicos;
compreender as implicações do estudo do comportamento para a Biologia da Conservação.
The goal of this curricular unit is to introduce Behavioral Ecology and Scobiology as the science that studies the
biological aspects of animal behavior and of social interactions among individuals on an evolutionary and
ecological perspective. It is our aim also to demonstrate the implications of animal behavior for conservation
biology and wildlife management, in particular for marine species and environments. At the end of this course
students should be able to:
discuss current research topics in Behavioral Ecology and Sociobiology;
evaluate in a critical way original research papers in the area;
communicate ideas and research data orally, in written form, and through the use of audiovisual support;
understand the biological mechanisms underlying animal behavior and how these are part of ecological and
evolutionary processes;
understand the implications of the study of animal behavior for Conservation Biology.
1. Introdução ao estudo do comportamento animal
1.1. O estudo do comportamento como disciplina interdisciplinar e integrativa
1.2. Genética do comportamento
1.3. Aprendizagem, memória e cognição animal
1.4. Selecção natural, adaptação e comportamento
1.5. Evolução e Comportamento
2. Ecologia comportamental
2.1. Relógios biológicos e ciclos de comportamento. 2.2. Selecção de habitats, orientação e navegação.
2.3. Comportamento alimentar
2.4. Comportamento antipredatório
3. Sociobiologia
3.1. Comportamento reprodutor e selecção sexual
3.2. Cuidados parentais e sistemas de acasalamento
3.3. Comunicação animal
3.4. Agressão e conflito
3.5. Vida em grupo, altruismo e cooperação
4. Comportamento Conservação e Gestão da Vida Selvagem
4.1. Selecção de habitats
4.2. Estratégias alimentares
4.3. Comportmento antipredatório
4.4. Comunicação acústica
4.5. Consequências demográficas da socialidade
4.6. Consequências demográficas da selecão sexual e comportamento reprodutor
3.3.5. Syllabus:
1. An introduction to the study of animal behaviour
1.1. The study of behaviour as an interdisciplinary and integrative subject
1.2. Genetics of behaviour
1.3. Learning, memory and animal cognition
1.4. Natural selection, adaptation and behaviour
1.5. Evolution and behaviour
2. Behavioural Ecology
2.1. Biological clocks and behavioural cycles 2.2. Habitat selection, mechanisms of orientation nand navigation
2.3. Foraging behaviour
2.4. Antipredator behaviour
3. Sociobiology
3.1. Reproductive behaviour and sexual selection
3.2. Parental care and mating systems
3.3. Animal communication
3.4. Agression and conflict
3.5. Group living, altruism e cooperation
4. Behaviour, Conservation and Wildlife Management
4.1. Habitat Selection
4.2. Foraging Behavior
4.3. Antipredator Behavior
4.4. Acoustic Communication
4.5. Demographic Consequences of Sociality
4.6. Demographic Consequences of Sexual Selection and Reproductive Behavior
curricular.
O programa da cadeira está organizado em 4 módulos temáticos que cobrem os diferentes aspectos da biologia
do comportamento, numa perspectiva evolutiva e ecológica, e a sua aplicação à Conservação. No primeiro
módulo (Introdução) do programa apresentamse os conceitos básicos do estudo do comportamento animal. É
introduzido o conceito fundamental dos diferentes níveis de análise do comportamento que reflectem dois tipos
distintos de questões o “Porquê” (a função e a evolução dos comportamentos) e o “Como” (i.e. o
desenvolvimento e os mecanismos causais do comportamento), salientandose assim a natureza
interdisciplinar e integrativa do estudo do comportamento. De seguida são abordados os mecanismos do
comportamento na sua vertente genética e de aprendizagem e processos cognitivos. Este módulo termina com
uma perspectiva evolutiva sobre o valor adaptativo do comportamento e a sua abordagem filogenética. No
segundo módulo (Ecologia Comportamental) são abordados temas que ilustram o papel central do
comportamento para a sobrevivência dos indivíduos, nomeadamente os aspectos ligados à organização
temporal e espacial do comportamento, a encontrar e obter alimento e a evitar predadores. O terceiro módulo
(Sociobiologia) incide sobre o estudo das interacções sociais e da organização social nos animais quer em
contextos de reprodução (sistemas de acasalamento, selecção sexual) e cuidados parentais, quer em
contextos sociais (cooperação e conflicto). No quarto e último módulo iremos aplicar os conhecimentos
adquiridos nos módulos anteriores a problemas específicos de Conservação e gestão de vida selvagem,
ilustrando deste modo a relevância da Ecologia Comportamental e da Sociobiologia para estas áreas. Como resultado no final do curso, e para além das competências genéricas descritas acima, os alunos devem
ser capazes de:
identificar os quatro níveis de análise utilizados no estudo do comportamento: mecanismos causais,
desenvolvimento, evolução e função;
estar familiarizados com o facto dos comportamentos e os seus mecanismos de controle estarem sujeitos
aos mesmos processos básicos de evolução que afectam outros traços fenotípicos;
ter uma visão crítica sobre as possiblidades e limitações do estudo científico do significado adaptativo do
comportamento.
utilizar o estudo do comportamento animal como ferramenta na conservação e gestão de vida selvagem.
The syllabus of this course is organized into four thematic modules that cover different aspects of the biology of
behavior, from an evolutionary and ecological perspective, and their application to conservation. In the first
module (Introduction) the basics of animal behavior will be presented. The fundamental concept that behavior
can be analyzed at different levels that reflect “Why” and “How” questions (i.e. the function and evolution of
behavior vs. the development and the causal mechanisms of behavior), highlighting the integrative and
interdisciplinary nature of behavioral biology. The mechanisms of behavior, from genetics to learning and
cognitive processes, will then be discussed. This module ends with an evolutionary perspective on the adaptive
value of behavior and the phylogenetic approach to behavior. The second module (Behavioral Ecology) will
focus on topics that illustrate the central role of behavior for the survival of individuals, including aspects related
to temporal and spatial aspects of behavior, finding and obtaining food and avoiding predators. The third module
(Sociobiology) focuses on the study of social interactions and social organization in animals both in contexts of
reproduction (mating systems, sexual selection) and parental care, and in social contexts (cooperation and
conflict). In the fourth and final module we will apply the knowledge acquired in previous modules to specific
problems of conservation and wildlife management, thereby illustrating the relevance of Behavioral Ecology and
Sociobiology for these areas.
As a result at the end of the course, and beyond the general skills described above, students should be able to:
Identify the four levels of analysis used in the study of behavior: causal mechanisms, development, evolution
and function;
Be familiar with the fact that the behavior and its underlying mechanisms are subject to the same basic
processes of evolution that affect other phenotypic traits;
Have a critical view of the possibilities and limitations of the scientific study of the adaptive significance of
behavior.
Use the study of animal behavior as a tool in conservation and wildlife management.
Para cada tópico do programa existem os seguintes instrumentos de aprendizagem:
1. uma lista de referências bibliográficas recomendadas que os alunos devem ler antecipadamente;
2. uma exposição oral pelo docente dos conceitos básicos e das abordagens experimentais para esse tópico;
3. um “journal club” no qual os alunos apresentam e discutem artigos de investigação referentes aos temas do
tópico em questão.
4. tutorias nas quais o docente pode orientar os alunos na pesquisa de artigos para apresentar e discutir no
“journal club”.
Existirá um website dedicado a esta unidade curricular no qual serão disponilizados os materiais de apoio (e.g.
programa, material audiovisual de apoio às aulas, artigos para o “journal club”, regras de funcionamento,
calendário lectivo, métodos de avaliação, etc.). Será utilizado um método de avaliação contínuo baseado na
apresentação e discussão de artigos, na participação nas aulas e em ensaios escritos sobre temas dos tópicos
do programa.
For each topic of the syllabus the following learning tools will be used:
1. a list of recommended references that students should read in advance;
2. an oral presentation by the teacher introducing the basic concepts and experimental approaches for each
topic;
3. a "journal club" in which students present and discuss research papers related to the themes of the syllabus.
4. tutorials in which the teacher can guide students in searching for research papers to be presented and
discussed at the "journal club".
There will be a dedicated website to this course in which supporting materials will be made available (e.g.
syllabus, audiovisual materials to support lessons, articles for the "journal club", rules and procedures,
academic calendar, evaluation methods, etc.). A continuous assessment method will be used based on the
presentation and discussion of articles, participation in lectures, and writing of written essays on topics of the
syllabus.
curricular.
pesquisa de determinados temas sobre os quais devem informar a turma.
de uma opinião esclarecida sobre um tema. Finalmente, a introdução de métodos de ensino focados na
aprendizagem cooperativa promovem a capacidade dos alunos trabalharem eficazmente em contexto de grupo,
contribuindo para diminuir o ambiente competitivo entre os estudantes e para aumentar a sua autoconfiança.
Todos estes aspectos são coerentes com os objectivos genéricos expressos acima.
outcomes.
The teaching methods described above are intended to promote an active learning style in students by
introducing moments of discussion in class, promoting the research on specific issues on which students
should inform the class. It will also be valued the reading of primary sources as a means for students to
understand the dynamics of the spread of scientific information and to promote a proactive approach in
searching for information and formation of an informed opinion on a given topic. Finally, the introduction of
teaching methods focused on cooperative learning will promote the students' ability to work effectively in a
group setting, contributing to reduce the competitive environment among students and increase their self
confidence. All these aspects are consistent with the general objectives outlined above.
1. Livros de texto:
Blumstein D.T., FernandezJuricic E. (2010). A Primer of Conservation Behavior. Sinauer Associates Inc.
Goodenough J., McGuire B., Jakob E. (2009). Perspectives on Animal Behavior, 3rd ed. John Wiley & Sons.
2. Leituras aprofundadas:
Caro T., Ed.(1998). Behavioral Ecology and Conservation Biology. Oxford University Press.
Clemmons J.R., Buchholz R., Eds. (1997). Behavioral Approaches to Conservation in the Wild. Cambridge
University Press.
Gosling L.M., Sutherland W.J., Eds. (2000). Behaviour and Conservation. Cambridge University Press.
Székely T., Moore A.J., Komdeur J., Eds. (2010). Social Behaviour: Genes, Ecology and Evolution. Cambridge
University Press.
Westneat D., Fox C., Eds. (2010). Evolutionary Behavioral Ecology. Oxford University Press.
3. Artigos de revisão e artigos originais de revistas científicas da especialidade.
(3. Reviews and original research papers from scientific journals)
Anexo IV Genética Aplicada de Populações Marinhas
Genética Aplicada de Populações Marinhas
Joana Isabel Espírito Santo Robalo
Carla Patrícia Cândido de Sousa Santos
Os objectivos visam introduzir os vários domínios da genética marinha, da filogeografia à genómica, e
apresentar as técnicas laboratoriais e estatísticas mais usadas actualmente na área. O aluno deverá adquirir
competências no domínio da extracção e amplificação de ADN e edição de sequências e leitura de
microssatélites. Deverá igualmente familiarizarse com o software de análise filogenética, a análise de
coalescência e de redes de haplótipos, aplicando esses conhecimentos à avaliação do tamanho efectivo das
populações, à identificação de stocks e à detecção de barreiras que afectam o fluxo genético. Pretendese que
o estudante possa aplicar os conhecimentos teóricos e as ferramentas moleculares e de análise em situações
práticas como a gestão de stocks, identificação da biodiversidade críptica e o delineamento de instrumentos de
conservação de espécies e habitats. Deverá compreender a utilização da genética na descoberta de novos
recursos com potencial biotecnológico.
The objectives aim to introduce students to various fields of marine genetics, from phylogeography to
genomics, and to present the laboratory and statistical techniques commonly used today in the area. The
student should acquire skills in the field of extraction and amplification of DNA sequences and editing and
reading of microsatellites. It should also become familiar with the software of phylogenetic analysis, the analysis
of networks and coalescence of haplotypes, applying this knowledge to evaluate the effective size of
populations, stock identification and detection of barriers that affect gene flow. It is intended that the student can
apply the theoretical knowledge and molecular tools and analysis in practical situations such as stock
management, identification of cryptic biodiversity and the design of instruments for the conservation of species
and habitats. It should understand the use of genetics in the discovery of new resources with biotechnological
potential.
1. Conceitos básicos em genética de populações
2. Conceitos básicos sobre as técnicas moleculares aplicadas à biologia das populações marinhas
3. Principais padrões filogeográficos das populações marinhas
4. Os métodos de coalescência e a utilização de marcadores genéticos para avaliação do tamanho e estrutura
das populações 5. Genética aplicada à identificação de recursos marinhos e seus derivados
6. Genética aplicada à identificação da biodiversidade e conservação
7. Genómica e transcriptómica e a sua utilização na identificação de recursos com potencial biotecnológico.
3.3.5. Syllabus:
1. Basic concepts in population genetics
2. Basics on the techniques applied to molecular biology of marine populations
3. Phylogeographic patterns of the major marine fish stocks
4. The methods of coalescence and the use of genetic markers to assess the size and structure of populations
5. Genetics applied to the identification of marine resources and their derivatives
6. Genetics applied to the identification and conservation of biodiversity
7. Genomics and transcriptomics and its use in identifying resources with biotechnological potential.
curricular.
Os objectivos desta unidade curricular visam introduzir os estudantes aos vários domínios da genética
marinha, da filogeografia à genómica, e familiarizálos com as técnicas laboratoriais e estatísticas mais usadas
actualmente na área.
Serão abordados os conceitos básicos em genética de populações assim como as técnicas moleculares
aplicadas à biologia das populações marinhas. Posteriormente serão apresentados os principais padrões
filogeográficos das populações marinhas assim como os métodos de coalescência e a utilização de
marcadores genéticos para avaliação do tamanho e estrutura das populações. Serão também discutidos os
aspectos da genética aplicada à identificação de recursos marinhos e seus derivados e à identificação da
biodiversidade e conservação. Finalmente os avanços na genómica e transcriptómica e a sua utilização na
identificação de recursos com potencial biotecnológico serão também abordados.
O programa desta unidade curricular é, como se poderá constatar confrontandoo com os objectivos, uma
concretização directa dos mesmos. Cada objectivo corresponde a um grupo de aulas teóricopráticas em que
em paralelo com os conceitos teóricos serão explorados e discutidos os aspectos práticos de cada temática. 3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.
The objectives of this course aim to introduce students to various fields of marine genetics, phylogeography of
genomics, and to familiarize them with the laboratory and statistical techniques commonly used today in the
area.
It will examine the basic concepts in population genetics and molecular techniques applied to the biology of
marine populations. Later we will present the main phylogeographic patterns of marine populations and
coalescence methods and the use of genetic markers to assess the size and structure of populations. Are also
discussed aspects of genetics applied to the identification of marine resources and derivative products and the
identification and conservation of biodiversity. Finally, advances in genomics and transcriptome and its use in
identifying resources with biotechnological potential will be addressed.
The program of this course is how we will see by comparing it with the direct targets of such an achievement.
Each objective corresponds to a group of practicaltheoretical lectures in which, in parallel to the presentation of
theoretical concepts, the different applications of each theme will be explored and discussed.
Com base na lista bibliográfica e em artigos de revisão específicos fornecidos atempadamente, será feito para
cada tópico: i) uma apresentação oral pelo docente dos conceitos básicos e assuntos actualmente em
discussão; ii) um ‘journal club’ no qual os alunos apresentam e discutem artigos ou capítulos de revisão
relativos aos temas em discussão; iii) tutorias de orientação dos alunos para apresentar e discutir as temáticas
no “journal club”.
A componente prática das aulas teórico práticas será ainda composta por aulas de: procedimentos
moleculares em laboratório (extracção de ADN, PCR, RFLPs); análise de dados em computador (edição e
alinhamento de sequências, análise filogenética, análise filogeográfica e demográfica com os diferentes
pacotes de software actualmente considerados mais interessantes). Um pequeno projecto de investigação
decorrerá ao longo do semestre. A avaliação será contínua valorizando a participação dos estudantes nas
aulas práticas e nas discussões temáticas.
Based on the general list of references and review articles provided previously, for each topic: i) an oral
presentation by the lecturer of basic concepts and issues currently under discussion; ii) a 'journal club' in which
students present and discuss review articles or chapters on topics under discussion; iii) tutorial orientation of
students to present and discuss the themes in the "journal club".
The practical component of the theoreticalpractial classes will also be complemented with classes of:
molecular procedures in the laboratory (DNA extraction, PCR, RFLPs)
data analysis using computers (editing, sequence alignment, phylogenetic, phylogeographic and demographic
analysis with different software packages currently considered the most interesting).
A small research project will be chosen to the class, and will be built throughout the semester.
The evaluation will be continuous, considering the participation of students in classes and in thematic
discussions.
curricular.
pesquisa de determinados temas que serão depois apresentados e discutidos com toda a turma.
de uma opinião esclarecida sobre um tema. Todos estes aspectos são coerentes com os objectivos genéricos
expressos acima.
Esta estratégia de ensino potencia a aplicação dos conceitos teóricos e metodologias transmitidas a casos de
estudo e situações aplicadas sendo esta uma área extremamente dinâmica e de grande relevância no âmbito
da conservação de populações marinhas.
outcomes.
The teaching methods described above is intend to promote an active learning mode among the students,
specific topics. All these aspects are consistent with the generic objectives expressed above.
This teaching strategy amplifies the application of theoretical concepts and methodologies transmitted during
the classes to case studies and applied situations, being this an extremely dynamic area of great relevant to the
conservation of marine populations.
Page RDM & Holmes EC (1998) Molecular Evolution: A Phylogenetic Approach. Blackwell Science, Oxford, U.K.
Salemi M & Vandamme A.M (2003) The Phylogenetic Handbook. A Practical Approach to DNA and Protein
Phylogeny. Cambridge University Press.
Cock JM, TessmarRaible, K. Boyen, C. & Viard, F. (eds) (2010). Introduction to Marine Genomics (Advances in
Marine Genomics). Springer Artigos de revisão e artigos originais de revistas científicas da especialidade.
(Reviews and original research papers from scientific journals)
Anexo IV Biologia e Conservação de Aves e Répteis Marinhos
Biologia e Conservação de Aves e Répteis Marinhos
Paulo Xavier Catry
Maria Ana Figueiredo Peixe Dias
Introduzir aspectos gerais da biologia e da ecologia das aves e dos répteis marinhos (particularmente as
tartarugas marinhas). Familiarizar os alunos com os grandes temas da ciência ornitológica e herpetológica em
ecossistemas marinhos, particularmente aqueles que têm relevância para a conservação da biodiversidade e
para a monitorização dos oceanos. Dar a conhecer instrumentos e realidades ajustados aos contextos
nacionais (sem perder a visão global) que permitam aos alunos vir a realizar investigação fundamental ou
aplicada nestes domínios. Os alunos deverão conhecer as principais características ecológicas e
comportamentais das aves e das tartarugas marinhas, e a forma como elas as expõem às grandes ameaças
do nosso tempo, tais como a introdução de espécies em ilhas, as pescas acessórias, a sobrepesca e as
alterações climáticas. Deverão também conhecer e ser capazes de discutir quais as principais metodologias
para o estudo e as técnicas e estratégias de conservação mais adequadas.
To give a general overview of the biology and ecology of seabirds and marine reptiles (particularly sea turtles).
To introduce the broad subjects of seabird and marine turtle science, particularly those with a relevance for
monitoring and biodiversity conservation. To familiarize students with information and tools relevant in the
Portuguese context (without loosing a broader, global perspective) that may allow them to incorporate research
or conservation programs. Students will be asked to learn the main ecological and behavioural traits of seabirds
and sea turtles, and the way those make them vulnerable to global threats such as species introductions,
bycatch, overfishing and climate change. Students should also know and be able to discuss the main research
methods and the main techniques and conservation strategies relevant for those groups.
1. Introdução ao mundo das aves e dos répteis marinhos.
2. Adaptações anatómicas, fisiológicas e comportamentais à vida no mar.
3. Ciclos de vida e estratégias reprodutoras.
4. Diversidade e distribuição global.
5. Ecologia espacial e migrações.
6. Ecologia trófica e papel nos ecossistemas.
7. Demografia (factores limitantes e regulação das populações). 8. Técnicas de estudo (censos, captura e marcação, determinação de parâmetros demográficos, seguimento
remoto de movimentos, uso de isótopos estáveis, dieta, obtenção de dados oceanográficos)
9. As aves e as tartarugas marinhas enquanto indicadores biológicos e parte de sistemas integrados de
monitorização e exploração sustentada dos recursos marinhos.
10. Estatutos, tendências demográficas e grandes ameaças em Portugal e no mundo. 11. Iniciativas, técnicas e estratégias de conservação. As aves e as tartarugas enquanto “espéciesbandeira”
para a conservação da biodiversidade e dos ecossistemas marinhos.
3.3.5. Syllabus:
1. Introduction to the world of seabirds and marine turtles.
2. Anatomical, physiological and behavioural adaptations to life in the ocean.
3. Life cycles and reproductive strategies.
4. Diversity and global distribution.
5. Spatial ecology and migration.
6. Feeding ecology, diet and roles in ecosystems.
7. Demography (limiting factors and population regulation). 8. Study techniques (census, capture and marking, estimating demographic parameters, tracking, stable
isotope tools, diet, oceanographic data)
9. Seabirds and sea turtles as tools for environmental monitoring and as part of ecosystembased marine
management.
10. Status, demographic trends and the main threats in Portugal and worldwide. 11. Initiatives, techniques and strategies for conservation. Seabirds and sea turtles as flagship species for the
conservation of biodiversity and ecosystem function.
curricular.
Para que os alunos possam adquirir competências que lhes permitam vir a integrar programas de investigação,
de monitorização ou de conservação, é indispensável que, (1) conheçam as características gerais dos
organismos em causa, (2) estejam ao corrente do estado da arte e das questões ainda mal resolvidas, (3)
compreendam quais os factores que condicionam a dinâmica populacional, (4) se apercebam das principais
ameaças e dos seus efeitos e (5) conheçam as soluções de conservação já encontradas ou em
desenvolvimento, de forma a poderem replicálas, adaptálas e desenvolvêlas em circunstâncias particulares.
Assim sendo, começaremos por apresentar as aves e os répteis marinhos (com destaque para as tartarugas),
relembrando as características gerais dos grupos, e as particularidades das espécies que habitam os oceanos.
A vida no mar e nas ilhas exigiu um conjunto assinalável de adaptações específicas que têm implicações
práticas para a demografia e a ecologia das espécies. Os ciclos de vida também apresentam características
particulares, implicando soluções evolutivas, bem como vulnerabilidades específicas destes vertebrados
marinhos. As aves e as tartarugas marinhas não apresentam uma diversidade muito alta, mas em termos de
biomassa e de papel ecológico nalguns sistemas são muito relevantes. Têm, além disso, uma distribuição
extraordinariamente ampla. As aves são grandes consumidores de peixe e cefalópodes, ao passo que as
tartarugas herbívoras bem como as que comem esponjas podem ser consideradas “espécieschave” em
certos ecossistemas costeiros. Quase todas estas espécies apresentam capacidade de realizar movimentos
de uma amplitude surpreendente, ou mesmo excepcional, e isso condiciona toda a sua estratégia de vida, bem
como a sua exposição a factores naturais ou outros, com origem nas actividades humanas. Um aspecto central na formação dos alunos será uma boa compreensão das características demográficas dos
organismos em questão. As aves marinhas, por exemplo, constituem um extremo evolutivo de estratégias
denominadas “tipoK”, de grande interesse científico, mas também com enormes implicações demográficas e
em termos de biologia de conservação. Já as tartarugas marinhas juntam características demográficas
aparentemente “contraditórias”, com uma elevada longevidade máxima, mas também uma grande
fecundidade. Uma boa compreensão dos factores que regulam e limitam as populações é essencial, quer de um
ponto de vista académico, quer do ponto de vista aplicado.
Será dada uma ênfase especial aos aspectos metodológicos na pesquisa com aves e tartarugas. Longe de se
apresentar informações como factos consumados, procurarseá transmitir uma boa compreensão dos
métodos que conduzem às principais teorias. Isto facilitará o desenvolvimento de um bom espírito crítico bem
como, evidentemente, um conhecimento de base que permitirá a integração dos alunos em futuros trabalhos de
investigação ou de monitorização. 3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.
In order to acquire the basic skills and knowledge allowing them to be incorporated in research or conservation
programs, students will have to (1) be familiar with the main characteristics of the relevant organisms, (2) be
aware of the state of the art and of current gaps in knowledge, (3) understand the main factors regulating
populations, (4) identify the main threats and their effects and (5) learn about the main current conservation
strategies, so that they can replicate or adapt them to particular contexts.
We will start by presenting seabirds and marine reptiles (focusing on sea turtles), reviewing the main features of
these broad groups and the special traits that characterize the species living in the sea. Life at sea and on
offshore islands has required a number of specific adaptations that are not only interesting per se, but which
have important implications in the demography and ecology of those species. Life cycles of marine forms also
present characteristics that have lead to specific evolutionary solutions, but also to vulnerabilities of these
marine vertebrates. Seabirds and sea turtles do not present a large diversity of species, but their overall
biomass and their ecological role are relevant in marine ecosystems. Furthermore, these groups have a very
widespread distribution. Birds are important consumers of fish and squid, while sea turtles that feed on plants or
on sponges often play a “keystone” role in coastal or reef ecosystems. Almost all species of seabirds and
turtles are wideranging, often engaging in longdistance migrations that end up by shaping their life strategies,
and also expose them to a diversity of environmental conditions, including anthropogenic threats.
A central aspect of the teaching will revolve around demography themes. Seabirds, for example, are clear “K
strategists”, presenting a considerable scientific interest, but also presenting, for this same reason, a great
vulnerability to a number of specific threatening factors that depress adult survival. Sea turtles, on the other
hand, present somewhat “contradictory” demographic traits, such as a high adult survival rate, but also a large
fecundity. A good understanding of the factors that regulate populations is mandatory, both from an academic
point of view, but also for a successful application of management and conservation strategies.
There will be a special focus on methodological issues. Instead of presenting knowledge as a finished package
of information, the students will understand how wisdom is acquired. This will help the development of the ability
to question and evaluate, and will provide students with basic knowledge that is essential for future integration in
research and conservation teams.
Para cada tema, será feita uma apresentação expositiva pelo docente, que permita transmitir conhecimentos
gerais sobre a matéria, profusamente ilustrados com exemplos específicos, escolhidos com base na sua
relevância, mas também com uma ênfase na situação portuguesa ou nos PALOP. Serão convidados
investigadores, bem como técnicos especialistas com experiência prática para fazer curtas exposições sobre
temas específicos. Serão dinamizados debates sobre questões relacionadas com ameaças e problemáticas de
conservação. Serão visitadas colecções de museu, bem como colecções de referência utilizadas em estudos
de dieta. Serão feitas saídas de campo extracurriculares, que incluirão trabalhos práticos de identificação e
censos, bem como sessões de captura e manuseamento de aves e recolha de amostras biológicas.
A avaliação terá uma componente baseada num exame, e outra baseada numa avaliação contínua da
participação nas aulas e debates.
For each subject, there will be oral presentations by the lecturer offering general information, sustained by
numerous specific examples, selected by criteria such as quality, interest, and relevance given the
geographical context of the students (special focus on Portugal and Portuguese speaking countries in Africa).
Researchers and conservation practitioners will be invited to make short presentations during the courses.
Debates will be organized where students will discuss conservation issues. We will visit museum collections, as
well as reference collections used for dietary studies. Short extracurricular field courses will be organized,
where students will practice identification, census methods, capture and handling of birds and collection of
biological samples. The evaluation of the students will be based on a written exam. This will be complemented by
a continuous evaluation during classes and debates.
curricular.
Os métodos escolhidos permitirão a transferência de uma quantidade apreciável de informação através das
exposições teóricas. O convite a especialistas para realizarem curtas palestras enriquecerá o contacto com as
realidades da ciência em causa. Os debates ajudarão a promover o sentido crítico e uma melhor compreensão
dos diferentes pontos de vista. As sessões práticas reforçarão os conhecimentos teóricos, numa perspectiva
de uma maior familiarização com as realidades da investigação, além de prepararem os alunos para futuras
aprendizagens mais complexas.
outcomes.
The chosen teaching methodologies will allow the transfer of a considerable amount of information through
classical lectures. The invited talks will enrich the students’ experience and allow contact with different realities
and persons. Debates will help students to develop their own ideas and critically evaluate the options favoured
by others. Practical sessions will reinforce theoretical learning, making students familiar with the routine of
research and monitoring, preparing them for further learning.
Schreiber EA & Burger J (eds) 2002. Biology of Marine Birds. CRC Press, Boca Raton.
Podulka S, Rohrbaugh RW & Bonney R (eds.) 2004. Handbook of Bird Biology. 2nd Edition. Cornell Lab of
Ornithology.
Spotila JR 2004. Sea Turtles. A Complete guide to their Biology, Behaviour and Conservation. Johns Hopkins
University Press, Baltimore.
Sutherland W, Newton I & Green RE 2004. Bird Ecology and Conservation. A Handbook of Techniques. Oxford
University Press.
Catry P, Costa H, Elias G & Matias R 2010. Aves de Portugal. Ornitologia do Território Continental. Assírio &
Alvim, Lisboa.
Catry P, Barbosa C & Indjai B 2010. Marine Turtles of GuineaBissau. Status, Biology and Conservation. Instituto
da Biodiversidade e das Áreas Protegidas, Bissau.
Ramírez I, Geraldes, P, Meirinho A, Amorim P & Paiva V 2008. Áreas Importantes para as Aves Marinhas em
Portugal. SPEA, Lisboa
Anexo IV Biologia Larvar e Recrutamento
Biologia Larvar e Recrutamento
Rita Alexandra Duarte Borges
Ana Margarida da Silva Faria
Pretendese que os alunos compreendam a diversidade de estratégias vitais e de formas embrionárias e
larvares, transições ontogenéticas relevantes, aspectos fundamentais da biologia larvar relacionados com a
alimentação, crescimento, capacidades sensoriais e comportamentais, a importância da fase larvar na
conectividade entre populações e na variabilidade do recrutamento, os mecanismos biofísicos envolvidos no
transporte larvar, teoria metapopulacional e consequências no design e gestão de áreas marinhas protegidas
(AMP) e de populações marinhas, os modelos de recrutamento e os principais métodos de estudo em biologia e
ecologia larvar.
Pretendese que os alunos compreendam a importância do estudo da fase larvar e recrutamento,
desenvolvendo capacidades de pesquisa e análise crítica da literatura relevante e o debate esclarecido sobre
as temáticas abordadas, a sua aplicação a contextos de gestão das populações marinhas bem como atitudes
de cooperação e respeito pelos colegas.
It is intended that the students recognize the diversity of early life histories and stages, the relevant ontogenetic
transitions, fundamental aspects of larval biology such as feeding, growth, sensorial and behavioural
capabilities, the role of larvae as propagules connecting populations and affecting recruitment dynamics, the
biophysical mechanisms involved in larval transport and survival, the metapopulation theory and consequences
for marine protected areas (MPA) network design, recruitment models and methods used in larval ecological
studies.
In the end of the curricular unit, it is meant that students understand the relevance of investigating early life
history stages, in addition to developing skills for critical search and analysis of relevant literature and the
informed debate of the focused themes, as well as cooperation and respect attitudes among colleagues.
1.Diversidade de estratégias vitais, estados embrionários e larvares e relações evolutivas 2. Porquê a existência de estados larvares pelágicos?
3. Breve contexto histórico do estudo da biologia larvar 4. Ontogenia e desenvolvimento. Transições relevantes na morfologia, função e habitat
5. Variabilidade e padrões nos estados iniciais do ciclo de vida
6. Métodos de amostragem e identificação dos estados larvares
7. Alimentação e condição nutricional
8. Idade e crescimento: estudos e métodos
9. Mecanismos sensoriais e estímulos ambientais
10. Comportamento larvar
11. Mecanismos biofísicos de transporte larvar
12. Conectividade vs autorecrutamento: teoria metapopulacional e consequências para a gestão
13. Modelos de recrutamento
14. Influência da fase larvar no sucesso do recrutamento
15. O papel das AMP no aumento da abundância larvar e recrutamento
3.3.5. Syllabus:
1. Diversity of marine eggs, embryos and larval forms and evolutionary relationships 2. Why the existence of a pelagic larval stage?
3. Historical context of the study of larval biology
4. Ontogeny and Development. Relevant transitions in form, function and habitat
5. Variety and patterns in early life history
6. Sampling and identification methods
7. Feeding and nutritional condition
8. Age and growth studies and methods
9. Sensing the environment: cues and sensorial channels 10. Larval behaviour
11. Biophysical mechanisms influencing dispersal
12. Connectivity vs selfrecruitment: metapopulation concept and consequences to management
13. Recruitment models
14. Relationship between early life history and recruitment success
15. The role of MPA’s in larval supply and recruitment
curricular.
Os tópicos propostos cobrem os aspectos mais relevantes da biologia larvar, recrutamento e possíveis
aplicações para a conservação.
Inicialmente é feito um enquadramento geral da diversidade de estratégias de reprodução, embriões e larvas,
numa abordagem transversal e comparativa entre grupos taxonómicos, bem como possíveis relações
filogenéticas. Discutemse as teorias sobre a evolução de um estado larvar pelágico e fazse um
enquadramento histórico dos estudos sobre biologia larvar.
Seguidamente abordamse aspectos fundamentais da biologia larvar, como o desenvolvimento e as transições
ontogenéticas no início do ciclo de vida de organismos marinhos, desde o ovo à metamorfose, focando
aspectos morfológicos e funcionais e as consequências de alterações de habitat. São também explorados os
padrões comuns e a variabilidade que pode ocorrer nas características vitais dos estados ontogenéticos. Em
seguida abordase os métodos de amostragem de estados larvares, salientando a sua selectividade e
complementaridade, bem como as características utilizadas na sua identificação morfológica. A utilidade e
controvérsia sobre o uso de novas técnicas de identificação molecular será também explorada, recorrendose
à discussão de artigos. Explicamse, seguidamente, os aspectos críticos relacionados com a alimentação das
larvas, as técnicas de estudo da condição nutricional, as aplicações em aquacultura, bem como a importância e
métodos dos estudos de determinação de idade e crescimento larvar. No tema seguinte será explorada a
importância das capacidades sensoriais na resposta a estímulos ambientais, bem como os aspectos
comportamentais relevantes ao longo da ontogenia que levam a questionar o paradigma dos estados larvares
como elementos passivos do plâncton.
Os tópicos seguintes centramse na importância do transporte de estados pelágicos para a conectividade entre
populações, fundamental para o estudo da dinâmica de populações costeiras. Serão abordados os factores
oceanográficos relevantes para a dispersão no oceano, a diferentes escalas, e os aspectos biológicos
relevantes, como os padrões de postura e eclosão e os efeitos maternais na qualidade dos estados pelágicos,
ou de que forma os aspectos de biologia larvar podem interagir com factores físicos, alterando o transporte
larvar. O grau de dispersão ou retenção e autorecrutamento e a sua consequência para a gestão das
populações costeiras é actualmente alvo de forte debate em ecologia marinha, pelo que serão abordados
estudos recentemente publicados em revistas relevantes, estimulando o debate científico entre os alunos.
Abordase em seguida a diversidade de modelos de recrutamento de peixes e a possível influência do
suplemento larvar e da variabilidade das características larvares no sucesso do recrutamento.
Finalmente destacase a aplicação e importância dos aspectos explorados para o delineamento e gestão de
AMP e consequências para a conservação e gestão de populações marinhas.
The programme of this curricular unit is organised in topics covering the most relevant aspects of Larval
Biology, recruitment ecology and applications for conservation.
The first modules explore general diversity of life histories and early forms through a taxonomical comparison.
Theories to explain the appearance of a pelagic larval stage are discussed and the general historical context of
larval biology is introduced.
Next, fundamental aspects of larval biology are explored. These include ontogenetic development from the egg
to the juvenile stage, highlighting important morphological and functional transitions, as well as in habitat.
Common patterns and variability in early life history traits are also explored.
Afterwards, an overview of selective but complimentary larval sampling methods is provided, as well as of the
major morphological features useful in larval identifications. The current debate on the use of these classical
methods versus molecular methods will be discussed with relevant literature. Critical aspects related with larval feeding and nutrition, age and growth studies and relevant methods and
applications are explained.
The relevance of sensorial capabilities and the ability to sense and react to environmental cues and the
ontogeny of larval behaviour are explored as fundamental aspects providing evidence that challenges the
traditional view of larvae as passive elements in the plankton.
The subsequent topics are centered in the role of marine pelagic larvae as propagules connecting coastal
populations, which is of great importance to our understanding of coastal population dynamics. Major
oceanographic factors acting at different scales will be highlighted, as well as the biological correlates such as
spawning patterns and maternal effects on larval condition or the interaction between larval traits and behavior
interacting with the physical environment to change larval trajectories.
The debate centered on the degree of larval dispersal or retention and the extent of selfrecruitment is a hot
topic in marine ecology; its importance and consequences to coastal population and marine protected areas
management will be explored by promoting the scientific discussion of recently published papers in the class.
The importance of the supplyside to explain recruitment variability is later discussed in the context of the most
relevant recruitment models, as well as the relationship between variability in early life history traits and
recruitment success.
Finally, the importance of the previous topics to the design and management of marine protected areas is
highlighted, as well as the consequences of the focused patterns and processes to marine conservation and
fisheries management.
Os conceitos serão expostos oralmente e com recurso a meios audiovisuais, com base na bibliografia geral
fornecida. Serão adicionalmente utilizados estudos relevantes de revisão ou elucidativos de controvérsia nos
temas em debate, que irão sendo actualizados. Serão organizados grupos para apresentação desses trabalhos
sobre os assuntos em discussão, que serão debatidos em grupo. Pretendese que os alunos sejam capazes de
pesquisar de forma autónoma e analisar de forma crítica os assuntos abordados nos trabalhos em discussão,
bem como as metodologias e análises de resultados. Estas apresentações serão orientadas em tutorias.
Os materiais de apoio (programa, material audiovisual, artigos e outra bibliografia, regras de funcionamento,
calendário lectivo, métodos de avaliação, etc.) serão disponibilizados num website. A avaliação será baseada
na apresentação e discussão de artigos, na participação nas aulas e em ensaios escritos sobre os temas
abordados.
Based on the general reference list provided to the students and in specific reviews or relevant papers
previously made available, for each topic there will be an oral presentation by the lecturer, with audiovisual
resources to explore the basic concepts and hot topics currently under discussion. Additionally, student groups
will present and critically discuss in the class relevant updated studies about the topics under analysis, after
searching more relevant information on the topic; there will be tutorial guidance of students to present and
discuss these studies.
All support materials will be provided in a dedicated website (programme, audiovisual material in support to the
classes, papers and other bibliographic sources, course rules and calendar, evaluation methods, etc.). The
evaluation method will be based on the papers presentations and discussion, participation in classes and written
essays on the focused topics.
curricular.
Os métodos de ensino descritos acima pretendem promover a interiorização dos conceitos básicos em análise
mas também uma aprendizagem activa pelos alunos através da pesquisa responsável e da exposição e
discussão de trabalhos na turma. A selecção de trabalhos de revisão permite uma abordagem global aos temas
focados; outros trabalhos destacarão o debate cienfíco actual de alguns dos temas expostos. A apresentação
destes trabalhos incentiva a reflexão e análise crítica pelos alunos, estimulando o debate científico. Esta
abordagem promove ainda a capacidade dos alunos trabalharem eficazmente em contexto de grupo,
incentivando atitudes de respeito mútuo e colaboração, de acordo com os objectivos expostos.
outcomes.
The teaching methods described above is intended to promote an active learning mode among the students,
specific topics. Finally, the introduction of specific teaching methods relaying on cooperative learning will enable
student ability to work efficiently in a group context, contributing in this way to diminish the competitive
atmosphere and to increase selfconfidence. All these aspects are consistent with the generic objectives
expressed above.
Chambers RC; EA Trippel 1997. Early Life History and Recruitment in Fish Populations. Chapman & Hall,
London. 596p.Fuiman LA; RG Werner 2002. Fishery Science: The Unique Contributions of Early Life Stages.
Blackwell Sciences.
Harris RP, Wiebe PH, Lenz J, Skjoldal HR, Huntley M. 2000. Zooplankton Methodology Manual. Acad.Press, 684p.
Kritzer, JP & PF Sale 2006. Marine Metapopulations. Acad.Press, San Diego. 544p.
McEdward L 1995. Ecology of Marine Invertebrate Larvae, CRC Press, BocaRaton, Florida 464p.
Moser, HG, WJ Richards, DM. Cohen, M P Fahay, AW Kendall, Jr, Richardson 1984. Ontogeny and systematics
of fishes. 760 p.
Sale, PF 2002. Coral reef fishes: dynamics and diversity in a complex ecosystem. Acad.Press, San Diego.549p.
Whitfield, M, Matthews J, Reynolds C. 1999. Aquatic Life cycle strategies. Survival in a variable environment.
Marine Biol. Ass. of the U.K. 149p.
Williamson DI 2003. The origins of Larvae. Kluwer Acad. Publ. 261p.
Additional review papers will be used.
Anexo IV Ecological modelling and spatial statistics
Ecological modelling and spatial statistics
n/a
Nesta unidade curricular pretendese explorar as técnicas básicas de modelação estatística, tradicionalmente
usadas em ecologia, abrangendo teoria, aplicações e software. Esperase que os estudantes adquiram
conhecimentos sobre modelação estatística em ecologia. Em particular, os alunos devem ser capazes de
explorar os métodos estatísticos para os quais a localização espacial desempenha um papel importante. Os
alunos devem ser capazes de reconhecer a abordagem estatística mais adequada dependendo do tipo de
variável resposta. Pretendese ainda que os alunos aprendem a incluir a variação espacial nos modelos
preditivos e que sejam capazes de usar o software R como uma ferramenta para a modelação de dados
ecológicos.
With this curricular unit we aim to explore the basic statistical modeling strategies traditionally used in ecology.
The course covers a blend of theory, applications, and software. It is expected that students acquire skills and
knowledge regarding statistical modeling in ecology. In particular, students should be able to explore the
statistical methods for which spatial locations play an explicit role. By the end of the course students must be
able to recognize the appropriate approach to model data depending on the type of the response variable and to
implement the analysis. Students will learn to include spatial variation into the models. The R software will be
introduced. By the end of the course students should be able to use R as a tool to model ecological data.
1. Introdução
1.1 Conceitos básicos em modelação estatística
1.2 Introdução ao software R. Modelação estatística no R
2. Modelação estatística
3. Modelos lineares generalizados
4. Modelos aditivos generalizados
5. Estatística espacial
5.1 Dados referentes a pontos
5.2 Dados referentes a areas
5.3 Processos pontuais
3.3.5. Syllabus:
1. Introduction
1.1 Basic statistical modeling concepts 1.2 Introducing R. Statistical modeling in R.
2. Statistical modeling
3. Generalized linear models
4. Generalized additive models
5. Spatial statistics:
5.1 Modelbased geostatistics (point level)
5.2 Areal processes (block level)
5.3 Spatial point process
curricular.
Na primeira parte do programa são abordados os conceitos básicos sobre modelação estatística sendo
apresentado o software R que permitirá aos alunos executar na prática a análise dos dados. Serão abordadas
duas áreas principais da modelação estatística. Os modelos lineares generalizados estendem os modelos
lineares clássicos aos casos em que a variância não é constante e/ou os erros não são normalmente
distribuídos permitindo a introdução de métodos apropriados para variáveis resposta não contínuas, discretas
ou binárias. Estes modelos permitirão aos alunos modelar dados ecológicos, independentemente do tipo de
observações disponíveis. Estes dados serão, sempre que possível, baseados em investigação realizada na
Unidade de Investigação em EcoEtologia do ISPA a fim de mostrar aos alunos como aplicar estas técnicas a
situações concretas. Os modelos aditivos generalizados são introduzidos para permitir aos alunos aprender
como modelar dados quando nenhum modelo paramétrico descreve convenientemente a forma da relação
entre a variável resposta e a(s) variável exploratória(s). Em ecologia, as localizações espaciais podem
desempenhar um papel importante na análise de dados. A estatística espacial pode ser dividida considerando
uma variação espacial discreta, uma variação espacial contínua ou de um processo pontual espacial. Estes
modelos cobrem de uma forma abrangente a análise de dados espaciais permitindo que os alunos estudem
padrões espaciais bem como a sua influência sobre a variável resposta(s) e efectuem a predição para locais
não observados. Será dada ênfase à aplicabilidade destas técnicas no estudo de populações marinhas e na
conservação e gestão dos ecossistemas marinhos.
The first part of the syllabus includes an overview of the main concepts regarding statistical modeling and the
introduction of the analysis tool R that will enable students to analyze data in practice. Two main statistical
modeling approaches will be introduced. The generalized linear models extend the classic linear models to the
cases where variance is not constant and/or the errors are not normally distributed enabling to introduce
methods appropriated to model response variables that are not continuous, being either discrete or binary.
These models will enable students to model ecological data regardless the type of observations available. These
data will be obtained whenever possible, from the research performed in the EcoEthology Research Unit, to
show students how to apply these techniques to tangible casestudies. The generalized additive models are
introduced to allow students to learn how to model data when no particular parametric form describes the shape
of the relationship between the response variable and the exploratory variable(s). In ecology, spatial locations
can play an explicit role in the analysis of data. Spatial statistics can be divided considering a discrete spatial
variation, a continuous spatial variation or a spatial point process. The models will allow students to study
spatial patterns, their influence on the response variable(s) and to predict for nonobserved locations. Particular
emphasis will be centred on the application of these techniques in the study of marine populations and the
conservation and management of marine ecosystems.
As aulas incluirão uma parte onde serão apresentados oralmente os principais conceitos teóricos, seguindose
a discussão e estudo de casos práticos. Em cada aula será apresentado aos alunos um conjunto diferente de
dados para analisar e implementar as abordagens de modelação discutidas usando o software R. Um site
dedicado à cadeira disponibilizará todos os materiais de apoio à docência (programa, material audiovisual de
apoio às aulas, artigos e outras fontes bibliográficas, as regras do curso e do calendário, métodos de avaliação,
etc.). A avaliação os alunos será baseada em relatórios práticos que incluam a descrição dos modelos
estatísticos utilizados e os principais resultados obtidos na análise dos conjuntos de dados apresentados ao
longo das aulas.
The classes will include an oral presentation of the main theoretical concepts followed by the discussion of
practical case studies. Students will have a different data set in each lecture to analyze and implement the
discussed modeling approaches using R software. A dedicated website will be use where all support materials
will be provided (programme, audiovisual material in support to the classes, papers and other bibliographic
sources, course rules and calendar, evaluation methods, etc.). The students evaluation will be based on
practical reports summarizing the used methods and the main results obtained by analyzing the given data sets.
curricular.
Os métodos de ensino acima descritos pretendem estabelecer uma base teórica sólida, preparando os alunos
para utilizar na prática as metodologias introduzidas. A apresentação de estudos de caso pretende
proporcionar aos alunos a exploração de aplicações práticas reais em ecologia. As sessões de laboratório
práticas utilizando R permitirão que os alunos explorem os métodos apresentados promover um modo de
aprendizagem activa.
outcomes.
The teaching methods described above intend to establish a solid theoretical foundation, preparing students to
use in practice the introduced methodologies. By presenting casestudies we intend to explore real practical
applications in ecology. The practical lab sessions using R will allow students to explore the presented methods
promoting an active learning mode.
Augustin, N.H., Mugglestone, M.A. and S. T. Buckland (1996), An Autologistic Model for the Spatial Distribution of
Wildlife, The Journal of Applied Ecology, 33, 339347 pp
Buckland, S..T. and D. A. Elston (1993). Empirical Models for the Spatial Distribution of Wildlife, The Journal of
Applied Ecology, 30, 478495 pp.
Diggle, P. J. and Ribeiro, Jr (2007). Modelbased Geostatistics. Springer, New York.
Faraway,J. J. (2006). Extending the Linear Model with R, Chapman & Hall / CRC
Zuur, A.F., Elena N. Ieno and Erik H.W.G. Meesters (2009) A Beginner’s Guide to R, Ed. Robert Gentleman and
Kurt Hornik and Giovanni G. Parmigiani, Springer
Zuur, A.F., Ieno, E.N., Walker, N., Saveliev, A.A., Smith, G.M. (2009). Mixed Effects Models and Extensions in
Ecology with R. Springer
Zuur, Ieno & Smith (2007). Analyzing Ecological Data, Springer
Wood, S. (2006). Generalized Additive Models: an introduction with R, CRC/Chapman & Hall
Anexo IV BemEstar Animal
BemEstar Animal
Os objectivos desta unidade curricular são a apresentação dos principais conceitos relacionados com bem
estar, incluindo o seu significado em termos morais; a discussão de diferentes abordagens relacionadas com a
avaliação científica do bemestar animal; a abordagem a problemas específicos do bemestar de animais
marinhos e formas de os reduzir; e o desenvolvimento de uma análise crítica dos mais vulgares problemas de
bemestar dos animais marinhos.
No final desta unidade curricular, os estudantes deverão ser capazes de:
1. Descrever conceitos relacionados com bemestar animal;
2. Identificar diferentes abordagens à avaliação do bemestar animal;
3. Debater problemas vulgares de bemestar de animais marinhos;
4. Avaliar, sumarizar e apresentar artigos de fontes primárias;
5. Escrever e falar acerca de ideias e resultados de investigação, usando meios audiovisuais para o efeito. 3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:
The objectives of this curricular unit are to present the main concepts related to animal welfare, including its
moral significance; to discuss different approaches to the scientific assessment and measurement of animal
welfare; to address specific welfare problems of marine animals and ways of reducing them; to develop a
critical analysis of the currently debated marine animal welfare problems.
By the end of this course students should be able to:
1.Describe the animal welfarerelated concepts;
2. Identify different approaches to the assessment of animal welfare;
3. Debate current marine animal welfare problems;
4. Evaluate, summarise and present scientific articles from primary sources;
5. Write and speak about ideas and results of research, using for that audiovisual means.
A. Introdução ao bemestar animal
1. Diferentes abordagens ao conceito de bemestar animal
2. Significado moral do conceito de bemestar animal
3. Investigação em bemestar animal B. Avaliação científica do bemestar animal 1. Saúde e bemestar animal
2. Bases neuroendócrinas do bemestar animal e medidas fisiológicas associadas.
3. Etologia aplicada: uso do comportamento como indicador do bemestar animal
4. Motivação, emoções e cognição: avaliação das experiências mentais dos animais
C. Problemas e gestão do bemestar de animais pertencentes a espécies marinhas 1. Bemestar de mamíferos marinhos 2. Bemestar de peixes em aquacultura
3. Bemestar associado à pesca à linha, à pesca comercial e à caça à baleia
4. Bemestar e conservação de espécies marinhas
5. Bemestar e protecção legal de espécies marinhas
3.3.5. Syllabus:
A. Introduction to Animal Welfare
1. Different approaches to the concept of animal welfare
2. Moral significance of the animal welfare concept
3. Research on animal welfare B. Scientific assessment of welfare 1. Health and welfare
2. Neuroendocrine basis of welfare and related physiological measures
3. Applied ethology: using behaviour as an indicator of welfare
4. Motivation, emotions and cognition: assessing the mental experiences of animals
C. Welfare problems and management of marine species
1. Welfare of marine mammals 2. Welfare in aquaculture
3. Welfare of animals and angling, fisheries and whaling
4. Welfare and marine species conservation
5. Welfare and legal protection of marine species
curricular.
Tal como mencionado no conteúdo programático, esta unidade curricular cobre os aspectos fundamentais
relacionados com os conceitos gerais de bemestar animal e sua avaliação e temas especificamente ligados ao
bemestar de animais marinhos. O programa encontrase dividido em três partes. A primeira é uma introdução
ao bemestar animal , cobrindo conceitos gerais, uma breve perspectiva histórica e a descrição das diferentes
abordagens ao bemestar animal (funcional, emocional e natureza) e aspectos de ética animal com relevância
para o conceito de bemestar animal. Esta parte relacionase directamente com o primeiro dos objectivos
curriculares. A segunda parte desta unidade curricular está relacionada com as diferentes abordagens que são levadas a
cabo na avaliação do bemestar animal e os tópicos a abordar incluem a importância da saúde para o bem
estar; as bases mais relevantes da neuroendocrinologia do stress, da dor da motivação e do prazer e algumas
das medidas de bemestar com elas relacionadas; a etologia aplicada e o uso do comportamento para medir
bemestar animal; e os conceitos de motivação, emoções e cognição e a sua importância para medir
experiências mentais nos animais. Esta parte relacionase directamente com o segundo dos objectivos
curriculares. A terceira parte desta unidade curricular irá abordar diferentes problemas relacionados com o bemestar de
animais pertencentes a espécies marinhas e a sua possível gestão. Inclui questões relacionadas com
problemas de mamíferos marinhos em cativeiro e no meio natural, aquacultura e aspectos relacionados com a
manutenção de diferentes sistemas, transporte e abate de peixes, problemas relacionados com a pesca à linha,
a pesca comercial e a caça à baleia; sinergias e colisões decorrentes de abordagens simultâneas de bemestar
e conservação, e uma revisão crítica da legislação existente na EU sobre protecção do bemestar de animais
de espécies marinhas. Esta parte relacionase directamente com o terceiro dos objectivos curriculares. A natureza teóricoprática desta unidade curricular irá permitir o uso de muitos casosestudo e exemplos
práticos ao longo dos tópicos a serem abordados. Estes serão investigados, apresentados e discutidos pelos
alunos na sala de aula, o que está relacionado directamente com o quarto e o quinto objectivo.
As stated in the syllabus, this curricular unit covers the most fundamental aspects related to general concepts
of animal welfare, its assessment, and the specific marine animal welfare issues. The programme is divided in
three parts. The first is an introduction to animal welfare which covers general concepts, a brief historical
background, the different approaches to animal welfare (functional, emotional and naturalness) and aspects of
animal ethics with relevance to the concept of animal welfare. This part relates directly to the first curricular unit
objectives. The second part of this curricular unit is related to different approaches to undertake animal welfare
assessment and topics to be addressed include the importance of health to welfare; relevant
neuroendocrinological basis of stress, pain, motivation and pleasure and some of the related measures to
assess welfare; applied ethology and the importance of using behavior to measure welfare; and the concepts of
motivation, emotions and cognition and their importance to assess mental experiences on animals. This part
relates directly to the second curricular unit objectives. The third part of this curricular unit will address different problems of marine animals welfare and their possible
management, including marine mammals and their problems in captivity and in nature, aquaculture and aspects
related to the maintenance of different systems, transport and slaughter of animals, welfare problems and
possible ways to improve them in angling, fisheries and whaling; synergies, collisions and priorities created
when dealing simultaneously with animal welfare and conservation, and a critical review of the legal protection
of the marine species welfare. This part relates directly to the third curricular unit objectives. The theoretical/practical nature of this curricular unit will allow the use of many case studies and practical
examples throughout the topics to be addressed. These will be searched, presented and discussed by the
students in the classroom, which covers the fourth and fifth objectives.
As metodologias de ensino incluem:
1. Exposição oral por parte do docente
2. Leitura e discussão de casosestudo
3. Apresentação e discussão de artigos de revisão e empíricos pelos estudantes
4. Tutorias de orientação para preparar e discutir os tópicos do programa
5. Avaliação: continua, baseada em ensaios escritos, apresentações e discussões nas aulas acerca de tópicos
específicos
Teaching methodologies will include:
1. Oral presentations by the lecturer 2. Reading and discussion of casestudies
3. Presentation and discussion of review or empiric papers by the students
4. Tutorial assistance to prepare and discuss topics of the programme
5. Evaluation: continuous, based on written essays and classroom presentation and discussion of specific
topics.
curricular.
As metodologias de ensino incluem:
1. Exposição oral por parte do docente irá cobrir os objectivos 13.
2. Leitura e discussão de casosestudo irá cobrir os objectivos 1 e 3.
3. Apresentação e discussão de artigos de revisão e empíricos pelos estudantes irá cobrir os objectivos 25.
4. Tutorias de orientação para preparar e discutir os tópicos do programa irá cobrir os objectivos 25.
5. Avaliação: continua, baseada em ensaios escritos, apresentações e discussões nas aulas acerca de tópicos
específicos. Irá cobrir todos os objectivos.
outcomes.
Teaching methodologies will include:
1. Oral presentations by the lecturer will cover objectives 1 3.
2. Reading and discussion of casestudies will cover objectives 1 and 3.
3. Presentation and discussion of review or empiric papers by the students will cover objectives 25.
4. Tutorial assistance to prepare and discuss topics of discussion will cover objectives 25.
5. Evaluation: continuous, based on written essays and classroom presentation and discussion of specific
topics. It will cover all objectives.
Appleby MC, Hughes BO, Mench JA, Olsson AC (editors) (2011) Animal Welfare. Oxfordshire: CAB International.
Braithwaite VA (2010) Do Fish Feel Pain? Oxford: Oxford University Press.
Branson EJ (editor) (2008). Fish Welfare. Oxford: Blackwell Publishing.
Broom, D. M. and K. G. Johnson (1993). Stress and Animal Welfare. London: Chapman & Hall.
Iwama GK, Pickering AD, Sumpter JP, Schreck CB. (1997) Fish Stress and Health in Aquaculture. Cambridge:
Cambridge University Press.
Pearce, J. M. (2008). Animal Learning & Cognition An Introduction. New York: Psychology Press.
Schusterman RJ, Thomas JA, Wood FG (editors) (1986) Dolphin cognition and behaviour: a comparative
approach (Comparative Cognition and Neuroscience). NewJersey: Lawrence Erlbaum Associates.
Wong, R. (2000). Motivation: A Biobehavioural Approach. Cambridge: Cambridge University Press.
Wynne, C. D. L. (2001). Animal Cognition: the Mental Lives of Animals. New York: Palgrave Macmillan.
Anexo IV Biologia e Conservação de Mamíferos Marinhos
Biologia e Conservação de Mamíferos Marinhos
n/a
Esta Unidade Curricular tem por objectivo transmitir uma compreensão global da biologia dos mamíferos
marinhos, com enfoque especial nas suas adaptações comportamentais e sensoriais. Os alunos adquirirão
noções sobre a biodiversidade e distribuição dos mamíferos marinhos, complementadas por informação sobre
a sua ecologia alimentar, migrações, questões de conservação e estratégias de mitigação.
Esperase ainda que os alunos adquiram a capacidade de identificar o tipo de técnica necessária para
investigar uma determinada questão científica ou de conservação relacionada com mamíferos marinhos.
This course aims to provide students with a global understanding of marine mammal biology, focusing on their
behavioural and sensorial adaptations. It is furthermore expected that a notion of marine mammal biodiversity
and distribution is acquired, complemented by information on their feeding ecology, migrations, conservation
issues and mitigation strategies.
It is also expected that students will be able to identify the methodological approach better suited to investigate
a given scientific or conservation question related to marine mammals.
1. A diversidade dos mamíferos aquáticos: cetáceos, carnívoros e sirénios.
2. Sua distribuição em rios, lagos, águas costeiras e oceânicas, do Equador às regiões polares.
3. Adaptações fisiológicas básicas dos mamíferos à vida aquática.
4. Alimento e predadores dos mamíferos aquáticos, e seus papéis nas teias tróficas.
5. Canais sensoriais usados pelos mamíferos aquáticos; o papel dominante da audição, e o biosonar como
adaptação especial dos odontocetos.
6. Estratégias comportamentais na alimentação, acasalamento, cuidados parentais e evitamento de
predadores.
7. Modos de comunicação dos mamíferos marinhos.
8. Principais ameaças às populações: capturas directas, capturas acidentais (bycatch), poluição e degradação
dos habitats; o problema actual da excessiva pressão do turismo em alguns habitats.
9. As espécies mais comuns em cativeiro e seu potencial de treino; estudos fisiológicos, sensoriais e
cognitivos de mamíferos marinhos.
10. Técnicas de investigação no meio natural.
3.3.5. Syllabus:
1. The diversity of aquatic mammals: cetaceans, carnivores and sirenians.
2. Aquatic mammals’ distribution in rivers, lakes, coastal and oceanic waters, from the equator to the polar
regions.
3. Basic physiological adaptations of mammals for aquatic life.
4. Food and predators of aquatic mammals, their roles in trophic webs.
5. Sensory channels used by aquatic mammals; the dominant role of audition and the special biosonar
adaptation in odontocetes.
6. Behavioural strategies of aquatic mammals for foraging, mating, rearing young and avoiding predators.
7. Modes of communication by marine mammals.
8. Major threats to marine mammal populations: direct captures, bycatch, pollution, habitat degradation; the
current problem of excessive tourism pressure in some habitats. 9. Species commonly maintained in captivity; uses of their training potential; physiological, sensory and
cognitive studies of marine mammals.
10. Field techniques of marine mammal research.
curricular.
Os temas do programa da Unidade Curricular, agrupados em 10 tópicos, cobrem todas as áreas essenciais
para um conhecimento geral da diversidade, classificação, distribuição, adaptações e comportamentos dos
mamíferos aquáticos, bem como das ameaças à sobrevivência das populações. Será dado ênfase às
metodologias de investigação que permitem o avanço do conhecimento nesta área, tanto em condições
artificiais (cativeiro), como no meio selvagem.
The syllabus is organized in 10 topics which cover all the essential areas for a general knowledge about the
diversity, classification, distribution, adaptations and behaviour of aquatic mammals, as well as the threats to
the survival of their populations. Emphasis will be given to the research methodologies that may be used to
obtain further knowledge, both in artificial environments (captivity) and in the wild.
Os temas da Unidade Curricular serão apresentados em aulas teóricopráticas de duas horas de duração, com
fortes componentes audiovisual e interactiva. Exercícios de identificação de espécies e de indivíduos serão
realizados a partir de suportes fotográficos e videográficos.
A avaliação será baseada em trabalhos realizados em pequenos grupos, que serão apresentados e discutidos
pela turma e pelo docente
Topics will be presented in twohour lectures, with strong audiovisual and interactive components. Species and
individuals identification exercises will be carried out based on photo and video recordings.
Evaluation will be based on smallgroup projects, to be presented in class for discussion.
curricular.
Uma abordagem teóricoprática, fortemente baseada na apresentação de imagens e sons, e aberta à
participação interactiva dos alunos com o docente, será a mais indicada para a aquisição das competências e
conhecimentos expressos nos objectivos da Unidade Curricular. A formação de pequenos grupos (23 alunos)
para a pesquisa dos recursos bibliográficos e electrónicos disponíveis permitirá a exploração dos temas de
uma forma mais criativa, enriquecedora da sua formação e até de maior interesse para o docente. No entanto,
cada elemento dos grupos estará sujeito a um escrutínio oral durante a apresentação dos trabalhos, que
permitirá uma apreciação da profundidade dos conhecimentos adquiridos acerca da biologia dos mamíferos
marinhos e também a sua partilha por todo o grupo.
outcomes.
An educational approach both theoretical and practical, strongly based on the presentation of images and
sounds, and open to the interactive participation of all students with the lecturer, will be the most suited to the
acquisition by the students of the knowledge and competencies expressed in the Curricular Unit’s objectives.
Small groups of 23 students will research the literature and the electronic resources available in a more
creative way, with more potential interest for the students and even for the lecturer. However, each student will
have to display, during the oral presentation in class, the depth of the knowledge acquired concerning marine
mammal biology, and that knowledge will thus be shared with the whole group.
Boyd, I. L., Bowen, W. D. & Iverson, S. J. (2010). Marine Mammal Ecology and Conservation: A Handbook of
Techniques. Oxford: Oxford University Press.
Evans, P. G. & Raga, J. A. (Eds.) (2001). Marine Mammals: Biology and Conservation. New York: Kluwer
Academic/Plenum Press.
Mann, Janet; Connor, Richard C., Tyack, Peter L., and Whitehead, Hal (Eds.) (2000). Cetacean Societies: Field
Studies of Dolphins and Whales. The University of Chicago Press, Chicago and London.
Perrin, W., Wursig, B. & Thewissen, J. G. M. (Eds.)(2008). Encyclopedia of Marine Mammals, Second Edition.
Amsterdam: Elsevier (Academic Press).
Reynolds, J. E., Wells, R. S. & Eide, S. D. (2001). The Bottlenose Dolphin: Biology and Conservation. University
Press of Florida.
Anexo IV Ética Ambiental
Ética Ambiental
n/a
Avaliação global dos impactos humanos no ambiente. Harmonização da vertente social, económica e ecológica
do desenvolvimento. Relação entre a ética ambiental e desenvolvimento sustentável, no pressuposto de que as
principais questões que se colocam na tomada de decisões passam pela ponderação da valia ética dos
ecossistemas naturais como caminho para compatibilizar os objectivos sociais e económicos actuais com os
interesses e opções das sociedades vindouras.
Adquirir os princípios básicos da ética ambiental. Estruturar o edifício ético que se coloca à sociedade na sua
relação com os ecossistemas naturais. Avaliar o conceito de desenvolvimento sustentável à luz dos princípios
da ética ambiental. Consciencialização do papel individual e colectivo no desenvolvimento das sociedades.
Adquirir competências básicas dos conceitos e princípios subjacentes à economia ecológica. Avaliar os
impactos globais das sociedades humanas no planeta e soluções para a construção de um futuro sustentável
Evaluation of global Human impacts on the environment. Harmonizing social, economic and ecological aspects
of development. Relationships between environmental ethics and sustainable development, assuming that the
main issues in decisionmaking processes have to deal with valuing the natural ecosystems from an ethical
perspective as a way to harmonize social and economic objectives of contemporary societies with the interests
and options of future societies.
To learn the basic principles of environmental ethics. Build the ethical framework that society faces on its
relation with natural ecosystems. To evaluate the concept of sustainable development in light of environmental
ethics principles. Awareness of individual and collective roles in the development of societies. Acquire basic
principles underlining ecological economics. Evaluate global impacts of human societies on the Planet and
solutions for building a sustainable future
1. Conceitos gerais de ética
2. Introdução à ética ambiental
3. As grandes correntes da ética ambiental; 4. Valor da ética ambiental para a sustentabilidade das actividades humanas – economia, tecnologia e valores
ambientais;
5. Desenvolvimento social e valores ambientais, responsabilidade individual e colectiva;
6. O papel da economia ecológica para o desenvolvimento sustentável; 7. O ambiente global (natural e artificial), biodiversidade, e os serviços dos ecossistemas
3.3.5. Syllabus:
1. General Ethical Concepts;
2. Introduction to Environmental Ethics;
3. The Main Approaches to Environmental Ethics; 4. Environmental Ethics Value for the Sustainability of Human Activities – Economy, Technology and
Environmental Values;
5. Social Development and Environmental Values, Individual and Collective Responsibility;
6. The Role of Ecological Economics for Sustainable Development; 7. The Global Environment (Natural and Artificial), Biodiversity and Ecosystem Services
curricular.
Esta Unidade Curricular fornecerá as bases para uma abordagem ética aos problemas ambientais, com
particular destaque para os desafios da gestão e conservação do ambiente marinho. A parte introdutória do
curso iniciase com uma apresentação geral da definição de ética enquanto ramo da filosofia que estuda a
moral, distinguese a moral de moralidades ou códigos de conduta e serão usados exemplos práticos do
desafio da abordagem ética em problemas ambientais. Em seguida, apresentamse as principais correntes da
ética ambiental, as suas forças e fraquezas, enquadramento teórico, e consequências práticas na aplicação de
casos de estudo com incidência marinha. Discutemse depois as implicações das consequências da
degradação ambiental e a forma como a ética ambiental pode contribuir para a sustentabilidade das actividades
humanas, fornecendo uma base conceptual de decisão para alguns dos principais dilemas ambientais. A este
respeito serão abordados os contributos da valorização do ambiente para uma sociedade socialmente mais
justa e ambientalmente sustentável e avaliados os contributos individuais e colectivos na procura de soluções
para os grandes problemas ambientais. Finalmente, na última parte desta Unidade Curricular, será dada uma introdução à Economia Ecológica
enquanto disciplina integradora da economia, ecologia, ética, ciências sociais e naturais e dados exemplos do
tipo de mudanças de fundo que precisam de ocorrer para a teoria económica tradicional abraçar o
desenvolvimento sustentável como o seu paradigma central. Serão dados exemplos de aplicação de
instrumentos associados e esta nova disciplina, como a pegada ecológica, e apresentados alguns dos
indicadores globais da degradação ambiental, dos ecossistemas naturais e da artificialização do planeta. Os
bens e serviços dos ecossistemas é outra área à qual será dado particular destaque como forma de introduzir
na teoria económica vigente formas de valorização ambiental que alterem o equilíbrio de forças no sentido de
uma maior sustentabilidade.
Este programa cumpre os objectivos definidos para esta unidade curricular permitindo aos alunos adquirir os
princípios básicos da ética ambiental, avaliar o conceito de desenvolvimento sustentável à luz dos princípios da
ética ambiental, adquirir uma consciencialização do papel individual e colectivo no desenvolvimento das
sociedades contemporâneas, conhecer os princípios e ferramentas da economia ecológica e avaliar os
impactos globais das sociedades humanas no planeta.
This Curricular Unit will provide the basis for an ethical approach to Environmental problems, with special focus
for the challenges of managing and preserving the marine environment. The introductory part of the program
starts with a general presentation on the definition of ethics as a branch of philosophy that studies the moral, a
distinction between moral and moralities or codes of conduct is provided and practical examples of the
challenge of the ethical approach in environmental problems will be given. Next, the main approaches to
environmental ethics will be presented, their strengths and weaknesses, the theoretical framework and
practical consequences in the application to marinerelated case studies. The implications of the consequences
of environmental degradation will be discussed, as well as the way environmental ethics may contribute to the
sustainability of human activities, providing a conceptual basis for decision for some of the main environmental
dilemmas. In this context, the role of environmental valuation for a fair and environmentally sustainable society
will be tackled and the individual and collective efforts in the search for solutions for the major environmental
problems will be evaluated.
Finally, in the last part of this Curricular Unit, an introduction to Ecological Economics as an integrative
discipline of economy, ecology, ethics, social and natural sciences will be presented and examples of the type of
deep changes that need to be done for the classical economic theory to embrace sustainable development as
its central paradigm. Examples will be given on the application of instruments associated to this discipline, such
as the ecological footprint, and some of the indicators of global environmental degradation, of natural systems
and artificialization of the planet will be presented and discussed. The ecosystem goods and services will also
be given particular attention as a way to insert in the mainstream ecological theory methods of environmental
valuation that may change the force equilibrium to a greater sustainability.
This program fulfills the objectives defined for this curricular unit allowing the students to learn the basic
principles of environmental ethics, evaluate the concept of sustainable development in light of environmental
ethics principles, be aware of the individual and collective roles in the development of contemporary societies,
understand the ecological economics principles and tools and evaluate global impacts of human societies on
the Planet.
As aulas teóricopráticas serão utilizadas para a apresentação teórica das principais problemáticas, discussão
de casos de estudo e apresentação de relatórios pelos alunos. A partir de um caso de estudo aplicado a
organismos marinhos e de bibliografia de base sobre ética ambiental, serão trabalhados nas aulas a análise
aos principais aspectos identificadores da problemática em questão e possíveis soluções para as mesmas. Os
alunos trabalharão em grupo na questão escolhida e apresentarão perante toda a turma as principais
conclusões a que chegaram. O aprofundamento das análises a efectuar será feito em contexto de tutoria.
Com base no ecampus do ISPA em plataforma Moodle serão disponibilizados os materiais de apoio (e.g.
programa, casos de estudo, artigos para discussão, regras de funcionamento, métodos de avaliação, etc.) Será
utilizado um método de avaliação contínuo baseado na apresentação e discussão de trabalhos de análise a
casos de estudo e na participação nas aulas
The theoreticalpractical classes will be used to the theoretical presentation of the main topics, discussion of
case studies and presentation of reports by the students. From a case study applied to marine organisms and of
baseline bibliography on environmental ethics, the analysis of the main aspects which allow the identification of
the questions at hand and possible solutions to the problem will be discussed and analysed in the classroom.
Students will work in groups in the chosen question and will present to all classmates their main conclusions.
The deepening of the analysis to be made and specific contents will be done in tutorial context.
Based on ISPA ecampus in Moodle platform, all materials will be available (e.g. program of the unit, case
studies, papers for discussion, functioning rules, calendar, evaluation methods, etc. A continuous evaluation
method will be used based on the presentations and discussion and analysis of case studies and participation in
classes.
curricular.
Numa Unidade Curricular onde se pretende que os estudantes adquiram os conhecimentos necessários para o
enquadramento das problemáticas abordadas e os apliquem a contextos práticos, as aulas teórico práticas
serão utilizadas para estes fins. Após uma breve introdução a conceitos gerais de ética e à ética ambiental, a
exploração das diferentes correntes da ética ambiental e das suas implicações será feita recorrendo a leituras
de artigos originais que constituam casos de estudo que possam ser discutidos e trabalhados em grupo pelos
alunos. Serão então apresentados a toda a turma e constituirão parte integrante do processo avaliativo. Para
melhor abordar as questões em análise, serão sempre usados exemplos do diaadia em que os alunos
consigam fazer a ponte entre as consequências do comportamento individual e colectivo e a degradação
ambiental e discutir de que forma a solução para os principais problemas ambientais passa pela integração de
uma dimensão ética na teoria económica e práticas comportamentais. Com esta componente fortemente
aplicada, as metodologias de ensino e avaliação através de trabalhos de grupo que analisem casos de estudo
aplicados às principais temáticas do programa, serão as mais eficazes para os objectivos que se definiram
para esta da Unidade Curricular. A introdução de métodos de ensino focados na aprendizagem em grupo
promovem o espírito de equipa e o trabalho colaborativo, contribuindo para diminuir o ambiente competitivo
entre os estudantes e para aumentar a sua autoconfiança.
outcomes.
In a Curricular Unit where is pretended that the students acquire the necessary skills for the framework of the
main problems discuss and apply them to practical contexts, the theoreticalpractical classes will be used with
that purpose. After a brief introduction to general concepts in ethics and environmental ethics, the different
approaches in environmental ethics and their implications will be explored using original articles which may be
used as case studies to be read and discussed by the students in groups. They will them be presented to all
class and will be an integral part of the evaluation process. To better approach the questions under analysis,
daytoday examples in which students are able to relate the consequences of individual and collective
behaviour and environmental degradation will be used, as well as ways to solve the present issues by
integrating an ethical dimension in the economic theory and behavioural frameworks. With this strongly applied
component, teaching methodologies and evaluation through group work to analyse case studies applied to the
main themes of the program, will be the most effective to fulfill the objective foreseen for the Curricular Unit. The introduction of teaching methods focused on cooperative learning will promote team work and the students'
ability to work effectively in a group setting, contributing to reduce the competitive environment among students
and increase their selfconfidence.
Louis P. Pojman (2004). Environmental Ethics: Readings in Theory and Application. 4th edition. Thomson
Learning
Susan J Armstrong & Richard G Botzler (2003). Environmental Ethics: Divergence and Convergence. 3rd
edition. McGraw Hill
Richard L. Knight & Suzanne Riedel (2002). Aldo Leopold and the ecological conscience. Oxford University
Press Costanza, R.; Cumberland, J.; Daly, H.; Goodland, R. & Norgaard, R.B. (eds.) (1997). An Introduction to Ecological
Economics. St. Lucie Press, Boca Raton, FL
Fiedler, P.L. & Jain, S.K. (eds.) (1992). Conservation Biology. Chapman & Hall James Rachels (2004). Elementos de Filosofia Moral. Gradiva, Lisboa.
Varner, G. (1998). In Nature’s Interests? Interests, Animal Rights and Environmental Ethics. Oxford University
Press
Aldo Leopold (2007). Pensar como uma Montanha. Editora Sempre em Pé
Anexo IV Biologia e Ecologia de Peixes
Biologia e Ecologia de Peixes
Esta Unidade Curricular tem como objectivo apresentar a Biologia e Ecologia de Peixes como área
multidisciplinar onde se cruzam aspectos taxonómicos, ecológicos, biológicos, de conservação e gestão,
comportamentais e fisiológicos. Pretendese demonstrar a importância dos peixes nos ecossistemas marinhos
como elementos estruturantes dos mesmos, as suas principais adaptações aos diferentes tipos de habitats
onde ocorrem, o papel funcional que desempenham nesses ecossistemas, a sua história evolutiva e
ontogenética e os desafios actuais da conservação destas comunidades e espécies.
Tem como objectivo fornecer aos alunos uma base conceptual para:
compreender o papel dos peixes nos ecossistemas marinhos e os desafios da sua conservação
debater as principais teorias sobre a ecologia dos peixes, o modo de estruturação das comunidades e os
mecanismos de recrutamento larvar
compreender os mecanismos ecológicos e evolutivos das comunidades de peixes nos ecossistemas do
planeta
The goal of this curricular unit is to introduce Fish Biology and Ecology as a multidisciplinary area where
taxonomy, ecology, biology, conservation and management, behaviour and physiology meet. It is our aim also to
demonstrate the importance of fish as structural elements of marine ecosystems, their main adaptations to the
different types of habitats where they occur, the functional role they have in those ecosystems, their
evolutionary and ontogenetic history and the current challenges of conservation of those species and
communities.
It aims at provide the students a conceptual basis to:
understand the role of fish in marine ecosystems and the challenges of their conservation
discuss the main theories on fish ecology, the way communities are structured and the mechanisms of larval
recruitment
understand the ecological and evolutionary mechanisms of fish communities on the main ecosystems of the
planet
1. A diversidade dos peixes
O que é um peixe?
2. Estrutura e função
Anatomia externa e formas do corpo, estruturas esqueléticas, principais sistemas, metabolismo e energia,
morfologia funcional 3. Padrões de história vital
Ciclos de vida,ontogenia e desenvolvimento, estados larvares, idade e crescimento 4. Ecologia dos peixes
Habitats, adaptações morfológicas, fisiológicas e comportamentais, predadores e presas, padrões e
mecanismos de reprodução
5. Comportamento dos peixes
Corte, desova e cuidados parentais, estratégias e tácticas alternativas de reprodução, comunicação, agressão
e agregações, relações interespecíficas, padrões temporais, migrações
6. Comunidades, ecossistemas e o papel funcional dos peixes
Interacções ao nível da comunidade, posições tróficas, papel nos ecossistemas, influência de factores físicos
7. Desafios da conservação de peixes
Extinções e perda de biodiversidade, ecossistemas perturbados, principais impactos, estratégias de
conservação
3.3.5. Syllabus:
1. Fish diversity
What is a fish?
2. Structure and function
External anatomy and body shapes, skeleton, main systems, metabolism and energy, functional morphology
3. Life history patterns
Life cycles, ontogeny and development, larval stages, age and growth
4. Fish ecology
Main habitats, morphological and behavioural adaptations, predators and prey, breeding patterns and
mechanisms
5. Fish behaviour
Courtship, spawning and parental care, alternative reproductive strategies and tactics, communication,
aggression and aggregations, interspecific relationships, temporal patterns, migrations
6. Communities, ecosystems and the functional role of fish
Interactions at the community level, trophic positions, role in ecosystems, influence of physical factors
7. Fish conservation challenges
Extinctions and biodiversity loss, dysfunctions in disturbed ecosystems, main impacts, conservation strategies
curricular.
Esta Unidade Curricular fornecerá as bases para a compreensão da Biologia e Comportamento dos Peixes e do
seu papel nos ecossistemas marinhos. Começa por se abordar a diversidade dos peixes enquanto grupo
fileticamente diverso, colocando numa perspectiva evolutiva a diversidade dos grupos de peixes actuais. Em
seguida falase dos aspectos da forma dos peixes e função das suas principais estruturas morfológicas e
fisiológicas. Depois apresentase a diversidade de padrões de história vital que é possível observar nestes
organismos, em concreto, os diferentes tipos de ciclos de vida e sua adaptação ao meio marinho, os padrões
de ontogenia e desenvolvimento dos estados larvares e de que forma os mesmos influenciam a dinâmica
populacional das espécies de peixes e, finalmente, os padrões de idade e crescimento referindose aos
padrões ontogenéticos e evolutivos do crescimento. No módulo seguinte, são abordadas questões da ecologia
dos peixes nomeadamente os principais habitats onde ocorrem e respectivas adaptações morfológicas,
fisiológicas e comportamentais, os peixes como predadores e presas nos ecossistemas marinhos e os
padrões e mecanismos de reprodução dando nota da enorme diversidade de estratégias existentes. O tópico
seguinte é centrado na diversidade dos comportamento dos peixes, nomeadamente de corte, desova e
cuidados parentais (mostrando os diferentes caminhos evolutivos, convergências e divergências
filogenéticas), as estratégias e tácticas alternativas de reprodução, e serão ainda abordados mecanismos de
comunicação, agressão e agregações em peixes, os diferentes tipos de relações interespecíficas, os padrões
de comportamento temporais e, finalmente, as estratégias de migração nos peixes. O sexto tópico é centrado
nas comunidades, ecossistemas e no papel funcional dos peixes apresentandose os diferentes tipos de
interacção a nível das comunidades, as posições tróficas e os efeitos dos peixes na distribuição e abundância
de outros organismos, o seu papel nos ecossistemas enquanto elementos estruturantes dos mesmos e, por
fim, a influência de factores físicos como a perturbação nessas comunidades. O último módulo apresenta e
discute os desafios da conservação dos peixes falando das extinções e perda da biodiversidade a que os
ecossistemas marinhos estão actualmente sujeitos, as disfunções observáveis em ecossistemas perturbados
e as suas consequências e dos impactos das actividades humanas a nível específico, genético e de
ecossistemas. Terminase com a discussão das principais estratégias de conservação que permitem
responder às actuais pressões e impactos, bem como ao tipo de respostas esperadas nas comunidades de
peixes em diferentes sistemas.
Este programa cumpre os objectivos definidos para esta unidade curricular permitindo aos alunos conhecer a
biologia e ecologia dos peixes como área multidisciplinar onde se cruzam aspectos taxonómicos, ecológicos,
biológicos, de conservação e gestão, comportamentais e fisiológicos.
The syllabus of this course will provide the basis for the understanding of Fish Biology and Ecology and the role
of fish in marine ecosystems. It starts by approaching fish diversity as a phyletically diverse group, putting in an
evolutionary perspective the current diversity of fish groups. Next, aspects of fish form and function of the
major morphological and physiological features are discussed. Then, the diversity of lifehistory patterns is
presented, namely the different types of life cycles and their adaptations to the marine environment, ontogenetic
and developmental patterns of larval stages and the ways they influence population dynamics of fish species
and, finally, growth and age patterns referring to the ontogenetic and evolutionary growth patterns. In the next
module, topics in fish ecology will be discussed, namely the main habitats where fish occur and their particular
morphological, physiological and behavioural adaptations, fish as predators and prey in marine ecosystems and
their breeding patterns and mechanisms, noting the huge diversity of existing strategies. Next topic is centred in
the diversity of fish behavior, namely, courtship, spawning and parental care (showing the different evolutionary
pathways, and phyletic convergences and divergences), the breeding strategies and tactics, and also
mechanisms of communication, aggression and aggregation in fish, the different types of interspecific
relationships, temporal behavioural patterns and, finally, migration strategies in fish. The sixth topic in centred in
the communities, ecosystems and fish functional role presenting the different types of interaction at the
community level, the trophic positions and the effects of fish in the distribution and abundance of other
organisms, their role in ecosystems as structuring elements an, finally, the influence of physical factors such as
disturbance in those communities.
The last module presents and discusses the conservation challenges applied to fishes namely extinction risks,
loss of biodiversity currently under way in marine ecosystems, the consequences of the dysfunctions of
disturbed ecosystems and the impacts on human activities at the specific, genetic and ecosystem levels. It will
end with a discussion of the main conservation strategies that allow to tackle the current pressures and
impacts, as well as with the type of responses of fish communities in different systems.
This syllabus fulfills the objectives foreseen for this curricular unit allowing the students to understand the fish
biology and ecology as a multidisciplinary area where taxonomy, ecology, biology, conservation and
management, behaviour and physiology meet.
Esta unidade curricular está estruturada em aulas teóricas e práticas laboratoriais. Para cada tópico do
programa, existem os seguintes instrumentos de aprendizagem:
1. uma lista de referências bibliográficas recomendadas que os alunos devem ler antecipadamente
2. uma exposição oral pelo docente dos conceitos básicos e das abordagens para esse tópico
3. um “journal club” no qual os alunos apresentam e discutem artigos de investigação sobre os diferentes
tópicos
4. práticas laboratoriais onde serão observados diferentes grupos de peixes e a respectiva diversidade,
anatomia e comportamento
5. tutorias nas quais o docente orienta os alunos na preparação para o “journal club”.
Com base no ecampus do ISPA serão disponibilizados os diversos materiais de apoio (artigos, programa,
meios audiovisuais de apoio às aulas, métodos de avaliação, etc.). A avaliação terá uma componente teórica e
uma avaliação contínua baseada na apresentação e discussão de trabalhos.
This curricular unit is structured in theoretical and practical laboratory classes. For each topic of the syllabus
the following learning tools will be used:
2. an oral presentation by the teacher introducing the basic concepts and approaches for each topic;
3. a "journal club" in which students present and discuss research papers related to the themes of the syllabus.
4. laboratory classes where the different fish groups, their diversity, anatomy and behaviour will be observed
5. tutorials in which the teacher guide students in preparing the "journal club".
Based on ISPA ecampus, all materials will be available (e.g. program of the unit, case studies, papers for
discussion, evaluation methods, etc. The evaluation will have a theoretical component and a continuous
evaluation based on the presentation and discussion of essays
curricular.
Nesta Unidade Curricular pretendese que os estudantes adquiram uma sólida base teórica sobre a Biologia e
Ecologia de Peixes bem como adquiram os conhecimentos práticos sobre a diversidade, anatomia,
comportamento e conservação de peixes. Para isso, serão expostos em contexto de aula teóricoprática os
principais conceitos associados aos diferentes tópicos do programa onde serão igualmente apresentados e
discutidos trabalhos pelos alunos em grupos, baseados em informação científica recorrendo a fontes
primárias. Nas aulas práticas de laboratório serão mostrados exemplos da diversidade, anatomia e
comportamento de peixes recorrendo a exemplares de diferentes grupos taxonómicos, vídeos e outro material
audiovisual e aquários, estando prevista a visita a lotas, aquários e oceanários para demonstração de questões
relacionadas com a diversidade dos grupos de peixes e as problemáticas da sua conservação.
Estas componentes de uma sólida formação teórica e de uma componente prática e aplicada permitirá cumprir
da melhor forma os objectivos que se definiram para esta Unidade Curricular. Em concreto, apresentar a
Biologia e Ecologia de Peixes como área multidisciplinar onde se cruzam aspectos taxonómicos, ecológicos,
biológicos, de conservação e gestão, comportamentais e fisiológicos. Pretendese demonstrar a importância
dos peixes nos ecossistemas marinhos como elementos estruturantes dos mesmos, as suas principais
adaptações aos diferentes tipos de habitats onde ocorrem, o papel funcional que desempenham nesses
ecossistemas, a sua história evolutiva e ontogenética e os desafios actuais da conservação destas
comunidades e espécies.
A introdução de métodos de ensino focados na aprendizagem em grupo pretendem promover um estilo de
aprendizagem activo nos alunos, através da introdução de momentos de discussão da matéria nas aulas, e
responsabilizando os alunos pela pesquisa de determinados temas sobre os quais devem informar a turma e
entre os estudantes e para aumentar a sua autoconfiança. É também valorizada a leitura de fontes primárias
como meio dos estudantes entenderem a dinâmica da propagação de informação científica e de promover uma
atitude proactiva na busca de informação e formação de uma opinião esclarecida sobre um tema.
outcomes.
In this Curricular Unit it is intended that the students will acquire a solid theoretical basis on Fish Biology and
Ecology as well as promote the practical approaches to the diversity, anatomy, behavior and conservation of
fish. For that purpose, the main concepts associated to the different topics of the program will be present in
theoreticalpractical classes where students will present and discuss in work groups specific topics based on
scientific information collected from primary sources. In the laboratory practical classes examples of fish
diversity, anatomy and behaviour will be shown through animals collected in fish markets belonging from
different taxonomic groups, videos and other audiovisual materials, as well as aquaria, and it is foreseen the
visit to fish markets, aquariums and oceanarium to demonstrate questions related with the diversity of fish
groups and the problems of their conservation. These components of a solid theoretical framework and a
practical and applied component will be the most effective to fulfill the objectives foreseen for this curricular
unit. Namely, to introduce Fish Biology and Ecology as a multidisciplinary area where taxonomy, ecology,
biology, conservation and management, behaviour and physiology meet. It is our aim also to demonstrate the
importance of fish as structural elements of marine ecosystems, their main adaptations to the different types of
habitats where they occur, the functional role they have in those ecosystems, their evolutionary and ontogenetic
history and the current challenges of conservation of those species and communities.
The introduction of teaching methods based on group learning allow to promote an active learning style in
students by introducing moments of discussion in class, promoting the research on specific issues on which
students should inform the class and promote the students' ability to work effectively in a group setting,
contributing to reduce the competitive environment among students and increase their selfconfidence. It will
also be valued the reading of primary sources as a means for students to understand the dynamics of the
spread of scientific information and to promote a proactive approach in searching for information and formation
of an informed opinion on a given topic. 3.3.9. Bibliografia principal:
Bone, Q. & Moore, R. 2008. Biology of Fishes. Third Edition. Taylor & Francis Group, New York.
Helfman, G.S., Collete, B.B., Facey, D.E. & Bowen, B.W. 2009. The diversity of fishes: biology, evolution, and
ecology. Third Edition. WileyBlackwell, Oxford, UK.
Long, J. 2010. The Rise of Fishes: 500 Million Years of Evolution. Second Edition. Johns Hopkins University
Press, Baltimore.
Moyle, P.B. & Cech, J.J. 2004. Fishes: An Introduction to Ichthyology. Fifth Edition. Benjamin Cummings.
Nelson, J.S. 2006. Fishes of the World. Fourth Edition. John Wiley & Sons, Inc. New Jersey.
Sale, P.F. 2002. Coral Reef Fishes: Dynamics and Diversity in a Complex Ecosystem. Academic Press,
Amsterdam
Artigos de revisão e artigos originais de revistas científicas da especialidade
Anexo IV Ecologia Marinha
Ecologia Marinha
Esta é uma das Unidades Curriculares centrais e tem como objectivo dar aos estudantes uma sólida formação
em ecologia marinha, estruturante para as restantes temáticas do curso. Pretendese apresentar os principais
pilares da ecologia marinha moderna, discutir de forma crítica as teorias explicativas dos padrões e processos
observados no meio marinho e relacionar os padrões de distribuição, história vital, evolutivos e ecológicos com
os desafios da conservação e gestão destes ecossistemas.
Serão utilizados exemplos que ilustrem os pontos em questão e visões alternativas dos processos explicativos
e será consolidada a noção do ecossistema marinho como um todo funcional.
Tem como objectivo fornecer aos alunos uma base conceptual para:
1compreender os tipos de sistemas e processos no meio marinho
2debater as principais teorias sobre a ecologia marinha e as suas consequências práticas
3compreender mecanismos ecológicos e evolutivos das comunidades marinhas nos principais ecossistemas
This is one of the core curricular units of this study cycle and its main objectives are to give students a solid
basis in marine ecology, structuring for the other themes of the course. The main pillars of modern marine
ecology are presented, the theories explaining patterns and processes in the marine environment will be
discussed and the patterns of distribution, life history, evolutionary and ecological will be related to the
challenges of conservation and management of these ecosystems.
Examples to illustrate the points in questions will be used and alternative vision of explanatory processes will be
discussed in order to consolidate the view of the marine ecosystem as a functional whole.
It aims at provide the students a conceptual basis to:
understand the systems and processes in the marine environment
discuss the main theories of marine ecology and their consequences
understand the ecological and evolutionary mechanisms of marine communities on the main ecosystems
1. Princípios de oceanografia e ecologia marinha
1.1. Aspectos históricos
1.2. O ambiente oceânico
1.3. Princípios ecológicos e evolutivos
2. Processos, padrões e sistemas no ambiente marinho
2.1. Comunidades planctónicas, nectónicas e bentónicas
2.2. Produção primária, produção microbiana e decomposição
2.3. Larvas e ecologia larvar
3. Sistemas ecológicos 3.1. Ecologia estuarina e ambientes costeiros
3.2. Ecologia intertidal
3.3. Meiofauna e sua importância
3.3. Sistemas pelágicos e fundos marinhos
3.4. Ecologia do mar aberto e do mar profundo
3.5. Comparação de ecossistemas marinhos e terrestres
4. O ecossistema marinho como um todo funcional
3.3.5. Syllabus:
1. Principles of oceanography and marine ecology
1.1. Historical aspects
1.2. The oceanic environment
1.3. Ecological and evolutionary principles
2. Processes, patterns and systems in the marine environment
2.1. Planktonic, nektonic and benthic communities
2.2. Primary production, microbial production and decomposition
2.3. Larvae and larval ecology
3. Ecological systems
3.1. Estuarine and coastal ecology
3.2. Intertidal ecology
3.3. Meiofauna and its importance
3.3. Pelagic systems and seabed environments
3.4. Open ocean and deep sea ecology
3.5. Comparison of marine and terrestrial ecosystems
4. The marine ecosystem as a functional whole
curricular.
Esta Unidade Curricular fornecerá as bases para a compreensão da Biologia Marinha como área estruturante
deste ciclo de estudos. Serão primeiro abordados princípios gerais de oceanografia e ecologia marinha, dando
nota de aspectos históricos que condicionaram a actual distribuição de organismos e ecossistemas, os
métodos de estudo do ambiente marinho, os domínios do ambiente oceânico (em coordenação com a unidade
curricular Biodiversidade, Biologia Populacional e Biogeografia Marinha), e as principais abordagens ecológica
e evolutivas à compreensão do funcionamento dos ecossistemas marinhos. No segundo módulo, apresentam
se os processos, padrões e sistemas no ambiente marinho, com ênfase nos mecanismos que condicionam a
distribuição das espécies e a constituição dos principais sistemas oceânicos e costeiros: das comunidades
planctónicas ao nécton e bentos marinho, os mecanismos de produção primária, microbiana e de
decomposição e os ciclos biogeoquímicos subjacentes, e, finalmente, a biologia e ecologia larvar cujas
particularidades condicionam a forma como os organismos marinhos evoluíram diferentes estratégias de
história vital. O terceiro módulo é dedicado aos sistemas ecológicos marinhos com uma descrição detalhada
dos principais processos que condicionam cada um deles: dos estuários aos recifies de coral, recifes
rochosos, mangais e sapais e pradarias marinhas; ao intertidal rochoso e arenoso e respectivas adaptações
anatómicas, fisiológica e comportamentais dos organismos que aí vivem; passando pela meiofauna e sua
importância na transferência de energia nos sistemas costeiros. Serão ainda apresentados os sistemas
pelágicos e as comunidades dos fundos marinhos, bem como a ecologia do mar aberto e do mar profundo com
destaque para as particularidades que as caracterizam. Este tópico termina com uma comparação entre os
ecossistemas marinhos e terrestres e consequências para a teoria ecológica do modo como os organismos
marinhos estruturam as suas comunidades e se dispersam no oceano. Finalmente o quarto módulo apresenta
uma integração da informação apresentada, dandose nota da importância de considerar o ecossistema
marinho como um todo funcional e as suas implicações para as estratégias de conservação.
Este programa cumpre os objectivos definidos para esta unidade curricular permitindo aos alunos conhecer os
principais processos, padrões e sistemas do ambiente marinho.
The syllabus of this curricular unit will provide the basis for the understanding of Marine Biology as a core area
of this study cycle. It will start by approaching general principles of oceanography and marine ecology, noting
the historical aspects that influenced the current distribution of organisms and ecosystems, the methods to
study the marine environment, the marine domains (in coordination with the curricular unit Biodiversity,
Population Biology and Marine Biogeography) and the main ecological and evolutionary approaches to
understand how marine ecosystems work.
In the second module, the processes, patterns and systems of the marine environment are presented, with
emphasis on the mechanisms that influence species distribution and the structuring of the ain oceanic and
coastal systems: from the plankton to the nekton and benthos, the mechanisms of primary and microbial
production and of decomposition and the underlying biogeochemical cycles, and, finally, the larval ecology and
biology and the way they influence how marine organisms have evolved different life history strategies. The
third module is dedicated to marine ecological systems with a detailed description of the main processes which
prevail in each: from estuaries to coral and rocky reefs, mangroves, saltmarshes and seagrass beds; to the
rocky and sandy intertidal and respective anatomical, physiological and behavioural adaptations of organisms
that live there; to the meiofauna and its importance in energy transfer in coastal systems. Pelagic systems and
seabed communities will also be presented, as well as the ecology of the open ocean and deep sea with
particular emphasis for their peculiarities. This topic ends with a comparison between marine and terrestrial
systems and its consequence to the ecological theory and the way marine organisms structure their respective
communities and disperse in the ocean. Finally, the fourth module integrates all previous information and will
highlight the importance of considering the marine ecosystem as a functional whole and the implications of this
concept to conservation strategies.
This syllabus fulfills the objectives foreseen for this curricular unit allowing the students to understand the main
processes, patterns and systems in the marine environment.
Esta unidade curricular está estruturada em aulas teóricas e trabalho de campo. Para cada tópico do programa,
existem os seguintes instrumentos de aprendizagem:
1. uma lista de referências bibliográficas recomendadas que os alunos devem ler antecipadamente
3. uma apresentação e discussão em grupo de tópicos a seleccionar
4. trabalho de campo que consistirá em saídas para o intertidal rochoso e arenoso/vasoso onde serão
observados diferentes grupos taxonómicos e avaliados os seus padrões de distribuição
5. tutorias nas quais o docente orienta os alunos na preparação para o trabalho de campo e relatórios.
This curricular unit is structured in theoretical classes and field work. For each topic of the syllabus the following
learning tools will be used:
2. an oral presentation by the teacher introducing the basic concepts and approaches for each topic;
3. a presentation and discussion in groups of topics to be chosen
4. field work consisting of visits to the rocky and sand/muddy intertidal where different taxonomic groups will be
observed and their distribution patterns will be studied
5. tutorials in which the teacher guide students in preparing the field work and reports.
curricular.
Nesta Unidade Curricular pretendese que os estudantes adquiram uma sólida base teórica sobre a Ecologia
Marinha bem como adquiram os conhecimentos práticos sobre os padrões de distribuição e zonamento de
organismos marinhos e as suas adaptações. Para isso, serão expostos em contexto de aula teórica os
principais conceitos associados aos diferentes tópicos do programa onde serão igualmente apresentados e
discutidos trabalhos pelos alunos em grupos, baseados em informação científica recorrendo a fontes
primárias. Nas saídas de campo serão mostrados exemplos da diversidade de diferentes grupos taxonómicos
em alguns ambientes costeiros e das respectivas adaptações, serão ainda usados vídeos e outro material
audiovisual pra reforçar aspectos centrais da matéria, estando prevista a visita uma costa rochosa, uma praia
e um estuário para demonstração de questões relacionadas com a diversidade dos grupos marinhos e as
problemáticas da sua conservação.
Esta sólida formação teórica em conjunto com uma componente prática e aplicada permitirá cumprir da melhor
forma os objectivos que se definiram para esta Unidade Curricular. Em concreto, apresentar os principais
pilares da ecologia marinha moderna, discutir de forma crítica as teorias explicativas dos padrões e processos
observados no meio marinho e relacionar os padrões de distribuição, história vital, evolutivos e ecológicos com
os desafios da conservação e gestão destes ecossistemas.
entre os estudantes e para aumentar a sua autoconfiança. As saídas de campo reforçam esta componente
bem como valorizam a experiência prática dos conceitos, padrões e processos abordados em contexto de sala
de aula. É também valorizada a leitura de fontes primárias como meio dos estudantes entenderem a dinâmica
da propagação de informação científica e de promover uma atitude proactiva na busca de informação e
formação de uma opinião esclarecida sobre um tema.
outcomes.
In this Curricular Unit it is intended that the students will acquire a solid theoretical basis on Marine Ecology as
well as promote the practical approaches to the distribution patterns and zoning of marine organisms and their
adaptations. For that purpose, the main concepts associated to the different topics of the program will be
present in theoreticalpractical classes where students will present and discuss in work groups specific topics
based on scientific information collected from primary sources. In the field work, examples of diversity of
different taxonomic groups in some coastal environments and their respective adaptations will be shown, and
videos and other audiovisual materials will also be used to reinforce central aspects of the topics, being
foreseen a visit to a rocky coast, a beach and an estuary to demonstrate issues related to the diversity of
marine groups and the problems of their conservation.
This solid theoretical framework and a practical and applied component will be the most effective to fulfill the
objectives foreseen for this curricular unit. Namely, present the main pillars of modern marine ecology, the
theories explaining patterns and processes in the marine environment and the patterns of distribution, life
history, evolutionary and ecological which will be related to the challenges of conservation and management of
these ecosystems.
contributing to reduce the competitive environment among students and increase their selfconfidence. Field
studies reinforce this component as well as value the practical experience of concepts, patterns and processes
presented in classroom context. It will also be valued the reading of primary sources as a means for students to
searching for information and formation of an informed opinion on a given topic. 3.3.9. Bibliografia principal:
Barnes, R.S.K. & Hughes, R.N. 1999. An Introduction to Marine Ecology. Third Edition. Blackwell, Oxford, Uk.
Levinton, J.S. 2001. Marine Biology: Function, Biodiversity, Ecology. Second Edition. Oxford University Press,
Oxford, UK.
Kaiser, M.J., Attrill, M.J., Jennings, S., Thomas, D.N., Barnes, D.K.A., Brierley, A.S. Polunin, N.V.C., Raffaelli, D.G.
& Williams, P.J.Ie B. 2005. Marine Ecology: Processes, Systems and Impacts. Oxford University Press, Oxford,
UK.
Nybakken, J. W. (2001). Marine Biology. An Ecological Approach, 5th Ed. San Francisco: Benjamin Cummings.
Roff, J. & Zacharias, M. (2011). Marine Conservation Ecology. London: Earthscan.
Anexo IV Governação do Oceano e Áreas Marinhas Protegidas
Governação do Oceano e Áreas Marinhas Protegidas
Esta é uma das Unidades Curriculares centrais e tem como objectivo dar aos estudantes uma sólida formação
em gestão e conservação dos oceanos. Pretendese apresentar os principais desafios da governação dos
oceanos e o papel que as áreas marinhas protegidas (AMPs) podem desempenhar numa mais eficaz e
duradoura protecção dos ecossistemas marinhos. São apresentados casos de estudo e mecanismos para
avaliar a eficácia das AMPs e estes mecanismos de gestão e conservação são enquadrados na temática mais
global da conservação dos oceanos fazendo referência ao quadro legal actual e suas implicações. Tem como objectivo fornecer aos alunos uma base para:
compreender os desafios da conservação marinha
debater os efeitos dos principais mecanismos de conservação e gestão e as sua consequências práticas
compreender o papel das AMPs na governação dos oceanos
This is one of the core curricular units and its main objectives are to give students a solid basis in conservation
and management of the oceans. The main challenges of ocean governance will be presented and the role marine
protected areas (MPAs) may have in a sustainable and lasting protection of the marine ecosystems. Case
studies will be presented to evaluate the efficacy of MAPs and these mechanisms of conservation and
management are seem in the global framework of ocean conservation referring to the current legal framework
and its consequences.
It aims at provide the students a basis to:
understand the challenges of marine conservation
discuss the effects of the main mechanisms of conservation and management and its practical consequences
understand the role of MPAs in ocean governance
1 Desafios da conservação marinha a nível global, regional e local
1.1 Breve história da gestão e conservação dos oceanos
1.2 Principiais instrumentos prós e contras
2 O que são áreas marinhas protegidas (AMPs)?
2.1 Tipos e definições de AMPs
3 Porque razão são as AMPs necessárias?
3.1 Ameaças aos ecossistemas marinhos e suas consequências
3.2 Pressões e impactos de actividades humanas
3.3 A ecologia dos ecossistemas marinhos e implicações para a conservação
4 Selecção de AMPs
4.1 Princípios e critérios de selecção de AMPs
4.2 Planos de gestão
4.3 Casos de estudo
4.4 Redes de AMPs
6 Quadro legal e suas implicações
6.1 Enquadramento legal a nível nacional, regional e global 6.2 Zonas de responsabilidade dos estados
6.3 O alto mar e a comunidade internacional
7 Formas de monitorização e objectivos de longotermo
8 Planeamento espacial marinho e papel das AMPs
9 Educação ambiental e dimensão ética no uso dos oceanos
10 Caminhos futuros para a conservação do oceano
3.3.5. Syllabus:
1 Challenges of marine conservation at the global, regional and local level
1.1 Brief history of ocean management and conservation
1.2 Main instruments pros and cons
2 What are marine protected areas (MPAs)?
2.1 Types and definitions of MPAs
3 Why do we need marine protected areas?
3.1 Threats to marine ecosystems and their consequences
3.2 Pressures and impacts of human activities
3.3 Ecology of marine ecosystems and implications for conservation
4 Selection of MPAs 4.1 Guiding principles and criteria for the selection of MPAs
4.2 Management plans
4.3 Case studies 4.4 Networks of MPAs
6 Legal framework and its implication
6.1 Legal framework at national, regional and global level 6.2 State responsibility areas
6.3 The high seas and the international community
7 Monitoring procedures and longterm objectives
8 Marine spatial planning and the role of MPAs
9 Marine education and ethical issues in the use of the ocean
10 Future prospects for ocean conservation
curricular.
Esta Unidade Curricular fornecerá as bases para a compreensão da Gestão e Conservação do Oceano e, em
particular, o papel das Áreas Marinhas Protegidas (AMPs). Serão abordados os desafios da conservação
marinha a nível global, regional e local, apresentando uma breve história sobre a gestão e conservação dos
oceanos. Os principiais instrumentos de gestão serão apresentados e os prós e contras da sua utilização serão
discutidos. De seguida clarificase o que se entende por áreas marinhas protegidas (AMPs), referindose aos
tipos e definições de AMPs. Enquadrase a sua utilização devido às actuais ameaças aos ecossistemas
marinhos e suas consequências bem como às principais pressões e impactos de actividades humanas.
Apresentase os princípios e critérios para a selecção de AMPs, os diferentes tipos de planos de gestão e
alguns casos de estudo exemplificando sucessos e falhanços na sua implementação. Dáse igualmente
destaque ao desafio da implementação de redes de AMPs e da sua importância para a eficaz gestão dos
ecossistemas marinhos. No módulo seguinte, é dada nota do quadro legal existente e suas implicações a nível
nacional, regional e global. Falase das zonas de responsabilidade dos estados no oceano, da problemática do
alto mar e do papel da comunidade internacional. São se seguida referidos os principais mecanismos de
monitorização e objectivos de longotermo e ainda dos processos de planeamento espacial marinho e o papel
das AMPs nos mesmos. Finalmente, referese a importância da educação ambiental e da dimensão ética do uso
dos oceanos como enquadradoras dos caminhos futuros para a conservação do oceano e o desenvolvimento
sustentável.
Este programa cumpre os objectivos definidos para esta unidade curricular permitindo aos alunos conhecer os
principais desafios da conservação marinha.
The syllabus of this curricular unit will provide the basis for understanding the challenges of Ocean Management
and Conservation and, in particular, the role of Marine Protected Areas (MPAs). The challenges of marine
conservation at the global, regional and local level will be discussed presenting a brief history of ocean
management and conservation. The main management instruments will be presented and pros and cons of their
use will be discussed. Next, the question what are marine protected areas (MPAs) is approached, referring to
the types and definitions of MPAs. Their use is related to the threats to marine ecosystems and their
consequences as well as the pressures and impacts of human activities. The principles and criteria for
selecting MPAs are presented, as well as different types of management plans and some case studies
illustrating successes and failures in their implementation. Particular attention will be given to the challenge of
implementing networks of MPAs and their importance to the successful management of marine ecosystems. In
the next module, the existing legal framework and its implication at the national, regional and global level will be
presented. The state responsibility areas and the problem of the management of the high seas and the
international community role are discussed. The main monitoring procedures and longterm objectives are
refereed next as well as the marine spatial planning processes and the role of MPAs on those. Finally, the
importance of marine education and ethical issues in the use of the ocean as central aspects of future
prospects for ocean conservation are referred.
This syllabus fulfills the objectives foreseen for this curricular unit allowing the students to understand the main
challenges of marine governance and conservation.
Esta unidade curricular está estruturada em aulas teóricas e aulas teóricopráticas. Para cada tópico do
programa, existem os seguintes instrumentos de aprendizagem:
1. lista de referências bibliográficas recomendadas que os alunos devem ler antecipadamente
3. uma apresentação e discussão em grupo de tópicos a seleccionar e com a definição de um plano de
ordenamento de uma AMP a ser feita nas aulas teóricopráticas
4. uma visita de estudo a uma área marinha protegida onde serão constatados os principais desafios de
conservação
5. tutorias nas quais o docente orienta os alunos na preparação para os relatórios.
This curricular unit is structured in theoretical and theoreticalpractical classes. For each topic of the syllabus
the following learning tools will be used:
1. a list of recommended references that students should read in advance
2. an oral presentation by the teacher introducing the basic concepts and approaches for each topic
3. a presentation and discussion in groups of topics to be chosen and the elaboration of a management plan for
a MAPS to be done at the theoreticalpractical classes
4. a field visit to a marine protected area where the main challenges of marine conservation will be presented to
the students
5. tutorials in which the teacher guide students in preparing the reports.
curricular.
Nesta Unidade Curricular pretendese que os estudantes adquiram uma sólida base teórica e aplicada sobre os
desafios da gestão e conservação marinha. Para isso, serão expostos em contexto de aula teórica os
principais conceitos associados aos diferentes tópicos do programa. Nas aulas teóricopráticas serão
apresentados e discutidos trabalhos pelos alunos em grupos, baseados em informação científica recorrendo a
fontes primárias. Na saída de campo os alunos constatarão no local alguns dos principais desafios da gestão
de áreas marinhas protegidas, e serão ainda usados vídeos e outro material audiovisual para reforçar aspectos
centrais da matéria.
Esta sólida formação teórica em conjunto com uma componente prática e aplicada permitirá cumprir da melhor
forma os objectivos que se definiram para esta Unidade Curricular. Em concreto, apresentar os principais
desafios da governação dos oceanos e o papel que as áreas marinhas protegidas (AMPs) podem desempenhar
numa mais eficaz e duradoura protecção dos ecossistemas marinhos através, nomeadamente, da
apresentação de casos de estudo e mecanismos para avaliar a eficácia das AMPs enquadrando esses
mecanismos de gestão e conservação na temática mais global da conservação dos oceanos fazendo
referência ao quadro legal actual e suas implicações.
entre os estudantes e para aumentar a sua autoconfiança. As saídas de campo reforçam esta componente
bem como valorizam a experiência prática dos conceitos, padrões e processos abordados em contexto de sala
de aula. É também valorizada a leitura de fontes primárias como meio dos estudantes entenderem a dinâmica
da propagação de informação científica e de promover uma atitude proactiva na busca de informação e
formação de uma opinião esclarecida sobre um tema.
outcomes.
In this Curricular Unit it is intended that the students will acquire a solid theoretical and applied basis on the
challenges of marine conservation and management. For that purpose, the main concepts associated to the
different topics of the program will be present in theoretical classes. In theoreticalpractical classes, students
will present and discuss in work groups specific topics based on scientific information collected from primary
sources. In the field work, students will be exposed to some of the main challenges of managing marine
protected areas, and videos and other audiovisual materials will also be used to reinforce central aspects of the
topics. This solid theoretical framework and a practical and applied component will be the most effective to fulfill
the objectives foreseen for this curricular unit. Namely, present the main challenges of ocean governance and
the role marine protected areas (MPAs) may have in a sustainable and lasting protection of the marine
ecosystems, through the presentation of case studies and framing the mechanisms of conservation and
management in the global framework of ocean conservation referring to the current legal framework and its
consequences.
contributing to reduce the competitive environment among students and increase their selfconfidence. Field
studies reinforce this component as well as value the practical experience of concepts, patterns and processes
presented in classroom context. It will also be valued the reading of primary sources as a means for students to
searching for information and formation of an informed opinion on a given topic. 3.3.9. Bibliografia principal:
Claudet, J. (Ed.) 2011. Marine Protected Areas: A Multidisciplinary Approach. Cambridge University Press,
Cambridge, UK.
Gubbay, S. (Ed.) 1995. Marine Protected Areas. Principles and Techniques for Management. Chapman & Hall,
London.
Hennessey, T.M. & Sutinen, J. G. 2005. Sustaining Large Marine ecosystems: The Human Dimension. Elsevier,
Amsterdam.
Roff, J. & Zacharias, M. 2011. Marine Conservation Ecology. London: Earthscan.
Techera, E. 2011. Marine Environmental Governance: From International Law to Local Practice. Routledge.
Anexo IV Estágio
Estágio
Joana Isabel do Espírito Santo Robalo
Paulo Xavier Catry
Rui Filipe Nunes Pais de Oliveira Vítor Manuel Carvalho Almada
O estágio pretende dar aos alunos a oportunidade de se integrarem em entidades ou instituições com quem o
ISPA tem protocolos de colaboração no sentido de aprenderem a resolver questões aplicadas directamente
relacionadas com os conteúdos deste ciclo de estudos. Alguns exemplos são: o Oceanário de Lisboa, o Aquário
Vasco da Gama, o Zoomarine de Albufeira, o Instituto de Conservação da Natureza e da Biodiversidade, etc.
Apresentamse neste curso dois perfis, dando a escolher aos alunos uma componente mais aplicada e
profissionalizante (onde o estágio tem maior peso) ou uma componente mais científica e académica (onde a
dissertação tem maior peso). Definemse como objectivos:
1. Colocar o aluno perante um contexto aplicado onde se inserirá numa equipa de trabalho
2. Aprender a definir um modelo de abordagem à problemática em causa
3. Produzir um relatório baseado na mais actual bibliografia, recorrendo a fontes primárias, relacionado com a
temática do estágio
The internship will provide the opportunity for the student to work in entities or institutions with which ISPA has
collaboration agreements to learn how to solve applied problems directly related to the contents of this study
cycle. Some examples are: Lisbon Oceanarium, Vasco da Gama Aquarium, Zoomarine in Albufeira, the Instituto
of Nature Conservation and Biodiversity, etc.
In this course, two profiles are possible, and the students may choose a more applied and professionalized
component (where the internship has a greater weight) or a more scientific and academic component (where the
dissertation has a greater weight).
The objectives are:
1. Place the student under an applied context as part of a work team
2. Learn to define an approach model for the issue at hand
3. Present a report based on the most current literature, mainly primary sources, related with the theme of the
internship 3.3.5. Conteúdos programáticos:
O conteúdo do estágio depende do assunto escolhido e da instituição onde o mesmo decorrerá. Cada ano o
Gabinete de estágios do ISPA oferecerá uma lista de locais que podem ser escolhidos pelos alunos.
3.3.5. Syllabus:
The contents of the internship will depend on the issue chosen and the institution where the work takes place.
Each year, ISPAs internship office will present a number of places students may choose.
curricular.
n/a
n/a
dissertação tem maior peso). No âmbito do estágio, a supervisão será assegurada por um dos elementos do
corpo docente destacado para o efeito, em articulação com quem nos locais de estágio tenha a formação e
competências necessárias para supervisionar o trabalho. A orientação será tutorial e o estudante será igualmente inserido em seminários de supervisão onde serão
avaliados os progressos do trabalho e aferidas as metodologias empregues e os resultados obtidos. Serão
apresentadas pelo estudante, periodicamente, as principais conclusões do seu trabalho ao resto do grupo. A
avaliação terá uma componente contínua avaliada em conjunto pelo supervisor interno da instituição de
acolhimento e pelo supervisor do ISPA e uma componente associada ao relatório final de estágio.
dissertation has a greater weight). The supervision of the internship will be made by an element of the academic
staff in articulation with who, in the institution where the internship will take place, have the necessary
competencies and skills to supervise the work.
Orientation will be tutorial and the student will also be included in supervision seminars where work progress
and results will be evaluated and the methodologies are adjusted if needed. The student will present periodically
the main conclusions of the work to the rest of the group. Evaluation will have a continuous component
evaluated by the intern supervisor of the host institution together with the academic staff member of ISPA and a
component associated to the final internship report.
curricular.
n/a
outcomes.
n/a
Varia com o tópico escolhido e a temática específica em análise. Será definida pelo supervisor baseado em
artigos de revisão e artigos originais de revistas científicas da especialidade.
Varies according to the chosen topic and the specific theme in analysis. Will be defined by the supervisor based
on Reviews and original research papers from scientific journals
Anexo IV Seminário de Dissertação
Seminário de Dissertação
Paulo Xavier Catry
Rui Filipe Nunes Pais de Oliveira Vítor Manuel Carvalho Almada
O seminário de dissertação pretende orientar os alunos para a realização de um trabalho científico, preparando
e acompanhando o aluno na identificação da temática a estudar, levantamento do problema, pesquisa
bibliográfica, definição da metodologia, escolha dos instrumentos e procedimento a seguir, tratamento dos
dados e compreensão dos resultados, discussão das principais conclusões e elaboração da dissertação.
Pretendese que o aluno desenvolva:
1. Capacidade de escolha de um problema científico de estudo
2. Capacidade para proceder a uma pesquisa bibliográfica adequada e relevante para a temática em análise
3. Capacidade para escolher a metodologia e técnicas de investigação adequadas
4. Capacidade para discutir e programar as fases de execução de um projecto de investigação
5. Capacidade de tratamento de dados e discussão de resultados.
6. Capacidade de redigir um trabalho de investigação
The dissertation seminar aims at guiding the student to perform a scientific work, preparing and supervising the
student in the identification of the theme of interest, raising the research issue, bibliographic research,
methodology definition, choice of instruments and procedures to follow, data treatment and interpretation of
results, discussion of main conclusions and elaboration of the dissertation.
It is intended that the student will develop:
1. Capacity to choose a scientific problem to study
2. Capacity to perform an adequate and relevant bibliographic research for the theme under analysis
3. Capacity to choose the methodology and adequate research techniques
4. Capacity to discuss and program the different phases of implementation of a research project
5. Capacity to treat data and discuss results
6. Capacity to write a scientific paper
Os conteúdos programáticos do seminário de dissertação são variáveis consoante as temáticas em estudo.
Contudo são focadas questões genéricas relacionadas com a investigação:
Pesquisa bibliográfica
Elaboração de problemas de investigação
Métodos e técnicas de investigação em biologia marinha e conservação
Análise e discussão de resultados
Redacção das diferentes partes de uma dissertação
Apresentação final e discussão de uma dissertação
3.3.5. Syllabus:
The contents of the dissertation seminar are variable and will depend on the issue chosen. However, some
generic topics related to scientific research will be presented:
Bibliographic research
Defining the research problem
Methods and techniques of research in marine biology and conservation
Analysis and discussion of results
Writing the different sections of a dissertation
Final presentation and discussion of the dissertation
curricular.
n/a
n/a
dissertação tem maior peso). No âmbito do seminário de dissertação, a supervisão será assegurada por um
dos elementos do corpo docente destacado para o efeito, podendo ou não estar em articulação com um
supervisionar externo caso o trabalho se realize noutra instituição científica. A orientação será tutorial e o estudante será igualmente inserido em seminários de dissertação onde serão
avaliados os progressos do trabalho e aferidas as metodologias empregues e os resultados obtidos. Serão
apresentadas pelo estudante, periodicamente, as principais conclusões do seu trabalho ao resto do grupo. A
avaliação será feita com base nos seminários de dissertação e na apresentação e defesa da dissertação.
dissertation has a greater weight). The supervision of the dissertation seminar will be made by an element of the
academic staff which may or not be in articulation with an external supervisor in case the work is performed in
another scientific institution. Orientation will be tutorial and the student will also be included in supervision seminars where work progress
and results will be evaluated and the methodologies are adjusted if needed. The student will present periodically
the main conclusions of the work to the rest of the group. Evaluation will be based on the dissertation seminars
and on the presentation and discussion of the dissertation
curricular.
n/a
outcomes.
n/a
Varia com o tópico escolhido e a temática específica em análise. O estudante procurará fontes bibliográficas
adequadas guiado pelo supervisor baseadas em artigos de revisão e artigos originais de revistas científicas da
especialidade.
Varies according to the chosen topic and the specific theme in analysis. The student will search for adequate
bibliographic sources guided by the supervisor based on reviews and original research papers from scientific
journals
4. Descrição e fundamentação dos recursos docentes
4.1 Descrição e fundamentação dos recursos docentes
4.1.1. Fichas curriculares dos docentes
Anexo V Emanuel João Flores Gonçalves
4.1.1.1. Nome do docente (preencher o nome completo):
4.1.1.2. Instituição de ensino superior (preencher apenas quando diferente da instituição proponente mencionada
em A1):
<sem resposta>
4.1.1.3 Unidade Orgânica (preencher apenas quando diferente da unidade orgânica mencionada em A2.):
<sem resposta>
4.1.1.4. Categoria:
Professor Associado ou equivalente
4.1.1.5. Regime de tempo na instituição que submete a proposta (%):
100
4.1.1.6. Ficha curricular de docente:
Mostrar dados da Ficha Curricular
Anexo V Ana Margarida da Silva Faria
em A1):
<sem resposta>
<sem resposta>
4.1.1.4. Categoria:
Professor Auxiliar ou equivalente
100
Anexo V André Levy Martins Coelho
em A1):
<sem resposta>
<sem resposta>
4.1.1.4. Categoria:
100
Anexo V Carla Patrícia Cândido de Sousa Santos
Carla Patrícia Cândido de Sousa Santos
em A1):
<sem resposta>
<sem resposta>
4.1.1.4. Categoria:
100
Anexo V Joana Isabel do Espírito Santo Robalo
em A1):
<sem resposta>
<sem resposta>
4.1.1.4. Categoria:
100
Anexo V João Paulo Maroco Domingos
em A1):
<sem resposta>
<sem resposta>
4.1.1.4. Categoria:
100
Anexo V Maria Leonor Santos Galhardo
em A1):
<sem resposta>
<sem resposta>
4.1.1.4. Categoria:
100
Anexo V Manuel Eduardo de Noronha Gamito Afonso dos Santos
em A1):
<sem resposta>
<sem resposta>
4.1.1.4. Categoria:
100
Anexo V Maria Ana Figueiredo Peixe Dias
em A1):
<sem resposta>
<sem resposta>
4.1.1.4. Categoria:
100
Anexo V Paulo Xavier Catry
Paulo Xavier Catry
em A1):
<sem resposta>
<sem resposta>
4.1.1.4. Categoria:
100
Anexo V Regina Maria Baltazar Bispo Carita
em A1):
<sem resposta>
<sem resposta>
4.1.1.4. Categoria:
100
Anexo V Rita Alexandra Duarte Borges
em A1):
<sem resposta>
<sem resposta>
4.1.1.4. Categoria:
10
Anexo V Rui Filipe Nunes Pais de Oliveira
em A1):
<sem resposta>
<sem resposta>
4.1.1.4. Categoria:
Professor Catedrático ou equivalente
100
Anexo V Vítor Manuel Carvalho Almada
em A1):
<sem resposta>
<sem resposta>
4.1.1.4. Categoria:
Professor Catedrático ou equivalente
100
4.1.2 Equipa docente do ciclo de estudos
4.1.2. Equipa docente do ciclo de estudos / Study cycle’s academic staff
Nome / Name
Grau /
Degree
Doutor
Doutor
Doutor
Carla Patrícia Cândido de Sousa
Santos
Joana Isabel do Espírito Santo
Robalo
Área científica / Scientific Area
Ecologia e Biossistemática / Ecology
and Biossystematics
Ecologia e Evolução / Ecology and
Evolution
Regime de tempo /
Employment link
Informação/
Information
100
Ficha submetida
100
Ficha submetida
100
Ficha submetida
Doutor
Biologia Evolutiva / Evolution Biology
100
Ficha submetida
Doutor
Biologia
100
Ficha submetida
100
Ficha submetida
100
Ficha submetida
Doutor
Manuel Eduardo de Noronha Gamito
Afonso dos Santos
Paulo Xavier Catry
Doutor
Fisiologia e Bioquímica / Physiology
and Biochemistry
Ciência Animal / Animal Sciences
Doutor
Biologia Animal / Animal Biology
100
Ficha submetida
Doutor
Doutor
100
100
Ficha submetida
Ficha submetida
Doutor
100
Ficha submetida
Doutor
Doutor
Doutor
Ecologia
Zoologia / Zoology
Engenharia Agronómica / Agronomic
Engineering
Biologia / Biology
Evolução / Evolution
10
100
100
1310
Ficha submetida
Ficha submetida
Ficha submetida
<sem resposta>
4.2. Dados percentuais da equipa docente do ciclo de estudos
4.2.1.a Número de docentes em tempo integral na instituição
13
4.2.1.b Percentagem dos docentes em tempo integral na instituição (campo de preenchimento automático
cálculado após a submissão do formulário)
99,2
4.2.2.a Número de docentes em tempo integral com uma ligação à instituição por um período superior a três anos
8
4.2.2.b Percentagem dos docentes em tempo integral com uma ligação à instituição por um período superior a três
anos (campo de preenchimento automático cálculado após a submissão do formulário)
61,1
4.2.3.a Número de docentes em tempo integral com grau de doutor
14
4.2.3.b Percentagem dos docentes em tempo integral com grau de doutor (campo de preenchimento automático
cálculado após a submissão do formulário)
106,9
4.2.4.a Número (ETI) de docentes do ciclo de estudos inscritos em programas de doutoramento há mais de um ano
<sem resposta>
4.2.4.b Percentagem dos docentes do ciclo de estudos inscritos em programas de doutoramento há mais de um
ano (campo de preenchimento automático cálculado após a submissão do formulário)
<sem resposta>
4.2.5.a Número (ETI) de docentes do ciclo de estudos não doutorados com grau de mestre (préBolonha)
<sem resposta>
4.2.5.b Percentagem dos docentes do ciclo de estudos não doutorados com grau de mestre (préBolonha) (campo
automático cálculado após a submissão do formulário)
<sem resposta>
4.3. Procedimento de avaliação do desempenho
4.3. Procedimento de avaliação do desempenho do pessoal docente e medidas para a sua permanente
actualização.
O desempenho global dos docentes do ISPAIU é avaliado em 4 vertentes: científica, pedagógica, extensão
universitária e gestão. O sistema implementado envolve a participação de colegas, alunos, responsáveis
directos e os Concelhos Científico e Pedagógico e indicadores objectivos de actividade científica (publicações
internacionais, projectos de investigação, comunicações em eventos científicos) e pedagógica (regularidade de
encontros, supervisão dos trabalhos dos alunos). O desempenho é expresso em 4 categorias: Excelente; Muito
Bom; Relevante; Insuficiente. A actualização científica dos docentes é promovida através da sua participação
em encontros científicos internacionais de excelência, como tem sido prática desde sempre. A constante
procura do saber e criação de conhecimento promovem igualmente essa actualização. A nível pedagógico, a
avaliação pelos alunos é fornecida no final de cada unidade curricular ao docente a fim manter um nível de
excelência na transmissão e consolidação de conhecimentos.
4.3. Academic staff performance evaluation procedures and measures for its permanent updating.
The academic staff performance evaluation uses for field; scientific, pedagogic, university extension and
outreach, management. It involves the participation of peers, students, supervisors and the Scientific and
Pedagogical Councils as well as objective indicators of scientific (international publications, research projects,
communications in scientific events) and pedagogical performance (regularity of meetings, students
supervision). Performance is expressed in 4 categories: Excellent, Very Good, Relevant, Insufficient. The
scientific updating is promoted through the participation in international scientific meetings, as has been
practice since the beginning. The constant search for and the creation of knowledge also promote this updating.
At the pedagogical level, the students perform an evaluation which is passed to the lecturer at the end of each
curricular unit with the aim to maintain a level of excellence in the diffusion and strengthen of knowledge.
5. Descrição e fundamentação de outros recursos humanos e materiais
5.1. Pessoal não docente adstrito ao ciclo de estudos.
O Curso terá a colaboração dos seguintes recursos humanos não docentes, para além do apoio dos serviços
administrativos do ISPA:
2 Técnicos superiores de manutenção laboratorial
3 Técnicos de sistemas e tecnologias da informação
3 Técnicos de documentação
2 Técnicos superiores de administração académica
1 Técnico de manutenção geral
1 Técnico superior de gestão de projectos
1 Técnico superior de contabilidade
5.1. Non academic staff allocated to the study cycle.
This PhD program will have the collaboration of the following non academic staff, besides the support from ISPA
administrative personnel:
2 Technician for laboratory maintenance
3 Technicians of systems and information technology 3 Documentation technicians
2 Technicians of academic administration
1 Technician of general maintenance 1 Technician of Project management 1 Technician of accounting 5.2. Instalações físicas afectas e/ou utilizadas pelo ciclo de estudos (espaços lectivos, bibliotecas, laboratórios,
salas de computadores, etc.).
As instalações do ISPA foram classificadas com Muito Bom pela Comissão de Avaliação Externa do Ensino
Superior. Todo o edifício está climatizado, é coberto por uma rede informática “wireless” e por um sistema
áudio.
O ISPA dispõe de:
Centro de Documentação (260 m2, 160 alunos em simultâneo)
Laboratório de aulas de Biologia (132 m2, 30 alunos) e três laboratórios de investigação 30 salas de aula (1650
lugares) com internet e multimédia
Dois auditórios (172 e 224 lugares), com vídeo e vídeoconferência
Sala de actos (80 lugares), com internet e multimédia
Sala de informática para aulas (30 lugares)
Sala de informática de acesso livre (50 lugares)
Três salas de estudo para alunos
Salão nobre para actos solenes, conferências e outros eventos científicos e culturais.
Espaço multiusos (220 m2) para exposições e outras actividades culturais
Bar Cantina, (350 m2, 300 lugares)
Bar Esplanada (50 lugares)
Livraria (101 m2)
Reprografia gerida pela Associação Estudantes.
5.2. Facilities allocated and/or used by the study cycle (teaching spaces, libraries, laboratories, computer rooms,
etc.).
ISPA facilities were classified as Very Good by the External Higher Education Evaluation Commission. The
entire building is acclimatized and covered by a wireless internet access and an audio and video system in all
classrooms.
ISPA has:
A Documentation Centre (260 m2, 160 students simultaneously)
Biology Laboratory for classes (132.3 m2, 30 students) and three research laboratories
Thirty classrooms (1650 seats) with internet and multimedia.
Two auditorium (172 e 224 seats), with video and videoconference
Formal events room (80 seats) with internet and multimedia
Computers classroom (30 seats)
Computer room freely accessible (50 seats)
Three study rooms for students only
Noble saloon for solemn acts, conferences and other cultural and scientific events
Multiuse space (220m2) for exhibitions and other cultural activities
Bar Cantina (350 m2, 300 seats).
Bar Esplanade (50 seats).
Bookstore (101 m2).
Reprography services managed by the Students Association
5.3. Indicação dos principais equipamentos e materiais afectos e/ou utilizados pelo ciclo de estudos (equipamentos
didácticos e científicos, materiais e TICs).
Estão disponíveis os seguintes laboratórios e equipamentos:
1) Neuroendocrinologia comportamental: equipamento para doseamento hormonal e para estudos de
expressão génica de receptores hormonais neurais e de neuroanatomia comparada
2) Genética Molecular: equipamentos para extracção e amplificação de DNA para trabalhos de filogenia e
filogeografia
3) Ecologia: lupas, microscópios e material de cirurgia e de histologia para estudos na área da microscopia,
histologia pequenas cirurgias e amostragem biológica
4) Biotério: uma sala de manutenção e quatro salas de experimentação animal
5) Laboratório Biológico de Apoio às Aulas: espaço multifuncional onde decorrem as aulas. Tem equipamentos
para microscopia, fisiologia, histologia, ecologia, genética molecular, bioquímica
Estão também disponíveis duas embarcações motorizadas, um ROV, sondas e vários equipamentos de
mergulho para apoio ao trabalho no mar. Para água doce existem 3 equipamentos de pesca eléctrica e sondas
multiparâmetros
5.3. Indication of the main equipments and materials allocated and/or used by the study cycle (didactic and
scientific equipments and materials and ICTs).
The following laboratories and equipment are available:
1) Behavioural Neuroendocrinology: equipment for hormone level quantification and gene expression of
hormonal neural receptors and comparative neuroanatomy;
2) Molecular genetics: equipment to extract and amplify DNA for phylogenetic and phylogeographic studies;
3) Ecology: stereomicroscopes, microscopes and surgical material for microscopy, histology and small surgery
and biological sampling;
4) Fish facilities: one maintenance room and 4 observation rooms.
5) Biological Lab: multifunctional lab where classes take place. It has equipment for microscopy, physiology,
histology, ecology, molecular genetics, biochemistry.
Also available are two boats, one ROV, probes and several diving equipments for work in the sea. For freshwater
studies 3 electrofishing equipments and multiparameter probes are available. 6. Actividades de formação e investigação
6.1. Indicação do(s) Centro(s) de Investigação devidamente reconhecido(s), na área científica predominante do
ciclo de estudos e respectiva classificação.
A Unidade de Investigação em EcoEtologia (FCT 331/94) teve origem num grupo inicial de investigadores
dedicados ao estudo do comportamento de peixes litorais. Estes trabalhos estenderamse à ecologia de peixes,
biologia larvar, monitorização e conservação, biogeografia, filogenia, filogeografia e evolução. Peixes
estuarinos e de água doce foram também incluídos, assim como mamíferos e aves marinhas. O estudo do
comportamento também levou a uma abordagem integrativa sobre endocrinologia comportamental de
vertebrados. É coordenada por Vítor Almada e encontrase dividida na linhas de investigação – Biologia e
Conservação de Organismos Aquáticos, liderada pelo coordenador, com 15 doutorados, e Biologia
Comportamental Integrativa (coordenador: Rui Oliveira) com 5 doutorados. Na última avaliação da FCT esta
unidade foi a única a ser classificada com “Excelente” nas Ciências do Mar.
http://alfa.fct.mctes.pt/apoios/unidades/avaliacoes/2007/painel?uid={66FC8A390EC848E985EE
AD36680FF747}
6.1. Research Centre(s) duly recognised in the main scientific area of the new study cycle and its mark.
The EcoEthology research unit (FCT 331/94) grew from an initial core of researchers dedicated to the study of
littoral fish behaviour. These studies led the team to the study of fish ecology, larval biology, monitoring and
conservation, biogeography, phylogeny, phylogeography and evolution; estuarine and freshwater fish and also
marine mammals and birds were also integrated. The study of behaviour also led to an integrative approach with
studies in behaviour endocrinology of vertebrates. The Unit is led by a coordinator (Vítor Almada) and is divided
in two research groups – Biology and conservation of aquatic organisms, led by the coordinator, with 15 PhDs,
and integrative behavioral biology, led by Rui Oliveira, with 5 PhDs. In the last FCT evaluation this unit was the
only classified with Excellent in Marine Sciences. http://www.ispa.pt/ui/uie/index.asp
http://alfa.fct.mctes.pt/apoios/unidades/avaliacoes/2007/painel?uid={66FC8A390EC848E985EE
AD36680FF747}
6.2. Indicação do número de publicações científicas da unidade orgânica, na área predominante do ciclo de
estudos, em revistas internacionais com revisão por pares nos últimos três anos.
127
6.3. Lista dos principais projectos e/ou parcerias nacionais e internacionais em que se integram as actividades
científicas, tecnológicas, culturais e artísticas desenvolvidas na área de ciclo de estudos.
Projectos em curso FCT
PTDC/MAR/69749/2007, PTDC/AACCLI/103110/2008, PTDC/MAR/101639/2008, PTDC/BIABEC/099416/2008,
PTDC/MAR/099366/2008, PTDC/MAR/105276/2008, HC/0009/2009, PTDC/AACAMB/111349/2009, PTDC/PSI
PCO/118776/2010, PTDC/MAR/118767/2010, PTDC/MAR/121071/2010
Projectos Europeus em Curso
MARINERA/MAR/0001/2008
BIOMARES (LIFE06 NAT/P/000192)
COPEWELL. FP7KBBE20104. Project 265957 Mais em http://www.ispa.pt/ui/uie/collaborations.asp
Parcerias Intern. (selecção)
James Cook Univ., Australia
Univ. of Salzburg, Austria
Univ. Federal de Juiz de Fora, Brazil
Univ. Bremen, Germany
Univ. de Pádua, Italy
Univ. Eduardo Mondlane, Mozambique
Univ. of Stellenbosch, South Africa Univ. de Barcelona, Spain
Univ. of La Laguna, Spain
Univ. Bern, Switzerland
Univ. Neuchatel, Switzerland
British Antarctic Survey, UK
Univ. of Aberdeen, UK
Univ. of Glasgow, UK
Univ. of Hull, UK
Marine Science Inst., UCSB, USA
Scripps, UCSD, USA
Marine Science Inst., U Texas, USA
6.3. Indication of the main projects and/or national and international partnerships where the scientific, technological,
cultural and artistic activities developed in the area of the study cycle are integrated.
Ongoing FCTprojects
PTDC/MAR/69749/2007, PTDC/AACCLI/103110/2008, PTDC/MAR/101639/2008, PTDC/BIABEC/099416/2008,
PTDC/MAR/099366/2008, PTDC/MAR/105276/2008, HC/0009/2009, PTDC/AACAMB/111349/2009, PTDC/PSI
PCO/118776/2010, PTDC/MAR/118767/2010, PTDC/MAR/121071/2010
European ongoing projects
MARINERA/MAR/0001/2008
BIOMARES (LIFE06 NAT/P/000192)
COPEWELL. FP7KBBE20104. Project 265957 http://www.ispa.pt/ui/uie/collaborations.asp
Intern. cooperation (selection)
James Cook U, Australia
Univ. of Salzburg, Austria
Univ. Federal de Juiz de Fora, Brazil
Univ. Bremen, Germany
Univ. de Pádua, Italy
Univ. Eduardo Mondlane, Mozambique
Univ. of Stellenbosch, South Africa Univ. de Barcelona, Spain
Univ. of La Laguna, Canary Islands, Spain
Univ. Bern, Switzerland
Univ. Neuchatel, Switzerland
British Antarctic Survey, UK
Univ. of Aberdeen, UK
Univ. of Glasgow, UK
Univ. of Hull, UK
Marine Science Inst., UCSB, USA
Scripps, UCSD, USA
Marine Science Inst., U Texas, USA
7. Actividades de desenvolvimento tecnológico, prestação de serviços à
comunidade e formação avançada
7.1. Descreva estas actividades e se a sua oferta corresponde às necessidades do mercado, à missão e aos
objectivos da instituição.
O Centro de Biociências é uma estrutura do ISPA destinada a articular as actividades de ensino, investigação
aplicada, realização de estudos, pareceres, etc. e de divulgação do conhecimento na área da Biologia. Do ponto
de vista científico é uma estrutura apoiada pela Unidade de Investigação em EcoEtologia. Apesar da unidade
ter a sua investigação predominantemente centrada na área das ciências do mar e, em sentido lato, na biologia
aquática, o Centro de Biociências realiza a sua actividade de educação, formação e prestação de serviços em
múltiplas vertentes da Biologia Aplicada.
O ISPA tem também beneficiado da experiência científica no domínio da Biologia do Comportamento como
suporte ao Mestrado em Psicobiologia e à Pós Graduação em Comportamento e BemEstar Animal. Para mais
informações:
http://centrodebiociencias.webnode.com/
http://www.ispa.pt/
7.1. Describe these activities and if they correspond to market needs and to the mission and objectives of the
institution.
The “Centro de Biociências” (Bioscience Center) is an ISPA structure devoted to the aim of articulating the
activities of teaching, applied research, scientific reports etc, and outreach activities in the area of Biology. It is
scientifically supported by the EcoEthology Research Unit. Although the unit has its research predominantly
centred in the Marine Sciences and aquatic biology the centre’s activities occur in multiple areas of applied
biology mainly in education, general outreach and services. ISPA has also benefited from the scientific
expertise of the EcoEthology Unit researchers. They support the Mestrado em Psicobiologia (Psychobiology
Master) and Pós Graduação em Comportamento e BemEstar Animal (Post Graduation in Behaviour and Animal
Welfare). For further information:
http://centrodebiociencias.webnode.com/
http://www.ispa.pt/
8. Enquadramento na rede de formação nacional da área (ensino superior
público)
8.1. Avaliação da previsível empregabilidade dos graduados por este ciclo de estudos com base nos dados do
MTSS.
Não aplicável
8.1. Evaluation of the graduates' forseen employability based on MTSS data.
Not applicable
8.2. Avaliação da capacidade de atrair estudantes baseada nos dados de acesso (DGES).
Não aplicável
8.2. Evaluation of the capacity to attract students based on access data (DGES).
Not applicable
8.3. Lista de eventuais parcerias com outras instituições da região que leccionam ciclos de estudos similares.
Não aplicável
8.3. List of eventual partnerships with other institutions in the region teaching similar study cycles.
Not applicable
9. Fundamentação do número total de ECTS do novo ciclo de estudos
9.1. Justificação do número total de unidades de crédito e da duração do ciclo de estudos com base no
determinado nos artigos 8.º ou 9.º (1.º ciclo), 18.º (2.º ciclo), 19.º (mestrado integrado) e 31.º (3.º ciclo) do DecretoLei
n.º 74/2006.
O presente ciclo de estudos conducente ao grau de mestre tem 180 créditos, estando de acordo com o exigido
pelo artigo 31º do DecretoLei nº 74/2006. Os primeiros 60 ECTS (1º ano) serão obtidos através da realização de
5 unidades curriculares semestrais (duas com 9 ECTS cada, uma com 6 ECTS e duas opcionais à escolha com
3 ECTS cada). Os segundos 60 ECTS (2º ano) são obtidos a partir de duas unidades curriculares anuais
(Seminário de Dissertação e Estágio) onde os alunos optarão por um de dois perfis: um em que o Estágio tem
18 ECTS e o Seminário de Dissertação 42 ECTS e outro mais aplicado em que o Estágio tem 42 ECTS e a
Dissertação 18 ECTS.
9.1. Justification of the total number of credit units and of the duration of the study cycle, based on articles no.8 or 9
(1st cycle), 18 (2nd cycle), 19 (integrated master) and 31 (3rd cycle) of DecretoLei no. 74/2006.
This study cycle directed to obtain a Master’s degree has 180 credits, in accordance with article 31st of Law
Decree nº 74/2006. The first 60 ECTS (1st year) will be obtained from attendance and approval to 5 curricular
units of one semester duration (two with 9 ECTS each, one with 6 ECTS and two optional units with 3 ECTS each).
The second 60 ECTS (2nd year) will be obtained in two annual curricular units (Dissertation Seminar and
Internship) where students will choose from one of two profiles: one where the Internship has 18 ECTS and the
Dissertation Seminar 42 ECTS and other more applied where the Internship has 42 ECTS and the Dissertation
Seminar 18 ECTS.
9.2. Metodologia utilizada no cálculo dos créditos ECTS das unidades curriculares.
O cálculo dos ECTS de cada unidade curricular tem em consideração a natureza das suas componentes
lectivas (T, TP e PL), de tutorias (OT) e de trabalho de campo (TC) e baseouse no tempo estimado necessário
para se atingirem os objectivos de cada UC. Considerouse ainda a avaliação (AV). Houve uma preocupação
em limitar o número de horas teóricas ao necessário para a apresentação das temáticas e discussão os
trabalhos, direccionando a aprendizagem do aluno para um trabalho de pesquisa e reflexão sobre as temáticas
abordadas nos ensinos TP e OT. No 1º ano, existem em cada semestre duas UC de 9 ECTS com 30 ou 45 T e 15
TP ou PL (e 15 OT), constituindo as unidades nucleares deste curso, em conjunto com um UC de 6 ECTS com 45
TP ou 30 T e 15 TP (e 15 OT). Os alunos podem ainda optar por duas UC de 3 ECTS em cada semestre
tipicamente com 30 TP e 5 OT. No 2º ano, a maioria do trabalho é realizado no contexto do estágio ou do
seminário de dissertação, e ambos têm 64 (S) e 6 ou 12 OT.
9.2. Methodology used for the calculation of ECTS credits
The ECTS calculation of credit units considered the nature of lecture components (T, TP and PL), tutorial (OT)
and field work (TC) and was based on the estimated time required to attain the objectives of each CU. The
evaluation time was also considered (AV). There was a central concern to limit the number of hours in the
theoretical classes, with most learning being directed to research and selflearning work on the topics
introduced during the TP and OT work. In the 1st year, there are two CU of 9 ECTS each in each semester with 30
or 45 T and 15 TP or PL (and 15 OT), being the nuclear CU of this course, together with one CU of 6 ECTS with 45
TP or 30 T and 15 TP (and 15 OT). Students may also choose two optional CU of 3 ECTS in each semester,
typically with 30 TP and 5 OT. In the 2nd year, most work is done in the context of the internship or the
dissertation seminar, and both have 64 (S) and 6 or 12 OT.
9.3. Indicação da forma como os docentes foram consultados sobre o método de cálculo das unidades de crédito.
O método de cálculo e a distribuição das unidades de crédito foram aprovados pelos coordenadores das
unidades curriculares, envolvendo os restantes docentes, no sentido de determinar o número de ECTS de cada
Unidade Curricular, a partir do número de horas de contacto previstas assim como do número de horas
dedicadas a estudo, preparação de trabalhos e projectos e de avaliação previsto. Apesar de não terem sido
realizados inquéritos formais aos estudantes e docentes com este fim, uma vez que se trata de um novo ciclo
de estudos, recolheuse a experiência existente nos órgãos do ISPA tendo sido consultados formalmente o
Conselho Científico e o Conselho Pedagógico. Comparamse ainda outros ciclos de estudos semelhantes a
nível nacional e internacional.
9.3. Indication of the way the academic staff was consulted about the method for calculating the credit units.
The method of calculating and distributing the credit units were approved by the coordinators of each curricular
unit, consulting the other staff members, to determine the number of ECTS of each curricular unit, based on the
number of contact hours as well as the number of hours dedicated to the study, preparation of oral and written
works, projects and evaluation. Although formal inquires to students or staff members were not undertaken with
this specific objective, as this is a new study cycle, we gathered the institutional experience or different
structures in ISPA with formal consultation of the Scientific and Pedagogical Councils. Other similar study
cycles at the national and international levels were also compared.
10. Comparação com ciclos de estudos de referência no espaço europeu
10.1. Exemplos de ciclos de estudos existentes em instituições de referência do Espaço Europeu de Ensino
Superior com a duração e estrutura semelhantes à proposta.
A implementação do novo curriculum de 2º ciclo em Biologia Marinha e Conservação no ISPA obedece às linhas
orientadoras do DecretoLei nº 74/2006, de 24 de Março. O plano de estudos segue o modelo em curso na
generalidade das universidades europeias e portuguesas que adoptaram as directrizes da European Higher
Education Area e que oferecem formação nesta área do conhecimento. Em particular, foi seguido o modelo que
obriga à obtenção de 60 ECTS em unidades curriculares dirigidas à formação em causa (formação teórica,
técnica, participação em seminários, desenvolvimento de pequenos projectos de investigação) com vista à
prossecução do programa de estudos de dois anos (180 ECTS) para recolha e tratamento dos dados e
elaboração da dissertação. Embora existam diversos 2ºs ciclos em Biologia Marinha na Europa (e.g. Groningen,
Essex, Bremen, Stockholm, Stirling), não encontrámos nenhum focado na ligação entre a Biologia Marinha e a
Conservação o que atesta o carácter pioneiro desta proposta.
10.1. Examples of study cycles offered in reference institutions of the European Area of Higher Education with
similar duration and structure to the proposed study cycle.
The implementation of the new 3rd cycle curriculum in ISPA follows the guidelines of the Law Decree nº 74/2006
of 24 March. The study plan follows the current model adopted in many European and Portuguese universities
which adopted the European Higher Education Area guidelines and offer curriculum in this area of knowledge. In
particular, the model which makes the completion of 60 ECTS in curricular units centred on the proposed course
contents (theoretical and technical skills, participation in seminars, development of small and focused research
projects) aimed at continuing the study program of two years (180 ECTS) with data collection and analysis and
completion of the Dissertation. Although there are several master’s in Marine Biology in Europe (e.g. Groningen,
Essex, Bremen, Stockholm, Stirling) we couldn’t find any centred in bridging Marine Biology and Conservation,
which concurs to the innovative character of the current proposal.
10.2. Comparação com objectivos de aprendizagem de ciclos de estudos análogos existentes em instituições de
referência do Espaço Europeu de Ensino Superior.
Os objectivos e competências definidos para o 2º ciclo de estudos em Biologia Marinha e Conservação do ISPA
foram delineados tendo em consideração o modelo actual vigente na generalidade das universidades
europeias. Durante o primeiro ano, o ciclo de estudos promove o desenvolvimento das competências
necessárias à produção de conhecimento científico na área da Biologia Marinha e Conservação e à sua
transmissão a públicos especializados e generalistas. O ano subsequente consiste no desenvolvimento de um
projecto de investigação com elevado grau de autonomia conducente à elaboração da dissertação, bem como a
um estágio de carácter profissionalizante em instituições de relevo para este ciclo de estudos. Estes objectivos
e competências são semelhantes aos traçados na generalidade dos 2ºs ciclos em Biologia Marinha existentes
em universidades europeias e portuguesas, destacandose a presente proposta pelo seu carácter inovador ao
associar a Conservação à Biologia Marinha e diferenciar dois perfis no 2º ano (um em que o estágio tem maior
peso e outro em que a dissertação tem mais ECTS atribuídos). Alguns exemplos a nível europeu de programas
de 2º ciclo em universidades de referência na área da Biologia Marinha partilham de forma genérica os
objectivos definidos para este ciclo de estudos.
10.2. Comparison with the intended learning outcomes of similar study cycles offered in reference institutions of the
European Area of Higher Education.
The objectives and competencies defined for the 2nd cycle of studies in Marine Biology and Conservation at
ISPA were designed considering the current model implemented in most European universities. During the first
year, the study cycle promote the development of the necessary competencies for the creation of scientific
knowledge in Marine Biology and Conservation and its communication to both specialized and generalized
audiences. The subsequent year consists in the execution of a research project with high level of autonomy
which will lead to the Master’s thesis, as well as an internship with a professionalization character in institutions
of interest to this study cycle. These objectives and competencies are similar to most 2nd cycles in Marine
Biology in European and Portuguese universities, but the current proposal stands out through its innovative
character by association Conservation with Marine Biology and differentiating two profiles in the 2nd year (one
in which the internship has a greater weight and another where the dissertation has more ECTS). Some
examples at the 2nd cycle programs at the European level in reference Universities in Marine Biology generally
share the goals defined to this study cycle.
11. Estágios e Períodos de Formação em Serviço
11.1. Indicação dos locais de estágio e/ou formação em serviço (quando aplicável)
Anexo VI Protocolos de Cooperação
Anexo VI Protocolos de Cooperação
11.1.1. Entidade onde os estudantes completam a sua formação:
<sem resposta>
11.1.2. Protocolo (PDF, máx. 100kB):
<sem resposta>
Anexo VII. Mapas de distribuição de estudantes
11.2. Anexo VII. Mapas de distribuição de estudantes. Plano de distribuição dos estudantes pelos locais de estágio.
(PDF, máx. 100kB)
Documento com o planeamento da distribuição dos estudantes pelos locais de formação em serviço
demonstrando a adequação dos recursos disponíveis. <sem resposta>
11.3. Recursos próprios da instituição para acompanhamento efectivo dos seus estudantes no
período de estágio e/ou formação em serviço.
11.3. Indicação dos recursos próprios da instituição para o acompanhamento efectivo dos seus estudantes nos
estágios e períodos de formação em serviço.
<sem resposta>
11.3. Indication of the institution's own resources to effectively follow its students during the inservice training
periods.
<no answer>
11.4. Orientadores cooperantes
Anexo VIII. Normas para a avaliação e selecção dos elementos das instituições de estágio responsáveis por
acompanhar os estudantes
11.4.1 Anexo VIII. Normas para a avaliação e selecção dos elementos das instituições de estágio responsáveis por
acompanhar os estudantes (PDF, máx. 100kB)
Documento com os mecanismos de avaliação e selecção dos monitores de estágio e formação em serviço,
negociados entre a instituição de ensino e as instituições de formação em serviço.
<sem resposta>
Anexo IX. Orientadores cooperantes de estágio e/ou formação em serviço
11.4.2. Anexo IX. Orientadores cooperantes de estágio e/ou formação em serviço (para ciclo de estudos de
formação de professores) / External supervisors responsible for following the students activities (only for
teacher training study cycles)
Nome / Instituição ou estabelecimento a Categoria Profissional / Habilitação Profissional /
Name que pertence / Institution
Professional Title
Professional qualifications
Nº de anos de serviço /
Nº of working years
<sem resposta>
12. Análise SWOT do novo ciclo de estudos
12.1. Apresentação dos pontos fortes.
Elevada qualificação do corpo docente que apresenta actividades profissionais e científicas de nível
internacional nas áreas de especialidade do programa de mestrado
Existência de uma Unidade de Investigação que integra a rede FCT com classificação de Excelente
Carácter inovador da proposta
Disponibilidade de recursos laboratoriais, bibliográficos, documentais e de trabalho de investigação no campo
específicos e adequados
Existência de parcerias de colaboração com outras Instituições de Ensino Superior, Centros de Investigação,
ONG’s e Institutos Públicos e Privados. A título de exemplo temos as Câmaras de Cascais, Lisboa e Oeiras, as
Universidades de Lisboa, Algarve e Porto, o Instituto Gulbenkian de Ciência, o Instituto da Conservação da
Natureza e da Biodiversidade, o Oceanário, o Zoomarine e o Aquário Vasco da Gama, entre muitos outros
Centralidade geográfica
Ambiente pedagógicos de excelência para o sucesso escolar dos alunos
12.1. Strengths.
High qualification of the lecturers which present professional and scientific activities of international level in the
areas of speciality of the master’s program.
The existence of a Research Unit which integrates the FCT network, classified as Excellent
Innovative character of the proposal
Specific and adequate Laboratorial, bibliographic, documental and field work resources
The existence of collaboration partnerships with many Higher Education, Research Centres, NGO’s and Public
and Private Institutions. As an example: Cascais, Lisboa and Oeiras City Halls, Lisboa, Algarve and Porto
Universities, the Gulbenkian Science Institute, the Institute for Nature Conservation and Biodiversity, Lisbon
Oceanarium, Zoomarine and Vasco da Gama Aquarium, among many others.
Geographical centrality
Excellent pedagogical environment for the students scholar success
12.2. Apresentação dos pontos fracos.
Ciclo de estudos recente, logo com pouca notoriedade
12.2. Weaknesses.
Recent study cycle, therefore with low profile
12.3. Apresentação das oportunidades criadas pela implementação.
As actuais perspectivas de desenvolvimento das ciências da vida e do ambiente e a aposta estratégica
nacional na área do mar
Oportunidade de potenciar as competências I&D específicas e distintivas do ISPA na área das ciências da vida
e no desenvolvimento de instrumentos de transferência de conhecimento aplicado nesta área. Com a
passagem a Instituto Universitário, as ciências da vida e em particular a Biologia, são áreas de
desenvolvimento estratégico e estruturante
A criação da Agência de Avaliação e Acreditação do Ensino Superior cria a expectativa de uma maior
regulação e exigência com os ciclos de estudos no ensino público e no ensino particular e cooperativo,
especificamente, com investimento em infraestruturas laboratoriais próprias, recursos humanos qualificados
e em regime de tempo integral, unidades de investigação credenciadas pela FCT e produção científica de
excelência a nível internacional
12.3. Opportunities.
The current perspectives of development of the life and environmental sciences and the strategic national
investment in the areas of the marine sciences
Opportunity to potentiate the R&D specific and distinctive competencies in the life sciences and in the
development of instruments for applied knowledge transfer in this area. With the conversion in a University
Institute, life sciences and in particular Biology, are areas of strategic development
The creation of the Agency for Evaluation and Accreditation of Higher Education raises the expectation that a
better regulation and greater control of the study cycles in the public and private systems, specifically with
investments in own laboratorial infrastructures, qualified human resources in full time, research units
accredited by the Science and Technology Foundation and scientific output of excellence at the international
level
12.4. Apresentação dos constrangimentos ao êxito da implementação.
Contexto sócioeconómico actual fortemente restritivo
Incertezas nas perspectivas de evolução nas políticas de financiamento do sistema científico e tecnológico
nacional
Incertezas acerca do papel do ensino particular e cooperativo de excelência no panorama do sistema de ensino
superior em Portugal face às enormes assimetrias existentes e fraca exigência na aplicação dos critérios de
qualidade
12.4. Threats.
Highly demanding and restrictive socioeconomic context
Uncertainties on the evolution perspectives of the funding policies of the scientific and technological system Uncertainties on the role of the private and cooperative system of excellence in the context of the higher
education system in Portugal considering the current enormous asymmetries and low requirements in the
application of the quality criteria
12.5. CONCLUSÕES
Apesar do contexto sócioeconómico actual fortemente restritivo e das incertezas associadas aos
constrangimentos e pontos fracos apontados, o sólido projecto do ISPA – Instituto Universitário de Ciências
Psicológicas, Sociais e da Vida garante o sucesso da implementação do presente ciclo de estudos. A existência
de uma Unidade de Investigação na área das Ciências da Vida classificada com Excelente pela FCT, o
dinamismo e produção científica de excelência dos seus membros doutorados que são a base do corpo
docente deste curso, a grande experiência na orientação de licenciados, mestrados, doutoramentos e pós
doutoramentos do corpo docente do ISPA, as colaborações mantidas com universidades nacionais e
estrangeiras de referência, empresas, institutos públicos e privados e organizações nãogovernamentais, são
maisvalias decisivas para o êxito deste curso. O ISPA possui os necessários meios humanos, materiais e
financeiros para garantir um acolhimento de excelência aos estudantes deste ciclo de estudos. O programa
proposto enquadrase com outros planos de estudo do mesmo ciclo quer de Universidades nacionais, quer de
outras Universidades Europeias, possibilitando a circulação dos alunos por diferentes instituições e a
acreditação dos planos de estudos. Este intercâmbio de estudantes e colaborações internacionais é prática
corrente no ISPA e este ciclo de estudos permitirá reforçar estas parcerias bem como procurar novos
programas de colaboração. Ao assegurar a formação criativa e original e a actualização permanente de
quadros superiores, com elevada qualidade, numa área prioritária do conhecimento responde ainda à procura
do mercado e às necessidades de qualificação do País.
12.5. CONCLUSIONS
In spite of the highly restrictive socioeconomic context and the uncertainties associated to the identified
constraints and weaknesses, the solid project of ISPA – University Institute of Psychological, Social and Life
Sciences, guarantees the success of the implementation of the present study cycle. The existence of a
Research Unit in the area of the Life Sciences classified with Excellent by FCT, the dynamism and scientific
production of excellence of its doctorate members who are the basis for the academic staff of this course, the
large experience of ISPA lecturers and researchers in supervising bachelors, masters, doctorates and post
doctorates, the many collaborations with national and foreign universities of reference, corporations, public and
private institutes and nongovernmental organizations, are decisive factors for the success of this course. ISPA
has all necessary human, material and financial resources to guarantee the highest quality reception for
students of this study cycle. The proposed program is in line with other study programs of the same cycle in
national and European universities, allowing the interchange of students in different institutions and the
accreditation of the study plan. This interchange of students and collaborations is current practice at ISPAIU
and this study cycle will allow the reinforcement of these partnerships as well as the establishment of new
collaboration programs. By guaranteeing de creative and original training and the constant update of senior
employees with high quality in a priority area of knowledge, it will also contribute to the market demand and the
qualification needs of the country.

Pedido de Acreditação

Transcrição

Documentos relacionados

nossa Apólice - Baroli Corretora

Auto-conhecimento e Comunicação

Flyer 1 S2005.cwk

Desenho

Escola EB 2 3 Piscinas

ERN.729 - PLANEJAMENTO E CONSERVAÇÃO AMBIENTAL

carta_claudio_maurilio

Inválido para efeitos de certificação

Diapositivo 1

Contratação de Escola – Educação Musical – GR 250