PPC_BBT_AnexoA_Ementas - Campus São José dos Campos
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Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia ANEXO A PLANOS DE ENSINO DO BACHARELADO EM BIOTECNOLOGIA 76 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Nome do Componente Curricular: Bioética e Biossegurança Período: 5o semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 36h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 36h Objetivos Gerais: A unidade curricular vai examinar aspectos básicos relacionados à origem do conceito de ética com foco principal na área biológica no contexto desta ciência e modulado pelas tendências que existem na sociedade. A questão da biossegurança será abordada a partir dos impactos possíveis gerados pela atividade humana e por eventos naturais. A questão da percepção de risco e sua análise será analisada. A legislação correspondente será examinada. Específicos: Ao final da unidade os alunos devem estar melhor preparados para adotar uma atitude crítica consistente e buscar informação confiável no que se refere à questões éticas e de biossegurança. Ementa: Origens dos critérios éticos e da moral. Ética médica. Direitos humanos. Eugênica. Diversidade e Racismo. Conceitos de etnia. A origem e herança africana do ser humano. Biossegurança no contexto da atividade e tecnologias humanas e dos eventos naturais. Análise de risco. Legislação correspondente. Repercussão na sociedade das questões relativas ética e segurança. Conteúdo Programático: Ética e moral, história e desenvolvimento Legislação correspondente humanos e animais Risco, análise e percepção Biossegurança Aspectos polêmicos Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas, filmes, debates entre grupos sobre os temas propostos, preparo de ensaios, vídeos na internet. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa, e tela de projeção, datashow com sistema de som e recursos para exibir DVDs. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular 77 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: 1. How risky is it, really? - David Ropeik, 2010, McGrawHill. 1. Risco, John Adams, 1995, Editora Senac. 2. Manual de Biossegurança, Mario H. Hirata, Rosario D.C. Hirata, Jorge Mancini Fo, 2012, Manole. Complementar: The better angels of our nature - why violence has declined, Steven Pinker, 2011, Viking. Whole earth discipline – Stewart Brand, 2009. Voodoo science, the road from foolishness to fraud, Robert L. Park, Oxford University Press, 2000. Armas, germes e aço - Jared Diamond, 2007. JE Smith. Biotechnology. 5ed. Cambridge 2009. Nome do Componente Curricular: Bioinformática Avançada Período: 6o semestre Pré-requisitos: Introdução à Bioinformática Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 36h Carga Horária Teórica: 36h Objetivos Gerais: Curso avançado de Bioinformática. Específicos: Curso teórico-prático introdutório às principais ferramentas computacionais da bioinformática. Ementa: Introdução à linguagem Python e ao uso de bibliotecas de BioPython. Métodos de Alinhamento de Sequências simples (Needleman-Wunsch, Smith-Waterman, BLAST). Métodos de alinhamentos múltiplos. Modelos de Markov escondidos. Análise de 78 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Clusters. Análise de Componentes Principais. Métodos de sequenciamento, montagem e análise de genomas. Conteúdo Programático: • Python • BioPython • Alinhamento de Sequências • Modelos de Markov • Análise de Clusters • Análise de Componentes Principais • Sequenciamento de Genomas Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e atividades práticas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula/ Laboratório de computação com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: KINSER, J.M. Python for Bioinformatics. Jones & Barltett, 2008. MOUNT, D.W. Bioinformatics. 2nd Ed. CSHL Press, 2004. LESK, A.M. Introdução à Bioinformática. 2ª Ed. Artmed, 2005. Complementar: GRAUR, D.; LI, W.H. Fundamentals of Molecular Evolution. 2nd Ed. Sinauer, 2000. N. C. Jones and P. A. Pevzner. An Introduction to Bioinformatics Algorithms, The MIT Press; 1 edition, 2004. D. Gusfield. Algorithms on Strings, Trees and Sequences: Computer Science and Computational Biology. Cambridge, UK: Cambridge University Press, 1997 M. Waterman. Introduction to Computational Biology: Maps, Sequences, and Genomes, Boca Raton, FL: CRC Press, 1995. R. Durbin, S. R. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison: Biological Sequence Analysis: 79 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids, Cambridge University Press, 1998. Nome do Componente Curricular: Biologia do Desenvolvimento Período: 3o semestre Pré-requisitos: Biologia Molecular do Gene Carga Horária Total: 36h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 36h Objetivos Gerais: Facilitação do aprendizado independente, crítico e contextualizado acerca da Biologia do Desenvolvimento de vertebrados. Específicos: Utilizar a história da biologia do desenvolvimento e suas bases científicas para estimular o raciocínio científico voltado a inovação e desenvolvimento biotecnológico. Ementa: Este curso visa apresentar ao aluno a história e as bases científicas da biologia do desenvolvimento, além de seus principais conceitos e relevância para a ciência moderna e inovativa. A disciplina foi estruturada para ser um guia do discente com informações objetivas, atualizadas e concisas, contribuindo para a integração dos domínios cognitivos, afetivos e psicomotor do aluno. Conteúdo Programático: 1. História da ciência; história da biologia do desenvolvimento; 2. Princípios da Biologia do Desenvolvimento: tradição anatômica, ciclo de vida, princípios da experimentação, genética, expressão gênica e comunicação celular. 2. Desenvolvimento embrionário inicial: gametogênese e fertilização em diferentes espécies; desenvolvimento de eixos. 3. Desenvolvimento embrionário tardio: gastrulação, neurulação, determinação sexual. 4. Metamorfose, regeneração e envelhecimento: contribuições da biologia do desenvolvimento para a ciência moderna. 5. Visualização de embriões de ave in ovo e ex ovo. Metodologia de Ensino Utilizada: Oferecer aos alunos do ICT a oportunidade de aprendizado sobre a biologia do desenvolvimento através de palestras, seminários, problemas e aula prática no laboratório de biologia. Recursos Instrucionais Necessários: Lupas, retroprojetor, lousa, computadores, tablets. 80 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: Gilbert, S. Developmental Biology. Ed. Sounders, 8a. edição. 2006 Moore & Persaud. Embriologia Básica. Ed. Elsevier, 8ª. ed. 2013 Anatomia Humana. Kent M. Van De Graaff. Editora Manole, 6ª edição. 2003. Complementar: Fisiologia Humana, Uma abordagem integrada. Dee Unglaub Silverthorn. Editora Artmed, 5ª Edição. 2010. Gray’s Anatomia para estudantes. Richard L. Drake, et al. Editora Elsevier, 2ª Edição. 2010. Histologia Texto e Atlas. Michael H. Ross & Wojciech Pawlina. Editora Guanabara-Koogan, 5ª Edição. 2008. Alberts, A.; Bray, D., Johnson, A, Lewis, J., Raff, M., Roberts, K & Walter, P. Fundamentos da Biologia Celular. Editora Artmed 1999. Lodish, H. e cols. Biologia Celular e Molecular. 5a ed., Ed. Artmed 2005. Nome do Componente Curricular: Biologia Estrutural Período: 6o semestre Pré-requisitos: Bioquímica I Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 36h Carga Horária Teórica: 36h Objetivos Gerais: Introdução à biologia estrutural. Específicos: Introdução à estrutura de proteínas e ácidos nucleicos, aos principais métodos da biologia estrutural e à prática de resolução de estruturas através da cristalografia de proteínas. Ementa: 81 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Introdução à biologia molecular. Estrutura dos ácidos nucleicos e das proteínas. Exemplos de estruturas de proteínas das vias de sinalização, de enzimas e de complexos proteicos. Classificação estrutural das proteínas. Biofísica Molecular. Cristalografia de raios X. Ressonância Magnética Nuclear. Conteúdo Programático: • Introdução. • Estrutura dos ácidos nucleicos. • Estrutura e das proteínas. • Classificação estrutural das proteínas. • Biofísica Molecular. • Cristalografia de raios X. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas teóricas e exercícios práticos. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula; data-show; laboratório computacional. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: BRANDEN, C.; TOOZE, J. Introduction to Protein Structure, 2nd Ed., Garland,1999. DRENTH, J. Principles of Protein X-Ray Crystallography, 3rd Ed. Springer, 2006. LESK, A. Introduction to Protein Science, Architecture, Function and Genomics, Oxford, 2010. Complementar: DONALD VOET & JUDITH G. VOET. Bioquímica Ed. Artmed, 2007. MCREE, D. Practical Protein Crystallography, 2ª Ed., Academic Press 1999. BANASZAK, L.J. Foundations of Structural Biology. Elsevier, 2000. BRUCE ALBERTS et al. Biologia Molecular da célula. 4ª Edição, Artmed, 2004. LILJAS, A. et al. Textbook of Structural Biology. World Scientific Publishing, 2009. 82 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Nome do Componente Curricular: Biologia Geral Período: 4°semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introdução à Biologia Geral. Específicos: Introdução à diversas áreas da taxonomia, sistemática, morfologia e fisiologia vegetal e animal. Ementa: Evolução. Taxonomia e sistemática dos seres vivos. Fisiologia e morfologia animal. Fisiologia e morfologia vegetal. Conteúdo Programático: • Evolução e Diversidade. • Introdução àTaxonomia e sistemática dos seres vivos. • O reino animal. • Fisiologia e morfologia dos principais grupos animais. • O reino vegetal. • Fisiologia e morfologia dos principais grupos vegetal. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: CAMPBELL, N.A.; REECE, J.B. Biology. 9 ed. Pearson 2011. PURVES, W.K.; SADAVA, D.; ORIANS, G.H.; HELLER, H.C. Vida: A ciência da 83 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Biologia. Vol II: Evolução, diversidade e ecologia. Porto Alegre: Artmed, 2005. MAYR, E. This Is Biology: The Science of the Living World. BELKNAP 1998. Complementar: 1. RAVEN PH, EVERT RF, EICHHORN S. Biology of Plants. 8th Ed. Freeman 2012. 2. KERBAUY, G.B. Fisiologia vegetal. 2 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2008. 3. ORR, R.T., Biologia dos Vertebrados, 5ª Ed. Roca, 1986. 4. Vários Autores. Princípios Integrados de Zoologia. 15ª Ed. Guanabara, 2013. 5. MILLER, HARLEY. Zoology. 9ed. McGraw-Hill, 2012. Nome do Componente Curricular: Biologia Molecular da Célula Período: 3°semestre Pré-requisitos: Fundamentos da Biologia Moderna Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introdução à biologia molecular celular. Específicos: Introdução avançada aos conceitos fundamentais da biologia molecular e celular. Ementa: Controle da expressão gênica. Estrutura e transporte membranal. Compartimentos intercelulares e direcionamento de proteínas. Mecanismos de comunicação celular. Câncer. Ciclo celular e apoptose. Citoesqueleto e matriz celular. Desenvolvimento. Imunologia. Conteúdo Programático: • Controle da expressão gênica. • Estrutura membranal e transporte membranal. • Compartimentos intercelulares e direcionamento de proteínas. • Mecanismos de comunicação celular. • Câncer. • Ciclo celular e apoptose. • Citoesqueleto e matriz celular. • Desenvolvimento. • Imunologia. 84 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Metodologia de Ensino Utilizada: Cátedras Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula; data-show. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: Alberts, A.; Bray, D., Johnson, A, Lewis, J., Raff, M., Roberts, K & Walter, P. Fundamentos da Biologia Celular. Editora Artmed 1999. Lodish, H. e cols. Biologia Celular e Molecular. 5a ed., Ed. Artmed 2005. Cooper. A Célula – Uma Abordagem Molecular. 3a ed. Ed. Artmed 2007. Complementar: ALBERTS, Bruce et al. Biologia molecular da célula. 5.ed. Artmed 2010 WATSON, James D; BERRY, Andrew; MALFERRARI, Carlos Afonso. DNA: o segredo da vida. São Paulo: Companhia das Letras, 2005. WALTER, Peter et al. Molecular biology of the cell. 5 ed. 2010. KARP, Gerald. Cell and molecular biology: concepts and experiments. 5 ed. 2008. Schrödinger, Erwin; Assis, Jesus P. (Trad.); Assis, Vera Y. K. P. (Trad.). O que é vida? UNESP, 1977. Nome do Componente Curricular: Biologia Molecular do Gene Período: 2°semestre Pré-requisitos: Fundamentos da Biologia Moderna Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introdução à Genética Clássica e Molecular. Específicos: 85 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Introdução às bases da genética e dos principais processos celulares. Ementa: Introdução à Genética Clássica e Molecular. Estrutura e Compactação do DNA. Genomas. Replicação. Transcrição. Tradução. Regulação da Expressão Gênica. Tecnologia do DNA Recombinante. Epigenética e RNAi. Conteúdo Programático: • Genética Clássica • Genética Molecular. • DNA. • Genomas. • Replicação. • Transcrição. • Tradução. • Regulação. • DNA Recombinante. • Epigenética • RNA de interferência. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: Alberts, A.; Bray, D., Johnson, A, Lewis, J., Raff, M., Roberts, K & Walter, P. Fundamentos da Biologia Celular. Editora Artmed 1999. Lodish, H. e cols. Biologia Celular e Molecular. 5a ed., Ed. Artmed 2005. Cooper. A Célula – Uma Abordagem Molecular. 3a ed. Ed. Artmed 2007. Complementar: 86 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia ALBERTS, Bruce et al. Biologia molecular da célula. 5.ed. Artmed 2010. WATSON, James D; BERRY, Andrew; MALFERRARI, Carlos Afonso. DNA: o segredo da vida. São Paulo: Companhia das Letras, 2005. WALTER, Peter et al. Molecular biology of the cell. 5 ed. 2010. KARP, Gerald. Cell and molecular biology: concepts and experiments. 5 ed. 2008. Schrödinger, Erwin; Assis, Jesus P. (Trad.); Assis, Vera Y. K. P. (Trad.). O que é vida? UNESP, 1977. Nome do Componente Curricular: Bioquímica Analítica Período: 5°semestre Pré-requisitos: Bioquímica I Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introdução à bioquímica analítica. Específicos: Introdução a aplicação de conhecimentos e procedimentos utilizados em análise bioquímica; Utilizar os conhecimentos de estrutura das macromoléculas para o desenvolvimento das habilidades manuais, com experimentos que relacionem os conhecimentos teóricos com os práticos. Ementa: Introdução e métodos estatísticos. Cromatografia. Eletroforese. Espectroscopia. Espectrometria de massas. Métodos eletro analíticos. Radioisótopos. Automação. Métodos Imunológicos. Enzimas. Testes Genéticos. Métodos de Sequenciamento. PCR e métodos derivados. Sondas. Microarranjos. Análise bioquímica de amino ácidos, proteínas, carboidratos e lipídeos. Biossegurança e aspectos éticos. Conteúdo Programático: 1. Introdução e Classificação dos métodos analíticos – Métodos estatísticos 2. Métodos de separação – Cromatografia 3. Eletroforese 4. Espectroscopia (UV/Vis) 5. Espectroscopia (IR, CD) 6. Espectrometria de massas 87 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 7. Ressonância magnética nuclear (NMR) 8. Métodos imunológicos 9. Enzimas 10. Testes genéticos e Métodos de sequenciamento 11. PCR, métodos derivados e Sondas 12 Microarranjos 13. Radioisótopos 14. Métodos eletro analíticos 15. Análise bioquímica de aminoácidos e proteínas 16. Análise bioquímica de carboidratos e lipídeos 17. Biossegurança e aspectos éticos Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas teóricas, exercícios e seminários. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula; data-show. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: HOLME, D.; Peck, H. Analytical Biochemistry. Addison Wesley 1998. BURTIS, C.; ASHWOOD, E.; BURNS, D. Tietz Textbook of Clinical Chemistry and Molecular Diagnostics. 4th Ed. Elsevier Saunders, 2006. PATRINOS, G.; ANSORGE, W. Ed. Molecular Diagnostics. 2nd Ed. Elsevier 2010. Complementar: 1. NELSON, D.L., COX, M.M. Princípios de Bioquímica de Lehninger 5ªEd. Artmed. 2011. 2. VOET, D., VOET, J.G. Bioquímica 4ª Ed. Artmed. 2013. 3. ROBYT. J.F. and WHITE, B.J., Biochemical Techniques: Theory and Practice, Waveland Press.1990. 4. 4BOYER, R.F. Modern Experimental Biochemistry. 3rd Edition. Prentice Hall, 2000. 88 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 5. COMPRY-NARDY, M. Práticas de laboratório em Bioquímica e Biofísica. Uma visão integrada. 1ª. Ed. Lab (Grupo Gen).2009. Nome do Componente Curricular: Bioquímica I Período: 2°semestre Pré-requisitos: Fundamentos de Biologia Moderna Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introdução à bioquímica. Específicos: Introdução aos conceitos fundamentais da bioquímica; à estrutura e função das principais moléculas biológicas e às principais vias do metabolismo energético. Ementa: Estrutura e Função de Proteínas, Glicídios, Ácidos Nucleicos e Lipídeos. Métodos Bioquímicos. Enzimas e enzimologia. Glicólise. Ciclo de Krebs. Fosforilação Oxidativa. Metabolismo do Glicogênio. Fotossíntese e Ciclo de Calvin. Conteúdo Programático: 1. Proteínas. 2. Glicídios. 3. Ácidos Nucleicos. 4. Lipídeos. 5. Métodos Bioquímicos. 6. Enzimas e enzimologia. 7. Glicólise. 8. Ciclo de Krebs. 9. Fosforilação Oxidativa. 10. Metabolismo do Glicogênio. 11. Fotossíntese e Ciclo de Calvin. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas teóricas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula; data-show. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e 89 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: 1. STRYER, L.; TYMOCZKO, J.L.; BERG, J.M. Bioquímica. 5a ed., Ed. GuanabaraKoogan, 2004. 2. ALBERTS, B. et al. Fundamentos da biologia celular. 2a ed. Porto Alegre: ARTMED, 2006. 3. NELSON, D.L.; COX, M.M. LEHNINGER princípios de bioquímica. 5a ed. Porto Alegre: Artmed, 2011. Complementar: 1. DONALD VOET & JUDITH G. VOET. Bioquímica Ed. Artmed, 2007. 2. HARVEY LODISH ET AL. Biologia Celular e Molecular. Ed. Artmed, 2007. 3. MARZZOCO, Anita; TORRES, Bayardo Baptista. Bioquímica básica. 3 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2007. 4. CAMPBELL, M. K. Bioquímica, 3ª edição, Artmed, 2000. 5. BRUCE ALBERTS et al. Biologia Molecular da célula. 4ª Edição, Artmed, 2004. Nome do Componente Curricular: Bioquímica II Período: 4°semestre Pré-requisitos: Bioquímica I Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Tópicos avançados da bioquímica. Específicos: Introdução a tópicos avançados da bioquímica do metabolismo. Ementa: Metabolismo dos Lipídeos. Metabolismo dos Aminoácidos. Metabolismo dos Ácidos Nucleicos. Mecanismos de Regulação do Metabolismo. Integração do Metabolismo. Introdução ao Metabolismo Secundário. Tipos de metabolismos energéticos microbiano. Metabolismo de E. coli. Diversidade metabólica de organismos heterótrofos aeróbicos. Catabolismo de heterótrofos aeróbicos. Organismos 90 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia quimiolitotróficos e fototróficos. Fixação de N2. Conteúdo Programático: • Lipídeos. • Aminoácidos. • Ácidos Nucleicos. • Regulação. • Metabolismo Secundário. • Metabolismos energéticos microbiano. • Heterótrofos aeróbicos. Quimiolitotróficos e fototróficos. • Fixação de N2. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: 1. STRYER, L. Bioquímica. Ed. Guanabara-Koogan, 2007. 2. NELSON, D.L.; COX, M.M. Lehninger princípios de bioquímica. 5 a ed. Porto Alegre: Artmed, 2011. 3. ALBERTS, B. et al. Fundamentos da biologia celular. 2a ed. Porto Alegre: ARTMED, 2006. Complementar: 1. GOTTSCHALK, G. Bacterial Metabolism (Springer Series in Microbiology) 2. VOET, VOET, Bioquímica, 4a ed. SARAIVA, 2013. 3. HARVEY LODISH ET AL. Biologia Celular e Molecular. Ed. Artmed, 2007. 4. MARZZOCO, Anita; TORRES, Bayardo Baptista. Bioquímica básica. 3 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2007. 5. CAMPBELL, M. K. Bioquímica, 3ª edição, Artmed, 2000. 91 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Nome do Componente Curricular: Biotecnologia Ambiental I Período: 6°semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introdução à biotecnologia ambiental. Específicos: Introdução à processos de biorremediação e ao tratamento de resíduos e à avaliação e monitoramento do meio ambiente. Ementa: Avaliação da biodiversidade para manutenção e conservação dos ecossistemas para seu uso aplicado. Processos biológicos de transformação de resíduos. Tratamentos aeróbios e anaeróbios. Remediação biológica utilizando microrganismos e plantas. Processos ambientalmente corretos envolvidos nas tecnologias verdes ou limpas (“greentech” ou “cleantech”). Prevenção, detecção e monitoramento. Efeitos bioquímicos e fisiológicos dos poluentes nos organismos. Desenvolvimento sustentável. Conteúdo Programático: • Biodiversidade e conservação de ecossistemas. • Tratamento de resíduos. • Biorremediação. • Desenvolvimento sustentável. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e atividades práticas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. 92 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bibliografia Básica: VALLERO, D.A. Environmental Biotechnology: A Biosystems Approach. Elsevier, Academic Press, 2010. FRANKHAM, Richard; BALLOU, Jonathan D.; BRISCOE, David A. Fundamentos da genética da conservação. SBG, 2008. G. M. Evans, J. C. Furlong, Environmental Biotechnology. Theoryand Application. John Wiley & Sons, England, 2003. Complementar: FRANKHAM, Richard; BALLOU, Jonathan D.; BRISCOE, David A. Introduction to Conservation Genetics. Cambridge University Press, 2ª edição, 2010. PRIMACK, Richard B., 1950-; RODRGUES, Efraim. Biologia da conservação. Londrina: Planta, 2006. BARRET,G.E., ODUM, E.P., Fundamentos de Ecologia, 5ª Ed. Thomson Pioneira, 2007. VALLERO, D.A. Environmental Biotechnology: A Biosystems Approach. Elsevier, Academic Press, 2010. RICKLEFS,R.E., A ECONOMIA DA NATUREZA, Guanabara 2010. Nome do Componente Curricular: Biotecnologia Ambiental II Período: 7°semestre Pré-requisitos: Biotecnologia Ambiental I Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introdução às principais tecnologias da engenharia bioquímica aplicada ao tratamento de água e efluentes líquidos. Específicos: Introdução ao monitoramento da qualidade de água e a engenharia bioquímica de purificação e tratamento de efluentes líquidos. Ementa: Parâmetros químicos e biológicos. Métodos de tratamento e purificação de água. Filtração. Métodos químicos. Dessalinização. Métodos aeróbicos. Métodos anaeróbicos. Tecnologia de tratamento de efluentes. Conteúdo Programático: • Parâmetros químicos e biológicos. 93 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia • Métodos de tratamento e purificação de água. Filtração. • Métodos aeróbicos. • Métodos anaeróbicos. • Engenharia bioquímica do tratamento de efluentes. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa e projetor. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: VALLERO, D.A. Environmental Biotechnology: A Biosystems Approach. Elsevier, Academic Press, 2010. METCALF & EDDY INC. Wastewater Engineering.4ª Ed. McGrawHill, 2003. G. M. Evans, J. C. Furlong, Environmental Biotechnology. Theoryand Application. John Wiley & Sons, England, 2003. Complementar: FRANKHAM, Richard; BALLOU, Jonathan D.; BRISCOE, David A. Introduction to Conservation Genetics. Cambridge University Press, 2ª edição, 2010. PRIMACK, Richard B., 1950-; RODRGUES, Efraim. Biologia da conservação. Londrina: Planta, 2006. BARRET,G.E., ODUM, E.P., Fundamentos de Ecologia, 5ª Ed. Thomson Pioneira, 2007. VALLERO, D.A. Environmental Biotechnology: A Biosystems Approach. Elsevier, Academic Press, 2010. RICKLEFS,R.E., A ECONOMIA DA NATUREZA, Guanabara 2010. 94 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Nome do Componente Curricular: Biotecnologia Animal Período: 6°semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introdução à biotecnologia animal. Específicos: Revisão sobre as diferentes tecnologias empregadas na biotecnologia animal. Ementa: Conceitos gerais. Bases da zoologia. Bases da fisiologia Animal. Introdução à Biotecnologia Animal. Aplicações. Doenças veterinárias de interesse econômico. Biotecnologia aplicada à produção e reprodução animal. Métodos de cultivo de células animais in vitro. Métodos de transferência de genes para células de mamíferos e células de insetos. Animais transgênicos: aplicações. Clonagem de animais. Conteúdo Programático: • Fisiologia comparativa dos animais. • Doenças veterinárias. • Reprodução animal. • Transferência de genes • Transgênicos • Clonagem de animais. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa e projetor. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. 95 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bibliografia Básica: COLLARES, T. Animais transgênicos - princípios & métodos. Sociedade brasileira de genética, 2005. GONÇALVES, P.B.D.; FIGUEIREDO, J.R.; FREITAS, V.J.F. Biotécnicas Aplicadas à Reprodução Animal. Roca, 2008. CASTILHO, L.R.; AUGUSTO, E.F.P.; MORAES, A. Tecnologia de Cultivo de Células Animais - de Biofármacos à Terapia Gênica. Roca, 2008. Complementar: ALBERTS, A.; BRAY, D., JOHNSON, A, LEWIS, J., RAFF, M., ROBERTS, K.; WALTER, P. Fundamentos da Biologia Celular. 1999. Editora Artmed – Porto Alegre – RS; LODISH, H. et al. Biologia Celular e Molecular. 2005. 5a ed., Ed. Artmed; LEHNINGER, A.L.; NELSON, D.I.; COX, M.M. Princípios de Bioquímica. 2007. 4a ed. Ed. Sarvier. R Rennerberg. Biotechnology for beginners. China: Academic Press, 2008. JE Smith. Biotechnology. 5ed. Cambridge 2009. Nome do Componente Curricular: Biotecnologia de Energias Renováveis I Período: 6°semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Apresentar aos alunos os conceitos relacionados à produção de etanol de primeira e segunda geração e seu uso como combustível. Específicos: O aluno será capaz de analisar os conceitos envolvidos com a produção de etanol, as principais matérias primas e processos industriais de produção de etanol de primeira e segunda geração, com foco nos processos biotecnológicos envolvidos, além de aspectos relacionados à sustentabilidade do etanol. Ementa: Introdução: histórico da energia no Brasil e no mundo. Biomassa. Bioetanol. Engenharia bioquímica do bioetanol. Substratos lignocelulósicos. Aspectos econômicos da produção de bioetanol. Combustível fóssil x biocombustível. Desafios para a agricultura e desenvolvimento sustentável. 96 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Conteúdo Programático: 1.0 Energia - conceitos 1.1 Evolução histórica do uso da energia 1.2 Recursos energéticos 1.3 Matriz energética 1.4 Biomassa e biocombustíveis 1.5 Biorrefinarias 1.6 Processos fermentativos 1.7 Processos enzimáticos 1.8 Combustão 2.0 Etanol de primeira geração 2.1 Etanol de cana-de-açúcar 2.2 Etanol de milho 2.3 Outras matérias primas 3.0 Etanol de segunda geração 3.1 Principais matérias primas 3.2 Processos bioquímicos 3.3 Outros processos 4.0 Sustentabilidade do etanol Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e seminários; apresentação de conceitos e discussão de aplicações. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa, microcomputador e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: Hinrichs, R.A., Kleinbach, M., Reis, L.B. Energia e Meio Ambiente. Cengage Learning, 2011. MOUSDALE D. BIOFUELS - Biotechnology, Chemistry, and Sustainable Development. CRC Press, 2008. 97 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia BNDES; CGEE. Bioetanol de cana-de-açúcar - energia para o desenvolvimento sustentável. Rio de Janeiro: BNDES, 2008. Complementar: GOLDENBERG,J., LUCON, O., Energia, meio ambiente e desenvolvimento, 3a edição, Editora da Universidade de São Paulo, 2008. BORBA, M., GASPAR, N. (Trad.). Um futuro com energia sustentável: iluminando o caminho. São Paulo: FAPESP; Amsterdam: InterAcademy Council; Rio de Janeiro: Academia Brasileira de Ciências, 2010. Disponível online em http://www.fapesp.br/publicacoes/energia.pdf CGEE. Bioetanol combustível: uma oportunidade para o Brasil. Brasília: CGEE, 2009. Klass, D. Biomass for Renewable Energy, Fuels, and Chemicals, Academic Press Publications, 1998. Gupta, R.B., Demirbas, A. Gasoline, Diesel and Ethanol Biofuels from Grasses and Plants. Cambridge University Press, 2010. Nome do Componente Curricular: Biotecnologia de Energias Renováveis II Período: 7°semestre Pré-requisitos: Biotecnologia de Energias Renováveis I Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Apresentar aos alunos os conceitos relacionados à produção de biocombustíveis além do etanol (biogás, biocombustíveis de segunda geração, butanol, etc.) Específicos: O aluno será capaz de analisar os conceitos envolvidos com a produção de outros biocombustíveis além do etanol, as principais matérias primas e processos industriais de sua produção, com foco nos processos biotecnológicos envolvidos, além de aspectos relacionados à sustentabilidade. Ementa: Biogás. Butanol. Hidrogênio. Biocombustíveis avançados. Fermentação de pentoses. Rotas termoquímicas para obtenção de biocombustíveis de segunda geração. Biocombustíveis de algas. Biocombustíveis de aviação. Sustentabilidade da produção de biocombustíveis. Biorrefinarias. Conteúdo Programático: 1. Biodigestão 98 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 1.1. Resíduos agropecuários 1.2. Resíduos urbanos 1.3. Resíduos industriais 2. Biocombustíveis avançados 2.1. Uso de materiais lignocelulósicos 2.2. Rotas termoquímicas 2.3. Fermentação de gás de síntese 2.4. Fermentação de C5 2.5 Fermentação de C6 a outros biocombustíveis 2.6 Fermentação ABE (Butanol) 3. Biocombustíveis de algas 4. Biocombustíveis de aviação 5. Sustentabilidade da produção de biocombustíveis 6. Biorrefinarias Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e seminários; apresentação de conceitos e discussão de aplicações. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa, microcomputador e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: Hinrichs, R.A., Kleinbach, M., Reis, L.B. Energia e Meio Ambiente. Cengage Learning, 2011. MOUSDALE D. BIOFUELS - Biotechnology, Chemistry, and Sustainable Development. CRC Press, 2008. Brown, R.C., Brown, T.R. Biorenewable Resources: Engineering New Products from Agriculture. 2nd ed., John Wiley & Sons, 2013. Complementar: GOLDENBERG,J., LUCON, O., Energia, meio ambiente e desenvolvimento, 3a edição, Editora da Universidade de São Paulo, 2008. 99 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia BORBA, M., GASPAR, N. (Trad.). Um futuro com energia sustentável: iluminando o caminho. São Paulo: FAPESP; Amsterdam: InterAcademy Council; Rio de Janeiro: Academia Brasileira de Ciências, 2010. Disponível online em http://www.fapesp.br/publicacoes/energia.pdf Drapcho, C.M., Nhuan, N.P., Walker , T.H., Biofuels Engineering. McGraw-Hill 2008. Klass, D. Biomass for Renewable Energy, Fuels, and Chemicals, Academic Press Publications, 1998. Gupta, R.B., Demirbas, A. Gasoline, Diesel and Ethanol Biofuels from Grasses and Plants. Cambridge University Press, 2010. Nome do Componente Curricular: Biotecnologia Vegetal Período: 7°semestre Pré-requisitos: Botânica e Fisiologia Vegetal Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introdução à biotecnologia vegetal. Específicos: Introdução ao métodos e conceitos da biotecnologia com plantas. Ementa: Conceitos básicos. Histórico da biotecnologia vegetal: melhoramento clássico versus manipulação genética. Micropropagação: cultura de células, tecidos e órgãos de plantas. Germinação e conservação de sementes. Bancos de germoplasma. Plantas transgênicas. Métodos de transformação de plantas. Bases moleculares da resistência de plantas a doenças. Interação planta-patógeno. Interação planta-insetos. Conteúdo Programático: • Padrões de crescimento em plantas, tipos de tecido, níveis de diferenciação celular e totipotência. • Meios de Cultura: Exigências nutricionais e hormonais. • Técnicas de Manipulação de plantas, tecidos e células em ambiente asséptico. • Introdução de sementes in vitro • Limpeza clonal e cultura de ápices ou de meristemas. • Culturas de gemas, brotos axilares, calos e de Células em Suspensão, Haplóides e de ovários 100 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia • Plantas transgênicas, Protoplastos; isolamento, transformação e cultura • Micro propagação. Técnicas e etapas da manipulação de plantas, condições de cultura, tipos de substrato. • Embriogênese somática • Interação planta-patógeno e planta-insetos Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e atividades práticas. Atividades extraclasse semanais em forma de lista de exercícios e seminários. Recursos Instrucionais Necessários: Laboratório com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: PRADO, C.B.A.; CASALI, C.A. Fisiologia vegetal: práticas em relações hídricas, fotossíntese e nutrição mineral. Barueri: Manole, c2006. KERBAUY, G.B. Fisiologia vegetal. 2 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2008. Biology ofplants. 7 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, c2001. Complementar: Pierik, R.L.M. In vitro Culture of Higher Plants. Martinus Nijhoff Publishers, Dordrecht. 1987. Reinert, J. e Yeoman, M.M. Plant Cell and Tissue Culture. A laboratory Manual. Sringer Verlag, Berlin. 1982. Torres, A.C., Caldas, L.S. e Buso, J.A. Cultura de Tecidos e Transformação Genética de Plantas. Embrapa – CNPH – CBAB, vol.1, 1998. R Rennerberg. Biotechnology for beginners. China: Academic Press, 2008. JE Smith. Biotechnology. 5ed. Cambridge 2009. 101 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Nome do Componente Curricular: Botânica e Fisiologia Vegetal Período: 6°semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introdução ao estudo da botânica. Específicos: Introdução ao estudo do diversos grupos de plantas, sua morfologia e fisiologia. Ementa: Classificação das Plantas. Algas. Musgos. Líquens. Pteridófitas. Gimnospermas. Angiospermas. Estrutura e Desenvolvimento de Angiospermas. Fisiologia Vegetal. Regulação hormonal do crescimento e desenvolvimento. Fatores de crescimento. Solo e nutrição. Transporte de substâncias e solutos. Conteúdo Programático: • Conceitos gerais de taxonomia vegetal • Relações hídricas • Transpiração • Transporte de água • Transporte de solutos orgânicos • Macro e micros nutrientes • Absorção iônica • Metabolismo do nitrogênio • Crescimento e desenvolvimento • Hormônios vegetais e mecanismos de ação – auxinas, giberelina, citocinina etileno, ABA. • Foto periodismo • Fatores ambientais que afetam a fotossíntese • Fotossíntese - Estresse fisiológico • Germinação e dormência Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e atividades práticas. Atividades extraclasse semanais em forma de lista de exercícios e seminários. Recursos Instrucionais Necessários: 102 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Laboratório com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: RAVEN PH, EVERT RF, EICHHORN S. Biology of Plants. 8th Ed. Freeman 2012. PRADO, C.B.A.; CASALI, C.A. Fisiologia vegetal: práticas em relações hídricas, fotossíntese e nutrição mineral. Barueri: Manole, c2006. KERBAUY, G.B. Fisiologia vegetal. 2 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2008. Complementar: JOLY, A.B. 1979. Botânica: introdução à taxonomia vegetal. 5ª ed. São Paulo, Editora Nacional. 777 p. FERRI, M.G.; MENEZES, N.L.; MONTEIRO, W.R. 1981. Glossário Ilustrado de Botânica. São Paulo, Ed. Nobel. 197 p. PRADO, C.B.A.; CASALI, C.A. Fisiologia vegetal: práticas em relações hídricas, fotossíntese e nutrição mineral. Barueri: Manole, c2006. KERBAUY, G.B. Fisiologia vegetal. 2 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2008. JE Smith. Biotechnology. 5ed. Cambridge 2009. Nome do Componente Curricular: Cálculo em Uma Variável Período: 1°semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 108h Carga Horária Prática: 36h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Apresentar aos alunos as origens históricas e os fundamentos do Cálculo. Mostrar aos a utilidade do cálculo infinitesimal e suas diversas aplicações nos campos científicos e tecnológicos. Desenvolver competência técnica para resolução de problemas práticos 103 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia em ciência e tecnologia. A ênfase desse curso é a compreensão de conceitos. Específicos: Ao final da unidade curricular o aluno deverá estar apto a analisar e resolver problemas que envolvam limites, derivação e integração. Devem conseguir entender um problema de cálculo geométrica e algebricamente. Os alunos devem ser capazes de discutir problemas científicos em termos de conceitos abstratos inerentes as técnicas de derivação e integração. Ementa: Funções reais de uma variável. Limite e continuidade. Derivação. Integração. Aplicações. Conteúdo Programático: • Funções de uma variável: revisão. Modelos matemáticos. • Limites: limite de uma função. Cálculos usando limite. Definição precisa de limite. Continuidade. Limites no infinito: assíntotas. Propriedades. Exemplos. Aplicações. • Derivação: motivação geométrica (o problema das tangentes). Taxa de variação. Definição. Regras de derivação. Derivadas de funções polinomiais e exponenciais. Regra do produto e do quociente. Derivadas de funções trigonométricas. Regra da cadeia. Derivação implícita. Derivadas de funções logarítmicas. • Aplicações da derivação: Valores máximos e mínimos. Teorema do valor médio. Taxas de variação nas ciências naturais e sociais. Esboços de gráficos. • Integração: Áreas e distâncias. Integral definida. Integral indefinida. Teorema fundamental do Calculo. Técnicas de integração: Integração por partes, integrais trigonométricas, substituição trigonométrica, Integração por funções parciais. • Aplicações da integração: Áreas entre curvas, volumes. Trabalho. Valor médio de uma função. Comprimento de arco. Área da superfície de revolução. Aplicações à física, engenharia, economia e biologia. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e de exercícios. Discussões e abordagem a problemas de maneira coletiva, feitas em grupos. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa e projetor multimídia. Acesso ao MOODLE como ferramenta de EAD. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. 104 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bibliografia Básica: 1. GUIDORIZZI, H. L. Um curso de cálculo. v. 1. 5ª Ed. Rio De Janeiro: LTC, 2007. 2. LEITHOLD, L. O cálculo com geometria analítica. v. 1. 3ª ed. São Paulo: Harbra, 1990. 3. STEWART, J. Cálculo. v.1. 6ª ed. São Paulo: Cengage Learning, 2009. Complementar: 1. BOULOS, P. Cálculo diferencial e integral. v.1. São Paulo: Pearson, 1999. 2. FLEMMING, D. M.; Gonçalves, M. B. Cálculo A: funções, limite, derivação e integração. 6ª ed. São Paulo: Pearson, 2006. 3. GUIDORIZZI, H. L. Um curso de cálculo. v. 2. 5ª Ed. Rio De Janeiro: LTC, 2007. 4. LARSON, R.; EDWARDS, B.; HOSTETLER, R. P. Cálculo. v. 1. 8ª ed. São Paulo: Mc Graw-Hill, 2006. 5. SIMMONS, G. F. Cálculo com geometria analítica. v. 1. 1ª ed. São Paulo: Pearson, 2008. 6. THOMAS, G. B. Cálculo. v. 1. 12ª ed. São Paulo: Pearson, 2013. Nome do Componente Curricular: Ciência, Tecnologia e Sociedade Período: 1º semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 36h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 36h Objetivos Gerais: Analisar crítica e interdisciplinarmente a Ciência e a Tecnologia entendendo-a como construção social. Compreender e analisar os principais debates do campo da Ciência, Tecnologia e Sociedade (CTS), especialmente na América Latina. Específicos: Compreender e analisar o advento do campo de CTS (Ciência, Tecnologia e Sociedade); Compreender e analisar os desdobramentos dos debates acerca da neutralidade, determinismo e não-neutralidade da Ciência e Tecnologia; Compreender e analisar impactos sociais e processos decisórios em Política Científica e Tecnológica. Ementa: Técnicas e tecnologias como dimensões da humanidade. Ciência, tecnologia e inovação como construção social. Advento do campo da CTS (Ciência, Tecnologia e Sociedade). Política científica e tecnológica. Valores e ética na prática científica. Controvérsias científicas. Conteúdo Programático: Ciência e Culturas; 105 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Advento da Ciência Moderna; Ciência e Tecnologia como construção social; Neutralidade, Determinismo Tecnológico e Não-Neutralidade; Ciência, Tecnologia e Gênero; Ciência, Tecnologia e Ambiente; Inovação Social e Tecnologias Sociais. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas; apresentação e discussão de situações-problema, listas de exercícios e seminários. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa, microcomputador e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: • Walter A. Bazzo (ed.), Introdução aos Estudos CTS (Ciência, Tecnologia e Sociedade), Organização dos Estados Ibero-americanos para a Educação, a Ciência e a Cultura (OEI), 2003. DAGNINO, Renato. Neutralidade da Ciência e Determinismo Tecnológico - Um Debate sobre a Tecnociência. Campinas: Editora da Unicamp, 2008. Latour, Bruno. Ciência Em Ação: Como Seguir Cientistas E Engenheiros Mundo Afora. São Paulo: Ed. Unesp, 2001. Complementar: 1. BOURDIEU, Pierre. Os Usos da Ciência. São Paulo: Ed. Unesp/Inra, 2002. 3. SHIVA, Vandana. Monoculturas da Mente-Perspectivas da Biodiversidade e da Biotecnologia, São Paulo: Global Editora, 2003. 4. DAGNINO, Renato & HERNAN, Thomas (org). Ciência, Tecnologia e Sociedade 106 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Uma Reflexão Latino-Americana. Editora Cabral, São Paulo, 2003. 5. FIGUEIREDO, VILMA. Produção Social da Tecnologia - Sociologia e Ciência Política - Temas Básicos. São Paulo: EPU, 1989. 6. BOURDIEU, Pierre. Para uma Sociologia da Ciência. São Paulo: Edições 70 Brasil, 2008. Nome do Componente Curricular: Ciência, Tecnologia, Sociedade e Ambiente Período: 2 º semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 36 h Carga Horária Prática: 0 h Carga Horária Teórica: 36 h Objetivos Gerais: Analisar crítica e interdisciplinarmente a Ciência e a Tecnologia entendendo-a como construção social bem como seus impactos ambientais. Compreender e analisar os principais debates da problemática ambiental para C&T. Compreender as relações entre Ensino de Ciências, Educação Ambiental e construção de C&T. Específicos: Compreender e analisar o advento do campo de CTSA (Ciência, Tecnologia, Sociedade e Ambiente) em relação ao de CTS (Ciência, Tecnologia e Sociedade); debater impactos ambientais da C&T; debater a mudança de ensino de ciências para C&T e sustentabilidade. Ementa: Advento do campo da CTSA (Ciência, Tecnologia, Sociedade e Ambiente). Tecnologias Alternativas. Movimentos socioambientais e Ciência e Tecnologia. Sócio diversidade, biodiversidade e Ciência e Tecnologia. Temas Geradores, Educação em CTSA e Educação Ambiental. Conteúdo Programático: • O campo da CTSA em relação ao campo CTS • Problemas Ambientais e C&T • Mudança do Clima e CTSA • Movimentos socioambientais e C&T • Ensino de Ciências e CTSA Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas; apresentação e discussão de situações-problema, listas de exercícios e seminários. Recursos Instrucionais Necessários: 107 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Sala de aula com lousa e projetor multimídia, computador. Acesso ao MOODLE. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: 1. Walter A. Bazzo (ed.), Introdução aos Estudos CTS (Ciência, Tecnologia e Sociedade), Organização dos Estados Ibero-americanos para a Educação, a Ciência e a Cultura (OEI), 2003. 2. Gadotti, Moacir. Fórum Mundial de Educação. Pro-posições para um outro mundo possível. Série Cidadania Planetária 1. Editora e Livraria Instituto Paulo Freire, 2009. 3. CANAVARRO, J. M. Ciência e sociedade. Coimbra, Portugal, Quarteto Editora, 2000. Complementar: 1. DAGNINO, Renato & HERNAN, Thomas (org). Ciência, Tecnologia e Sociedade - Uma Reflexão Latino-Americana. Editora Cabral, São Paulo, 2003. 2. Rezende, Sergio Machado. Momentos da Ciência e Tecnologia no Brasil. Uma caminhada de 40 anos pela C&T. Editora Vieira & Lente, 2010. 3. CUNHA, Marcia Borin da. O movimento ciência/tecnologia/sociedade (CTS) e o ensino de ciências: Condicionantes estruturais. São Paulo: Revista Scientia, v.06, n. 12, 2006. p. 121-134. 4. Loureiro, C. F. B., Layrargues, P.P., Castro, R. S.de. (Orgs.) Sociedade e Meio Ambiente: A educação Ambiental em Debate. São Paulo: Cortez, 2000. 5. VOGT, C.; POLINO, C. (orgs.). Percepção Pública da Ciência: resultados da pesquisa na Argentina, Brasil, Espanha e Uruguai. Campinas: Editora da UNICAMP, 2003. 108 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Nome do Componente Curricular: Ecologia Avançada Período: 7 º semestre Pré-requisitos: Introdução à Ecologia Carga Horária Total: 72 h Carga Horária Prática: 0 h Carga Horária Teórica: 72 h Objetivos Gerais: Tópicos avançados de ecologia de sistemas. Específicos: Análise integrada da ecologia de sistemas terrestres. Ementas: Ciclos biogeoquímicos. Evolução e a biosfera. Modelagem ambiental. A hidrosfera. A atmosfera. Solo e sedimentos. Erosão. Fatores antropomórficos. Conteúdo Programático: • Ciclos biogeoquímicos. • Evolução e a biosfera. • Modelagem ambiental. • A hidrosfera. • A atmosfera. • Solo e sedimentos. • Erosão. • Fatores antropomórficos. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: 109 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia MILLER, T., Essentials of Ecology. Cengage 2005. TOWNSEND, C.R.; BEGON, M.; HARPER, J. L. Fundamentos em Ecologia. 2ª Ed. PortoAlegre:Artmed, 2006. PURVES, W.K.; SADAVA, D.; ORIANS, G.H.; HELLER, H.C. Vida: A ciência da Biologia. Vol II: Evolução, diversidade e ecologia. Porto Alegre: Artmed, 2005. Complementar: RICKLEFS,R.E., A ECONOMIA DA NATUREZA, Guanabara 2010 BARRET,G.E., ODUM, E.P., Fundamentos de Ecologia, 5ª Ed. Thomson Pioneira, 2007. VALLERO, D.A. Environmental Biotechnology: A Biosystems Approach. Elsevier, Academic Press, 2010. FRANKHAM, Richard; BALLOU, Jonathan D.; BRISCOE, David A. Fundamentos da genética da conservação. SBG, 2008. PRIMACK, Richard B., 1950-; RODRGUES, Efraim. Biologia da conservação. Londrina: Planta, 2006. Nome do Componente Curricular: Empreendedorismo em Biotecnologia Período: 5º semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 36h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 36h Objetivos Gerais: Introdução às bases da administração e do empreendedorismo. Específicos: Introdução à administração, à gestão estratégica de tecnologia e inovação em biotecnologia e à proteção de propriedade intelectual. Ementas: Disciplina que investiga a relação entre os processos de pesquisa científica na biotecnologia e o mercado de produtos e processos. São também estudados como o mercado influência e afeta o desenvolvimento da pesquisa biotecnológica através dos fatores econômicos, e as estruturas para o desenvolvimento e proteção intelectual através de regulações, patentes, competição e cooperação entre empresas. Conteúdo Programático: ▪ Introdução à administração. ▪ Gestão estratégica de tecnologia e inovação. ▪ Proteção intelectual 110 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e atividades práticas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: SIMON, F.; KOTLER, P. Building global biobrands: taking biotechnology to market, Free Pr, 2003. SIMON, F. "Market access for biopharmaceuticals: new challenges." Health Affairs 25(5): 1363-1370, 2006. AUSTIN, M. Business Development for the Biotechnology and Pharmaceutical Industry, Gower Publishing Company, 2008. Complementar: KRAGL, U. Technology transfer in biotechnology: from lab to industry to production, Springer Verlag, 2005. GANGULI, P.; PRICKRIL, B. et al. Technology transfer in biotechnology: a global perspective, Vch Pub, 2009. OECD (2011) Future Prospects for Industrial Biotechnology. Organisation For Economic Co-operation And Development. BURGELMAN, R.A.; C.M. CHRISTENSEN, et al. Strategic management of technology and innovation, McGraw-Hill/Irwin, 2008. SCHILLING, M.A. (2005). Strategic management of technological innovation, McGraw-Hill Education. 111 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Nome do Componente Curricular: Engenharia Bioquímica I Período: 5º semestre Pré-requisitos: Fundamentos de Engenharia Bioquímica; Microbiologia Geral Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introduzir os princípios da engenharia de bioprocessos para alunos de graduação na área de Biotecnologia. Específicos: Apresentar os conceitos básicos necessários ao desenvolvimento, à otimização e à operação de processos bioquímicos. Ementas: Apresentação dos conceitos teóricos envolvidos na pesquisa e no desenvolvimento de processos biotecnológicos de interesse industrial. As ferramentas apresentadas nesta disciplina - estequiometria e cinética de bioprocesso, análise de bioprocesso e projeto de biorreatores - devem possibilitar a compreensão dos fenômenos biológicos e controlar às reações bioquímicas envolvidas nesse tipo de processo. Esses conhecimentos são fundamentais na definição e otimização das várias operações unitárias, notadamente na fase de síntese do bioproduto ("upstream"). Conteúdo Programático: 1.Introdução; 2.Cinética Enzimática; 3.Estequiometria e Cinética de Bioprocesso; 4.Análise de bioprocesso; 5.Reatores homogêneos. 6.Biorreatores. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e atividades práticas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: 112 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia SHULER, M.L.; KARGI, F. Bioprocess engineering: basic concepts. BioprocessEngineering: Basic Concepts, 2ndEdition, Prentice Hall,2001, 576p. SCHMIDELL, W.; LIMA, U.A.; AQUARONE, E.; BORZANI, W. Biotecnologia industrial. vol 2: Engenharia Bioquímica, Edgard Blucher, 2000. RATLEDGE, C.; KRISTIANSEN, B. Basic Biotechnology. Cambridge University Press; 3rd edition, 2006 Complementar: Fonseca, M.M.; Teixeira, J.A. Reatores biológicos: fundamentos e aplicações. Lisboa: Lidel Edições Técnicas, 2007, 483p. (Colecão Biotec) ISBN 9727573665 Levenspiel, O. Engenharia das reações químicas. São Paulo: Editora Blücher, 2011. 563 p. ISBN 9788521202752. Fogler, H.S. Elementos de engenharia das reações químicas. 4.ed. Rio de Janeiro: LTC, 2009. 853 p. ISBN 9788521617167 Blanch, H.W.; Clark, D.S. Biochemical engineering. Boca Raton: CRC/Taylor & Francis, 1997. 702 p. ISBN 9780824700997 Doran, P.M. Bioprocess engineering principles. USA: Academic Press, 2012. Nome do Componente Curricular: Engenharia Bioquímica II Período: 6º semestre Pré-requisitos: Engenharia Bioquímica I Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introduzir os princípios da engenharia de bioprocessos para alunos de graduação na área de Biotecnologia. Específicos: Apresentar os conceitos básicos necessários ao desenvolvimento, à otimização e à operação de processos bioquímicos. Ementa: Apresentação dos conceitos teóricos envolvidos na pesquisa e no desenvolvimento de processos biotecnológicos de interesse industrial. As ferramentas apresentadas nesta disciplina - ampliação de escala de bioprocessos, monitoramento e controle de bioprocessos, separação e purificação de bioproduto, avaliação econômica - em conjunto com aqueles vistos anteriormente na disciplina Engenharia Bioquímica I (prérequisito), devem possibilitar uma compreensão total dos fenômenos biológicos e técnicas de controle das reações bioquímicas envolvidas nesse tipo de bioprocesso. 113 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Esses conhecimentos são fundamentais na definição e na otimização das várias operações unitárias, tanto da fase de síntese do bioproduto ("upstream"), como de sua separação e purificação (“downstream”). Conteúdo Programático: 1. Monitoramento e controle de bioprocessos. 2. Ampliação de escala de bioprocesso; 3. Separação de bioprodutos (rompimento celular; clarificação; concentração); 4. Purificação de produtos biotecnológicos (membranas, extração líquido-líquido, adsorção por troca iônica, afinidade, e hidrofobicidade: precipitação; cristalização) 5. Avaliação econômica. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e atividades práticas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: PESSOA Jr, A, KILIKIAN B. Purificação de processos biotecnológicos. Manole, 2005, 444p. SHULER, M.L.; KARGI, F. Bioprocess engineering: basic concepts. BioprocessEngineering: Basic Concepts, 2ndEdition, Prentice Hall,2001, 576p. SCHMIDELL, W.; LIMA, U.A.; AQUARONE, E.; BORZANI, W. Biotecnologia industrial. vol 2: Engenharia Bioquímica, Edgard Blucher, 2000. Complementar: Blanch H.W.; Clark D.S. Biochemical engineering. Boca Raton: CRC/Taylor & Francis, 1997. 702 p. ISBN 9780824700997 Nielsen J.; Villadsen J.; Lidén, G. Bioreaction Engineering Principles. Springer 2011 (3a Ed). 591p. ISBN 978-1441996879. RATLEDGE, C.; KRISTIANSEN, B. Basic Biotechnology. Cambridge University Press; 3rd edition, 2006 Fonseca M.M.; Teixeira J.A. Reatores biológicos: fundamentos e aplicações. 114 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Lisboa: Lidel Edições Técnicas, 2007, 483p. (Colecão Biotec) ISBN 9727573665 DORAN, P.M. Bioprocess engineering principles. USA: Academic Press, 2012. Nome do Componente Curricular: Engenharia Tecidual e Medicina Regenerativa Período: 7º semestre Pré-requisitos: Biologia Molecular da Célula; Fisiologia Humana Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Aprimoramento e prática de aprendizado independente, crítico e contextualizado acerca das recentes descobertas científicas na área da engenharia tecidual e medicina regenerativa. Específicos: a. Capacitar o aluno a identificar e compreender os processos já conhecidos aplicados à engenharia tecidual e medicina regenerativa; b. Capacitar o aluno a aplicar o conhecimento biológico adquirido a problemas que envolvam a BT e MR em sua solução. Ementa: Disciplina teórica. Visa promover o entendimento dos princípios e conceitos da engenharia molecular, celular e tecidual; ensinar as técnicas básicas de engenharia tecidual; e estimular a aplicação dos conceitos básicos da engenharia tecidual à problemas práticos da área da saúde. Conteúdo Programático: Introdução à Engenharia de Tecidos; Crescimento de tecidos; Biomateriais na Engenharia de Tecidos; Scaffolds (Suportes) na Engenharia de Tecidos; Métodos de preparo de scaffolds; noções de bioreatores para cultura de células; Células-tronco e aplicações na Engenharia de Tecidos; Engenharia de Tecidos no sistema gastrointestinal; Engenharia de Tecidos no sistema genitourinário; Engenharia de Tecidos no sistema ósseo; Engenharia de Tecidos no sistema nervoso; Engenharia de Tecidos da pele; Produtos comerciais da Engenharia de Tecidos; Regulamentação; Perspectivas na área de Engenharia de Tecidos; Órgãos artificiais. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e atividades práticas. Recursos Instrucionais Necessários: Laboratório com lousa e projetor multimídia. Acesso ao MOODLE. Critérios de Avaliação: 115 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: MCCONNELL, J. et al. Anatomy, Physiology and Pathology of the Skeletal System. Versão online gratuita, 2008. DAVIES, J.E. Bone Engineering. Editora Em2. 2000. MUKHERJEE, A. Biomimetics: Learning from Nature. InTech , 2010 Complementar: LANZA, R., LANGER, R, VACANTI, J.P. Principles of Tissue Engineering. 3 ed. San Diego: Academic Press, 2007 PALSSON, B., HUBBELL, J.A., PLONSEY, R., BRONZINO, J.D. Tissue Engineering (Principles and Applications in Engineering). 1 ed., New York: CRC, 2003. ALBERTS, Bruce et al. Biologia molecular da célula. 5.ed. Artmed 2010. Lodish, H. e cols. Biologia Celular e Molecular. 5a ed., Ed. Artmed 2005. Cooper. A Célula – Uma Abordagem Molecular. 3a ed. Ed. Artmed 2007. Nome do Componente Curricular: Fenômenos Mecânicos Período: 2o semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Oferecer uma apresentação lógica e quantificada da mecânica, com ênfase na dinâmica e nas consequentes leis de conservação. Possibilitar a compreensão de seu significado teórico e reconhecer seus fundamentos experimentais. Ressaltar os conceitos fundamentais da mecânica e sua utilidade nos diversos ramos da ciência básica como química, engenharia e biologia. Desenvolver habilidades para manipular a matemática requerida para expressar os conceitos envolvidos. Específicos: Entender a mecânica de forma integrada e visualizar um problema em 116 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia diferentes perspectivas; Descrever problemas mecânicos relacionados ao movimento e equilíbrio através do uso das leis da mecânica; Relacionar os conceitos fundamentais da mecânica com aplicações em áreas adjacentes; Empregar ferramentas básicas de cálculo diferencial e integral na resolução de problemas práticos; Assimilar o significado teórico das leis e princípios de conservação e suas bases experimentais, concebendo a inter-relação entre teoria e experimento. Ementa: Medidas e Unidades. Leis de Movimento. Aplicações das leis de Newton. Trabalho e energia. Momento. Sistemas de partículas. Conteúdo Programático: Introdução o Medidas e Unidades o Quantidades Fundamentais em Mecânica o Sistemas de Unidades o Unidades derivadas e dimensões o Sistemas de coordenadas o Definições básicas: Velocidade e Aceleração Leis de Movimento o Lei da Inércia e Massa o Segunda Lei de Newton o Terceira Lei de Newton o Princípio da relatividade clássica Aplicações das leis de Newton o Movimento translacional e as transformações de Galileu. o Movimento sob força constante: Movimento retilíneo. Composição de velocidades e acelerações. o Movimento relativo. o Movimento curvilíneo. Aceleração tangencial e normal. o Movimento Circular Uniforme: Velocidade e Aceleração Angular. o Vetores no movimento circular o Força resultante o Equilíbrio o Forças de atrito o Forças viscosas 117 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia o Sistemas com massas variáveis Trabalho e energia o Definição: Trabalho e energia o Teorema trabalho-energia cinética o Forças conservativas e energia potencial o Potencial da mola e potencial gravitacional o Relação entre força e energia potencial o Conservação da energia o Potência o Forças conservativas e não conservativas o Dissipação da energia Movimento gravitacional e Leis de Kepler o A lei da gravitação o Energia potencial gravitacional o Energia e movimento orbital o Potencial e campo gravitacional o Leis de Kepler: Lei das órbitas, lei das áreas e lei dos períodos. Momento o Momento linear o Conservação do Momento o Colisões o Momento angular: Torque e momento de inércia o Conservação do momento angular o Forças centrais Sistemas de partículas o Movimento do centro de massa o Massa reduzida o Centro de massa e centro de gravidade o Momento angular de um sistema de partículas o Momento angular orbital e spin o Momento angular de um corpo rígido o Rotação e oscilação de um corpo rígido o Equilíbrio de um corpo rígido o Energia cinética de um corpo rígido o Conservação da energia num sistema de partículas Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas; apresentação e discussão de situações-problema, listas de 118 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia exercícios e seminários. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa, microcomputador e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: 1. Paul A. Tipler, Física para cientistas e engenheiros, v.1, 6ª ed., Livros Técnicos e Científicos Editora. 2. David Halliday, Robert Resnick e Jearl Walker, Fundamentos de Física, v.1, 8ª ed., Livros Técnicos e Científicos Editora. 3. Raymond A. Serway e John W. Jewett, Jr., Principios de Física, v.1, Editora Thonsom. Complementar: Nussenveig, Moysés, Curso de Física Básica:v.2, 4a. Ed., Edgard Blücher. Alonso, M., Finn, E., Física Um curso Universitário, v.1, Edgard Blücher. R. Feynman, Lectures on Physics, v.1, Addison Wesley. C. Kittel, W. D. Knight e M. A. Ruderman, Mecânica, Curso de Física de Berkeley vol. 1, Edgard Blucher (1970). M. Fishbane, S. Gasiorowicz e S. T. Thorton, Physics for Scientists and Engineers, 2a ed., Prentice Hall (1996). Nome do Componente Curricular: Física Geral Período: 3º semestre Pré-requisitos: Fenômenos Mecânicos Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Objetivos Gerais: Carga Horária Teórica: 72h 119 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Introdução à fenômenos oscilatórios, à termodinâmica, à hidrostática e hidrodinâmica , aos fenômenos eletromagnéticos e à física moderna. Específicos: Introdução conceitual à física experimental e suas aplicações. Ementa: Oscilações e ondas. Fluidos. Termodinâmica. Ótica. Eletricidade e Magnetismo. Física Moderna. Conteúdo Programático: 1. Oscilações e ondas. 2. Termodinâmica. 3. Fluidos. 4. Ótica. 5. Eletricidade. 6. Magnetismo. 7. Introdução à física moderna. Metodologia de Ensino Utilizada: Cátedras. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula; data-show. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia Básica: 1. TIPLER, P.A. Física para cientistas e engenheiros, v.1, 6ª ed., Livros Técnicos e Científicos Editora. 2. HALLIDAY, D.; RESNICK, R.; WALKER, J. Fundamentos de Física, v.1, 8ª ed., Livros Técnicos e Científicos Editora. 3. SERWAY, R.A.; JEWETT, Jr., J.W. Princípios de Física, v.1, Editora Thomsom. Complementar: 1. R. Feynman, Lectures on Physics, v.1, Addison Wesley. 2. C. Kittel, W. D. Knight e M. A. Ruderman, Mecânica, Curso de Física de 3. Berkeley vol. 1, Edgard Blucher (1970).Moisés Nussenzweig, Curso de Física Básica: v.1, 4ª ed., Editora Edgard Blücher. 4. Marcelo Alonso e Edward Finn, Física Um Curso Universitário, v.1, Editora Edgard Blücher. 120 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 5. C. Kittel, W. D. Knight e M. A. Ruderman, Mecânica, Curso de Física de Berkeley vol. 1, Edgard Blucher (1970). Nome do Componente Curricular: Fisiologia Experimental Período: 4º semestre Pré-requisitos: Fisiologia Humana Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 72h Carga Horária Teórica: 0h Objetivos Gerais: Fornecer ao aluno conhecimentos práticos sobre o funcionamento do organismo a partir do conceito central de homeostasia, fundamentais para apreensão das relações de interdependência entre os diversos sistemas que constituem o organismo humano. Específicos: Facilitar o aprendizado prático, independente e crítico sobre o funcionamento dos sistemas, e estimular o desenvolvimento da visão sistêmica do organismo, como base para a compreensão das alterações funcionais com as quais terão contato na prática profissional. Ementa: Biossegurança; Experimentação Animal; Sangue; Sistema Neuromuscular; Sistema Cardiovascular; Sistema Renal; Sistema Respiratório; Sistema Gastrintestinal; Sistema Sensorial; Sistema Endócrino. Conteúdo Programático: Biossegurança Experimentação Animal Sangue - Hemostasia Sistema Neuromuscular - Mecanismo de contração muscular, controle de força, relação tensão-comprimento Sistema Cardiovascular – Ciclo cardíaco, regulação da pressão arterial, contratilidade do miocárdio Sistema Renal – Perfusão renal Sistema Respiratório - Reatividade pulmonar e brônquica, perfusão pulmonar, espirometria Sistema Gastrintestinal – Motilidade gastrintestinal Sistema Sensorial – Sensações somáticas e reflexos medulares Sistema Endócrino Metodologia de Ensino Utilizada: 121 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Aulas práticas demonstrativas, apresentação de seminários e estudos de casos. Recursos Instrucionais Necessários: Equipamentos do laboratório de Fisiologia Experimental, data-show, lousa, software de simulação computadorizada e o software LabStudent. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: 1. Barker K. Na bancada - Manual de iniciação científica em laboratório de pesquisas biomédicas. 1. ed. Porto Alegre: Artmed, 2002. 2. Silverthorn DU. - Fisiologia Humana – Uma Abordagem Integrada. 5. ed. Porto Alegre: Artmed, 2010. 3. Constanzo L. Fisiologia. 5.ed. São Paulo: Elsevier, 2014. Complementar: 1. Peterson S, Loring J. Human stem cell manual: A laboratory guide. 2. ed. São Paulo: Elsevier, 2012. 2. Hedrich H. The laboratory mouse. 2. ed. São Paulo: Elsevier, 2012. 3. Vianna LMA. Manual de fisiologia experimental. 1. ed. São Paulo: Yendis, 2009. 4. Valle S, Telles JL. Bioética e biorrisco: Abordagem transdisciplinar. 1. ed. Rio de Janeiro: Interciência, 2003. 5. Tharp GD, Woodman DA. Experiments in Physiology. 10. ed. Pearson, 2010. Nome do Componente Curricular: Fisiologia Humana Período: 3º semestre Pré-requisitos: não há Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: O aluno deverá adquirir conhecimentos necessários para entender o funcionamento 122 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia fisiológico dos sistemas que compõem o corpo humano. Específicos: Introdução à Respiração e Metabolismo celular. Sistema Muscular Esquelético, Sistema Nervoso Central. Sistema Nervoso Autônomo, Células sanguíneas. Física do Sangue. Sistema Cardiovascular. Sistema Respiratório. Sistema Digestório. Sistema Renal. Regulação da Temperatura Corporal. Endocrinologia. Processos Fisiopatológicos. Ementa: Introdução à Respiração e Metabolismo celular. Sistema Muscular Esquelético, Sistema Nervoso Central. Sistema Nervoso Autônomo, Células sanguíneas. Física do Sangue. Sistema Cardiovascular. Sistema Respiratório. Sistema Digestório. Sistema Renal. Regulação da Temperatura Corporal. Endocrinologia. Processos Fisiopatológicos. Conteúdo Programático: • Introdução à Fisiologia. • Sistema Nervoso Central: Organização do Sistema Nervoso; Funções Básicas das Sinapses; Neurotransmissores; Receptores Sensoriais; Dor e Sensações Térmicas; Reflexos Medulares. • Sistema Nervoso Autônomo: Simpático, Parassimpático. • Músculo Esquelético: Potenciais de Membrana e Potenciais de Ação, Contração do Músculo-esquelético, Controle da Função Muscular pelo Córtex Motor, Gânglios e Cerebelo. • Sistema Cardiovascular: Músculo Cardíaco e Excitação Rítmica do Coração, Controle do Fluxo Sanguíneo. • Sistema Respiratório: Ventilação e Circulação Pulmonar, Controle da Respiração. • Sistema Renal: Compartimentos dos Líquidos Corporais, Líquidos Extracelular e Intracelular, Formação de Urina pelos Rins. • Sistema Endócrino: Eixo Hipotalâmico-Hipofisário, Hormônios Metabólicos da Tireóide, Hormônios Córtico-Supra-Renais, Insulina, Glucagon e Diabetes Melito. • Metabolismo: Controle Hipotalâmico da Temperatura, Influência do Sistema Nervoso Autônomo. Metodologia de Ensino Utilizada: Oferecer aos alunos a oportunidade aprendizado sobre a fisiologia humana através de aulas expositivas. Recursos Instrucionais Necessários: 123 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Data-show e lousa. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia Básica: Silverthorn, Deen Unglaub. - Fisiologia Humana – Uma Abordagem Integrada. 5a ed., 2010 - Ed. Artmed. Guyton, A C.; Hall, E. J. - Fisiologia Humana e Mecanismos das Doenças. 6a ed., 1997 - Ed. Guanabara Koogan. Constanzo L. Fisiologia. 3a ed., 2007- Ed. Elsevier. Berne & Levi - Fisiologia. 6a ed., 1997 - Ed. Elsevier. Complementar: 1. McArdle, W.D.; Katch, F.I.; Katch, V.L. Fisiologia do Exercício: Energia, Nutrição e Desempenho Humano. 6a. ed. 2008. Guanabara Koogan. 2. Abbas, A.K.; Kumar, V; Fausto, N.; Aster, J.C. Robbins & Cotran – Patologia: Bases Patológicas das Doenças. 8a. ed. 2010. Elsevier. 3. Nelson, D.L.; CoX, M.M. Princípios de Bioquímica de Lehninger. 5a. ed. 2011. Artmed. 4. Carroll, Robert G - Fisiologia. 6a ed. 2007 - Ed. Elsevier 2007. 5. Douglas, Carlos R -Tratado de Fisiologia Humana Aplicada às Ciências Médicas. 6a ed., 2006 – Ed. Guanabara-Koogan. Nome do Componente Curricular: Fundamentos de Biologia Moderna Período: 1º semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introdução às bases bioquímicas, moleculares e fisiológicas da biologia moderna. 124 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Específicos: Conceitos fundamentais da bioquímica, biologia molecular e fisiologia humana; estrutura e função das principais biomoléculas; conceitos fundamentais de metabolismo e dos principais processos celulares envolvidos na fisiologia do organismo. Ementa: Introdução à Ciência da Biologia. Tópicos Introdutórios em Evolução, Diversidade e Bioética. Bases químicas. Estrutura e função das principais biomoléculas. Fundamentos do metabolismo energético. Replicação. Tradução e transcrição. Conteúdo Programático: 1) Introdução à Biologia. 2) Bases químicas. 3) Introdução à bioquímica. 4)Estrutura e função das principais moléculas biológicas. 5) Metabolismo. 6) Estrutura da célula procariota e eucariota. 7) Processo de replicação do DNA. 8) Processo de transcrição do RNA. 9) Processo de tradução de proteínas. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas teóricas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia Básica: 1. ALBERTS, Bruce et al. Fundamentos da biologia celular. 2.ed. Porto Alegre: ARTMED, 2006. 2. Stryer, L., Tymoczko, J. L., Berg, J. M. Bioquímica. 5a ed., Ed. Guanabara-Koogan 2004. 3. Silverthorn, Deen Unglaub. - Fisiologia Humana – Uma Abordagem Integrada. 5a ed., Ed. Artmed 2010. Complementar: 125 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 1. NELSON, David L; COX, Michael M. Lehninger princípios de bioquímica. 5.ed. Porto Alegre: Artmed, 2011. 2. Guyton, A C.; Hall, E. J. – Tratado de Fisiologia Médica. 11a ed., Ed. Elsevier 2011. 3. HARVEY LODISH ET AL. Biologia Celular e Molecular. Ed. Artmed, 2007. 4. Berne & Levi - Fisiologia. 6a ed., Ed. Elsevier 1997. 5. Berne & Levi - Fisiologia. 6a ed., Ed. Elsevier 1997. 6. Alberts, Bruce et.al. The Cell: problem book. 5th edition, Garland Science. Nome do Componente Curricular: Fundamentos de Engenharia Bioquímica Período: 4º semestre Pré-requisitos: Matemática Geral; Física Geral Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introduzir os princípios da engenharia de bioprocessos para Engenheiros, Químicos e Biólogos. Específicos: Apresentar os fundamentos da engenharia química aplicados à bioprocessos: balanços de massa e energia, fenômenos de transporte e cinéticas de reações químicas. Ementa: Os conceitos apresentados nesta disciplina são essenciais para as etapas de transformação de descobertas biológicas em produtos de interesse industrial. A partir dos fundamentos da engenharia (balanços de massa e energia, fenômenos de transporte e cinéticas de reações químicas) estabelecem-se as base para compreender e controlar às reações bioquímicas envolvidas nesse tipo de processo. Esses conhecimentos são fundamentais na definição e otimização das várias operações unitárias, tanto da fase de síntese (upstream), como de recuperação e purificação de produtos (downstream), que serão abordadas em disciplinas subsequentes. Conteúdo Programático: 1. Introdução; 2. Cálculos de engenharia; 3. Termodinâmica aplicada. 4. Balanços de massa; 5. Balanços de energia; 6. Transporte de quantidade de movimento; 7. Transporte de calor; 8. Transporte de massa; 9. Cálculo de reatores homogêneos. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas teóricas e exercícios práticos. Recursos Instrucionais Necessários: 126 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Salas de aula, computador e projetor. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia Básica: PM Doran, Bioprocess engineering principles. USA: Academic Press, 2012. 928p. ISBN 978-0122208515. RM Felder; RW Rousseau. PRINCIPIOS ELEMENTARES DOS PROCESSOS QUIMICO. Rio de Janeiro: LTC. 2005 (3a Ed). 604p. ISBN 978-8521614296. O Levenspiel. Engenharia das reações químicas. São Paulo: Editora Blücher, 2011. 563 p. ISBN 9788521202752. Complementar: 1. HW Blanch; DS Clark. Biochemical engineering. Boca Raton: CRC/Taylor & Francis, 1997. 702 p. ISBN 9780824700997. 2. J Villadsen , J Nielsen, G Lidén. Bioreaction Engineering Principles. Springer 2011 (3a Ed). 591p. ISBN 978-1441996879. 3. DM Himmelblau; JB Riggs. ENGENHARIA QUIMICA - PRINCIPIOS E CALCULOS. Rio de Janeiro:LTC. 2006 (7a Ed). 2006. 868p., ISBN 978-8521615026. 4. HS Fogler. Elementos de engenharia das reações químicas. 4.ed. Rio de Janeiro: LTC, 2009. 853 p. ISBN 9788521617167. 5. ML Shuler; F Kargi. Bioprocess engineering: basic concepts. 2nd ed. Upper Saddle River: Prentice Hall, 2002. 553 p. ISBN 0130819085. 6. Katho e Yoshida, Biochemical Engineering, Wiley 2009. ISBN 3527325360. Nome do Componente Curricular: Imunologia Aplicada Período: 7º semestre Pré-requisitos: Imunologia Geral Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos 127 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Gerais: Apresentar aos alunos as bases experimentais da imunologia. Específicos: Criar capacidade crítica nos alunos para a avaliação de dados experimentais. Ementa: Linfocinas, citocinas e sinalização celular. Imunoprofilaxia. Imunidade e tumores. Imunidade e transplantes. Doenças auto-imunes. Soros e vacinas. Anticorpos como ferramentas biotecnológicas. Conteúdo Programático: • Linfocinas e citocinas – usos como ferramentas terapêuticas • Sinalização celular – conhecer para interferir • Imunoprofilaxia – vacinas. • Tumores, transplantes – controle da resposta imune • Doenças auto-imunes e alergias – controle da resposta imune Anticorpos como ferramentas biotecnológicas – etapas de produção.. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e atividades práticas. Atividades extraclasse semanais em forma de lista de exercícios e seminários. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. 128 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bibliografia Básica: CALICH, V.L.G.; VAZ, C.A.C. Imunologia. Rio de Janeiro: Revinter, 2001. 260 p. ABBAS, A.K.; LICHTMAN, A.H. Imunologia básica: funções e distúrbios do sistema imunológico. Patricia Dias Fernandes (Trad.). 3ª ed. Rio de Janeiro: Elsevier, 2009. ABBAS, A.K.; LICHTMAN, A.H.; PILLAI, S. Imunologia celular e molecular. Claudia Reali (Trad.), et al. 6ª ed. Rio de Janeiro: Elsevier, 2008. Complementar: BENJAMINI, E.; COICO, R.; SUNSHINE, G. Imunologia. Rafael Silva Duarte (Trad.). 4 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, c2002. JANEWAY JR, C.A. et al. Imunobiologia: o sistema imune na saúde e na doença. Cristina Bonorino (Trad.). 5 ed. Porto Alegre: Artmed, 2002. GODING, JAMES W. Monoclonal antibodies: principles and practice. 3 ed. London: Academic Press, 1993. 492 p. ZHIQIANG AN. Therapeutic Monoclonal Antibodies: From Bench to Clinic. 1 ed. Wiley& Sons, 2009. ROITT, I.M.; BROSTOFF, J.; MALE, D. Imunologia. Ida Cristina Gubert (Trad.). 6ª ed. Barueri - SP: Manole, 2003. Nome do Componente Curricular: Imunologia Geral Período: 6º semestre Pré-requisitos: Biologia Molecular da Célula Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Apresentar aos alunos as bases, conceitos fundamentais e princípios gerais da imunologia. Específicos: Apresentar os tipos de resposta imune, os tecidos, as células e as moléculas de maior relevância, os princípios do reconhecimento próprio e não próprio. Ementa: Visão histórica. Sistema imune inato e adaptativo. Anticorpos: isotipos, recombinação somática. Antígeno. Sistema complemento. Órgãos e células do sistema imune. 129 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Resposta imune humoral e celular. Reações de Hipersensibilidade. Receptores celulares. Linfocinas e citocinas. Controle da resposta imune. Imunidade e infecção. Conteúdo Programático: • Propriedades gerais da resposta imune • Células e tecidos do sistema imune • Desenvolvimento de linfócitos, ativação celular de linfócitos B e T • Rede idiotípica. • Imunidade inata e imunidade adquirida, anticorpos e antígenos • MHC e apresentação de antígeno • Mecanismos efetores e sinalização celular. • Hipersensibilidade, tolerância, autoimunidade, alergia e anergia. • Imunidade e infecção Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas. Atividades semanais em forma de lista de exercícios e seminários. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. 130 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bibliografia Básica: CALICH, V.L.G.; VAZ, C.A.C. Imunologia. Rio de Janeiro: Revinter, 2001. 260 p. ABBAS, A.K.; LICHTMAN, A.H. Imunologia básica: funções e distúrbios do sistema imunológico. Patricia Dias Fernandes (Trad.). 3ª ed. Rio de Janeiro: Elsevier, 2009. ABBAS, A.K.; LICHTMAN, A.H.; PILLAI, S. Imunologia celular e molecular. Claudia Reali (Trad.), et al. 6ª ed. Rio de Janeiro: Elsevier, 2008. Complementar: BENJAMINI, E.; COICO, R.; SUNSHINE, G. Imunologia. Rafael Silva Duarte (Trad.). 4 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, c2002. JANEWAY JR, C.A. et al. Imunobiologia: o sistema imune na saúde e na doença. Cristina Bonorino (Trad.). 5 ed. Porto Alegre: Artmed, 2002. GODING, JAMES W. Monoclonal antibodies: principles and practice. 3 ed. London: Academic Press, 1993. 492 p. ZHIQIANG AN. Therapeutic Monoclonal Antibodies: From Bench to Clinic. 1 ed. Wiley& Sons, 2009. ROITT, I.M.; BROSTOFF, J.; MALE, D. Imunologia. Ida Cristina Gubert (Trad.). 6ª ed. Barueri - SP: Manole, 2003. Nome do Componente Curricular: Introdução à Bioinformática Período: 5o semestre Pré-requisitos: Biologia molecular da célula ; Lógica de programação Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 36 h Carga Horária Prática: 36 h Objetivos Gerais: Introduzir o aluno à biologia computacional por meio da apresentação e discussão dos modelos utilizados para a análise de sequências de proteínas, ácidos nucléicos e modificações pós-traducionais. Específicos: Fornecer subsídios para o entendimento da diversidade e complexidade de fenômenos em bioquímica e biologia molecular a partir da análise computacional de dados experimentais. Ementa: Este curso introdutório será fundamentalmente baseado na utilização de ferramentas bioinformáticas para o entendimento de diversos processos em biologia molecular e 131 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia bioquímica. Com o advento das estratégias analíticas empregadas em biologia moderna, a bioinformática tem se tornado uma ciência de fundamental importância, sobretudo para auxiliar a interpretação e atribuir significância ao grande volume de informação adquirido. Conteúdo Programático: • Bancos de dados em biologia; • Ferramentas bioinformáticas on line para o estudo de genes; • Genomas e transcriptomas; • Duplicação gênica e suas implicações evolutivas; • Matrizes PAM e BLOSUM e suas aplicações no alinhamento de sequências; • Pacote BLAST; • ClustalW • Hmmer • Aspectos introdutórios à espectrometria de massas; • Proteoma - o complemento protéico do genoma; • Introdução à proteômica computacional; • Análise proteômica in silico: Peptide Mass Fingerprint e MS/MS ion search; • Análise de modificações pós-tradicionais; • Interações proteína-proteína. • Bioestatística Metodologia de Ensino Utilizada: Aula expositiva e prática. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa, microcomputador e projetor multimídia. Laboratório computacional. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. 132 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bibliografia Básica: 1. Lesk, A. Introdução à bioinformática. Artmed, 2°ed., 2008. 2. Krawetz, S.A.; Womble, D.D. Introduction to bioinformatics – A theoretical and practical approach. Humana Press, 2003. 3. Ewens, W.J.; Grant, G.R. Statistical methods in bioinformatics- An introduction. Springer, 2nd ed., 2010. Complementar: 1. Pevsner, J. Bioinformatics and functional genomics. John Wiley & Sons Inc. 2 nd ed., 2009. 2. Samuelson, T. Genomics and bioinformatics. Cambridge, University Press. 2012. 3. Sanger, F. Sequences, sequences and sequences. Ann. Rev. Biochem. 57:1-28, 1988. 4. Green, E.D. Strategies for the systematic sequencing of complex genomes. Nat. Rev. Gen. 2:573-583, 2001. 5. Altschul, S. et al., Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Res. 25(17):3389-402, 1997. Nome do Componente Curricular: Introdução à Biologia de Sistemas Período: 6º semestre Pré-requisitos: Biologia molecular da célula Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 36h Carga Horária Teórica: 36h Objetivos Gerais: Reconhecer a importância do estudo de sistemas biológicos como sistemas, bem como do estudo integrado das partes que os compõem e aplicar os conhecimentos adquiridos para o entendimento de sistemas complexos, tais como vias metabólicas, redes de regulação gênica e de interação proteína-proteína. Específicos: Fornecer subsídios para o entendimento da diversidade e complexidade de fenômenos em bioquímica e biologia molecular a partir da análise de dados de sistemas-modelo em biologia. Ementa: A biologia sistêmica compreende o estudo interdisciplinar de sistemas biológicos, sobretudo com auxílio de modelos matemáticos e/ou computacionais. De forma mais 133 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia específica, em biologia sistêmica busca-se entender as propriedades que emergem da interação entre as partes, em detrimento ao entendimento (exclusivamente) do funcionamento destas de forma isolada. Ao longo deste curso introdutório serão apresentados temas-chave em biologia sistêmica, bem como artigos científicos que ilustram as propriedades de sistemas biológicos, tais como (a) modularidade, (b) robustez e (c) utilização recorrente de elementos de circuito (network motifs). Uma introdução à modelagem matemática de redes biológicas e identificação de padrões de interação será também apresentada. Tentativamente, os alunos serão familiarizados com o programa Cytoscape, para análise e integração de dados oriundos de redes de interação biológica Conteúdo Programático: • Introdução ao estudo de sistemas biológicos; 7. Variáveis em biologia; 8. Redes de interação biológica (redes de regulação gênica e metabólicas); 9. Estimativa de parâmetros, características e princípios operacionais de sistemas biológicos (design and operating principles) motivos de rede (network motifs); 10. Dinâmica e propriedade de redes; 11. Redes do tipo ‘mundo pequeno’; 12. Introdução à modelagem matemática de redes biológicas; 13. Tópicos emergentes em biologia sistêmica (genômica/transcriptômica/proteômica e metabolômica). Metodologia de Ensino Utilizada: Aula expositiva e prática. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa, microcomputador e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia Básica: Voit, E.O. A first course in systems biology. Garland Science, 2013. 134 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Alon, U. An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits (Chapman and Hall/CRC Press), 2006. Klip, E., Liebermeister, W.,Wierling, C., Kowald, A., Lehrach, H., Herwig, R. Systems biology - A textbook. Wiley-VCH, 2009. Complementar: Watts, D.J. Six degrees: the science of a connected age. W.W. Norton & Company, 2004. Milo, R., Shen-Orr, S., Itzkovitz, S., Kashtan, N., Chklovskii,D., Alon, U. Network motifs: simple building blocks of complex networks. Science, 298:824827, 2002. Alon, U. Biological networks:The tinkerer as an engineer.Science 301:1866-67, 2003. Kitano, H. Biological robusteness. Nat.Gen.5: 826-837, 2004. Bray, D. Molecular networks:the top-down view. Science 301, 1864-65, 2003. Nome do Componente Curricular: Introdução à Biotecnologia Período: 2º semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 36h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 36h Objetivos Gerais: Introduzir os conceitos básicos da biotecnologia e suas principais aplicações científicas e industriais. Específicos: Apresentar rapidamente as principais ferramentas usadas pela biotecnologia (modificação genética, biologia molecular, microbiologia industrial, engenharia bioquímica, etc.) e introduzir as principais linhas de desenvolvimento da área. Ementa: O curso propõe uma introdução à Biotecnologia Clássica e Moderna mediante a breve explanação das principais técnicas (biologia molecular, microbiologia industrial e engenharia bioquímica) envolvidas na manufatura de produtos biológicos e a apresentação de um conjunto representativos de bioprodutos e bioprocessos das áreas das Biotecnologias “Branca” (produtos de aplicação industrial ou ambiental), “Vermelha” (produtos com aplicação na saúde) e “Verde” (produtos com aplicação 135 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia agrícola). Conteúdo Programático: Introdução; Biotecnologia e medicina; A genética e biologia molecular na Biotecnologia; Microbiologia industrial e Engenharia bioquímica; Biotecnologia Ambiental; Biologia de Sistemas; Bioinformática; Biocombustíveis e biorrefinarias; Produção de enzimas; Biofármacos e vacinas; Desenho racional de inibidores; Biossegurança; Engenharia Biomédica e Engenharia tecidual ; Células tronco; Mercado, Patentes, Regulação; Seminários dos alunos. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas. Seminários de áreas temáticas ministrados por alunos. Relatórios das aulas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula, computador e projetor. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia Básica: R Rennerberg. Biotechnology for beginners. China: Academic Press, 2008, 349p. ISBN 978-0-12-373581-2. N Lima; M Mota (Coord.). Biotecnologia: fundamentos e aplicações. Lisboa: Lidel, 2003. 505 p. ISBN 9789727571970. WJ Thieman; MA Palladino. Introduction to Biotechnology. Pearson Education, 2013 , 3rd Edition, 408p. ISBN 978-0321766113. Complementar: Schmidell, Willibaldo (Coord.) et al. Biotecnologia industrial: engenharia química. São Paulo: Edgard Blucher, 2001. v.2. 541 p. ISBN 9788521202790 . Lima, Urgel de Almeida (Coord.) et al. Biotecnologia industrial: processos fermentativos e enzimáticos. São Paulo: Edgard Blücher, 2001. v.3. 593 p. ISBN 9788521202806. 2ª Reimpressão - 2007; 4ª reimpressão - 2011. Bon, Elba P. S.; Ferrara, Maria Antonieta; Corvo, Maria Luísa (Ed.). Enzimas em 136 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia biotecnologia: produção, aplicações e mercado. Rio de Janeiro: Interciência, 2008. 506 p. ISBN 9788571931893. JE Smith. Biotechnology. 5ed. Cambridge 2009. DP Clark, NJ Pazdernik. Biotechnology. Academic Cell Update. Elsevier 2012. Nome do Componente Curricular: Introdução à Ecologia Período: 5o semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introdução ao estudo da Ecologia. Específicos: Introdução aos fundamentos do estudo dos diversos níveis de organização das relações entre os seres vivos e o meio ambiente. Ementa: Recursos naturais e ecossistemas. Interações entre as espécies. Fluxo de energia em ecossistemas. Biodiversidade e ecossistemas. Hiperciclos ecológicos. Fotossíntese e sequestro de carbono. Ecologia e Ciência do Sistema Terrestre. Ecologia e Agricultura sustentável. Evolução e ecologia. Conteúdo Programático: Meio ambiente. Fluxo de energia em ecossistemas. Hiperciclos ecológicos. Fotossíntese e sequestro de carbono. Ecologia de sistemas. Ciência do Sistema Terrestre. Agricultura sustentável. Evolução Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e atividades extraclasse semanais em forma de lista de exercícios. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular 137 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: MILLER, T., Essentials of Ecology. Cengage 2005. TOWNSEND, C.R.; BEGON, M.; HARPER, J. L. Fundamentos em Ecologia. 2ª Ed. PortoAlegre:Artmed, 2006. PURVES, W.K.; SADAVA, D.; ORIANS, G.H.; HELLER, H.C. Vida: A ciência da Biologia. Vol II: Evolução, diversidade e ecologia. Porto Alegre: Artmed, 2005. Complementar: RICKLEFS,R.E., A ECONOMIA DA NATUREZA, Guanabara 2010 BARRET,G.E., ODUM, E.P., Fundamentos de Ecologia, 5ª Ed. Thomson Pioneira, 2007. VALLERO, D.A. Environmental Biotechnology: A Biosystems Approach. Elsevier, Academic Press, 2010. FRANKHAM, Richard; BALLOU, Jonathan D.; BRISCOE, David A. Fundamentos da genética da conservação. SBG, 2008. PRIMACK, Richard B., 1950-; RODRGUES, Efraim. Biologia da conservação. Londrina: Planta, 2006. Nome do Componente Curricular: Laboratório de Biologia Molecular e Celular Período: 4o semestre Pré-requisitos: Biologia Molecular da Célula Carga Horária Total: 36h Carga Horária Prática: 36h Carga Horária Teórica: 0h Objetivos Gerais: Apresentar aos alunos as bases experimentais para cultura de células eucarióticas, abordagem de questões moleculares em células e tecidos. Mostrar aos alunos técnicas para visualização e localização de proteínas em células e tecidos usando anticorpos monoclonais e policlonais usando princípios físicos e químicos, técnicas de identificação e dosagem de moléculas em solução usando anticorpos. Desenvolver competência técnica para resolução de problemas práticos em biotecnologia celular e 138 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia molecular. A ênfase desse curso é a compreensão de conceitos, discernimento técnico e resolução de problemas práticos durante a experimentação. Específicos: Ao final da unidade curricular o aluno deverá estar apto a executar criticamente procedimentos práticos de abordagem celular e molecular. Ementa: Introdução à Cultura de Células. Transfecção. Western-Blot. Imunoprecipitação. Imunofluorescência. ELISA. Conteúdo Programático: Cultura de células – diferentes meio de cultura, componentes essenciais de meios de cultura, uso de soro, periodicidade de passagem/repique. Transfecção e expressão de genes exógenos em células. Eletroforese de proteínas e western blot Imunoprecipitação e western blot Imunofluorescência em células e tecidos Imuno ensaio de detecção de moléculas em suspensão - ELISA Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e atividades práticas. Atividades extraclasse semanais em forma de lista de exercícios e seminários. Recursos Instrucionais Necessários: Laboratório com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido no Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: MANIATIS, T.; FRITSCH, E.F.; SAMBROOK, J. Molecular cloning: a laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory, 1982. ALBERTS, A.; BRAY, D.; JOHNSON, A.; LEWIS, J.; RAFF, M.; ROBERTS, K.; WALTER, P. Fundamentos da Biologia Celular. Editora Artmed 1999. ABBAS, ABUL K.; LICHTMAN, ANDREW H., Imunologia Molecular e Celular. Editora Elsevier 2012. 139 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Complementar: 1. DOUDNA, JENNIFER A.; DOUDNA, JENNIFER A.; M. COX, MICHAEL, Biologia Molecular – Princípios e Técnicas. Artmed, 2012. 2. ABBAS, ABUL K.; LICHTMAN, ANDREW H., Imunologia Básica. Editora Elsevier 2013. 3. BRAY, DENNIS; HOPKIN, KAREN; ALBERT, BRUCE, Fundamentos da Biologia Celular. Artmed, 2012. 4. Lodish, H. e cols. Biologia Celular e Molecular. 5a ed., Ed. Artmed 2005. 5. KARP, Gerald. Cell and molecular biology: concepts and experiments. 5 ed. 2008. Nome do Componente Curricular: Laboratório de Bioquímica Analítica Período: 6o semestre Pré-requisitos: Bioquímica Analítica Carga Horária Total: 36 h Carga Horária Prática: 36 h Carga Horária Teórica: 0 h Objetivos Gerais: Introdução aos principais métodos da bioquímica analítica. Específicos: Laboratório introdutório às principais técnicas analíticas na biotecnologia, incluindo espectroscopia, cromatografia, espectrometria de massas e ressonância magnética nuclear. Ementa: Espectroscopia UV/VIS. Métodos Cromatográficos. HPLC. Interpretação de resultados de espectroscopia IR e CD, RMN. Espectrometria de Massas. Métodos de extração. Conteúdo Programático: Espectroscopia UV/VIS. Métodos Cromatográficos. HPLC. Espectroscopia IR Espectroscopia CD Ressonância Magnética Nuclear. Espectrometria de Massas. Métodos de extração. 140 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Metodologia de Ensino Utilizada: Experimentos em laboratório. Recursos Instrucionais Necessários: Laboratório. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido no Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: HOLME, D.; PECK, H. Analytical Biochemistry. Addison Wesley 1998. BURTIS, C.; ASHWOOD, E.; BURNS, D. Tietz Textbook of Clinical Chemistry and Molecular Diagnostics. 4th Ed. Elsevier Saunders, 2006. PATRINOS, G.; ANSORGE, W. Ed. Molecular Diagnostics. 2nd Ed. Elsevier 2010. Complementar: 2. STRYER, L. Bioquímica. Ed. Guanabara-Koogan, 2007. 3. NELSON, D.L.; COX, M.M. Lehninger princípios de bioquímica. 5a ed. Porto Alegre: Artmed, 2011. 4. VOET, VOET, Bioquímica, 4a ed. SARAIVA, 2013. 5. CAMPBELL, M. K. Bioquímica, 3ª edição, Artmed, 2000. 6. MARZZOCO, Anita; TORRES, Bayardo Baptista. Bioquímica básica. 3 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2007. Nome do Componente Curricular: Laboratório de Bioquímica Período: 3º semestre Pré-requisitos: Bioquímica I, Biologia Molecular do Gene Carga Horária Total: 72 h Carga Horária Prática: 72 h Carga Horária Teórica: 0 h Objetivos Gerais: Proporcionar um curso prático de bioquímica e biologia molecular aos alunos do BCT para familiarizar estes às técnicas básicas da tecnologia de DNA recombinante e da produção de proteínas recombinantes. Específicos: 141 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Introduzir estudantes a métodos experimentais, incluindo considerações de segurança biológica. Aplicação de técnicas básicas em um laboratório de bioquímica e biotecnologia molecular: Clonagem, expressão, purificação e análise de proteínas recombinantes. Ementa: 1. Segurança Biológica e Química. 2. Métodos para o trabalho com microorganismos. 3. Métodos e técnicas da tecnologia de DNA recombinante. 4. Métodos de produção de proteínas recombinantes. 5. Métodos analíticos da bioquímica de proteínas. Conteúdo Programático: • Preparação de tampões, meios e soluções • PCR, Purificação de DNA, Tecnologia de DNA recombinante • Transformação de E.coli • Expressão de proteínas em E.coli • Extração e purificação de proteínas Metodologia de Ensino Utilizada: Seminários preparatórios e prática de bancada. Recursos Instrucionais Necessários: Laboratório Nível de Segurança Biológica 1 equipado, Monitores estudantis, em torno de R$ 50,00 por aluno para gastos materiais. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia Básica: LEHNINGER. Princípios de Bioquímica Ed. Sarvier, 2007. LUBERT STRYER. Bioquímica Ed. Guanabara Koogan, 2007. Alberts, A.; Bray, D., Johnson, A, Lewis, J., Raff, M., Roberts, K & Walter, P. Fundamentos da Biologia Celular. Editora Artmed 1999. Complementar: 2. HARVEY LODISH ET AL. Biologia Celular e Molecular. Ed. Artmed, 2007. 3. DONALD VOET & JUDITH G. VOET. Bioquímica Ed. Artmed, 2007. 142 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 4. SIMÕES, Jose A.Martinho et al. Guia do laboratório de química e bioquímica. Lidel, 2000. 5. Brown, T.A. Gene Cloning and DNA Analysis. 6a Ed. Willey, 2010. 6. Barker K. At the Bench: A Laboratory Navigator, Updated Edition. 2a Ed Cold Spring Harbor Laboratory Press 2005. Nome do Componente Curricular: Laboratório de Engenharia Bioquímica Período: 6o semestre Pré-requisitos: Engenharia Bioquímica I Carga Horária Total: 36h Carga Horária Prática: 36h Carga Horária Teórica: 0h Objetivos Gerais: Permitir ao aluno integrar os conceitos apresentados na microbiologia aplicada, bioquímica do metabolismo e nas várias disciplinas de engenharia bioquímica, mediante experimentos realizados em escala de bancada, em frascos e biorreator. Específicos: Através das práticas laboratoriais, apresentar ao aluno as técnicas laboratoriais empregadas na pesquisa, no desenvolvimento e na otimização de bioprocessos de interesse industrial. Ementa: A disciplina pretende consolidar importantes conceitos teóricos aprendidos em disciplinas de engenharia bioquímica, microbiologia e bioquímica, mediante uma série de experimentos realizados em escala de bancada (frascos e biorreator). Esses conceitos são essenciais no desenvolvimento e na otimização de bioprocessos de interesse industrial. Os experimentos concentram-se nas operações unitárias da fase de síntese do produto (upstream), i.e., cinéticas enzimática e microbiana, modo de operação e caracterização de biorreatores, bem como naquelas operações características da etapa de separação e purificação de bioprodutos (downstream). Conteúdo Programático: 1. Cinética enzimática; 2. Cinética microbiana em frascos; 3. Análise de dados; esterilização de equipamentos; 4. Biorreatores; 5. Transferência de oxigênio; 6.Tempo de mistura; 7. Monitoramento e controle de bioprocesso; 8. Separação de bioproduto; 9. Purificação de bioproduto Metodologia de Ensino Utilizada: Planejamento e realização de experimentos laboratoriais. Relatórios de ensaios. Recursos Instrucionais Necessários: Laboratório com lousa e projetor multimídia. 143 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido no Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: PELCZAR M.; CHAN E.C.S.; KRIEG N.R. Microbiologia, 2a ed., vol.1, Makron Books, São Paulo, 1997. PESSOA A; KILIKIAN B. Purificação de processos biotecnológicos. Manole, 2005, 444p. SHULER M.L.; KARGI F. Bioprocess engineering: basic concepts. BioprocessEngineering: Basic Concepts, 2ndEdition, Prentice Hall,2001, 576p. Complementar: SCHMIDEL W.; LIMA U.A.; AQUARONE E.; BORZANI W. Biotecnologia industrial. vol 2: Engenharia Bioquímica, Edgard Blucher, 2000. Blanch HW; Clark DS. Biochemical engineering. Boca Raton: CRC/Taylor & Francis, 1997. 702 p. ISBN 9780824700997 Nielsen J, Villadsen J, Lidén, G. Bioreaction Engineering Principles. Springer 2011 (3a Ed). 591p. ISBN 978-1441996879. RATLEDGE C.; KRISTIANSEN B. Basic Biotechnology. Cambridge University Press; 3rd edition, 2006 Fonseca MM; Teixeira JA. Reatores biológicos: fundamentos e aplicações. Lisboa: Lidel Edições Técnicas, 2007, 483p. (Colecão Biotec) ISBN 9727573665 Nome do Componente Curricular: Laboratório de Microbiologia Período: 4º semestre Pré-requisitos: Microbiologia Geral Carga Horária Total: 36h Carga Horária Prática: 36h Carga Horária Teórica: 0h Objetivos Gerais: Introdução à prática do laboratório de microbiologia. 144 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Específicos: Este curso tem como objetivo expor técnicas básicas de manipulação, identificação, quantificação de microrganismos. Ementa: Métodos de isolamento e identificação microbiana. Manipulação correta de materiais potencialmente contaminados e normas de biossegurança. Estudo de métodos de assepsia, desinfecção e esterilização de materiais utilizados em laboratório microbiológico. Conteúdo Programático: • Introdução à formas de manipulação de microrganismos em ambiente estéril. • Isolamento de Microrganismos. • Identificação de microrganismos. • Biossegurança. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas prática de laboratório. Recursos Instrucionais Necessários: Laboratório com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia Básica: TORTORA, G. J.; VAINSTEIN, M. H.; SCHRANK, A. (Cons., super. , rev.técn.). Microbiologia. Porto Alegre: Artmed, 2008. MADIGAN, M.T.; MARTINKO, D.; CLARK. Microbiologia de Brock. 12 ed. Porto Alegre: Artmed, 2010 BLACK, J.G. Microbiologia. Fundamentos e perspectivas. 4 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2002. Complementar: 145 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 1. TRABULSI, L. R.; ALTERTHUM, F. Microbiologia. 5 ED. São Paulo: Atheneu. 2008. 2. VERMELHO, A.B.; BASTOS, M.C.F.; SÁ, M.H.B. Bacteriologia geral. Guanabara Koogan, 2008. 3. WINN JR., W.; et.al. Koneman diagnostic microbiológico. 6 ed. Guanabara Koogan, 2008. 4. ZAITZ, C. Compêndio de Micologia Médica. Rio de Janeiro: Medsi. 1998. 5. SCHAECHTER, M.; INGRAHAM, J.L.; NEIDHARDT, F.C. Micróbio: uma visão geral. Artmed, 2010. Nome do Componente Curricular: Língua Brasileira de Sinais – LIBRAS Período: 7o semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 36h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 36h Objetivos Introdução à Língua Brasileira de Sinais como o objetivo de que os discentes tenham conhecimento suficiente dessa língua para capacitar a comunicação com portadores de deficiência auditiva. Ementa: Introdução à Língua de Sinais Brasileira – Libras. Características básicas da fonologia. Noções básicas de léxico, de morfologia e de sintaxe. Noções de variação. Prática de Libras. Conteúdo Programático: Breve introdução à surdez Alfabeto manual ou dactilológico . Sinal-de-Nome. Características básicas da fonologia de Libras. Sistematização do léxico. Números. Expressões socioculturais. Substantivos, adjetivos, pronomes. Noções de tempo e de horas. Aspectos sócio-lingüísticos: variação em Libras. Prática de Libras. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e atividades práticas. 146 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: BRASIL. Ministério da Educação e do Desporto/Secretaria de Educação Especial. Língua Brasileira de Sinais - LIBRAS. 1998. v. 111 (série Atualidades pedagógicas.n.4). BRITO, Lucinda Ferreira. Por uma gramática de línguas de sinais. Rio de Janeiro, Tempo Brasileiro, 1995. COUTINHO, Denise. LIBRAS e Língua Portuguesa: Semelhanças e diferenças. Arpoador, João Pessoa , 2000. Complementar: 1. DAMÁZIO, Mirlene F.M. (Org.). Língua de sinais brasileira no contexto do ensino superior: Termos técnicos científicos. Uberlândia/MG: Editora Graça Hebrom. 2005. 2. CAPOVILLA, F. C., RAPHAEL, W. D., Dicionário Enciclopédico Ilustrado Trilingue da Língua de Sinais Brasileira, v. I e II. São Paulo, Edusp, 2001. 3. FELIPE, Tânia A. Libras em contexto. Brasília, MEC/SEESP No 7, 2007. 4. LABORIT, Emanuelle. O Vôo da Gaivota. Paris - Copyright Éditions, 1994. 5. QUADROS, Ronice Muller de Obra. Língua de sinais brasileira: estudos linguísticos. Porto Alegre, 2004. Nome do Componente Curricular: Lógica de Programação Período: 1º semestre Pré-requisitos: Não há Carga horária total: 72h Carga Horária Prática: 30h Carga Horária Teórica: 42h 147 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Objetivos Geral: Propiciar o aprendizado de introdução á computação e lógica de programação de computadores. Específicos: Ao final do curso, os estudantes devem ser capazes de projetar algoritmos e de desenvolver programas. Ementa: Introdução à computação; Noções de lógica; Conceitos e representação de algoritmos; Constantes e variáveis; Estruturas de controle; Vetores; Matrizes; Registros e uniões; Procedimentos, Funções com passagem de parâmetros por valor e referência; Recursividade; Introdução à linguagem de programação; Conteúdo Programático: Parte 1. Introdução a computação; Introdução a lógica de programação; Noções de lógica; Algoritmos; Pseudocódigos e fluxogramas; Teste de mesa. Parte 2. Elementos básicos de algoritmos: Constantes, variáveis simples e compostas; Tipos enumerados; Comandos de entrada e saída; Expressões, estruturas sequenciais e condicionais; Estruturas de repetição; Funções. Parte 3. Linguagem de programação C (padrão ANSI): Sintaxe da linguagem; Modularização: procedimentos e funções (passagem de parâmetros por valor e referência); Funções recursivas. Vetores, matrizes, registros e uniões; Busca sequencial e binária em vetores; Metodologia de Ensino Utilizada: Utilização da linguagem C++ no contexto de programação estruturada; Aulas expositivas sobre o desenvolvimento de algoritmos e aulas práticas em laboratório para implementação dos algoritmos. Extensa prática de programação extra classe (20 horas), coordenada com o auxílio da ferramenta de ensino à distância Moodle e com o apoio de monitores. A metodologia de ensino baseada na resolução de problemas (Problem Based Learning) será amplamente utilizada. O professor, após apresentar a teoria necessária, irá propor problemas e atuará apenas como facilitador/problematizador junto aos alunos na resolução do problema. Recursos Instrucionais Necessários: Laboratório de computação equipado com o sistema operacional Linux e com o compilador gcc. Ambiente integrado de desenvolvimento Codeblocks. Projetor de slides. Sala de aula com quadro-negro. Ambiente de apoio pedagógico Moodle. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, 148 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia Básica: Forbellone, André L.V; Eberspache, Henri F. Lógica de programação: a construção de algoritmos e estruturas de dados. 3.ed. São Paulo: Pearson, 2005. 218 p. ISBN 978-85-7605-024-7.; Feofiloff, Paulo. Algoritmos em linguagem C. Rio de Janeiro: Elsevier, 2009. 208 p. ISBN 978-85-352-3249-3.; Mokarzel, Fábio; Soma, Nei. Introdução à ciência da computação. Rio de Janeiro: Elsevier, 2008. 429 p. ISBN 978-85-352-1879-4.; Complementar: Mizrahi, Victorine Viviane. Treinamento em linguagem C: módulo profissional. Säo Paulo: Makron, c1993. 225 p. ISBN 978-85-346-0109-2.; Deitel, Paul; Deitel, Harvey. C: como programar. *C: how to program+. Tradução: Daniel Vieira. 6 ed. São Paulo: Pearson Prentice Hall, 2011. 818 p. ISBN 978-85-7605934-0.; KERNIGHAN, Brian W; VIEIRA, Daniel; RITCHIE, Dennis M. C: a linguagem de programação padrão ANSI. Rio de Janeiro: Campus, 1989. ISBN 978-85-7001-586-0.; FARRER, Harry et al. Algoritmos estruturados. 3.ed. Rio de Janeiro: LTC, 1999. 284 p. ISBN 978-85-216-1180-6. ; Horowitz, Ellis; Sahni, Sartaj; Rajasekaran, Sanguthevar. Computer algorithmics/C++. New York: Computer Science, 1997. 769 p. ISBN 978-0-7167-8315-2. Nome do Componente Curricular: Matemática Geral Período: 2º semestre Pré-requisitos: Cálculo em uma Variável Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introdução conceitual à matemática superior. Específicos: Conhecimento de conceitos fundamentais sobre vetores, matrizes e suas operações. Introdução ao cálculo de várias variáveis. Conceitos básicos de números complexos. Fundamentos de séries e equações diferenciais ordinárias. Ementa: Vetores, matrizes, determinantes e sistemas lineares. Derivada de funções de várias 149 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia variáveis. Números complexos, séries e equações diferenciais. Conteúdo Programático: 1. Vetores. 2. Matrizes. 3. Determinantes e sistemas lineares. 4. Derivada de funções de várias variáveis. 5. Números complexos 6. Séries. 7. Equações diferenciais. Metodologia de Ensino Utilizada: Cátedras. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula; data-show. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia Básica: 1. WELTNER, K. et al. Mathematics for physicists and engineers: fundamentals and interactive study guide. Berlin: Springer, 2009. 2. LEITHOLD, L. O cálculo com geometria analítica. v. 1. 3ª ed. SãoPaulo:Harbra, 1990. 3. SIMMONS, G. F. Cálculo com geometria analítica. v. 1. 1ª ed. SãoPaulo:Pearson, 2008. Complementar: 1. Boulos, P. ; Abud, Z. I. Cálculo Diferencial e Integral. São Paulo :Pearson, 2006. vol. 2 . 2. Flemming, D. M. ; Gonçalves, M. B. Cálculo B: Funções de Várias Variáveis, Integrais Múltiplas, Integrais Curvilíneas e de Superfície. 2ª Ed. São Paulo, Pearson, 2007. 3. Simmons, G. F. Cálculo com Geometria Analítica. 1ªed. São Paulo:Makron Books, vol. 2. 4. Lima, E., L., Geometria Analítica e Álgebra Linear, Coleção Matemática Universitária, IMPA, 2a. Edição, 201. 5. ZILL, D. G.; CULLEN M. R. Equações diferenciais. 3ªed. São Paulo: Makron, 2001. v. 1. 150 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Nome do Componente Curricular: Microbiologia Aplicada e Industrial Período: 3º semestre Pré-requisitos: Microbiologia Geral Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Estudo Introdutório aos Fundamentos da Microbiologia Aplicada e Industrial. Específicos: Estudo do metabolismo dos microrganismos e aplicações para processos e produtos biotecnológicos. Ementa: Histórico e novas tendências em bioprocessos/ microbiologia industrial; Morfologia e Bioquímica de procariotos e eucariotos; Fases de um processo microbiológico genérico; Microrganismos de interesse industrial e ambiental; Principais substratos industriais Rotas metabólicas de interesse industrial e ambiental; Fermentações; Aminoácidos; Antibióticos; Biotransformações; Biotecnologia Alimentícia. Conteúdo Programático: • Metabolismo energético • Cultivo e crescimento microbiano fases de um processo microbiológico genérico • Microrganismos de interesse industrial e ambiental • Substratos industriais • Rotas metabólicas de interesse industrial e ambiental • Fermentações • Aminoácidos • Antibióticos • Biotransformações • Biotecnologia Alimentícia. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas. Recursos Instrucionais Necessários: 151 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Sala de aula com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia Básica: MADIGAN, M.T.; MARTINKO, D.; CLARK. Microbiologia de Brock. 12 ed. Porto Alegre: Artmed, 2010 TORTORA, G. J.; VAINSTEIN, M. H.; SCHRANK, A. (Cons., super. , rev.técn.). Microbiologia. Porto Alegre: Artmed, 2008. TRABULSI, L. R.; ALTERTHUM, F. Microbiologia. 5 ED. São Paulo: Atheneu. 2008. Complementar: 1. BORZANI, W.; SCHMIDELL, W., LIMA, U.A.; AQUARONE, E. Biotecnologia Industrial. Volume 1. São Paulo: Edgard Blucher, 2001 2. VERMELHO, A.B.; BASTOS, M.C.F.; SÁ, M.H.B. Bacteriologia geral. Guanabara Koogan, 2008. 3. WINN JR., W.; et.al. Koneman diagnostic microbiológico. 6 ed. Guanabara Koogan, 2008. 4. ZAITZ, C. Compêndio de Micologia Médica. Rio de Janeiro: Medsi. 1998. 5. WESSNER, DUPONT. Microbiology. Willey 2013. Nome do Componente Curricular: Microbiologia Geral Período: 3º semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72 h Objetivos Gerais: Fornecer informações básicas de bactérias, fungos e vírus, enfocando estrutura e fisiologia, abordando suas relações com outros organismos e interferência no meio ambiente. Trabalhar com exercícios de modo a desenvolver a formação dos alunos. 152 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Específicos: Incentivar a discussão científica entre os alunos nas diferentes áreas da microbiologia geral e específica. Estimular os alunos a fazerem críticas científicas dos trabalhos apresentados nas diferentes áreas da microbiologia, e não somente na área de concentração do estudo desenvolvido pelo aluno. Desenvolver e aprimorar as técnicas de apresentação de seminários, de forma a fomentar as discussões sobre os avanços da microbiologia. Ementa: Morfologia e estruturas bacterianas. Nutrição e crescimento bacteriano. Metabolismo bacteriano. Genética bacteriana. Morfologia e estruturas de Archaeas. Nutrição e crescimento de Archaeas. Técnicas moleculares para Identificação de Microrganismos. Biologia dos fungos levuriformes e filamentosos. Nutrição e crescimento fúngico. Morfologia e estruturas de protozoários. Nutrição e crescimento dos protozoários. Métodos de controle microbiano. Propriedades gerais dos vírus e sua replicação. Patogênese bacteriana, fúngica e viral. Origem e Evolução dos vírus. Terapia Gênica. Príons. Conteúdo Programático: Morfologia e estruturas bacterianas. Nutrição e crescimento bacteriano. Metabolismo bacteriano. Genética bacteriana. Técnicas moleculares para Identificação de Microrganismos. Biologia dos fungos levuriformes e filamentosos. Nutrição e crescimento fúngico. Métodos de controle microbiano. Biologia de Protozoários. Propriedades gerais dos vírus e sua replicação. Origem e Evolução dos vírus. Terapia Gênica. Patogênese viral, bacteriana, fúngica e viral. Príons. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas com fomento de discussões. Recursos Instrucionais Necessários: Multimídia para as aulas teóricas. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia 153 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Básica: Madigan, M.T. et al. Microbiologia de Brock. São Paulo: Prentice Tortora, G.J. et al. Microbiologia. Porto Alegre: ArtMed, 10ª ed., 2010. SCHAECHTER, M.; INGRAHAM, J.L.; NEIDHARDT, F.C. Micróbio: uma visão geral. Artmed, 2010. Complementar: 1. TRABULSI, L. R.; ALTERTHUM, F. Microbiologia. 5 ED. São Paulo: Atheneu. 2008. 2. ZAITZ, C. Compêndio de Micologia Médica. Rio de Janeiro: Medsi. 1998. 3. VERMELHO, A.B.; BASTOS, M.C.F.; SÁ, M.H.B. Bacteriologia geral. Guanabara Koogan, 2008. 4. WINN JR., W.; et.al. Koneman diagnostic microbiológico. 6 ed. Guanabara Koogan, 2008. 5. BLACK, J.G. Microbiologia. Fundamentos e perspectivas. 4 ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2002. Nome do Componente Curricular: Modelagem Molecular Período: 7º semestre Pré-requisitos: Biologia Estrutural Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 36 h Carga Horária Teórica: 36h Objetivos Gerais: Introdução à teoria e prática da modelagem molecular. Específicos: Curso teórico-prático de introdução aos principais conceitos da modelagem molecular desde a análise de campos de forças moleculares aos principais métodos de optimização de estruturas biológicas. Ementa: Métodos de bioinformática estrutural. Modelagem molecular. Mecânica Molecular. Dinâmica molecular. Cálculos energéticos. Desenho racional de fármacos. Conteúdo Programático: Modelos moleculares Campos de Forças Moleculares Mecânica Molecular Potenciais híbridos Métodos de otimização 154 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Análise de modos normais Simulações de dinâmica molecular. Cálculos energéticos Desenho racional de inibidores Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e atividades práticas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula o com lousa e projetor multimídia. Laboratório computacional. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia Básica: LEACH, A.R. Molecular Modelling, Principles and Applications. 2nd Ed. Prentice Hall 2001. SCHLICK, T. Molecular Modeling and Simulation. Springer 2002. CRAMER, C.J. Computational Chemistry. Wiley 2002. Complementar: FIELD, M.J. A Practical Introduciton to the Simulation of Molecular Systems. JENSEN, J.H. Molecular Modeling. CRC Press 2012. HINCHLIFFE. Molecular Modelling for Beginners. 2a Ed. Wiley 2011. BRANDEN, C.; TOOZE, J. Introduction to Protein Structure, 2nd Ed., Garland,1999. MILLER, TANNER. Essentials of Chemical Biology. Structure and Dynamics of Biological Macromolecules. Wiley 2013. 155 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Nome do Componente Curricular: Modelos Animais Período: 7º semestre Pré-requisitos: Biotecnologia Animal Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introdução à teoria e prática de trabalho com modelos animais. Específicos: Introdução ao trabalho experimental com diversos modelos animais incluindo transgênicos. Ementa: Introdução de modelos experimentais em medicina e biologia. Roedores. C. elegans. D. melanogaster. Zebra fish. Transgenia. Nocauteamento gênico. RNA de interferência. Morfolinos. Conteúdo Programático: D.melanogaster. E. elegans. Zebrafish. Transgênicos. Knock downs e knock outs. RNAi. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala com lousa e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. 156 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bibliografia Básica: 1 COLLARES, T. Animais transgênicos - princípios & métodos. Sociedade brasileira de genética, 2005. GONÇALVES, P.B.D.; FIGUEIREDO, J.R.; FREITAS, V.J.F. Biotécnicas Aplicadas à Reprodução Animal. Roca, 2008. CASTILHO, L.R.; AUGUSTO, E.F.P.; MORAES, A. Tecnologia de Cultivo de Células Animais - de Biofármacos à Terapia Gênica. Roca, 2008. Complementar: I. ALBERTS, A.; BRAY, D., JOHNSON, A, LEWIS, J., RAFF, M., ROBERTS, K.; WALTER, P. Fundamentos da Biologia Celular. 1999. Editora Artmed – Porto Alegre – RS; 7. LODISH, H. et al. Biologia Celular e Molecular. 2005. 5a ed., Ed. Artmed; 8. LEHNINGER, A.L.; NELSON, D.I.; COX, M.M. Princípios de Bioquímica. 2007. 4a ed. Ed. Sarvier. 9. R Rennerberg. Biotechnology for beginners. China: Academic Press, 2008. 10. JE Smith. Biotechnology. 5ed. Cambridge 2009. Nome do Componente Curricular: Proteômica Período: 7º semestre Pré-requisitos: Bioquímica Analítica; Introdução à Bioinformática Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 36h Carga Horária Teórica: 36h Objetivos Gerais: Espera-se que ao final deste curso o aluno seja capaz de entender a importância da proteômica como ciência e da espectrometria de massas como estratégia analítica no entendimento da complexidade dos mais diversos processos biológicos, bem como da heterogeneidade estrutural inerente às proteínas eucarióticas. Específicos: • Entender como evoluíram as metodologias de análises de proteínas desde a técnica desenvolvida por Frederick Sanger à utilização de espectrometria de massas para o sequenciamento de peptídeos/proteínas; • Discutir os princípios básicos relacionados às propriedades físico-química dos aminoácidos, que permitem a sua análise por espectrometria de massas; • Abordar, de forma introdutória, o funcionamento de um espectrômetro de massas e a suas aplicações em proteômica; • Introduzir o conceito de análises “ômicas” (de larga escala) e reconhecer sua 157 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia importância na ciência atual. • Familiarizar-se com as principais plataformas bioinformáticas de análise de dados proteômicos de larga-escala. Ementa: O estudo do complemento protéico do genoma (proteoma) tem se consolidado como ciência e revelado importantes desafios na biologia contemporânea. O entendimento da proteômica como ciência passa obrigatoriamente pela compreensão de características físico-químicas de proteínas e peptídeos, bem como pelos conceitos já bem estabelecidos de análise de dados em larga-escala, tais como na genômica e na transcriptômica. As plataformas bioinformáticas em proteômica tem evoluído concomitantemente com as novas tecnologias de aquisição de dados, desta forma, torna-se de fundamental importância entender os algoritmos bioinformáticos que norteiam a análise, identificação e sequenciamento de peptídeos por espectrometria de massas. Conteúdo Programático: Aspectos introdutórios a química de proteínas e análise de compostos orgânicos em fase gasosa. Introdução à separação de biomoléculas para análise por espectrometria de massas. Principais plataformas bioinformáticas de análise proteômica e de modificações pós-traducionais de proteínas. Espectrometria de massas. MS/MS. Exemplos e aplicações de análise proteômica. Digestão in gel e “proteômica shotgun”. Proteômica quantitativa (label-based e label-free). Preparo de amostras para espectrometria de massas. Aquisição e análise bioinformática de dados em proteômica. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e atividades práticas. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula e laboratório com lousa, projetor multimídia e computadores com sistema operacional Windows. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. 158 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Bibliografia Básica: ARDREY, R.E. Liquid chromatogrtaphy – Mass spectrometry: An introduction. John Wiley & Sons, 2003. KANNICHT, C. Post translational modifications of proteins – tools for functional proteomics. Humana Press, 2002. KINTER, M.; SHERMAN, N.E. Protein sequencing and identification using tandem mass spectrometry. John Wiley & Sons, 2000. Complementar: TWYMAN, R.M. Principles of Proteomics. Taylor & Francis Group, 2007. WESTERMEIER, R.; NAVEN, T. Proteomics in Practice: a laboratory manual of proteome analysis. Darmstadt-German, Wiley-VCH Verlag-GmbH Press, 2002. Bischoff, R., Schlüter, H. Amino acids: chemistry, functionality and selected non-enzymatic post translational modifications. J. Proteomics 75:2275-96, 2012. Cottrell, J.S. Protein identification using MS/MS data. J. Proteomics 74:184251, 2011. Artigos a serem entregues durante as aulas. Nome do Componente Curricular: Química Geral Período: 1o semestre Pré-requisitos: Não há Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Introduzir os conceitos de estrutura química e transformações. Noções básicas de todas as áreas da química: inorgânica, orgânica, analítica, físico-química e biologia química. Específicos: Entender a estrutura dos átomos; Relacionar estrutura de átomos com ligações químicas; Relacionar estruturas de moléculas com suas propriedades; Elucidar equações químicas; Entender os principais parâmetros físico-químicos e suas aplicações; Relacionar propriedades químicas das principais biomoléculas com suas funções biológicas. Ementa: 159 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Noções preliminares. Estrutura do átomo e periodicidade química. Ligações químicas. Estudo dos gases. Estequiometria. Soluções. Termoquímica. Eletroquímica. Cinética química. Equilíbrios químicos. Biomoléculas. Conteúdo Programático: Noções preliminares o Constituição da matéria o Classificação da matéria o Estados físicos da matéria o Transformações da matéria Estrutura do átomo e periodicidade química o Principais características do átomo o Modelos atômicos o Tabela periódica Ligações químicas o Teorias da ligação o Ligação iônica ou eletrovalente o Ligação covalente ou molecular o Geometria molecular o Polaridade o Forças intermoleculares o Ligação metálica o Nomenclatura de compostos Estudo dos gases o Características gerais dos gases o Transformações gasosas o Equação de estado dos gases perfeitos o Mistura de gases Estequiometria o Tipos de fórmulas (percentual, mínima, molecular) o Estequiometria das reações químicas Soluções o Tipos de soluções e solubilidade. o Aspectos quantitativos das soluções Termodinâmica o Termoquímica: Processos exotérmicos e endotérmicos o Entalpia e sua variação o Calor ou entalpia das reações químicas 160 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia o Lei de Hess o Energia Livre de Gibbs o Entropia Eletroquímica o Pilhas, potencial das pilhas. o Eletrólise (ígnea e em meio aquoso) Cinética-Química o Estudo da velocidade das reações químicas. o Ocorrência de reações químicas Equilíbrios químicos o Constante de equilíbrio. o Deslocamento de equilíbrio. Equilíbrio em meio aquoso. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas; apresentação de conceitos e discussão de aplicações. Resolução de lista de exercícios. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa, microcomputador e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela unidade curricular no início das atividades letivas devendo ser aprovado pela Comissão de Curso e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. A promoção do aluno na unidade curricular obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no Projeto Pedagógico do Curso. Bibliografia Básica: 1. P. Atkins & L. Jones, Princípios De Química: Questionando A Vida Moderna E O Meio-Ambiente 2001. 2. J. C. Kotz & P. Treichel Jr., Chemistry & Chemical Reactivity, Saunders College Publishing 4aed 1999. 3. T. Brown, H. E. Lemay, E., B. Busten, Química: A ciência central. 9 ed. PrenticeHall, 2005. Complementar: 1. Atkins, P. W., Paula, J., Físico-Química, Vol.3, 7ª ed., LTC. 2. Lee, J. D., Concise Inorganic Chemistry, 5 ed., Blackwell Science. 161 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 3. J. McMurry. Química Orgânica. vol. 1, 6 ed. Cengage Learning, 2005. 4. J. McMurry. Química Orgânica. vol. 2, 6 ed. Cengage Learning, 2005. 5. Russel, J. B. Química Geral 2a Edição. Vol. I E II, Editora Afiliada. Nome do Componente Curricular: Química Medicinal I Período: 6º semestre Pré-requisitos: Bioquímica I Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Curso introdutório à química medicinal. Específicos: Introdução à farmacologia e às principais estratégias e métodos para o desenvolvimento e produção de fármacos. Ementa: Introdução. Estrutura e características de fármacos. Relações estrutura-função de receptores e alvos moleculares. Princípios de desenho de fármacos. Produtos naturais. Biofármacos. Estratégias gerais em síntese e purificação de fármacos. Farmacocinética. Fases de desenvolvimento de fármacos. Aprovação e produção. Aspectos Legais. Conteúdo Programático: Introdução à Farmacologia. Desenho de fármacos. Produtos naturais. Biofármacos. Farmacocinética. Aspectos legais. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas. Recursos Instrucionais Necessários: Laboratório com lousa e projetor multimídia. Acesso ao MOODLE. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o 162 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia Básica: BARREIRO, E.J.; FRAGA, C.A.M. Química medicinal: as bases moleculares da ação dos fármacos. 2. ed. Porto Alegre: Artmed, 2008. THOMAS, G. Química medicinal: uma introdução. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2003. WERMUTH, C.G. The pratice of medicinal chemistry. 3rd. ed. Amsterdam: Elsevier, 2008. Complementar: Nogrady T, Weaver D. Medicinal Chemistry. 2nd ed. Oxford 2005. Patrick, G.L. An Introduction to Medicinal Chemistry. 5a Ed. Oxford 2013. DONALD VOET & JUDITH G. VOET. Bioquímica Ed. Artmed, 2007. STRYER, L.; TYMOCZKO, J.L.; BERG, J.M. Bioquímica. 5a ed., Ed. GuanabaraKoogan, 2004. NELSON, D.L.; COX, M.M. LEHNINGER princípios de bioquímica. 5a ed. Porto Alegre: Artmed, 2011. Nome do Componente Curricular: Química Medicinal II Período: 7º semestre Pré-requisitos: Química Medicinal I Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0 h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Curso avançado de química medicinal. Específicos: Introdução às principais classes de fármacos e seus alvos moleculares. Ementa: Principais classes de fármacos e seus alvos moleculares. Neurotransmissores e seus receptores. Hormônios e seus receptores. Imunomoduladores e seus receptores. Alvos membranares. Alvos citoplasmáticos. Organismos patogênicos como alvos. Conteúdo Programático: 163 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Tipos de fármacos Neurofarmacologia. Sistema endócrino. Imunomoduladores. Alvos moleculares. Antibióticos. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas e atividades práticas. Recursos Instrucionais Necessários: Laboratório com lousa e projetor multimídia. Acesso ao MOODLE. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia Básica: BARREIRO, E.J.; FRAGA, C.A.M. Química medicinal: as bases moleculares da ação dos fármacos. 2. ed. Porto Alegre: Artmed, 2008. THOMAS, G. Química medicinal: uma introdução. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2003. WERMUTH, C.G. The practice of medicinal chemistry. 3rd. ed. Amsterdam: Elsevier, 2008. NOGRADY T, WEAVER D. Medicinal Chemistry. 2nd ed. Oxford 2005. Complementar: Nogrady T, Weaver D. Medicinal Chemistry. 2nd ed. Oxford 2005. Patrick, G.L. An Introduction to Medicinal Chemistry. 5a Ed. Oxford 2013. DONALD VOET & JUDITH G. VOET. Bioquímica Ed. Artmed, 2007. STRYER, L.; TYMOCZKO, J.L.; BERG, J.M. Bioquímica. 5a ed., Ed. GuanabaraKoogan, 2004. NELSON, D.L.; COX, M.M. LEHNINGER princípios de bioquímica. 5a ed. Porto Alegre: Artmed, 2011. 164 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Nome do Componente Curricular: Química Orgânica Período: 3º semestre Pré-requisitos: Química Geral Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Fornecer aos alunos conhecimentos básicos sobre as várias técnicas de caracterização de materiais, com o propósito de permitir a aplicação na solução de problemas relativos à fabricação e análise de falhas de materiais e produtos. Específicos: O aluno será capaz de: Identificar a função a qual pertence um composto orgânico. Construir o nome desse composto. Entender as reações possivelmente utilizadas para a síntese do composto. Entender as reações que podem ser realizadas com o composto. Entender a relação entre propriedades físicas e estrutura dos compostos. Conhecer as principais aplicações dos compostos orgânicos. Ementa: Estrutura e propriedades físico-químicas de compostos orgânicos, síntese e reações de alcanos, alcenos, alcino, haletos de alquila, álcoois, fenóis, éteres, epóxidos, ácidos orgânicos, esteres, amidas, cetonas e aldeídos. Conteúdo Programático: A - ESTRUTURA QUÍMICA E REATIVIDADE 1. Introdução à química orgânica. Orbitais atômicos. Orbitais moleculares. Metano (hibridização sp3). Etano (hibridização sp2). Etino (hibridização sp). Geometria molecular. As ligações e seus parâmetros: comprimento, energia e ângulo de ligação. Polaridade. Efeito indutivo. Efeito mesomérico. B - COMPOSTOS ORGÂNICOS REPRESENTATIVOS 1. Grupos funcionais. Propriedades físicas e estrutura molecular. Introdução as reações orgânicas. C - ALCANOS E CICLOALCANOS 1. Introdução. Fonte (petróleo). Forma dos alcanos. Nomenclatura. Propriedades físicas. Reações. Síntese. Aspectos industriais. D – ALCENOS 1. Nomenclatura. Propriedades físicas. Isomeria geométrica. Síntese: reações de 165 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia eliminação. Propriedades químicas: reações de adição. E – ALCINOS 1. Introdução. Nomenclatura. Propriedades físicas. Síntese: hidrogenação. NOMENCLATURA. F - HALETOS DE ALQUILA 1. Introdução. Nomenclatura. Propriedades físicas. Síntese. Aplicações. G - ALCOOIS E ÉTERES 1. Estrutura. Nomenclatura. Propriedades físicas. Síntese. Reações. H – EPÓXIDOS 1. Estrutura e nomenclatura. Propriedades físicas. Síntese. Reações. I - COMPOSTOS AROMÁTICOS E FENÓIS 1. Introdução e importância dos compostos aromáticos. Benzeno. Reatividade e orientação (efeito do substituinte). Reação de substituição aromática (eletrofílica e nucleofílica). Fenol. Propriedades físicas. Síntese. Reações do fenol: substituição aromática nucleofílica. J - CETONAS E ALDEÍDOS 1. Estrutura. Nomenclatura. Propriedades físicas. Síntese. Reações: adições nucleofílicas ao grupo carbonila. Reações aldólicas. K - ÁCIDOS CARBOXÍLICOS 1. Estrutura. Nomenclatura. Propriedades físicas. Síntese. Reações. L - ÉSTERES E AMIDAS 1. Estrutura. Nomenclatura. Propriedades físicas. Síntese. Reações. Metodologia de Ensino Utilizada: Aulas expositivas; apresentação de conceitos e discussão de aplicações. Resolução de lista de exercícios. Recursos Instrucionais Necessários: Sala de aula com lousa, microcomputador e projetor multimídia. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia 166 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia Básica: 1. Solomons T. W. G., Fryhle C. B. Química Orgânica, v. 1 e 2, LTC, 9ª ed., 2009. 2. Carey, F. A. Química Orgânica, v 1 e 2, 7ª ed., Bookman, 2011. 3. Bruice, P. Y. Química Organica, v1 e 2, 4ª ed., Pearson Prentice Hall, 2006. Complementar: 1. Atkins, Peter; Jones, Loretta. Princípios de química: questionando a vida moderna e o meio ambiente, 3ª ed., Bookman, 2006. 2. Brown, Theodores L et al. Química: a ciência central. 9ª ed., Pearson Prentice Hall, 2005. 3. Kotz, J. C.; Treichel, P. M; Weaver, G. C. Química geral e reações químicas, Cengage Learning, 2010. 4. Costa, Paulo R. R. Ácidos e bases em química orgânica. Bookman, 2005. 5. Vollhardt, K. Peter; Schore, Neil E. Química orgânica: estrutura e função. Tradução de: Ricardo Bicca de Alencastro et al. 4ª ed., Bookman, 2004. Nome do Componente Curricular: Termodinâmica Química Período: 4º semestre Pré-requisitos: Química Geral; Cálculo em Uma Variável Carga Horária Total: 72h Carga Horária Prática: 0h Carga Horária Teórica: 72h Objetivos Gerais: Dar uma visão global dos fenômenos envolvendo variação de energia e correlacionálos com as mudanças estruturais da matéria. Focalizar os modelos teóricos e correlacioná-los com os resultados experimentais envolvendo energia. Específicos: 1. Utilizar o formalismo da termodinâmica para que o aluno desenvolva a capacidade de abstrair conceitos a partir de sistemas termodinâmicos. 2. Desenvolver no aluno a capacidade de identificar na Termodinâmica Química uma ferramenta poderosa para entender fenômenos físico-químicos de diferentes áreas das Ciências Exatas. Ementa: Introdução a leis da termodinâmica e suas aplicações químicas. Potencial Químico e Equilíbrio de soluções. Conteúdo Programático: 1. Introdução á Termodinâmica, gases ideais e reais; 2. Conceitos de calor, trabalho, primeira Lei da Termodinâmica e processos reversíveis; 167 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 3. Segunda Lei da Termodinâmica; 4.Terceira Lei da Termodinâmica; 5. Funções de Estado e Potencial Químico; 6. Equilibrio de fases; 7. Equilíbrio Químico; 8. Soluções. Metodologia de Ensino Utilizada: Serão ministradas aulas expositivas. Também se buscara fazer com que os e alunos participem da aula, que eles desenvolvam os conceitos termodinâmicos e relacionem com os acontecimentos do cotiado. Recursos Instrucionais Necessários: Quadro negro, datashow. Critérios de Avaliação: O sistema de avaliação será definido pelo docente responsável pela UC no início das atividades letivas e divulgado aos alunos. O sistema adotado deve contemplar o processo de ensino e aprendizagem estabelecido neste Projeto Pedagógico, com o objetivo de favorecer o progresso do aluno ao longo do semestre. Para isto, as avaliações deverão ser ponderadas de maneira crescente ou, ainda, propiciar alternativas de recuperação, como provas substitutivas e/ou aplicação de trabalhos adicionais. A promoção do aluno na UC obedecerá aos critérios estabelecidos pela Pró-Reitoria de Graduação, tal como discutido no projeto pedagógico do curso. Bibliografia Básica: Atkins P., Paula J. Físico-Química, Trad. de Horácio Macedo, 8a ed., LTC- Livros Técnicos e Científicos, 2008. Castellan G.W. Fundamentos de Físico-Química. Trad. de Cristina M.P. dos Santos, LTC, 1986. McQuarrie D. A., Simon J. D. Physical Chemistry: A Molecular Approach University Science Books, 1997. Complementar: 1. McQuarrie, Donald A. Quantum Chemistry. 2ed, California: University Science Books, 2007 Terron L. R.Termodinâmica - Química Aplicada, Manole, 2009. 2. Van Wylen, Gordon et al. Fundamentos da termodinâmica clássica. São Paulo, Edgard Blücher LTDA, 1995. 3. Oliveira, Mário José Termodnâmica. São Paulo: Livraria da Física, 2005. 4. Pilla L., Termodinâmica Química e Equilíbrio Químico, Editora da Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 2ª ed., 2006. 168 Universidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos Instituto de Ciência e Tecnologia 5. Halliday, D.; Walker, J.; Resnik, R. Fundamentos de física, 8ed., LTC, 2009, vol. 2 169