CV - Laboratoire d`étude des Transferts en Hydrologie et

MICROBIOGEOCHIMISTE DES SOLS ET DES EAUX
Jean M.F. MARTINS
CR1 CNRS
Section 30
EDUCATION
Sept 2008
Nov 1993
Juil. 1990
Juil. 1989
Juil. 1988
LTHE (UMR 5564), Responsable de l’équipe TransPore
BP53, 460, rue de la piscine, OSUG B, C206, F-38041 Grenoble Cedex 9
Tél : +33 (0)4 76 63 56 04, [email protected]
Date de naissance: 28.05.1967, Portugal
Nationalité : Française et Portugaise
Situation : marié, 3 enfants
Habilitation (HDR) Biogéochimie des sols et des eaux. Univ. Grenoble I (F)
Doctorat de Mécanique de l’environnement, Univ. Grenoble I / INPG (F)
DEA Ecologie Microbienne des sols et des eaux, University of LYON (F)
Maîtrise de Biotechnologies, Univ. LYON (F)
Licence de Biochimie Univ. LYON (F)
PROFESSIONAL EXPERIENCE
10/99 to date
LTHE, UMR 5564 (CNRS, INPG, UJF, IRD) Grenoble (F)
CR1 CNRS, Biogéochimiste, Chef de l’équipe TransPore du LTHE,
05/99 –08/99
Lab. de Physico-chimie de la Matière Minérale du BRGM, Orléans (F)
Chef de projet, Ingénieur de recherches.
05/1996 - 05/99
EPFL, DGR/IATE, Lab. d’Hydrologie et Aménagement, Lausanne (CH)
Professor Assistant.
11/1993 - 05/96
EPFL, DGR/IATE, Lab. d’Hydrologie et Aménagement, Lausanne (CH)
Post-doctorant, chef de projets.
1990 - 1993
Institut National Polytechnique de Grenoble - UNIV. Grenoble (F)
Lab. d’Etude des Transferts en Hydrologie et Environnement (LTHE)
Doctorant
1989 - 1990
Lab. de Microbiologie des sols, Univ. Lyon I (F), Microbial Ecologist.
DIRECTION ET ANIMATION DE LA RECHERCHE
• Responsable de l’équipe Transpore (Transferts en milieux poreux et multiphysique) depuis 2010 (12
permanents, 32 membres en 2014). 122 articles publiés entre 2010 et 2014. Futur responsable de
l’équipe HyDRIMZ du LTHE (2016-2020) (40 membres).
• Membre du comité de direction du LTHE (depuis 2010) et diverses représentations du D.U.
• Responsable de l’axe « Qualité des sols et du sous-sol (Qualitess) » de l’UMR de 2004 à 2011
• Responsable de l’animation des séminaires du LTHE de 2000 à 2005.
• Obtention de contrats de financement de la recherche. 15 en tant que coordinateur et 20 en tant que
partenaire (WP) auprès d’ECCO, EC2CO, ANR, INEE, INSU, FUI, RISE H2020, CAPES-COFECUB...
• Encadrement d’étudiants: 49 Masters/PFE, 16 doctorants (3 en cours) et 11 postdocs (2 en cours)…
• Encadrement de 2 techniciens à l’Hydram (EPFL) et de 2 Assistants-Ingénieurs au LTHE.
• Implication dans l’animation scientifique locale : rédaction de rapports quadriennaux ; animation de l’atelier
« sols » de l’OSU Grenoble (avec G. Sarret) ; expertises pour les collectivités locales grenobloises
(SIGREDA, Metro…) sur la vulnérabilité des ressources en eau et en sols, déchets...
• Implication dans l’animation scientifique nationale ; Membre du CS Ecodyn de ECCO, membre du CS
Microbien de EC2CO, Membre du CS Ecodyn de EC2CO, Membre du CP Bioindicateurs de l’Ademe,
Membre du CSO du Pôle d’Ecotoxicologie de Rovaltain (2011-2012). Membre du CS Mi-lourds de l’INSU.
Co-animateur d’un atelier Prospective INSU/SIC EDD 2007. Membre du groupe de réflexion sur le
rapprochement EC2CO – LEFE (2013-2014). Membre du CS du Réseau Ecodynamique des
Micropolluants (REM) coordonné par P. Hinsinger et P. Benoit (INRA) >2003.
CoResponsable d'une structure de recherche régionale depuis 2004 avec L. Charlet, puis avec R. Geremia
(LECA) : Le plateau MOME du GIS Envirhonalp (RA). Je suis resp. de la zone 2 au LTHE
• Implication internationale : Expert CEFIPRA, Membre du groupe COST 66 de l’UE, Organisation de
manifestations scientifiques (1 congrès international, 3 workshops). Animation de 3 sessions et table
ronde à des congrès nationaux et internationaux. Membre du Lab. Mixte Intern. (LMI) Vostok (représ.
LTHE) créé en 2011, faisant suite au GDRi Vostock (2006-2011). Membre du Lab. Mixte International
Titicaca Bolivie, soumis pour financement en 2014. Coordinateur du projet international Transmeth
(Brésil, CAPES-COFECUB). Rédaction d’un projet Européen (Pégase) impliquant 9 laboratoires (2000).
Co-responsable du projet Protinus (H2020 RISE) avec Céline Duwig (IRD).
• 45 Publications dans des revues spécialisées de rang A, mais aussi généraliste (Science).
• Editeur associé d’un numéro spécial du J. Contam. Hyrology, Vol. 33, N° (1-2). Review Editor pour la revue
Frontiers in Soil Processes.
• Membre de l'Institut des Métaux en Biologie de Grenoble (IMBG) du pôle Européen de Grenoble et
correspondant pour le LTHE.
• Membre de diverses sociétés savantes : ARPEA, ACS, ISSS, SFMéca, SFMicrob. SSP, EAG, AGS.
TACHES COLLECTIVES ET ENSEIGNEMENT
• Activité de « reviewer » pour 6 revues internationales; évaluation de demandes de financement
internationales et nationales (CEFIPRA, CAPES-COFECUB, ECCO, EC2CO, INSU Milourds ANR)
• Membre du conseil scientifique du LTHE depuis 2006.
• Jury. Nombreux jurys (>40) de L3 à HDR, dont 15 jurys de thèse (6 comme rapporteur) et 1 jury d’HDR (L.
Ranjard). Membre d’1 jury de recrutement de maître de conférences et d’1 AI CNRS.
e
• Responsable d’un module de cours 3 cycle (Microbiology and physicochemistry of (polluted) soils, ED
e
TUE, 5-20 étudiants 3 cycle, selon années).
e
• Enseignement en masters niveau M1 et M2 et 3 année Ingénieur (50-60h/an) depuis 2001.
• Correspondant du M2R Transferts Sol et Aquifère d’Avignon pour le LTHE (labo. d’accueil).
• Gestion du laboratoire de microbiogéochimie de l’Hydram (EPFL) et du LTHE (Fonctionnement, choix des
équipements et achats, maintenance, formation aux BPL, tarification…).
• Vulgarisation: Stand fête de la science 2002 ; Conférence Biennale de l’Environnement (Bobigny) 2002 ;
Cinéma–débat public : Polluting paradise, Mon Ciné, St Martin d’Hères, 2013.
PUBLICATIONS:
45 articles sci., 11 conférences invitées en congrès nationaux/internationaux,130 conférences /posters.
(http://www.researcherid.com/rid/B-2715-2008 ou https://www.researchgate.net/profile/Jean_Martins3).
Articles récents :
Martins J.M.F. Bacterial cells transport in porous media: a challenge for polluted soils bioremediation.
Submitted to J Chem Technol Biotechnol. 22/02/15.
Navel A., G. Uzu, L. Spadini, S. Sobanska and J.M.F. Martins. Combining microscopy with spectroscopic
and chemical methods for tracing the origin of atmospheric fallouts from mining sites. Submitted to J.
Haz. Mat. 31/01/2015.
Spadini L., Bu J., Martins J.M.F., Navel A., Morel M.C. and Faure P. GC-MS biomarkers and molecular
patterns in a variably organic matter amended vineyard soil. Submitted to Eur. J. Soil Sci. 16/03/2015.
Navel A., L. Spadini, J.M.F. Martins, E. Vince and I. Lamy. Unravelling the respective importance of soil
mineral and organic phases in metal speciation: complementary insights from microscale approaches.
Submitted to Environ. Sci. Technol. 25/03/2015.
Simonin M., J. P. Guyonnet, J.M.F. Martins, M. Ginot and A. Richaume. Influence of soil properties on the
toxicity of TiO2 nanoparticles on carbon mineralization and bacterial abundance. J. Hazardous Material.
http://dx.doi.org/10.1016/j.jhazmat.2014.10.004. 283: 529-535. 2015.
Berhanu T. A., J. Savarino, J. Erbland, W. C. Vicars, S. Preunkert, J.M.F. Martins and M.S. Johnson. Isotopic
effects of nitrate photochemistry in snow: a field study at Dome C, Antarctica. Atmos. Chem. Phys.
Discuss. 14: 33045-33088, 2015.
Constancias F., N. Chemidlin Prévost-Bouré, S. Terrat, S. Aussems, V. Nowak, J.-P. Guillemin, L. Biju-Duval,
A. Navel, J.M.F. Martins, P.A. Maron, and L. Ranjard. Micro-scale evidence for a high decrease of soil
bacterial density and diversity by cropping. DOI 10.1007/s13593-013-0204-3. Agron. Sustain. Dev. Agro.
Sustain. Dev. 34: 831-840. 2014.
Desaunay A. and J.M.F. Martins. A physical cell-fractionation approach to assess the surface adsorption and
internalization of cadmium by Cupriavidus metallidurans CH34. J. Haz. Mat. 273: 231-238. 2014.
Morel M.C., L. Spadini, K. Brimo, J.M.F. Martins. Speciation study in the Sulfamethoxazole-Cu-pH-soil
system by combining IR spectrometric and titrimetric approaches. Sci. Total Environ. 481: 266-273. 2014.
Navel A. and J.M.F. Martins. Effect of organic amendment and vegetalization of natural vineyard soils on the
microscale biogeochemistry of field-applied copper. Sci. Total Environ. 466: 681-689. 2014.
Vitorge E., S. Szenknect, Martins J.M.F., V. Barthes, A. Auger, O. Renard, J.P. Gaudet. Comparison of three
labeled silica nanoparticles used as tracers in transport experiments in porous media. Part I: Synthesis
and characterizations. Environ. Poll. 184: 613–619. 2014.
Vitorge E., S. Szenknect, Martins J.M.F., V. Barthes, J.P. Gaudet. Comparison of three labeled silica
nanoparticles used as tracers in transport experiments in porous media. Part II: Transport experiments
and modeling. Environ. Poll. 184: 605-612. 2014.
Rolland du Roscoat S., J.M.F. Martins, P. Séchet, E. Vince, Pierre Latil, and C. Geindreau. Application of
synchrotron-based X-ray micro-tomography for visualizing bacterial biofilms 3D microstructure in porous
media Biotech. Bioengin. DOI 10.1002/bit.25168. J. 12-2013.
Causse B., L., Spadini, J.M.F. Martins, T. Lenoir, A. Heyraud, and C. Delolme. Proton and Cu exchange
properties of the Exopolysaccharide Xanthan. Chem. Geol. 359: 150–158. 2013.
Mbaye S., P. Séchet, F. Pignon and J.M.F. Martins. Influence of hydrodynamics on the growth kinetics of
glass-adhering Pseudomonas putida cells through a parallel plate flow chamber. Biomicrofluidics. 7(5):
054105. 2013
Martins J.M.F., S. Majdalani, E. Vitorge, A. Desaunay, A. Navel, V. Guiné, J.F. Daïan and J.P. Gaudet.
Importance of macropore flow for the transport of Escherichia coli cells in undisturbed cores of a brown
leached soil. Environ. Sci.: Processes Impacts, 15: 347-356. 2013.
Vitorge E., Szenknect S., Martins J.M.F. and J.P. Gaudet. Experimental evidence and modelling of size- and
concentration-dependent deposition of fluorescent silica nanocolloids in saturated sand columns. DOI:
10.1039/C3EM30860J. Environ. Sci.: Processes Impacts. 5(8): 1590-1600. 2013.