et al.

Transcrição

et al.
Sistemática de carnívoros nos últimos 30
anos: resolução de velhos problemas e
descoberta de novas questões
Eduardo Eizirik
Faculdade de Biociências, PUCRS, Brasil
Instituto Pró-Carnívoros, Brasil
8º Congresso Brasileiro de Mastozoologia
João Pessoa, PB - 28/09/2015
SIMPÓSIO: Avanços em estudos sistemáticos de Mamíferos Brasileiros 2
Sistemática de carnívoros nos últimos 30 anos:
resolução de velhos problemas e descoberta de
novas questões.
Eduardo Eizirik
Faculdade de Biociências, PUCRS, Brasil
Instituto Pró-Carnívoros, Brasil
A ordem Carnivora
287 espécies
Distribuição: Holártica, Etiópica, Neotropical, Oriental
Problemas prevalentes nos anos 1980-1990
1.
Posição filogenética de Carnivora dentro de Placentalia.
2. Composição das famílias; relações filogenética entre as famílias.
3. Monofilia dos pinípedes (carnívoros marinhos); onde se colocam na
filogenia dos carnívoros ? Posição da morsa (Odobenidae)?
4. Taxa enigmáticos: panda gigante, panda vermelho, civeta das
palmeiras africana, fossa, ‘stink badgers’.
III
II
I
Filogenia dos
mamíferos
placentários.
Perissodactyla
Carnivora
Pholidota
Cetartiodactyla
Chiroptera
Eulipotyphla
Boreoeutheria
IV
rhino
tapir
horse
cat
caniform
pangolin
whale
dolphin
hippo
ruminant
pig
llama
flying fox
rousette fruit bat
phyllostomid bat
hedgehog
shrew
mole
mouse
rat
O.W. hystricognath
caviomorph
sciurid
rabbit
pika
flying lemur
tree shrew
strepsirhine
human
sloth
anteater
armadillo
s.e.elephant shrew
l.e.elephant shrew
tenrec
aardvark
sirenian
hyrax
elephant
opossum
diprotodontian
Rodentia
Lagomorpha
Dermoptera
Scandentia
Primates
Xenarthra
Macroscelidae
Afrosoricida
Tubulidentata
Sirenia
Hyracoidea
Proboscidea
Marsupialia
Afrotheria
Murphy et al. 2001. Science.
Novo conjunto de
dados:
26 genes
35 kb
11.000 aa
Meredith et al. 2011.
Science.
Problemas prevalentes nos anos 1980-1990
1.
Posição filogenética de Carnivora dentro de Placentalia.
2. Composição das famílias; relações filogenética entre as famílias.
3. Monofilia dos pinípedes (carnívoros marinhos); onde se colocam na
filogenia dos carnívoros ? Posição da morsa (Odobenidae)?
4. Taxa enigmáticos: panda gigante, panda vermelho, civeta das
palmeiras africana, fossa, ‘stink badgers’.
Ordem Carnivora: Famílias tradicionais (até fim dos anos 1990)
Felidae
Feliformia
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Caniformia
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
Odobenidae
Felidae
Feliformia
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Caniformia
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
38 espécies
Odobenidae
Felidae
Feliformia
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Caniformia
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
4 espécies
Odobenidae
Felidae
Feliformia
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Caniformia
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
34 espécies
Odobenidae
Felidae
Feliformia
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Caniformia
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
37 espécies
Odobenidae
Felidae
Feliformia
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Caniformia
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
35 espécies
Odobenidae
Felidae
Feliformia
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Caniformia
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
8 espécies
Odobenidae
Felidae
Feliformia
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Caniformia
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
19 espécies
Odobenidae
Felidae
Feliformia
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Caniformia
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
65 espécies
Odobenidae
Felidae
Feliformia
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Caniformia
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
14 espécies
Odobenidae
Felidae
Feliformia
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Caniformia
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
18 espécies
Odobenidae
Felidae
Feliformia
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Caniformia
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
1 espécie
Odobenidae
Início dos anos 2000
1. Expansão de estudos moleculares (focos geralmente separados em
Caniformia e Feliformia).
2. Contínua controvérsia sobre as relações filogenética entre as famílias.
3. Progressiva resolução de alguns problemas (p.ex. monofilia dos
pinípedes).
4. Proposta de novas linhagens em 2003.
Gaubert & Veron 2003. Proc R. Soc. B
Yoder et al. 2003. Nature
Filogenia molecular da
ordem Carnivora 33.3
7.2
38.6
32.2
8.7
19.6
37.4
28.6
7.8
9.2
20.0
13.1
40.5
20.7
30.0
3.5
42.6
14.8
18.2
Paleoc.
Eocene
60
50
Oligocene
40
30
Miocene
20
Million Years Ago
Pi Pe
10
0
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
CANIFORMIA
32.0
Felidae
FELIFORMIA
(supermatriz de
14 genes nucleares)
10.3
Felis
Acinonyx
Leopardus
Lynx
Panthera
Prionodon
Crocuta
Hyaena
Parahyaena
Proteles
Suricata
Herpestes
Ichneumia
Rhynchogale
Helogale
Cryptoprocta
Galidia
Fossa
Civettictis
Genetta
Paradoxurus
Nandinia
Canis
Nyctereutes
Urocyon
Mephitis
Spilogale
Conepatus
Mydaus
Eira
Martes
Enhydra
Lontra
Ictonyx
Mustela
Meles
Taxidea
Bassariscus
Procyon
Nasua
Bassaricyon
Potos
Ailurus
Arctocephalus
Zalophus
Odobenus
Phoca
Mirounga
Ailuropoda
Ursus
Manis
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Filogenia molecular da
ordem Carnivora 33.3
10.3
38.6
32.2
8.7
19.6
37.4
28.6
7.8
9.2
20.0
13.1
40.5
20.7
30.0
3.5
42.6
14.8
18.2
Paleoc.
Eocene
60
50
Oligocene
40
30
Miocene
20
Million Years Ago
Pi Pe
10
0
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
CANIFORMIA
32.0
Felidae
FELIFORMIA
7.2
Felis
Acinonyx
Leopardus
Lynx
Panthera
Prionodon
Crocuta
Hyaena
Parahyaena
Proteles
Suricata
Herpestes
Ichneumia
Rhynchogale
Helogale
Cryptoprocta
Galidia
Fossa
Civettictis
Genetta
Paradoxurus
Nandinia
Canis
Nyctereutes
Urocyon
Mephitis
Spilogale
Conepatus
Mydaus
Eira
Martes
Enhydra
Lontra
Ictonyx
Mustela
Meles
Taxidea
Bassariscus
Procyon
Nasua
Bassaricyon
Potos
Ailurus
Arctocephalus
Zalophus
Odobenus
Phoca
Mirounga
Ailuropoda
Ursus
Manis
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Filogenia molecular da
ordem Carnivora 33.3
10.3
38.6
32.2
8.7
19.6
37.4
28.6
7.8
9.2
20.0
13.1
40.5
20.7
30.0
3.5
42.6
14.8
18.2
Paleoc.
Eocene
60
50
Oligocene
40
30
Miocene
20
Million Years Ago
Pi Pe
10
0
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
CANIFORMIA
32.0
Felidae
FELIFORMIA
7.2
Felis
Acinonyx
Leopardus
Lynx
Panthera
Prionodon
Crocuta
Hyaena
Parahyaena
Proteles
Suricata
Herpestes
Ichneumia
Rhynchogale
Helogale
Cryptoprocta
Galidia
Fossa
Civettictis
Genetta
Paradoxurus
Nandinia
Canis
Nyctereutes
Urocyon
Mephitis
Spilogale
Conepatus
Mydaus
Eira
Martes
Enhydra
Lontra
Ictonyx
Mustela
Meles
Taxidea
Bassariscus
Procyon
Nasua
Bassaricyon
Potos
Ailurus
Arctocephalus
Zalophus
Odobenus
Phoca
Mirounga
Ailuropoda
Ursus
Manis
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Filogenia molecular da
ordem Carnivora 33.3
10.3
38.6
32.2
8.7
19.6
37.4
28.6
7.8
9.2
20.0
13.1
40.5
20.7
30.0
3.5
42.6
14.8
18.2
Paleoc.
Eocene
60
50
Oligocene
40
30
Miocene
20
Million Years Ago
Pi Pe
10
0
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
CANIFORMIA
32.0
Felidae
FELIFORMIA
7.2
Felis
Acinonyx
Leopardus
Lynx
Panthera
Prionodon
Crocuta
Hyaena
Parahyaena
Proteles
Suricata
Herpestes
Ichneumia
Rhynchogale
Helogale
Cryptoprocta
Galidia
Fossa
Civettictis
Genetta
Paradoxurus
Nandinia
Canis
Nyctereutes
Urocyon
Mephitis
Spilogale
Conepatus
Mydaus
Eira
Martes
Enhydra
Lontra
Ictonyx
Mustela
Meles
Taxidea
Bassariscus
Procyon
Nasua
Bassaricyon
Potos
Ailurus
Arctocephalus
Zalophus
Odobenus
Phoca
Mirounga
Ailuropoda
Ursus
Manis
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Filogenia molecular da
ordem Carnivora 33.3
10.3
38.6
32.2
8.7
19.6
37.4
28.6
7.8
9.2
20.0
13.1
40.5
20.7
30.0
3.5
42.6
14.8
18.2
Paleoc.
Eocene
60
50
Oligocene
40
30
Miocene
20
Million Years Ago
Pi Pe
10
0
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
CANIFORMIA
32.0
Felidae
FELIFORMIA
7.2
Felis
Acinonyx
Leopardus
Lynx
Panthera
Prionodon
Crocuta
Hyaena
Parahyaena
Proteles
Suricata
Herpestes
Ichneumia
Rhynchogale
Helogale
Cryptoprocta
Galidia
Fossa
Civettictis
Genetta
Paradoxurus
Nandinia
Canis
Nyctereutes
Urocyon
Mephitis
Spilogale
Conepatus
Mydaus
Eira
Martes
Enhydra
Lontra
Ictonyx
Mustela
Meles
Taxidea
Bassariscus
Procyon
Nasua
Bassaricyon
Potos
Ailurus
Arctocephalus
Zalophus
Odobenus
Phoca
Mirounga
Ailuropoda
Ursus
Manis
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Filogenia molecular da
ordem Carnivora 33.3
10.3
38.6
32.2
8.7
19.6
37.4
28.6
7.8
9.2
20.0
13.1
40.5
20.7
30.0
3.5
42.6
14.8
18.2
Paleoc.
Eocene
60
50
Oligocene
40
30
Miocene
20
Million Years Ago
Pi Pe
10
0
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
CANIFORMIA
32.0
Felidae
FELIFORMIA
7.2
Felis
Acinonyx
Leopardus
Lynx
Panthera
Prionodon
Crocuta
Hyaena
Parahyaena
Proteles
Suricata
Herpestes
Ichneumia
Rhynchogale
Helogale
Cryptoprocta
Galidia
Fossa
Civettictis
Genetta
Paradoxurus
Nandinia
Canis
Nyctereutes
Urocyon
Mephitis
Spilogale
Conepatus
Mydaus
Eira
Martes
Enhydra
Lontra
Ictonyx
Mustela
Meles
Taxidea
Bassariscus
Procyon
Nasua
Bassaricyon
Potos
Ailurus
Arctocephalus
Zalophus
Odobenus
Phoca
Mirounga
Ailuropoda
Ursus
Manis
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Filogenia molecular da
ordem Carnivora 33.3
10.3
38.6
32.2
8.7
19.6
37.4
28.6
7.8
9.2
20.0
13.1
40.5
20.7
30.0
3.5
42.6
14.8
18.2
Paleoc.
Eocene
60
50
Oligocene
40
30
Miocene
20
Million Years Ago
Pi Pe
10
0
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
CANIFORMIA
32.0
Felidae
FELIFORMIA
7.2
Felis
Acinonyx
Leopardus
Lynx
Panthera
Prionodon
Crocuta
Hyaena
Parahyaena
Proteles
Suricata
Herpestes
Ichneumia
Rhynchogale
Helogale
Cryptoprocta
Galidia
Fossa
Civettictis
Genetta
Paradoxurus
Nandinia
Canis
Nyctereutes
Urocyon
Mephitis
Spilogale
Conepatus
Mydaus
Eira
Martes
Enhydra
Lontra
Ictonyx
Mustela
Meles
Taxidea
Bassariscus
Procyon
Nasua
Bassaricyon
Potos
Ailurus
Arctocephalus
Zalophus
Odobenus
Phoca
Mirounga
Ailuropoda
Ursus
Manis
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Filogenia molecular da
ordem Carnivora 33.3
10.3
38.6
32.2
8.7
19.6
37.4
28.6
7.8
9.2
20.0
13.1
40.5
20.7
30.0
3.5
42.6
14.8
18.2
Paleoc.
Eocene
60
50
Oligocene
40
30
Miocene
20
Million Years Ago
Pi Pe
10
0
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
CANIFORMIA
32.0
Felidae
FELIFORMIA
7.2
Felis
Acinonyx
Leopardus
Lynx
Panthera
Prionodon
Crocuta
Hyaena
Parahyaena
Proteles
Suricata
Herpestes
Ichneumia
Rhynchogale
Helogale
Cryptoprocta
Galidia
Fossa
Civettictis
Genetta
Paradoxurus
Nandinia
Canis
Nyctereutes
Urocyon
Mephitis
Spilogale
Conepatus
Mydaus
Eira
Martes
Enhydra
Lontra
Ictonyx
Mustela
Meles
Taxidea
Bassariscus
Procyon
Nasua
Bassaricyon
Potos
Ailurus
Arctocephalus
Zalophus
Odobenus
Phoca
Mirounga
Ailuropoda
Ursus
Manis
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Filogenia molecular da
ordem Carnivora 33.3
10.3
38.6
32.2
8.7
19.6
37.4
28.6
7.8
9.2
20.0
13.1
40.5
20.7
30.0
3.5
42.6
14.8
18.2
Paleoc.
Eocene
60
50
Oligocene
40
30
Miocene
20
Million Years Ago
Pi Pe
10
0
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
CANIFORMIA
32.0
Felidae
FELIFORMIA
7.2
Felis
Acinonyx
Leopardus
Lynx
Panthera
Prionodon
Crocuta
Hyaena
Parahyaena
Proteles
Suricata
Herpestes
Ichneumia
Rhynchogale
Helogale
Cryptoprocta
Galidia
Fossa
Civettictis
Genetta
Paradoxurus
Nandinia
Canis
Nyctereutes
Urocyon
Mephitis
Spilogale
Conepatus
Mydaus
Eira
Martes
Enhydra
Lontra
Ictonyx
Mustela
Meles
Taxidea
Bassariscus
Procyon
Nasua
Bassaricyon
Potos
Ailurus
Arctocephalus
Zalophus
Odobenus
Phoca
Mirounga
Ailuropoda
Ursus
Manis
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Filogenia molecular da
ordem Carnivora 33.3
10.3
38.6
32.2
8.7
19.6
37.4
28.6
7.8
9.2
20.0
13.1
40.5
20.7
30.0
3.5
42.6
14.8
18.2
Paleoc.
Eocene
60
50
Oligocene
40
30
Miocene
20
Million Years Ago
Pi Pe
10
0
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
CANIFORMIA
32.0
Felidae
FELIFORMIA
7.2
Felis
Acinonyx
Leopardus
Lynx
Panthera
Prionodon
Crocuta
Hyaena
Parahyaena
Proteles
Suricata
Herpestes
Ichneumia
Rhynchogale
Helogale
Cryptoprocta
Galidia
Fossa
Civettictis
Genetta
Paradoxurus
Nandinia
Canis
Nyctereutes
Urocyon
Mephitis
Spilogale
Conepatus
Mydaus
Eira
Martes
Enhydra
Lontra
Ictonyx
Mustela
Meles
Taxidea
Bassariscus
Procyon
Nasua
Bassaricyon
Potos
Ailurus
Arctocephalus
Zalophus
Odobenus
Phoca
Mirounga
Ailuropoda
Ursus
Manis
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Filogenia molecular da
ordem Carnivora 33.3
10.3
38.6
32.2
8.7
19.6
37.4
28.6
7.8
9.2
20.0
13.1
40.5
20.7
30.0
3.5
42.6
14.8
18.2
Paleoc.
Eocene
60
50
Oligocene
40
30
Miocene
20
Million Years Ago
Pi Pe
10
0
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
CANIFORMIA
32.0
Felidae
FELIFORMIA
7.2
Felis
Acinonyx
Leopardus
Lynx
Panthera
Prionodon
Crocuta
Hyaena
Parahyaena
Proteles
Suricata
Herpestes
Ichneumia
Rhynchogale
Helogale
Cryptoprocta
Galidia
Fossa
Civettictis
Genetta
Paradoxurus
Nandinia
Canis
Nyctereutes
Urocyon
Mephitis
Spilogale
Conepatus
Mydaus
Eira
Martes
Enhydra
Lontra
Ictonyx
Mustela
Meles
Taxidea
Bassariscus
Procyon
Nasua
Bassaricyon
Potos
Ailurus
Arctocephalus
Zalophus
Odobenus
Phoca
Mirounga
Ailuropoda
Ursus
Manis
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Filogenia molecular da
ordem Carnivora 33.3
10.3
38.6
32.2
8.7
19.6
37.4
28.6
7.8
9.2
20.0
13.1
40.5
20.7
30.0
3.5
42.6
14.8
18.2
Paleoc.
Eocene
60
50
Oligocene
40
30
Miocene
20
Million Years Ago
Pi Pe
10
0
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
CANIFORMIA
32.0
Felidae
FELIFORMIA
7.2
Felis
Acinonyx
Leopardus
Lynx
Panthera
Prionodon
Crocuta
Hyaena
Parahyaena
Proteles
Suricata
Herpestes
Ichneumia
Rhynchogale
Helogale
Cryptoprocta
Galidia
Fossa
Civettictis
Genetta
Paradoxurus
Nandinia
Canis
Nyctereutes
Urocyon
Mephitis
Spilogale
Conepatus
Mydaus
Eira
Martes
Enhydra
Lontra
Ictonyx
Mustela
Meles
Taxidea
Bassariscus
Procyon
Nasua
Bassaricyon
Potos
Ailurus
Arctocephalus
Zalophus
Odobenus
Phoca
Mirounga
Ailuropoda
Ursus
Manis
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Filogenia molecular da
ordem Carnivora 33.3
10.3
38.6
32.2
8.7
19.6
37.4
28.6
7.8
9.2
20.0
13.1
40.5
20.7
30.0
3.5
42.6
14.8
18.2
Paleoc.
Eocene
60
50
Oligocene
40
30
Miocene
20
Million Years Ago
Pi Pe
10
0
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
CANIFORMIA
32.0
Felidae
FELIFORMIA
7.2
Felis
Acinonyx
Leopardus
Lynx
Panthera
Prionodon
Crocuta
Hyaena
Parahyaena
Proteles
Suricata
Herpestes
Ichneumia
Rhynchogale
Helogale
Cryptoprocta
Galidia
Fossa
Civettictis
Genetta
Paradoxurus
Nandinia
Canis
Nyctereutes
Urocyon
Mephitis
Spilogale
Conepatus
Mydaus
Eira
Martes
Enhydra
Lontra
Ictonyx
Mustela
Meles
Taxidea
Bassariscus
Procyon
Nasua
Bassaricyon
Potos
Ailurus
Arctocephalus
Zalophus
Odobenus
Phoca
Mirounga
Ailuropoda
Ursus
Manis
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Filogenia molecular da
ordem Carnivora 33.3
10.3
38.6
32.2
8.7
19.6
37.4
28.6
7.8
9.2
20.0
13.1
40.5
20.7
30.0
3.5
42.6
14.8
18.2
Paleoc.
Eocene
60
50
Oligocene
40
30
Miocene
20
Million Years Ago
Pi Pe
10
0
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
CANIFORMIA
32.0
Felidae
FELIFORMIA
7.2
Felis
Acinonyx
Leopardus
Lynx
Panthera
Prionodon
Crocuta
Hyaena
Parahyaena
Proteles
Suricata
Herpestes
Ichneumia
Rhynchogale
Helogale
Cryptoprocta
Galidia
Fossa
Civettictis
Genetta
Paradoxurus
Nandinia
Canis
Nyctereutes
Urocyon
Mephitis
Spilogale
Conepatus
Mydaus
Eira
Martes
Enhydra
Lontra
Ictonyx
Mustela
Meles
Taxidea
Bassariscus
Procyon
Nasua
Bassaricyon
Potos
Ailurus
Arctocephalus
Zalophus
Odobenus
Phoca
Mirounga
Ailuropoda
Ursus
Manis
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Filogenia molecular da
ordem Carnivora 33.3
10.3
38.6
32.2
8.7
19.6
37.4
28.6
7.8
9.2
20.0
13.1
40.5
20.7
30.0
3.5
42.6
14.8
18.2
Paleoc.
Eocene
60
50
Oligocene
40
30
Miocene
20
Million Years Ago
Pi Pe
10
0
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
CANIFORMIA
32.0
Felidae
FELIFORMIA
7.2
Felis
Acinonyx
Leopardus
Lynx
Panthera
Prionodon
Crocuta
Hyaena
Parahyaena
Proteles
Suricata
Herpestes
Ichneumia
Rhynchogale
Helogale
Cryptoprocta
Galidia
Fossa
Civettictis
Genetta
Paradoxurus
Nandinia
Canis
Nyctereutes
Urocyon
Mephitis
Spilogale
Conepatus
Mydaus
Eira
Martes
Enhydra
Lontra
Ictonyx
Mustela
Meles
Taxidea
Bassariscus
Procyon
Nasua
Bassaricyon
Potos
Ailurus
Arctocephalus
Zalophus
Odobenus
Phoca
Mirounga
Ailuropoda
Ursus
Manis
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Idade das linhagens atuais de cada família de
carnívoros terrestres
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Novas questões
1.
Refinamento da filogenia e datação molecular em cada uma
das famílias.
- Questões de discordância genealógica
2.
Delimitação de espécies.
3.
Refinamento da definição de distribuições geográficas.
4. Hibridação entre espécies próximas.
5. Definição de unidades infra-específicas.
O Grande Intercâmbio
Americano e a diversificação
dos carnívoros neotropicais
Meta-análise de filogenias e datações
moleculares empregando
supermatrizes de genes nucleares
Padrões contrastantes de
diversificação entre as famílias de
carnívoros.
Eizirik. 2012. in: Bones clones and biomes.
Univ. Chicago Press.
O Grande Intercâmbio
Americano e a diversificação
dos carnívoros neotropicais
Meta-análise de filogenias e datações
moleculares empregando
supermatrizes de genes nucleares
Padrões contrastantes de
diversificação entre as famílias de
carnívoros.
Oportunidade para
investigar processos
recentes de especiação e
testar critérios de
delimitação de espécies para
carnívoros.
Eizirik (2012)
Filogenia e filogeografia de Conepatus spp.
Manoel Fontoura-Rodrigues
(Dout., PUCRS, 2013)
Dados de mtDNA
(linhagens da Am. Sul)
Corroboração dos grupos
com dados nucleares
(microssatélites) e
morfométricos
Filogenia e filogeografia de Conepatus spp.
Manoel Fontoura-Rodrigues
(Dout., PUCRS, 2013)
Conclusões:
- Forte estruturação geográfica.
- Nome C. semistriatus inadequado para a
população presente no centro e nordeste
do Brasil.
- Necessidade de revisão taxonômica
integrada para o gênero.
Novas questões
1.
Refinamento da filogenia e datação molecular em cada uma
das famílias.
- Questões de discordância genealógica
2.
Delimitação de espécies.
3.
Refinamento da definição de distribuições geográficas.
4. Hibridação entre espécies próximas.
5. Definição de unidades infra-específicas.
Eizirik (2012)
Interspecific divergence and hybridization in genus Leopardus
?
Tatiane Trigo
Leopardus
tigrinus
L. tigrinus
Leopardus
geoffroyi
L. geoffroyi
L. colocolo
ML phylogeny
of mtDNA
haplotypes
(1,024 bp)
Microsatellites (9 loci)
Brazilian tigrinas
harbored mtDNA
from three different
species!
Costa Rica tigrina
Trigo et al. 2008. Mol. Ecol.
Complex history of
hybridization and
divergence
- Ancient hybridization and
introgression from L.
colocolo into NE L. tigrinus.
- Ongoing hybridization
between SSE L. tigrinus
and L. geoffroyi.
- No hybridization between
L. colocolo and L. geoffroyi.
- No gene flow between NE
and SSE populations of L.
tigrinus !
Two species:
L. tigrinus
L. guttulus
Trigo et al. 2013. Curr. Biol.
Trigo et al. 2014. PLoS One
Trigo et al. 2014. PLoS One
Correlation of morphological,
genetic and spatial variables
among the male specimens
sampled in RS and vicinities.
(A–B) patterns of genetic (A)
and morphological (B) variation,
with individuals ordered on the
X-axis based on their ‘q’ values
estimated with STRUCTURE (in
A) or their PCI scores estimated
with the PCA (in B); (C)
correlation between genetic and
morphological variation; (D–E)
correlation between individual
‘q’ values (D) or PCI scores (E)
and spatial transects across the
hybrid zone. Geographical
distances used in the spatial
analyses were measured in km as
lines that were perpendicular to
the dashed line shown in Figure
4, with samples collected north
or east of this line (towards the
L. guttulus side) receiving a
positive value, and those
obtained south or west (towards
the L. geoffroyi side) receiving a
negative value
Trigo et al. 2014. PLoS One
Ongoing work: Genome-wide SNP array, GBS and WGS
Illumina custom array containing ~63K domestic cat SNPs
- 6,158 are variable within the genus Leopardus
- 3,371 are variable in the subset shown below
OGE1
OGE.003
LGE0031
LGE0077
LGE0075
LGE0036
LTI0124
LTI0140
100
LTI0138
57
LTI0102
57
LTI0160
63
OGU.003
LTI1
LTI.6
100
LTI13
59
47
36
55
100
67
34
96
100
L. geoffroyi
L. guttulus
L. guigna
L. tigrinus (NE Brazil)
LCO.3
LPA.006
0.05
Costa Rica ‘tigrina’
L. colocolo
L. pardalis
Filogeografia do gato palheiro
(Leopardus colocolo)
Anelisie S. Santos
(M.Sc. PUCRS, 2012)
- História evolutiva complexa
- Há estruturação geográfica recente
- Implicações taxonômicas
O gênero Lycalopex
L. sechurae
L. culpaeus
L. griseus
L. vetulus
L. gymnocercus
L. fulvipes
Tchaicka et al. (in review)
CE01
CE02
CE03
CE04
CE07
93
CE08
CE06
100
CE05
CE09
79 F01 (M)
62
F02 (M)
F03
C01 (A)
C03 (A)
C05 (A)
C04 (A)
C08 (A)
C06 (A)
C02 (A)
C14
C09 (A)
C10 (A)
C11 (A)
C13 (A)
C12 (B)
C07 (A)
GR01 (N) *
GR23 (BP) P)
GR03(M)
GR02 (M)
(M)
GR21
GR04
GR05 (N) *
GR06 (N) *
GR13
GR09 (O) *
GR10 (O) *
GR08 (O) *
GR11 (N) *
GR07 (O) *
GR12 (O) *
GR15 (B)
GR14 (B)
GR17
GR16
GR20
GR18
GR22
GR19
O gênero Lycalopex
• Filogenia: mtDNA
• Árvore de NJ baseada em 588pb da
região controle.
• Suporte dos ramos:NJ.
L. fulvipes
L. culpaeus
L. griseus
G01
G02 (C)
100
100
S01
V01 (I)
V03 (I)
V09 (J)
V10 (H)
V15
V02 (I)
V06 (I)
V16
V17(G)
V12 (G)
V04 (I)
V05 (I)
V07 (I)
55
V13 (G)
V11 (G)
V08 (L)
V14
0.005 substitutions/site
G05 (C)
G06 (D)
G18 (F)
G17
G16 (C)
G09 (C)
G12 (C)
G20 (C)
G03 (E)
G10 (F)
G11 (D)
G07 (D,F)
G04 (C)
G19 (F)
G08 (D)
G13 (D)
G15 (E)
G14 (D)
L. gymnocercus
L. sechurae
L. vetulus
Tchaicka et al. (in review)
Filogenia (ML) de seis
segmentos
concatenados de
mtDNA (6 kb)
M. Favarini et al. (in prep)
Foto: Adriano Gambarini
Lycalopex vetulus
Foto: Luis Claudio Marigo
Lycalopex gymnocercus
* Adaptado de CENAP/ICMBio ( fevereiro 2012)
F. Garcez et al. (in prep)
Foto: Adriano Gambarini
Lycalopex vetulus
Foto: Luis Claudio Marigo
Lycalopex gymnocercus
* Adaptado de CENAP/ICMBio ( fevereiro 2012)
F. Garcez et al. (in prep)
Foto: Adriano Gambarini
Lycalopex vetulus
F. Garcez et al. (in prep)
L. gymnocercus
mtDNA
D-loop (614 pb)
Maximum likelihood
L. vetulus
F. Garcez et al. (in prep)
7
23
Nordeste
4
3
Centro-Oeste
Sudeste
Lycalopex gymnocercus
5
6
8
F. Garcez et al. (in prep)
Análise de marcadores
nucleares (11 locos de
microssatélites)
Hipótese de trabalho:
Hibridação recente entre L. vetulus e L. gymnocercus,
induzida por ação antrópica
Perspectiva:
Análises populacionais detalhadas em escala genômica.
Agradecimentos
William Murphy
Mark Springer
Steve O’Brien
Thales R. Freitas
Sandro L. Bonatto
Marilyn Raymond
Fred Lemos
Tadeu Oliveira
Leandro Silveira
Constanza Napolitano
Warren Johnson
Robert Wayne
Klaus Koepfli
Kris Helgen
Dênis Sana
Ronaldo G. Morato
Flávio Rodrigues
Gitana Cavalcanti
Rogério de Paula
Rodrigo Jorge
Priscilla Villela
Apoio: CNPq, CAPES, FAPERGS, NIH, NSF, FNMA,
CESP, WCS, WWF, CVRD, PETROBRAS
Tatiane C. Trigo
Cristine S. Trinca
Manoel F. Rodrigues
Taiana Haag
Ligia Tchaicka
Renata Bornholdt
Alexsandra Schneider
Lucas Gonçalves
Henrique Figueiró
Taiz L. Simão
Flavia Tirelli
Marina Favarini
Laura Heidtmann
Fabrício Garcez
Isadora França
Gustavo Lorenzana
Fernanda Trindade
Sarah Dias dos Santos
Maria Eduarda Appel

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