Sabatina Ecologia Microbiana comentada

1.
[3.500] (IP:281473819190826 | 19:14:37 | 21:35:18 | 20:41 | 5456.738)
Discuta o artigo desta semana de forma detalhada o suficiente para que o leitor de seu resumo
tenha um bom entendimento do artigo.
De acordo com o artigo “Microbiology is the basis of sustainable agriculture: an opinion” a partir da
revolução verde houve uma intensificação no uso de tecnologias na agricultura, através do uso intensivo de
agroquímicos, o que tem contribuído para o aumento da poluição, da perda da biodiversidade e mudanças
climáticas. Por isso, nos últimos anos tem-se investido em técnicas que provocam a perturbação mínima do
ambiente, minimizando o uso de insumos agrícolas, entre elas está o uso microorganismos na nutrição
vegetal e animal e no controle biológico de doenças e pragas. O artigo tem como enfoque a relação
simbiótica entre microorganismos e plantas, que está relacionada a parte nutricional, pois essas associações
permitem as plantas terem acesso aos nutrientes pouco disponíveis no solo, principalmente N e P. As
bactérias fixadoras de nitrogênio e os fungos micorrizicos são os principais microorganismos que se
associam as plantas de maneira benéfica. As associações se baseiam em trocas de nutrientes, onde o
microorganismo recebe C e em troca oferece N e P para que a planta se desenvolva de maneira mais
eficiente. As bactérias fixadoras de nitrogênio, rizobios, e as leguminosas co-evoluiram por milhões de anos,
de modo que genes específicos são responsáveis para reconhecimento, nodulação e a simbiose ocorra.
Portanto a simbiose entre bactérias fixadoras e plantas é ativada por sinais de nodulação emitidos pelo
hospedeiro, codificados por dezenas de genes (nod/noe/nol) presentes na maioria das espécies de
Rhizobium. Com o processo de domesticação de algumas leguminosas, a simbiose foi prejudicada, por isso
com o melhoramento genético busca-se otimizar as associações. As associações entre plantas e fungos
micorrizicos (VAM) é fundamental para que as plantas tenham acesso ao P que é um nutriente pouco móvel
no solo. Há uma imensa gama de microorganismos endofiticos, porém poucos foram bem caracterizados
quanto a genética e funcionalidade, as principais funções dos endofiticos é o controle de doenças e pragas,
fixação de N e desintoxicação de contaminantes ambientais. No geral, o que se busca é o conhecimento dos
fatores genéticos, bioquímicos entre outros, envolvidos no processo de simbiose entre microorganismos e
plantas, principalmente através de técnicas moleculares, de modo a otimizar essas interações, reduzindo
assim o uso de agroquímicos na agricultura e consequentemente os impactos ambiental e ecológico
provocados pelo uso desses produtos, buscando um modelo de agricultura mais sustentável.
embora excessivamente sumário tocou nos pontos principais
2. [2.000] (IP:281473819190826 | 19:15:34 | 19:24:46 | 09:12 | 35.813)
Um mesmo método pode avaliar diversidade e atividade microbianas no solo?
Um mesmo método não pode ser utilizado para avaliar a diversidade e a atividade microbianas no solo, pois
são baseadas em princípios diferentes. A avaliação da atividade é baseada, principalmente, nas reações
bioquímicas realizadas pelos microorganismos como a respiração, produção de calor, concentração de ATP,
atividades enzimáticas, neste último se enquadra atividades relacionadas aos organismos fixadores de
nitrogênio, amonificadores, desnitrificadores, metanogênicos entre outros. Para isso, são utilizadas técnicas
isotópicas, cromatografia, calorimetria, titulometria, bioluminescência, colorimetria e microscopia de alta
resolução. Enquanto que a avaliação da diversidade podem ser realizadas de maneira direta, semidireta ou
indireta. As avaliações diretas são baseadas na observação dos organismos em seu ambiente natural, através
da observação de estruturas como os nódulos, galhas, raízes colonizadas por fungos micorrizicos e também
da macrofauna ou de microscopia simples. As avaliações semidiretas são um pouco mais complexas, pois
envolvem a utilização de corantes, sondas genéticas e microscopia de alta resolução. Já os métodos indiretos
são bem mais complexos em relação aos dois primeiros, pois envolvem cultivo em meio de cultura,
estimativa da biomassa microbiana, biomarcadores ou moléculas assinatura e isolamento e identificação do
DNA do solo.
excelente
3. [2.000] (IP:281473819190826 | 19:15:54 | 19:25:54 | 10:00 | 29.678)
O que aparece primeiro: o solo ou a biota do solo? Justifique detalhadamente sua resposta.
A biota do solo aparece primeiro. O solo é formado a partir da interação entre o material de origem (rocha),
relevo, clima, tempo e organismos, portanto, os diferentes graus de ação de cada um desses fatores irá
interferir nas diferenças entre os tipos de solos encontrados e também entre os próprios horizontes de um
mesmo solo. A biota do solo tem fundamental participação na formação do solo, através da adição e
decomposição da matéria orgânica, formação da estrutura do solo, formação de agregados, abertura de
galerias, ciclagem e disponibilização dos nutrientes para outros organismos, portanto é um dos principais
componentes do solo.
ótimo
4. [2.000] (IP:281473819190826 | 19:16:15 | 19:26:24 | 10:09 | 28.983)
Qual a ligação entre PCR e extremófilos?
A PCR (Reação em Cadeia da Polimerase) é um método de amplificação do DNA fora do organismo vivo,
ou seja, in vitro. Esta técnica tem sido utilizada em laboratórios para diversos fins, como o seqüenciamento
de genes, teste de paternidade, medicina forense, diagnóstico de doenças, melhoramento genético, entre
outros. No entanto, essa técnica só se tornou possível com a descoberta de um organismo extremófilo, a
bactéria Thermus aquaticus, encontrada em fontes hidrotermais. A partir dessa bactéria foi obtida a enzima
Taq DNA Polimerase, que é uma DNA Polimerase termoestável, portanto capaz de suportar a alta
temperatura do termociclador que pode chegar a 96 oC, necessária para que ocorra a desnaturação da
molécula DNA, permitindo que os fragmentos de DNA desejados possam ser replicados com mais
eficiência.
ok
5. [2.000] (IP:281473819190826 | 19:16:30 | 19:27:03 | 10:33 | 37.276)
Compare métodos de avaliação de diversidade e de população microbianas no solo.
As avaliações de diversidade e de população microbiana podem ser realizadas por métodos semelhantes, no
entanto a avaliação da diversidade tem como objetivo a identificação das espécies, estirpes ou raças dos
microorganismos, enquanto que a avaliação de população visa o conhecimento do número mais provável de
microorganismos (NMP) de uma determinada espécie ou estirpe presentes no solo. As avaliações podem ser
realizadas por métodos diretos, semidiretos e indiretos. As avaliações diretas são realizadas a partir de
microscopia simples e também da observação de estruturas morfológicas como nódulos, galhas e raízes com
fungos micorrizicos. As avaliações semidiretas utilizam microscopia de alta resolução associada a utilização
de corantes e sondas genéticas, mais utilizado em trabalhos com micorrizas, nematóides e esporos. Enquanto
que as avaliações indiretas são mais complexas e trabalhosas, mas apontam resultados bastante precisos.
Entre estas técnicas pode-se citar o isolamento e cultivo em meios de cultura, que podem ser liquido, sólido
e semi-sólido com relação a consistência e sintéticos e complexos com relação à composição. A utilização
de meios de cultura para avaliação de diversidade e contagem de microorganismos tem como principal fator
limitante o fato de apenas 1% dos organismos do solo ser cultivável em laboratório. A contagem de
microorganismos é baseada em tabelas estatísticas. O uso de biomarcadores ou “moléculas assinatura” e
isolamento e identificação do DNA do solo são técnicas mais precisas de avaliação da diversidade, pois
englobam os microorganismos não cultiváveis e parasitas obrigatórios. No primeiro caso, através de análises
bioquímicas identificando substancias que são especificas de um determinado grupo de organismos como o
ergosterol. A utilização do DNA do solo, onde é realizada a extração do DNA de amostras do solo, que pode
ser caracterizado por diferentes técnicas, onde fragmentos de DNA específicos, rDNA 16S para bactérias e
rDNA 18S para eucariotos, são amplificados através de PCR. Além disso, as avaliações da população
microbiana pode ser feita pela quantificação da biomassa microbiana, através fumigação-incubação e
fumigação-extração.
ok
1.
[2.000] (IP:281473857233406 | 18:23:47 | 22:21:00 | 57:13 | 46.609)
O que aparece primeiro: o solo ou a biota do solo? Justifique detalhadamente sua resposta.
A biota do solo aparece primeiro se nos lembrarmos dos fatores de formação do solo podemos observar
cincos fatores importantes que são eles: clima, organismos, relevo, material de origem e tempo. Então os
microrganismos se incluem entre esses fatores atuando como agente pedogenético estes atuam interagindo
diretamente com o material de origem promovendo seu intemperismo e remobilização, dentre esses
podemos citar bactérias, fungos, protozoários, nematoides, cupins, minhocas, formigas etc. Para o
intemperismo podemos destacar participação de microrganismos através de reações que liberam prótons,
nutrientes inorgânicos e ácidos orgânicos. Como outras atividades podemos destacar a ação remobilizadora
dos horizontes através de sua atividade escavadora, atribuindo à meso e macrofauna do solo a criação de
galerias, o transporte de elementos finos das camadas profundas dos solos para superfície, a subdivisão dos
matérias grosseiros facilitando o ataque microbiano e a exportação de substâncias ao longo do perfil
modificando suas características físico-químicas.
excelente
2.
[2.000] (IP:281473857233406 | 18:25:14 | 22:23:40 | 58:26 | 6.257)
Como o meio de cultura utilizado para incubação do solo afeta a avaliação da diversidade
microbiana?
Por sua facilidade de execução, este é o método de avaliação da ocorrência, densidade e diversidade mais
adotado. Embora sofra uma série limitação, pois estima-se que apenas cerca de 1% ou menos dos
organismos do solo seja cultivável, isto é, apresentem crescimento em meio de cultura. Assim, contagens
por esse método apresentem sempre resultados subestimados da densidade de organismos do solo. Além
disso, características morfológicas, fisiológicas e bioquímicas em meio de cultura não refletem
necessariamente o mesmo status encontrado no solo. Há dois tipos de meios de cultura em relação á
composição os sintéticos e os complexos. Os meios sintéticos são aqueles em que a composição química é
exatamente conhecida esse tipo de meio são normalmente utilizados para o crescimento de organismos
autotrófico. Os meios complexos apresentam composição indefinida, esses meios são utilizados
normalmente para bactérias heterotróficas e fungos.
No caso de microrganismos anaeróbicos deve-se utilizar um meio especial denominado de meio redutor,
este apresenta em sua composição um reagente como o tioglicolato de sódio que é capaz de se combinar
com oxigênio dissolvido e eliminando-o da cultura. Existem meios que proporcionam o desenvolvimento de
vários tipos de microrganismos chamados de meios de uso geral, que passam a ser chamados de meio
enriquecido quando são complementados com alguma substância de forma a fortifica-lo. Meios seletivos são
meios que apresentam substâncias que favorecem o crescimento de determinado microrganismo e/ou inibem
o crescimento de outros no meio, por exemplo, neste meio há componentes como sais de bile e cristal de
violeta (que inibem o desenvolvimento de bactérias-gram positivas), ou substratos degradados somente por
alguns tipos de microrganismos, ou antibióticos. Então de acordo com as diferenças na composição dos
meios de cultura citados podemos encontrar condições de crescimento microbiano diferenciado o que pode
afetar a avaliação da diversidade microbiana.
rodou, rodou, encheu linguiça, fugiu da pergunta, mas terminou respondendo bem no finzinho. Só um ponto
está errado quanto ao meio sintético ou simples. Ele também é muito utilizado para heterotróficos, quando
queremos avaliar se utilizam uma determinada fonte de C ou se produzem determinados aminoácidos por
exemplo. Assim, o método tradicional para encontrar organismos celulolíticos é um meio simples em que a
celulose é a única fonte de C, e portanto quem quer que cresça tem de produzir celulase
3.
[3.750] (IP:281473857233406 | 18:25:41 | 22:28:25 | 02:44 | 1.639)
Discuta o artigo desta semana de forma detalhada o suficiente para que o leitor de seu resumo
tenha um bom entendimento do artigo.
O artigo de titulo Microbiology is the basis of sustainable agriculture: an opinion refere-se ao uso da
microbiologia agrícola como uma das estratégias promissoras a ser usada na agricultura sustentável. A
microbiologia agrícola apresenta-se como um campo de pesquisa sintético responsável pela transferência de
conhecimento de microbiologia geral e ecologia microbiana para as biotecnologias agrícolas e através dos
conhecimentos adquiridos com esta estratégia podemos substituir algumas medidas adotadas pela agricultura
intensiva que tem com passar dos anos proporcionado um alto custo ecológico contribuindo para a poluição
mundial e perda de biodiversidade. O uso da microbiologia agrícola pode alcançar alguns objetivos como
substituir agrotóxicos perigosos (fertilizantes minerais, pesticidas), poder melhorar as funções adaptativas e
de nutrição de culturas e pecuária e uma diminuição do custo e melhoria da qualidade dos produtos
agrícolas. Para a nutrição microbiana de plantas o destaque principal é a simbiose onde microrganismos e
plantas se associam, o modelo mais estudado para a simbiose nutricional é a associação leguminosa e
rizobios fixadores de nitrogênio atmosférico está é uma interação mutualística que se baseia no feedback
positivo entre os parceiros, ou seja, é uma interação que traz beneficio para ambos os parceiros planta e
microrganismo. Em leguminosas, esses feedbacks são combinados com a regulação sistémica da formação
de nódulos, que envolve os elementos comuns para a defesa de agentes patógenos, em leguminosas o sinal
sistêmico lançado para a emergência dos primórdios nodulares é reforçada pela oferta de nitrato externo,
levando à restrição da nodulação por fertilizante N. Esta restrição é implementada através de um sinal a
partir de folhas o que reflete a dependência do desenvolvimento simbiose com a taxa de fotossíntese. Do
lado do rizóbio o desenvolvimento da simbiose é ativado por alguns sinais específicos (fator Nod) que são
codificados por dezenas de genes como o nod/nol/noe.
Nas plantas existe uma ampla gama de microrganismos em seus tecidos vegetais as comunidades
microbianas podem estabelecer associações de forma endofítica que são organismos que colonizam
internamente seus tecidos e epifitica organismos que vivem na superfície de sues tecidos. Estas comunidades
tem sido objeto de estudos principalmente através de técnicas oriunda da genética molecular. Através destas
pesquisas uma grande diversidade da microflora endofitica, tem sido revelada só que apenas alguns
representantes da comunidade endofitica foram geneticamente e funcionalmente caracterizado como é o
caso de fixadores de N2 Azoarcus sp , para a maioria dos microrganismos endofíticos os impactos
adaptativos permanecem obscuro. As principais funções dos microrganismos endofiticos são controle
biológico de patógenos e fixação de N2 apenas para algumas espécies de bactérias endofiticas porque genes
nif só foram encontrados em uma pequena fração dessas espécies. As comunidades microbianas epifítica são
mais numerosa e funcionalmente diversificadas na rizosfera e rizoplano. As interações plantamicroorganismo dentro da rizosfera têm sido amplamente analisadas, no entanto a atenção tem sido dada
apenas para alguns microrganismos, como por exemplo, para espécies fixadores de N2 Azospirillum e
defensivas pseudômonas.
O potencial agronômico do produto da associação simbiótica entre planta e microrganismo a partir da
análise de seus impactos ecológicos têm sido estudados para melhor fixação N2 e simbiose micorrízicos.
Está preparação das espécies microbianas podem ser utilizadas para melhorar a produtividade vegetal. Então
um maior conhecimento das associações entre plantas e microrganismos pode proporcionar formas eficazes
de desenvolvimento de uma agricultura sustentável a fim de garantir a produção de alimentos para humanos
e animais com um mínimo de perturbação do ambiente.
para começo de conversa agrotóxico é um termo pejorativo, e pouco técnico. O termo adequado é
agroquímico, ou defensivo agrícola. Para continuar a conversa, adubo não é defensivo agrícola, nem muito
menos agrotóxico, embora seja um agroquímico. de resto, ok, mas espero um maior nível de
aprofundamento no futuro
4.
[1.500] (IP:281473857233406 | 18:26:05 | 22:29:15 | 03:10 | 1.62)
Discuta métodos de avaliação de diversidade e sua aplicação.
Os métodos de avaliações de ocorrência de diversidade são descritos como métodos diretos, semidiretos e
indiretos. As avalições diretas destaca-se por observar os organismos como ocorrem em seu habitat, ou
ainda avalia-lo após um método de coleta relativamente simples. Alguns exemplos de avalições diretos são
através de estruturas morfológicas como avaliação da nodulação por rizóbios em leguminosas, microscopia
simples usada para avaliar colonização micorrízica, extração simples usada para macrofauna. Este método
direto tem a vantagem de considerar os microrganismos não cultiváveis. Avaliações semidiretas, para está
avalição as amostras de solos são submetidas a algum processo ou tratamento mais complexo que causa
pouca ou nenhuma alteração na característica a ser estudada. Células ou componentes celulares são tratados
com corantes fluorescente, com ou sem antígenos específicos ou ligados a sondas genéticas, que são
segmentos de DNA específicos marcados com corantes fluorescentes ou por radiotividade utilizados para
detectar a presença de sequência complementar de DNA ou RNA, para a visualização microscópio
especifico, está é uma técnica que considera uma maior quantidade de microrganismos em relação ao cultivo
em meio de cultura.
Método de avaliação indireto nessas avaliações os processo são bem mais complexos que os anteriores e
muitas vezes baseado em premissas. Podemos destacar as seguintes avaliações para este método indireto:
meios de cultivo nutritivo, este é o mais adotado dos métodos de avalição da ocorrência, densidade e
diversidade por causa de sua facilidade de execução. É um método em que a população de microrganismos é
avaliada por meio de cultivo em meio de cultura liquido, sólido ou semi-sólido, utilizando diversas
diluições, este modo de avaliação produz uma estimativa da densidade da população de microrganismo de
uma amostra, porém é um método de avaliação que apresenta suas limitações contagens por esse método
apresentam sempre resultados subestimados da densidade de organismos do solo, além disso o meio de
cultura utilizado não refletem necessariamente o mesmo status encontrado no solo e não considera os
microrganismos não cultiváveis. Outro método indireto de avalição é a biomassa microbiana entre os
principais métodos empregados para avaliação da biomassa microbiana temos a fumigação-incubação e
fumigação-extração, estes métodos se baseiam na avaliação do carbono contido nos microrganismos. Para
avaliação em fumigação-incubação se usa amostras de solos que são fumigadas com clorofórmio e outra
amostra não fumigada, estas duas amostras são incubadas em frasco separado contendo uma base que vai
capturar o CO2 resultante da respiração decorrente do crescimento dos organismos inoculados, usando como
substrato os organismos mortos pela fumigação. Pelo método da fumigação-extração o carbono liberado pela
morte dos microrganismos pelo clorofórmio é determinado por extração, oxidação e digestão química,
seguidas pela titulação. Outro método de avaliação indireta é através de biomarcadores ou moléculasassinatura, são importantes para identificar a presença de determinados organismos ou classes de organismos
que os produzem, uma vantagem deste método é que estes não requerem remoção das células de seus
ambientes naturais, alguns exemplos de moléculas marcadoras são ergosterol, ácidos murâmicos e
diaminopimélicos, ácidos nucléicos (DNA e RNA) também podem ser considerados biomarcadores. Outro
método é o isolamento e identificação do DNA do solo para este método existem duas técnicas diferentes
uma é a extração de células inteiras que portanto podemos admitir que estão vivas, a segunda técnica é lise
direta o solo é submetido diretamente a algum tipo de tratamento que normalmente incluem temperaturas e
reagentes que vão quebrar todas as células e extrair o DNA, neste caso vai extrair o DNA “vivo ou morto”.
resposta bastante boa quanto aos métodos, infelizmente misturou alhos e bugalhos. Grande parte dos
métodos citados não tem nada a ver com avaliação de diversidade, tal como respiração e seus derivados.
Estes determinam população ou atividade microbiana.
5.
[2.000] (IP:281473857233406 | 18:26:33 | 22:30:30 | 03:57 | 7.37)
Como a variabilidade do solo, em suas diversas escalas, afeta a composição da biota do solo?
O solo como habitat é um sistema heterogêneo descontinuo e estruturado, formado por micro-habitats
discretos com diferentes características químicas, físicas e comunidades biológicas. Esses micro-habitats ou
microssitios é o local particular ou volume de solo, onde células, populações ou comunidades microbianas
são encontradas e cujo status físico-quimico, influência seu comportamento. Esses microssitios do solo
podem sofrer mudanças rapidamente influenciando na biodiversidade de microorganismos, portanto a
grande variabilidade dos micro-habitats com seus respectivos microambientes permite a coexistência de
organismos com características bastante distintas. No solo o desenvolvimento de microorganismos depende
da disponibilidade de nutrientes, pH, temperatura, umidade, aeração, estrutura, textura etc. Muitas dessas
características podem variar de solo para solo ou em um mesmo solo podemos ter diferenças nestas
características resultando nos diferentes microssitios até próximos um do outro, o que vem a afetar na
variação da biota do solo. Aqui vamos citar alguns exemplos de variabilidade do solo que pode afetar a
composição da sua biota. O arranjamento das partículas minerais do solo pode resultar em diferentes
agredados e estruturação, quando analisamos a estruturação de um solo sempre observamos propriedades
como a distribuição de macroporos e microporos, propriedades essas que vão refletir em outras propriedades
como aeração e infiltração de água (umidade do solo) sendo que essas características também devem
influenciar na sobrevivência e na diversidade de microorganismos, por exemplo, a porosidade não só está
relacionada ao conteúdo de água e gases, mas também com a disponibilidade de espações para os macros e
microorganismos. Poros com alguns micrômetros (2 a 6) são adequados para a entrada de bactérias,
enquanto fungos necessitam de poros maiores. Quando observamos a fase sólida com destaque para
partículas minerais como areia, silte e argila alguns trabalhos observam a existe de uma relação entre a
biomassa microbiana e atributos edáficos do solo tais como o teor de argila. Por exemplo: a argila aumenta a
adsorção de compostos orgânicos e nutrientes, proporciona maior capacidade tampão da acidez e protege os
microrganismos contra predadores (os microrganismos ficam adsorvidos às partículas de argila) isto é um o
reflexo da propriedade mineral do solo que pode influenciar na biota do solo. Ao analisar outro atributo do
solo que pode afetar a população microbiana de um solo podemos ter como exemplo o pH do solo (atributo
químico) os micorganismos do solo são muito sensíveis às variações de pH geralmente as bactérias e
actinomicetos preferem pH de neutro à alcalino e os fungos pH ácido. Outro ponto importante é a
disponibilidade de substrato em um solo os microorganismos ocupam em torno de 0,5% do espaço poroso
do solo, essa porcentagem pode aumentar significativamente no solo rizosférico, devido ao aumento na
disponibilidade de substrato. Em um solo não rizosférico com ausência de ingredientes necessários para seu
metabolismo a maioria dos microrganimos se encontra morta ou em dormência, porém é importante a
natureza dos matérias que fornecem carbono, nutrientes e energia e a dinâmica dos fatores físicos-químicos
afetando o metabolismo e a disponibilidade de substrato.
Vamos tomar como exemplo um solo A que apresentar dois microssitios com características físico-quimicas
diferentes: microssitio A1 caracterizado por apresentar maior quantidade de macroporos que de microporos
resultando em menor retenção de água, apresenta um pH baixo (ácido). O microssitio A2 já apresenta uma
maior quantidade de microporos (umidade maior), pH tendendo mais a alcalinidade, sendo que neste
microssitio o excesso de água pode provocar condições de anaerobiose especifico no interior dos agregados.
Ao analisarmos a biota dos dois microssitios com condições físico-quimicas diferentes podemos observar
uma diversidade como, por exemplo, podemos ter no A1 microrganismo que toleram a acidez a onde
microorganismos sensíveis a essa propriedade química possivelmente não conseguiriam sobreviver a estas
condições e também estaria presente microorganismos com metabolismo aeróbio. Para o A2 já teria a
presença de microorganismos que preferem pH neutro a alcalino, e teríamos microoganismo com
metabolismo microbiano anaeróbico quando este microssitio apresentar condições de anaerobiose. Então
pequenas distâncias como milímetros no solo podem ter uma condição de oxigênio, luz e nutrientes diferente
que propicia o desenvolvimento de variados microrganismos.
excelente, mas tem características peculiares para um aluno de mestrado, com indicações fortes de ter
copiado de otura fonte. eu não vou fazer um cheque detalhado, e corrijo sem saber o autor, mas sugiro que
avaliem (isto vale para todos) se realmente vocês estão respondendo à questão, ou se estão copiando de
alguma fonte, inclusive sabatinas anteriores, já que vi que algumas foram acessadas nos últimos dias. Usar
estas respostas anteriores para ajudar a entender o assunto é muito bom, mas a resposta tem de ser sua, afinal
a função principal da sabatina é ajudar VOCÊ a saber se entendeu bem o assunto, e poderá utilizar estes
conhecimentos no futuro,
1.
[3.500] (IP:281473857229962 | 18:18:18 | 23:07:55 | 49:37 | 5.933)
Discuta o artigo desta semana de forma detalhada o suficiente para que o leitor de seu resumo
tenha um bom entendimento do artigo.
1- Discuta o artigo desta semana de forma detalhada o suficiente para que o leitor de seu resumo tenha um
bom entendimento do artigo.
O artigo trata da relação entre a microbiologia e agricultura sustentável, onde a principal função é relacionar
conhecimentos científicos com ênfase em uma melhoria das principais funções produtividade das plantas
através de manipulações e até mesmo a substituição de perigosos agroquímicos (fertilizantes minerais,
pesticidas) com micro-organismos (bactérias, fungos) interagindo com plantas agronomicamente em uma
relação simbiótica, gerando uma diminuição dos custos e uma melhora da qualidade dos produtos agrícolas.
Para isso o texto tras um retrospecto histórico negativo da evolução da agricultura o qual cita um sistema de
produção agrícola de uso intensivo dos meios de produção na qual se produz grande quantidade de um único
tipo de produto (latifúndio) gerando um alto gasto de combustíveis e recursos naturais conduzindo a um alto
impacto ambiental que ocorreu em meados do século 20. Nessa nova concepção, procurava-se maximizar a
produção agrícola com intervenções diversas, dentre as quais o uso super estimado de adubos químicos.
Estas estratégias trouxeram sérios problemas para os ecossistemas nos quais foram aplicados
indiscriminadamente, problemas esses que despertaram a consciência para uma agricultura mais racional e
comprometida com o meio ambiente.
O texto cita a importância de dois processos e como ocorre a transmissão de microrganismos entre plantas,
animais e solo através de uma relação entre microrganismo e planta e a outra entre bactérias fixadoras de
nitrogênio e solo, citando as relações mutualísticas como a mais eficaz. Na relação entre microrganismo e
planta existem várias comunidades de bactérias que tem relação direta com a planta. Onde essas
comunidades é estudo de varias pesquisas molecular implementado por técnicas, tais como terminais de
comprimento de fragmentos de restrição e análise de polimorfismo (t-RFLP), a desnaturação em gel de
gradiente
eletroforese, clonagem e sequenciamento de rDNA.
Contudo a aplicação dessa tecnica de substituição de produtos agroquímicos, geralmente é parcial e só às
vezes pode ser completa, por exemplo, na cultura de leguminosas doméstica. Porém, a domesticação e
seleção de plantas deram origem a uma perda da sua atividade simbiótica.
A aplicação agricultura sustentável com o uso de relações simbióticas para o desenvolvimento da planta ou
funções defensivas pode representar um campo promissor para biotecnologia agrícola. As perspectivas para
um desenvolvimento futuro da agricultura microbiologia pode envolver novas tecnologias.
bastante superficial, mas pelo menos não colocou adubo como agrotóxico, embora ainda tenha colocado
como um agroquímico perigoso. embora concorde que a substituição do adubo por microbiota sempre que
possível seja muito interessante, isto não quer dizer que adubo seja ruim, como seu texto pareça dizer.
2.
[1.000] (IP:281473857229962 | 18:21:24 | 23:08:08 | 46:44 | 6.318)
Discuta métodos de avaliação de diversidade e sua aplicação.
2- Discuta métodos de avaliação de diversidade e sua aplicação.
Solo é uma coleção de corpos naturais, formado por materiais minerais e orgânicos contendo
microrganismos vivos. A biodiversidade de plantas e animais são grandemente conhecidas e estudadas,
enquanto a diversidade de microorganismos é, na sua maior parte, desconhecida. Microorganismos
apresentam riqueza em diversidade molecular e química, visto que eles estão na base de processos básicos
do ecossistema. Há somente 1,7 milhões de espécies descritas.
Dependentes de cultura
Bactérias são isoladas do ambiente e postas em cultura;onde os Ácido nucléico é extraído da cultura de
bactérias para fins de identificação.
Desvantagens:
Não é possível cultivar uma ampla variedade de microorganismos;
As bactérias isoladas representam uma pequena parte do que está realmente presente naquele local.
Independentes de cultura
Ácido nucléico é extraído diretamente das amostras coletadas; Geralmente é feita a amplificação do DNA a
partir do RNA extraído, por PCR. Pode haver clonagem e seqüenciamento do amplificado para identificar e
enumerar as espécies bacterianas presentes na amostra. A extração de ácidos nucléicos diretamente das
amostras do ambiente chama a atenção para a grande proporção de microorganismos que não são facilmente
cultivados em laboratório, mas que tem grande importância em atividades de biodegradação.
superficial e não incluiu vários métodos diretos, como os aplicados em fauna...
3.
[2.000] (IP:281473857229962 | 18:22:31 | 23:08:18 | 45:47 | 5.327)
Qual a base lógica de técnicas como DGGE, TGGE ou RFLP?
3- Qual a base lógica de técnicas como DGGE, TGGE OU RFLP?
A técnica de RFLPenvolve a clivagem do DNA por enzimas de restrição, a separação por eletroforese,em
gel de agarose ou poliacrilamida, dos fragmentos gerados na clivagem e suavisualização em forma de
bandas (Ferreira, 1998).
As técnicas que se baseiam na migração diferencial de fragmentos de nucleotídeos de mesmo tamanho têm
sido amplamente usadas como ferramenta no estudo da diversidade de microrganismos presentes em
amostras complexas, como solo, água, plantas e alimentos. Devido à diferença na seqüência de bases,
fragmentos de mesmo tamanho podem ser separados eletroforeticamente em géis desnaturantes (DGE) como
os aplicados nas técnicas de DGGE (denaturant gradient gel electrophoresis), TGGE (temperature gradient
gel electrophoresis), TTGE (temporal temperature gel electrophoresis).
A capacidade dessa técnica de eletroforese desnaturante em discriminar seqüências de DNA de fragmentos
de mesmo tamanho permite a geração de padrões de bandas variáveis de acordo com a composição de
microrganismos em diferentes amostras ambientais. Desde então, diversos autores têm aplicado esta técnica
como ferramenta no estudo da diversidade microbiana para identificar diferenças no padrão de bandeamento
dos produtos de PCR derivados de amostras ambientais. A princípio o uso dessa técnica para geração de
“fingerprinting” em amostras ambientais permite que quaisquer produtos de amplificação por PCR de várias
amostras sejam analisados por DGGE/TGGE, gerando muitas informações sobre a composição e flutuação
de populações no ambiente em curto espaço de tempo, sem que haja necessidade da aplicação de técnicas
tradicionais de isolamento.
Uma das limitações para a análise da diversidade são os “primers” usados na reação de PCR, os quais
devido à especificidade para um grupo filogenético restringem a avaliação da riqueza (número de espécies).
A proporção entre indivíduos é outro parâmetro que não pode ser analisado pelas técnicas disponíveis.
Como uma das restrições pode se considerar que os sistemas de desnaturação empregados nos géis de
DGGE/TGGE têm um baixo poder de resolução e não existe uma forma garantida de definir a temperatura
de desnaturação (Tm) da hélice do DNA.
excelente
4.
[1.500] (IP:281473857229962 | 18:23:22 | 23:08:27 | 45:05 | 3.452)
Pode existir uma simbiose indireta? Justifique sua resposta.
4- Pode existir uma simbiose indireta? Justifique sua resposta.
Simbiose é a relação interespecífica (de espécies diferentes) que ocorre entre dois ou mais organismos de
espécies diferentes, de forma mutuamente vantajosa.
Essa associação íntima entre organismos ocorre em plantas, animais, fungos, bactérias, etc., onde cada um
contribui positivamente beneficiando a sobrevivência do outro e a de si próprio.
Tradicionalmente, a simbiose é definida como uma relação mutuamente benéfica envolvendo contato físico
muito próximo entre dois organismos que não são da mesma espécie.
Há várias formas de simbiose. Em algumas situações, como na simbiose forçada, os organismos necessitam
da relação simbiótica para poder sobreviver. Já no caso da simbiose facultativa, a relação simbiótica dá a
cada organismo uma chance maior de sobrevivência, mas não é absolutamente necessária. Relações
simbióticas nem sempre são simétricas, elas podem ser forçadas para certos organismos e facultativas para
outros.
Um organismo pode fazer sua morada diretamente no corpo de outro organismo, ou mesmo viver dentro
dele. É importante considerar a relação bioquímica entre dois organismos. Se eles estiverem gerando e
compartilhando enzimas, proteínas, gases ou outras substâncias químicas, logo podemos concluir que existe
simbiose indireta.
só foi tentar responder no finzinho, e só vi dizer que podia existir. O ponto é que pode existir realmente, mas
quando dois organismos que já são simbióticos entrarem em simbiose com um terceiro. Um exemplo é a
simbiose entre micorrizas e "mycorrhiza helper bacteria". assim, a simbiose entre MHB e planta poderia ser
considerada como indireta
5.
[1.500] (IP:281473857229962 | 18:24:16 | 23:09:05 | 44:49 | 12.213)
Compare métodos de avaliação de diversidade e de população microbianas no solo.
5- Compare métodos de avaliação de diversidade e de população microbianas no solo.
Primeiramente os métodos de avaliação da diversidade e de população diferem quanto ao conceito. A
avaliação da diversidade visa identificar as diferentes espécies ou estirpes de microrganismo no solo
enquanto que a avaliação de população microbiana no solo visa identificar o número mais provável de
microrganismos (NPM) de uma mesma espécie ou grupos de espécies. Mas, podem ser avaliados por
métodos semelhantes. As técnicas de avaliação da diversidade bem como da população são muito
trabalhosas e, na maioria das vezes, fornecem estimativas do real número que o solo principalmente as que
utilizam meios de cultura para isolamento da diversidade/população de microrganismos do solo. A
diversidade é avaliada mais precisamente utilizando biomarcadores como de caráter genético ou bioquímico,
por exemplo, o rRNA 16S para distinção entre espécies. Grupos de organismos podem ser identificados
também utilizando biomarcadores como ergosterol, ácidos murâmicos e diaminopimélicos ou mesmo pelo
microscópio. Contudo, a avaliação da diversidade utilizando meios de cultura seletivos e microscopia devem
ser utilizados como estudo preliminar. (Silveira e Freitas, 2005). A avaliação da diversidade de diferentes
estirpes de uma mesma espécie ou de diferentes espécies pode ser realizada por meio da utilização de meios
de cultura. Por exemplo, a utilização de 96 formas diferentes de carbono orgânico (biolog) separadamente
em meios de cultura para isolamento de estirpes puras, mas isso não implica dizer que todas as estirpes
estarão presentes nesta amostragem visto que a utilização de mais de uma fonte de carbono no mesmo meio
pode proporcionar o isolamento de novas espécies. Além disso, a avaliação da diversidade de
microrganismos em meios de cultura só contabiliza os que podem ser cultivados, sendo assim,
microrganismos não-cultiváveis e parasíticos obrigatórios não serão contabilizados. Silveira e Freitas (2007)
citam que 99,5 a 99,9% das bactérias do solo não são cultiváveis em meios tradicionais, concluindo ser este
uma grande limitação da utilização deste método. Um modo mais preciso de avaliação da diversidade de
microrganismos do solo é por meio de identificação molecular, por exemplo, do rRNA 16S, sendo a
extração feita de amostras de solo. Por este método todos os microrganismos presentes na amostra de solo
são identificados em relação a este biomarcador. Características fenotípicas (Morfológicas, fisiológicas e
bioquímicas) e genéticas também são utilizadas para identificação da diversidade de microrganismos. Existe
também, índices que avaliam a diversidade de microrganismos como é o caso do índice de ShannonWeaver-H´. Uma grande importância da quantificação da diversidade de microrganismos é a sua utilização
para avaliação de impactos ou estresses ocorridos no ambiente, sendo os microrganismos bons indicadores
destas mudanças, pois possuem “alta sensibilidade a perturbações antropogênicas, correlação com diversas
funções benéficas do solo, papel direto em muitos do ecossistema ciclos biogeoquímicos etc.”(Silveira e
Freitas, 2007). A população de microrganismos assim como da diversidade é avaliada por meio de cultivo
em meio de cultura seja este líquido, sólido ou semi-sólido utilizando diversas diluições. Este modo de
avaliação produz uma estimativa da densidade da população de microrganismos de uma amostra. Para a
contagem de microrganismos utiliza se tabelas estatísticas ou podem ser estimados pela contagem das
colônias formadas multiplicando-as pelo seu fator de diluição. A população microbiana pode também ser
avaliada por métodos de quantificação da Biomassa microbiana como fumigação-incubação, fumigaçãoextração e respiração microbiana. Destaque deve ser dado também a forma de amostragem que dependendo
da época, vegetação etc. podem influenciar estes parâmetros.
embora seja uma boa resposta, tem vários pontos meio repetitivos, aparentemente pela falta de junção entre
as diversas fontes utilziadas.
1.
[2.000] (IP:281473816235900 | 14:00:38 | 15:26:53 | 26:15 | 26612.991)
Como a variabilidade do solo, em suas diversas escalas, afeta a composição da biota do solo?
A estrutura do solo depende da associação entre as partículas minerais (areia, argila e silte) e matéria
orgânica, onde agregados de diferentes tamanhos e estabilidade são formados. A organização estrutural das
partículas do solo produz um habitat heterogêneo para os microrganismos caracterizados por diferentes
substratos, nutrientes, conteúdo de água, valores de pH, concentração de oxigênio. O estado agregado do
solo origina poros na matriz permitindo a existência de ar e água necessários às suas funções biológicas. A
estrutura da comunidade, assim como a biomassa, é afetada pelo tamanho da partícula do solo, além disso,
as frações de argila e de silte possuem a maior diversidade microbiana. De acordo com aspectos geológicos,
climáticos, faunístico e florístico, por exemplo, além da influência do homem, o solo apresenta propriedades
que determinam a sua comunidade microbiana. A biota do solo, conforme o seu tamanho, pode ser dividida
em micro, meso e macrorganismos, tanto para fauna quanto para flora. De acordo com as características
edáficas e climáticas exigidas pelo ambiente a densidade dos grupos de organismos podem variar, sendo as
bactérias o grupo mais numeroso. Além disso, fungos, bactérias e minhocas são aqueles que normalmente
possuem maior biomassa. Conforme Moreira & Siqueira (2006), a grande variabilidade dos microhabitats
com seus respectivos microambientes propicia a coexistência de organismos com características bastante
diferentes. Assim, os organismos possuem influência na origem e manutenção da organização dos
constituintes do solo.
ok
2.
[2.000] (IP:281473816235900 | 14:00:51 | 15:29:10 | 28:19 | 112.388)
Os meios de cultura mais comumente utilizados são complexos ou simples?
Os meios de cultura são substâncias (uma associação qualitativa e quantitativa), que fornecem os nutrientes
essenciais para o desenvolvimento (crescimento – cultivo) de microrganismos, em laboratório (fora do seu
meio natural). A avaliação de determinado organismo ou grupo em meio de cultura deve considerar suas
exigências específicas nutricionais e ambientais (condições favoráveis), como por exemplo, o tipo de
metabolismo e a temperatura (pode-se citar também o pH, pressão osmótica, umidade, entre outros),
respectivamente, assim como suas características funcionais. Os meios de cultura podem ser classificados,
conforme a sua composição química em simples ou complexos, sendo os mais comumente utilizados os
complexos. Os meios de cultura simples são aqueles em que os componentes são quimicamente definidos,
sendo utilizados normalmente para o crescimento de seres autotróficos (plantas, algas e algumas bactérias).
Já os meios de cultura complexos apresentam algum componente que possua composição variável, como
extrato de levedura, de carne, de plantas, ou produtos da digestão proteica. O meio de cultura complexo
encontrado na forma sólida é denominado ágar nutriente (com agentes solidificantes), e se encontrando na
forma líquida é denominado caldo nutriente (sem agentes solidificantes).
ok, mas o início parecia que não tinha entendido a pergunta
3.
[4.000] (IP:281473816235900 | 14:00:56 | 15:40:59 | 40:03 | 4.158)
Discuta o artigo desta semana de forma detalhada o suficiente para que o leitor de seu resumo
tenha um bom entendimento do artigo.
O artigo argumenta sobre a microbiologia ser a base da agricultura sustentável. As tecnologias de agricultura
intensiva, que garantiu a 'revolução verde' no século 20, teve um alto custo ecológico, contribuindo para a
poluição mundial, mudança climática desfavorável e a perda de biodiversidade. Com isso, maior atenção
tem sido dada ao desenvolvimento da agricultura sustentável. Para atingir esse objetivo, a estratégia é
substituir agrotóxicos perigosos, como fertilizantes minerais e pesticidas, por preparações favoráveis ao
ambiente de micróbios simbióticos. A microbiologia agrícola é apresentada como um campo de pesquisa
responsável pela transferência de conhecimento de microbiologia geral e ecologia microbiana às
biotecnologias agrícolas, tendo como principal objetivo a análise compreensiva sobre microrganismos
simbióticos (bactérias, fungos) interagindo com plantas agronomicamente importantes e animais, sendo
focado no artigo, as plantas. Microrganismos formam múltiplas simbioses com plantas, não sendo possível
obter um fornecimento equilibrado de nutrientes entre si: eles são submetidos a um desequilíbrio metabólico
geral obtendo um excesso de C, mas sofrem uma deficiência de outros macroelementos, principalmente de
N e P. Nas plantas, as interações com os microrganismos são diversas, variando de simbioses de duas partes,
como a simbiose nodular de leguminosa-rizóbio na fixação de N2, ou micorriza arbuscular, a multipartes de
comunidades endofíticas ou epifíticas (raiz-associada, filosfera). Os melhores modelos genéticos estudados
para simbioses nutricionais são associações de duas partes, que resultam na formação de sistemas genéticos
de superorganismos, responsáveis pela produtividade do hospedeiro. Assim, interações mutualísticas são
mais eficazes se baseadas no feedback metabólico positivo entre os parceiros, sendo mutuamente
estimulante, onde o fluxo intenso de N ou P simbiotroficamente adquiridos por nódulos ou raízes
micorrízicas estimulam a fotossíntese da planta, auxiliando o desenvolvimento de simbioses e proliferação
microbiana. Em leguminosas, esses feedbacks são combinados com a regulação sistêmica da formação de
nódulo, que envolve os elementos comuns para a defesa de patógenos (por exemplo, ácidos salicílico) e a
regulamentação do desenvolvimento não-simbiótico (por exemplo, HAR1 para o desenvolvimento de raízes
laterais). Os genes hospedeiros que controlam o desenvolvimento das simbioses podem ser considerados
como os principais determinantes para o desempenho de micróbios benéficos agricolamente importantes. O
desenvolvimento de programas responsáveis por gerar esses nichos são produtos de mais de 60 milhões de
anos de co-evolução de leguminosas com rizóbios. Isto resultou na co-evolução de sistemas genéticos entre
parceiros complementares que codificam para os subprogramas simbióticos responsáveis por infecção,
histogênese de nódulo, e endocitose de bactérias por células da planta. O primeiro subprograma foi
fornecido pelo ancestral de micorrizas vesiculares-arbusculares (VAM), em que a infecção nodular
compartilha muitos genes regulatórios Sym. VAM é um tipo ecologicamente muito importante de simbiose
nutricional formado por plantas terrestres com fungos Glomeromycota. Por meio dessa simbiose, 80-90%
das plantas terrestres obtem fornecimento de nutrientes, principalmente de fosfatos. Grande parte das plantas
mantem em seus tecidos e superfícies, comunidades de multipartes microbianas utilizando uma ampla
variedade de funções adaptativas. Estas comunidades são objetos de investigação molecular implementado
por 16 rDNA baseados em técnicas como eletroforese em gel com gradiente de desnaturação, clonagem e
sequenciamento de rDNA. Apenas alguns representantes das comunidades endofíticas foram geneticamente
e funcionalmente caracterizados. As principais funções dos micróbios endofíticos são controle biológico de
patógenos e/ou pragas, desintoxicação de contaminantes ambientais e, separação de plantas a partir de
resíduos de seu próprio metabolismo. Várias funções tróficas de endófitos podem ser adaptativamente
importantes, como a absorção N, P e Fe pelo solo. As saídas nutricionais e defensivas de interações plantasmicróbios podem ser melhoradas devido à regulação do crescimento de plantas, implementada através da
modulação do estado hormonal do hospedeiro. Os impactos são importantes sob estresses ambientais. Além
disso, as duas principais estratégias que podem estar envolvidas nesta regulação são a produção bacteriana
de fitohormônios, e a modulação da sua síntese nas plantas. Vários são os mecanismos de formação das
comunidades microbianas que residem em tecidos de plantas, sendo a principal via de ocupação das plantas
pela microflora externa através de fendas epidérmicas induzidas pela emergência das raízes laterais. As
comunidades simbióticas microbianas podem ser consideradas como os produtos de integração genética de
plantas hospedeiras com seus aliados microbianos, que estão na base da unidade estrutural / funcional dos
parceiros, sendo tal integração expressa mais claramente durante a co-evolução dos parceiros, podendo ser
avaliados através de genética de populações e abordagens de filogenia molecular. Além disso, fala-se no
texto que existem na regulação as comunidades local e sistêmica, relacionados à estratégias alternativas de
sua evolução. Alguns patógenos de colheita de plantas podem ter evoluído a partir dos componentes
regulares da microflora endofítica, funcionando como simbiontes benéficos (defensivos) em plantas
selvagens. As simbioses para fins nutricionais apresentam tipos localizados mais benéficos para as plantas
hospedeiras. Já as comunidades microbianas epifíticas são mais numerosas e funcionalmente diversificadas
na rizosfera e rizoplano. Uma combinação de nutrição, defensivos e funções regulamentares podem ser
difundidos nas comunidades da rizosfera. A análise destes sistemas utiliza abordagens de metagenômicas,
permitindo a separação de taxonômicas, estruturas populacional e metabólica, funções ecológicas de
comunidades microbianas, que resultaram da adaptação de vida livre, microflora do solo nos nichos
endossimbióticos. Funções expressas por micróbios simbióticos (tanto nutricional, defensiva, regulamentar e
controle biológico) em relação em seus hospedeiros estão relacionadas à utilização agronômica eficaz.
Contudo, a domesticação e seleção de plantas deram origem a uma perda da sua atividade simbiótica, por
exemplo, o equilíbrio entre o simbiotrófico e a nutrição nitrogenada combinada diminuiu em muitas
leguminosas devido ao seu cultivo sob alto nível de nitrogênio. Melhoramento de plantas pode ser aplicado
para criar combinações ideais de genótipos de diferentes parceiros, sendo mais promissora essa abordagem
em simbioses de leguminosa-rizóbio, onde são evidentes as fortes correlações entre a eficiência ecológica do
mutualismo e sua especificidade genotípica. Apesar de diversas espécies microbianas poderem ser usadas
para melhorar a produção vegetal, necessitam ser desenvolvidas outras diferentes abordagens para melhorar
os tipos nutricional e defensivo de mutualismo microbiano. Além disso, a microbiologia agrícola enfrenta
importantes desafios ecológicos e genéticos, como desafios associados com agentes patogênicos humanos,
freqüentemente encontrado em comunidades endofíticas, como nas espécies de Bacillus e Staphylococcus.
Dessa forma, o conhecimento de genética, biologia molecular, ecologia e evolução das interações
simbióticas poderia permitir o desenvolvimento de micróbio baseado em agricultura sustentável (agricultura
ecologicamente equilibrada, economicamente viável), propiciando uma melhoria das principais funções
adaptativas e produtividade em plantas cultivadas manipulando os seus coabitantes microbianos, além da
substituição parcial ou completa de agroquímicos ecologicamente perigosos por preparações microbianas,
uma diminuição dos custos e uma melhor qualidade de produtos agrícolas.
excelente resumo com a única ressalva de que nunca vi adubo sendo chamado de agrotóxico, como já
comentei em outra resposta. Aproveito para lembrar novamente, mais uma vez e de novo, que agrotóxico é
um termo pejorativo, não técnico.
4.
[2.000] (IP:281473816235900 | 14:01:01 | 15:31:01 | 30:00 | 34.545)
Qual a lógica dos métodos para determinação de biomassa e respiração microbianas?
Os dois métodos se fundamentam em um fator de avaliação sujeito a mensuração, como por exemplo, o
CO2 capturado em solução de uma base – hidróxido de sódio (NaOH) ou hidróxido de potássio (KOH) –
que pode se relacionar com outro fator que não se possa, ou seja difícil de ser quantificado, como a biomassa
e a respiração microbiana. Além disso, a partir dos dados de respiração e biomassa microbiana se pode
calcular o quociente metabólico (qCO2), que quantifica o C-CO2 evoluído por unidade de C microbiano. No
método de biomassa microbiana, a biomassa microbiana (BM) do solo pode ser definida como a parte da
matéria orgânica formada por organismos vivos (pertencentes do Archea, Bacteria, Fungi, Protista e alguns
do Reino Animalia) com volume menor que 5 x 10³µm³, contendo, em média, 2 a 5% do carbono orgânico e
1 a 5% do nitrogênio total do solo, e expressa como micrograma (µg) de carbono por grama de solo seco.
Entre os diversos métodos utilizados para quantificação da biologia microbiana, podem citados os métodos
da microscopia direta, do trifosfato de adenosina, da respiração induzida pelo substrato, da fumigaçãoincubação e da fumigação-extração, sendo os dois últimos os mais difundidos. Já o método de respiração
microbiana é representado pela oxidação da matéria orgânica por organismos aeróbios do solo, podendo ser
avaliada pelo consumo de O2 ou pela produção de CO2. A determinação de O2 pode ser realizada por
cromatografia gasosa ou eletrorespirômetro, enquanto que a de CO2 pode ser feita por titulação ou
condutividade elétrica (quando é capturado por bases – NaOH ou KOH), cromatografia gasosa, por
exemplo. Esses métodos devem ser calibrados para cada situação em que estão sendo utilizados.
ótimo, mas tem uma mistura no meio do caminho que deixa dúvida sobre o entendimento da questão...
aprofunde o máximo possível, mas sempre no tema central, ou diretamente ligados. A definição de biomassa
microbiana, ou outros métodos como microscopia direta não têm qualquer relevância para o que se quer
saber
5.
[2.000] (IP:281473816235900 | 14:01:07 | 15:31:40 | 30:33 | 32.783)
Qual a ligação entre PCR e extremófilos?
O estudo de extremófilos (microrganismos que sobrevivem e vivem em condições ótimas em ambientes
considerados inabitáveis para a vida, como fontes termais superficiais e abissais, fumarolas, condições
extremas de pH, águas extremamente salgadas e temperaturas baixas) vem sendo importante nas aplicações
biotecnológicas. Pode-se citar, por exemplo, a archea Pyrococcus furiosus e a bactéria Thermus aquaticus
que vivem em altas temperaturas, e fornecem DNA polimerases importantes para o aprimoramento da
técnica de PCR (reação em cadeia de polimerase é um método baseado na amplificação seletiva de uma
quantidade reduzida de DNA de uma única célula, sendo a base do desenvolvimento da biologia molecular e
utilizado no mapeamento genético, clonagem de genes, detecção de doenças hereditárias, entre outras
aplicações). O PCR, método em que se utiliza altas temperaturas, recorre ao uso de enzimas isoladas de
organismos termófilos.
ótimo.