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Estudos e análises laboratoriais disponibilizados pelo CGMJM
O Centro de Genética Médica Doutor Jacinto Magalhães (CGMJM) encontra-se
integrado no Centro Hospitalar do Porto, E.P.E. desde Janeiro de 2013.
O CGMJM mantém os princípios da orgânica do ex-Instituto de Genética Médica
Jacinto de Magalhães (IGM), com uma estrutura multidisciplinar constituída por
uma Unidade de Consulta, com as valências de Genética Médica, Psicologia e
Nutrição, e três Unidades Laboratoriais - Unidade de Bioquímica Genética,
Unidade de Citogenética e Unidade de Genética Molecular.
Nesta brochura são elencados
disponibilizados pelo CGMJM.
os
estudos
e
análises
laboratoriais
Unidade de
Bioquímica
Genética
Responsável
Lúcia Lacerda
Contactos: 226070315
[email protected]
secretariado: 226070317
ANÁLISES DA UNIDADE DE BIOQUIMICA GENÉTICA
1
Metabolismo dos lisossomas
Ácido Siálico (Salla /Infantile Sialic Acid Storage Disease - ISSD)
Ácido siálico
Gene SLC17A5 - Salla
Alfa-manosidose
Alfa-manosidase
Gene MAN2B1 - Alfa-manosidose
Aspartilglucosaminuria
Aspartilglucosaminidase
Beta-manosidose
Beta-Manosidase
Gene MANBA - Beta-manosidose
Ceroidolipofuscinose Neuronal 1 (Santavuori) - CLN1
Gene PPT1 - Ceroidolipofuscinose Neuronal 1
Palmitoil-proteína tioesterase
Ceroidolipofuscinose Neuronal 2 (Jansky - Bielschowsky) - CLN2
Gene TPP1 - Ceroidolipofuscinose Neuronal 2
Tripeptidil peptidase I
Ceroidolipofuscinose Neuronal 3 (Spielmeyer - Vogt) - CLN3
Gene CLN3 - Ceroidolipofuscinose Neuronal 3
Ceroidolipofuscinose Neuronal 4 - CLN4
Gene DNAJC5 - Ceroidolipofuscinose Neuronal 4
Ceroidolipofuscinose Neuronal 5 - CLN5
Gene CLN5 - Ceroidolipofuscinose Neuronal 5
Ceroidolipofuscinose Neuronal 6 - CLN6
Gene CLN6 - Ceroidolipofuscinose Neuronal 6
Ceroidolipofuscinose Neuronal 7 - CLN7
Gene MFSD8 - Ceroidolipofuscinose Neuronal 7
Ceroidolipofuscinose Neuronal 8 - CLN8
Gene CLN8 - Ceroidolipofuscinose Neuronal 8
Ceroidolipofuscinose Neuronal 10 - CLN10
Gene CTSD - Ceroidolipofuscinose Neuronal 10
Ceroidolipofuscinose Neuronal 11 - CLN11
Gene GRN - Ceroidolipofuscinose Neuronal 11
Ceroidolipofuscinose Neuronal 12 - CLN12
Gene ATP13A2 - Ceroidolipofuscinose Neuronal 12
Ceroidolipofuscinose Neuronal 13 - CLN13
Gene CTSF - Ceroidolipofuscinose Neuronal 13
Ceroidolipofuscinose Neuronal 14 - CLN14
Gene KCTD7 - Ceroidolipofuscinose Neuronal 14
Défice de saposinas
Gene PSAP - Défice de saposinas
Epilepsia progressiva mioclónica 4 (EPM4)
Gene SCARB2 - Epilepsia progressiva mioclónica 4 (EPM4)
Glucocerebrosidase
ANÁLISES DA UNIDADE DE BIOQUIMICA GENÉTICA
Fabry
Alfa-galactosidase A
Gene GLA - Doença de Fabry
Globotriaosilceramida
Farber
Gene ASAH1 - Doença de Farber
Fucosidose
Alfa-fucosidase
Gene FUCA1 - Fucosidose
Galactosialidose
Ácido siálico
Alfa-neuraminidase
Beta-galactosidase
Gene CTSA - Galactosialidose
Gangliosidose GM1 ou Mucopolissacaridose tipo IVB (Morquio B)
Beta-galactosidase
Gene GLB1 - Gangliosidose GM1
Gangliosidose GM2 - Variante 0 (Sandhof)
Beta-hexosaminidase A
Beta-hexosaminidase total
Gene HEXB - Gangliosidose GM2, variante 0
Hexosaminidases, eletroforese de isoenzimas
Gangliosidose GM2 - Variante AB (deficiencia em activador)
Gene GM2A - Gangliosidose GM2, variante AB
Gangliosidose GM2 - Variante B (Tay-Sachs) e B1
Beta-hexosaminidase A
Beta-hexosaminidase total
Gene HEXA - Gangliosidose GM2, Variante B (Tay-Sachs) e B1
Hexosaminidases, eletroforese de isoenzimas
Gaucher
Beta-D-quitotriosidase
Fosfatase ácida resistente ao tartarato
Gene GBA - Doença de Gaucher
Glucocerebrosidase
Glicogenose tipo II (Pompe)
Alfa-glucosidase
Gene GAA - Doença de Pompe
Oligossacaridos
Krabbe
Galactocerebrosidade
Gene GALC - Doença de Krabbe
Leucodistrofia Metacromática
Arilsulfatase A
Arilsulfatases, eletroforese de isoenzimas
Gene ARSA - Leucodistrofia metacromática
Sulfatídeos
ANÁLISES DA UNIDADE DE BIOQUIMICA GENÉTICA
Lipase ácida (Wolman / Cholesteryl Ester Storage Disease - CESD)
Gene LIPA - Lipase ácida
Lipase ácida
Mucolipidose
Alfa-manosidase
Beta-glucosidase
Beta-glucuronidase
Beta-hexosaminidase A
Beta-hexosaminidase total
Mucolipidose tipo II alfa/beta (I cell disease) e III alfa/beta (pseudo Hurler)
Gene GNPTAB - Mucolipidose tipos II alfa/beta e III alfa/beta
Mucolipidose tipo III Gama
Gene GNPTG - Mucolipidose tipo III G
Mucolipidose tipo IV
Gene MCOLN1 - Mucolipidose tipo IV
Mucopolissacaridose tipo I (Hurler/Scheie)
Alfa-iduronidase
Gene IDUA - Mucopolissacaridose tipo I (Hurler/Scheie)
Mucopolissacaridose tipo II (Hunter)
Gene IDS - Mucopolissacaridose tipo II (Hunter)
Iduronato-sulfatase
Mucopolissacaridose tipo IIIA (Sanfilippo A)
Gene SGSH - Mucopolissacaridose tipo IIIA (Sanfilippo A)
Heparan-N-sulfatase
Mucopolissacaridose tipo IIIB (Sanfilippo B)
Alfa-N-acetil-glucosaminidase
Gene NAGLU - Mucopolissacaridose tipo IIIB (Sanfilippo B)
Mucopolissacaridose tipo IIIC (Sanfilippo C)
Acetil-CoA:alfa-glucosamina N-acetiltransferase
Gene HGSNAT - Mucopolissacaridose tipo IIIC (Sanfilippo C)
Mucopolissacaridose tipo IIID (Sanfilippo D)
Gene GNS - Mucopolissacaridose tipo IIID (Sanfilippo D)
N-acetilglucosamina-6-sulfato sulfatase
Mucopolissacaridose tipo IIIE (Sanfilippo E)
Gene ARSG - Mucopolissacaridose tipo IIIE (Sanfilippo E)
Mucopolissacaridose tipo IVA (Morquio A)
Galactose-6-sulfatase
Gene GALNS - Mucopolissacaridose tipo IVA (Morquio A)
Mucopolissacaridose tipo VI (Maroteaux-Lamy)
Arilsulfatase B
Gene ARSB - Mucopolissacaridose tipo VI (Maroteaux-Lamy)
Mucopolissacaridose tipo VII (Sly)
Beta-glucuronidase
Gene GUSB - Mucopolissacaridose tipo VII (Sly)
Mucopolissacaridose tipo IX
Gene HYAL1 - Mucopolissacaridose tipo IX
Hialuronidase
ANÁLISES DA UNIDADE DE BIOQUIMICA GENÉTICA
Mucopolissacaridoses
Glicosaminoglicanos, eletroforese bidimensional
Glicosaminoglicanos, quantificação e eletroforese monodimensional
Mucosulfatidose (Défice múltiplo de sulfatases)
Arilsulfatases, eletroforese de isoenzimas
Galactose-6-sulfatase
Gene SUMF1 - Mucosulfatidose
Iduronato-sulfatase
N-acetilglucosamina-6-sulfato sulfatase
Niemann-Pick tipo A/B
Beta-D-quitotriosidase
Esfingomielinase
Gene SMPD1 - Doença de Niemann-Pick A/B
Niemann-Pick tipo C
Beta-D-quitotriosidase
Colesterol intracelular, coloração com filipina
Gene NPC1 - Doença de Niemann-Pick tipo C1
Gene NPC2 - Doença de Niemann-Pick tipo C2
Oligossacaridoses
Oligossacaridos
Picnodisostose
Gene CTSK - Picnodisostose
Schindler
Alfa-N-acetil-galactosaminidase
Oligossacaridos
Sialidose
Ácido siálico
Alfa-neuraminidase
Gene NEU1 - Sialidose
Sialúria
Ácido siálico
2
Metabolismo dos peroxissomas
Ácido pipecólico
Ácido pipecólico
Adrenoleucodistrofia ligada ao X (X-ALD)
Ácidos gordos de cadeia muito longa
Gene ABCD1 - Adrenoleucodistrofia ligada ao cromossoma X
Condrodisplasia rizomélica punctata (RCDP) tipo 1
Ácido fitânico
Dihidroxiacetonafosfato aciltransferase
Gene PEX7 - Condrodisplasia rizomélica punctata (RCDP) tipo 1
Plasmalogénios
Condrodisplasia rizomélica punctata (RCDP) tipo 2
Dihidroxiacetonafosfato aciltransferase
Gene GNPAT - Condrodisplasia rizomélica punctata (RCDP) tipo 2
Plasmalogénios
ANÁLISES DA UNIDADE DE BIOQUIMICA GENÉTICA
Condrodisplasia rizomélica punctata (RCDP) tipo 3
Dihidroxiacetonafosfato aciltransferase
Gene AGPS - Condrodisplasia rizomélica punctata (RCDP) tipo 3
Plasmalogénios
Deficiência em 2-metil-acilCoA racemase
Ácido fitânico
Ácido pristânico
Precursores dos ácidos biliares
Deficiência em acilCoA oxidase peroxissomal (ACOX)
Ácidos gordos de cadeia muito longa
Gene ACOX1 - Deficiência em acilCoA peroxissomal
Deficiência em proteína D-bifuncional (DBP)
Ácido fitânico
Ácido pristânico
Ácidos gordos de cadeia muito longa
Gene HSD17B4 - Défice de proteína D-bifuncional
Precursores dos ácidos biliares
Doença de Refsum adulto
Ácido fitânico
Doença Peroxissomal
Ácido fitânico
Ácido pristânico
Ácidos gordos de cadeia muito longa
Plasmalogénios
Espectro Zellweger (Sindrome de Zellweger, Adrenoleucodistrofia Neonatal, Doença de Refsum infantil)
Ácido fitânico
Ácido pristânico
Ácidos gordos de cadeia muito longa
Dihidroxiacetonafosfato aciltransferase
Gene PEX1 - Síndrome do espectro Zellweger
Plasmalogénios
Precursores dos ácidos biliares
3
Defeitos congénitos da glicosilação (CDG)
Defeito congénito da glicosilação tipo Ia (CDG1a)
Gene PMM2 - CDG tipo Ia - defeito congénito da glicosilação tipo Ia (CDG1a)
Defeito congénito da glicosilação tipo Ib (CDG1b)
Gene MPI - defeito congénito da glicosilação tipo Ib (CDG1b)
Defeito congénito da glicosilação tipo IIm (CDG2M)
Gene SLC35A2 - Defeito congénito da glicosilação tipo IIm (CDG2M)
Defeito congénito da glicosilação tipo Iv (CDG1v)
Gene NGLY1 - CDG tipo Iv (CDG1v) - defeito congénito da glicosilação tipo Iv (CDG1v)
Defeitos congénitos da glicosilação (CDG)
Transferrina deficiente em carbohidratos
Transferrina, focagem isoelétrica
ANÁLISES DA UNIDADE DE BIOQUIMICA GENÉTICA
4
Glicogenoses
Glicogenose cardíaca (congénita letal)
Gene PRKAG2 - Glicogenose cardíaca (congénita letal)
Glicogenose tipo 0 (défice de glicogénio sintetase)
Gene GYS1 - Glicogenose tipo 0
Gene GYS2 - Glicogenose tipo 0
Glicogenose tipo Ia (défice de glicose-6-fosfatase)
Gene G6PC - Glicogenose tipo Ia (défice de glicose-6-fosfatase)
Glicogenose tipo Ib/Ic
Gene SLC37A4 (G6PT1) - Glicogenose tipo Ib/Ic
Glicogenose tipo III
Gene AGL - Glicogenose tipo III
Glicogenose tipo IV
Gene GBE1 - Glicogenose tipo IV
Glicogenose tipo V (McArdle)
Gene PYGM - Glicogenose tipo V
Glicogenose tipo VI
Gene PYGL - Glicogenose tipo VI
Glicogenose tipo VII (défice de fosfofrutoquinase)
Gene PFKM - Glicogenose tipo VII (défice de fosfofrutoquinase)
Glicogenose tipo IXd (GSD9D)
Gene PHKA1 - Glicogenose tipo IXd (GSD9D)
Glicogenose tipo X (GSD10)
Gene PGAM2 - Glicogenose tipo X (GSD10)
Glicogenose tipo XI (GSD11)
Gene LDHA - Glicogenose tipo XI (GSD11)
Glicogenose tipo XII (GSD12)
Gene ALDOA - Glicogenose tipo XII (GSD12)
Glicogenose tipo XIII (GSD13)
Gene ENO3 - Glicogenose tipo XIII (GSD13)
Glicogenose tipo XIV (GSD14)
Gene PGM1 - Glicogenose tipo XIV (GSD14)
Glicogenose tipo XV (GSD15)
Gene GYG1 - Glicogenose tipo XV (GSD15)
5
Oxidação de ácidos gordos
Défice de carnitina palmitoil transferase II
Gene CPT2 - Défice de carnitina palmitoil transferase II
6
Metabolismo da creatina
Défice de guanidinoacetato N-metiltransferase
Gene GAMT - Défice de guanidinoacetato N-metiltransferase
Défice de L-arginina:glicina amidinotransferase
Gene GATM - Défice de L-arginina:glicina amidinotransferase
Défice do transportador da creatina
Gene SLC6A8 - Défice do transportador da creatina
ANÁLISES DA UNIDADE DE BIOQUIMICA GENÉTICA
7
Outros Disturbios Metabólicos
Atrofia cerebral autossómica recessiva (ARCA)
Gene TMPRSS4 - ARCA
Colestase intra-hepática progressiva familiar tipo 1 (PFIC1)
Gene ATP8B1 - Colestase intra-hepática progressiva familiar tipo 1 (PFIC1)
Colestase intra-hepática progressiva familiar tipo 2 (PFIC2)
Gene ABCB11 - Colestase intra-hepática progressiva familiar tipo 2 (PFIC2)
Colestase intra-hepática progressiva familiar tipo 3 (PFIC3)
Gene ABCB4 - Colestase intra-hepática progressiva familiar tipo 3 (PFIC3)
Danon
Gene LAMP2 - Doença de Danon
Diabetes tipo MODY1
Gene HNF4A- Diabetes tipo MODY1
Diabetes tipo MODY2
Gene GCK- Diabetes tipo MODY2
Diabetes tipo MODY3
Gene HNF1A- Diabetes tipo MODY3
Diabetes tipo MODY4
Gene PDX1- Diabetes tipo MODY4
Diabetes tipo MODY5
Gene HNF1B- Diabetes tipo MODY5
Diabetes tipo MODY6
Gene NEUROD1- Diabetes tipo MODY6
Diabetes tipo MODY7
Gene KLF11- Diabetes tipo MODY7
Diabetes tipo MODY8
Gene CEL- Diabetes tipo MODY8
Diabetes tipo MODY9
Gene PAX4- Diabetes tipo MODY9
Diabetes tipo MODY10
Gene INS- Diabetes tipo MODY10
Diabetes tipo MODY11
Gene BLK- Diabetes tipo MODY11
Epilepsia progressiva mioclónica 1A (Unverricht-Lundborg)
Gene CSTB - Epilepsia progressiva mioclónica 1A (Unverricht-Lundborg)
Fenilcetonúria
Gene PAH - Fenilcetonúria
Hiperplasia suprarrenal congénita
Gene CYP21A2 - Hiperplasia suprarrenal congénita
Hipofosfatasia
Gene ALPL - Hipofosfatasia
Homocistinúria por défice de remetilação
Gene MTHFR - Homocistinúria por défice de remetilação
Ictiose ligada ao X
Esteróide sulfatase
Gene STS - Ictiose ligada ao X
ANÁLISES DA UNIDADE DE BIOQUIMICA GENÉTICA
Intolerância à lactose
Gene LCT - Intolerância à lactose
Gene MCM6 - Intolerância à lactose - pesquisa de variantes
Síndrome de Smith-Lemli-Opitz
Gene DHCR7 - Síndrome de Smith-Lemli-Opitz
Trimetilaminuria
Gene FMO3 – Trimetilaminuria
Trombose, fatores genéticos predisponentes
Gene MTHFR - pesquisa de variantes - Trombose, fatores genéticos predisponentes
8
Síntese de ácidos biliares
Défice congénito da síntese de ácidos biliares 1
Gene HSD3B7 - Défice congénito da síntese de ácidos biliares 1
Precursores dos ácidos biliares
9
Acidúrias orgânicas
Acidúria glutárica tipo 1
Gene GCDH - Acidúria glutárica tipo 1
Acidúria L-2-hidroxiglutárica
Gene L2HGDH - Acidúria L-2-hidroxiglutárica
Leucinose (MSUD)
Genes BCKDHA, BCKDHB, DBT e DLD - Leucinose
10
Farmacogenética
Butirilcolinesterase
Gene BCHE - Butirilcolinesterase
11
Avaliação terapêutica
Ácidos gordos essenciais - restrição alimentar
Ácidos gordos polinsaturados
Adrenoleucodistrofia ligada ao X (X-ALD)
Ácidos gordos de cadeia muito longa
Alfa-manosidose
Alfa-manosidase
Fabry
Alfa-galactosidase A
Globotriaosilceramida
Gangliosidose GM2 - Variante B (Tay-Sachs) e B1
Beta-hexosaminidase A
Beta-hexosaminidase total
Gaucher
Beta-D-quitotriosidase
Beta-glucosidase
Fosfatase ácida resistente ao tartarato
Glicogenose tipo II (Pompe)
Alfa-glucosidase
Oligossacaridos
ANÁLISES DA UNIDADE DE BIOQUIMICA GENÉTICA
Leucodistrofia Metacromática
Arilsulfatase A
Sulfatídeos
Lipase ácida (Wolman / Cholesteryl Ester Storage Disease - CESD)
Lipase ácida
Mucopolissacaridose tipo I (Hurler/Scheie)
Alfa-iduronidase
Glicosaminoglicanos, quantificação e eletroforese monodimensional
Mucopolissacaridose tipo II (Hunter)
Glicosaminoglicanos, quantificação e eletroforese monodimensional
Iduronato-sulfatase
Mucopolissacaridose tipo IIIB (Sanfilippo B)
Alfa-N-acetil-glucosaminidase
Glicosaminoglicanos, quantificação e eletroforese monodimensional
Mucopolissacaridose tipo IIIC (Sanfilippo C)
Acetil-CoA:alfa-glucosamina N-acetiltransferase
Glicosaminoglicanos, quantificação e eletroforese monodimensional
Mucopolissacaridose tipo IVA (Morquio A)
Galactose-6-sulfatase
Mucopolissacaridose tipo VI (Maroteaux-Lamy)
Arilsulfatase B
Glicosaminoglicanos, quantificação e eletroforese monodimensional
Niemann-Pick tipo A/B
Beta-D-quitotriosidase
Niemann-Pick tipo C
Beta-D-quitotriosidase
12
Procedimento pré-analítico
Cultura celular em pele e outros tecidos sólidos para estudos metabólicos
Extração de DNA para estudos de NGS
Extração de DNA para estudos posteriores
Reposição, expansão e congelação de culturas
1. Para cada um das patologias diagnosticadas é possível oferecer:
- rastreio familiar das mutações encontradas no caso índex,
- diagnóstico pré-natal bioquímico e/ou molecular se caso índex genotipado - contactar previamente o laboratório.
ANÁLISES DA UNIDADE DE BIOQUIMICA GENÉTICA
2. O estudo de Hidrópsia fetal inclui o diagnóstico das seguintes patologias:
Defeitos Congénitos da Glicosilação tipo Ia (CDG Ia)
Farber
Galactosialidose
Gangliosidose GM1
Gaucher
Gliconenose tipo IV
ISSD
Mucolipidose tipo II (I-cell)
Mucopolissacaridoses tipo I, IVA, IVB, VII
Niemann-Pick tipo A/B e C
Sialidose
Sindrome de Zellweger
Sulfatidose múltipla
Wolman
3. Estudos de Next Generation Sequencing (NGS):
Acompanhando os mais recentes desenvolvimentos na análise genética baseados na tecnologia de
NGS, são disponibilizados painéis de genes estudados em simultâneo, consoante a apresentação ou
suspeita clínica.
PAINEL
1 - Hipoglicemia
Nº de genes
48
2 - Doenças congénitas da glicosilação (CDG)
39
3 - Defeitos do metabolismo intermediário
100
4 - Doenças mitocondriais
188
5 - Metabolismo de moléculas complexas
91
6 - Leucodistrofias
37
7 - Epilepsia
117
8a - Miopatias estruturais
64
8b - Miopatias metabólicas
51
8c - Polineuropatias periféricas
50
9 - Hiperlaxitude articular (hipotonia)
38
10 - Diabetes tipo MODY
22
11 - Distonias
18
12 - Defeitos na via RAS/MAPK (síndrome de Noonan e relacionados)
13
13 - Defeitos da morfogénese cerebral
120
14 - Ciliopatias
50
15 - Atraso mental ligado ao cromossoma X
52
16 - Craniossinostose
17
17 - Ataxias (excepto associadas a expansões de trinucleotídeos)
53
ANÁLISES DA UNIDADE DE BIOQUIMICA GENÉTICA
INSTRUÇÕES PARA COLHEITA DE AMOSTRAS
Sangue
Tubo com anticoagulante heparinato de lítio
10 ml - (Para doenças peroxissomais, jejum noturno-adultos ou 3h-lactente)
Tubo sem anticoagulante
3 ml - (défices congénitos da glicosilação)
Sangue seco em cartão
Cartão - 2 círculos
Urina de 2 dias consecutivos com conservante
Total de urina do período 10-18h de 2 dias ou alíquota de 100 ml com indicação do volume recolhido durante os 2 dias
Urina de 24 horas
Total de urina de 24h ou aliquota de 100ml com indicação do volume total recolhido
Pele
Tubo estéril com meio de cultura ou soro fisiológico estéril
Fragmento colhido com biótomo adequado à idade
Líquido amniótico
1ml /semana de gestação em Tubo estéril de fundo cónico
Vilosidades do córion
20mg em Tubo estéril com meio de cultura ou soro fisiológico estéril
LCR
Contactar laboratório
DNA
Tubo estéril
As colheitas de amostras biológicas deverão ser:
- Enviadas pelo correio em envelope almofadado (se possível) de forma a estar no laboratório até ao dia seguinte,
- Transportadas à temperatura ambiente (sem congelar nem refrigerar).
As biopsias de pele deverão ser:
Efetuadas de 2ª a 5ª feira, para que nunca corra o risco de ficar retida nos correios (de 6ª para sábado).
Na escolha da região a biopsar deve ser tido em conta a vascularização e pilosidade do local; a parte interna do
antebraço é considerada adequada, dado que não convém colher um fragmento constituído por adipócitos.
Para minorar a dor da punção, poderá ser aplicado creme anestésico em camada grossa no local escolhido, que
deverá ficar selado com penso oclusivo durante 1 hora e até ao momento de efetuar a punção.
A área deverá ser desinfetada antes do procedimento (com Betadine, por exemplo).
A biopsia de pele (e não de músculo) deverá ser efetuada com biótomo descartável e asséptico (com secção da
punção adequada à idade). O fragmento de derme deverá ser colocado em tubo cheio com soro fisiológico estéril e à
temperatura ambiente (para que o fragmento não fique colado às paredes secas do tubo).
Não congelar o tubo de colheita pois a pele destina-se ao estabelecimento de linha celular de fibroblastos cultivados.
Pelo mesmo motivo, a biopsia deverá ser transportada à temperatura ambiente de acordo com o descrito nos 3
primeiros pontos.
Unidade de
Citogenética
Responsável
M. Luz Fonseca e Silva
Contactos: 226070308
[email protected]
secretariado: 226070334
ANÁLISES DA UNIDADE DE CITOGENÉTICA
1
Procedimentos pré-analíticos
Culturas celulares (sangue, líquido amniótico, vilosidades do córion, pele e outros tecidos)
Culturas celulares para estudos metabólicos/moleculares
Culturas celulares sincronizadas
Reposição, expansão e congelação de culturas
2
Anomalia cromossómica
Cariótipo
Cariótipo com bandas de alta resolução
FISH – Pintura cromossómica individual
FISH – Pintura para todos os cromossomas
FISH – Sonda centromérica individual
FISH – Regiões centroméricas de todos os cromossomas
FISH – Sonda subtelomérica individual
FISH – Regiões subteloméricas de todos os cromossomas
FISH – Sonda sequência única
MLPA – Regiões subteloméricas de todos os cromossomas
MLPA – Síndromes de microdeleção / microduplicação
3
Síndromes de microduplicação
S. de duplicação 7q11.23
MLPA – S. de dup 7q11.23
S. de duplicação 15q11-q13
MLPA – S. de dup 15q11-q13
S. de duplicação 16p11.2
MLPA – S. de dup 16p11.2
S. de Potocki-Lupski - dup 17p11.2
MLPA – S. de Potocki-Lupski - dup 17p11.2
S. de duplicação 22q11.2
MLPA – S. de dup 22q11.2
S. de duplicação MECP2 - Xq28
MLPA – S. de dup MECP2 - Xq28
4
Síndromes de microdeleção
S. de deleção 1p36
FISH – S. del 1p36
MLPA – S. del 1p36
S. de deleção 2p16
MLPA – S. del 2p16
S. de deleção 2q23
MLPA – S. del 2q23
S. de deleção 2q33
MLPA – S. del 2q33
S. de deleção 3q29
MLPA – S. del 3q29
ANÁLISES DA UNIDADE DE CITOGENÉTICA
S. de deleção 9q22.3
MLPA – S. del 9q22.3
S. de deleção 10p14
FISH – S. de del 10p14
MLPA – S. de del 10p14
S. de deleção 15q24
MLPA – S. del 15q24
S. de deleção 17q21
MLPA – S. del 17q21
S. de Angelman – del 15q11.2
FISH – S. Angelman – del 15q11.2
MLPA – S. Angelman – del 15q11.2
S. de Cri-du-Chat - del 5p15.2
FISH – S. de Cri-du-Chat – del 5p15.2
MLPA – S. de Cri-du-Chat – del 5p15.2
S. de DiGeorge
FISH – S. de DiGeorge – del 22q11
MLPA – S. de DiGeorge – del 22q11
S. de Langer-Gideon
MLPA – S. de Langer-Gideon
S. de Miller-Dieker
FISH – S. de Miller-Dieker
MLPA – S. de Miller-Dieker
S. de Phelan-McDermid – del 22q13.33
MLPA – S. Phelan-McDermid - del 22q13.33 - Gene SHANK3
S. de Prader-Willi – del 15q11.2
FISH – S. de Prader-Willi – del 15q11.2
MLPA – S. de Prader-Willi – del 15q11.2
S. de Smith-Magenis – del 17p11.2
FISH – S. de Smith-Magenis – del 17p11.2
MLPA – S. de Smith-Magenis – del 17p11.2
S. de Williams – del 7q11.23
FISH – S. de Williams – del 7q11.23
MLPA – S. de Williams – del 7q11.23
MLPA – S. de Williams – FISH7
S. de Wolf-Hirschhorn – del 4p16.3
FISH – S. de Wolf-Hirschhorn - del 4p16.3
MLPA – S. de Wolf-Hirschhorn - del 4p16.3
5
Outros
CHARGE – del 8q12
FISH – CHARGE – del 8q12
Gene PML
FISH – Gene PML
Gene SHOX
FISH – Gene SHOX
MLPA – Gene SHOX
ANÁLISES DA UNIDADE DE CITOGENÉTICA
Gene SRY
FISH – Gene SRY
Gene XIST
FISH – Gene XIST
Neurofibromatose tipo I – Gene NF1
FISH – S. Neurofibromatose – Gene NF1
MLPA – Neurofibromatose – Gene NF1
Perturbações do espectro do autismo
MLPA – Autismo
Retinoblastoma – del 13q14.2
FISH – Retinoblastoma – del 13q14.2
S. de Down
FISH – Região Crítica do S. de Down
S. de Pallister-Killian
FISH – S. de Pallister-Killian
S. de Rett – del Xq28
MLPA – S. de Rett – del Xq28
S. de Rubinstein-Taybi – del16p13.3
FISH – S. de Rubinstein-Taybi – del 16p13.3
MLPA – S. de Rubinstein-Taybi – del 16p13.3
S. de Sotos – del 5q35
FISH – S. Sotos – del 5q35
MLPA – S. Sotos – del 5q35
INSTRUÇÕES PARA COLHEITA DE AMOSTRAS
Sangue (não necessita jejum)
Tubo estéril com EDTA - MLPA e extração DNA
Tubo estéril com heparinato de sódio ou lítio - cariótipo e FISH
3 - 5 ml
Líquido amniótico
Tubo estéril de fundo cónico
1 ml / semana de gestação
Vilosidades do córion
Tubo estéril com meio de transporte
20 mg
Pele
Tubo estéril com meio de transporte ou soro fisiológico estéril
Fragmento colhido com biótomo adequado à idade
Outros tecidos
Recipiente estéril apropriado ao tecido
Unidade
de
Genética
Molecular
Responsável
Rosário Santos
Contactos: 226070304
[email protected]
secretariado: 226070330
ANÁLISES DA UNIDADE DE GENÉTICA MOLECULAR
1
Amiloidose
Amiloidose renal
Gene FGA (fibrinogénio Aa) - Amiloidose
Gene LYZ (lisozima) - Amiloidose
Mutação p.E526V no gene FGA (fibrinogénio Aa) - Amiloidose
Mutações no hotspot do gene FGA (fibrinogénio Aa) - Amiloidose
Amiloidose renal, défice apolipoproteína A-II, hipercolesterolemia familiar
Gene APOA2 (apolipoproteína A-II) - Amiloidose
Mutação p.X78S no gene APOA2 (apolipoproteína A-II) - Amiloidose
Amiloidose visceral (> 3 tipos)
Gene APOA1 (apolipoproteína A-I) - Amiloidose
Mutação p.G26R no gene APOA1 (apolipoproteína A-I) - Amiloidose
Polineuropatia Amiloidótica Familiar (PAF), Paramiloidose
Diagnóstico pré-natal - PAF - Amiloidose
Gene TTR - PAF - Amiloidose
Mutação p.V48M (ex-p.V28M) no gene TTR - PAF - Amiloidose
Mutação p.V50M (ex -p.V30M) no gene TTR - PAF, tipo Andrade - Amiloidose
Polineuropatia Amiloidótica Familiar (PAF), tipo finlandesa, Paramiloidose
Mutação p.D274Y no gene GSN - PAF, tipo Finlandesa - Amiloidose
2
Atraso mental / Défice intelectual (XLID)
ARX [MIM#300419]
Gene ARX - atraso mental / défice intelectual [MIM#300419]
Gene ARX - duplicação frequente - atraso mental / défice intelectual [MIM#300419]
Gene ARX - rastreio de familiar - atraso mental / défice intelectual [MIM#300419]
ATRX [MIM#301040]
Gene ATRX - atraso mental / alfa-talassémia [MIM#301040]
FRAXE [MIM#309548]
Gene AFF2 (FRAXE) - exclusão ou confirmação - atraso mental ligado ao X [MIM#309548]
Gene AFF2 (FRAXE) - exclusão por PCR - atraso mental ligado ao X [MIM#309548]
MED12 [MIM#300188]
Gene MED12 - mutações frequentes - atraso mental ligado ao X [MIM#300188]
Painel 3XLID
Atraso mental ligado ao cromossoma X - painel 3XLID
Síndrome de X-frágil (FXS) [MIM#300624]
Gene FMR1 - exclusão da S. de X-frágil por PCR - atraso mental/défice cognitivo
Gene FMR1 - exclusão da S. de X-frágil por PCR - diagnóstico pré-natal
Gene FMR1 - exclusão ou confirmação da S. de X-frágil por SB - atraso mental / défice cognitivo
Gene FMR1 - exclusão ou confirmação da S. de X-frágil por SB - diagnóstico pré-natal
Gene FMR1 - perfil da região [CGG]
ANÁLISES DA UNIDADE DE GENÉTICA MOLECULAR
3
Cardiomiopatia hereditária
Cardiomiopatia dilatada com défice de condução
Gene LMNA - Cardiomiopatia dilatada com défice de condução
Cardiomiopatia dilatada, cardiomiopatia hipertrófica
Gene MYBPC3 - Cardiomiopatia dilatada / hipertrófica
Gene MYH7 - Cardiomiopatia dilatada / hipertrófica
Gene TNNT2 - Cardiomiopatia dilatada / hipertrófica
Gene TTN (C-terminus) - Cardiomiopatia dilatada / hipertrófica
Cardiomiopatia dilatada, não-compactação ventrículo esquerdo (LDBB)
Gene LDB3 - Cardiomiopatia dilatada
Cardiomiopatia hereditária - geral
Cardiomiopatia hereditária - Diagnóstico pré-natal
Cardiomiopatia hereditária - Rastreio de familiar
Cardiomiopatia restritiva, hipertrófica, dilatada
Gene TNNI3 - Cardiomiopatia restritiva / hipertrófica
4
Diagnóstico pré-natal - rastreio
Aneuploidias (DPN)
Aneuploidias - marcadores polimórficos (QF-PCR)
Aneuploidias - MLPA
Determinação de zigotia (DPN)
Determinação de zigotia - marcadores polimórficos
Determinação do sexo fetal (DPN)
Determinação do sexo fetal - marcadores polimórficos
Exclusão de contaminação materna (DPN)
Contaminação materna em amostras fetais - marcadores polimórficos
5
Distrofia Muscular
Distrofia das Cinturas - geral
Análise de transcritos - Distrofia das Cinturas
Diagnóstico pré-natal - Distrofia das Cinturas
Ligação génica/co-segregação de variante - Distrofia das Cinturas
Perfil proteico em biópsia muscular - Distrofia das Cinturas
Pesquisa de mutação frequente - Distrofia das Cinturas
Rastreio de familiar - Distrofia das Cinturas
Distrofia das Cinturas tipo 1A (LGMD1A)
Gene MYOT - Distrofia das Cinturas tipo 1A (LGMD1A)
Distrofia das Cinturas tipo 1B (LGMD1B)
Gene LMNA - Distrofia das Cinturas tipo 1B (LGMD1B)
ANÁLISES DA UNIDADE DE GENÉTICA MOLECULAR
Distrofia das Cinturas tipo 1C (LGMD1C)
Gene CAV3 - Distrofia das Cinturas tipo 1C (LGMD1C)
Distrofia das Cinturas tipo 2A (LGMD2A)
Gene CAPN3 - Distrofia das Cinturas tipo 2A (LGMD2A)
Distrofia das Cinturas tipo 2B (LGMD2B)
Gene DYSF - Distrofia das Cinturas tipo 2B (LGMD2B)
Distrofia das Cinturas tipo 2C (LGMD2C)
Gene SGCG - Distrofia das Cinturas tipo 2C (LGMD2C)
Distrofia das Cinturas tipo 2D (LGMD2D)
Gene SGCA - Distrofia das Cinturas tipo 2D (LGMD2D)
Distrofia das Cinturas tipo 2E (LGMD2E)
Gene SGCB - Distrofia das Cinturas tipo 2E (LGMD2E)
Distrofia das Cinturas tipo 2F (LGMD2F)
Gene SGCD - Distrofia das Cinturas tipo 2F (LGMD2F)
Distrofia das Cinturas tipo 2G (LGMD2G)
Gene TCAP - Distrofia das Cinturas tipo 2G (LGMD2G)
Distrofia das Cinturas tipo 2H (LGMD2H)
Gene TRIM32 - Distrofia das Cinturas tipo 2H (LGMD2H)
Distrofia das Cinturas tipo 2I (LGMD2I)
Gene FKRP - Distrofia das Cinturas tipo 2I (LGMD2I)
Distrofia das Cinturas tipo 2J (LGMD2J)
Gene TTN (C-terminus) - Distrofia das Cinturas tipo 2J (LGMD2J)
Distrofia das Cinturas tipo 2K (LGMD2K)
Gene POMT1 - Distrofia das Cinturas tipo 2K (LGMD2K)
Distrofia das Cinturas tipo 2L (LGMD2L)
2 mutações frequentes no gene ANO5 - Distrofia das Cinturas tipo 2L (LGMD2L)
Gene ANO5 - Distrofia das Cinturas tipo 2L (LGMD2L)
Rastreio complementar do gene ANO5 - Distrofia das Cinturas tipo 2L (LGMD2L)
Distrofia das Cinturas tipo 2M (LGMD2M)
Gene FKTN - Distrofia das Cinturas tipo 2M (LGMD2M)
Distrofia das Cinturas tipo 2N (LGMD2N)
Gene POMT2 - Distrofia das Cinturas tipo 2N (LGMD2N)
Distrofia das Cinturas tipo 2O (LGMD2O)
Gene POMGNT1 - Distrofia das Cinturas tipo 2O (LGMD2O)
Distrofia das Cinturas tipo 2P (LGMD2P)
Gene DAG1 - Distrofia das cinturas tipo 2P (LGMD2P)
Distrofia das Cinturas, sarcoglicanopatias
8 mutações frequentes (genes SGCA,SGCB e SGCG) - Sarcoglicanopatias
Genes SGCA, SGCB, SGCD e SGCG - Sarcoglicanopatias
Distrofia Muscular de Duchenne / Becker
Análise de transcritos - Distrofia Muscular de Duchenne / Becker
ANÁLISES DA UNIDADE DE GENÉTICA MOLECULAR
Deleções / duplicações no gene DMD - Distrofia Muscular de Duchenne / Becker
Diagnóstico pré-natal - Distrofia Muscular de Duchenne / Becker
Rastreio de familiar - Distrofia Muscular de Duchenne / Becker
Sequenciação do gene DMD - Distrofia Muscular de Duchenne / Becker
Distrofia Muscular de Emery-Dreifuss - geral
Diagnóstico pré-natal - Distrofia Muscular de Emery-Dreifuss
Ligação génica/co-segregação de variante - Distrofia Muscular de Emery-Dreifuss
Rastreio de familiar - Distrofia Muscular de Emery-Dreifuss
Distrofia Muscular de Emery-Dreifuss (AR/AD)
Gene LMNA - Distrofia Muscular de Emery-Dreifuss (EDMD2/3)
Distrofia Muscular de Emery-Dreifuss, ligada ao cromossoma X
Gene EMD - Distrofia Muscular de Emery-Dreifuss (EDMD1)
Gene FHL1 - Distrofia Muscular Emery-Dreifuss (EDMD6)
Distrofia Muscular Oculofaríngea (OPMD)
Gene PABPN1 - Distrofia Muscular Oculofaríngea (OPMD)
6
Distrofia Muscular Congénita
Distrofia Muscular Congénita - geral
Análise de transcritos - Distrofia Muscular Congénita
Diagnóstico pré-natal - Distrofia Muscular Congénita
Ligação génica/co-segregação de variante - Distrofia Muscular Congénita
Rastreio de familiar - Distrofia Muscular Congénita
Distrofia Muscular Congénita com defeitos de glicosilação do distroglicano
Gene FKRP - Distrofia Muscular Congénita (MDC1C, MEB, WWS)
Gene FKTN - Distrofia Muscular Congénita (CMD1X, FCMD, WWS)
Gene GTDC2 - Distrofia Muscular Congénita (WWS)
Gene ISPD - Distrofia Muscular Congénita (MEB, WWS, LGMD)
Gene LARGE - Distrofia Muscular Congénita (MDC1D)
Gene POMGNT1 - Distrofia Muscular Congénita (MEB, WWS)
Gene POMT1 - Distrofia Muscular Congénita (WWS)
Gene POMT2 - Distrofia Muscular Congénita (MEB, WWS)
Distrofia Muscular Congénita com défice de merosina (MDC1A)
Gene LAMA2 - Distrofia Muscular Congénita (MDC1A)
Mutações frequentes no gene LAMA2 (nível 1) - Distrofia Muscular Congénita (MDC1A)
Rastreio complementar do gene LAMA2 (nível 2) - Distrofia Muscular Congénita (MDC1A)
Distrofia Muscular Congénita relacionada com o gene DNM2
Gene DNM2 - Distrofia Muscular Congénita (CMTDIB, M. Centronuclear)
Distrofia Muscular Congénita relacionada com o gene LMNA
Gene LMNA - Distrofia Muscular Congénita (MDC)
Distrofia Muscular Congénita relacionada com os genes COL6A (Bethlem, Ullrich)
Gene COL6A1 - Distrofia Muscular Congénita (Bethlem, OPLL, Ullrich)
ANÁLISES DA UNIDADE DE GENÉTICA MOLECULAR
Gene COL6A2 - Distrofia Muscular Congénita (Bethlem, Ullrich)
Gene COL6A3 - Distrofia Muscular Congénita (Bethlem, Ullrich)
Sindrome de Espinha Rígida
Gene FHL1 - Distrofia Muscular Congénita (RSS), S. Espinha Rígida
Gene SEPN1 - Distrofia Muscular Congénita (RSMD1, MDRS1, CFTD, RSS)
7
Doença do Neurónio Motor
Atrofia Muscular Espinhal (SMA) - tipo I, II, III, IV
Deleção do gene SMN1 em homozigotia (nível 1) - Atrofia Muscular Espinhal (SMA)
Diagnóstico pré-natal - Atrofia Muscular Espinhal (SMA)
Estudo quantitativo dos genes SMN - Atrofia Muscular Espinhal (SMA)
Rastreio de familiar (mutação conhecida) - Atrofia Muscular Espinhal (SMA)
Rastreio de familiar (mutação desconhecida) - Atrofia Muscular Espinhal (SMA)
Sequenciação/ expressão dos genes SMN (nível 2) - Atrofia Muscular Espinhal (SMA)
Atrofia Muscular Espinhal com défice respiratório (SMARD)
Deleções / duplicações no gene IGHMBP2 - Atrofia Muscular Espinhal com défice respiratório (SMARD)
Gene IGHMBP2 - Atrofia Muscular Espinhal com défice respiratório (SMARD)
Gene IGHMBP2 - Diagnóstico pré-natal - Atrofia Muscular Espinhal com défice respiratório (SMARD)
Gene IGHMBP2 - Rastreio de familiar - Atrofia Muscular Espinhal com défice respiratório (SMARD)
Atrofia Muscular Espinhal e Bulbar (Doença de Kennedy)
Gene AR - Atrofia Muscular Espinhal e Bulbar (Doença de Kennedy)
8
Doenças Cérebro-vasculares
CADASIL
Gene NOTCH3 - Diagnóstico pré-natal - CADASIL
Gene NOTCH3 - Rastreio de familiar - CADASIL
Gene NOTCH3 (exões 2-24) - CADASIL
Gene NOTCH3, Rastreio complementar (exões 1, 25 a 33) - CADASIL
9
Fibrose Quística
Fibrose Quística
Diagnóstico pré-natal - Fibrose Quística (mucoviscidose)
Estudo de familiar - Fibrose Quística (mucoviscidose)
Gene CFTR (nível 2) - Fibrose Quística (mucoviscidose)
Mutações frequentes no gene CFTR (nível 1) - Fibrose Quística (mucoviscidose)
10
Hipertermia Maligna
Susceptibilidade à hipertermia maligna tipo 1 (MHS1), S. King-Denborough
3 hotspots do gene RYR1 - Hipertermia Maligna (MHS1)
Gene RYR1 - Hipertermia Maligna (MHS1)
Gene RYR1 - Rastreio de familiar - Hipertermia Maligna (MHS1)
ANÁLISES DA UNIDADE DE GENÉTICA MOLECULAR
Rastreio complementar do gene RYR1 - Hipertermia Maligna (MHS1)
11
Menopausa precoce
Falência ovárica prematura (FXPOI) [MIM#311360]
Pré-mutação associada ao gene FMR1 - menopausa precoce (FXPOI) [MIM#311360]
12
Miopatia Congénita
Miopatia congénita, disproporção congénita do tipo de fibras
Gene LMNA- Miopatia congénita, disproporção congénita do tipo de fibras
Miopatia nemalínica, disproporção congénita do tipo de fibras
Gene TPM3 - M. nemalínica, disproporção congénita do tipo de fibras - miopatia congénita
Miopatia central core (CCD), Miopatia centronuclear
3 hotspots do gene RYR1 - M. central core (CCD), centronuclear - Miopatia Congénita
Gene RYR1 - M. central core (CCD), centronuclear - Miopatia Congénita
Rastreio complementar do gene RYR1 - M. central core (CCD), centronuclear - Miopatia Congénita
Miopatia Centronuclear
Gene BIN1 - Miopatia Centronuclear
Gene DNM2 - Miopatia Centronuclear
Miopatia centronuclear, Miopatia miotubular
Gene MTM1 - M. centronuclear, miotubular - Miopatia Congénita
Miopatia Congénita - geral
Análise de transcritos - Miopatia Congénita
Diagnóstico pré-natal - Miopatia Congénita
Rastreio de familiar - Miopatia Congénita
Miopatia congénita (multi-minicore, cardiomiopatia)
Gene MYH7 - Miopatia congénita (multi-minicore)
Miopatia congénita e cardiomiopatia
Gene MYBPC3 - Miopatia congénita e cardiomiopatia
Miopatia multiminicore
Gene SEPN1 - M. multiminicore - Miopatia Congénita
Miopatia nemalínica
Gene ACTA1 - Miopatia congénita (nemalínica)
Gene TPM2 - Miopatia congénita (nemalínica)
13
Miopatia Distal
Miopatia de Miyoshi
Gene ANO5 - Miopatia de Miyoshi tipo 3 (MMD3)
Gene DYSF - Miopatia de Miyoshi tipo 1 (MMD1)
Miopatia Distal - geral
Diagnóstico Pré-Natal - Miopatia Distal
Rastreio de familiar - Miopatia Distal
ANÁLISES DA UNIDADE DE GENÉTICA MOLECULAR
Miopatia distal de Nonaka (miopatia com corpos de inclusão)
Gene GNE - M. de Nonaka, m. com corpos de inclusão - Miopatia Distal
Miopatia distal tibial, miopatia centronuclear
Gene TTN (C-terminus) - M. centronuclear - Miopatia distal tibial
Miopatia distal tipo Laing
Gene MYH7 - Miopatia distal tipo Laing
Miopatia Distal tipo Welander
Gene TIA1 - Miopatia Distal tipo Welander
14
Outras Miopatias
Miopatia hereditária com insuficiência respiratória precoce
Gene TTN-Miopatia hereditária com insuficiência respiratória precoce
Miopatia Miofibrilar
Gene DES - Miopatia Miofibrilar
Gene FHL1 - Miopatia Miofibrilar
Gene LDB3 - Miopatia Miofibrilar
Gene MYOT - Miopatia Miofibrilar
15
Síndromes
Alfatalassémia mielodisplásica [MIM#300448]
Gene ATRX - atraso mental / alfa-talassémia [MIM#301040]
Atraso mental com facies hipotónica [MIM#309580]
Gene ATRX - atraso mental / alfa-talassémia [MIM#301040]
Atraso mental ligado ao cromossoma X
Painel 3XLID - atraso mental ligado ao cromossoma X
Encefalopatia epiléptica [MIM#308350]
Gene ARX - atraso mental / défice intelectual [MIM#300419]
Gene ARX - duplicação frequente - atraso mental/défice intelectual [MIM#300419]
Gene ARX - rastreio de familiar - atraso mental / défice intelectual [MIM#308350]
Hidranencefalia com malformações genitais [MIM#300215]
Gene ARX - atraso mental / défice intelectual [MIM#300419]
Gene ARX - duplicação frequente - atraso mental/défice intelectual [MIM#300215]
Gene ARX - rastreio de familiar - atraso mental / défice intelectual [MIM#300215]
Lisencefalia ligada ao X [MIM#300215]
Gene ARX - atraso mental / défice intelectual [MIM#300215]
Gene ARX - duplicação frequente - atraso mental / défice intelectual [MIM#300215]
Gene ARX - rastreio de familiar - atraso mental / défice intelectual [MIM#300215]
Lujan-Fryns [MIM#309520]
Gene MED12 - mutações frequentes - atraso mental ligado ao X [MIM#309520]
Ohdo, ligado ao X [MIM#300895]
Gene MED12 - mutações frequentes - atraso mental ligado ao X [MIM#300895]
ANÁLISES DA UNIDADE DE GENÉTICA MOLECULAR
Opitz-kaveggia [MIM#305450]
Gene MED12 - mutações frequentes - atraso mental ligado ao X [MIM#305450]
Partington [MIM#309510]
Gene ARX - atraso mental / défice intelectual [MIM#309510]
Gene ARX - duplicação frequente - atraso mental / défice intelectual [MIM#309510]
Gene ARX - rastreio de familiar - atraso mental / défice intelectual [MIM#309510]
Proud [MIM#300004]
Gene ARX - atraso mental / défice intelectual [MIM#300004]
Gene ARX - duplicação frequente - atraso mental / défice intelectual [MIM#300004]
Gene ARX - rastreio de familiar - atraso mental / défice intelectual [MIM#300004]
Síndrome de Cornelia de Lange
Diagnóstico pré-natal - S. de Cornelia de Lange
Gene NIPBL - S. de Cornelia de Lange
Genes SMC1A e HDAC8 - S. de Cornelia de Lange
Rastreio de familiar - S. de Cornelia de Lange
Síndrome de Crigler-Najjar
Diagnóstico pré-natal - S. de Crigler-Najjar
Gene UGT1A1 - Rastreio de familiar - S. de Crigler-Najjar
Gene UGT1A1 - S. de Crigler-Najjar
Mutações frequentes no gene UGT1A1 - S. de Crigler-Najjar
Síndrome de Gilbert
Duplicação [TA] no gene UGT1A1 - S. de Gilbert
Gene UGT1A1 - Rastreio de familiar (mutação conhecida) - S. de Gilbert
Gene UGT1A1 - S. de Gilbert
Variantes de susceptibilidade no gene UGT1A1 - S. de Gilbert
Síndrome de quebras de Nijmegen
Gene NBN - Diagnóstico pré-natal - Síndrome de quebras de Nijmegen
Mutação c.657_661del no gene NBN - Síndrome de quebras de Nijmegen
Síndrome de Shwachman-Bodian-Diamond
Gene SBDS - Diagnóstico pré-natal - S. de Shwachman-Bodian-Diamond
Gene SBDS - Rastreio de familiar - S. de Shwachman-Bodian-Diamond
Gene SBDS - S. de Shwachman-Bodian-Diamond
Síndrome de tremor/ataxia (FXTAS) [MIM#300623]
Pré-mutação no gene FMR1-S. de tremor / ataxia (FXTAS) [MIM#300623]
Síndrome de X-frágil (FXS) [MIM#300624]
Gene FMR1 - exclusão da S. de X-frágil por PCR - atraso mental / défice cognitivo
Gene FMR1 - exclusão ou confirmação da S. de X-frágil por SB - atraso mental / défice cognitivo
Síndrome progeróide de Hutchinson-Gilford
Gene LMNA - Diagnóstico Pré-Natal - S. de Hutchinson-Gilford
Gene LMNA - Rastreio de familiar - S. de Hutchinson-Gilford
Gene LMNA - S. de Hutchinson-Gilford
ANÁLISES DA UNIDADE DE GENÉTICA MOLECULAR
16
Síndromes Miotónicos
Distrofia miotónica de Steinert tipo 1 (DM1)
Gene DMPK - Exclusão ou confirmação por SB - Distrofia miotónica de Steinert
Gene DMPK - Exclusão por PCR - Distrofia miotónica de Steinert
Gene DMPK -Diagnóstico pré-natal - Distrofia miotónica de Steinert
17
Tremor / ataxia
Síndrome de tremor / ataxia (FXTAS) associado ao gene FMR1 [MIM#300623]
Pré-mutação no gene FMR1-S. de tremor / ataxia (FXTAS) [MIM#300623]
18
Outros estudos de genética molecular
Aniridia
Diagnóstico pré-natal - Aniridia
Gene PAX6 - Aniridia, Coloboma, hipoplasia do nervo óptico
Mutação c.637C>T no gene PAX6 - Aniridia
Displasia mandibuloacral com lipodistrofia tipo A
Gene LMNA - Displasia mandibuloacral com lipodistrofia tipo A
Dissomia Uniparental
Cromossoma 14 - estudo de metilação e del/dup
Dissomia Uniparental do cromossoma 14 - análise por microsatélites
Dissomia Uniparental do cromossoma 15 - análise por microsatélites
Hipotiroidismo congénito (disormonogénese) [MIM#274500]
Gene TPO - Hipotiroidismo por disormonogénese [MIM#274500]
Lipodistrofia Familiar de Dunnigan
Gene LMNA - Lipodistrofia Familiar de Dunnigan
Neurodegenerescência com acumulação cerebral de ferro (NBIA)
Diagnóstico pré-natal (PLA2G6) - Distrofia Neuroaxonal Infantil
Gene PLA2G6 - Distrofia Neuroaxonal Infantil
Gene PLA2G6 - Rastreio de familiar - Distrofia Neuroaxonal Infantil
Mutações frequentes no gene PLA2G6 - Distrofia Neuroaxonal Infantil
Neurodegenerescência com acumulação cerebral de ferro tipo 2B
Gene PLA2G6 - Neurodegenerescência com acumulação cerebral de ferro
Síndrome Angelman
Síndrome Angelman - estudo de metilação e del/dup
Síndrome Prader-Willi
Síndrome Prader-Willi - estudo de metilação e del/dup
Outros:
Armazenamento de DNA em banco (a longo prazo)
ANÁLISES DA UNIDADE DE GENÉTICA MOLECULAR
Armazenamento de DNA em Biobanco (projectos de investigação)
Armazenamento de outras amostras em banco
Extração de DNA para estudos posteriores
Identificação por marcadores polimórficos
Levantamento de DNA para envio
Lionização - Inativação do X (Ensaio HUMARA)
Rastreio de Mutação frequente
Estudos com marcadores polimórficos
INSTRUÇÕES PARA COLHEITA DE AMOSTRAS
Sangue
Tubo estéril com EDTA
3 - 5 ml
DNA
Tubo estéril
Vilosidades do córion
Tubo estéril com meio de transporte
20 mg
Vilosidades do córion em cultura
Caixa de cultura cheia com meio de cultura
25cm2 (50 ml) - 75cm2 (250ml)
Líquido amniótico
Tubo estéril de fundo cónico
2 ml (preferencialmente, entre 3-5 ml)
Amniócitos em cultura
Caixa de cultura cheia com meio de cultura
25cm2 (50 ml) - 75cm2 (250ml)
Sangue seco em cartão
Cartão
2 círculos
Músculo
Rec. apropriado acondicionado com neve carbónica
50 mg
Outros tecidos
Recipiente estéril apropriado ao tecido
50 mg
Fibroblastos em cultura
Caixa de cultura cheia com meio de cultura
Notas:
No caso de estudos de diagnóstico pré-natal, contactar previamente o laboratório.
Em caso de dúvidas, contactar o secretariado através do telefone 226070330.
NOTAS:
Versão 02
novembro 2015

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