relat act 2002
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RELATÓRIO DE ACTIVIDADES DO CIBO/IPATIMUP 2002 ÍNDICE PÁG. 1. INTRODUÇÃO ....................................................................................................................... 2 2. RESUMO DOS OBJECTIVOS PROPOSTOS PARA 2002 E RESPECTIVOS RESULTADOS ........................................................................................ 4 3. INVESTIGAÇÃO .................................................................................................................... 5 3a. Produção científica ..................................................................................................... 5 3b. Participação em Conselho Editoriais ........................................................................ 5 3c. Prémios ........................................................................................................................ 6 3d. Projectos de investigação em curso (ou concluídos) em 2002 .............................. 6 4. FORMAÇÃO APÓS-A-GRADUAÇÃO .................................................................................. 10 4a. Teses de Doutoramento .............................................................................................. 10 4b. Estágios ....................................................................................................................... 13 5. UNIDADE DE EDUCAÇÃO CONTÍNUA E DIFUSÃO CIENTÍFICA ...................................... 14 6. SERVIÇO À COMUNIDADE ................................................................................................. 16 7. SEMINÁRIOS CIENTÍFICOS ............................................................................................... 23 8. WORKSHOPS E CURSOS INTERNACIONAIS ................................................................ 25 9. TRABALHOS PUBLICADOS OU ACEITES PARA PUBLICAÇÃO .................................. 27 9a. Artigos científicos.................................................................................................... 27 9b. Capítulos de livros ................................................................................................... 35 ANEXOS: Research Strategic Plan e Programas da V Portugalia Genética, XI Porto Cancer Meeting, FOOD SAFETY 2002 e VI Conferência do Equinócio. 1. INTRODUÇÃO Depois de um ano marcado pela intensidade do envolvimento do IPATIMUP nas actividades do Porto Capital Europeia da Cultura, 2002 foi um ano relativamente calmo. (Tanto quanto é possível haver calma na actual circunstância portuguesa). Dando continuidade à prática inaugurada no Relatório de 1997 salientam-se seguidamente alguns indicadores de desempenho relativos a 2002. a) Elaboração e início da implementação do Research Strategic Plan do Instituto para 2002-2007 com o apoio da FLAD e o recurso a uma Empresa Norte-Americana b) Publicação (ou aceitação para publicação) de 97 artigos científicos, 83 em revistas com factor de impacto superior a 1, 28 em revistas com factor de impacto superior a 3 e 12 em revistas com factor de impacto superior a 6. c) Autoria de um livro “A espécie das origens” editado pela Gradiva (Autor: António Amorim) e coautoria de alguns capítulos de livros de genética populacional, genética forense e patologia humana. d) Finalização de seis doutoramentos (um dos quais aguarda ainda a marcação de Provas): dois em Medicina e quatro em Biologia ou Biologia Humana, com teses de qualidade internacional. e) Participação na revisão de artigos científicos submetidos a mais de duas dezenas de revistas internacionais de Patologia, Oncologia, Oncobiologia, Genética Humana e Genética Populacional (Os investigadores do CIBO/IPATIMUP integram, nesta altura, o Editorial Board de 14 dessas revistas). f) Coordenação e realização da quinta edição do Programa GABBA (Programa doutoral da Universidade do Porto) em colaboração com a FMUP, FCUP, ICBAS-UP e IBMC. g) Participação activa na coordenação e realização da 1ª edição e lançamento da 2ª edição do Programa de Educação Contínua e Mestrado em Medicina Molecular da Faculdade de Medicina da Universidade do Porto h) Participação activa na coordenação e realização da 2ª edição do Programa de Iniciação à Investigação Científica em Ciências da Saúde em colaboração com diversas Associações de Estudantes e algumas instituições da Universidade do Porto. i) Apoio à formação de 30 médicos, biólogos e bioquímicos. j) Os investigadores do IPATIMUP ganharam em 2002 diversos prémios e distinções de natureza científica e sócio-cultural. k) Consultadoria diagnóstica para instituições da Europa, América do Norte e do Sul e África. l) Organização de 18 Seminários Científicos, uma Reunião Internacional sobre Higiene e Segurança Alimentar (FOOD SAFETY, 2002), o III Workshop Internacional do Cromossoma Y e dois Workshops/Seminários tutoriais, para além das habituais reuniões anuais do IPATIMUP (V Portugália Genética, XI Porto Cancer Meeting e VI Conferência do Equinócio). Vale a pena referir que estas actividades trouxeram ao Porto cerca de 50 dos melhores especialistas internacionais nos diferentes assuntos e contaram com a participação de mais de mil e quinhentos médicos, biólogos, nutricionistas, etc. m) Organização, por solicitação do Prof. Ramoa Ribeiro, Presidente da FCT, da 1ª Sessão de Avaliação Intercalar de Projectos de Investigação em dois domínios das Ciências da Saúde “Ciências Biomédicas de Órgãos e Sistemas e Oncologia” e “Medicina Molecular e Genética e Imunologia” n) Desempenho de funções nas seguintes instituições internacionais: Sociedade Europeia de Patologia (Past-President e Comité Executivo), Escola Europeia de Patologia, Curso Europeu de Patologia Celular, Associação Europeia de Prevenção do Cancro, Clubes Europeus de Patologia Gastrointestinal, Patologia Endócrina e Citopatologia (Presidência), Sociedade Internacional de Citopatologia, Associação dos Directores de Anatomia Patológica e Patologia Cirúrgica (EUA). Em 2002 o IPATIMUP foi agraciado com a insígnia da Cruz Vermelha de Benemerência em cerimónia presidida pela Presidente da Cruz Vermelha Portuguesa, Drª Maria de Jesus Barroso. Durante o ano 2002 continuámos a receber, sempre que o solicitámos, apoio dos vários organismos dependentes do Ministério da Ciência e Tecnologia (FCT, OCT e ICCTI), assim como da Universidade do Porto, dos Associados do IPATIMUP e da Fundação Calouste Gulbenkian. Cumpre também agradecer a preciosa ajuda que nos deram, em vários aspectos, os membros do Conselho Científico e Técnico. 2. RESUMO DOS OBJECTIVOS PROPOSTOS PARA 2002 E RESPECTIVOS RESULTADOS a) Manter a qualidade da investigação científica tanto “fundamental” como de “translacção” Este objectivo foi alcançado na integra conforme se poderá ver através da comparação da produção científica em 2002 com a dos anos anteriores (ver quadro na pág. 5) b) Consolidar a instituição enquanto Laboratório Associado do Ministério da Ciência e do Ensino Superior (MCES) Este objectivo foi também alcançado na íntegra tanto no domínio da investigação vocacionada para o cancro e lesões precancerosas do estômago como no da prestação de serviços diagnóstico de qualidade (ver págs. 16-20 e 27-35). A organização funcional do Instituto melhorou imenso com a entrada em funções de uma especialista em gestão. Continuamos entretanto sem conseguir produzir um Site com qualidade na INTERNET. O IPATIMUP preparou-se cuidadosamente, em articulação com o IBMC, o INEB e o Centro de Neurociências de Coimbra, para o concurso nacional de re-equipamento das instituições científicas que deveria ter sido realizado em 2002. O adiamento deste concurso (para 2003?) constitui uma limitação muito grande ao desenvolvimento do IPATIMUP (e dos outros Laboratórios Associados e Institutos de Investigação portugueses) já que o último concurso para aquisição de equipamento teve lugar em 1991. c) Proceder às obras de correcção das avarias no prédio, elaborar o projecto de ampliação do edifício e iniciar algumas obras de recuperação de laboratórios. Objectivo integralmente alcançado com o apoio da Firma Ribeirinho Soares e da Fundação Calouste Gulbenkian. d) Reorganizar a estrutura interna da IPATIMUP Este objectivo tem vindo a ser progressivamente alcançado com a individualização das duas Unidades de Prestação de Serviços e a instalação plena da Contabilidade Analítica (Como corolário destas melhorias foi possível elaborar, pela primeira vez, um orçamento do IPATIMUP). e) Conseguir o apoio da chamada Sociedade Civil para a investigação científica que se realiza no IPATIMUP Apesar do reconhecimento generalizado da opinião pública (Insígnia da Cruz Vermelha de Benemerência e vários prémios e galardões individuais e colectivos) não conseguimos em 2002 aumentar a recolha de fundos para as actividades de investigação do IPATIMUP. (Por outras palavras este foi um objectivo totalmente falhado). f) Manter e, sempre que possível, melhorar o nível alcançado anteriormente nos seguintes aspectos: i. Pós-graduação e especialização profissional Os objectivos listados no Plano de Actividades para 2002 foram alcançados na totalidade excepto no que se refere ao número de Teses de Doutoramento (6 em vez das 7 que havíamos previsto) e ao desenvolvimento do programa de apoio ao Internato de Anatomia Patológica que teve de ser interrompido devido às modificações no âmbito da FCT. Apesar desta contrariedade seis dos 10 Internos do Serviço de Anatomia Patológica do H.S. João terminaram com sucesso a parte escolar do Mestrado em Medicina Molecular da Faculdade de Medicina do Porto. ii. Unidade de Educação Contínua e Difusão Científica Objectivos alcançados na integra (ver págs. 14 e 15). iii. Prestação de Serviços à Comunidade Os processos de Controlo de Qualidade e Acreditação de ambas as Unidades progrediram em bom ritmo. A quantidade dos exames diminuiu um pouco na UPS1 e aumentou um pouco na UPS2 (ver respectivos relatórios nas págs. 16-22). iv. Organização de eventos científicos de carácter institucional ou internacional Os objectivos explicitados neste ponto foram integralmente cumpridos (e, passe a imodéstia, com brilhantismo) (ver págs. 23-26). 3. INVESTIGAÇÃO 3a. Produção científica Os investigadores do CIBO/IPATIMUP foram autores ou co-autores, em 2002, de 97 artigos publicados (ou aceites para publicação) em revistas científicas (págs. 27-34), sete artigos publicados em Livros de Proceedings (pág.35) e de cinco capítulos de livros (pág. 35). O Prof. António Amorim publicou o livro “A Espécie das Origens”, Gradiva, 2002. Noventa e quatro dos 97 artigos científicos foram publicados (ou aceites para publicação) em revistas internacionais com Factor de Impacto entre 0,2 e 14,2. Oitenta e seis por cento dos trabalhos (n=83) foram publicados em revistas com Factor de Impacto superior a 1, vinte e nove por cento (n=28) em revistas com Factor de Impacto superior a 3, e doze por cento (n=12) em revistas com Factor de Impacto superior a 6. No quadro seguinte comparam-se os dados de 2002 com 1998, 1999, 2000 e 2001 Nº total de artigos (publicados e em publicação) Artigos em Livros de Proceedings Artigos em Revistas Artigos em Revistas editadas em Portugal ou em outros Países Latinos ou Latino-Americanos Artigos em Revistas Internacionais não Latinas sem FI Artigos em Revistas Internacionais c/FI Artigos em Revistas c/FI>1,0 Artigos em Revistas c/FI>3,0 Artigos em Revistas c/FI>6,0 1998 81 1999 105 2000 95 2001 89 2002 104 99 8 87 10 79 7 97 11(15%) 11(11%) 6(7%) 3(4%) 1(1%) 11(15%) 53(70%) 3(3%) 85(85%) 8(9%) 73(84%) 6(8%) 70(89%) 2(2%) 94(97%) 46(57%) 20(25%) 8(10%) 62(64%) 20(21%) 6(6%) 66(76%) 26(30%) 7(8%) 60(76%) 24(30%) 8(10%) 83(86%) 28(29%) 12(12%) 6 75 6 A análise do quadro permite concluir que a produção científica aumentou em quantidade em relação aos anos anteriores sem ter perdido em qualidade. É de referir ainda a subida consistente (e pronunciada…) da percentagem dos artigos publicados em revistas internacionais com Factor de Impacto (de 60% em 1996 até 97% em 2002). Finalmente, mantivemos em 2002 um nível de publicação em revistas científicas de elevada exigência editorial semelhante, ou superior, ao da grande maioria dos institutos de patologia europeus de características comparáveis às do CIBO/IPATIMUP. 3b. Participação em Conselhos Editoriais Os investigadores do IPATIMUP são membros dos Conselhos Editoriais de 14 revistas científicas internacionais: Advances in Anatomic Pathology (Lippincott), Cancer Genetics and Cytogenetics (Elsevier), Current Diagnostic Pathology (Churchill Livingstone), Diagnostic Cytopathology (Wiley), Endocrine Pathology (Blackwell), European Journal of Cancer Prevention (Oxford Communications), Histopathology (Blackwell), International Journal of Surgical Pathology (Churchill Livingstone), Journal of Pathology (Wiley), Pathology Research & Practice (Gustav Fischer Verlag), Pathology Update (Gustav Fischer Verlag), Patologia (Revista da Sociedade Espanhola de Anatomia Patológica), Seminars in Diagnostic Pathology (W.B. Saunders) e Virchows Archiv (Springer Verlag). 3c. Prémios Prémios Para além de vários prémios e galardões cívicos e/ou culturais os investigadores do IPATIMUP ganharam em 2002 os seguintes prémios científicos. • Prémio de Melhor Trabalho na Área de Citologia não-Ginecológica com o trabalho: Avaliação de metástases de câncer da mama em efusões pleurais no XVII Congresso Brasileiro de Citopatologia, Foz do Iguaçu, PR, 2002. Autores: Granja NM, Soares R, Rocha S, Paredes J, Longatto-Filho A, Alves VA, Schmitt FC • Prémio da Melhor Comunicação Oral com o trabalho: “Frecuencia del cancer de mama hereditario, familiar y esporadico, en el momento del diagnostico, a los 5 años y a los 12 años de seguimiento”. V Encontros da Medicina Xeral Galega, Santiago de Compostela, Espanha, 2002. Autores: Cortizo-Torres ME, Cameselle-Teijeiro JF, Duarte F, López-Touza A, Schmitt FC • Burgen Scholarship Award 2002 - prémio atribuído à Doutora Céu Figueiredo pela Academia Europaea (Outubro de 2002). 3d. Projectos de investigação em curso (ou concluídos) em 2002 • Projectos de investigação aprovados e/ou negociados em 2000 ou 2001 (a iniciar em 2001 ou 2002) “Promotion and development of GalNacMUC1 and NeuAc Alpha2-6GalNac-MUC1 glycopeptides for immunotherapy in cancer” – Fundação para a Ciência e Tecnologia - POCTI/36376/CBO/2000 – 2000-2003 – 36 meses – IR: Celso Reis. (Fin. € 107.171,72) “Factores genéticos e ambientais (infecção por Helicobacter Pylori) que contribuem para a agregação familiar do carcinoma gástrico” – Fundação para a Ciência e Tecnologia POCTI/35374/CBO/2000 – 2001-2004 – 36 meses – IR: Raquel Seruca. (Fin. € 131.852,24) “Tabagismo e deficiência de 1-antitripsina” - Conselho de Prevenção do Tabagismo - CPT – 20012004 – 36 meses – IRs: Jorge Rocha e António Amorim. (Fin. € 49.879,79) “Tabagismo e cancerização das vias aéreas superiores” - Conselho de Prevenção do Tabagismo CPT – 2001-2004 – 36 meses – IRs: Conceição Souto Moura, Raquel Seruca e Fernando Schmitt. (Fin. € 49.879,79) “Deficiência em Ornitina Transcarbamílase (OTC): Espectro mutacional, análise haplotípica e diagnóstico” – Fundação para a Ciência e Tecnologia - POCTI/1999/MGI/35809 – 2001-2004 – 36 meses – IR: Prof. António Amorim. (Fin. € 39.903,83) “Molecular genetic characterisation of mixed carcinomas of the stomach: Implications for phenotypic divergence and biological aggressiveness” – Fundação para a Ciência e Tecnologia POCTI/1999/MGI/35586 – 2001-2004 – 36 meses – IR: Fátima Carneiro. (Fin. € 57.257,01) “Genetic diversity of Helicobacter pylori: clinical relevance of cagA, vacA and iceA genes” – Fundação para a Ciência e Tecnologia - POCTI/ESP/43650/1999 – 2001-2003 – 24 meses – IR: Fátima Carneiro. (Fin. € 64.843,73) “Avaliação da relevância dos polimorfismos da interleucina-1 na carcinogénese gástrica” – 152/01 - Ministério da Saúde – 2002 – 12 meses – IR: Ana Filipa Capelinha. (Fin. € 6.234,97) “Mecanismos de regulação hormonal em angiogénese” – 218/01 – Ministério da Saúde – 2002 – 12 meses - IR: Raquel Soares. (Fin. € 7.481,97) “Myonuclear abnormalities as a basis for inclusion body myositis” - Fundação para a Ciência e Tecnologia - POCTI/43632/ESP/2000 – 2002-2004 – 23 meses – IR: Sterling Carpenter. (Fin. € 24.939,89) “Recidiva de bócio nodular: Análise da factores predisponentes de natureza clínica, psicológica, imunológica, anátomo-patológica e molecular” - Fundação para a Ciência e Tecnologia POCTI/ESP/43631/1999 – 2002-2004 – 24 meses – IR. Profª Elsa Fonseca. (Fin. € 29.927,87) “Percepção e gestão do risco alimentar em consumidores adultos portugueses” – Fundação para a Ciência e Tecnologia - POCTI/43640/ESP/2000 – 2002-2004 – 24 meses – IR: Maria Daniel Almeida. (Fin. € 22.445,91) “Análise de doença residual mínima em neoplasias linfóides por PCR quantitativa em tempo real (RT-PCR)” – FCG-47261 - Fundação Calouste Gulbenkian – 2001-2004 – 36 meses – IR: Clara Sambade. (Fin. € 149.639,37) “Epidemiologia molecular de isoladoa clínicos de pseudomonas aeruginosa associados a infecções nosocomiais” - FCG-47273 - Fundação Calouste Gulbenkian – 2001-2004 – 36 meses – IR: Pedro Fonseca. (Fin. € 41.899,02) “Diminuição dos níveis de Bcl-2 e xIAP pela tecnologia antisense – potencial uso na terapêutica da leucemia mielóide aguda” – Fundação para a Cência e Tecnologia - POCTI/FCB/42754/2001 – 2002-2004 – 24 meses – IR: Maria Helena Vasconselos. (Fin. € 65.762,00) “Mutações e delecções mitocondriais em tumores da tireóide pos-Chernobyl e no respectivo parenquima normal adjacente” – Fundação para a Ciência e Tecnologia – POCTI/CBO/43944/2001 – 12 meses – IRs: Manuel Sobrinho Simões e Paula Soares. (Fin. € 34.915,85) “Estudo da regulação da transcrição de genes de mucinas em patologia gástrica” – acção integrada Luso-Espanhola – 2002-2004 – 24 meses – IR: Doutora Raquel Almeida. “Mutações germinais da caderina-E e carcinoma difuso hereditário do estômago: caracterizaçõao funcional, bioquímica e molecular – Fundação para a Ciência e Tecnologia - POCTI/CBO/40820/2001 – 2002-2005 - 36 meses – IR: Raquel Seruca. (Fin. € 89.275,00) “Fucosiltransferases humanas: organização na membrana e regulação da actividade in vivo” – Fundação para a Ciência e Tecnologia - POCTI/P/BIO/12072/98 –– 2000-2002 – 30 meses - IR: Leonor David. (Fin. € 84.795,64) “Methylation and transcription factors involved in aberrant mucin expression in gastric carcinogenesis” – Fundação para a Ciência e Tecnologia - POCTI/CBO/39075/2001 – 2002-2005 - 36 meses – IR: Leonor David. (Fin. € 83.000,00) “Investigação sobre o papel do hospedeiro e da infecção por Helicobacter pylori na carcinogénese gástrica” – L-V-173/2002 - Fundação Luso Americana para o Desenvolvimento – 20022005 – 36 meses – IR: Leonor David. (Fin. € 52.500,00) “Caracterização das lesões gástricas associadas à infecção por Helicobacter pylori em trabalhadores dos Estaleiros navais de Viana do Castelo (ENVC), cerca de quatro anos depois do rastreio inicial e da implementação de uma estratégia terapêutica baseada na identificação de factores de risco do hospedeiro e do Helicobacter pylori” – Fundação Calouste Gulbenkian - FCG54918 – 2002-2005 – 36 meses – IR: Leonor David. (Fin. € 120.000,00) “Utilização de “microarray CGH” para o estudo da instabilidade cromossómica em diferentes fases da carcinogénese gástrica” – Fundação para a Ciência e Tecnologia - POCTI/CBO/41179/2001 – 2002-2005 – 36 meses – IR: Fátima Carneiro. (Fin. € 101.110,00) “Mutações e delecções do ADN mitocondrial (mtDNA) em tumores de células de Hurtle da tireóide: Significado prognóstico e associação com polimofirmos do mtDNA” – Fundação para a Ciência e Tecnologia - POCTI/NSE/41055/2001 – 2002-2005 – 36 meses – IR: Manuel Sobrinho Simões. (Fin. € 92.500,00) “Identificação e caracterização de mecanismos envolvidos na aquisição de motilidade e invasibilidade das células do carcinoma papilar da tireóide” – Fundação para a Ciência e Tecnologia - POCTI/CBO/38567/2001 – 2003-2006 – 36 meses – IR: Manuel Sobrinho Simões. (Fin. € 61.798,00) “Plan for developing Increased Extramural research support at IPATIMUP” – L-V-242/2002 – Fundação Luso Americana para o Desenvolvimento – 2002-2004 – 24 meses – IR: Manuel Sobrinho Simões. (Fin. € 10.000,00) “Polimorfismos dos Genes de reparação do ADN em populações e doentes com cancro da mama de origem portuguesa” – L-V-172/2002 – Fundação Luso Americana para o Desenvolvimento – 20022005 – 36 meses – IR: Fernando Schmitt. (Fin. € 50.000,00) “Programa de Acreditação do IPATIMUP na qualidade de Laboratório Associado do Ministério da Ciência e Tecnologia” – 2002-2005 – 36 meses – IR: Fernando Schmitt. (Fin. € 118.367,13) “Caracterização molecular de três famílias portuguesas com cardiomiopatia dilatada familiar” – FCG – 35-47230-S – Fundação Calouste Gulbenkian – 2001-2004 – 36 meses – IR: José Carlos Cardoso e Elisabete Bernardes. (Fin. € 39.901,00) “Helicobacter pylori virulence and interleukin-1 polymorphisms: interplay in gastric carcinogenesis” – Fundação para a Ciência e Tecnologia – POCTI/CBO/41550/2001 – 2003-2006 – 36 meses – IR: José Carlos Machado. (Fin. € 93.615,00) “Antropogenética do arquipélago de São Tomé e Príncipe: um caso exemplar de microevolução humana” – Fundação para a Ciência e Tecnologia - POCTI/ANT/42510/2001 – 2003-2006 – 36 meses – IR: Jorge Rocha. (Fin. € 90.000,00) “Restauro, remodelação, ampliação e melhoria das condições de segurança e protecção das pessoas e do meio ambiente no IPATIMUP” – IE2 – Fundação para a Ciência e Tecnologia – (Fin. € 2.177.751,63) “Papel da segregação membranar em rafts na modulação/alteração das vias de transdução de sinal em tireóide normal e em carcinoma papilar da tireóide” – Fundação para a Ciência e Tecnologia - POCTI/NSE/48171/2002 – 2003-2006 – 36 meses – IR: Paula Soares (Fin. € 72.654,00) “Tratamento e susceptibilidade na leucemia linfoblástica aguda infantil: influência de factores genéticos em enzimas destoxifixadoras” – Fundação para a Ciência e Tecnologia POCTI/MGI/45076/2002 – 2003-2005 – 24 meses – IR: Maria João Prata. (Fin. € 56.200,00) “Identificação dos mecanismos de escape à acção da P53 na carcinogénese humana usando as neoplasias da tiréoide como modelo de estudo” – Fundação para a Ciência e Tecnologia POCTI/CBO/41084/2001 – 2003-2006 – 36 meses – IR: Paula Soares. (Fin. € 67.825,00) • Outros projectos no âmbito de concursos e/ou enquadramentos internacionais* International Gastric Cancer Linkage Consortium (Supported by European and North American funds) (IRs do IPATIMUP: Fátima Carneiro e Raquel Seruca) 4. FORMAÇÃO APÓS-A-GRADUAÇÃO 4a Teses de doutoramento • Carla Oliveira, bióloga, estudante do Programa GABBA, doutorou-se em Biologia Humana na Faculdade de Medicina da Universidade do Porto em Março de 2002 (Orientador no IPATIMUP: Prof. Raquel Seruca) Título da Tese: Molecular genetic profiles of sporadic and familial gastric cancer. A study of microsatellite instability and E-cadherin Trabalhos: I. Carla Oliveira, Raquel Seruca, Mário Seixas, Manuel Sobrinho-Simões. The clinicopathologic features of gastric carcinoma with microsatellite instability may be mediated by mutations of different “target genes” A study of the TGF RII, IGFII R and BAX genes. American Journal of Pathology 153:1211-1219. 1998. II. Mafalda Pinto, Carla Oliveira, José Carlos Machado, Luis Cirnes, Fátima Carneiro, Richard Hamelin, Robert Hofstra, Raquel Seruca, Manuel Sobrinho-Simões. MSI-L gastric carcinomas share the hMLH1 methylation status of MSI-H carcinomas but not their clinicopathological profile. Laboratory Investigation 80:1915-1922. 2000. III. José Carlos Machado, Carla Oliveira, Ralph Carvalho, Paula Soares Soares, Gert Berx, Carlos Caldas, Raquel Seruca, Fátima Carneiro, Manuel Sobrinho-Simões. E-cadherin gene (CDH1) promoter methylation as the second hit in sporadic diffuse gastric carcinoma. Oncogene 20:15251528. 2000. IV. Carla Oliveira, Maria Cristina Bordin, Nicola Grehan, David Huntsman, Gianpaolo Suriano, José Carlos Machado, Lauri Aaltonen, Charles E. Jackson, Raquel Seruca, Carlos Caldas. Screening of ECadherin in gastric cancer families reveals germ-line mutations only in hereditary diffuse gastric cancer kindred. (In press – Human Mutation). • João António Pinto de Sousa, médico, assistente da Faculdade de medicina e especialista em cirurgia do Hospital de S. João, doutorou-se em Medicina na Faculdade de Medicina da Universidade do Porto em 17 de Junho de 2002 (Orientador no IPATIMUP: Prof. Leonor David) Título da Tese: Carcinoma do estômago: Diferentes localizações - perfis clínicopatológicos e prognósticos diferentes? Trabalhos publicados Sousa JP, Pimenta A. ALGUNS ASPECTOS EPIDEMIOLÓGICOS E CLÍNICOS DO CARCINOMA DO ESTÔMAGO. Arq Port Cirurgia 1997;6:233-230 Pinto de Sousa J, Maciel R, Queirós H, David L, Pimenta A. 232 CARCINOMAS GÁSTRICOS RESSECADOS EM 12 ANOS: A ESTABILIZAÇÃO DOS RESULTADOS OU A IMPOTÊNCIA DA CIRURGIA? Arq Port Cirurgia 2000;9:153-159 Pinto de Sousa J, David L, Seixas M, Pimenta A. CLINICO-PATHOLOGICAL PROFILES AND PROGNOSIS OF GASTRIC CARCINOMAS FROM THE CARDIA, FUNDUS/BODY AND ANTRUM. Dig Surg 2001;18:102-110 Pinto de Sousa J, David L, Seixas M, Pimenta A. SHOULD CARDIA CARCINOMAS BE DISTINGUISHED FROM MORE DISTAL LESIONS? Recent Advances in Diseases of the Esophagus. Pinoti HW, Cecconello I, Felix VN, Oliveira MA (editors), Bolonha, Monduzzi Editore, 297- 301, 2001 Gouveia A, Pinto de Sousa J, Pimenta A, David L. THE INFLUENCE OF VENOUS INVASION IN CARDIA CARCINOMA PROGNOSIS. Recent Advances in Diseases of the Esophagus. Pinoti HW, Cecconello I, Felix VN, Oliveira MA (editors), Bolonha, Monduzzi Editore, 303-307, 2001 Carvalho F, Sousa JP, Pimenta A, Gomes AT, Moura AJ, Ribeiro LMC, Azevedo RM, Soares JM, Pinho C, David L. POLIMORFISMO DO GENE MUC1 EM DOENTES DISPÉPTICOS E DADORES DE SANGUE. Arq Medicina 2001; 15:11-13 Pinto de Sousa J, Preto JR, David L, Pimenta A. CARCINOMA DO ESTÔMAGO OPERADO: UMA ENTIDADE DIFERENTE OU UM CARCINOMA GÁSTRICO PROXIMAL? Arq Port Cirurgia 2001;10:30-37 Preto JR, Pinto de Sousa J, David L, Pimenta A. A INVASÃO VENOSA E A INFLUÊNCIA NO PROGNÓSTICO DO CARCINOMA GÁSTRICO. Arq Port Cirurgia 2001;10:80-88 Pinto de Sousa J, David L, Reis CA, Gomes R, Silva L, Pimenta A. MUCINS MUC1, MUC2, MUC5AC AND MUC6 EXPRESSION IN THE EVALUATION OF DIFFERENTIATION AND CLINICOBIOLOGICAL BEHAVIOUR OF GASTRIC CARCINOMA. Virchows Arch 2002;440:304-310 Pinto de Sousa J, David L, Almeida R, Leitão D, Preto JR, Seixas M, Pimenta A. C-erb B-2 EXPRESSION IS ASSOCIATED WITH TUMOUR LOCATION AND VENOUS INVASION AND INFLUENCES SURVIVAL OF PATIENTS WITH GASTRIC CARCINOMA. Int J Surg Pathol 2002;10:247-256 • Luisa Pereira, bióloga, mestre em Genetica Humana Aplicada, doutorou-se em Biologia na Faculdade de Ciências da Universidade do Porto em Fevereiro de 2002. (Orientador no IPATIMUP: Prof. António Amorim) Título da Tese: A genetic portrait of Portugal in iberian, european and african frameworks as drawn from the study of Y-chromosome and mitochondrial DNA polymorphisms. Trabalhos: I. PEREIRA, L., DUPANLOUP, I., ROSSER, Z.H., JOBLING, M.A., BARBUJANI, G. (2001) Y-Chromosome Mismatch Distributions In Europe. Mol. Biol. Evol. 18:1259-1271. II. DUPANLOUP, I., PEREIRA, L., BERTORELLE, G., CALAFELL, F., PRATA, M.J., AMORIM, A., BARBUJANI, G. No Evidence Of Demographic Expansions In Human Y-Chromosome Biallelic Variation. (In preparation). III. PEREIRA, L., PRATA, M.J., AMORIM, A. (2002) An Evaluation Of The Proportion Of Identical Y-Str Haplotypes Due To Recurrent Mutation. In: Sensabaugh G.F., Lincoln, P.J., Olaisen, B. (Eds) Progress In Forensic Genetics 9 (In press). Elsevier Science, Amsterdam. IV. PEREIRA, L., PRATA M.J., JOBLING M.A., AMORIM, A. (2000) Analysis Of The Y-Chromosome And Mitochondrial Dna Pools In Portugal. In Renfrew C., Boyle K. (Eds) Archaeogenetics: Dna And The Population Prehistory Of Europe. Chapter 20:191-195. Mcdonald Institute Monographs. Oxbow Books, Cambridge. V. PEREIRA, L., PRATA, M.J., AMORIM, A. (2000) Diversity Of Mtdna Lineages In Portugal: Not A Genetic Edge Of European Variation. Ann. Hum. Genet. 64:491 -506. VI. PEREIRA, L., PRATA, M.J., BRIÓN, M., JOBLING, M.A., CARRACEDO, A., AMORIM, A. (2000) Clinal Variation Of The Yap+ Y Chromosome Frequencies In Western Iberia. Hum. Biol. 72: 937-944. VII. PEREIRA, L., MACAULAY, V., PRATA, M.J., AMORIM, A. (2002) Phylogeny Of The Mtdna Haplogroup U6. Analysis Of The Sequences Observed In North Africa And Iberia. In: Sensabaugh G.F., Lincoln, P.J., Olaisen, B. (Eds) Progress In Forensic Genetics 9 (In Press). Elsevier Science, Amsterdam. VIII. ROSSER, Z.H., ZERJAL, T., HURLES, M.E., ADOJAAN, M.A., ALAVANTIC, D., AMORIM, A., AMOS, W., ARMENTEROS, M., ARROYO, E., BARBUJANI, G., BECKMAN, L., BERTRANPETIT, J., BOSCH, E., BRADLEY, D.G., BREDE, G., COOPER, G.C., CÔRTE-REAL, H.B.S.M., DE KNIJFF, P., DECORTE, R., DUBROVA, Y.E., EVGRAFOV, O., GILISSEN, A., GLISIC, S., GÖLGE, M., HILL, E.W., JEZIOROWSKA, A., KALAYDJIEVA, L., KAYSER, M., KRAVCHENCO, S.A., LAVINHA, J., LIVSHITS, L.A., MARIA, S., MCELREAVEY, K., MEITINGER,T.A., BELA MELEGH, B., MITCHELL, R.J., NICHOLSON, J., NØRBY, S., NOVELLETTO, A., PANDYA, A., PARIK, J., PATSALIS, P.C., PEREIRA, L., PETERLIN, B., PIELBERG, G., PRATA, M.J., PREVIDERÉ, C., RAJCZY, K., ROEWER, L., ROOTSI, S., RUBINSZTEIN, D.C., SAILLARD, J., SANTOS, F.R., SHLUMUKOVA, M., STEFANESCU, G., SYKES, B.C., TOLUN, A., VILLEMS, R., TYLER-SMITH, C., JOBLING, M.A. (2000) YChromosomal Diversity Within Europe Is Clinal And Influenced Primarily By Geography Rather Than Language. Am. J. Hum. Genet. 67:1526-1543. IX. PEREIRA, L., MACAULAY, V., TORRONI, A., SCOZZARI, R., PRATA, M.J., AMORIM, A. (2001) Prehistoric And Historic Traces In The Mtdna Of Mozambique: Insights Into The Bantu Expansions And The Slave Trade. Ann. Hum. Genet. 65 (In press). X. PEREIRA, L., GUSMÃO, L., ALVES, C., AMORIM, A., PRATA, M.J. Y-Chromosome Pool In The Southeastern African Population Of Mozambique: The Small European Influence And The Bantu Diversity Reduction. (In preparation). • Rui Reis, biólogo, estudante do Programa GABBA, doutorou-se em Biologia Humana na Faculdade de Medicina da Universidade do Porto em Fevereiro de 2002 (Orientador no IPATIMUP: Prof. José Manuel Lopes) Título da Tese:Genetic alterations associated with development of human diffusely infiltrating astrocytomas Trabalhos: I. Rui M. Reis, Akira Hara, Paul Kleihues, Hiroko Ohgaki. Genetic evidence of neoplastic nature of gemistocytes in astrocytomas. Acta Neuropathologica, 2001, 102:422-425. II. Hironori Fujisawa, Rui M. Reis, Mitsutoshi Nakamura, Stefano Colella, Yasuhiro Yonekawa, Paul Kleihues, Hiroko Ohgaki. Loss of heterozygosity on chromosome 10 is more extensive in primary (de novo) than in secondary glioblastomas. Laboratory Investigation, 2000, 80: 65-72. III. Rui M. Reis, Mitsutoshi Nakamura, Jun Masuoka, Takao Watanabe, Stefano Colella, Yasuhiro Yonekawa, Paul Kleihues, Hiroko Ohgaki. Mutation analysis of hBUB1, hBUBR1 and hBUB3 genes in glioblastomas. Acta Neuropathologica, 2001, 101:297-304. IV. Rui M. Reis, Riita Herva, Sebastian Brandner, John Koivukangas, Nikolai Mironov, Walter Bär, Paul Kleihues, Hiroko Ohgaki. Second Primary Glioblastoma. Journal of Neuropathology and Experimental Neurology, 2001, 60:208-215. V. Rui M. Reis, Dilek Könü-Lebleblicioglu, José M. Lopes, Paul Kleihues, Hiroko Ohgaki. Genetic profile of the gliosarcoma. American Journal of Pathology, 2000, 156:425-432. • Sandra Alves, bióloga, mestre em Genética Humana Aplicada, doutorou-se em Biologia na Faculdade de Ciências da Universidade do Porto em Junho de 2002 (Orientador no IPATIMUP: Prof. Maria João Prata) Título da Tese: Genetic Characterisation of the Drug metabolising enzymes Thiopurine Smethyltransferase, Glutathione S-transferase mu-1 and Glutathione S-transferase theta-1 in the Northern Portuguese Population. Trabalhos: I. Alves S, Prata MJ, Ferreira F, Amorim A. Thiopurine methyltransferase: alternative molecular diagnostics and preliminary data from North Portugal. Pharmacogenetics 1999; 9:257-261. II. Alves S, Prata MJ, Ferreira F, Amorim A. Characterization of three new VNTR alleles in the promoter region of the TPMT gene. Human Mutation 2000; 15:121. III. Alves S, Prata MJ, Ferreira F, Amorim A. Screening of thiopurine S-methyltransferase mutations by horizontal conformation sensitive gel electrophoresis. Human Mutation 2000, 15:246-253. IV. Alves S, Amorim A, Ferreira F, Prata MJ. Influence of the variable number of tandem repeats located in the promoter region of the thiopurine methyltransferase gene on enzymatic activity. Clin Pharmacol Ther 2001:70, 165-74. V. Alves S, Amorim A, Ferreira F, Norton L, Prata MJ. The GSTM1 and GSTT1 genetic polymorphisms and susceptibility to acute lymphoblastic leukemia in children from North Portugal. Leukemia 2002; 6:1565-7. VI. Alves S, Amorim A, Prata MJ. The evolution of a VNTR located within the promoter region of the thiopurine methyltransferase gene: inferences from population and sequence data. Hum Genet 2002; 111:172-8. VII. Alves S, Amorim A, Rocha J, Prata MJ. Tracing the origin of the most common thiopurine methyltransferase (TPMT) variants: evidences from patterns of haplotypic association with two CA repeats. (submetido para publicação). • Entregou também a sua Tese de Doutoramento na Escola de Ciências da Saúde da Universidade do Minho o Dr. Filipe Sansonetty, médico, assistente na Universidade do Minho e investigador do IPATIMUP desde a sua criação. A Tese intitula-se "Routine DNA measurements in clinical flow cytometric – a personal experience on methodology and application” e teve como orientador o Prof, Manuel Sobrinho Simões. O Dr. Filipe Sansonetty aguarda agora a marcação das Provas. 4c. Estágios O IPATIMUP assegurou estágios formativos a 30 médicos, biólogos, bioquímicos e técnicos portugueses, brasileiros e europeus. Na pág. 17 discriminam-se os dados referentes aos estágios na UPS1 de 7 elementos provenientes de instituições portuguesas (n=2) e brasileiras (n=5). 5. UNIDADE DE EDUCAÇÃO CONTÍNUA E DIFUSÃO CIENTÍFICA INTRODUÇÃO - - - O ano de 2002 foi um ano de transição e reestruturação da Unidade de Educação Contínua e Difusão Científica do IPATIMUP. A reformulação das políticas ministeriais e municipais, consequentes à alternância governativa, associada ao desgaste produzido pelo programa “Os Outros em Eu” do ano 2001, justificam em parte esta circunstância. Por outro lado, o trabalho de parceria com o Museu de Transportes e Comunicações do Porto foi estimulado, com transferência de algumas funções da Unidade para ela e libertação das disponibilidades físicas e humanas do instituto de tarefas de divulgação directas. Finalmente, deu-se início ao projecto de estabelecer no Porto um Centro Ciência Viva para as Ciências da Saúde, o que muito se fica a dever ao conhecimento especializado do Prof. Manuel Costa da universidade dos Açores. A. PROGRAMA CIÊNCIA VIVA V. a) Os resultados do “V Concurso de Projectos Ciência Viva”, a que o IPATIMUP concorreu, foram conhecidos demasiado tarde e após as datas previstas de trabalho com os professores das Escolas da Grande Área do Porto. Por esta razão, o IPATIMUP desistiu do Projecto. b) No ano de 2002, não se realizou o “VI concurso de Projectos Ciência Viva”. c) O Projecto PIV-1871 “Virtualab”, da responsabilidade do Dr. Filipe Sansonetty, prolongou-se pelo ano de 2002. B. ENSINO EXPERIMENTAL DAS CIÊNCIAS. a) Protocolo com o Pelouro da Educação da Câmara Municipal do Porto. Programa “Viver uma Escola Diferente”. Escolas do primeiro ciclo do ensino básico. b) Ensino lúdico e experimental das ciências. Trabalho directo com os alunos. Sessões semanais de um tempo lectivo, ao longo de todo o ano escolar 2001-2002, em quatro escolas do primeiro ciclo do ensino básico do Porto. c) Este protocolo foi totalmente reformulado no ano lectivo de 2002-2003; a partir de Outubro de 2002, o IPATIMUP deixou de colaborar directamente no ensino experimental das Escolas do primeiro ciclo do ensino básico do Porto. C. CIÊNCIA VIVA NAS FÉRIAS. a) Projecto do Ministério da Ciência e Tecnologia para aplicação científica dos jovens nas férias, através de um estágio voluntário no IPATIMUP. b) No verão de 2002 estagiaram no IPATIMUP, durante duas semanas, 5 alunos do ensino secundário do Grande Porto. D. V FORUM CIÊNCIA VIVA. a) No VI Forum Ciência Viva, o IPATIMUP participou no atelier Ciência Viva, com um processo simples de extracção de DNA de diversos tipos de fruta. Luís Cirnes, Luísa Ayres e Daniela Garcia, sob direcção do Prof. Doutor Manuel Costa (10-11.5.2002). b) Este Forum contou com um mesa-redonda de apresentação das actividades Ciência Viva em Férias de alguns Laboratórios Associados. Nele participaram o responsável por esta Unidade do IPATIMUP e o aluno estagiário de 2001 Franco Alexandre. E. SEMANA NACIONAL DA CULTURA CIENTÍFICA. a) Exposição de trabalhos de investigação de alunos do Ensino Secundário e Sessão solene no Pavilhão do Conhecimento em Lisboa. Presença do Drs. Filipe Sansonetty e Luís Cirnes e dos alunos Ângelo Jesus e Mónica Oliveira (Dia Nacional da Cultura Científica: 24.11.2002). b) Domingo da Cultura Científica. Iniciativa do Museu dos Transportes e Comunicações do Porto. Apoio científico do IPATIMUP, que esteve presente através do Dr. Luís Cirnes. F. MUSEU DOS TRANSPORTES E COMUNICAÇÕES. a) O Museu de Transportes e Comunicações do Porto inaugurou uma exposição permanente sobre Comunicação, onde, em parceria com o IPATIMUP e a supervisão científica do mesmo, através do Prof. Doutor Manuel Costa, incluiu um Laboratório de Biologia Celular e Bioquímica (21.2.2002). b) As visitas de alunos dos diversos graus de ensino ao IPATIMUP passaram, a partir dessa data, a realizar-se no dito Laboratório. c) O Prof. Paul Robinson ministrou neste local, a convite do IPATIMUP, um Curso de Microscopia, destinado a alunos do Ensino Básico (terceiro ciclo) e Secundário do Porto. G. VI CONFERÊNCIA DO EQUINÓCIO. a) A VI Conferência do Equinócio teve por tema “Norma, Anormalidade, Anomalia” e foi coordenada por Teresa Patrício Gouveia (22.10.2002). b) Henrique de Barros, António Fontes, João Fernandes, João Pina Cabral e Marcelo Rebelo de Sousa deram à Conferência a transversalidade de discursos desejada. H. AGÊNCIA NACIONAL CIÊNCIA VIVA a) O IPATIMUP foi aceite membro associado da Agência Nacional Ciência Viva, na reunião da sua Assembleia-Geral de 2.4.2002. I. “OS OUTROS EM EU” – LANÇAMENTO DO LIVRO DE ACTAS a) As actas do Programa “Os Outros em Eu”, iniciativa do IPATIMUP no Porto 2001 — Capital Europeia da Cultura foram publicadas em livro. O seu lançamento decorreu na Biblioteca Almeida Garrett, no dia 15.2.2002. 6. SERVIÇO À COMUNIDADE 6a) Unidade de Prestação de Serviços (UPS1) Introdução De forma a cumprir um dos objectivos do CIBO/IPATIMUP para 2002: aumentar a qualidade e quantidade dos serviços prestados pela Unidade de Prestação de Serviços, reforçámos alguns aspectos estruturais da Unidade com reflexos positivos no aumento do número de exames (8,3% em relação a 2001). Vale a pena salientar que mesmo com um enquadramento profissional no sentido de se obter rentabilidade económica, a Unidade não deixou de prestar serviços gratuitos de consultadoria, os quais não só trazem prestígio internacional, como garantem material precioso para fins investigacionais. Estes resultados reflectem-se no número de publicações alcançadas em 2002 com material obtido através da nossa rotina (ver # 4). Também continuámos a actuar como um centro de formação profissional pós-graduado, tendo recebido, em 2002, na sequência do que vem sucedendo desde há vários anos, 7 técnicos e patologistas de diferentes países (ver # 3). Outro objectivo da UPS em 2002 foi o de dar início a um Processo de Acreditação, via College of American Pathologists (CAP) com o apoio do Programa Operacional de Saúde (Saúde XXI). 1. Recrutamento de pessoal: • • • Em Janeiro de 2002, contratamos (em regime de recibos verdes a técnica Sara Ricardo). A Técnica Raquel Santos, em Janeiro de 2002 deixou o seu serviço para gozo de licença de maternidade, e cessou relações laborais com a Unidade assim que a referida licença terminou. A Técnica Nádia Santos, cessou relações laborais com a Unidade em 31 de Dezembro de 2002. 2. Aquisição de Equipamento: Com a finalidade de equipar o laboratório de rotina diagnóstica, no âmbito do Programa de Acreditação da Unidade via College of American Pathologists com o Apoio do Programa Saúde XXI, foram adquiridos os seguintes equipamentos: Aparelho/Empresa – Modelo Preço s/ IVA IVA (19%) Marcador Automático de Lâminas, marca inglesa Sahndon, modelo Microwriter (*) Garal 13.996,00 € 2.659,24 € Beecher Tissue Microarray, Man MTPA (*) Speculum 14.195,43 € 2.697,13 € Placa fria Freezer Pathotec (**) Hospitrans 3.000,00 € 570,00 € (*) O Projecto Saúde XXI comparticipa com 75% do total. (**) Adquirido integralmente com recursos da Unidade. 3. Estágios, visitas de curta duração e treino de internos: I. ESTÁGIOS Período Nome Jorge Sérgio Reis Filho, Especialista em Anatomia Patológica, Universidade Federal do Paraná, Brasil Cidália Gonçalves, Técnica de anatomia patológica citológica e tanatológica, Centro Hospitalar dos Capuchos e Desterro, Lisboa, Portugal Susana Mesquita, Técnica de Anatomia Patológica, Instituto do Câncer do Ceará, Brasil Agostinho Gouvêa, Especialista em Anatomia Patológica, UFMG, Belo Horizonte, Brasil Guilhema Cano, Patologista, Hospital Garcia da Orta, Lisboa, Portugal Paulo Eduardo Fahel, Médico Residente em Anatomia Patologia, Universidade Federal da Bahia, Bahia, Brasil Maria Betânia Silva, Bióloga do Instituto Fiocruz de Salvador, Bahia, Brasil II. Tipo de Estágio 01/04/01-31-07-02 Patologia, Imunohistoquímica, Patologia Mamária 02/10/01- 15/04/02 Imunocitoquímica Concluído 03/06/02-26/06/02 Imunocitoquímica e Hibridização in situ Concluído 9/06/02-21/07/02 Patologia Concluído 01/09/02-13/12/02 Patologia Mamária Concluído 30/09/02-18/12/02 Patologia cirurgica, Citopatologia e Patologia Mamária Imunocitoquímica e Hibridização in situ Concluído 15/10/02-6/12/02 VISITAS DE CURTA DURAÇÃO Professor Marcello Franco, Universidade Federal de São Paulo, SP, Brasil Professor Francisco Valdeci Ferreira, Universidade Federal do Ceará, CE, Brasil Prof. António Hartman, Faculdade de Medicina Santa Casa, Porto Alegre, RS, Brasil 4. Exames realizados na U.P.S. Nº total de exames: 13.358 Captura Híbrida: 114 Citologias: 9.453 (6.114 - Projecto de Santo Tirso) Citologias Aspirativas: 1.272 Histológicos: 985 Histoquímicos: 117 Imuno-histoquímicos: 256 Patologia veterinária: 4 PCR por HPV: 14 Hibridização in situ: (Projecto ROCHE): 275 Genética Molecular e Citogenética Diagnóstico de Sindrome de Prader-Willi: 55 Diagnóstico de Síndrome de Angelman: 43 Diagnóstico de Síndrome de X-frágil: 6 Situação Actual Concluído Concluído Diagnóstico de Doença de Chron: 175 Estudo molecular de delecção 1p: 14 Estudo molecular de translocações: 7 Fenotipagem de -1 antitripsina: 113 Pesquisa de Amplificação de N-myc: 8 Pesquisa de Instabilidade de Microssatélites: 73 Pesquisa de Mutação no RET: 17 Pesquisa de Mutações do gene P53: 42 Pesquisa de Mutações nos genes BRCA1 e BRCA2: 20 Pesquisa de Mutações do gene OTC: 6 Pesquisa de Mutações do gene TMPT: 6 Citometria Citometria de Fluxo: 114 Citometria de Imagem: 5 Casos em consulta*: 164 * Os casos em consulta foram oriundos das seguintes instituições: Prof. Dr. Dr. Dr. Drª Drª Prof. Dr. Dr. Drª Dr. Dr. Prof. Dr. Drª Dr. Drª Drª Dr. Drª Dr. Dr. Prof. Dr. Dr. Drª Drª Dr. Drª Dr. Dr. Dr. Prof. Dr. Drª Drª Dr. Prof. Dr. A. Verhest - Institut Jules Bordet – Bruxelas - Bélgica Afonso Fernandes - Hospital Santa Maria – Lisboa - Portugal Alexander Marx - Pathologisches Institut der Universität Würzburg – Würzburg – Alemanha Ana Maria Carvalho – Hospital Curry Cabral – Lisboa - Portugal Ana Paula Martins – Hospital Santa Cruz – Carnaxide - Portugal Angeles Torres Nieto - Hospital Universitario Rio Ortega – Valladolid – Espanha António Lázaro - Hospital Distrital Setúbal – Setúbal – Portugal Carla Valenti - Zumarragako Ospitalea - Zumarraga - Espanha Carlos Alberto Fernandes Ramos - Laboratório Virchow - João Pessoa - Paraíba - Brasil Carlos Alberto Ribeiro - Belo Horizonte – MG - Brasil Carlos Lopes - I.P.O. – Porto - Portugal Carmen Penin - Complexo Hospitalar de Ourense - Ourense – Espanha Christian Gulmann - RCSI - Beaumont Hospital - Dublin - Ireland Conceição Souto Silva - I.P.O. – Porto - Portugal Conchita de Miguel - Hospital Virgem del Camino - Hospital Virgem del Camino – Pamplona - Espanha Denis Larsimont - Institut Jules Bordet - Bruxelles - Belgique Denise Nunes Oliveira - Instituto de Prevenção do Câncer do Ceará – Fortaleza – Ceará – Brasil Eduardo De Miguel Herran - Galdakaoko Ospitalea - Galdakao (Bizkaia)- Espanha Eduardo Studart - Laboratório Silvany Studart - Hospital Português - Salvador – Bahia – Brasil Eliane Souto de Abreu - Fac. Medicina de Botucatu UNESP – Botucatu – São Paulo - Brasil Elias Fernando Miziara - CIAP - Centro Integrado de Anatomia Patológica - Asa Sul Brasília – Brasil Eloísa de Brida Tormena - Laboratório Fenix - Curitiba – PR - Brasil Elvira Soga – Instituto Oncológico – San Sebastian - Espanha Emílio Marcelo Pereira - Laboratório Salomão e Zoppi - São Paulo – Brasil Fátima Magalhães - Hospital Pedro Hispano – Matosinhos - Portugal Ferhunde Dizdaroglu - Istanbul Üniversitesi Istanbul Tip Fakültesi Patoloji – Çapa - Turquia Fernando Pardal - Hospital S. Marcos – Braga – Portugal Fortunato Vieira – Guimarães - Portugal G. S. Delides – Heraklion - Crete - Greece Ginesa Garcia-Rostan - Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas – Madrid – Espanha Helena Schmid - Porto Alegre – RS - Brasil Henrique de Oliveira Costa – Maceió – Alagoas - Brasil Ian Damjanov – Ku Med Center - Kansas City – Estados Unidos da América Drª Drª Drª Drª Drª Dr. Dr. Dr. Dr. Dr. Dr. Dr. Drª Drª Drª Dr. Drª Prof. Dr. Drª Dr. Prof. Dr. Drª Drª Drª Drª Drª Dr. Dr. Dr. Drª Drª Dr. Drª Drª Prof. Dr. Prof. Dr. Dr. Drª Drª Dr. Dr. Dr. Drª Drª Drª Dr. Dr. Drª Drª Dr. Ierecê Aymoré - CLAP - Claudio Lemos Anat. Patológica – Botafogo – Brasil Inês Vieira de Castro – São Paulo - Brasil Isabel Amendoeira - Hospital São João – Porto - Portugal Isabel Amorim – Hospital Geral de Santo António – Porto - Portugal Isabel Macedo Pinto – Porto - Portugal Javier Perez Villanueva - Complexo Hospitalario Xeral Cíes - Vigo - Espanha Jorge Alberto Thomé - Instituro de Anatomia Patológica e Citopatologia – Rio Preto – Brasil Jorge Sergio Reis Filho - Hospital das Clínicas – Curitiba - Brasil Jose Antonio Ortiz - Povisa Centro Médico – Vigo – Espanha José Cameselle Teijeiro - Hospital Clínico Universitário - Santiago de Compostela – Espanha José Carlos Rivero Vera - Hospital Gral de Gran Canaria Dr. Negrin - Las Palmas de Gran Canaria Espanha Josefo Ferro - Hospital Central de Maputo – Maputo - Moçambique Leonora Pope - HC da UFPr – Curitiba - Brasil Lina Gomes dos Santos – Piaui - Brasil Linda Giannikaki - University of Crete – Crete - Grécia Louis Gaboury - Centre hospitalier de l'Université de Montréal – Montréal – Canadá Luisa Cristina - Instituto de Anatomia Patológica F.M.I. – Lisboa – Portugal Luiz Fernando Bleggi Torres - Hospital das Clínicas - Curitiba - Brasil Márcia Caldart Tregnago - Centro Patologia Médica - Caxias do Sul – RS – Brasil Macedo Dias – Porto – Porgual Marcello Franco – Universidade Federal de São Paulo – SP - Brasil Maria Cecília Ferro - Laboratório de Patologia e Citologia de Sorcaba – Sorocaba – Brasil Maria João Martins - Hospitais da Universidade de Coimbra – Coimbra – Portugal Maria Salete Trigueiro de Araújo – Paraíba - Brasil Maria Teresa Dias de Carvalho - Hospital S. Teotónio - Viseu Marian Khan Sheehan - Hospital Central de Maputo - Moçambique Matias Lozano Valero - Hospital Santiago Apostol – Vitória – Alava – Espanha Müller-Hermelink - Pathologisches Institut der Universität Würzburg – Würzburg – Alemanha Muriel Infante - Institut Universitaire de Pathologie - Lausanne - Switzerland Nara V. de Matos Granja - Hospital do Câncer - A.C. Camargo – São Paulo – Brasil Patrícia Sabino de Matos - FCM/ Unicamp – Campinas – São Paulo – Brasil Paul Komminoth - UniversitatsSpital – Zurich - Alemanha Paula Guerra - S.M.A.S. – Lisboa - Portugal Paz Santiago Freijanes - Complexo Hospitalario Xeral-Cies – Vigo – Espanha R. Heimann – Brussels - Belgium Rodolfo Montironi - Institute of Pathological Anatomy and Histopathology - Torrette di Ancona - Italy Romualdo Correia Lins Filho – Caruaru - Pernambuco - Brasil Rosa Madureira – Hospital Santa Maria – Lisboa – Portugal Rosella de Oliveira Santos - S.A. Hospital Aliança – Salvador – Bahia – Brasil Samuel Rotman - Institut Universitaire de Pathologie – Lausanne – África do Sul Sergio Santana Filho - Hospital Aliança – Salvador – Bahia – Brasil Serpil D. Sak - Ankara U. Tip Fak Patoloji – Sihhiye – Ankara – Turquia Sônia Lima Marcena - Centro de Saúde Dr Jose Augusto Barreto – Aracaju – SE – Brasil Teresa Ribas Arião - Hospital de León – León – Espanha Teresinha Castello Branco Carvalho - Sociedade Piauiense de Combate ao Câncer - Centro Teresina - Piauí - Brasil Thomas McKee - Institut Universitaire de Pathologie – Lausanne – África do Sul Victor Piana de Andrade - Laboratório PAT – Vitória – ES – Brasil Violante Assis - Faculdade de Medicina da Universidade Federal de Juiz de Fora - Juiz de Fora - MG Brasil Waldete Cabral Moraes - Centro Integrado de Anatomia Patológica de Brasília – Brasília – Brasil Yersu Kapran - Istanbul Üniversitesi Istanbul Tip Fakültesi Patoloji ABD – Çapa - 5. Controle de Qualidade • • • • Data de Instituição 19-01-1998 Membros • Prof. Fernando Schmitt • Drª Maria José Bento • D. Susana Silva Nº de Casos Revistos em 2002 - 300 Principais Conclusões no Final do 5º Ano: O aumento do número de exames da UPS no ano de 2002 em relação ao ano passado (1.027 exames) não alterou significativamente a qualidade dos exames revistos pela Comissão no que diz respeito a concordância diagnóstica, registo dos achados, tempo de resposta e qualidade do material: 1. A concordância diagnóstica total entre o diagnóstico original e o revisto pela Comissão de Controle de Qualidade manteve-se nos mesmos níveis alcançados em 2001, com ligeira melhoria (99%). 2. Devido à introdução de alguns novos exames e possivelmente a falha na adopção do sistema informático utilizado pela UPS voltamos a ter em 2002, uma pequena percentagem (0,5%) de exames não codificados. Pretendemos dentro do Processo de Acreditação modificar completamente o Sistema Informático da Unidade. 3. O tempo médio que a realização dos exames e elaboração dos respectivos relatórios apresentou um discreto aumento em relação às biópsias, (média de 5,5 dias). Este tempo deve-se à incorporação na rotina da UPS de citologias cérvico-vaginais de rastreio, cujo tempo de resposta aceitável (5-6 dias) é maior do que o esperado para os exames histológicos e de citologia aspirativa (2-3 dias). Os exames citológicos do Programa de Rastreio de Santo Tirso têm como tempo médio de resposta 11,8 dias, valor inferior ao estabelecido no protocolo (15 dias). 4. O número de material examinado considerado de boa qualidade (77%) aumentou em relação a 2001 (71%) mas ainda não atingiu o alcançado em 2000 (79%). A maior parte destes casos corresponde a citologias cérvico-vaginais do Programa de Rastreio de Santo Tirso. Infelizmente os responsáveis pelo programa continuam a não atender ao nosso pedido de adoptarem como rotina o método de citologia em monocamada, o qual mostrou em Estudo Piloto que há uma melhoria significativa de qualidade do material observado. 5. De acordo com o referido no ano passado iniciamos um projecto no âmbito do Programa Saúde XXI para Acreditação da UPS pelo Colégio Americano de Patologistas. 6b) Unidade de Prestação de Serviços de Identificação e Parentescos (UPS2) A unidade foi criada, de facto, em Janeiro, mas por razões administrativas, a sua contabilidade separada só pôde começar a funcionar em Fevereiro. A sua criação correspondeu à necessidade de, face ao crescimento do volume de serviços e à sua estabilização tecnológica, lhe conferir maior agilidade e clarificação de objectivos. Por outro lado o tipo de serviços prestados era técnica, processual e juridicamente distinto dos englobados na UPS, pelo que não fazia sentido agregá-los àquela unidade. O resumo das actividades desenvolvido é o seguinte: Nº de exames requeridos: Pedidos Cancelados: Em curso (por falta de uma ou mais colheitas): Tipos de exame: Caracterizações/identificações genéticas: Paternidades Com 1 pretenso pai, sem análise da mãe: Com 2 filhos: Com 3 filhos: Com 1 pretenso pai e com análise da mãe: Com 2 filhos: Com 2 pretensos pais e com análise da mãe: Com 3 pretensos pais e com análise da mãe: Outros parentescos: Locais de Requisição: Porto: 108 Vila Nova de Gaia 34 Lisboa 25 Vila da Feira 12 Penafiel 6 Santo Tirso 5 Bragança 4 Macedo de Cavaleiros 4 Braga 3 Santa Cruz das Flores 3 Vinhais 2 Póvoa de Varzim 2 Mirandela 2 Ponta Delgada 2 Viana do Castelo 1 Guimarães 1 Arouca 1 Matosinhos 1 Vizela 1 Angra do Heroísmo 1 Vila do Conde 1 Trofa 1 Barcelos 1 Lagos 1 Horta 1 223 3 8 3 31 1 2 181 1 4 2 2 Tipos de Requerentes Tribunais Averiguações Oficiosas de Paternidade Outras Particulares 138 6 79 7. SEMINÁRIOS CIENTÍFICOS Data: 22 de Janeiro Horário: 16 horas Título: Regulation of MUC4 in pancreatic cancer cells (TGF-beta and smads). Orientador: Doutora Isabelle VanSeuningen, INSERM, Lille. Realizar-se-á no dia 19 de Abril um Seminário Científico integrado no X Encontro da Sociedade Portuguesa de Patologia. Data: 30 de Janeiro Horário: 16 horas Título: Cell fate decision genes in human lymphopoiesis Orientador: Prof. Leonor Parreira, Faculdade de Medicina de Lisboa e Instituto Gulbenkian de Ciência Data: 4 de Fevereiro Horário: 14h30m Título: Regulation of mitotic events by chromosomal passengers Orientador: Prof. William Earnshaw, Wellcome Centre for Cell Biology, ICMB, Universidade de Edimburgo. Data: 4 de Março Horário: 15h30m Título: New insights into the potential cooperativity between the FGFR and Notch signaling pathways” Orientador: Prof. Tom Maciag, Director do Center for Molecular Medicine, Maine Medical Center Research Institute, USA Data: 3 de Abril Horário: 15 horas Título: Apresentação e discussão do Projecto Preliminar dos Laboratórios de Genética, Imunologia e Microbiologia da Faculdade de Ciências Médicas. Orientador: Arquitecto Thomaz Zinkel e Prof. António Rendas, Director da Faculdade de Ciências Médicas da Universidade Nova de Lisboa Data: 19 de Abril Horário: 14h30m Título: La fievre aphteuse, son diagnostic clinique et differentiel Orientador: Prof. Jean Marie Gourreau, Lab. D’Études et de Reserches en Pathologie Animale et Zoonoses, Paris. Data: 8 de Maio Horário: 16 horas Título: “Evidence of mitochondrial failure in severe traumatic brain injury: designing a new therapy”. Orientador: Dr. Oscar Luís Alves, Post-doc associate, Division of Neurosurgery, Medical College of Virginia, Richmond, VA, USA. Data: 22 de Maio Horário: 15 horas Título: “Sessão informativa sobre a Propriedade Intelectual como factor competitivo na investigação da Universidade do Porto” Orientador: Dr. António Teixeira, Coordenador do Gabinete de Apoio a Propriedade Industrial da Universidade do Porto Data: 5 de Junho Horário: 15 horas Título: “Nanochips technology” e “Microdissection” Orientador: IPATIMUP/ALFAGENE Data: 12 de Junho Horário: 15h00 Título: “Jornalistas e Cientistas – Uma relação possível ou “Como comunicar a investigação científica” Orientador: Dr. Vasco Ribeiro (Assessor de Comunicação da Universidade do Porto) e Dr. Sandra Sá Couto (Jornalista da RTP – Porto) Data: 25 de Julho Horário: 16 horas Título: Synaptic vs nonsynaptic neurotransmission in the superficial dorsal horn of the spinal cord Orientador: Doutor Alfredo Ribeiro da Silva, McGill University, Montreal, Quebec, Canada Data: 16 de Outubro Horário: 14h30m Título: “Genomics and proteomics in câncer research: Generation next” Orientador: Prof. Simo Schwartz, Centre de Investigaciones en Bioquímica e Biologia Molecular, Barcelona Data: 31 de Outubro Horário: 17 horas Título: O Cancro na fronteira entre o desenvolvimento e evolução. Orientador: Doutor Luís Costa, Professor na Faculdade de Medicina da Beira Interior Data: 5 de Novembro Horário: 17 horas Título: Helicobacter pylory virulence: Genotyping and clinical relevance Orientador: Doutora Céu Figueiredo, Bolseira Pós-doutoramento da FCT (Delft Laboratory, Netherlands e IPATIMUP). Data: 12 de Novembro Horária: 16 horas Título: “Some aspects of carcinogenesis Orientador: Prof. Sir Dillwyn Williams, Strangeways Research Laboratory, University of Cambridge, Cambridge, United Kingdom Data: 18 de Novembro Horário: 16 horas Título: “A investigação científica em Portugal” Orientador: Prof. José Mariano Gago, ex. Ministro da Ciência e da Tecnologia e Coordenador do Laboratório de Instrumentação e Partículas (LIP) Data: 26 de Novembro Horário: 15h30m Título: “Investigação em Saúde: A Clínica e os Números” Orientador: Doutor Manuel Pedro Magalhães, Cirurgião Cardio-Torácico, Director do Hospital da Cruz Vermelha Portuguesa Data: 27 de Novembro Horário: 16 horas Título: “Moving messengers” Orientador: Prof. Carmo Fonseca, Coordenadora do Instituto de Medicina Molecular (IMM) da Faculdade de Medicina de Lisboa 8. WORKSHOPS E CURSOS INTERNACIONAIS 28 de Janeiro a 11 de Fevereiro (2 semanas) Módulo sobre “Ciclo Celular, Necrose e Apoptose” do Curso e Mestrado em Medicina Molecular da F. Medicina do Porto. 18 de Fevereiro a 4 de Março (2 semanas) Módulo sobre “Oncobiologia Molecular” do Curso e Mestrado em Medicina Molecular da F. Medicina do Porto. 11 e 12 de Março SEMINÁRIO “WRITE WINNING GRANTS” Orientador: Prof. Stephen W. Russel Patrocínio: FLAD Organização: Doutor Celso Reis 8 a 12 de Abril (1 semana) Módulo sobre “Técnicas em Biologia Molecular” do Curso e Mestrado em Medicina Molecular da F. Medicina do Porto. 18 e 19 de Abril (2 dias) Seminário de Lâminas de Patologia Veterinária. Organização: Prof.. Fátima Gärtner 22 de Abril a 4 de Maio Módulo sobre “Oncobiologia” do Programa Graduado em Áreas da Biologia Básica e Aplicada (Programa Doutoral GABBA da Universidade do Porto). 14 a 16 de Março V PORTUGALIA GENÉTICA Conferência Internacional sobre “Linhagens Femininas e Masculinas na Ibéria” Organização: Prof. António Amorim 3 e 4 de Maio XI PORTO CANCER MEETING Curso Avançado sobre Carcinoma Gástrico Hereditário – Reunião do International Gastric Cancer Linkage Consortium Organização: Profs Fátima Carneiro e Raquel Seruca 24 a 26 de Maio FOOD SAFETY 2002 Conferência Internacional sobre segurança e higiene alimentar. Contacto: Prof. Ricardo Cabral Módulos sobre “Cancro do Colon e Recto”, “Cancro do Estômago”, “Cancro da Mama”, “Cancro do Pulmão”, “Cancro da Tireóide”, “Doença Inflamatória Intestinal”, “Fibrose Quistica” e “Hepatites víricas e Hepatocarcinogénese” do Curso e Mestrado em Medicina Molecular da Faculdade de Medicina da Universidade do Porto (2 semanas por módulo). 7 e 8 de Outubro VI Conferência do Equinócio Conferência sobre Ciência e Cultura: “O Corpo” Organização: Prof. Rui Mota Cardoso e Doutora Teresa Patrício Gouveia 4 a 9 Novembro (2 semanas) Módulo sobre “Genética Populacional” do Programa GABBA 7 a 9 de Novembro III Workshop Internacional do Cromossoma Y - “Y chromosome database(s): state of the art and future prospects”. Organização: Doutora Leonor Gusmão 9. TRABALHOS PUBLICADOS OU ACEITES PARA PUBLICAÇÃO 9a. Artigos científicos 1. Alves S, Amorim A, Ferreira F, Norton L, Prata MJ. The GSTM1 and GSTT1 genetic polymorphisms and susceptibility to acute lymphoblastic leukaemia in children from North 4.3 Portugal. Leukemia 6:1565-7, 2002 2. Alves S, Amorim A, Prata MJ. Evolution of a VNTR located within the promoter region of the 1.2 thiopurine methyltransferase gene: inferences from population and sequence. American Journal of Primatology 57: 21-9, 2002 3. Alves S, Amorim A, Prata MJ. The evolution of a VNTR located within the promoter region of 3.2 the thiopurine methyltransferase gene: inferences from population and sequence data. Human Genetics 111:172-8, 2002 4. Azevedo L, Calafell F, Vilarinho L, Amorim A. Haplotype analysis and phylogeny of ornithine 2.1 transcarbamylase polymorphisms. Annales of Human Genetics 66: 379-85, 2002 5. Azevedo L, Vilarinho L, Teles EL, Amorim A. Ornithine transcarbamylase deficiency: a novel 2.3 splice site mutation in a family with meiotic recombination and a new useful SNP for diagnosis. Molecular Genetics and Metabolism 76:68-70, 2002 6. Brehm A, Pereira L, Bandelt HJ, Prata MJ, Amorim A. Mitochondrial portrait of the Cabo Verde archipelago: the Senegambian outpost of Atlantic slave trade. Annals Human Genetics 2.1 66:49-60, 2002 7. Carvalho B, Seruca R, Buys CH, Kok K. Novel expressed sequences obtained by means of a 3.5 suppression subtractive hybridisation analysis from the 6q21 region that is frequently deleted in gastric cancer. European Journal of Cancer 38:1126-32, 2002 8. Carvalho R, Kayademir T, Soares P, Canedo P, Sousa S, Oliveira C, Leistenschneider P, 3.9 Seruca R, Gött P, Blin N, Carneiro F, Machado JC. Loss of heterozygosity and promoter methylation, but not mutation, may underlie loss of TFF1 in gastric carcinoma. Laboratory Investigation 82: 1319-1326, 2002. 9. Castro P, Fonseca E, Magalhães J, Sobrinho Simões M. Follicular, papillary and “hybrid” 0.5 carcinomas of the thyroid, Endocrine Pathology 13, 2002 10. Cortizo-Torres ME, Cameselle-Teijeiro JF, Duarte F, Schmitt FC, López-Touza A. Criteria for 0.5 definition of hereditary breast cancer in a clinic perspective. Breast Journal 6: 402-403, 2002. 11. Costa C, Soares R, Reis-Filho JS, Leitão D, Amendoeira I, Schmitt FC. Cyclo-oxygenase 2 1.9 expression is associated with angiogenesis and lymph node metastasis in human breast cancer. Journal of Clinical Pathology 55: 429-434, 2002. 12. Crespo A, Filla MB, Murphy WJ. Low responsiveness to IFN-gamma, after pretreatment of 5.0 mouse macrophages with lipopolysaccharides, develops via diverse regulatory pathways. European Journal of Immunology 32:710-9, 2002 13. Declich P, Tavani E, Bellone S, Porcellati M, Raimondi D, Grassini R, Carneiro F, Bordi C: 1.7 .Sporadic, syndromic, and Zollinger-Ellison syndrome associated fundic gland polyps consistently express cytokeratin 7. Virchows Archiv 441: 96-97, 2002. 14. Duarte F, Cameselle-Teijeiro JF, Soares R, Seixas C, Cortizo-Torres ME, Pérez-Villanueva J, Schmitt FC. Análisis de mutaciones en los genes RCA1 y BRCA2 en pacientes con cáncer de 0.2 mama y ovario del norte de Portugal y Galicia. Revista Clinica Española 202: 259-263, 2002. 15. Duval A, Reperant M, Compoint A, Seruca R, Ranzani GN, Iacopetta B, Hamelin R. Target 8.3 gene mutation profile differs between gastrointestinal and endometrial tumors with mismatch repair deficiency. Cancer Research 62:1609-12, 2002 16. Fernandes AT, Brehm A, Alves C, Gusmão L, Amorim A. Genetic profile of the Madeira 1.0 Archipelago population using the new PowerPlex16 System kit. Forensic Science Internatiomal 125:281-283, 2002 17. Figueiredo C, Machado JC, Pharoah P, Seruca R, Sousa S, Carvalho R, Capelinha AF, Quint 14.2 W, Caldas C, van Doorn LJ, Carneiro F, Sobrinho-Simões M: Helicobacter pylori and interleukin-1 genotyping: An opportunity to identify high-risk individuals for gastric carcinoma?. Journal of National Cancer Institute 94: 1680–1687, 2002. 18. Filho JS, Soares MF, Wal R, Christmann RB, Liu CB, Schmitt FC. Fine-needle aspiration 1.0 cytology of pulmonary rheumatoid nodule: case report and review of the major cytologic features. Diagnostic Cytopathology 26:150-3, 2002 19. Gama A, Paredes J, Milanezi MF, Reis-Filho JS, Gartner F, Schmitt FC. P-cadherin 2.5 expression in canine lactating mammary gland. Journal of Cellular Biochemistry 86: 420421, 2002. 20. Gartner F, Santos M, Gillete D, Schmitt FC. Inflammatory pseudotumour of the spleen in a 1.1 dog. Veterinary Record 150: 697-698, 2002. 21. Granja NM, Soares R, Rocha S, Paredes J, Longatto-Filho A, Alves VA, Wiley E, Schmitt FC, 1.0 Bedrossian C. Evaluation of breast cancer metastases in pleural effusions by molecular biology techniques. Diagnostic Cytopathology 27: 210-213, 2002. 22. Gusmão L, Alves C, Beleza S, Amorim A.Forensic evaluation and population data on the new 1.1 Y-STRs DYS434, DYS437, DYS438, DYS439 and GATA A10. International Journal of Legal Medicine 116:139-147, 2002 23. Gusmão L, Alves C, Costa S, Amorim A, Brion M, González-Neira A, Carracedo A. Point 1.1 mutations in the flanking regions of the Y-chromosome specific STRs DYS391, DYS437 and DYS438. International Journal of Legal Medicine 116:322-326, 2002 24. Gusmão L, González-Neira A, Alves C, Lareu M, Costa S, Amorim A, Carracedo A. 1.0 Chimpanzee homologous of human Y specific STRs. A comparative study and a proposal for nomenclature. Forensic Science International 126:129-136, 2002 25. Gusmão L, González-Neira A, Alves C, Sánchez-Diz P, Dauber EM, Amorim A, Carracedo A. 1.2 Genetic diversity of Y specific STRs in Chimpanzees (Pan troglodytes). American Journal of Primatology 57::21-29, 2002 26. Ivanova R, Soares P, Castro P, Sobrinho-Simões M. Diffuse (or multinodular) follicular variant 1.7 of papillary thyroid carcinoma: a clinicopathologic and immunohistochemical analysis of 10 cases of an aggressive form of differentiated thyroid carcinoma. Virchows Archiv 440:418424, 2002. 27. Kosmahl M, Egawa N, Schröder S, Carneiro F, Lüttges J, Klöppel G: Mucinous nonneoplastic 3.2 cyst of the pancreas: a novel nonneoplastic cystic change? Modern Pathology 15: 154-158, 2002. 28. Lesueur F, Corbex M, McKay J, Lima J, Soares P, Griseri P, Burgess J, Ceccherini I, Landolfi 5.1 S, Papotti M, Amorim A, Goldga D, Romeo G. Specific haplotypes of the RET proto-oncogene are over-represented in patients with sporadic papillary thyroid carcinoma. Journal of Medical Genetics 39:260-265, 2002 29. Lima J, Máximo M, Sobrinho-Simões S. Phenotype versus genotype in thyroid tumours. 2.8 Histopathology 41 (Suppl.2):184-187, 2002 30. Lopes JM, Nesland JM, Reis-Filho JS, Holm R. Differential Ki67 and bcl-2 immunoexpression 2.8 in solid-glandular and spindle cell components of biphasic synovial sarcoma: a double immunostaining assessment with cytokeratin and vimentin. Histopathology 40:464-71, 2002 31. Magro F, Correia M, Moreira G, Dinis-Ribeiro M, Amandio V, Carneiro F, Ribeiro T: Adenocarcinoma of the cecum as the first manifestation of ulcerative colitis complicated by primary sclerosing cholangitis and endomyocardial fibrosis. Inflammatory Bowel Disease 8: 287-290, 2002. 32. Martins S, Trigo F, Azevedo L, Silva MJ, Guimaraes JE, Amorim A. Haplotype study of 4.3 microsatellites flanking the t(15;17) breakpoint in acute promyelocytic leukemia patients from North Portugal.Leukemia. 16:1353-7, 2002 33. Máximo V, Soares P, Lima J, Cameselle-Teijeiro J, Sobrinho-Simões M. Mitochondrial DNA 7.1 somatic mutations (point mutations and large deletions) and mitochondrial DNA variants in human thyroid pathology. A study with emphasis on Hürthle cell tumors. American Journal of Pathology 160:1857-1865, 2002 34. Nabais S, Machado JC, Lopes C, Seruca R, Carneiro F, Sobrinho-Simões M: Different patterns of β-catenin expression in gastric carcinomas: relationship with clinicopathological 2.8 parameters and prognostic outcome (Letter-to-the Editor). Histopathology 41: 368-369, 2002. 35. Oliveira C, Bordin MC, Grehan N, Huntsman D, Suriano G, Machado JC, Kiviluoto T, Aaltonen 6.1 L, Jackson CE, Seruca R, Caldas C. Screening E-cadherin in gastric cancer families reveals germline mutations only in hereditary diffuse gastric cancer kindred. Human Mutation 19:510-517, 2002 36. Paredes J, Milanezi F, Viegas L, Amendoeira I, Schmitt FC. P-cadherin expression is 1.7 associated with high-grade ductal carcinoma in situ of the breast. Virchows Archiv 440: 1621, 2002. 37. Paredes J, Milanezi F, Reis-Filho JS, Leitão D, Athanazio D, Schmitt F. Aberrant P-cadherin 1.1 expression: is it associated with estrogen-independent growth in breast cancer? Pathology Research and Practice 198: 795-802, 2002 38. Paredes JC, Milanezi MF, Reis-Filho JS, Leitão DR, Athanazio DA, Schmitt FC. Correlação entre as expressões de P-caderina e de receptores de estrógeno no câncer da mama. Jornal Brasileiro de Patologia 38:307-313, 2002. 39. Pereira EM, Maeda SA, Reis-Filho JS. Sarcomatoid variant of anaplastic large cell lymphoma 2.1 mimicking a primary breast cancer: a challenging diagnosis. Archives of Pathology Laboratory Medicine 126: 723-726, 2002. 40. Pereira L, Gusmão L, Alves C, Amorim A, Prata MJ. Bantu and European Y-lineages in Sub2.1 Saharan Africa. Annals of Human Genetics 66:369-378, 2002 41. Pereira L, Prata MJ, Amorim A, Mismatch distribution analysis of Y-STR haplotypes as a tool for the evaluation of identity-by-state proportions and significance of matches-the European 1.0 picture. Forensic Science International 130: 147-155, 2002 42. Pinto-de-Sousa J, David L, Reis CA, Gomes R, Silva L, Pimenta A . Mucins MUC1, MUC2, MUC5AC and MUC6 expression in the evaluation of differentiation and clinico-biological 1.7 behaviour of gastric carcinoma. Virchows Archiv 440: 304-10, 2002 43. Pinto-de-Sousa J., David L., Almeida R., Leitão D., Preto J. R., Seixas M., Pimenta A. c-erb B-2 Expression is associated with tumor location and venous invasion and influences survival 0.5 of patients with gastric carcinoma. International Journal of Surgical Pathology 10: 247256, 2002 44. Preto A, Reis-Filho J, Ricardo S, Soares P. P63 expression in papillary and anaplastic 1.1 carcinomas of the thyroid gland: Lack of an oncogenetic role in tumorigenesis and progression. Pathology, Research and Practice 198: 449-454, 2002 45. Reis-Filho JS, Albergaria A, Milanezi F, Amendoeira I, Schmitt FC. Naked nuclei revisited: p63 1.0 immunoexpression. Diagnostic Cytopathology 27: 135-138, 2002. 46. Reis-Filho JS, Figueiredo TM, Schmitt FC. Multicystic ovarian tumor in a 46-year-old female 1.2 patient. Archives Pathology Laboratory and Medicine 126: 871-872, 2002. 47. Reis-Filho JS, Milanezi F, Soares MF, Fillus Neto J, Schmitt FC. Intradermal spindle 1.0 cell/pleomorphic lipoma of the vulva: case report and review of the literature. Journal of Cutaneous Pathology 29: 59-62, 2002. 48. Reis-Filho JS, Milanezi F, Amendoeira I, Albergaria A, Schmitt FC. P63 staining of 1.9 myoepithelial cells in breast fine needle aspirates: a study of its role in differentitating in situ from invasive ductal carcinomas of the breast. Journal of Clinical Pathology 55: 936-939, 2002. 49. Reis-Filho JS, Milanezi F, Ferro J, Schmitt FC. Pediatric pigmented dermatofibrosarcoma 1.1 protuberans (Bednar tumor): case report and review of the literature with emphasis on the differential diagnosis. Pathology Research and Practice 198: 621-625, 2002. 50. Reis-Filho JS, Milanezi F, Schmitt FC. Maspin is expressed in the nuclei of breast 5.1 myoepithelial cells. Journal of Pathology 197: 272-274, 2002. 51. Reis-Filho JS, Milanezi F, Soares MF, Fillus-Neto J, Schmitt FC. Intradermal spindle 1.0 cell/pleomorphic lipoma of the vulva: case report and review of the literature. Journal Cutaneous Pathology 29: 59-62, 2002 52. Reis-Filho JS, Paiva ME, Lopes JM. Congenital composite hemangioendothelioma: case 1.0 report and reappraisal of the hemangioendothelioma spectrum. Journal Cutaneous Pathology 29:226-231, 2002 53. Reis-Filho JS, Paiva ME, Lopes JM. Pathologic quis case 36-year-old female with muscle pain 2.1 and weakness. Archives of Pathology Laboratory Medicine 126:1245-1246. 2002 54. Reis-Filho JS, Paredes J, Milanezi F, Schmitt FC. Clinicopathologic implications of E-cadherin 3.9 reactivity in patients with lobular carcinoma in situ of the breast. Cancer 94: 2114-2116, 2002. 55. Reis-Filho JS, Pope LZB, Balderrama CMSR, Fillus-Neto J, Schmitt FC. Epithelioid malignant 0.6 peripheral nerve sheath tumour: case report and review of the previously published cases. Cytopathology 13: 54-63, 2002 56. Reis-Filho JS, Pope LZB, Milanezi F, Balderrama CMSR, Serapião MJ, Schmitt FC. Primary 1.0 epithelial malignant mesothelioma of the pericardium with deciduoid features: cythistologic and immunohistochemical study. Diagnostic Cytopathology 26: 117-122, 2002. 57. Reis-Filho JS, Schmitt FC, Soares MF, Figueiredo TMS, Fillus-Neto J. Fine needle aspiration 1.0 cytology of paratesticular rhabdomyosarcoma mimicking a testicular germ cell tumor. Acta Cytologica 46: 787-789, 2002. 58. Reis-Filho JS, Schmitt FC. Taking advantage of basic research: p63 is a reliable myoepithelial 1.8 and stem cell marker. Advances in Anatomic Pathology 9: 280-289, 2002. 59. Reis-Filho JS, Silva P, Milanezi F, Lopes JM. Hyaline cell-rich chondroid syringoma: case 1.1 report and review of the literature. Pathology Research and Practice 198: 755-64, 2002 60. Reis-Filho JS, Soares MF, Wal R, Christmann RB, Liu CB, Schmitt FC. Fine-needle aspiration 1.0 cytology of pulmonary rheumatoid nodule: case report and review of the major cytologic features. Diagnostic Cytopathology 26: 150-153, 2002. 61. Reis-Filho JS, Soares R, Schmitt FC. Angiogenesis in lymph node metastases. 2.8 Histopathology 40: 103-107, 2002. 62. Reis-Filho JS, Souto-Moura C, Lopes JM. Classic Kaposi's sarcoma of the tongue: case 0.8 report with emphasis on the differential diagnosis. Journal of Oral Maxillofacial Surgical 60:951-4, 2002 63. Reis-Filho JS, Torio B, Albergaria A, Schmitt FC. Maspin expression in normal skin and usual 1.7 cutaneous carcinomas. Virchows Archiv 441:551-8, 2002 64. Reis-Filho JS, Torio B, Albergaria A, Schmitt FC. P63 expression in normal skin and usual 1.0 cutaneous carcinomas. Journal Cutaneous Pathology 29: 517-523, 2002. 65. Reis-Filho JS. p63 expression in sarcomatoid/metaplastic carcinomas of the breast. 2.8 Histopathology 42:94-5, 2002 66. Rocha AS, Soares P, Machado JC, Máximo V, Fonseca E, Sobrinho-Simões M. 1.0 Mucoepidermoid carcinoma of the thyroid: a tumour histotype characterised by P-cadherin neoexpression and marked abnormalities of E-cadherin/catenin complex. Virchows Archiv 440:498-504, 2002 67. Sampaio P, Gusmão L, Alves C, Pina-Vaz C, Amorim A, Pais C. A highly polymorphic 4.0 microsatellite for the identification of Candida albicans strains. Journal of Clinical Microbiology 41:552-557, 2002 68. Schmitt FC, Reis-Filho JS. Oncogenes, granules and breast cancer: what has c-myc to do 0.5 with apocrine changes? Breast 11: 463-465, 2002. 69. Schwientek T, Bennett EP, Flores C, Thacker J, Hollmann M, Reis CA, Behrens J, Mandel U, Keck B, Schafer MA, Haselmann K, Zubarev R, Roepstorff P, Burchell JM, TaylorPapadimitriou J, Hollingsworth MA, Clausen H. Functional conservation of subfamilies of 7.3 putative UDP-N-acetylgalactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferases in Drosophila, Caenorhabditis elegans, and mammals. One subfamily composed of l(2)35Aa is essential in Drosophila. Journal of Biological Chemistry 277: 22623-22638, 2002 70. Seixas S, Ferrand N, Rocha J. Microsatellite variation and evolution of the human duffy blood group polymorphism. Molecular Biology and Evolution 19:1802-1806, 2002 5.4 71. Seixas S, Mendonca C, Costa F, Rocha J. alpha1-Antitrypsin null alleles: evidence for the recurrence of the L353fsX376 mutation and a novel G-->A transition in position +1 of intron 2.4 IC affecting normal mRNA splicing. Clinical Genetics 62:175-180, 2002 72. Silva E, Teixeira A, David L, Carneiro F, Reis CA, Sobrinho-Simões J, Serpa J, Veerman E, Bolscher J, Sobrinho-Simões M: Mucins as key molecules for the classification of intestinal 1.7 metaplasia of the stomach. Virchows Archiv 440: 311-317, 2002. 73. Simpson RHW, Reis-Filho JS, Pereira EM, Ribeiro AC, Abdulkadir A. Polymorphous low grade adenocarcinoma of the salivary glands with transformation to high grade carcinoma. 2.8 Histopathology 41: 250-259, 2002 74. Soares R, Reis-Filho JS, Gartner F, Schmitt FC, Arispa LI, Graubert MD. Vascular endothelial 7.1 growth factor, transforming growth factor- , and estrogen receptors: possible cross-talks and interactions. American Journal of Pathology 160: 381-383, 2002. 75. Sobrinho-Simões M. Different diagnosis of thyroid tumours (letter-to-the-editor). Endocrine 0.5 Pathology 13, 2002 76. Sobrinho-Simoes M, Oliveira C. Different types of epithelial cadherin alterations play different roles in human carcinogenesis. Advances in Anatomic Patholology 9:329-37, 2002 1.8 77. Sobrinho-Simoes M, Sambade C, Fonseca E, Soares P. Poorly differentiated carcinomas of the thyroid gland: a review of the clinicopathologic features of a series of 28 cases of a 0.5 heterogeneous, clinically aggressive group of thyroid tumors. International Journal of Surgical Pathology 10:123-31, 2002 78. Suraweera N, Duval A, Reperant M, Vaury C, Furlan D, Leroy K, Seruca R, Iacopetta B, Hamelin R. Evaluation of tumor microsatellite instability using five quasimonomorphic 13.0 mononucleotide repeats and pentaplex PCR.Gastroenterology. 123:1804-1811, 2002 79. Teixeira A, David L, Reis CA, Costa J, Sobrinho-Simoes M.Expression of mucins (MUC1, MUC2, MUC5AC, and MUC6) and type 1 Lewis antigens in cases with and without 5.1 Helicobacter pylori colonization in metaplastic glands of the human stomach. Journal of Pathology 197:37-43, 2002 80. Teixeira-da-Costa L. Modeling of Genetic Instability: Looking for “Newton’s Binomial” of Colon Cancer. Cancer Biology & Therapy 1:6, 693-695, 2002 81. Tomas G, Seco L, Seixas S, Faustino P, Lavinha J, Rocha J. The peopling of Sao Tome (Gulf of Guinea): origins of slave settlers and admixture with the Portuguese. Human Biology 1.7 74:397-411, 2002 82. Beleza S, Alves C, González-Neira A, Lareu M, Amorim A, Carracedo A, Gusmão L. 1.1 Extending STR markers in Y chromosome haplotypes. International Journal of Legal Medicine (em publicação). 83. Brennetot C, Pinto M , Oliveira C, Schwartz Jr S, Seruca R, Duval A, Hamelin R. Frequent Ki13.0 ras mutations in gastric tumors of the MSI phenotype. Gastroenterology (em publicação). 84. Carneiro F, Machado JC, Nabais S, Santos CM, Sobrinho-Simões M: Mixed carcinoma of the 2.8 stomach: a clinicopathological entity. Histopathology (em publicação). 85. Carvalho A, Carmena M, Sambade C, Earnshaw WC, Wheatley SP. Survivin is required for stable checkpoint activation in response to loss of spindle tension in HeLa cells. Journal of Cell Biology (em publicação) 12.9 86. Carvalho B, Pinto M, Cirnes L , Oliveira C, Machado JC, Suriano G, Hamelin R, Carneiro F, 3.5 Seruca R. Concurrent hypermethylation of gene promoters is associated with MSI-H phenotype and diploidy in gastric carcinomas. European Journal of Cancer (em publicação). 87. Cruz J, Reis Filho JS, Lopes JM. Cutaneous malignant melanoma: the great pretender. 0.5 International Journal of Surgical Pathology (em publicação) 88. Cruz J, Reis Filho JS, Lopes JM. Primary cutaneous malignant melanoma with lipoblast-like 2.1 cells. Archives of Patholology and Laboratory Medicine (em publicação) 89. Cruz J, Reis Filho JS, Silva P, Lopes JM. Expression of c-met tyrosine-kinase receptor is 3.0 biologically and prognostically relevant for primary cutaneous malignant melanomas. Oncology (em publicação) 90. Guerra A, Rego C, Castro EMB, Seixas S, Rocha J. Association between apolipoprotein 1.0 phenotype and lipid profile and adiposity in Portuguese children. Annals of Nutrition and Metabolism (em publicação) 91. Lima J, Máximo V, Soares P, Sobrinho-Simões M. Alterations of the SDHD gene locus in midgut carcinoids, Merkel cell carcinoma, pheochromocytomas and abdominal 4.4 paragangliomas. (Letter-to-the-editor). Genes, Chromosomes & Cancer (em publicação) 92. Nabais S, Machado JC, Lopes C, Seruca R, Carneiro F, Sobrinho-Simões M: Patterns of β0.5 catenin expression in gastric carcinoma: clinicopathological relevance and mutation analysis. International Journal of Surgical Pathology (em publicação). 93. Parra FC Amado R, Lambertucci JR Rocha J, Antunes CM Pena SDJ . Color and genomic 10.9 ancestry in Brazilians. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (em publicação) 94. Pinto M, Oliveira C, Cirnes L, Machado JC, Ramires M, Nogueira A, Carneiro F, Seruca R: 5.1 Promoter methylation of TGFbeta receptor I and mutation of TGFbeta receptor II are frequent events in MSI sporadic gastric carcinomas. Journal of Pathology (em publicação). 95. Pinto M, Wu Y, Suriano G, Mensink R, Duval A, Oliveira C, Carvalho B, Hamelin R, Seruca R, 1.5 Hofstra R. MBD4 mutations are rare in sporadic MSI gastric carcinomas.Cancer Genetics and Cytogenetics (em publicação) 96. Reis-Filho JS, Paiva ME, Lopes JM. 47-year-old-woman with a 7-year-history of osteomalacia 8.6 and hypophosphatemia [case of the month]. Brain Pathology (em publicação) 97. Rocha AS, Soares P, Fonseca E, Cameselle-Teijeiro JM, Sobrinho-Simões M. E-cadherin 2.8 loss rather than β-catenin alterations is a common feature of poorly differentiated thyroid carcinomas. Histopathology (em publicação) Livros e Capítulos de Livros Amorim A. “A Espécie das Origens. Gradiva. Lisboa, 2002 Amorim A. Linhagens mitocondriais e do cromossomo Y em Portugal. In PENA SJ (org.) Homo brasilis. Aspectos genéticos, lingüisticos, históricos e socioantropológicos da formação do povo brasileiro. FUNPEC Editora, Ribeirão Preto, 2002 Alves C, Gusmão L, Pereira L, Amorim A. Multiplex STR genotyping: comparison study, population data and new sequence information. Progess in Forensic Genetics 9 (em publicação). Beleza S, Gusmão L, Gonzaléz-Neira A, Carracedo A, Amorim A. Optimization of Y-STR multiplexing combining established and newly described loci. Progess in Forensic Genetics 9 (em publicação). Berardi G, Toscanini U, Haas E, Gusmão L, Raimondi E. Y Chromosome haplotypes for 9 STRs in Tobas, Amerindians from North of Argentina. Progess in Forensic Genetics 9 (em publicação). Fernandes AT, Gusmão L, Pereira L, Brehm A, Prata MJ, Amorim A. Y-Chromosome haplotypes in Madeira archipelago population. Progess in Forensic Genetics 9 (em publicação). Gonzaléz-Neira A, Sánchez-Diz P, Gusmão L, Lareu L, Carracedo A. Sequence structure of 12 novel Y chromosome microsatellites and PCR amplification strategies. Progess in Forensic Genetics 9 (em publicação). Gusmão L, Carracedo A. Y chromosome specific STRs. Profiles in DNA (em publicação) Gusmão L, Gonzaléz-Neira A, Alves C, Amorim A, Carracedo A. Y chromosome Short Tandem Repeat polymorphisms: A comparison between humans and chimpanzees. Progess in Forensic Genetics 9 (em publicação). Gusmão L, Alves C, Beleza S, Amorim A. Y-Chromosome STR defined haplotypes in North Portugal. Progess in Forensic Genetics 9 (em publicação). Sobrinho Simões M. Sections on Follicular Carcinoma, Poorly Differentiated Carcinoma, Mucinous Carcinoma e Solitary Fibrous Tumour do livro Pathology & Genetics – Endocrine Tumours da série World Health of Organization Classification of Tumours (em publicação)
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