relat act 2000

RELATÓRIO DE ACTIVIDADES
DO C.I.B.O./I.P.A.T.I.M.U.P.
2000
1
ÍNDICE
1.
2.
INTRODUÇÃO
RESUMO DOS OBJECTIVOS PROPOSTOS PARA 2000
E RESPECTIVOS RESULTADOS
PÁG.
2
4
3.
INVESTIGAÇÃO
3a. Produção científica
3b. Participação em Conselho Editoriais
3c. Prémios
3d. Projectos de investigação em curso (ou concluídos) em 2000
4.
FORMAÇÃO APÓS-A-GRADUAÇÃO
4a. Teses de Doutoramento
4b. Programas de Pós-Graduação e Iniciação Científica
4c. Estágios
9
9
11
11
5.
EDUCAÇÃO CONTÍNUA E DIFUSÃO CIENTÍFICA
12
6.
SERVIÇO À COMUNIDADE
14
7.
SEMINÁRIOS CIENTÍFICOS
20
8.
WORKSHOPS E CURSOS INTERNACIONAIS
23
9.
TRABALHOS PUBLICADOS OU ACEITES PARA PUBLICAÇÃO
9a. Artigos científicos
9b. Capítulos de livros
25
25
31
ANEXO
a) Protocolo FCT – IPATIMUP (Laboratório Associado do MCT)
b) Relatório da 1ª Reunião Anual do Programa GABBA
6
6
7
7
33
2
INTRODUÇÃO
O ano de 2000 foi, sem que tal reflicta necessariamente o simbolismo da data, um ano de transição.
Felizmente uma transição com manutenção da qualidade da investigação científica, da formação científica
e da prestação de serviços à comunidade.
A transição notou-se sobretudo no domínio institucional:
a) O CIBO/IPATIMUP, classificado pelo Painel Internacional de Avaliação como Excelente, passou,
em Dezembro, a ser um dos quatro Laboratórios Associados do Ministério da Ciência e da
Tecnologia.
b) As Faculdades de Medicina, Ciências, Medicina Dentária e Ciências da Nutrição e Alimentação da
Universidade do Porto, o ICBAS e o Hospital de S. João passaram a acompanhar o IPO no grupo dos
Associados Aderentes do IPATIMUP reforçando deste modo a sua integração institucional.
c) O IPATIMUP passou a Associado da Associação do Museu dos Transportes e Comunicações
aumentando assim substancialmente a sua interface no domínio da Divulgação Científica.
Dando continuidade à prática inaugurada no Relatório de 1997 salientam-se, seguidamente, alguns
“indicadores-de-desempenho” relativos ao ano 2000:
a) Publicação (ou aceitação para publicação) de 96 artigos científicos, 66 dos quais em revistas com
factor de impacto superior a 1, 26 em revistas com factor de impacto superior a 3 e 7 em revistas
com factor de impacto superior a 6
b) Co-autoria dos seguintes capítulos de livros publicados (ou enviados para publicação) em 2000:
COMPREHENSIVE TUMOUR TERMINOLOGY da União Internacional Contra o Cancro,
PATHOLOGY & GENETICS OF TUMOURS OF THE DIGESTIVE SYSTEM da Organização
Mundial de Saúde e da União Internacional Contra o Cancro e PATHOLOGY REPORTING OF
HUMAN NEOPLASMS da Associação dos Directores de Anatomia Patológica e Patologia Cirúrgica
(EUA).
c) Realização de cinco doutoramentos, um em Medicina e quatro em Biologia Humana, com teses de
qualidade internacional e provas argumentadas por cientistas estrangeiros.
d) Participação na revisão de artigos científicos submetidos a mais de duas dezenas de revistas
internacionais de Patologia, Oncologia, Oncobiologia, Genética Humana e Genética Populacional.
(Os investigadores do CIBO/IPATIMUP integram, nesta altura, o Editorial Board de 14 dessas
revistas).
e) Participação activa na coordenação e realização da 3ª edição do Programa Graduado em Áreas de
Biologia Básica e Aplicada da Universidade do Porto (Programa GABBA) e colaboração na
organização da 1ª Reunião Anual do Programa.
f) Realização do 2º ano do Programa de Pós-Graduação em Anatomia Patológica (Internato Médico)
para 8 internos da especialidade em colaboração com a Faculdade de Medicina do Porto e com o
Serviço de Anatomia Patológica do Hospital de S. João, e realização do 1º ano do Programa de
Iniciação à Investigação Científica em Biomedicina para 12 alunos de Medicina e Medicina Dentária.
g) Apoio à formação de 14 médicos estagiários brasileiros e europeus (Espanha e País de Gales) em
programas de pós-doutoramento, doutoramento ou aperfeiçoamento profissional.
h) Consultadoria diagnóstica para instituições da Alemanha, Bélgica, Brasil, EUA, Espanha, França,
Grécia, Holanda, Inglaterra, Itália, Moçambique, Rússia, Suíça e Turquia, e participação no núcleo
fundador do TELEPATHOLOGY CONSULTATION CENTER da União Internacional contra o
Cancro sediado na Humboldt University (Berlim).
i) Organização de 24 Seminários Científicos orientados por especialistas convidados e organização de
três Reuniões Internacionais de média/grande dimensão para além das habituais reuniões anuais do
IPATIMUP (III Portugalia Genetica, IX Porto Cancer Meeting e IV Conferência do Equinócio).
j) Entre os prémios ganhos em 2000 por investigadores do IPATIMUP salientou-se, pela sua
singularidade, o Prémio de Jovem Investigador – 2000 atribuído ao Doutor José Carlos Machado pela
Associação Europeia de Prevenção do Cancro.
k) Desempenho de funções nas seguintes instituições internacionais: Sociedade Europeia de Patologia
(Presidência), Escola Europeia de Patologia, Curso Europeu de Patologia Celular, Associação
Europeia de Prevenção do Cancro, Clubes Europeus de Patologia Gastrointestinal, Patologia
Endócrina e Citopatologia (Presidência), Sociedade Internacional de Citopatologia, Associação dos
Directores de Anatomia Patológica e Patologia Cirúrgica (EUA).
3
A assinalar a formalização da passagem do CIBO/IPATIMUP a Laboratório Associado do Ministério da
Ciência e da Tecnologia o Instituto recebeu, no dia 23 de Novembro, a visita do Senhor Presidente da
República, Dr. Jorge Sampaio, e do Senhor Ministro da Ciência e Tecnologia, Prof. José Mariano Gago.
Durante o ano 2000 continuámos a receber sempre que o solicitámos, apoio dos vários organismos
dependentes do Ministério da Ciência e Tecnologia (FCT, OCT e ICCTI), da Universidade do Porto, da
Faculdade de Medicina do Porto, dos Associados do IPATIMUP e da Fundação Calouste Gulbenkian.
Cumpre também agradecer a preciosa ajuda que nos deram, em vários domínios, os membros do
Conselho Científico e Técnico.
Um último ponto para referir uma mudança de “política editorial” em relação às duas Unidades Externas
do IPATIMUP. Uma vez que tanto a Unidade de Patobiologia (IPO-Porto – Responsável: Prof. Carlos
Lopes) como a de Microbiologia (H.S.João – Responsável: Prof. Aguiar Nogueira) tiveram nos últimos
anos um desenvolvimento muito apreciável e conseguiram uma notável autonomia decidimos que não
seria justo continuar a contabilizar em nome do IPATIMUP os “feitos” dessas Unidades no que diz
respeito a realizações científicas (eventos, publicações, etc.). Interromperemos assim a partir deste ano a
referida contabilização sem que tal signifique como é óbvio qualquer intenção de diminuir a colaboração
quer com os investigadores dessas unidades quer com as respectivas instituições (O IPO-Porto e o
Hospital de S. João são aliás Associados Aderentes do IPATIMUP e têm contribuido de forma
substancial para o sucesso do Instituto).
4
1. RESUMO DOS OBJECTIVOS PROPOSTOS PARA 2000 E RESPECTIVOS RESULTADOS
Tal como nos relatórios anteriores iniciamos o presente Relatório com uma comparação sumária do que
afirmámos serem os nossos Objectivos no Plano de Actividades para 2000 e aquilo que conseguimos, de
facto, realizar.
1. Preparar o Edifício e os Jardins para as perturbações que a construção da linha do Metro e da
respectiva Estação nas imediações do CIBO/IPATIMUP irá causar
Das acções previstas neste 1º objectivo foram realizadas as que dizem respeito à manutenção do edifício e
dos jardins – o que não impediu que a água das chuvas invernais tenha voltado a penetrar em parte do
edifício – e à identificação de todas as espécies arbóreas com placas desenhadas pelo Dr. João Honrado
da F.Ciências da U. Porto.
Já depois de iniciada a construção da vedação na fronteira oeste do terreno interrompemos esta actividade
por um excelente motivo: o MCT informou-nos que iríamos poder ampliar o edifício do Instituto –
retomando o projecto inicial de construção de um U – o que implicará a instalação dos estaleiros-dasobras na referida fronteira do edifício.
A chegada do Metro parece ainda longínqua ...
2. Consolidar o modelo de gestão e contabilidade do CIBO/IPATIMUP
Objectivo atingido excepto no que se refere à capacidade produzir, já este ano, um orçamento consistente
e solidamente fundamentado. Continuaremos entretanto o exercício de controlo orçamental limitado que
havíamos iniciado o ano passado (ver anexo no Plano de Actividades para 2001).
3. Continuar a inflexão da investigação no sentido da investigação-de-translacção com reforço das
componentes clínica e de saúde pública.
Este objectivo foi plenamente atingido conforme se pode ver através da análise da lista de publicações
(pág. 25 e seguintes) e do sucesso de quatro projectos de investigação de natureza epidemiológica:
Patologia gástrica associada à infecção por H.pylori em trabalhadores dos Estaleiros Navais de Viana do
Castelo (ARS – Norte, Empresa dos ENVC, Hospital S. João e IPATIMUP), Carcinogénese gástrica em
populações de Portugal, Colombia e E.U.A. (FLAD, New Orleans University e IPATIMUP),
Optimização do tratamento do bócio (Fundação Calouste Gulbenkian, Hospital de S. João e IPATIMUP)
e International Gastric Cancer Linkage Consortium (diversas instituições europeias e norte-americanas
sob a égide de um Steering Committee presidido pelo Prof. Carlos Caldas).
4. Manter (e melhorar em certos aspectos) o nível alcançado na Pós-Graduação e Especialização
Profissional.
Os objectivos identificados neste ponto foram atingidos.
4a. A 3ª edição do Programa GABBA correu muitíssimo bem e a 4ª edição iniciou-se em Novembro de
2000 sob a coordenação dos Profs Castro Lopes (F.M.Porto) e Fátima Carneiro
(F.M.Porto/IPATIMUP) e está a ter um desenvolvimento excelente. Foi também possível realizar, em
22 e 23 de Dezembro, num Hotel do Porto e em regime de dedicação exclusiva, a 1ª Reunião Anual
do Programa GABBA (ver anexo b).
Doutoraram-se 4 bolseiros do CIBO/IPATIMUP e 1 médica da F.Medicina/H.S.João (Havíamos
previsto o doutoramento de 4 ou 5 bolseiros e de 1 ou 2 médicos).
4b-f. Objectivos totalmente alcançados com distinção, aliás, no que diz respeito aos Programas de Pósgraduação e de Iniciação Científica. O IPATIMUP e os seus investigadores colaboraram, em 2000,
activamente, com a Escola Superior de Técnicos de Saúde do Porto (ESTES), com a Escola de
Ciências da Saúde da Universidade do Minho e com a futura Escola de Ciências da Saúde da
Universidade de Aveiro.
5. Manter as actividades da Unidade de Educação Contínua e Difusão Científica.
A Unidade de Educação Contínua e Difusão Científica continuou, em 2000, a colaborar em diversos
Projectos de Ensino Experimental das Ciências envolvendo muitos professores e algumas centenas de
alunos de 12 escolas do ensino básico e secundário sobretudo, mas não exclusivamente, da área
metropolitana do Porto (O IPATIMUP está geminado, por exemplo, com a Escola EB1 de Rio de
Moinhos nas margens do rio Sado). No fim do ano o IPATIMUP passou a ser Associado da Associação
5
do Museu dos Transportes e Comunicações e assinou com o Museu um protocolo de colaboração no
domínio da qualificação de recursos humanos e do apoio à divulgação científica.
6. Manter e, se possível, reforçar, as actividades da Unidade de Prestação de Serviços
Este objectivo foi inteiramente alcançado – ou mesmo ultrapassado – conforme se poderá verificar
através da leitura do Relatório da Unidade de Prestação de Serviços (UPS) (pág.14 e seguintes).
7. Manter o nível alcançado na organização de eventos científicos de interesse institucional ou
nacional
Todos os eventos científicos programados para 2000 - as 3 reuniões anuais tradicionais do IPATIMUP e
as 3 reuniões internacionais extraordinárias – foram realizados de acordo com o previsto e, passe a
imodéstia, com enorme sucesso (pág. 25 e seguintes).
8. Evoluir para Laboratório Associado do Ministério da Ciência e da Tecnologia
Este objectivo foi alcançado em 23 de Novembro de 2000, data em que se formalizou a assinatura do
contrato-programa entre o MCT e o IPATIMUP (ver anexo a) . De acordo com o referido contratoprograma o IPATIMUP propõe-se, enquanto Laboratório Associado do MCT e sem descurar as suas
actividades-chave (investigação, formação avançada e divulgação científica), “responder a necessidades
de interesse público” em duas linhas de orientação – “prevenção e diagnóstico precoce do cancro do
estômago” e “melhoria da qualidade do diagnóstico das doenças malignas e pre-malignas” – tendo em
conta as seguintes características da instituição:
a) Ênfase na investigação de translação centrada em problemas de patologia humana em geral e da
patologia oncológica em particular (ligação da investigação básica às aplicações práticas).
b) Larguíssima experiência de ligação a instituições do Estado com funções de prestação de serviços
(hospitais, institutos de oncologia, etc.).
c) Aposta na melhoria do diagnóstico e no esclarecimento mais preciso da etiopatogenia das doenças
cancerosas e precancerosas valorizando o papel das interacções genético-ambientais (com incidência
particular na patologia do estômago).
d) Concentração excepcional de recursos humanos e logísticos nas áreas da oncobiologia, patologia
oncológica, genética populacional e toxicologia, permitindo uma aproximação multidisciplinar à
problemática do cancro.
e) Adequação da organização interna da instituição, com autonomia financeira da Unidade de Prestação
de Serviços e uma Unidade de Divulgação Científica com larga tradição de integração e ligação à
sociedade, da ciência que se faz no IPATIMUP.
f) Larga prática de controlo de qualidade, recurso sistemático a avaliações externas independentes e
ênfase na prestação de contas (história de “accountability”).
9. Ampliação das instalações
Este objectivo parece poderá ser alcançado em breve já que o MCT acedeu apoiar o Instituto na
candidatura aos fundos para a ampliação do edifício do CIBO/IPATIMUP e aprovou o Estudo Prévio
elaborado pelo arquitecto Sérgio Losa. O Estudo-Prévio foi também já aprovado pelo Reitor da
Universidade do Porto, a Câmara Municipal do Porto e o arquitecto Rui Mealha, responsável pelo plano
de edificações e arranjo urbanístico no Polo 2 da Universidade do Porto. O ante-projecto para a ampliação
das instalações está actualmente a ser elaborado.
6
3. INVESTIGAÇÃO
3a. Produção científica
Os investigadores do CIBO/IPATIMUP foram autores ou co-autores de cerca de duas centenas de
Comunicações Científicas, apresentadas na forma de Apresentação Oral ou de Poster em reuniões
internacionais realizadas em Portugal ou no estrangeiro, de 7 capítulos de livros ( pág. 31 ) e de 95
artigos científicos (pág. 25 e seguintes).
Oito dos 95 artigos foram publicados ou aceites para publicação em Livros de Proceedings, 6 em
Revistas editadas em Portugal ou em outros Países Latinos ou Latino-Americanos, 8 em Revistas
Internacionais sem Factor de Impacto (FI) e 73 em Revistas Internacionais com Factor de Impacto entre
0,6 e 12,2 (ver lista completa a partir da pág. 25). Setenta e seis por cento dos artigos foram publicados
em Revistas com Factor de Impacto superior a 1, 30% em Revistas com Factor de Impacto superior a 3 e
8% em Revistas com Factor de Impacto superior a 6 .
No quadro seguinte comparam-se os dados de 2000 com os de 1996, 1997, 1998 e 1999.
Nºtotal de artigos(publicados e em
publicação)
Artigos em Livros de Proceedings
Artigos em Revistas
Artigos em Revistas editadas em Portugal
ou em outros Países Latinos ou LatinoAmericanos
Artigos em Revistas Internacionais não
Latinas sem FI
Artigos em Revistas Internacionais c/FI
Artigos em Revistas c/FI>1,0
Artigos em Revistas c/FI>3,0
Artigos em Revistas c/FI>6,0
1996
70
1997
75
1998
81
1999
105
2000
95
6
64
9
66
6
75
6
99
8
87
11(17%)
9(14%)
11(15%)
11(11%)
6(7%)
15(23%)
12(18%)
11(15%)
3(3%)
8(9%)
38(60%)
25(36%)
11(17%)
2(3%)
45(68%)
32(48%)
13(20%)
3(5%)
53(70%)
46(57%)
20(25%)
8(10%)
85(85%)
62(64%)
20(21%)
6(6%)
73(84%)
66(76%)
26(30%)
7(8%)
A análise do quadro permite extrair as seguintes conclusões:
1. Diminuiu, em relação a 1999, o número de artigos publicados em revistas científicas (87 em vez de 99);
esta diminuição fora prevista no Plano de Actividades para 2000.
2. À diminuição do número absoluto de artigos (ponto anterior) corresponde no entanto um ligeiro aumento
do número de artigos publicados em revistas internacionais com factor de impacto superior a 1 (66 em vez
de 62), e F.I. superior a 3 (26 em vez de 20) e F.I. superior a 6 (8 em vez de 6).
3. Como corolário do ponto anterior tem-se observado um aumento consistente da percentagem de artigos
publicados em revistas internacionais com Factor de Impacto superior a 1 (36% em 1996; 48% em 1997;
57% em 1998; 64% em 1999, 76% em 2000). Este ponto reflecte a aposta dos investigadores do Instituto
na melhoria da qualidade da produção científica.
3b. Participação em Conselhos Editoriais
Os investigadores do IPATIMUP são membros dos Conselhos Editoriais de 14 revistas científicas
internacionais: Advances in Anatomic Pathology (Lippincott); Cancer Genetics and Cytogenetics
(Elsevier); Current Diagnostic Pathology (Churchill Livingstone); Diagnostic Cytopathology (Wiley),
Endocrine Pathology (Blackwell); European Journal of Cancer Prevention (Oxford Communications),
Histopathology (Blackwell), International Journal of Surgical Pathology (Churchill Livingstone); Journal
of Pathology (Wiley); Pathology Research & Practice (Gustav Fischer Verlag); Pathology Update
(Gustav Fischer Verlag); Patologia (Revista da Sociedade Espanhola de Anatomia Patológica); Seminars
in Diagnostic Pathology (W.B. Saunders); Virchows Archiv (Springer Verlag).
7
3c. Prémios
•
Prémio de Jovem Investigador – 2000 atribuído ao Doutor José Carlos Mahcaod (Carrer Award for
the best young research in the field of cancer prevention) pela Associação Europeia de Prevenção do
Cancro na Reunião Anual da Associação (Heidelberga, Junho de 2000).
•
1º Prémio da Sociedade Portuguesa de Genética Humana 2000. “Isolamento de cDNAs na região de
2cM do braço longo do cromossoma 6 implicada no desenvolvimento do carcinoma gástrico” 4ª
Reunião da Sociedade de Genética Humana, Porto. (Beatriz Carvalho, F. Carneiro, R. Seruca,
K.Kok).
•
A comunicação sob a forma de poster de: Prudêncio C, Sansonetty F, Sousa MJ, Côrte-Real M, Leão
C: FCM functional assay of multiple resistance of the yeast Debaryomyces hansenii to fluconazole,
5-fluorocytosine and amphotericin B. Evaluation of its reversion, apresentada no XX Congress of the
International Society for Analytical Cytology – ISAC, Montpellier, France, 20-25 May, 2000
(Cytometry, supplement 10, p104) recebeu o prémio Outstanding Student Poster Award
3d. Projectos de investigação em curso (ou concluídos) em 2000
•
Projectos de investigação negociados e/ou iniciados em 1996
Avaliação de marcadores biológicos de diagnóstico e prognóstico em lesões neoplásicas e
neoplasiformes da tireóide I.R. - M.Sobrinho-Simões (PRAXIS - 2/2.1/SAU/1187/95) 36 meses 1996-2000. (Fin.10.000c).
Bases moleculares e implicações biológicas da instabilidade de microssatélites no cancro gástrico.
I.R. - Raquel Seruca (PRAXIS - 2/2.1/BIA/250/94 ) 36 meses -1999-2000. (Fin. 6.000c).
Estudo de mecanismos genotípicos e fenotípicos subjacentes à aquisição de propriedades invasoras
e metastizantes. Utilização das células de carcinoma papilar da tireóide do homem como uma
espécie de "modelo da natureza". I.R. - M.Sobrinho-Simões (PRAXIS - 2/2.1/BIA/100/94 ) 36 meses 1997-2000. (Fin.6.000c).
Proliferação e apoptose em linfomas. I.R. - C.Sambade (PRAXIS - 2/2.1/SAU/1239/95 ) 36 meses 1997-2000. (Fin. 12.000c).
Transplante autólogo de progenitores hemopoiéticos periféricos — abrir o caminho para a
genoterapia. I.R. - J.E. - Guimarães (PRAXIS - 2/2.1/SAU/1283/95 ) 36 meses -1997-2000.
(Fin.20.000c).
•
Projectos de investigação negociados e/ou iniciados em 1997
Host factors and Helicobacter pylori infection in gastric carcinogenesis. A study of mucin genes,
ABO/Lewis phenotypes and H. pylori strains in patients with gastric cancer precursor lesions in
Portugal, Colombia and USA. (IRs: F. Carneiro, L.David e M.Sobrinho Simões) (FLAD - Projecto nº
492/97) - 36 meses - 1997-2000. (Fin.12.240c).
•
Projectos de investigação iniciados em 1998
Rastreio/Estudo piloto de patologia gástrica associada à infecção por Helicobacter pylori na
população constituída por trabalhadores dos Estaleiros Navais de Viana do Castelo. (IRs: F.
Carneiro, L.David e M.Sobrinho Simões) (ARS-Norte, IPATIMUP, Estaleiros Navais de Viana do
Castelo, H.S.João) - 24 meses - 1998-2000. (Fin. 11.445c).
8
•
Projectos de investigação iniciados em 1999
Glicosilação das mucinas na mucosa gástrica normal, metaplasia intestinal, carcinoma gástrico e
linhas celulares de carcinoma gástrico: papel das glicosiltransferases e das apomucinas
PRAXIS/P/SAU/14111/1998 - 1999-2001 - 24 meses - IR: Leonor David (Fin. 20.000 c)
Perfis genético-moleculares no cancro gástrico esporádico e familiar PRAXIS/P/SAU/14292/1998 1999-2001 - 24 meses - IR: Raquel Seruca (Fin.15.000c)
Tumores mamários da cadela. Aspectos comparativos da carcinogénese mamária do homem e do
cão PRAXIS/C/CVT//1998 " - 1999-2001 - 24 meses - IR: Fátima Gärtner (Fin. 6.060c)
Mechanisms involved in somatic hypermutations of B cells during the germinal center reaction
PRAXIS/P/SAU/14315/1998 - 1999-2001 - 24 meses - IR: Ola Söderberg (Fin. 10.000c)
Optimização do tratamento do bócio nodular da tireoide - (Projecto financiado pela Fundação
Calouste Gulbenkian) - 1999- 2001 - 24 meses -IRs: António Taveira e M. Sobrinho Simões (Fin.
7.500c)
•
Projectos de investigação negociados em 2000 (a iniciar em 2001)
Promotion and development of GaiNacMUC1 and NeuAc Alpha2-6GalNac-MUC1 Glycopeptides
for immunotherapy in cancer (POCTI/36376/CBO/2000) – 2001-2003 – 36 meses – IR: Celso Reis
(Fin.21.486c)
Factores genéticos e ambientais (infecção por Helicobacter Pylori) que contribuem para a
agregação familiar do carcinoma gástrico (SAPIENS Projecto – 35374/99) – 2001-2003 – 36 meses –
IRs: Raquel Seruca e Fátima Carneiro (Fin. 26.434c)
Tabagismo e deficiência de α1-antitripsina ( Conselho de Prevenção do Tabagismo) – 2000-2003 – 36
meses – IRs: Jorge Rocha e António Amorim (Fin. 10000c)
Tabagismo e cancerização das vias aéreas superiores (Conselho de Prevenção do Tabagismo) – 20002003 – 36 meses – IRs: Conceição Souto Moura, Raquel Seruca e Fernando Schmitt (Fin. 10.000c)
•
Outros projectos no âmbito de concursos e/ou enquadramentos internacionais*
ECP - IM - Intervention study on Helicobacter pylori and intestinal metaplasia (European Cancer
Prevention Organization ) - 36 + 24 meses - 1995-2000 (IR: Fátima Carneiro)
Mucins in the pathophysiology in inflammatory diseases of the bronchial and gastric intestinal
epithelia (BIOMED II da U.E.) - 36 meses - 1998-2001 (IR: Leonor David)
Aplicação de novas tecnologias no estudo de doenças infecciosas e parasitárias e em oncobiologia
(ICCTI/CAPES nº 423/CAPES) - 24 meses - 1998-2000 (IR: Fernando Schmitt).
International Gastric Cancer Linkage Consortium (Supported by European and North American
funds) (IRs do IPATIMUP: Fátima Carneiro e Raquel Seruca)
• Nota: Os financiamentos para estes Projectos cobrem apenas despesas de viagem, transporte de
amostras e telecomunicações.
9
4. FORMAÇÃO APÓS-A-GRADUAÇÃO
4a Teses de doutoramento
Luis Filipe Santos Silva, biólogo, mestre em Oncobiologia, doutorou-se em 15 de Março de 2000.
Os seus orientadores institucionais foram o Prof. António Amorim e a Prof. Leonor David e teve
como arguente estrangeiro o Prof. Angel Carracedo Alvarez (Faculdade de Medicina da
Universidade de Santiago de Compostela, Espanha). O Doutor Luis Filipe Santos Silva foi Aprovado
por Unanimidade (classificação máxima para Doutoramentos realizados na Universidade do Porto).
Título da Tese: “Polymorphisms of DNA repetitive regions and susceptibility to gastric cancer /
Polimorfismos de regiões repetitivas de ADN e susceptibilidade para carcinoma gástrico”
Silva F, Gusmão L, Amorim A. Segregation analysis of Tetra- and pentanucleotide short tandem repeat
polymorphisms: deviation from mendelian expectations. Electrophoresis 20: 1697-1701, 1999.
Silva F, Amorim A, Gusmão L. Somatic instability in gastric tumors at STRs used in forensic genetics.
Prog For Genet 7: 424-426, 1998.
Silva F, Gusmão L, Alves C, Seruca R, David L, Amorim A. Tetra-and pentanucleotide short tandem
repeat instability in gastric cancer. Electrophoresis 18: 1633-1636, 1997.
Gusmão L, Prata M, Amorim A, Silva F, Bessa I. Caracterisation of four short tandem repeat (STR) loci TH01, VWA31/A, CD4, and TP53 -in North Portugal. Hum Biol 69, 1: 31-40, 1996.
•
Maria do Céu Fontes Herdeiro Figueiredo, bióloga, mestre em Oncobiologia, doutorou-se em 23
de Outubro de 2000. O seu orientador e institucional foi a Prof. Fátima Carneiro e teve como
arguentes estrangeiros os Doutores Wim Quint e Leen-Jan van Doorn (Delft Diagnostic Laboratory,
Delft, Holanda). A Doutora Céu Figueiredo foi Aprovada por Unanimidade (classificação máxima
para Doutoramentos realizados na Universidade do Porto).
Título da Tese: “vacA, cagA and iceA genes of Helicobacter pylori: Genotyping, epidemiology and
clinical relevance”.
van Doorn LJ, Figueiredo C, Rossau R, Jannes G, van Asbroeck M, Sousa JC, Carneiro F, Quint WGV.
Typing of Helicobacter pylori vacA gene and detection of cagA gene by PCR and reverse hybridisation. J
Clin Microbiol 36: 1271-1276, 1998.
van Doorn LJ, Figueiredo C, Sanna R, Pena S, Midolo P, Ng EK, Atherton JC,Blaser MJ, Quint WG.
Expanding allelic diversity of Helicobacter pylori vacA. J Clin Microbiol 36: 2597-2603, 1998.
van Doorn LJ, Figueiredo C, Sanna R, Plaisier A, Schneeberger P, de Boer W, Quint W. Clinical
relevance of the cagA, vacA and iceA status of Helicobacter pylori. Gastroenterology 115: 58-66, 1998.
van Doorn LJ, Figueiredo C, Sanna R, Blaser MJ, Quint WG. Distinct variants of Helicobacter pylori
cagA are associated with vacA subtypes. J Clin Microbiol 37: 2306-2311, 1999.
van Doorn LJ, Figueiredo C, Mégraud F, Pena S, Midolo P, Queiroz DM, Carneiro F, Vanderborght B,
Pegado MD, Sanna R, de Boer W, Schneeberger PM, Correa P, Ng EK, Atherton J, Blaser MJ, Quint
WG. Geographic distribution of vacA allelic types of Helicobacter pylori. Gastroenterology 116: 823830, 1999.
Figueiredo C, Quint WGV, Sanna R, Sablon E, Donahue JP, Xu Q, Miller GG, Peek RM, Blaser MJ, van
Doorn LJ. Genetic organization of the iceA locus of Helicobacter pylori. Gene 246: 59-68, 2000.
10
Figueiredo C, van Doorn LJ, NogueiraC, Soares JM, Pinho C, Figueira P, Quint WGV, Carneiro F.
Helicobacter pylori genotypes are associated with clinical outcome in Portuguese patients and reveal a
high prevalence of infections with multiple strains. Scand J Gastroenterol (em publicação).
Nogueira C, Figueiredo C, Carneiro F, Taveira-Gomes A, Barreira R, Figueira P, Salgado C, Belo L,
Peixoto A, Bravo JC, Bravo LE, Realpe JL, Plaisier AP, Quint WGV, Correa P, van Doorn LJ. The
histopathology of Helicobacter pylori-induced gastritis is associated with bacterial genotypes. Am J
Pathol (em publicação).
Figueiredo C, Quint W, Nouhan N, van den Munckhof H, Herbrink P, Scherpenisse J, de Boer W,
Schneeberger P, Perez-Perez G, Blaser MJ, van Doorn LJ. Assessment of Helicobacter pylori vacA and
cagA genotypes and host serological response. J Clin Microbiol (em publicação).
•
Maria Raquel Almeida, bióloga, mestre em Oncobiologia, doutorou-se em 27 de Outubro de 2000.
O seu orientador institucional foi a Prof. Leonor David e teve como arguentes estrangeiros os Profs
Henrik Clausen (Faculty of Health Sciences da Universidade de Copenhaga) e Michael
Hollingfworth (Eppley Institute, University of Nebrasca, Medical Center, EUA). A Doutora Raquel
Almeida foi Aprovada por Unanimidade (classificação máxima para Doutoramentos realizados na
Universidade do Porto).
Título da Tese: “Identification and characterization of a human β4 galactosyltransferase gene family:
Control of type 2 chain synthesis and contribution to define the molecular basis of a defect in
proteoglycan biosynthesis”
Almeida R, Amado M, David L, Levery SB, Holmes EH, Merkx G, van Kessel AG, Rygaard E, Hassan
H, Bennett E, Clausen H. A Family of Human β4-Galactosyltransferases. Cloning and Expression of
Two Novel UDP-Galactose: β-N- Acetylglucosamine β1,4-Galactosyltransferases, β4Gal-T2 and β4GalT3. J Biol Chem 272: 31979-31991, 1997.
Almeida R, Levery SB, Mandel U, Kresse H, Schwientek T, Bennett EP, Clausen H. Cloning and
Expression of a Proteoglycan UDP-Galactose: βXylose β1,4-Galactosyltransferase I: A Seventh Member
of the Human β4Galactosyltransferase Gene Family. J Biol Chem 274: 26165-26171, 1999
Amado M, Almeida R, Carneiro F, Levery SB, Holmes EH, Nomoto M, Hollingsworth M, Hassan H,
Schwientek T, Nielsen PA, Bennett EP, Clausen H. A Family of Human β3-Galactosyltransferases.
Characterization of four members of a UDP-Galactose: β-N-Acetyl-Glucosamine/β-N-Galactosamine β1,3-Galactosyltransferase family. J Biol Chem 273 (21): 12770-12778, 1998
Amado M, Almeida R, Schwientek T, Clausen H. Identification of large Galactosyltransferase gene
families: Galactosyltransferases for all functions. Biochim Bioph Acta 1473: 35-53, 1999
Schwientek T, Almeida R, Levery SB, Holmes EH, Bennett EP, Clausen H. A novel member of the
UDP-Galactose: β-N-Acetyl-Glucosamine β1,4 Galactosyltransferase family, β4Gal-T4, exhibits NAcetyllactosamine synthase activation by α-lactalbumin. J Biol Chem 273: 29331-29340, 1998
•
Domingos Monforte Cruz, engenheiro electrónico e de computadores e mestre em informática,
doutorou-se em 23 de Novembro de 2000. O seu orientador institucional foi o Prof. Mário Seixas e
teve como arguente, para além dos Prof. João Álvaro Carvalho (Faculdade de Engenharia da
Universidade do Minho) e Marques dos Santos (Faculdade de Engenharia da Universidade do Porto)
o Prof. Ivan Damjanov (Kansas Medical College, Kansas University, E.U.A.). O Doutor Domingos
Cruz foi Aprovado por Unanimidade (classificação máxima para Doutoramentos realizados na
Universidade do Porto).
Título da Tese: “Digital image documentation in anatomic pathology (routine, training and research)”.
11
Cruz D, Schmitt F, Seixas M. An information system for quality assessment in pathology. Arch Pathol
Lab Med 124: 816, 2000.
Cruz D, Schmitt F, Seixas M. Surgical pathology image–based documentation: Redundancy vs. essential
information. Arch Pathol Lab Med 124:815–816, 2000.
Cruz D, Seixas M. A surgical pathology system for gross specimen examination. Proc AMIA Symp, pp.
236–240, 1999
Cruz D, Valentí C, Dias A, Seixas M, Schmitt F. Microvessel density counts in breast cancer: Slides vs.
digital images. Analyt Quant Cytol Histol, 2000 (em publicação).
Cruz D, Valentí C, Seixas M, Schmitt F. Digital image documentation for quality assessment. Arch
Pathol Lab Med (em publicação).
•
Doutora Cidália Irene Azevedo Pina Vaz, médica especialista em Patologia Clínica e investigadora
da Unidade de Microbiologia (Unidade Externa do IPATIMUP sediada no Hospital de S. João),
doutorou-se em 11 de Dezembro de 2000 com a Tese “Determinação da actividade antimicrobiana no
género Candida por citometria de fluxo”. A Doutora Cidália Pina Vaz foi Aprovada por
Unanimidade (classificação máxima para Doutoramentos realizados na Universidade do Porto).
4b. Programas de Pós-Graduação e Iniciação Científica
•
IPATIMUP participou activamente na coordenação e realização da 3ª edição do Programa Graduado
em Áreas de Biologia Básica e Aplicada da Universidade do Porto (Programa GABBA), assim cono
na organização e início da 4ª edição desse mesmo Programa. O IPATIMUP colaborou também
activamente na organização da 1ª Reunião Anual do Programa (Relatório anexo).
•
IPATIMUP participou na realização do 2º ano do Programa de Pós-Graduação em Anatomia
Patológica (Internato Médico) para 8 internos da especialidade em colaboração com a Faculdade de
Medicina do Porto e com o Serviço de Anatomia Patológica do Hospital de S. João.
•
IPATIMUP assegurou a realização do 1º ano do Programa de Iniciação à Investigação Científica em
Biomedicina para 12 alunos de Medicina e Medicina Dentária.
4c. O IPATIMUP assegurou estágios formativos a 14 médicos e estagiários brasileiros e europeus
(Espanha e País de Gales) em programas de pós-doutoramento, doutoramento ou aperfeiçoamento
profissional (ver pág.15-16)
12
5. EDUCAÇÃO CONTÍNUA E DIFUSÃO CIENTÍFICA
UNIDADE DE EDUCAÇÃO CONTÍNUA E DIFUSÃO CIENTÍFICA
RELATÓRIO DE ACTIVIDADES 2000
A.
PROGRAMA CIÊNCIA VIVA III
a) Alargamento da rede iniciada no Programa Ciência Viva II a uma nova escola da área
metropolitana do Porto: Escola Secundária de Gondomar,
b) Início: Fevereiro de 1999.
c) Fim: Julho de 2000.
B. ENSINO EXPERIMENTAL DAS CIÊNCIAS NAS ESCOLAS BÁSICAS DO PORTO
a) Protocolo com o Pelouro da Educação da Câmara Municipal do Porto.
b) Programa: “Viver uma Escola Diferente” . Escolas do primeiro ciclo do ensino básico.
Trabalho directo com professores no ano lectivo de 1997/98.
Trabalho directo com alunos de 4 escolas do Porto nos anos lectivo de 1998/99. 1999/2000 e
2000/2001.
c) O IPATIMUP responsabiliza-se pelo ensino lúdico e experimental das ciências, numa
investigação aplicada de materiais, experiências, metodologias e trabalho de grupo que permita
desenvolver as capacidades cognitivas, as perícias e as atitudes científicas.
C. CIÊNCIA VIVA NAS FÉRIAS
a) Projecto do MCT para aplicação científica dos jovens nas férias, através de um estágio
voluntário , numa Instituição Científica de Investigação. O IPATIMUP foi uma das escolhidas.
b) 12 alunos do Ensino Secundário estagiaram no IPATIMUP durante duas semanas no verão de
2000.
D. CONFERÊNCIA DO EQUINÓCIO
a) Seminários de Reflexão Interdisciplinar.
b) Objectivo: pensar transversalmente a Medicina e a Investigação, promovendo o estudo e a
discussão multi e interdisciplinar.
c) Conferência aberta a convidados de acordo com experiência, reflexão e trabalhos pessoais.
Conferência do Equinócio de 2000: O torna-viagem: do brasileiro do princípio do século ao
cientista actual.
Conferencistas:
Maria do Belém Roseira e Arnaldo Saraiva;
António Coutinho e Domingos Henrique
E. SEMANA DA CIÊNCIA E TECNOLOGIA (20 a 25 de Novembro de 2000).
a) Forum FNAC: O livro e a Divulgação Científica.
Presentes: Raquel Seruca e José Carlos Machado (IPATIMUP); Maria de Fátima Venceslau
(E.S. Carlos Cal Brandão); José Paiva e Regina Castro (Museu dos Transportes e
Comunicações). Moderador: Rui Mota Cardoso.
b) Sessão Solene do Dia da Ciência e Tecnologia, com a presença do Presidente da República e do
Ministro da Ciência e da Tecnologia.
F. ACTIVIDADES DE INTERCÂMBIO CIENTÍFICO NO IPATIMUP
a) E. S. de Gondomar: “Mãos no DNA” – 9 alunos
b) E. S. Carlos Cal Brandão: “Extracção de ácidos nucleicos, nomeadamente de DNA;
amplificação de sequências de DNA por PCR; análise electroforética em gel de agarose;
visualização do gel de agarose em luz ultravioleta; análise de resultados” – 15 alunos.
c) E.S. Garcia d´Orta: “DNA: suporte universal da informação genética” – 20 alunos.
G.
PROTOCOLO DE GEMINAÇÃO COM A ESCOLA BÁSICA 1 DE RIO DE MOINHOS
Em protocolo de cooperação assinado no dia da visita de estudo ao IPATIMUP dos alunos da Escola
do primeiro ciclo de Rio de Moinhos, o IPATIMUP e a Escola de Rio de Moinhos aceitaram
trabalhar em conjunto em actividades a definir caso a caso e no respeito mútuo pela liberdade de
13
decisão de cada entidade, numa perspectiva de partilha de recursos e conhecimentos, e tendo em
vista o desabrochar do ensino experimental das ciências nessa escola.
H.
PAVILHÃO DE PORTUGAL NA EXPOSIÇÃO DE HANÔVER
a) Integrado na Exposição de Hanôver, a Unidade Ciência Viva do Ministério da Ciência e
Tecnologia, desenvolveu um projecto de Janeiro a Maio de 2000, envolvendo grupos de jovens
das escolas secundárias portuguesas e alemãs, enquadrados pelos respectivos professores, e a
comunidade científica portuguesa.
b) Tendo por fim desenvolver para a promoção da cultura científica, o projecto pretendeu
aproximar os jovens dos dois países, através e nas questões científicas relacionadas com a área
Saúde.
c) O site da Ciência Viva acompanhou e apoiou todo o projecto, publicando os conteúdos relativos
às temáticas em estudo e dando espaço à interacção entre cientistas e jovens, com respostas a
dúvidas e debate de questões científicas.
d) O IPATIMUP disponibilizou a consultadoria científica dos seus investigadores Filipe
Sansonetty, Fátima Carneiro, Sobrinho Simões, Fernando Schmitt e Raquel Seruca, com
responsabilidade organizativa do primeiro.
e) A pedido expresso dos alunos do Gymnasium Bad Essen e do sua professora Dieter Grube, o
IPATIMUP respondeu a um inquérito sobre problemas e estratégias de Saúde Pública
portuguesa, elaborado por Guilherme Gonçalves.
f) A Escola Secundária Carlos Cal Brandão, geminada com o nosso Instituto, participou no
projecto.
g) Os alunos desta escola e o nosso investigador Filipe Sansonetty estiveram presentes no
encerramento do projecto, no pavilhão português, no dia de Portugal da Exposição de Hanôver.
I.
MUSEU DE TRANSPORTES E COMUNICAÇÕES – COLABORAÇÃO
Após a colaboração estabelecida com o Museu de Transportes e Comunicações, durante a Semana
da Ciência e Tecnologia de 1999, através da participação na exposição
COMUNICAÇÃO/COMUNICAÇÕES, o IPATIMUP aprofundou os contactos e a possibilidade de
trabalho conjunto com esta instituição, no intuito de vir a apoiar o desenvolvimento de um espaço de
ciência e experiência numa das exposições permanentes previstas para o Museu a partir do Outuno
de 2001. Em Dezembro de 2000 o IPATIMUP assinou com a Associação do Museu dos Transportes
e Comunicações um protocolo de colaboração.
J.
OUTRAS ACTIVIDADES
a) Palestra “Genética do cancro” no Pavilhão do Conhecimento em Lisboa – Doutora Raquel
Seruca.
b) Reunião com os alunos do ensino secundário da ES/3 João Gonçalves Zarco de Matosinhos:
“Ciência, o que é, para que serve?” – Dr. Aureliano Jorge Dias.
c) Visitas de estudo ao Laboratório de Citometria de vários grupos de alunos da licenciatura em
Biologia da Faculdade de Ciências da Universidade do Porto – Dr. Filipe Sansonetty.
M. PROGRAMA CIENCIA VIVA IV
O Dr. Filipe Sansonetty é o coordenador do Projecto Virtualab – Experimentação interactiva –
Projecto PIV-1871, financiado pelo CIENCIA VIVA IV. Este projecto, que tem como principal
objectivo conseguir a melhoria do ensino experimental das ciências na escola, teve início em finais
de 2000.
14
7.
SERVIÇO À COMUNIDADE
Para além dos serviços ao exterior prestados através da UPS foram ainda realizados outros que, pela sua
especificidade (nomeadamente os de ordem forense) não se contabilizaram naquela unidade. No período
em apreço, corresponderam a 177 testes de paternidade, 92 análises de deficiência da alfa 1-antitripsina
(PI) e 10 de deficiência de ornitina carbamoíltransferase (OTC).
Na área forense também merece referência a participação no controle de qualidade organizado pelo
Grupo Espanhol e Português da International Society of Forensic Genetics, em que os resultados
produzidos foram totalmente conformes aos consensuados.
Unidade de Prestação de Serviços (UPS)
Relatório de Actividades 2000
Introdução
De forma a cumprir um dos objectivos do CIBO/IPATIMUP para 2000: “Manter e se possível reforçar, as
actividades da Unidade de Prestação de Serviços”, reforçámos alguns aspectos estruturais da Unidade
com reflexos positivos no aumento significativo do número de exames (63% em relação a 1999), bem
como no acréscimo da facturação. Vale a pena salientar que mesmo com um enquadramento profissional
no sentido de se obter rentabilidade económica, a Unidade não deixou de prestar serviços gratuitos de
consultadoria, os quais não só trazem prestígio internacional, como garantem material precioso para fins
investigacionais. Também continuámos a actuar como um centro de formação profissional pós-graduado,
tendo recebido, em 2000, na sequência do que vem sucedendo desde há vários anos, 14 técnicos e
patologistas de diferentes países (ver # 3).
1.
Recrutamento de pessoal:
•
Durante o ano de 2000, a Drª Fernanda Milanezi (São Paulo – Brasil) exerceu as funções de Fellow
em Patologia, com responsabilidades diagnósticas sob supervisão nas áreas de citopatologia e
anatomia patológica. O programa de Fellowship vai continuar no ano 2001 com a mesma
colaboradora.
Contratação para a U.P.S. das Técnicas Nádia Santos Cristina Freitas
Rescisão de contrato com o Técnico Alexandre Salvador
•
•
2. Aquisição de Equipamento:
Com a finalidade de equipar o Laboratório de Rotina Diagnóstica em 2000 foram feitas as seguintes
aquisições de equipamento, com o apoio da Fundação Calouste Gulbenkian (*). As despesas referentes ao
IVA foram suportadas pelo IPATIMUP.
Aparelho/Empresa – Modelo
Microscópio de múltipla observação
Refª Axioskop 2 – Hitec Norte
Processador para citologias em meio líquido
Thinprep 2000 – Speculum
Criostato CM1100
Artº 149DSC10003 Nº serie 344 – Leica
Micrótomo de disco
Artº 14046931478 Nº série – 251 – Leica
Preço s/ IVA
4.000.000$00
IVA (17%)
680.002$00
6.324.876$00
1.075.214$00
1.387.500$00
235.875$00
1.800.000$00
306.000$000
15
3. Estágios, visitas de curta duração e treino de internos:
Estágios
Nome
Ana Cristina Andrade, licenciada em
Biologia,
Faculdade
de
Ciências,
Universidade do Porto, Porto
Ana Lúcia Quirino de Oliveira, Interna de
Anatomia Patológica, Hospital de Base de
Brasília, Brasília, DF, Brasil
Beatriz Hornburg, Especialista em Anatomia
Patológica,
CEDAP, Joinvile, Santa
Catarina, Brasil
Carlos Puentes, Interno de Anatomia
Patológica, Hospital Juan Canalejo, Coruña,
Espanha
Daniel Abensur Athanázio,Estudante de
Medicina,Universidade Federal da Bahia,
Salvador, Bahia, Brasil
Fernando Monteiro Aarestrup, Especialista
em Anatomia Patológica, Universidade
Federal de Juiz de ForaJuiz de Fora, MG,
Brasil
Giovana W. Di Santis, patologista
veterinária, Universidade Estadual Paulista,
Botucatu, SP, Brasil
Huw Davies, Estudante de Medicina,
Cardiff, País de Gales, U.K.
Jorge Sérgio Reis Filho, Interno de
Anatomia Patológica da Universidade
Federal do Paraná, Brasil
Leda Viegas de Carvalho, Especialista em
Anatomia Patológica, Universidade Federal
de São Paulo, São Paulo, Brasil
Lígia Almeida, técnica de Análises Clínicas,
Serviço de Sangue, Hospital de S. Marcos,
Braga
Luciana Gomes Rocha, Interna de Anatomia
Patológica, Universidade de São Paulo,
Ribeirão Preto, SP, Brasil
Marcus Davis Braga, Especialista em
Anatomia Patológica, Universidade Federal
do Ceará, Fortaleza, Ceará, Brasil
Maria João Serra Teles Amaro, citotécnica,
Serviço de Anatomia Patológica, Hospital de
São Bernardo, Setúbal, Portugal
Pilar Seara, Especialista em Anatomia
Patológica, Pamplona, Espanha
Sueli Suzigan, Especialista em Anatomia
Patológica, Laboratório Larpac, São José do
Rio Preto, SP, Brasil
Período
Tipo de Estágio
1/1/00-30/01/00
Citometria de Fluxo
Concluído
3/1/00-28/2/00
Patologia
Citopatologia
Concluído
1/04/00-30/5/00
Patologia,
Citopatologia,
Imunohistoquímica
Patologia,
Citopatologia,
Imunohistoquímica
Patologia mamária
Concluído
1/02/00-28-02-00
Patologia Mamária
Imunohistoquímica
Biologia Molecular
Concluído
7/05/00-7/06/00
Patologia
Veterinária
Citopatologia
Patologia mamária
Concluído
Patologia,
Citopatologia,
Imunohistoquímica,
Patologia Mamária
Biologia Molecular,
Citometria
Patologia Mamária
Doutoramento
Concluído
1/1/00-30/10/00
Citometria de Fluxo
Concluído
6/11/00-29-/12/00
Concluído
7/02/00-27/02/00
Patologia,
Citopatologia,
Imunohistoquímica
Patologia
14/02/00-25/02/00
Citopatologia
Concluído
9/10/00-8/12/00
Patologia,
Citopatologia,
Imunohistoquímica
Patologia
Imunohistoquímica
Doutoramento
Concluído
1/12/9-28/2/00
1/10/00-30-11-00
1/9/00-31-10-00
8/5/00-8/7/00
1/10/00-31/10/00
Situação Actual
Concluído
Concluído
Concluído
Concluído
Concluído
Concluído
16
Visitas de curta duração
Profa. Ana Nogueira, Professora de Patologia, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas
Gerais, Brasil.
Angela Logullo, Especialista de Anatomia Patológica, São Paulo, Brasil
Prof. Athanase Billis, Professor de Patologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, Brasil.
Dr. Björn Björnsson, Especialista de Patologia Molecular, Oslo, Noruega
Prof. José Russo, Prof. de Patologia, Fox Chase Institute, Philadelphia, U.S.A.
Profa. Maria de Fátima Borges, Professora de Endocrinologia, Faculdade de Medicina do Triângulo Mineiro,
Uberaba, Minas Gerais, Brasil.
Treino de Internos
João Cruz, Interno de Anatomia Patológica do Hospital de São João, Porto, Portugal
Palmira Lima, Interna de Anatomia Patológica do Hospital de São João, Porto, Portugal
Pilar Troncoso, Interna de Anatomia Patológica do Hospital de São João, Porto, Portugal
4. Exames realizados na U.P.S.
Nº total de exames: 11286
Captura Híbrida: 140
Citologias: 9.105 (5.716 - Projecto de Santo Tirso)
Citologias Aspirativas: 661
Histológicos: 850
Histoquímicos: 116
Imuno-histoquímicos: 322
Patologia veterinária: 2
PCR por HPV: 31
Ultrastruturais: 44
Genética Molecular e Citogenética
Diagnóstico de Sindrome de Prader-Willi: 53
Diagnóstico de Síndrome de Angelman: 34
Diagnóstico de Síndrome de X-frágil: 12
Estudo molecular de delecção 1p: 15
Estudo molecular de translocações: 9
Pesquisa de Amplificação de N-myc: 15
Pesquisa de Instabilidade de Microssatélites: 60
Pesquisa de Mutação no RET: 21
Pesquisa de Mutações do gene P53: 11
Pesquisa de Mutações no gene E-caderina: 2
Pesquisa de Mutações nos genes BRCA1 e BRCA2: 6
Pesquisa de Chlamydia: 1
Citometria
Citometria de Fluxo: 150
Citometria de Imagem: 4
Casos em consulta*: 161
* Os casos em consulta foram oriundos das seguintes instituições:
Dr. A. Gassel - Pathologisches Institut der Universitat Wurzburg - Alemanha
Dr. Alfredo Lopez Cousillas - Hospital Virgem del Camino – Pamplona – Espanha
Dr. Antonio C. O. Meneses – Faculdade Medicina Triângulo Mineiro – MG - Brasil
17
Dr. António Lázaro - Hospital Distrital Setúbal – Setúbal – Portugal
Dr. Carlos Alberto Ribeiro – Universidade Federal de Minas Gerais – Minas Gerais - Brasil
Dr. Carlos Prada Puentes – Hospital Juan Canalejo – Coruña – Espanha
Dr. Denis Larsimont – Institute Jules Bordet – Bruxelas – Bélgica
Dr. E. de Miguel Herran – Hospital de Gualdekao – Bizcaia – Espanha
Dr. Élbio C. de Paula – Goiás – Brasil
Dr. Emílio Marcelo Pereira – Laboratório Salomão e Zoppi – São Paulo – Brasil
Dr. Fabiano Pinto Saggioro – Hospital do Câncer São Judas Tadeu – São Paulo – Brasil
Dr. Fred Ellinger – Marília – São Paulo - Brasil
Dr. Helder Alagia – Liga Amazorense Contra o Câncer – Amazónia – Brasil
Dr. Henrique de Oliveira Costa – Alagoas - Brasil
Dr. Javier Menárguez – Hospital Universitário Gregorio Moranón – Madrid – Espanha
Dr. Jean-Louis Dargent – Chu Saint-Pierre – Bruxelas - Bélgica
Dr. Jeronymo Stecca – São Paulo – Brasil
Dr. João Bosco de Souza-Centro Mossoró – RN - Brasil
Dr. John D. Mellinger -Saint Mary´s – Michigan – U.S.A.
Dr. Jorge Sergio Reis Filho-HC da UFPr-Curitiba-Brasil
Dr. José Manuel Cameselle Teijeiro-Servicio de Anatomía Patológica – Santiago Compostela - Espanha
Dr. Josefo Ferro-Hospital Central de Maputo-Moçambique
Dr. Luciano Espinheira Fonseca Jr. – Universidade Federal da Bahia - Bahia - Brasil
Dr. Luis Carlos da Silva – Faculdade de Medicina de Marília – S.P. - Brasil
Dr. Maçanori Odashiro – Campo Grande - Brasil
Dr. Macedo Dias – Porto - Portugal
Dr. Manuel Dias-Maternidade Júlio Dinis – Porto - Portugal
Dr. Müller-Hermelink - Pathologisches Institut der Universitat Wurzburg - Alemanha
Dr. Paul Komminoth – Universitat Spital – Zurique - Suiça
Dr. Paulo Figueiredo – Coimbra – Portugal
Dr. Serpil D. Sak- Ankara - Turquia
Dr. Tiemo Katzenberger – Pathologiches der Universitat Wurzburg - Alemanha
Dr. Vicente Marco – Hospital General de Catalunya – Espanha
Drª Carla Valentí – Zunarragako – Ospitalea – Zunarrage - Espanha
Drª Conchita de Miguel-Hospital Virgem del Camino – Pamplona - Espanha
Drª Fátima Celino Catão – Paraíba - Brasil
Drª Helena Taveira – SAMS - Lisboa
Drª Ierecê Aymoré-CLAP - Claudio Lemos Anat. Patológica – Rio de Janeiro - Brasil
Drª Inês Vieira de Castro – Universidade de São Paulo – São Paulo – Brasil
Drª Ione Boaventura Schreiber – Belo Horizonte - Brasil
Drª Karina Salgado – RS - Brasil
Drª Laura Teresa Correia Vieira – Hosp. S. Rafael – Bahia – Brasil
Drª Manuela Lacerda – I.P.O. – Coimbra – Portugal
Drª Maria Auxiliadora Machado Lopes Pereira-Hospital Aliança-Salvador – Bahia – Brasil
Drª Maria Cláudia Vaz Diniz – Paraíba – Brasil
Drª Maria Socorro M. de Morais – Natal – Brasil
Drª Maria Teresa Dias de Carvalho – Hospital S. Teotónio – Viseu - Portugal
Drª Maria Teresa Franca – Hospital Sta. Maria - Portugal
Drª Maria Tzardi – Creta - Grécia
Drª Michaela Ott - Pathologisches Institut der Universitat Wurzburg - Austria
Drª Mônica Blaya de Azevedo-Laboratório de Patologia Moinhos – Porto Alegre - Brasil
Drª Paula Guerra Marques – Hospital do SAMS – Portugal
Drª Rosa Madureira – Hospital Sta Maria - Portugal
Drª Salete Silva – Hospital Fernando Fonseca – Portugal
Drª Teresa Carvalho – Hosp. S. Teotónio – Viseu - Portugal
Drª Terezinha Marques – IPACES – Vitória – Brasil
Grupo de Transplante Hepático do H.S.João – Porto – Portugal
Hospital de Joaquim Urbano – Porto – Portugal
Prof. Dr. Juan José Cabrera Galván – Universitat de las Palmas - Espanha
Prof. Dr. Luiz Antônio Rodrigues de Freitas - Hospital Aliança-Salvador – Bahia – Brasil
18
Prof. Dr. Marcello Franco – Escola Paulista de Medicina – S.P. – Brasil
Prof. Dr. Meral Koyuncuoglu – Izmiz – Turquia
Prof. Dr. R. Heimann – Bruxelas – Belgica
Prof. Dr. Valdeci Ferreira – Universidade Federal do Ceará – Fortaleza – Brasil
Prof. Dr. W. Wegmann – Kantonolés Institut fur Pathologie - Suiça
Prof. Dr. Walter Schürch-Dépt. Pathologie - Hôtel-Dieu – CHUM – Montréal – Canada
Prof. Ian Damjanov – Kansas – U.S.A.
5. Participação na Organização de Reuniões Científicas
Coorganização do Curso Prático: Imunofenotipagem de Leucemias por Citometria de Fluxo,
IPATIMUP e IZASA Portugal, Porto, 16-17 de Fevereiro de 2000
6. Controle de Qualidade
• Data de Instituição
• Membros
• Prof. Fernando Schmitt
• Drª Maria José Bento
• D. Susana Silva
•
Nº de Casos Revistos em 2000 - 300
•
Principais Conclusões no Final do 3º Ano:
19-01-1998
O aumento significativo do número de exames da UPS no ano de 2000 em relação ao ano passado (4267
exames) não alterou significativamente a qualidade dos exames revistos pela Comissão no que diz
respeito a concordância diagnóstica, registo dos achados, tempo de resposta e qualidade do material:
a)
A concordância diagnóstica total entre o diagnóstico original e o revisto pela Comissão de Controle
de Qualidade foi ainda mais elevada do que no ano de 1999 (98% vs 96%).
b) A implementação de uma nova base de dados adaptada ao Sistema de Codificação SNOMED
permitiu que aumentássemos o número de exames codificados de 94 para 98%. Continuamos com o
objectivo de conseguir que todos os casos sejam codificados atempadamente.
c)
tempo médio que a realização dos exames e elaboração dos respectivos relatórios manteve-se estável
em relação às biópsias, mas aumentou no seu geral (média de 4,8 dias), desde que biópsias e
citologias cérvico-vaginais foram incluídas no mesmo sub-sistema. Este facto deve-se à incorporação
na rotina da UPS de citologias cérvico-vaginais de rastreio, cujo tempo de resposta aceitável (5-6
dias) é maior do que o esperado para os exames histológicos e de citologia aspirativa (2-3 dias). Os
exames citológicos do Programa de Rastreio de Santo Tirso têm como tempo médio de resposta 11,5
dias, valor inferior ao estabelecido no protocolo (15 dias).
d) Em relação a 1999 o número do material examinado considerado de boa qualidade
aumentou de 70% para 79%. No ano anterior a Comissão havia detectado uma queda deste
número relativo a 1998, especialmente devido aos casos de citologia cérvico-vaginal de
rastreio do Programa de Santo Tirso e seguiu a adopção de colheita de citologia em meio
líquido. Durante o ano de 2000 o Instituto adquiriu um sistema próprio para exame de
citologia em monocamada (ver item #2). Apesar disto o Programa só passou a utilizar esta
metodologia nos três últimos meses de 2000 e estes exames representam apenas 8,6% do
total de exames do rastreio. Mesmo com este número pequeno de exames já se detectaram
reflexos positivos no que diz respeito ao aumento do número de material de boa qualidade.
A meta para o próximo ano é sensibilizar os responsáveis pelo Programa de Rastreio que a
maior parte destes exames seja em citologia em meio líquido.
e) Para se adaptar às exigências cada vez maiores de qualidade de excelência diagnóstica, a
Comissão recomenda para o próximo ano a adopção de 2ª opinião (relatórios assinados por
dois especialistas) em casos específicos e tentativa de estabelecimento de um projecto com o
19
Instituto Português de Qualidade para financiamento de medidas que permitam a
creditação da Unidade de Diagnóstico por Entidades como o Colégio Americano de
Patologistas.
7. Participação em protocolos de consenso para Controlo de Qualidade
•
Lígia Almeida e Filipe Sansonetty, UK National External Quality Assessment Scheme for FetoMaternal Haemorrhage, UK NEQAS (FMH), PO Box 1000, Watford, WD1 8RJ, UK. Steering
Committee Chairperson: Mrs J Chapman, Scheme Co-Directors: Dr. S Knowles/Dr. J ParkerWilliams, Scheme Co-Managers: Mrs CE Milkins/Miss JM Wardle. 1999-2000
•
Maria José Gonçalves, Maria do Céu Monteiro e Filipe Sansonetty. Protocol proposal for the
analysis of immature platelets. Iniciativa do European Working Group on Clinical Cell Analysis,
de que somos membros: Kappelmayer J (chairman), Debrecen, Hungary; Barlage S, Regensburg,
Germany; Caldini A, Florence, Italy, Chatelain B, Mont-Godinne, Belgium; Kawiak J, Warsaw,
Poland; Kekomaki R, Helsinki, Finland; Orfão A, Salamanca, Spain; Reverter JC, Barcelona, Spain;
Rothe G, Regensburg; Germany; Sansonetty F, Porto, Portugal; Scharf RE, Dusseldorf, Germany;
Schmitz G, Regensburg, Germany; Villarubia J, Madrid, Spain; Zupanska B, Warsaw, Poland.
20
7. SEMINÁRIOS CIENTÍFICOS
Data: 4 de Janeiro (3ª feira)
Horário: 9 horas
Título: Indirect induction of SOCS-1 in macrophages stimulated with bacterial lipopolysaccharide: partial
role of autocrine/paracrine IFN- /
Orientador: Dr. Ana Crespo, The Wilkinson Laboratory, University of Kansas Medical Center, USA
Data: 5 de Janeiro (4ª feira)
Horário: 16 horas
Título: Antibodies against VEGF receptors block VEGF-induced leukemia cell growth
Orientador: Doutor Sérgio Dias, Cornell University Medical College, USA
Data: 25 de Janeiro (3ª feira)
Horário: 15 horas
Título: Aspectos da Investigação sobre Malária em curso no Centro de Malária e Doenças Tropicais
Orientador: Prof. Virgilio do Rosário, Universidade Nova de Lisboa
Data: 26 de Janeiro (4ª feira)
Horário: 16 horas
Título: Nuevos conceptos de la patologia de la enfermedade de Hodgkin
Orientador: Prof. Jeronimo Forteza Vila, Universidade de Santiago de Compostela
Data: 23 de Fevereiro (4ª feira)
Horário: 16 horas
Título: O Centro Regional de Saúde Pública do Norte (CRSPN)
Orientador: Dr. Agostinho Castro e Freitas, Coordenador do CRSPN
Data: 3 de Março (6ª feira)
Horário: 16 horas
Título: Apoptosis and cell cycle control in cancer
Orientador: Dr. John Lawry, Institute for Cancer Studies, University Medical School, Sheffield, UK
Data: 30 de Março (5ª feira)
Horário: 15 horas
Título: Part I: Vertebrate genome non equivalence
Part II: Staufen in mammals: localisation or asymmetry?
Orientador: Doutor Samuel Aparício, Dept of Oncology, University of Cambridge, U.K.
Data: 14 de Abril (6ª feira)
Horário: 16 horas
Título: Plasmodium-host interactions: inasion and developement in the liver
Orientador: Doutora Maria Manuel Mota, Division of Immunology, New York University Medical
Center, USA
Data: 10 de Maio (4ª feira)
Horário: 9h00m
Título: I – Slide Seminar on Surgical Pathology (15 casos)
II – 11h00m – Lecture “Stoneage Medicine in the island of New Guinea”
Orientador: Doutor Robin Cooke, Director do Departamento de Patologia da Faculdade de Medicina de
Brisbane, Australia e Editor da Newsletter da International Academy of Pathology
21
Data: 6 de Junho (3ª feira)
Horário: 16 horas
Título: Dificuldades Diagnósticas nas Biopsias Prostáticas de Agulha
Orientador: Prof. Athanase Billis, Director do Departamento de Patologia, Universidade de Campinas,
Brasil
Data: 14 de Junho (4ª feira)
Horário: 16 horas
Título: Functional characterization of the cancer-related SYT,SSX and SYT-SSX proteins
Orientador: Doutor Nuno Rodrigues dos Santos, Department of Human Genetics, Universidade de
Nijmegen, Holanda
Data: 11 de Julho (3ª feira)
Horário: 16 horas
Título: Molecular characterization of gliosarcomas
Orientador: Dr. Rui Reis, Unit of Molecular Pathology of Brain Tumours, IARC, Lyon
Data: 20 de Setembro (4ª feira)
Horário: 10h00m às 12h30m
Título: “Molecular markers of susceptibility and disease in the gastrointestinal tract”
10h00m – 10h30m – Molecular and population genetics of the polymorphism responsible for lactase
dependent digestion capacity in humans. Dallas Swallow, London, UK
10h30m – 11h00m - Organochlorates and mutations of K-ras in pancreatic cancer: a candidate etiologic
clue. Francisco Real, Barcelona, Spain
11h00m – 11h30m – Café
11h30m – 12h00m – Mucins and trefoil peptides in normal and diseased gastrointestinal tract. Anthony
Corfield, Bristol, U.K.
12h00m – 12h30m – Lectins, colitis and colon cancer. Jonathan Rhodes, Liverpool, UK
Data: 21 de Setembro (5ª feira)
Horário: 15h00m
Título: Whole genome expression profiling
Orientadores: Dr. Grace Shen ( Gene Logic) e Profs Nasir Lasani e Gordon Stamp (Imperial College,
UK)
Data: 28 de Setembro (5ª feira)
Horário: 14h30m
Título: Patologia cirúrgica da mama – casos problema (Seminário de Lâminas)
Orientador: Dr. Vicente Marco Molina (Director do Serviço de Anatomia Patológica do Hospital Geral
da Catalunha, Barcelona. Espanha)
Data: 10 de Outubro (3ª feira)
Horário: 16 horas
Título: Diagnósticos diferenciais em biopsia da próstata
O que o patologista deve referir no relatório anatomo-patológico em biopsias da próstata
Orientador: Drª Sueli Suzigan, Professora Adjunta na Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto,
São Paulo, Brasil
Data: 31 de Outubro (3ª feira)
Horário: 15 horas
Título: INSA e IPATIMUP: Perspectivas de colaboração
Orientadores: Dr. João Lavinha, Director do Instituto Nacional de Saúde Ricardo Jorge
Data: 9 de Novembro (5ª feira)
Horário: 15 horas
Título: Evidenciary requirements for risk based news
22
Orientador: Sara Thurin Rollin do Bureau of Environmental News, The Bureau of National Affairs, Inc.,
Washington D.C., U.S.A.
Data: 16 de Novembro (5ª feira)
Horário: 18 horas
Título: “Ras signaling and inhibitors of apoptosis (IAPs): fishing for the missing link”
Orientador: Doutor Luis Martins, Imperial Cancer Research Fund, Londres
Data: 22 de Novembro (4ª feira)
Horário: 16 horas
Título: Construction of a KO-mouse strain for the tefoil peptide gene TFF2.
Orientador: Doutor Tuncay Kayademir da Universidade de Tubingen, Alemanha
Data: 27 de Dezembro (4ª feira)
Horário: 16 horas
Título: P53 na carcinogénese oral
Orientador: Doutora Isabel Cruz, Dept of Oral Pathology, Free University, Amsterdão, Holanda
Data: 28 de Dezembro (5ª feira)
Horário: 16 horas
Título: Autocrine and paracrine angiogenic pathways regulate tumour growth
Orientador: Doutor Sérgio J.R.Dias, Dept of Hematology/Oncology, Cornell University Medical
College, Nova Iorque, E.U.A.
23
8. WORKSHOPS E CURSOS INTERNACIONAIS
O IPATIMUP organizou em 2000, como nos anos anteriores, a III Portugalia Genética “Milénios de
divergência/cinco séculos de mistura (de genes e de populações)”, o IX Porto Cancer Meeting “New
perspectives in cancer understanding and cancer treatment” e a IV Conferência do Equinócio “O tornaviagem: do brasileiro do princípio do século ao cientista actual “ (ver pág.12).
O IPATIMUP organizou ainda, em 2000, três outras reuniões internacionais:
“First Intercontinental Congress of Pathology” realizado na primeira semana de Maio na Madeira
com a participação de cerca de 750 patologistas europeus, norte-americanos e sul-americanos.
“Mucins in Human Diseases” – reunião “fechada”, para especialistas realizada em Setembro no Porto
com a participação de cerca de 50 dos melhores investigadores mundiais em mucinas.
“FOOD SAFETY – 2000” realizado em Novembro de 2000 no Porto com a participação de mais de
20 especialistas norte-americanos, europeus e asiáticos e uma assistência de cerca de 600 profissionais
e investigadores em Segurança Alimentar, Toxicologia Ciências da Saúde.
O programa do IX Porto Cancer Meeting for o seguinte:
IX Porto Cancer Meeting
(O 1º Porto Cancer Meeting que quase poderia ser falado em português...)
April 17-19, 2000
New perspectives in cancer understanding and cancer treatment
Faculty
Angelo Cardoso, MD, PhD, Harvard University, Boston, USA
Donald McDonald, MD, PhD, University of California, San Francisco, USA
Leonor Parreira, MD, PhD, Medical Faculty of Lisboa, Portugal
Wadih Arap, MD, PhD, University of Texas, Houston, USA
Celso Reis, Msc, PhD, IPATIMUP, Porto, Portugal
Raquel Almeida, Msc, IPATIMUP, Porto, Portugal
Leonor David, MD, PhD, Medical Faculty of Porto & IPATIMUP, Porto, Portugal
Key words
• Endothelial cells, blood vessels, tumour vessels, angiogenesis, vascular targeting and vasculogenic
mimicry
• Chromatin, differentiation and cancer
• Mucins, glycosyltransferases and abnormal glycosylation in neoplastic and preneoplastic conditions.
• Immunotherapy.
Programme
Monday, April 17
9.00 - 9.15 Introduction - M. Sobrinho Simões
1st block - Chromatin, differentiation and cancer
9.15 - 10.30
The 3rd and 4th dimensions of the genome in cell differentiation - L. Parreira
10.30 - 11.00
Coffee break
11.00 - 12.15
The 3rd and 4th dimensions of the genome in leukaemogenesis - L. Parreira
12.15 - 14.30
Light lunch and targeted poster round (Selection of some posters according to the
expertise of the members of the Faculty)
2nd block - Mucins and glycosyltransferases as targets for new diagnostic and therapeutic
strategies
14.30 - 15.45
Mucins as markers of susceptibility (genetic polymorphism) and aberrant
differentiation in gastric cancer and precancerous conditions - L. David
15.45 - 16.15
Coffee break
16.15 - 17.00
Mucin glycoforms (Tn-MUC1 and STn-MUC1) as new tools for cancer
immunotherapy: Role of the lectin domains of GalNAc transferases for the
generation of cancer- associated epitopes - C. Reis
17.00 - 17.45
Mutations in B1, 4-Galactosyltransferases are responsible for defective
glycosylation of proteoglycans in humans - R. Almeida
18.00 - 19.00
Special Session (Press Conference? Meet the expert format?)
24
Tuesday, April 18
3rd block - Title - Cancer therapy in the era of complexity and self-organization
9.00 - 10.15 Tumour immunity as therapy for acute leukaemia - reversing the outcome of a lost
race - A. Cardoso
10.15 - 10-45
Coffee break
10.45 - 12.00
Tumour cell: microenvironment dynamic reciprocity in acute leukaemia - disrupting
the acquisition of selective advantage - A. Cardoso
12.00 - 13.30
Light lunch
4th block - Blood vessels and vascular targeting
13.30 - 14.45
Molecular diversity of blood vessels - W. Arap
14.45 - 15.15
Coffee break
15.15 - 16.30
Novel approaches for vascular targeting - W. Arap
17.00 - 19.00
Poster discussion - Only for GABBA students and IPATIMUP members (Please
read: the Faculty is free...).
Wednesday, April 19
5th block - Vasculogenic mimicry in tumours
9.00 - 10.15
Phenotypic abnormalities in endothelial cells of tumour vessels - D. McDonald
10.15 - 10.45
Coffee break
10.45 - 12.00
Vasculogenic mimicry in tumours: how strong is the evidence? - D. McDonald
12.00 - 12.45
General discussion
13.00
Adjourn
25
9. TRABALHOS PUBLICADOS OU ACEITES PARA PUBLICAÇÃO
9a. Artigos científicos
1.
F.I.
Alves C, Amorim A, Gusmão L. VWA STR genotyping inconsistency between Perkin Elmers’ Profiler Plus Kit and Promega’s Geneprint. Progress in Forensic Genetics 8:467-469, 2000.
2.
Alves C, Silva F, Gusmao L, Seruca R, Soares P, Reis RM, Amorim A: Extended structural 2,6
variation of a pentanucleotide repeat in the GSTP1 gene: characterisation in a normal
population and in thyroid and gastric tumours. European Journal of Human Genetics 8:540544, 2000.
3.
Alves S, Prata MJ, Ferreira F, Amorim A. Screening of thiopurine S-methyltransferase 2,7
mutations by horizontal conformation sensitive gel electrophoresis. Human Mutation 15:246253, 2000.
4.
Alves S, Prata MJ, Ferreira F, Amorim A.Characterization of three new VNTR alleles in the 2,7
promoter region of the TPMT gene. Human Mutation (Online) 15: 121, 2000.
5.
Amado M, Bennett EP, Carneiro F, Clausen H: Characterization of the histo-blood group O2 1,4
gene and its protein product. Vox Sanguinis 79: 219-226, 2000.
6.
Amorim A, Alves C, Gusmão L. Somatic and germinal mutations in STRs. Progress in Forensic Genetics 8:37-39, 2000.
7.
Brión M, Lareu MV, Pereira L, González-Neira A, Salas A, Prata MJ, Amorim A, Carracedo, A. Y chromosome lineages in Iberians: construction of highly informative haplotypes using
biallelic markers, STRs and the minisatellite MSY1. Progress in Forensic Genetics 8: 263265, 2000.
8.
Cameselle JF, Álvarez P, Milanezi MF, Díaz MJ, Pérez-Villanueva J, Schmitt FC. Carcinoma papilar dimórfico infiltrante de mama. Revista de Senologia Y Patologia Mamaria 13: 192196, 2000.
9.
Carneiro F, Sobrinho-Simoes M. The prognostic significance of amplification and 3,7
overexpression of c-met and c-erb B-2 in human gastric carcinomas. Cancer 88: 238-240,
2000
10. Carrilho C, Cantel M, Gouveia P, David L. Simple mucin-type carbohydrate antigens (Tn, 1,8
sialosyl-Tn, T and sialosyl-T) and gp 230 mucin-like glycoprotein are candidate markers for
neoplastic transformation of the human cervix. Virchows Archiv 437:173-179, 2000
11. Crespo A, Filla MB, Russell SW, Murphy WJ. Indirect induction of suppressor of cytokine 4,3
signalling-1 in macrophages stimulated with bacterial lipopolysaccharide: partial role of
autocrine/paracrine interferon-alpha/beta. Biochemistry Journal 349:99-104, 2000
12. Cruz D, Schmitt F, Seixas M. An information system for quality assessment in pathology. 1,4
Archives of Pathology and Laboratory Medicine 124: 816, 2000.
13. Cruz D, Schmitt F., Seixas M. Surgical pathology image–based documentation: Redundancy 1,4
vs. essential information. Archives of Pathology and Laboratory Medicine 124:815–816,
2000.
26
14. David L, Silva F, Seruca R, Pinto M, Reis C, Sobrinho-Simoes M. Correspondence re: A. E. 3,4
Biemer-Huttmann et al., Mucin core protein expression in colorectal cancers with high levels
of microsatellite instability indicates a novel pathway of morphogenesis. Clin. Cancer Res., 6:
1909-1916, 2000; Clinical Cancer Research 6:4461-4462.
15. Estevao-Costa J, Gil-Da-Costa MJ, Medina AM, Sobrinho-Simoes M. Thyroid carcinoma in a 1,5
newborn: clinical challenges in managing the first recorded case. Medical and Pediatric
Oncology 34: 290-292, 2000
16. Figueiredo C, Quint WGV, Sanna R, Sabion E, Donahue JP, Xu W, Miller GG, Peek RM, 2,3
Blaser MJ, van Doorn LJ: Genetic organization and heterogeneity of the iceA locus of
Helicobacter pylori. Gene 246:59-68, 2000.
17. Fortuna M, Salvador A, Sansonetty F, Sousa MJ, Côrte-Real M and Leão C: Cell Cycle Analysis in Yeasts. Current Protocols in Cytometry 11.13.1 –11.13.8, 2000
18. Gamborino E, Carrilho C, Ferro J, Khan M, Garcia C, Suarez M, Yokoyama H, Schmitt FC. 1,0
Fine-needle aspiration diagnosis of Kaposi´s sarcoma in a developing country. Diagnostic
Cytopathology 23: 322-325, 2000.
19. Geraldes M, Gartner F, Schmitt FC. Immunohistochemical study of hormonal receptors and 1,2
cell proliferation in normal canine mammary glands and spontaneous mammary tumours.
Veterinary Record 146: 403-406, 2000.
20. González-Neira A, Gusmão L, Barral S, Lareu MV, Carracedo A. Multiplexing Y chromosome STRs: analysis of artefactual bands and PCR strategies. Progress in Forensic Genetics 8:436438, 2000.
21. González-Neira A, Gusmão L, Lareu MV, Amorim A, Carracedo Distribution of Y- 1,4
Chromosome STR defined haplotypes in Iberia. Forensic Science International 110:117-126,
2000.
22. Gusmão L, Amorim A, Martins N, Prata MJ, Gonzalez-Neira A, Lareu MV, Carracedo A. Y chromosome STR haplotypes in Macau (SE China). Progress in Forensic Genetics 8:324326, 2000.
23. Gusmão L, Gonzalez-Neira A, Brión M, Lareu MV, Carracedo A. Homologous STRs in the X and Y-chromosomes: a contribution to understand human sexual chromosomes evolution.
Progress in Forensic Genetics 8:64-66, 2000.
24. Gusmão L, González-Neira A, Sánchez-Diz P, Lareu MV, Amorim A, Carracedo A. 1,4
Alternative primers for DYS391 typing: advantages of their application to forensic genetics.
Forensic Science International 112:49-57, 2000.
25. Gusmão L, Sánchez-Diz P, Alves C, Lareu MV, Carracedo A, Amorim A. Genetic diversity of 1,6
nine STRs in two iberian populations: Galicia and Northern Portugal. International Journal
of Legal Medicine 114:109-113, 2000.
26. Hassan H, Reis CA, Bennett EP, Mirgorodskaya E, Roepstorff P, Hollingsworth MA, Burchell 7,7
J, Taylor-Papadimitriou J, Clausen H. The lectin domain of UDP-N-acetyl-Dgalactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-T4 directs its glyco-peptide
specificities. Journal of Biological and Chemistry 2000
27. Lopez-Ferrer A, de Bolos C, Barranco C, Garrido M, Isern J, Carlstedt I, Reis CA, Torrado J, 5,7
Real FX.Role of fucosyltransferases in the association between apomucin and Lewis antigen
expression in normal and malignant gastric epithelium. Gut 47 349-356, 2000.
27
28. Macedo G, Costa Maia J, Araújo F, Carneiro F, Gomes A, Koch C, Cunha Ribeiro LM, Araújo Teixeira A, Tomé Ribeiro A: Hepatite C em transplantação hepática. Jornal Português de
Gastrenterologia 7: 147-151, 2000.
29. Macedo G, Costa Maia J, Gomes A, Ribeiro LM, Carneiro F, Teixeira A, Tome Ribeiro A. 0,6
Hepatitis C virus infection and liver transplantation. Transplant Proceedings 32:2667, 2000.
30. Macedo G, Maia JC, Gomes A, Amil J, Fernandes N, Carneiro F, Teixeira A, Ribeiro T. 0,6
Wilson's disease: challenging diagnosis, management, and liver transplantation timing.
Transplant Proceedings 32:2668, 2000.
31. Macedo G, Maia JC, Gomes A, Carneiro F, Lopes S, Mota AM, Teixeira A, Ribeiro T. 0,6
Contribution of transjugular liver biopsy in fulminant hepatic failure. Transplant Proceedings
32:2643, 2000.
32. Machado JC, Carneiro F, Sobrinho-Simões M: E-cadherin mutations in gastric carcinoma 3,8
(Letter-to-the Editor). Journal of Pathology 191: 466-467, 2000.
33. Machado JC, Nogueira AMMF, Carneiro F, Reis CA, Sobrinho-Simões M. Gastric carcinoma 3,8
exhibits distinct types of cell differentiation: an immunohistochemical study of trefoil peptides
(TFF1 and TFF2) and mucins (MUC1, MUC2, MUC5AC and MUC6). Journal of Pathology
190: 437-443, 2000.
34. Machado JC, Reis C, Carneiro F, Sobrinho-Simões M: Comments on “Primary signet-ring cell 2,7
carcinoma of the lung: histochemical and immunohistochemical characterization”. Human
Pathology 31: 272, 2000.
35. Manco L, Ribeiro ML, Maximo V, Almeida H, Costa A, Freitas O, Barbot J, Abade A, 3,2
Tamagnini G: A new PKLR gene mutation in the R-type promoter region affects the gene
transcription causing pyruvate kinase deficiency. Bristish Journal of Haematology 110:993997, 2000.
36. Marinho AF, Botelho M, Schmitt FC. Evaluation of numerical abnormalities of chromosomes 0,7
1 and 17 in proliferative epithelial breast lesions using fluorescence in situ hybridization.
Pathology Research and Practice 196:227-33, 2000.
37. Marquez J, Schmitt F. Radiometric homogenization of the color cryosection images from the VHP lungs for 3D segmentation of blood vessels. Comput Med Imaging Graph 24:181-191,
2000.
38. Máximo V, Soares P, Machado JP, Seruca R, Sobrinho Simões M. Mitochondrial DNA 12,2
alteration in gastric cancer. Gastroenterology 119:1808-1809, 2000.
39. Máximo V, Sobrinho Simões M: Hürthle cell tumours of the thyroid. A review with emphasis 1,8
on mitochondrial abnormalities with clinical relevance. Virchows Archiv 437:107-115,2000.
40. Maximo V, Sobrinho-Simoes M. Mitochondrial DNA 'common' deletion in Hurthle cell lesions 3,8
of the thyroid. Journal of Pathology 192: 561-562, 2000.
41. Nogueira C, Figueired C, Carneiro F, David L, Peixoto A, Cardoso de Oliveira M, Taveira Gomes A, Barreira R, Tomé Ribeiro A, Salgado C, Figueira P, Belo L, Ribeiro AM, Lomba C,
Pitta MF, Monteiro ML, Nina N, Gonçalves G, Quint WGV, van Doorn LJ, Sobrinho-Simões
M: Associação entre os genótipos de Helicobacter pylori e o desenvolvimento de gastrite
crónica atrófica e metaplasia intestinal. Primeiros resultados de uma acção de rastreio. Jornal
Português de Gastrenterologia 7: 138-146, 2000.
28
42. Papotti M, Volante M, Komminoth P, Sobrinho-Simoes M, Bussolati G. Thyroid carcinomas 3,3
with mixed follicular and C-cell differentiation patterns. Seminars in Diagnostic Pathology
17:109-119,2000.
43. Peek RM Jr, van Doorn LJ, Donahue JP, Tham KT, Figueiredo C, Blaser MJ, Miller GG. 4,2
Quantitative detection of helicobacter pylori gene expression In vivo and relationship to gastric
pathology. Infectious Immunology 68:5488-5495, 2000.
44. Pereira L, Brión M,Prata MJ, Jobling MA, Carracedo A, Amorim A. Gradient of Y
chromosome haplogroup 21 across the Western Iberia. Progress in Forensic Genetics 8: 281283, 2000.
-
45. Pereira L, Prata MJ, Amorim A. Analysis of mitochondrial DNA hypervariable regions I and II in a North Portuguese population. Progress in Forensic Genetics 8:338-340, 2000.
46. Pereira L,Prata MJ, Brión M, Jobling MA, Carracedo A, Amorim A. Clinal variation of the 1,0
YAP+ Y chromosome frequencies in Western Iberia. Human Biology 72: 937-944, 2000.
47. Pereira FR, Pereira WC, Machado JC. Ultrasonic wave speed measurement using the time- 0,7
delay profile of rf-backscattered signals. Ultrasonics 38:708-710, 2000.
48. Pereira L, Gusmão L, Prata MJ, Mota P, Trovoada MJ, Amorim A:. Study of the loci A, B and 1,0
C from the STR system MBP: population data from North Portugal and São Tomé e Príncipe.
Human Biology 72:481-487, 2000.
49. Pérez-Lezaun A, Calafell F, Clarimón J, Bosch E, Mateu E, Gusmão L, Amorim A, Benchemsi 1,6
N, Bertranpetit J. Report on allele frequency data on 13 short tandem repeats in a stratified
population sample of the iberian peninsula and northern africa using the AmpFLSTR Profiler
Plus, AmpFLSTR cofiler and AmpFLSTR Green I PCR amplification Kits. International
Journal of Legal Medicine 113:208-214, 2000.
50. Pina-Vaz C, Rodrigues AG, Sansonetty F, Martinez-de-Oliveira J, Fonseca AF and Mardh PA: Antifungal activity of local anesthetics against Candida species. The Journal of Infectious
Diseases in Obstetrics and Ginecology, 8:124-137, 2000
51. Pina-Vaz C, Sansonetty F, Rodrigues AG, Martinez-de-Oliveira J, Fonseca AF and Mardh PA: 1,7
Antifungal activity of ibuprofen alone and in combination with fluconazole against Candida
species. Journal of Medical Microbiology 49: 1-10, 2000
52. Pinto M, Oliveira C, Machado JC, Cirnes L, Tavares J, Carneiro F, Hamelin R, Hofstra R, 4,5
Seruca R, Sobrinho-Simões M: MSI-L gastric carcinomas share the hMLH1 methylation status
of MSI-H carcinomas but not their clinicopathological profile. Laboratory Investigation 80:
1915-1923, 2000.
53. Prata MJ, Miranda C, Rocha J, Amorim A. Allelic Affinities between the F13A Common Gene 1,4
products inferred by the analysis of an (AAAG)n STR polymorphism within the 5' untranslated
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Fenoglio-Preiser C, Carneiro F, Correa P, Guilford P, Lambert R, Megraud F, Muñoz N, Powell SM,
Rugge M, Sasako M, Stolte M, Watanabe H: Gastric carcinoma. In: WHO Classification of Tumours
- Pathology and Genetics of Tumours of the Digestive System. Hamilton SR and Aaltonen LA (eds),
IARC Press: Lyon, 2000.
2.
Pereira, L., Prata M.J., Jobling M., Amorim, A. Analysis of the Y-chromosome and mitochondrial
DNA pools in Portugal. In RENFREW C, BOYLE K (eds) Archaeogenetics: DNA and the
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3.
Schmitt FC. Patologia da mama. In:Bogliolo-Patologia. Editora Guanabara Koogan, Rio de Janeiro,
RJ, 2000 (6ª ed.), pg 538-562.
4.
Caldas C, Carneiro F: Helicobacter pylori. Encyclopedia of Genetics (em publicação).
5.
Carneiro F, David L, Sobrinho-Simões M: Tumours of the stomach, thyroid and parathyroid. In_
Comprehensive Tumour Terminology, UICC, Wyley (em publicação).
6.
Ohgaki H, Biernat W, Reis RM, Chimelli L, Kleihues P: Gliosarcoma. In: Pathology and Genetics of
Tumors of the Nervous System Kleihues P, Cavemee WK (eds) (em publicação).
7.
Reis MR, Herva R, Baer W, Kleihues P, Ohgaki H: Second primary glioblastoma In: Pathology and
Genetics of Tumors of the Nervous System Kleihues P, Cavemee WK (eds) (em publicação)
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