Síndrome da Hipofosfatasia (ALPL) TNSALP

Transcrição

Síndrome da Hipofosfatasia (ALPL) TNSALP
Grupos de doenças
Doenças
Genes/Localização/Patógeno
Síndrome da
Hipofosfatasia (ALPL)
TNSALP
Síndrome de Leigh
mtT8993G
MLH1
MSH2
Sindrome de Lynch
MLH1 e MSH2
MSH6
Síndrome de Noonan
PTPN11
SOS1
RAF1
RIT1
Síndromes
Exames
Sequenciamento dos éxons
Estudo molecular miopatias mitocondriais - leighs, mutação T8993C por PCR
seguido de sequenciamento do mtDNA
MLPA para o gene MLH1
Sequenciamento do gene MLH1
PCR da mutação familial específica
PCR da mutação familial específica do gene MSH2
MLPA para o gene MSH2
Sequenciamento do gene MSH2
Deleções e duplicações por MLPA
Mutações nos genes MLH1 e MSH2 por PCR seguido de sequenciamento
automático e análise de toda a sequencia codificante dos genes
Sequenciamento do gene MSH6
MLPA deleções e duplicações
PCR da mutação familial específica
Sequenciamento dos éxons (sequenciamento do gene)
Sequenciamento do gene SOS1
Sequenciamento do gene RAF1
Sequenciamento do gene RIT1
Síndrome do Tumor
Hamartoma
Síndrome Charge
Síndrome de Marfan
Tipo 1
PTEN
MLPA para rearranjos do gene PTEN
CHD7
Síndrome de Rett
MECP2
Síndrome de Angelman
UBE3A
Síndrome de PraderWilli/Angelman
SNRPN
Síndrome de Li-Fraumeni
CHEK2
Síndrome de Von-Hippel
Lindau (VHL)
(Angioblastomose)
VHL
Sequenciamento do gene CDH7
MLPA do gene FBN1
Sequenciamento do gene FBN1 por NGS
Sequenciamento das regiões codificadoras do gene (éxons 2, 3 e 4) Sanger
MLPA para deleções e duplicações do gene
Sequenciamento de Nova Geração do gene MECP2
Sequenciamento do gene UBE3A
PCR da mutação familial específica
Teste de metilação do gene por PCR
Estudo molecular por MLPA
Mutação no gene CHEK2 (região do éxon 10) – 1100delc por PCR seguido de
sequenciamento tipo Sanger
Mutação do gene VHL por PCR e sequenciamento direto bidirecional dos éxons
1, 2 e 3
Síndrome de Leri Weill
SHOX
SHOX e SHOXY
Síndrome de BlackfanDiamond
GATA1
Síndrome de Cohen
COH1
Síndrome de Ehlers-Danlos
- Osteogênese imperfeita
Síndrome de Ehlers-Danlos
tipo IV
Osteogênese imperfeita
tipo V
COL1A1
COL1A2
Sequenciamento gene COH1
Screening mutações c.3348_3349delCT, c.9258_9259insT,I2820T, éxon 23 por
sequenciamento
Estudo molecular gene COH1 por MLPA
Sequenciamento gene COL1A1
Sequenciamento gene COL1A2
COL3A1
Sequenciamento gene COL3A1
IFITM5
Mutação c-14C-T da região 5' UTR por sequenciamento
Síndrome do X frágil
FMR1
Southern Blot da expansão CGG plena do gene
MS-PCR ou TP-PCR da expansão CGG do gene
Doenças do gene FMR1, PCR expansão CGG e eletroforese capilar
Síndrome de Ondine
PHOX2B
FBN1
Mutação familiar conhecida no gene VHL por PCR seguido por sequenciamento
Mutação no gene SHOX por PCR e sequenciamento
Mutação nos genes SHOX e SHOXY por MLPA
Sequenciamento gene GATA1
Estudo molecular gene PHOX2B por PCR seguido de análise de fragmentos
Sequenciamento do gene PHOX2B
Síndrome de Silver-Russel
H19
Síndrome de Smith Lemli
Opitz
DHCR7
Síndrome de Sotos
NSD1
Síndrome de Wagr
WAGR
Síndrome de Warburg
RAB3GAP1
Síndrome de Williams
Genes cromossomo 7
Síndrome de Wilson
Síndrome Ipex
Síndrome Kearns-Sayre
ATP7B
FOXP3
ADNmt
Estudo molecular por MLPA
Estudo molecular por PCR seguida de sequenciamento tipo Sanger
Deleção no gene NSD1 por MLPA
Mutações no gene NSD1 por sequenciamento
Análise gene WAGR por MLPA
Screening mutações R392X, Q447X, W578X, R671X, IVS7-2 A>G, IVS8+1 G>A,
158del ACTG, 333delT, 932delC
Sequenciamento gene RAB3GAP1
Estudo molecular por MLPA
Estudo genético por PCR e genotipagem em sequenciador
Sequenciamento do gene ATP7B
Estudo molecular gene FOXP3 por PCR seguido de sequenciamento
Estudo molecular por PCR e Southern Blot
Grupos de doenças
Síndromes
Doenças
Genes/Localização/Patógeno
Síndrome Rubinstein-Taybi
CREBBP
Síndrome Simpson-GolabiBehmel
GPC3
Síndrome Velocardiofacial
TBX1 - Cromossomo 22q11
Síndrome Wiskott Aldrich
WAS
Síndrome de BerardinelliSeip ou Lipodistrofia
congênita generalizada
Síndrome de Alport
Síndrome de Baraistser Winter
BSCL2
SEIPINA e AGPAT2
AGPAT2
COL4A5
Síndrome de Turner
Pesquisa cromossomo Y
Síndrome de Larsen
Síndrome de Lesch Nyha
Síndrome de Marfan
Síndrome de Barth
Síndrome de Bartter
Síndrome de Beckwith
Wiedemann
Síndrome de Gilbert
Síndrome de Gitelman
Síndrome de QT longo
Síndrome de HallervordenSpatz (HSS)
ACTB
Exames
Mutação nos éxons do gene CREBBP por MLPA
Mutação nos éxons do gene CREBBP por sequenciamento
Deleções gene GPC3 por MLPA
Sequenciamento gene GPC3
Estudo molecular qualitativo por PCR e genotipagem por eletroforese capilar
em sequenciador automático
Estudo molecular deleção das regiões 22q11.2 do gene TBX1 por MLPA
Sequenciamento gene WAS
Sequenciamento gene BSCL2
Estudo molecular mutações 645insAA, 669insA e de1317-588 por PCR
Sequenciamento gene AGPAT2
Sequenciamento gene COL4A5
Sequenciamento gene ACTB
Pesquisa de cromossomo Y para síndrome de Turner por PCR seguida de
eletroforese capilar
Sequenciamento gene FLBN
Sequenciamento gene HPRT1
Tipo 1 - sequenciamento gene FBN1
Tipo 2 - sequenciamento gene TGFBR 1
Tipo 2 - sequenciamento gene TGFBR 12
Sequenciamento do gene TAZ por NGS
Tipo 2 - sequenciamento gene KCNJ1
Tipo 3 - sequenciamento gene CLCNKB
Tipo 4A - sequenciamento gene BSND
Tipo 4B - sequenciamento gene CLCNKA
FLBN
HPRT1
FBN1
TGFBR 1
TGFBR 2
TAZ
KCNJ1
CLCNKB
BSND
CLCNKA
KCNQ1OT1, H19DMR, KvDMR,
Metilação nos genes por MLPA
CDKN1C e IGF2
Estudo genético polimorfismos do gene UGT1A1 - toxicidade do irinotecam UGT1A1
por PCR e análise de fragmentos
SLC12A3
Sequenciamento gene SLC12A3
KCNQ1
Sequenciamento gene KCNQ1
PANK2
Estudo molecular neurodegeneração associada ao pantotenato quinase,
sequenciamento do gene PANK2

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